Name: replication of the ordered, nonredundant library of pseudomonas aeruginosa strain pa14 transposon insertion mutants
Uploaded: 2018-05-04T13:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Replication of the Ordered, Nonredundant Library of Pseudomonas aeruginosa strain PA14 Transposon Insertion Mutants at JoVE.com

ברצוננו להודות ליסה Philpotts של הספריה הווירטואלית טריידוול MGH להנחיה שלה חפש את מסד הנתונים. עבודה זו נתמכה על ידי איגוד סיסטיק פיברוזיס (YONKER16G0 ו- HURLEY16G0) NIH NIAID (BPH ואייד: R01 A1095338).

התראה: לנצל אמצעי בטיחות BSL-2 רגיל בעת טיפול aeruginosa פ, פתוגניות. אם אתה אדם immunocompromised או יש מצב רפואי מגביר את הרגישות שלך זיהום חיידקי, קח זהירות מיוחדת בעת עבודה עם פ . aeruginosa. להתייעץ עם המשרד אבטחה במוסד שלך ולקבל אישור מהרופא שלכם לפני שעבדה עם PA14 ע נ קבע או ספריות מוטציה של פתוגנים ...

P. aeruginosa PA14NR הינו משאב יקר ערך עבור הקהילה המדעית. לפי לערכת 2017/03 ממסד חיוני אינדיקטורים המדע של Clarivate Analytics,. Liberati et al. (2006) 37, אשר מתאר את בניית ערכת PA14NR, היא מדורגת במקום 1% העליונים של מיקרוביולוגיה פרסומים. Google Scholar דוחות. מעל 600 אזכורים של. Liberati, et al. (2006) לכתב הי?...

Pseudomonas aeruginosa הוא phenotypically, genotypically מגוונת וישימה גראם שליליים חיידק נוכח קרקע, מים, סביבות האנושי ביותר, כמו גם microflora העור. בהשוואה למינים רבים של חיידקים, aeruginosa פ יש גנום גדולה יחסית של Mbp 5.5-7 עם גבוהה G + C תוכן (65-67%). יתר על כן, חלק ניכר את הגנים מעורבים הסתגלות מטבולית, חלק רשתות רגולטוריות, המאפשרות גמישות רבה בתגובה עקה1. פ aeruginosa מבטא שפע של הגורמים התקפה אלימה, תערוכות נטייה כדי ליצור biofilms, הנו היכולת לתאם בין תגובות דרך חישת מרובים מסלולים ו מציג קיבולת הבולטים לפתח עמידות לאנטיביוטיקה סובלנות2,3,4,5,6,7,8. תכונות אלה מציגים אתגרים משמעותיים לטיפול זיהומים הנגרמים על ידי aeruginosa פ.
כרוניות זיהומים aeruginosa פ יכול להתרחש מצבי מחלה רבים. סיסטיק פיברוזיס (CF), מחלה גנטית נגרמת על ידי מוטציה של הגן סיסטיק פיברוזיס Transmembrane מוליכות הרגולטור (CFTR) , התוצאה היא הפרשות inspissated, נגועים בתוך האוויר, ברונכיאקטזיס מתקדמת ובסופו של דבר, למוות כשל נשימתי9. מאת לבגרות, הרוב המכריע של חולים עם CF כרוני נגוע aeruginosa פ, אשר ממלא תפקיד מפתח התחלואה והתמותה הקשורים למחלה זו10. בנוסף, חולים עם כוויות חמורות הפציעות11, tracheostomies12, החלפות פרקים13או קטטרים שכנה14 הם בסיכון לזיהום aeruginosa פ הקשורים ליכולת של החיידקים טופס biofilms ולברוח לארח תגובות דלקתיות15. יתרה מזאת, קולוניזציה מתרחשת ללא תחרות לאחר אוכלוסיה עמידים בפני אנטיביוטיקה מרובות או סובלנית נבחרה דרך טיפול מיקרוביאלית רחבת ספקטרום רציף12,16,17 , 18. הבנה טובה יותר בפתוגנזה של aeruginosa פ יהיו השלכות משמעותיות על מצבי מחלה רבים.
מספר aeruginosa פ קליניים מבודד, כולל זנים PAO1, PA103, PA14, פאק, נחקרו בהרחבה לחקור תכונות שונות של פתוגנזה aeruginosa פ . זן PA14 הוא בידוד קליניים שייך לאחד הנפוצים המשובטים קבוצות ברחבי העולם19,20 , לו לא היה בהרחבה passaged במעבדה. PA14is מאוד מידבק במודלים חוליות של זיהום, עם אנדוטוקסין הבולטים פרופיל21, pili מבנה22, פתוגניות איי23, הקלד מערכת הפרשת השלישי (TTSS), cytotoxicity כלפי מידע יונקים תאים24 ו פרופילים עמידות והתמדה לאנטיביוטיקה25. יתר על כן, PA14 הוא גם מאוד מידבק במערכות דגם פתוגן-פונדקאי רבים, כולל צמח העלה הסתננות מודלים26,27, זיהוםCaenorhabditis elegans מודלים28, 29, חרק מודלים30,31, כמו גם דלקת ריאות העכבר דגמי32,33 , צריבה בעור מודלים34.
ספריות מוטציה הגנום כולו הן אוספים של isogenic מוטציות בגנים חיוניים מהווה כלי רב עוצמה כדי להבין את הביולוגיה של אורגניזם בכך שהוא מאפשר ניתוח של ג'ין פונקציה בקנה מידה גנומית. שני transposon ליד, הרוויה ההכנסה מוטציה ספריות שנבנה ב פ aeruginosa זמינים כעת להפצה. האתרים ההכנסה של טרנספוזונים שנקבע עבור שתי ספריות. ספריות nonredundant כביכול אלה להקל על מחקרים ברמת הגנום של זני חיידקים על ידי להקטין במידה ניכרת את הזמן ואת עלות מעורב ההקרנה uncharacterized מוטציות אקראיות transposon. Aeruginosa פ PAO1 transposon מוטציה הספרייה, שנבנה ב MPAO1 לבודד את זן PAO1 באמצעות טרנספוזונים ISphoA/ הא והואlacZ/ הא35, היא נאצרה על ידי המעבדה Manoil, אוניברסיטת וושינגטון. הספרייה כוללת תבדוק-רצף אוסף של מוטציות transposon 9,437 מספק כיסוי הגנום רחב וכולל שתי מוטציות של גנים רוב36. מידע אודות ספריית מוטנטים של transposon PAO1 aeruginosa פ הוא ציבורי, נגישים לאינטרנט Manoil המעבדה באתר-http://www.gs.washington.edu/labs/manoil/libraryindex.htm. Aeruginosa פ זן PA14 nonredundant transposon ההכנסה מוטציה ספריה (מוגדר PA14NR) נבנה בזן PA14 באמצעות MAR2xT7 ו- Tn טרנספוזוניםphoA37 מופץ כיום על ידי המחלקה לרפואת בבית החולים הכללי במסצ'וסטס. ערכת PA14NR כוללת אוסף של יותר מ- 5,800 מוטציות עם הוספות transposon יחיד בגנים חיוניים37. פרטים על הקמה של ערכת PA14NR מתוארים http://pa14.mgh.harvard.edu/cgi-bin/pa14/home.cgi?section=NR_LIB אתר ציבורי, אינטרנט נגיש, אשר כולל גם מגוון רחב של כלי חיפוש באינטרנט כדי להקל על השימוש PA14NR הגדר.
ערכת PA14NR המקורית כללה מוטציות 5,459, שנבחר מתוך ספרייה מקיפה של 34,000 transposon אקראיים ההכנסה מוטציות, התואמים 4,596 גנים PA14 החזוי המייצגים 77% של כל החזוי PA14 גנים37. מאז הקמת הספרייה בשנת 2006 נוספו המוטנטים החדשים וכוללת כיום ערכת PA14NR 5,800 יותר מוטציות38 המייצגים כ-4,600 מינים גנים PA14. רוב המוטציות transposon PA14 נוצרו על רקע פראי סוג37. פרטים על כל חבר של ספריית מוטנטים, כולל רקע גנטי, זמינים דרך חיפוש במסד הנתונים המקוון, או על-ידי הורדת את הגיליון האלקטרוני של ספריית Nonredundant, שתי תכונות זמין באתר האינטרנט של PA14 (http:// pa14.mgh.harvard.edu/cgi-bin/pa14/home.cgi). רוב המוטציות שנוצרו באמצעות MAR2xT7 של transposon (MrT7), עם קבוצה קטנה שנוצרו באמצעות transposon TnPhoA (phoA)37. בכל transposon יש קלטת של עמידות לאנטיביוטיקה, המאפשר בחירה מוטציה באמצעות גנטמיצין (MrT7) או kanamycin (phoA). ערכת PA14NR של מוטציות מאוחסן בשישים ושלוש 96-ובכן צלחות, כולל בקרה 96-ובכן נוספים שני לוחות, המורכבים מסקטור פראי סוג PA14 מחוסן, בארות uninoculated intercalated בתבנית מוגדרת מראש. התבנית 96-ובכן צלחת לזווג עם כלי החיפוש באינטרנט מאוד מקלה על התפתחות אישית הקרנת מבחני המאפשרים למשתמשים בקלות לזהות גנים הקשורים פנוטיפים מוטציה. כלי החיפוש המקוון להקל גם לחיפוש ובחירת ושכמותי רלוונטיים נוספים הנדרשים ללימודי.
PA14, PAO1 transposon מוטציה הספריות הן במשאבים גלובליים חשוב מאוד עבור הקהילה המדעית, הם משלימים אחד את השני אימות את התפקוד של הגנים לא ידוע מסלולים של פתוגן חיידקי הזה. בצירוף מקרים, מאז הקמת ספריות מוטציה transposon של PAO1 ו- PA14, מלא הגנום אנליזת רצפי דנ מבודד aeruginosa פ רבים הראו כי PAO1 ו- PA14 שייך שונים subclades הגדולות של aeruginosa עמ' האמיניות7,39,40,41. כי קליניים aeruginosa פ מבודד נמצאים מופצים ברחבי האמיניות, העובדה כי PAO1 ו- PA14 שייך שונים aeruginosa פ תת-קבוצות המעלה את ערכו של מוטציה transposon שתי ספריות עבור השוואתי מחקרים.
פרסומים המתארים את הבנייה וסינון של ספריות מוטציה חיידקיים, כולל ספריות aeruginosa פ 35,37,42, זמינים בקלות בספרות. עם זאת, לפי מיטב ידיעתנו, אין פרוטוקולים שפורסמו המתארת הליכים מפורטים ואת טכניקות המשמשות לצורך שכפול, תחזוקה, אימות של חיידקי ספריות מוטציה הינם זמינים.
המתודולוגיה המתוארים בפרסום זה מתאר קבוצה של פרוטוקולים שלושה המאפשרים שימוש ותחזוקה של ערכת PA14NR. הפרוטוקול הראשון מתאר שכפול של הספרייה כמומלץ לנמענים של ערכת PA14NR. פרוטוקול השני כולל הנחיות ומבטא, גדל, ואחסון מוטציות בודדות מזוהה באמצעות ערכת PA14NR. הפרוטוקול השלישי מתאר טכניקות בקרת איכות, כולל PCR הגברה של קטעים מן transposon מוטציות ורצף הבאים כדי לאשר את הזהות מוטציה. זו קבוצה של פרוטוקולים עשוי גם להיות מותאם שכפול ותחזוקה של חיידקי ספריות מוטציה או אוספים אחרים. השכפול של חיידקי ספריות מוטציה או אוספים מומלץ מאוד כדי לשמור על השלמות של "העותק הראשי" (העותק המקורי קיבל). שכפול של מספר עותקים של ערכת PA14NR לשימוש מעבדה שגרתיות ממזער את ההסתברות של זיהום interwell של העותק הראשי.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Materials for Library Replication</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sterile 96-well Tissue-culture treated, case of 50</td>
			<td>Corning Life Sciences</td>
			<td>353072</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sterile 96 Well Clear V-Bottom 2000&#956;L Deep Well Plates, case of 25</td>
			<td>Corning Life Sciences</td>
			<td>3960</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nunc OmniTray (rectangular plates), case of 60</td>
			<td>Thermo Scientific Rochester</td>
			<td>242811</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Rectangular Ice Pan, Midi (4L)</td>
			<td>Corning Life Sciences</td>
			<td>432104</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Secure-Gard Cone Mask, case of 300</td>
			<td>Cardinal Health</td>
			<td>AT7509</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>AluminaSeal, pack of 100</td>
			<td>Diversified Biotech</td>
			<td>ALUM-100</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Breathe-Easy membrane, pack of 100</td>
			<td>Diversified Biotech</td>
			<td>BEM-1</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sterile, individually wrapped, 50mL Solution Trough/Reagent Reservoir, case of 100</td>
			<td>Sorenson</td>
			<td>S50100</td>
			<td>via Westnet Incorporated</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plate roller</td>
			<td>VWR</td>
			<td>60941-118</td>
			<td>via VWR</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cryo Laser Labels - CRYOLAZRTAG 2.64&#34; x 0.277&#34;, pack of 16 sheets</td>
			<td>GA International</td>
			<td>RCL-11T1-WH</td>
			<td>via Labtag.com (template for printing also available from Labtag.com)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96-well replicator</td>
			<td>V &#38; P Scientific, Inc.</td>
			<td>Custom 407C, 3.18mm pin diameter, 57mm long</td>
			<td>via V &#38; P Scientific, Inc.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Multitron Pro, 3mm Shaking incubator</td>
			<td>Infors HT</td>
			<td>l10003P</td>
			<td>via Infors HT</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Picus 12 Channel 50-1200&#956;L Electronic Pipette</td>
			<td>Sartorius</td>
			<td>735491PR</td>
			<td>via Sartorius</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Filter Tips 50-1200&#956;L, pack of 960</td>
			<td>Biohit</td>
			<td>14-559-512</td>
			<td>via Fisher Scientific; use electronic multichannel-compatible tips</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dry Ice</td>
			<td>User-specific vendor</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Materials for Individual Mutant Storage</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fisherbrand Premium Microcentrifuge Tubes: 1.5mL</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>05-408-130</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pipettes (P1000, P200, P20, P2)</td>
			<td>Gilson</td>
			<td>F167370</td>
			<td>via Gilson</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Materials for Quality Control PCR</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fisherbrand Premium Microcentrifuge Tubes: 1.5mL</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>05-408-130</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NanoDrop</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>ND-2000</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PCR Thermocycler</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Omnistrips PCR Tubes with domed lids</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>AB0404</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ART Barrier low-retention pipette tips (10 uL, 100 uL, 1000 uL)</td>
			<td>Molecular BioProducts, Inc.</td>
			<td>Z676543 (10 uL), Z676713 (100 uL), Z676802 (1000 uL)</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pipettes (P1000, P200, P20, P2)</td>
			<td>Gilson</td>
			<td>F167370</td>
			<td>via Gilson</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fisherbrand Premium Microcentrifuge Tubes: 1.5mL</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>05-408-130</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MasterPure DNA Purification Kit</td>
			<td>Epicentre</td>
			<td>MCD85201</td>
			<td>via Epicentre Technologies Corp</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>GeneRuler 1 kb Plus DNA Ladder, ready-to-use</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>SM1333</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RediLoad Loading Buffer</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>750026</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chemicals</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chemicals for Library and Individual Mutant Storage</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glycerol MB Grade, 1L</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>G5516</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LB Broth</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Per 1L dH2O: 10g tryptone, 5g yeast extract, 5g NaCl, 1ml 1N NaOH (Current Protocols in Molecular Biology.&#160; Wiley, 1994.)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tryptone</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>T7293</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Yeast Extract</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>Y1625</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Chloride</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S7653</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Hydroxide</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S8045</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LB&#160; agar</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>See preparation above, add 15g Bacto Agar</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bacto Agar</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>A5306</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gentamicin sulfate, 10g</td>
			<td>BioReagent</td>
			<td>1405-41-0</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Kanamycin sulfate</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>11815024</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethanol, 190 proof</td>
			<td>Decon</td>
			<td>04-355-221</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chemicals for Quality Control PCR</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Primers</td>
			<td>User-preferred vendor</td>
			<td></td>
			<td>See primers listed in Table 3</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Corning cellgro Molecular Biology Grade Water</td>
			<td>Corning</td>
			<td>46000CV</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Taq Polymerase Buffer</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>10342020</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Taq DNA Polymerase, recombinant</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>10342020</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>dNTPs</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>10297018</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agarose</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A9539</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

replication of the ordered, nonredundant library of pseudomonas aeruginosa strain pa14 transposon insertion mutants

Pseudomonas aeruginosa הוא phenotypically, genotypically מגוונת וישימה גראם שליליים חיידק נפוץ בסביבות אנושי. Aeruginosa פ הוא מסוגל ליצור biofilms לפתח עמידות לאנטיביוטיקה, לייצר הגורמים התקפה אלימה, להתפתח במהירות במהלך זיהום כרוני. לפיכך aeruginosa פ יכול לגרום הן אקוטית, כרונית, קשה לטפל בדלקות, וכתוצאה מכך תחלואה משמעותית באוכלוסיות מסוימות החולה. זן aeruginosa פ PA14 הוא בידוד קליני האדם עם מבנה הגנום שנשמרת מדביק מגוון רחב של מחשבים מארחים יונקים ו nonvertebrate, שהופך PA14 זן אטרקטיבי ללמוד את הפתוגן. בשנת 2006, נוצרה מוטציה nonredundant transposon ההכנסה ספריה המכילה מוטציות 5,459 המקביל 4,596 גנים PA14 החזוי. מאז, הפצה של הספרייה PA14 אפשרה את קהילת המחקר להבין טוב יותר את הפונקציה של גנים יחידניים מסלולים מורכבים של aeruginosa פ. שמירה על תקינות הספרייה באמצעות תהליך השכפול דורשת טכניקות טיפול נכונה ומדויקת. לשם כך, כתב יד זה מציג פרוטוקולים המתארים בפרוטרוט השלבים המעורבים ספריית שכפול, בקרת איכות ספריית ואחסון נאות של מוטציות בודדות.

12 עותקים חדשים של ערכת PA14NR היו משוכפלות באמצעות פרוטוקול ואני הערכה בקרת איכות של העותקים החדש שנוצר נערך באמצעות פרוטוקול השלישי.
PA14NR להגדיר לוחות מוטציה יחד עם לוחות בקרה, המורכבים מסקטור פראי סוג PA14 מחוסן, uninoculated בארות intercalated ב כקביעת ...

Watch this Scientific Journal Video about Replication of the Ordered, Nonredundant Library of Pseudomonas aeruginosa strain PA14 Transposon Insertion Mutants at JoVE.com

Replication of the Ordered, Nonredundant Library of Pseudomonas aeruginosa strain PA14 Transposon Insertion Mutants

שכפול של הוזמן, ספריית Nonredundant של Pseudomonas aeruginosa זן PA14 Transposon ההכנסה מוטציות

Pseudomonas aeruginosa זיהום גורם תחלואה משמעותית מארחים פגיע. Nonredundant transposon ההכנסה מוטציה הספרייה של זן aeruginosa פ PA14, כמנהל PA14NR להגדיר, מקלה על ניתוח של ג'ין פונקציונליות בתהליכים רבים. המוצג כאן הוא פרוטוקול כדי ליצור עותקים באיכות גבוהה של ספריית מוטנטים PA14NR להגדיר.

Pseudomonas aeruginosa is a phenotypically and genotypically diverse and adaptable Gram-negative bacterium ubiquitous in human environments. P. aeruginosa ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Replication of the Ordered, Nonredundant Library of Pseudomonas aeruginosa strain PA14 Transposon Insertion Mutants

Co-culture Models of Pseudomonas aeruginosa Biofilms Grown on Live Human Airway Cells

Co-culture Models of Pseudomonas aeruginosa Biofilms Grown on Live Human Airway Cells

Co-מודלים של תרבות Pseudomonas aeruginosa Biofilms גדל על תאים חיים Airway האדם

Bacterial biofilms have been associated with a number of different human diseases, but biofilm development has generally been studied on non-living ...

Pseudomonas aeruginosa and Saccharomyces cerevisiae Biofilm in Flow Cells

Pseudomonas aeruginosa and Saccharomyces cerevisiae Biofilm in Flow Cells

Pseudomonas aeruginosa ו biofilm Saccharomyces cerevisiae בתוך תאים Flow

Many microbial cells have the ability to form sessile microbial communities defined as biofilms that have altered physiological and pathological ...

RNA Isolation of Pseudomonas aeruginosa Colonizing the Murine Gastrointestinal Tract

RNA Isolation of Pseudomonas aeruginosa Colonizing the Murine Gastrointestinal Tract

RNA בידוד Pseudomonas aeruginosa מיישבים את מערכת העיכול Murine

Pseudomonas aeruginosa (PA) infections result in significant morbidity and mortality in hosts with compromised immune systems, such as patients with ...

Long Term Chronic Pseudomonas aeruginosa Airway Infection in Mice

Long Term Chronic Pseudomonas aeruginosa Airway Infection in Mice

כרוני לטווח ארוך<em&gt; Pseudomonas aeruginosa</em&gt; זיהום דרכי הנשימה בעכברים

A mouse model of chronic airway infection is a key asset in cystic fibrosis (CF) research, although there are a number of concerns regarding the model ...

Identification of Novel Genes Associated with Alginate Production in Pseudomonas aeruginosa Using Mini-himar1 Mariner Transposon-mediated Mutagenesis

Identification of Novel Genes Associated with Alginate Production in Pseudomonas aeruginosa Using Mini-himar1 Mariner Transposon-mediated Mutagenesis

זיהוי גנים הקשורים לרומן אלגינט ייצור ב<em&gt; Pseudomonas aeruginosa</em&gt; שימוש מיני<em&gt; Himar1</em&gt; Mutagenesis תיווך transposon מרינר

Pseudomonas aeruginosa is a Gram-negative, environmental bacterium with versatile metabolic capabilities. P. aeruginosa is an opportunistic bacterial ...

Pseudomonas aeruginosa Induced Lung Injury Model

Pseudomonas aeruginosa Induced Lung Injury Model

Pseudomonas aeruginosa מושרה ריאות פגיעה דגם

In order to study human acute lung injury and pneumonia, it is important to develop animal models to mimic various pathological features of this disease. ...

Generation and Multi-phenotypic High-content Screening of Coxiella burnetii Transposon Mutants

Generation and Multi-phenotypic High-content Screening of Coxiella burnetii Transposon Mutants

דור והקרנה גבוהה תוכן רב-פנוטיפי של<em&gt; Burnetii Coxiella</em&gt; מוטאנטים טרנספוזון

Invasion and colonization of host cells by bacterial pathogens depend on the activity of a large number of prokaryotic proteins, defined as virulence ...

Creation of a Dense Transposon Insertion Library Using Bacterial Conjugation in Enterobacterial Strains Such As Escherichia Coli or Shigella flexneri

Creation of a Dense Transposon Insertion Library Using Bacterial Conjugation in Enterobacterial Strains Such As Escherichia Coli or Shigella flexneri

יצירה של צפוף Transposon ההכנסה הספרייה באמצעות קוניוגציה Enterobacterial זנים כגון Escherichia Coli או שיגלה flexneri

Transposon mutagenesis is a method that allows gene disruption via the random genomic insertion of a piece of DNA called a transposon. The protocol below ...

High-throughput Parallel Sequencing to Measure Fitness of Leptospira interrogans Transposon Insertion Mutants During Golden Syrian Hamster Infection

High-throughput Parallel Sequencing to Measure Fitness of Leptospira interrogans Transposon Insertion Mutants During Golden Syrian Hamster Infection

רצף מקביל בתפוקה גבוהה כדי כושר מדד לזיהום Leptospira interrogans Transposon ההכנסה מוטציות במהלך הזהב הסורי אוגר

In this manuscript, we describe a transposon sequencing (Tn-Seq) technique to identify and quantify Leptospira interrogans mutants altered in fitness ...

Generation of In-Frame Gene Deletion Mutants in Pseudomonas aeruginosa and Testing for Virulence Attenuation in a Simple Mouse Model of Infection

Generation of In-Frame Gene Deletion Mutants in Pseudomonas aeruginosa and Testing for Virulence Attenuation in a Simple Mouse Model of Infection

הדור של המסגרת של גן In-Frame מוטציות מחיקה ב פסאודומונס aeruginosa ובדיקת התקפה אלימה מודל עכבר פשוט של זיהום

Microorganisms are genetically versatile and diverse and have become a major source of many commercial products and biopharmaceuticals. Though some of ...