Name: fatty acid 13c isotopologue profiling provides insight into trophic carbon transfer and lipid metabolism of invertebrate consumers
Uploaded: 2018-04-17T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Fatty Acid 13C Isotopologue Profiling Provides Insight into Trophic Carbon Transfer and Lipid Metabolism of Invertebrate Consumers at JoVE.com

R ・ メンツェルとドイツ研究振興協会 (RU RU780/11-1) によって L. ・ ルッスの財政支援は、感謝します。R. Nehring RU 780/10-1 によって資金を供給されました。最後に、原稿の校正のため博士ハシバミ Ruvimbo Maboreke に非常に感謝しています。

記述されていたプロトコルは、動物倫理の能力には該当しません。しかし、人々 は、高等動物の記述されていたプロトコルを適応し場合、により、機関の動物倫理委員会承認動物処理するためのプロトコルであること注意します。
1. 動物の栽培
注: すべては確立プロトコル26,27,28?...

<ol>
	<li>Ruess, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Application+of+lipid+analysis+to+understand+trophic+interactions+in+soil.">Application of lipid analysis to understand trophic interactions in soil.</a> Ecology. 86 (8), 2075-2082 (2005).</li><li>Ruess, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipid+composition+of+Collembola+and+their+food+resources+in+deciduous+forest+stands+-+Implications+for+feeding+strategies.">Lipid composition of Collembola and their food resources in deciduous forest stands - Implications for feeding strategies.</a> Soil Biology and Biochemistry. 39 (8), 1990-2000 (1990).</li><li>Chamberlain, P. M., Bull, I. D., Black, H. I. J., Ineson, P., Evershed, R. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fatty+acid+composition+and+change+in+Collembola+fed+differing+diets:+identification+of+trophic+biomarkers.">Fatty acid composition and change in Collembola fed differing diets: identification of trophic biomarkers.</a> Soil Biology and Biochemistry. 37 (9), 1608-1624 (2005).</li><li>Stott, A. W., Davies, E., Evershed, R. P., Tuross, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Monitoring+the+routing+of+dietary+and+biosynthesised+lipids+through+compound-specific+stable+isotope+(delta+C-13)+measurements+at+natural+abundance.">Monitoring the routing of dietary and biosynthesised lipids through compound-specific stable isotope (delta C-13) measurements at natural abundance.</a> Naturwissenschaften. 84 (2), 82-86 (1997).</li><li>Ruess, L., Haggblom, M. M., Langel, R., Scheu, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nitrogen+isotope+ratios+and+fatty+acid+composition+as+indicators+of+animal+diets+in+belowground+systems.">Nitrogen isotope ratios and fatty acid composition as indicators of animal diets in belowground systems.</a> Oecologia. 139 (3), 336-346 (2004).</li><li>Pollierer, M. M., Scheu, S., Haubert, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Taking+it+to+the+next+level:+Trophic+transfer+of+marker+fatty+acids+from+basal+resource+to+predators.">Taking it to the next level: Trophic transfer of marker fatty acids from basal resource to predators.</a> Soil Biology and Biochemistry. 42 (6), 919-925 (2010).</li><li>Ferlian, O., Scheu, S., Pollierer, M. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trophic+interactions+in+centipedes+(Chilopoda,+Myriapoda)+as+indicated+by+fatty+acid+patterns:+Variations+with+life+stage,+forest+age+and+season.">Trophic interactions in centipedes (Chilopoda, Myriapoda) as indicated by fatty acid patterns: Variations with life stage, forest age and season.</a> Soil Biology and Biochemistry. 52, 33-42 (2012).</li><li>Ruess, L., Chamberlain, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+fat+that+matters:+Soil+food+web+analysis+using+fatty+acids+and+their+carbon+stable+isotope+signature.">The fat that matters: Soil food web analysis using fatty acids and their carbon stable isotope signature.</a> Soil Biology and Biochemistry. 42 (11), 1898-1910 (2010).</li><li>Traugott, M., Kamenova, S., Ruess, L., Seeber, J., Plantegenest, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Empirically+characterising+trophic+networks:+What+emerging+DNA-based+methods,+stable+isotope+and+fatty+acid+analyses+can+offer.">Empirically characterising trophic networks: What emerging DNA-based methods, stable isotope and fatty acid analyses can offer.</a> Adv Ecol Res. 49, 177-224 (2013).</li><li>Hammer, B. T., Fogel, M. L., Hoering, T. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stable+carbon+isotope+ratios+of+fatty+acids+in+seagrass+and+redhead+ducks.">Stable carbon isotope ratios of fatty acids in seagrass and redhead ducks.</a> Chemical Geology. 152 (1-2), 29-41 (1998).</li><li>Budge, S. M., Iverson, S. J., Koopman, H. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Studying+trophic+ecology+in+marine+ecosystems+using+fatty+acids:+A+primer+on+analysis+and+interpretation.">Studying trophic ecology in marine ecosystems using fatty acids: A primer on analysis and interpretation.</a> Marine Mammal Science. 22 (4), 759-801 (2006).</li><li>Haubert, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trophic+structure+and+major+trophic+links+in+conventional+versus+organic+farming+systems+as+indicated+by+carbon+stable+isotope+ratios+of+fatty+acids.">Trophic structure and major trophic links in conventional versus organic farming systems as indicated by carbon stable isotope ratios of fatty acids.</a> Oikos. 118 (10), 1579-1589 (2009).</li><li>Ngosong, C., Raupp, J., Richnow, H. H., Ruess, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tracking+Collembola+feeding+strategies+by+the+natural+13C+signal+of+fatty+acids+in+an+arable+soil+with+different+fertilizer+regimes.">Tracking Collembola feeding strategies by the natural 13C signal of fatty acids in an arable soil with different fertilizer regimes.</a> Pedobiologia. 54 (4), 225-233 (2011).</li><li>Bec, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessing+the+reliability+of+fatty+acid-specific+stable+isotope+analysis+for+trophic+studies.">Assessing the reliability of fatty acid-specific stable isotope analysis for trophic studies.</a> Methods in Ecology and Evolution. 2 (6), 651-659 (2011).</li><li>Gladyshev, M. I., Makhutova, O. N., Kravchuk, E. S., Anishchenko, O. V., Sushchik, N. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stable+isotope+fractionation+of+fatty+acids+of+Daphnia+fed+laboratory+cultures+of+microalgae.">Stable isotope fractionation of fatty acids of Daphnia fed laboratory cultures of microalgae.</a> Limnologica. 56 (Supplement C. 56 (Supplement C), 23-29 (2016).</li><li>Gladyshev, M. I., Sushchik, N. N., Kalachova, G. S., Makhutova, O. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stable+isotope+composition+of+fatty+acids+in+organisms+of+different+trophic+levels+in+the+Yenisei+river.">Stable isotope composition of fatty acids in organisms of different trophic levels in the Yenisei river.</a> PLoS One. 7 (3), e34059 (2012).</li><li>Eisenreich, W., Dandekar, T., Heesemann, J., Goebel, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Carbon+metabolism+of+intracellular+bacterial+pathogens+and+possible+links+to+virulence.">Carbon metabolism of intracellular bacterial pathogens and possible links to virulence.</a> Nature Reviews Microbiology. 8 (6), 401-412 (2010).</li><li>Eylert, E., Bacher, A., Eisenreich, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=NMR-based+isotopologue+profiling+of+microbial+carotenoids.">NMR-based isotopologue profiling of microbial carotenoids.</a> Methods Mol Biol. 892, 315-333 (2012).</li><li>Garton, N. J., O'Hare, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tuberculosis:+feeding+the+enemy.">Tuberculosis: feeding the enemy.</a> Chemical Biology. 20 (8), 971-972 (2013).</li><li>Rosenblatt, J., Chinkes, D., Wolfe, M., Wolfe, R. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stable+isotope+tracer+analysis+by+GC-MS,+including+quantification+of+isotopomer+effects.">Stable isotope tracer analysis by GC-MS, including quantification of isotopomer effects.</a> Am J Physiol. 263 (3), E584-E596 (1992).</li><li>Fernandez, C. A., Des Rosiers, C., Previs, S. F., David, F., Brunengraber, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Correction+of+13C+mass+isotopomer+distributions+for+natural+stable+isotope+abundance.">Correction of 13C mass isotopomer distributions for natural stable isotope abundance.</a> J Mass Spectrom. 31 (3), 255-262 (1996).</li><li>Heuner, K., Eisenreich, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+intracellular+metabolism+of+legionella+by+isotopologue+profiling.">The intracellular metabolism of legionella by isotopologue profiling.</a> Methods Mol Biol. 954, 163-181 (2013).</li><li>Willenborg, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+the+pivotal+carbon+metabolism+of+Streptococcus+suis+serotype+2+under+ex+vivo+and+chemically+defined+in+vitro+conditions+by+isotopologue+profiling.">Characterization of the pivotal carbon metabolism of Streptococcus suis serotype 2 under ex vivo and chemically defined in vitro conditions by isotopologue profiling.</a> J Biol Chem. 290 (9), 5840-5854 (2015).</li><li>Menzel, R., Ngosong, C., Ruess, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isotopologue+profiling+enables+insights+into+dietary+routing+and+metabolism+of+trophic+biomarker+fatty+acids.">Isotopologue profiling enables insights into dietary routing and metabolism of trophic biomarker fatty acids.</a> Chemoecology. 27 (3), 101-114 (2017).</li><li>Buse, T., Ruess, L., Filser, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=New+trophic+biomarkers+for+Collembola+reared+on+algal+diets.">New trophic biomarkers for Collembola reared on algal diets.</a> Pedobiologia. 56 (3), 153-159 (2013).</li><li>Hutson, B. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+variations+of+the+plaster-charcoal+culture+method+on+a+Collembolan,+Folsomia+candida.">Effects of variations of the plaster-charcoal culture method on a Collembolan, Folsomia candida.</a> Pedobiologia. 18, 138-144 (1978).</li><li>Fountain, M. T., Hopkin, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Folsomia+candida+(Collembola):+a+&amp;#34;standard&amp;#34;+soil+arthropod.">Folsomia candida (Collembola): a &amp;#34;standard&amp;#34; soil arthropod.</a> Annu Rev Entomol. 50, 201-222 (2005).</li><li>ISO, I. O. f. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Soil Quality-Inhibition of reproduction of Collembola (Folsomia candida) by soil pollutants. , (1999).</li><li>Welch, D. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Applications+of+cellular+fatty+acid+analysis.">Applications of cellular fatty acid analysis.</a> Clin Microbiol Rev. 4 (4), 422-438 (1991).</li><li>Dodds, E. D., McCoy, M. R., Rea, L. D., Kennish, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gas+chromatographic+quantification+of+fatty+acid+methyl+esters:+flame+ionization+detection+vs.+electron+impact+mass+spectrometry.">Gas chromatographic quantification of fatty acid methyl esters: flame ionization detection vs. electron impact mass spectrometry.</a> Lipids. 40 (4), 419-428 (2005).</li><li>Kuppardt, S., Chatzinotas, A., Kastner, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+a+fatty+acid+and+RNA+stable+isotope+probing-based+method+for+tracking+protist+grazing+on+bacteria+in+wastewater.">Development of a fatty acid and RNA stable isotope probing-based method for tracking protist grazing on bacteria in wastewater.</a> Appl Environ Microbiol. 76 (24), 8222-8230 (2010).</li><li>Zhang, X., He, H., Amelung, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+GC/MS+method+for+the+assessment+of+15N+and+13C+incorporation+into+soil+amino+acid+enantiomers.">A GC/MS method for the assessment of 15N and 13C incorporation into soil amino acid enantiomers.</a> Soil Biology and Biochemistry. 39 (11), 2785-2796 (2007).</li><li>Vetter, W., Thurnhofer, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+fatty+acids+by+mass+spectrometry+in+the+selected+ion+monitoring+mode.">Analysis of fatty acids by mass spectrometry in the selected ion monitoring mode.</a> Lipid Technol. 19 (8), 184-186 (2007).</li><li>Thurnhofer, S., Vetter, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+gas+chromatography/electron+ionization-mass+spectrometry-selected+ion+monitoring+method+for+determining+the+fatty+acid+pattern+in+food+after+formation+of+fatty+acid+methyl+esters.">A gas chromatography/electron ionization-mass spectrometry-selected ion monitoring method for determining the fatty acid pattern in food after formation of fatty acid methyl esters.</a> J Agric Food Chem. 53 (23), 8896-8903 (2005).</li><li>Haubert, D., Haggblom, M. M., Scheu, S., Ruess, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+fungal+food+quality+and+starvation+on+the+fatty+acid+composition+of+Protaphorura+fimata+(Collembola).">Effects of fungal food quality and starvation on the fatty acid composition of Protaphorura fimata (Collembola).</a> Comparative Biochemistry and Physiology B-Biochemistry &amp; Molecular Biology. 138 (1), 41-52 (2004).</li></ol>

Isotopologue のプロファイル
FAs 13C 分布の定量的側面の詳細な分析では、炭素の食物網でのパーティション分割を割り当てるには最先端の技術を必要があります。現在の仕事は isotopologue 13C を評価するためにプロファイリングを採用/熱帯の相互作用のための共通の FA バイオ マーカー12C 比。このメソッドでは、液体クロマトグラフィー (...

土壌など不可解な生息地で栄養関係解決困難な動物のサイズが小さいによってさらに制限されます。最後の十年は、フィールド条件1,2,3の下の土壌動物相の供給戦略を定義するためのバイオ マーカーとしての脂肪酸の使用で特に、生化学的な生態学の進歩を見ています。これは全体の分子として消費者組織のリソースから脂肪酸を組み込むことができるという事実に基づく、食事ルーティング4と呼ばれる、プロセス。脂肪酸の転送は、以上 3 つ栄養のレベル、すなわち、菌類から粘管目5線虫に報告されています。最近では、捕食動物は、6、7を考慮され、土壌食物網における栄養マーカーとして脂肪酸の最初のレビューが公開された8,9をされています。
栄養相互作用の詳細については、脂肪酸の安定同位体プロービング (FA SIP) によって達成されます。13C の定量/ダイエットと消費することができます脂肪酸12C 比バイナリ リンクのせいと関連付けられている炭素フローを見積もるし、地上波で採用されている、淡水、海洋の食物網10,11 ,12,13。基本的な前提は、ルーティングされた脂肪酸が酵素プロセスの対象とはしたがっての13C 信号、すなわち、 13C/12C 消費者の脂肪酸の比はダイエット1に類似しています。ただし、食物連鎖を13C 署名の段階的な減少は栄養研究14,,1516FA SIP の広範なアプリケーションをそれにより妨げる水生システムで報告されています。さらに、地上の食物網におけるほとんどの無脊椎動物の脂質代謝の知識はまだ限られています。
栄養マーカー脂肪酸食物網生態学における定量的炭素フローの決定のための手段としての使用のための消費者における脂質代謝経路の理解が欠かせません。念頭、 13C isotopologue のプロファイリングは、原理的にはすべての生物学的システムの17、炭素代謝の調査のため適用できる有望な方法であります。13C 標識炭素基板、 13C 代謝ネットワーク内の分布の導入は消費者を特定の isotopologue 分布の生成された代謝産物からトレースできます。これは定量核代謝共鳴分光法18,19または質量20,は21、その高いため低バイオマス後者の支持された生体試料によって評価されることができます。感度。
ただし、isotopologue プロファイルがされて正常にアミノ酸に適用し、細菌性病原体17,22,23, 脂肪酸の実装の体内の炭素代謝に洞察力を提供酸が遅れています。安定同位体標識前駆体脂肪酸、その食物ルーティングや劣化、土壌無脊椎動物の消費者に β 酸化を介しての運命の最初の詳細な分析、最近メンツェルらによって実行されました。24. 13C 標識脂肪酸 isotopologue による頻繁な土壌無脊椎動物、トビムシ、キーの子孫の後で導入実験の方法論的基礎を提供するここでは。これらの植栽は、土壌食物網とがよく、栄養マーカー脂肪酸8,25の調査の重要なコンポーネントは、フォームの良いモデル グループです。
栄養マーカー脂肪酸食物網生態学における定量的炭素フローの決定のための手段としての使用のための消費者における脂質代謝経路の理解が欠かせません。現在のプロトコルは、トビムシから実験、および抽出および支配的な脂質画分 (中性脂質、リン脂質) のメチル化のための生化学的なプロシージャを供給所のデザインと設定を与えます。質量分析法による脂肪酸の isotopologue 組成を分析する方法について説明し、関連の数式と計算について説明します。この手順の結果: (i) 1 つ以上によって (すなわち、脂肪酸分子イオン M+) 親イオンの質量を超える isotopologues の比質量単位 (M+1、+2M、M+3、等) および (ii) 全体1313C 標識前駆体由来の脂肪酸で C 濃縮。このアプローチは、これらは、成功したラベルの吸収量を確保するための制御された条件下で十分な量の培養とその後を前提に他の捕食者-被食者相互作用に適用できる一般にトビムシに使用、検証します。

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>neoLab-Round jars</td>
			<td>neoLab</td>
			<td>2-1506</td>
			<td>69 x 40 mm, 10 pacs/pack</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Charcoal activated</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>X865.1</td>
			<td>p.a., powder, CAS No. 7440-44-0</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Alabaster Dental</td>
			<td>R&#214;HRICH-GIPSE</td>
			<td>---</td>
			<td>http://www.roehrich-gipse.de/dentalgipse.php</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chloroform</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>7331.1</td>
			<td>HPLC &#8805; 99,9 %</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>P717.1</td>
			<td>HPLC &#8805; 99,9 %</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hexan</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>7339.1</td>
			<td>HPLC &#8805; 98 %</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>tert-Butyl methyl ether (MTBE)</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>T175.1</td>
			<td>HPLC &#8805; 99,5 %</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Aceton</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>7328.2</td>
			<td>HPLC &#8805; 99,9 %</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NaOH</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>6771.1</td>
			<td>p.a. &#8805;99 %, in pellets</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>di-Natriumhydrogenphosphat</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>P030.1</td>
			<td>p.a. &#8805;99 % , water free</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Na-dihydrogenphosphat Dihydrat</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>T879.1</td>
			<td>p.a. &#8805;99 %</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hypochloric acid (6 N)</td>
			<td>VWR International</td>
			<td>26,115,000</td>
			<td>AVS TITRINORM vol. solution</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bond Elut (Columns)</td>
			<td>Agilent Tech.</td>
			<td>14102037</td>
			<td>HF Bond Elut-SI, 500 mg, 3 mL, 50/PK</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pr&#228;paratengl&#228;ser Duran</td>
			<td>Glasger&#228;tebau Ochs</td>
			<td>135215</td>
			<td>&#216; 16 x 100 mm, plus screw cap with handy knurl and integrated PTFE/silicone gasket</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Supelco 37 Component FAME Mix</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>47885-U Supelco</td>
			<td>10&#160;mg/mL in methylene chloride, analytical standard</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FlowMesh</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>2796.1</td>
			<td>Polypropylene mesh, approximately 0.3 mm thick, with 1 mm strand spacing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bacterial Acid Methyl Ester (BAME) Mix</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>47080-U Supelco</td>
			<td>10&#160;mg/mL in methyl caproate, analytical standard</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methyl nonadecanoate</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>74208</td>
			<td>analytical standard &#8805; 98.0 %</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hexadecanoic acid-1-13C (Palmitic)</td>
			<td>Larodan Fine Chemicals</td>
			<td>78-1600</td>
			<td>GC &#8805; 98.0 % (13C: 99.0 %)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RVC 2-25 CDplus</td>
			<td>Martin Christ Gefrier-trocknungsanlagen</td>
			<td></td>
			<td>Compact benchtop midi concentrator</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Alpha 2-4 LDplus</td>
			<td>Martin Christ Gefrier-trocknungsanlagen</td>
			<td></td>
			<td>Drying manifold</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MZ 2C NT</td>
			<td>Vacuubrand GMBH</td>
			<td></td>
			<td>Vacuum pump</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Roto-Shake Genie</td>
			<td>Scientific Industries</td>
			<td></td>
			<td>Combined rocking and rotating device</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>XP64 Micro Comparator</td>
			<td>Mettler Toledo</td>
			<td></td>
			<td>Super high precision balance</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>GC-System 7890A</td>
			<td>Agilent Tech.</td>
			<td></td>
			<td>Gas chromatograph</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>7000 GC/MS Triple Quad</td>
			<td>Agilent Tech.</td>
			<td></td>
			<td>Triple Quad mass spectrometer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>7683B Series Injector</td>
			<td>Agilent Tech.</td>
			<td></td>
			<td>Sample injector</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Heraeus Multifuge 3SR+</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td></td>
			<td>Centrifuge with 10 ml tube rotor</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

fatty acid 13c isotopologue profiling provides insight into trophic carbon transfer and lipid metabolism of invertebrate consumers

通常完全な分子として同化、マイナーまたはなしの変更は、異なる栄養段階の間食事ルーティングできるように消費者組織に転送されるため、脂肪酸 (FAs)、食物網の生態学的に有用なバイオ マーカーです。しかし、FA 栄養マーカー アプローチはまだ土壌動物相の脂質代謝の限られた知識によって妨げられます。この調査は、脂肪酸代謝経路の 2 つの広範な土壌トビムシ、 Protaphorura fimataとHeteromurus 光沢苔のトレーサーとして完全ラベル パルミチン酸 (13C16:0、99 の atom %) を使用しました。運命、この前駆体の新陳代謝の変更を調査するために isotopologue のプロファイリングの手法を提案する単一イオンのモニタリングを用いた質量分析法によって行います。さらに、上流の研究室実験を供給、抽出および支配的な脂質画分 (中性脂質、リン脂質) と関連数式および計算のメチル化して説明します。Isotopologue プロファイリング13C 標識前駆体由来の脂肪酸で全体の13C 濃縮収量のみではなく、また親イオン (すなわちFA の分子イオンの質量を超える isotopologues のパターンを生成M+) それぞれのラベルの 1 つまたは複数の質量単位(M+1、+2M、M+3等)で FA。この知識は、デノボ合成と比較して完全に消費された FA の栄養経路の比率に結論をことができます。Isotopologue のプロファイリングは、栄養相互作用を分離する土壌動物における脂肪酸代謝の評価のための便利なツールとして使用することをお勧めします。

トビムシの新鮮な重量と脂質含量 記述されている実験の過程で NLFAs および PLFAs の内容変わりませんでした大幅時間をかけて大幅24が、供試体の重量がわずかに増加したに対し。両方のパラメーターは、トビムシ標本の体力の良いレベルを示します。脂肪酸組成と同位体分析のためのサンプリング日に対応する実験中のトビムシの新鮮...

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Fatty Acid 13C Isotopologue Profiling Provides Insight into Trophic Carbon Transfer and Lipid Metabolism of Invertebrate Consumers

脂肪酸13C Isotopologue プロファイリング栄養炭素転送および無脊椎動物消費者の脂質代謝への洞察力を提供します。

すなわち、分子全体消費者組織への伝達と脂肪酸の同化脂肪酸の栄養マーカー アプローチ変更が小さい土壌無脊椎動物の脂肪酸代謝の知識のギャップによって妨げられて無またはマイナー。Isotopologue ・ プロファイリングは、栄養相互作用を分離するための貴重なツールとして提供されます。

Fatty acids (FAs) are useful biomarkers in food web ecology because they are typically assimilated as a complete molecule and transferred into consumer ...

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Fatty Acid 13C Isotopologue Profiling Provides Insight into Trophic Carbon Transfer and Lipid Metabolism of Invertebrate Consumers

Identification of Fatty Acids in Bacillus cereus

Identification of Fatty Acids in Bacillus cereus

脂肪酸の同定で<em&gt;セレウス菌</em

The Bacillus species contain branched chain and unsaturated fatty acids (FAs) with diverse positions of the methyl branch (iso or anteiso) and of the ...

Detergent-free Ultrafast Reconstitution of Membrane Proteins into Lipid Bilayers Using Fusogenic Complementary-charged Proteoliposomes.

洗剤無料補完充電プロテオリポソーム融合ペプチドを用いた脂質膜に膜タンパク質の超高速再構成。

Detergents are indispensable for delivery of membrane proteins into 30-100 nm small unilamellar vesicles, while more complex, larger model lipid bilayers ...

Sampling and Pretreatment of Tooth Enamel Carbonate for Stable Carbon and Oxygen Isotope Analysis

安定炭素・酸素同位体分析の炭酸塩のサンプリングと歯のエナメル質の前処理

Stable carbon and oxygen isotope analysis of human and animal tooth enamel carbonate has been applied in paleodietary, paleoecological, and ...

Nitropeptide Profiling and Identification Illustrated by Angiotensin II

アンジオテンシンIIによるニトロペプチドプロファイリングと同定

Protein nitration is one of the most important post-translational modifications (PTM) on tyrosine residues and it can be induced by chemical actions of ...

Isolation of Lipoprotein Particles from Chicken Egg Yolk for the Study of Bacterial Pathogen Fatty Acid Incorporation into Membrane Phospholipids

細菌病原体脂肪酸を膜リン脂質に取り込む研究のための鶏卵黄からのリポタンパク質粒子の単離

Staphylococcus aureus and other Gram-positive pathogens incorporate fatty acids from the environment into membrane phospholipids. During infection, the ...

Detergent-assisted Reconstitution of Recombinant Drosophila Atlastin into Liposomes for Lipid-mixing Assays

Detergent-assisted Reconstitution of Recombinant Drosophila Atlastin into Liposomes for Lipid-mixing Assays

脂質混合アッセイ用リポソームへの組換えショウジョウバエアラストシンの洗剤支援再構成

Membrane fusion is a crucial process in the eukaryotic cell. Specialized proteins are necessary to catalyze fusion. Atlastins are endoplasmic reticulum ...

Profiling Ubiquitin and Ubiquitin-like Dependent Post-translational Modifications and Identification of Significant Alterations

ユビキチンおよびユビキチン様依存性翻訳後修飾のプロファイリングと有意な変化の同定

Ubiquitin (ub) and ubiquitin-like (ubl) dependent post-translational modifications of proteins play fundamental biological regulatory roles within the ...

Optimized Incorporation of Alkynyl Fatty Acid Analogs for the Detection of Fatty Acylated Proteins using Click Chemistry

クリックケミストリーを用いた脂肪酸アシル化タンパク質の検出のためのアルキニル脂肪酸類似体の最適化された組み込み

Fatty acylation, the covalent addition of saturated fatty acids to protein substrates, is important in regulating a myriad of cellular functions in ...

Ganglioside Extraction, Purification and Profiling

ガングリオシドの抽出、精製、プロファイリング

Gangliosides are glycosphingolipids that contain one or more sialic acid residues. They are found on all vertebrate cells and tissues but are especially ...