Name: quantitative and qualitative method for sphingomyelin by lc-ms using two stable isotopically labeled sphingomyelin species
Uploaded: 2018-05-07T13:00:00
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यह काम शिक्षा, संस्कृति, खेल, विज्ञान और जापान के प्रौद्योगिकी (KAKENHI) को K.H. (#15K01691), Y.F. (#15K08625), K.Y. (#26461532), और मंत्रालय से असभ्य रोग परियोजना के अध्ययन के लिए अनुदान के मंत्रालय से एक अनुसंधान अनुदान द्वारा समर्थित किया गया स्वास्थ्य, श्रम और कल् याण (K.Y. #201510032A) । हम इस पांडुलिपि का एक मसौदा संपादन के लिए Edanz समूह (www.edanzediting.com/ac) का शुक्र है ।

उपयोग करने से पहले सभी प्रासंगिक सामग्री सुरक्षा डेटा शीट (MSDS) से परामर्श करें । त्वचा व्युत्पन्न एसएम द्वारा नमूना संदूषण को कम करने के लिए दस्ताने पहनें । वर्तमान प्रोटोकॉल ईगल के न्यूनतम आवश्यक माध?...

<ol>
	<li>Huitema, K., van den Dikkenberg, J., Brouwers, J. F., Holthuis, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+a+family+of+animal+sphingomyelin+synthases.">Identification of a family of animal sphingomyelin synthases.</a> EMBO J. 23 (1), 33-44 (2004).</li><li>Kihara, Y., Mizuno, H., Chun, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lysophospholipid+receptors+in+drug+discovery.">Lysophospholipid receptors in drug discovery.</a> Exp Cell Res. 333 (2), 171-177 (2015).</li><li>Kihara, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthesis+and+degradation+pathways,+functions,+and+pathology+of+ceramides+and+epidermal+acylceramides.">Synthesis and degradation pathways, functions, and pathology of ceramides and epidermal acylceramides.</a> Prog Lipid Res. 63, 50-69 (2016).</li><li>Merrill, A. 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C., Kelly, S., Wang, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sphingolipidomics:+high-throughput,+structure-specific,+and+quantitative+analysis+of+sphingolipids+by+liquid+chromatography+tandem+mass+spectrometry.">Sphingolipidomics: high-throughput, structure-specific, and quantitative analysis of sphingolipids by liquid chromatography tandem mass spectrometry.</a> Methods. 36 (2), 207-224 (2005).</li><li>Houjou, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+and+selective+identification+of+molecular+species+in+phosphatidylcholine+and+sphingomyelin+by+conditional+neutral+loss+scanning+and+MS3.">Rapid and selective identification of molecular species in phosphatidylcholine and sphingomyelin by conditional neutral loss scanning and MS3.</a> Rapid Commun Mass Spectrom. 18 (24), 3123-3130 (2004).</li><li>Hama, K., Fujiwara, Y., Tabata, H., Takahashi, H., Yokoyama, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comprehensive+Quantitation+Using+Two+Stable+Isotopically+Labeled+Species+and+Direct+Detection+of+N-Acyl+Moiety+of+Sphingomyelin.">Comprehensive Quantitation Using Two Stable Isotopically Labeled Species and Direct Detection of N-Acyl Moiety of Sphingomyelin.</a> Lipids. , (2017).</li><li>Bligh, E. 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H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+simple+method+for+the+isolation+and+purification+of+total+lipides+from+animal+tissues.">A simple method for the isolation and purification of total lipides from animal tissues.</a> J Biol Chem. 226 (1), 497-509 (1957).</li><li>Thomas, M. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ozone-induced+dissociation:+elucidation+of+double+bond+position+within+mass-selected+lipid+ions.">Ozone-induced dissociation: elucidation of double bond position within mass-selected lipid ions.</a> Anal Chem. 80 (1), 303-311 (2008).</li><li>Baba, T., Campbell, J. L., Le Blanc, J. C., Baker, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In-depth+sphingomyelin+characterization+using+electron+impact+excitation+of+ions+from+organics+and+mass+spectrometry.">In-depth sphingomyelin characterization using electron impact excitation of ions from organics and mass spectrometry.</a> J Lipid Res. 57 (5), 858-867 (2016).</li><li>Ryan, E., Nguyen, C. Q. N., Shiea, C., Reid, G. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detailed+Structural+Characterization+of+Sphingolipids+via+193+nm+Ultraviolet+Photodissociation+and+Ultra+High+Resolution+Tandem+Mass+Spectrometry.">Detailed Structural Characterization of Sphingolipids via 193 nm Ultraviolet Photodissociation and Ultra High Resolution Tandem Mass Spectrometry.</a> J Am Soc Mass Spectrom. , (2017).</li><li>Pham, H. T., Ly, T., Trevitt, A. J., Mitchell, T. W., Blanksby, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differentiation+of+complex+lipid+isomers+by+radical-directed+dissociation+mass+spectrometry.">Differentiation of complex lipid isomers by radical-directed dissociation mass spectrometry.</a> Anal Chem. 84 (17), 7525-7532 (2012).</li></ol>

वर्तमान गुणात्मक विधि में, हम एक SPC और एक एन-acyl moiety के एमएस3 उत्पाद आयनों प्राप्त की । यह ठीक से दोनों एक SPC और एक N-acyl moiety असाइन करने के लिए महत्वपूर्ण है । यह अंत करने के लिए, यह ध्यान दिया जाना चाहिए कि...

Sphingomyelin (SM) स्तनधारी कोशिकाओं में एक आम sphingolipid है । SM intracellularly1 संश्लेषित और एक sphingosine-1-फॉस्फेट और एक ceramide, जो प्रतिरक्षा कोशिका तस्करी और त्वचा बाधा homeostasis, क्रमशः2में महत्वपूर्ण भूमिका है के रूप में अंय sphingolipids के लिए एक अग्रदूत के रूप में प्रस्तुत है, 3. इस प्रकार, एसएम चयापचय का सटीक विश्लेषण sphingolipids की शारीरिक और रोग भूमिकाओं elucidating के लिए महत्वपूर्ण है ।
एसएम एक ceramide और एक phosphorylcholine है कि ceramide के 1-hydroxy समूह से जुड़ा हुआ है, जो आगे एक sphingosine और एक N-acyl moiety से बना है से बना है । sphingosine और N-acyl moiety दोनों में कार्बन और दोहरे बांड संख्या में एक किस्म ceramide (और SM) प्रजातियों की संख्या में परिणाम है । LC-ईएसआई-ms/ms में हाल ही में अग्रिमों की मात्रात्मक और गुणात्मक विश्लेषण SM4,5के लिए सक्षम किया गया है । गुणात्मक विश्लेषण में, LCB के उत्पाद आयन स्पेक्ट्रा असाइन करके SM के एक sphingoid LCB के कार्बन और दोहरे बांड की संख्या की पहचान की गई । हालांकि, n-acyl moiety की संरचनात्मक जानकारी सीधे प्राप्त नहीं किया गया था क्योंकि इसके इसी उत्पाद आयनों की सूचना नहीं दी गई है, और इसलिए N-acyl moieties के प्रणेता आयनों के बीच विभेदक विश्लेषण द्वारा मुजे किया गया और उत्पाद आयनों दोनों सकारात्मक और नकारात्मक आयन मोड4,5में LCB करने के लिए इसी । इस रिपोर्ट में, हम दोनों LCB और N-acyl moiety के उत्पाद आयनों का पता लगाने के लिए एक विधि वर्तमान में एक साथ एमएस3 मोड का उपयोग ट्रिपल quadrupole और quadrupole रैखिक आयन जाल जन स्पेक्ट्रोमेट्री, जो सटीक संरचनात्मक सुविधा प्रत्येक SM प्रजातियों की अटकलें6।
आयन दमन (या वृद्धि) जैविक नमूनों में मैट्रिक्स की वजह से प्रभाव नियंत्रण रेखा में सटीक ठहराव-ईएसआई-एमएस विश्लेषण में बाधा, और इसलिए, यह समान मैट्रिक्स में ब्याज की सभी analytes के लिए अंशांकन curves का निर्माण करने के लिए वांछनीय है जैविक नमूना है । हालांकि, इस रणनीति संभव नहीं है क्योंकि यह जैविक नमूनों में सभी एसएम प्रजातियों, विशेष रूप से व्यापक विश्लेषण में तैयार करने के लिए लगभग असंभव है । इस प्रकार, यह एक अंशांकन वक्र का निर्माण करने के लिए व्यावहारिक है और जैविक नमूनों में नुकीला एक प्रतिनिधि एसएम प्रजातियों का उपयोग मात्रात्मक श्रृंखला का निर्धारण । हम एक अंशांकन वक्र का निर्माण करने के लिए दो isotopically-लेबल एसएम प्रजातियों का इस्तेमाल किया; एक एक मानक यौगिक के लिए एक आंतरिक मानक और दूसरे के लिए इस्तेमाल किया गया था । हम isotopically की एक छोटी राशि का पता लगाया-लेबल SM प्रजातियों के रूप में एक मानक यौगिक जैविक नमूनों में नुकीला और सफलतापूर्वक एक अंशांकन वक्र और मात्रात्मक श्रेणी6प्राप्त ।

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:737px;" width="738">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">PBS</td>
			<td style="width:131px;">ThermoFisher</td>
			<td style="width:119px;">10010023</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">100 mm tissue culture dish</td>
			<td style="width:131px;">IWAKI</td>
			<td style="width:119px;">3020-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Cell scraper</td>
			<td style="width:131px;">IWAKI</td>
			<td style="width:119px;">9000-220</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Siliconized 2.0 mL tube</td>
			<td style="width:131px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">02-681-321</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Test tube</td>
			<td style="width:131px;">IWAKI</td>
			<td style="width:119px;">TST SCR 16-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Teflon-lined screw cap</td>
			<td style="width:131px;">IWAKI</td>
			<td style="width:119px;">9998CAP415-15</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Disposable glass tube</td>
			<td style="width:131px;">IWAKI</td>
			<td style="width:119px;">9832-1310</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:321px;">CAPCELL PAK C18 ACR 3 &#181;m 1.5 mm I.D. x 100 mm</td>
			<td style="width:131px;">Shiseido</td>
			<td style="width:119px;">92223</td>
			<td>Guard cartridge is inserted into cartridge holder, and linked to C18 column</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:321px;">CAPCELL C18 MGII S-3 2.0 mm x 10 mm GUARD CARTRIDGE</td>
			<td style="width:131px;">Shiseido</td>
			<td style="width:119px;">12197</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Cartridge holder</td>
			<td style="width:131px;">Shiseido</td>
			<td style="width:119px;">12415</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Acetonitrile</td>
			<td style="width:131px;">Wako</td>
			<td style="width:119px;">018-19853</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">2-Propanol (Isopropyl Alcohol)</td>
			<td style="width:131px;">Wako</td>
			<td style="width:119px;">161-09163</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Methanol</td>
			<td style="width:131px;">Wako</td>
			<td style="width:119px;">134-14523</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Formic acid</td>
			<td style="width:131px;">Wako</td>
			<td style="width:119px;">066-00466</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">28% Ammonia water</td>
			<td style="width:131px;">Wako</td>
			<td style="width:119px;">016-03146</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Sonicator (bath type)</td>
			<td style="width:131px;">SHARP</td>
			<td style="width:119px;">UT-206H</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Vortex mixer for glass test tube</td>
			<td style="width:131px;">TAITEC</td>
			<td style="width:119px;">Mix-EVR</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">1.4 mL glass vial</td>
			<td style="width:131px;">Tomsic</td>
			<td style="width:119px;">500-1982</td>
			<td>Samples are stored in 1.4 mL glass vial sealed with screw cap and 8 mm septum at -20&#176;C</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">8 mm septum</td>
			<td style="width:131px;">Tomsic</td>
			<td style="width:119px;">200-3322</td>
			<td>When samples are analyzed, screw caps are replaced with screw caps with slit septum</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Screw cap for 1.4 mm glass vial</td>
			<td style="width:131px;">Tomsic</td>
			<td style="width:119px;">500-2762</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Screw cap with slit septum</td>
			<td style="width:131px;">Shimadzu GLC</td>
			<td style="width:119px;">GLCTV-803</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">PVDF 0.22 &#181;m filter</td>
			<td style="width:131px;">Millipore</td>
			<td style="width:119px;">SLGVR04NL</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:321px;">Triple quadrupole and quadrupole linear ion trap mass spectrometry</td>
			<td style="width:131px;">SCIEX</td>
			<td style="width:119px;">QTRAP4500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:321px;">The software for data acquisition and analysis of product ion spectra</td>
			<td style="width:131px;">SCIEX</td>
			<td style="width:119px;">Analyst</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:321px;">The software for data integration in quantitative analysis</td>
			<td style="width:131px;">SCIEX</td>
			<td style="width:119px;">MultiQuant</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">HPLC system</td>
			<td style="width:131px;">Shimadzu</td>
			<td style="width:119px;">Nexera</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Glass bottle</td>
			<td style="width:131px;">Sansyo</td>
			<td style="width:119px;">85-0002</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">d18:1/24:0 sphingomyelin</td>
			<td style="width:131px;">Avanti Polar Lipids</td>
			<td style="width:119px;">860592P</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Sphingosylphosphorylcholine</td>
			<td style="width:131px;">Merck</td>
			<td style="width:119px;">567735</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Fetal bovine serum</td>
			<td style="width:131px;">ThermoFisher&#160;</td>
			<td style="width:119px;">26140079</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">L-glutamine</td>
			<td style="width:131px;">ThermoFisher&#160;</td>
			<td style="width:119px;">25030081</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:321px;">Penicillin and streptomycin</td>
			<td style="width:131px;">Sigma</td>
			<td style="width:119px;">P4333</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Eagle&#8217;s minimum essential medium</td>
			<td style="width:131px;">Sigma</td>
			<td style="width:119px;">M4655</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

quantitative and qualitative method for sphingomyelin by lc-ms using two stable isotopically labeled sphingomyelin species

हम sphingomyelin (SM) गुणात्मक और मात्रात्मक द्वारा तरल क्रोमैटोग्राफी-electrospray Ionization-मिलकर मास स्पेक्ट्रोमेट्री (LC-ईएसआई-ms/ms) का विश्लेषण करने की एक विधि प्रस्तुत करते हैं । SM एक phosphorylcholine और हाइड्रोफिलिक और hydrophobic घटक के रूप में एक ceramide से बना एक आम sphingolipid है, क्रमशः । sphingoid लांग चेन बेस (LCB) और moiety में एक N-acyl ceramide में कई प्रकार के कारण स्तनधारी कोशिकाओं में एसएम प्रजातियों के एक नंबर मौजूद हैं । इस रिपोर्ट में, हम एक LCB में कार्बन और दोहरे बांड की संख्या का आकलन करने की एक विधि दिखाते हैं और एक N-acyl moiety में उनके इसी उत्पाद आयनों के आधार पर ms/ms/ms (ms3) प्रयोगों में । इसके अतिरिक्त, हम sm प्रजातियों के लेबल वाले दो स्थिर isotopically का उपयोग करके sm के लिए एक मात्रात्मक विश्लेषण विधि प्रस्तुत करते हैं, जो sm quantitation में प्रयुक्त श्रेणी का निर्धारण करने की सुविधा देता है । वर्तमान पद्धति जैविक नमूनों और औद्योगिक उत्पादों जैसे सौंदर्य प्रसाधनों में एसएम प्रजातियों की एक किस्म निस्र्पक में उपयोगी होगी ।

रासायनिक संश्लेषित d18:1/24:0 एसएम (चित्रा 1ए) और d18:1/24:0 हेला कोशिकाओं से निकाले गए लिपिड नमूनों में एसएम (चित्रा 1बी) नियंत्रण रेखा द्वारा विश्लेषण किया गया-ईएसआई...

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Quantitative and Qualitative Method for Sphingomyelin by LC-MS Using Two Stable Isotopically Labeled Sphingomyelin Species

नियंत्रण रेखा से Sphingomyelin के लिए मात्रात्मक और गुणात्मक विधि-MS दो स्थिर Isotopically लेबल Sphingomyelin प्रजातियों का उपयोग

यहां, हम एक प्रोटोकॉल को यों तो क्रमशः और कई प्रतिक्रिया निगरानी और एमएस/ms/ms मोड, का उपयोग कर प्रत्येक sphingomyelin प्रजातियों के योग्य वर्तमान ।

We present a method of analyzing sphingomyelin (SM) qualitatively and quantitatively by liquid chromatography-electrospray Ionization-tandem mass ...

Research

JoVE Journal

Biochemistry

An Efficient Method for the Isolation of Highly Purified RNA from Seeds for Use in Quantitative Transcriptome Analysis

मात्रात्मक Transcriptome विश्लेषण में उपयोग के लिए बीज से उच्च शुद्ध शाही सेना के अलगाव के लिए एक कारगर तरीका

Plant seeds accumulate large amounts of storage reserves comprising biodegradable organic matter. Humans rely on seed storage reserves for food and as ...

A Method for Measuring Metabolism in Sorted Subpopulations of Complex Cell Communities Using Stable Isotope Tracing

जटिल सेल समुदाय स्थिर आइसोटोप ट्रेसिंग के प्रयोग के आधार पर छाँटे गए उप-जनसंख्या में मापने चयापचय के लिए एक विधि

Mammalian cell types exhibit specialized metabolism, and there is ample evidence that various co-existing cell types engage in metabolic cooperation. ...

A Protein Preparation Method for the High-throughput Identification of Proteins Interacting with a Nuclear Cofactor Using LC-MS/MS Analysis

एक प्रोटीन प्रोटीन की उच्च throughput पहचान नियंत्रण रेखा एमएस / एमएस विश्लेषण का प्रयोग एक परमाणु cofactor साथ बातचीत के लिए तैयारी विधि

Transcriptional coregulators are vital to the efficient transcriptional regulation of nuclear chromatin structure. Coregulators play a variety of roles in ...

DNA Polymerase Activity Assay Using Near-infrared Fluorescent Labeled DNA Visualized by Acrylamide Gel Electrophoresis

डीएनए पोलीमरेज़ गतिविधि परख का उपयोग कर के पास अवरक्त फ्लोरोसेंट लेबल डीएनए visualized द्वारा Acrylamide जेल ट्रो

For any enzyme, robust, quantitative methods are required for characterization of both native and engineered enzymes. For DNA polymerases, DNA synthesis ...

Highly Sensitive and Quantitative Detection of Proteins and Their Isoforms by Capillary Isoelectric Focusing Method

अत्यधिक संवेदनशील और मात्रात्मक पता लगाने के प्रोटीन और उनके Isoforms द्वारा केशिका Isoelectric ध्यान केंद्रित विधि

Immunoblotting has become a routine technique in many laboratories for protein characterization from biological samples. The following protocol provides ...

Efficient Purification and LC-MS/MS-based Assay Development for Ten-Eleven Translocation-2 5-Methylcytosine Dioxygenase

कुशल शुद्धि और नियंत्रण रेखा-ms/दस के लिए परख विकास आधारित-ग्यारह Translocation-२ ५-Methylcytosine Dioxygenase

The epigenetic transcription regulation mediated by 5-methylcytosine (5mC) has played a critical role in eukaryotic development. Demethylation of these ...

Ubiquitin Chain Analysis by Parallel Reaction Monitoring

समानांतर प्रतिक्रिया निगरानी द्वारा सर्वव्यापकइन चेन विश्लेषण

Assessment of the global profile of ubiquitin chain topologies within a proteome is of interest to answer a wide range of biological questions. The ...

Single-Molecule Imaging of EWS-FLI1 Condensates Assembling on DNA

डीएनए पर एकत्र होने वाले ईडब्ल्यूएस-एफएलआई 1 कंडेनसेट की एकल-अणु इमेजिंग

The fusion genes resulting from chromosomal translocation have been found in many solid tumors or leukemia. EWS-FLI1, which belongs to the FUS/EWS/TAF15 ...

A Robust Single-Particle Cryo-Electron Microscopy (cryo-EM) Processing Workflow with cryoSPARC, RELION, and Scipion

A Robust Single-Particle Cryo-Electron Microscopy cryo-EM Processing Workflow with cryoSPARC, RELION, and Scipion

एक मजबूत एकल कण क्रायो-इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी (क्रायो-ईएम) क्रायोस्पार्क, RELION, और Scipion के साथ प्रसंस्करण वर्कफ़्लो

Recent advances in both instrumentation and image processing software have made single-particle cryo-electron microscopy (cryo-EM) the preferred method ...

Analyzing the Interaction of Fluorescent-Labeled Proteins with Artificial Phospholipid Microvesicles using Quantitative Flow Cytometry

मात्रात्मक प्रवाह साइटोमेट्री का उपयोग करके कृत्रिम फॉस्फोलिपिड माइक्रोवेसिकल्स के साथ फ्लोरोसेंट-लेबल प्रोटीन की बातचीत का विश्लेषण करना

In the human body, most of the major physiologic reactions involved in the immune response and blood coagulation proceed on the membranes of cells. An ...