Name: replication of the ordered, nonredundant library of pseudomonas aeruginosa strain pa14 transposon insertion mutants
Uploaded: 2018-05-04T13:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Replication of the Ordered, Nonredundant Library of Pseudomonas aeruginosa strain PA14 Transposon Insertion Mutants at JoVE.com

Veritabanı arama Lisa Philpotts MGH Treadwell sanal kütüphane onun rehberlik için teşekkür etmek istiyorum. Bu eser Kistik Fibrozis Vakfı (YONKER16G0 ve HURLEY16G0) ve NIH NIAID tarafından desteklenmiştir (BPH ve ADE: R01 A1095338).

Dikkat: Standart BSL-2 güvenlik önlemleri P. aeruginosa, insan bir patojen işlerken kullanır. İmmün bireysel veya bakteriyel enfeksiyona yatkınlık artar herhangi bir sağlık sorunu varsa, özel P. ile çalışırken dikkatli aeruginosa. Kurumunuzun Biyogüvenlik ofiste danışmak ve ile çalışmaya başlamadan önce doktorunuza onay almak PA14 NR ayarla veya bakteriyel patojenlerin mutant kitaplıkları.
<img alt="Figure 1" class="xf...

P. aeruginosa PA14NR ayarla bilimsel topluluk için değerli bir kaynaktır. Göre Şubat 2017 dataset Clarivate Analytics'in temel bilim göstergeler veritabanından, Liberati vd. (2006) PA14NR ayarla inşaatı açıklayan, 37, Mikrobiyoloji yayınlar üst % 1 sınıflanır. Google Akademik Liberati vd. , 600'den fazla alıntıları raporları aynı derecede-in Ağustos 2017 orijinal el yazması (2006). Kütüphanede P. aeruginosa patogenezinde temel m...

Pseudomonas aeruginosa phenotypically ve genotypically farklı ve uyarlanabilir Ayagin Gram-negatif bakteri toprak, su ve en insani ortamlar, hem hem içinde cilt mikrofloranın mevcut olduğunu. Birçok bakteri türü için karşılaştırıldığında, P. aeruginosa 5,5-7 Mbp (65-%67) yüksek G + C içerik ile nispeten büyük bir genom vardır. Ayrıca, onun genleri önemli bir bölümünü metabolik adaptasyon katılmaktadırlar ve çevresel stres1yanıt olarak büyük esneklik için izin düzenleyici ağların bir parçasıdır. P. aeruginosa virülans faktörleri bir bolluk ifade eder, meyil formu biyofilmler için sergiler, birden çok çekirdek yolları algılama aracılığıyla yanıt koordine yeteneği sahip ve antibiyotik direnci geliştirmek için önemli bir kapasite görüntüler ve hoşgörü2,3,4,5,6,7,8. Bu öznitelikler P. aeruginosatarafından neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde önemli sorunlar mevcut.
Kronik P. aeruginosa enfeksiyonlar çok sayıda hastalık durumlarında oluşabilir. Kistik fibroz (CF), Kistik fibrozis transmembran gürültülerinden regülatörü (CFTR) gen mutasyon genetik bir hastalığı inspissated, enfekte sekresyonun solunum yolu içinde sonuçları ilerici bronşiektazi ve sonuçta, ölüm solunum yetmezliği9. Yetişkinlik, CF ile hastaların çoğu kronik morbidite ve mortalite ile bu hastalık10ilişkili anahtar bir rol oynayan P. aeruginosa, bulaşmış. Ayrıca, hastalar şiddetli Yanık yaraları11, tracheostomies12, eklem replasmanları13ya da kalıcı kateter14 ile P. aeruginosa enfeksiyon bakteri yeteneği oluşturmak için ilgili etkilenir biyofilmler ve kaçış ana bilgisayar inflamatuar yanıt-e doğru15. Ayrıca, çoklu antibiyotik dirençli ya da hoşgörülü nüfus geniş spektrumlu, sıralı antimikrobiyal tedavi12,16,17 seçildikten sonra kolonizasyon rekabet olmadan oluşur , 18. P. aeruginosa patogenezinde daha iyi anlamak için çok sayıda hastalık durumlarında önemli etkileri olacak.
Suşların PAO1, PA103, PA14 ve PAK, dahil olmak üzere birkaç P. aeruginosa klinik yalıtır P. aeruginosa Patogenez farklı özelliklerini araştırmak için kapsamlı bir şekilde incelenmiştir. Soy PA14 en yaygın klonal gruplar dünya çapında19,20 birine ait olan ve yoğun laboratuvarda pasajlı değil bir klinik izole olduğunu. PA14is enfeksiyon, dikkate değer bir endotoksin ile omurgalı modellerinde son derece öldürücü profil21, pili yapısı22, patojen Adaları23, III salgı sistemi (TTSS) yazın, sitotoksisite doğru memeli hücreleri24 ve antibiyotik direnci ve sebat25profillerinde. Ayrıca, PA14 da çok sayıda ana bilgisayar-patojen modeli sistemlerinde son derece öldürücü, bitki yaprak da dahil olmak üzere26,27infiltrasyon modelleri,Caenorhabditis elegans enfeksiyon modeller28, 29, böcek modelleri30,31, hem de fare pnömoni modelleri32,33 ve cilt yanık modelleri34.
Genom çapında mutant kitaplıkları isogenic mutant gen işlevi analizini genomik bir ölçekte izin vererek bir organizma biyolojisi anlamak için çok güçlü araçlar teşkil önemli olmayan genlerdeki koleksiyonlarıdır. İki doygunluk yakınındaki transposon ekleme mutant kitaplıkları P. aeruginosa içinde inşa şu anda dağıtım için kullanılabilir. Transpozonlar ekleme siteleri her iki kütüphane için tespit edilmiştir. Bu sözde nonredundant kütüphaneler genom genelinde Çalışmalar bakteri suşlarının zamanı önemli ölçüde azaltarak kolaylaştırmak ve söz konusu olursa maliyet tarama uncharacterized rasgele transposon mutantlar. MPAO1 içinde inşa P. aeruginosa PAO1 transposon mutant Kütüphane, izole Transpozonlar IS kullanarak strain PAO1phoA/ hah velacZolduğunu / hah35, küratörlüğünü Manoil lab tarafından Washington Üniversitesi. Kütüphane koleksiyonunun geniş genom kapsama alanı sağlar ve çoğu genler36için iki mutantlar içeren bir sıra doğrulanmış 9,437 transposon mutant oluşur. P. aeruginosa PAO1 transposon mutant kitaplığı hakkında bilgi http://www.gs.washington.edu/labs/manoil/libraryindex.htm, kamu, internet erişimli Manoil lab Web sitesinde mevcuttur. P. aeruginosa zorlanma Transpozonlar MAR2xT7 ve TnphoAkullanarak strain PA1437 yılında inşa nonredundant transposon ekleme mutant kitaplığı (PA14NR Set) şu anda Pediatri bölümü tarafından dağıtılan PA14 Hastane Massachusetts General. PA14NR ayarla tek transposon eklemeleri önemli olmayan genler37' den fazla 5,800 mutantlarla topluluğu oluşur. PA14NR ayarla inşaatı ile ilgili ayrıntılar da içeren çeşitli PA14NR kullanımını kolaylaştırmak için online arama araçları kamu, internet erişimli site http://pa14.mgh.harvard.edu/cgi-bin/pa14/home.cgi?section=NR_LIB içinde açıklanan Ayarlayın.
Orijinal PA14NR ayarla 5,459 mutantlar, tüm tahmin edilen PA14 genler%3777 temsil eden 4,596 tahmin edilen PA14 genler için karşılık gelen yaklaşık 34.000 rasgele transposon ekleme mutantlar, kapsamlı kitaplığından seçilen oluşur. Kütüphane inşaatı 2006 yılında beri yeni mutantlar eklenmiş ve halen yaklaşık 4,600 PA14 genler temsil fazla 5,800 mutantlar38 PA14NR kümesi içerir. PA14 transposon mutantlar çoğunluğu vahşi türü arka plan37yılında üretildi. Detayları da dahil olmak üzere genetik arka plan, mutant kütüphanenin her üye ile ilgili çevrimiçi veritabanı arama yoluyla veya Nonredundant kütüphane elektronik tablo, her iki özellik (http:// PA14 Web sitesinde kullanılabilir indirme mevcuttur pa14.mgh.Harvard.edu/cgi-bin/pa14/Home.cgi). Mutantlar çoğunluğu MAR2xT7 kullanılarak oluşturulan TnPhoA (phoA) transposon37kullanılarak oluşturulan küçük bir set ile (MrT7) transposon. Her transposon gentamisin (MrT7) veya sefaloridin (phoA) kullanarak mutant seçim için izin verir bir antibiyotik direnci kaset var. Mutantlar PA14NR kümesi 63 96-şey levha depolanır ve kaplamalar, vahşi türü PA14 oluşur aşısını iki ek 96-şey denetimi içerir ve az wells bir hazır ayar deseni ara. Çevrimiçi arama araçları ile büyük ölçüde eşleştirilmiş 96-şey plaka biçimi kolayca mutant fenotipleri ile ilişkili genlerin tanımlamak, kullanıcıların deneyleri eleme özel geliştirme kolaylaştırır. Çevrimiçi arama araçları da arama ve seçim daha fazla çalışmalar için gerekli ek ilgili mutantların kolaylaştırmak.
PA14 ve PAO1 transposon mutant kitaplıklar bilimsel toplum için çok önemli küresel kaynaklar ve onlar birbirlerini tamamlayıcı bilinmeyen genlerin fonksiyonun ve yollar bu bakteriyel patojenin doğrulanıyor. Tesadüfen, PAO1 ve PA14 transposon mutasyon kitaplıklar inşaat beri PAO1 ve PA14 P. aeruginosa farklı büyük subclades için ait tam-genom DNA sıralama analizi birçok P. aeruginosa yalıtır göstermiştir phylogeny7,39,40,41. Klinik P. aeruginosa izole ediyor çünkü bulundu phylogeny PAO1 ve PA14 için farklı P. aeruginosa ait aslında boyunca dağıtılmış alt gruplar iki transposon mutasyon kitaplıkları için karşılaştırmalı değerini artırır çalışmalar.
İnşaat açıklayan ve P. aeruginosa kitaplıkları35,de dahil olmak üzere, bakteri mutasyona uğramış kütüphanelerin eleme yayınlar37,42, literatürde hazır. Ancak, bizim bilgi en iyi şekilde açıklayan ayrıntılı yordamlar ve çoğaltma için kullanılan teknikler hiçbir yayımlanmış bakım ve bakteri mutasyona uğramış kütüphanelerin doğrulama kullanılabilir iletişim kurallarıdır.
Bu yayında sıraladı metodoloji, kullanımı kolaylaştıran üç iletişim kuralları kümesi ve bakım PA14NR kümesi açıklar. İlk protokol çoğaltma Kütüphane PA14NR ayarla alıcıları için önerilen biçimde açıklamaktadır. İkinci Protokolü çizgiler, büyüyen ve bireysel mutant PA14NR ayarla kullanarak tanımlanan depolamak için yönergeler içerir. Kalite kontrol teknikleri, transposon mutantlar parçalardan amplifikasyon PCR ve mutant kimliğini onaylamak için sonraki sıralama dahil olmak üzere üçüncü protokolünü açıklar. Bu iletişim kuralları kümesi de çoğaltma ve diğer bakteri mutasyona uğramış kitaplıkları veya koleksiyonları bakım için adapte olabilir. Bakteri mutasyona uğramış kitaplıkları veya koleksiyonları çoğaltılması son derece "ana kopya" bütünlüğünü korumak için tavsiye edilir (orijinal kopya aldı). Çoğaltma kümesinin PA14NR rutin laboratuvar kullanım için birkaç kopya ana kopya interwell bulaşma olasılığını en aza indirir.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Materials for Library Replication</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sterile 96-well Tissue-culture treated, case of 50</td>
			<td>Corning Life Sciences</td>
			<td>353072</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sterile 96 Well Clear V-Bottom 2000&#956;L Deep Well Plates, case of 25</td>
			<td>Corning Life Sciences</td>
			<td>3960</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nunc OmniTray (rectangular plates), case of 60</td>
			<td>Thermo Scientific Rochester</td>
			<td>242811</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Rectangular Ice Pan, Midi (4L)</td>
			<td>Corning Life Sciences</td>
			<td>432104</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Secure-Gard Cone Mask, case of 300</td>
			<td>Cardinal Health</td>
			<td>AT7509</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>AluminaSeal, pack of 100</td>
			<td>Diversified Biotech</td>
			<td>ALUM-100</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Breathe-Easy membrane, pack of 100</td>
			<td>Diversified Biotech</td>
			<td>BEM-1</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sterile, individually wrapped, 50mL Solution Trough/Reagent Reservoir, case of 100</td>
			<td>Sorenson</td>
			<td>S50100</td>
			<td>via Westnet Incorporated</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plate roller</td>
			<td>VWR</td>
			<td>60941-118</td>
			<td>via VWR</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cryo Laser Labels - CRYOLAZRTAG 2.64&#34; x 0.277&#34;, pack of 16 sheets</td>
			<td>GA International</td>
			<td>RCL-11T1-WH</td>
			<td>via Labtag.com (template for printing also available from Labtag.com)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96-well replicator</td>
			<td>V &#38; P Scientific, Inc.</td>
			<td>Custom 407C, 3.18mm pin diameter, 57mm long</td>
			<td>via V &#38; P Scientific, Inc.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Multitron Pro, 3mm Shaking incubator</td>
			<td>Infors HT</td>
			<td>l10003P</td>
			<td>via Infors HT</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Picus 12 Channel 50-1200&#956;L Electronic Pipette</td>
			<td>Sartorius</td>
			<td>735491PR</td>
			<td>via Sartorius</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Filter Tips 50-1200&#956;L, pack of 960</td>
			<td>Biohit</td>
			<td>14-559-512</td>
			<td>via Fisher Scientific; use electronic multichannel-compatible tips</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dry Ice</td>
			<td>User-specific vendor</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Materials for Individual Mutant Storage</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fisherbrand Premium Microcentrifuge Tubes: 1.5mL</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>05-408-130</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pipettes (P1000, P200, P20, P2)</td>
			<td>Gilson</td>
			<td>F167370</td>
			<td>via Gilson</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Materials for Quality Control PCR</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fisherbrand Premium Microcentrifuge Tubes: 1.5mL</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>05-408-130</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NanoDrop</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>ND-2000</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PCR Thermocycler</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Omnistrips PCR Tubes with domed lids</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>AB0404</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ART Barrier low-retention pipette tips (10 uL, 100 uL, 1000 uL)</td>
			<td>Molecular BioProducts, Inc.</td>
			<td>Z676543 (10 uL), Z676713 (100 uL), Z676802 (1000 uL)</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pipettes (P1000, P200, P20, P2)</td>
			<td>Gilson</td>
			<td>F167370</td>
			<td>via Gilson</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fisherbrand Premium Microcentrifuge Tubes: 1.5mL</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>05-408-130</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MasterPure DNA Purification Kit</td>
			<td>Epicentre</td>
			<td>MCD85201</td>
			<td>via Epicentre Technologies Corp</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>GeneRuler 1 kb Plus DNA Ladder, ready-to-use</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>SM1333</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RediLoad Loading Buffer</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>750026</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chemicals</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chemicals for Library and Individual Mutant Storage</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glycerol MB Grade, 1L</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>G5516</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LB Broth</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Per 1L dH2O: 10g tryptone, 5g yeast extract, 5g NaCl, 1ml 1N NaOH (Current Protocols in Molecular Biology.&#160; Wiley, 1994.)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tryptone</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>T7293</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Yeast Extract</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>Y1625</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Chloride</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S7653</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Hydroxide</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S8045</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LB&#160; agar</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>See preparation above, add 15g Bacto Agar</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bacto Agar</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>A5306</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gentamicin sulfate, 10g</td>
			<td>BioReagent</td>
			<td>1405-41-0</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Kanamycin sulfate</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>11815024</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethanol, 190 proof</td>
			<td>Decon</td>
			<td>04-355-221</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chemicals for Quality Control PCR</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Primers</td>
			<td>User-preferred vendor</td>
			<td></td>
			<td>See primers listed in Table 3</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Corning cellgro Molecular Biology Grade Water</td>
			<td>Corning</td>
			<td>46000CV</td>
			<td>via Fisher Scientific</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Taq Polymerase Buffer</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>10342020</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Taq DNA Polymerase, recombinant</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>10342020</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>dNTPs</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>10297018</td>
			<td>via ThermoFisher</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agarose</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A9539</td>
			<td>via Sigma-Aldrich</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

replication of the ordered, nonredundant library of pseudomonas aeruginosa strain pa14 transposon insertion mutants

Pseudomonas aeruginosa phenotypically ve genotypically farklı ve uyarlanabilir Ayagin Gram-negatif bakteri insan ortamlarda her yerde var. P. aeruginosa biyofilmler formu, antibiyotik direnci geliştirmek, virülans faktörleri üretmek ve hızla gelişmeye kronik bir enfeksiyon sırasında yapabiliyor. Böylece P. aeruginosa hem akut ve kronik, enfeksiyonları, tedavisi zor bazı hasta nüfus önemli morbidite sonuçlanan neden olabilir. P. aeruginosa yük PA14 çeşitli PA14 bu patojen çalışmak için çekici bir zorlanma yapma memeli ve nonvertebrate ana bilgisayarları bozar bir korunmuş genom yapısı ile bir insan klinik izole olduğunu. 2006 yılında 5,459 mutantlar 4,596 tahmin edilen PA14 genler için karşılık gelen içeren nonredundant transposon ekleme mutant bir kütüphane oluşturulmuştur. O zamandan beri PA14 Kütüphane dağılımı bireysel genlerin fonksiyonun ve P. aeruginosakarmaşık yollar daha iyi anlamak araştırma topluluğu izin verdi. Çoğaltma işlemi boyunca Kütüphane bütünlük bakımından uygun taşıma ve hassas teknikler gerektirir. Bu amaçla, bu el yazması ayrıntılı adımları Kütüphane çoğaltma, Kütüphane kalite kontrol ve bireysel mutant uygun depolama yer tarif iletişim kuralları sunar.

On iki yeni kopyalarını PA14NR ayarla ben ve üretilen yeni kopya bir kalite kontrol değerlendirme protokolü III kullanılarak gerçekleştirilmiştir protokolünü kullanarak çoğaltılmış.
PA14NR mutant plaka ile birlikte kontrol levha, vahşi türü PA14 oluşur aşılamaya ve hazır ayar deseni (şekil 4A) ara wells az, çoğaltılmış ayarla methology Protokolü ı. denetiminde açıkla...

Watch this Scientific Journal Video about Replication of the Ordered, Nonredundant Library of Pseudomonas aeruginosa strain PA14 Transposon Insertion Mutants at JoVE.com

Replication of the Ordered, Nonredundant Library of Pseudomonas aeruginosa strain PA14 Transposon Insertion Mutants (Video) | JoVE

Sipariş edilmiş, Pseudomonas aeruginosa baskı PA14 Transposon ekleme mutantlar Nonredundant Kütüphane çoğaltılması

Pseudomonas aeruginosa enfeksiyon savunmasız konaklarda önemli morbidite neden olur. Nonredundant transposon ekleme mutant Kütüphane P. aeruginosa baskı PA14 PA14NR grubu olarak belirlenmiş, analiz çok sayıda süreçlerde gen işlevlerinin kolaylaştırır. Burada sunulan yüksek kaliteli PA14NR ayarla mutant kitaplığın kopyalarını oluşturmak üzere bir protokoldür.

Pseudomonas aeruginosa is a phenotypically and genotypically diverse and adaptable Gram-negative bacterium ubiquitous in human environments. P. aeruginosa ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Replication of the Ordered, Nonredundant Library of Pseudomonas aeruginosa strain PA14 Transposon Insertion Mutants

Co-culture Models of Pseudomonas aeruginosa Biofilms Grown on Live Human Airway Cells

Co-culture Models of Pseudomonas aeruginosa Biofilms Grown on Live Human Airway Cells (Video) | JoVE

Co-kültür Modelleri Pseudomonas aeruginosa</emCanlı İnsan Havayolu Hücreler Yetiştirilen> Biyofilmler

Bacterial biofilms have been associated with a number of different human diseases, but biofilm development has generally been studied on non-living ...

Pseudomonas aeruginosa and Saccharomyces cerevisiae Biofilm in Flow Cells

Pseudomonas aeruginosa and Saccharomyces cerevisiae Biofilm in Flow Cells (Video) | JoVE

Pseudomonas aeruginosa ve Saccharomyces cerevisiae Biyofilm Akış Hücreler

Many microbial cells have the ability to form sessile microbial communities defined as biofilms that have altered physiological and pathological ...

RNA Isolation of Pseudomonas aeruginosa Colonizing the Murine Gastrointestinal Tract

RNA Isolation of Pseudomonas aeruginosa Colonizing the Murine Gastrointestinal Tract (Video) | JoVE

RNA İzolasyonu Pseudomonas aeruginosa Murin Gastrointestinal Yolu koloniler

Pseudomonas aeruginosa (PA) infections result in significant morbidity and mortality in hosts with compromised immune systems, such as patients with ...

Long Term Chronic Pseudomonas aeruginosa Airway Infection in Mice

Long Term Chronic Pseudomonas aeruginosa Airway Infection in Mice (Video) | JoVE

Uzun Vadeli Kronik<em&gt; Pseudomonas aeruginosa</emFarelerde&gt; Havayolu Enfeksiyon

A mouse model of chronic airway infection is a key asset in cystic fibrosis (CF) research, although there are a number of concerns regarding the model ...

Identification of Novel Genes Associated with Alginate Production in Pseudomonas aeruginosa Using Mini-himar1 Mariner Transposon-mediated Mutagenesis

Identification of Novel Genes Associated with Alginate Production in Pseudomonas aeruginosa Using Mini-himar1 Mariner Transposon-mediated Mutagenesis (Video) | JoVE

Alginat içinde üretimi ile ilişkili yeni genlerin tanımlanması<em&gt; Pseudomonas aeruginosa</emKullanma&gt; Mini-<em&gt; Himar1</em&gt; Mariner Transposon dolayımlı mutagenez

Pseudomonas aeruginosa is a Gram-negative, environmental bacterium with versatile metabolic capabilities. P. aeruginosa is an opportunistic bacterial ...

Pseudomonas aeruginosa Induced Lung Injury Model

Pseudomonas aeruginosa Induced Lung Injury Model (Video) | JoVE

Pseudomonas aeruginosa Kaynaklı Akciğer Hasarı Modeli

In order to study human acute lung injury and pneumonia, it is important to develop animal models to mimic various pathological features of this disease. ...

Generation and Multi-phenotypic High-content Screening of Coxiella burnetii Transposon Mutants

Generation and Multi-phenotypic High-content Screening of Coxiella burnetii Transposon Mutants (Video) | JoVE

Üretim ve Çok fenotipik Yüksek içerik Eleme<em&gt; Coxiella burnetii</em&gt; Transposon Mutantlar

Invasion and colonization of host cells by bacterial pathogens depend on the activity of a large number of prokaryotic proteins, defined as virulence ...

Creation of a Dense Transposon Insertion Library Using Bacterial Conjugation in Enterobacterial Strains Such As Escherichia Coli or Shigella flexneri

Creation of a Dense Transposon Insertion Library Using Bacterial Conjugation in Enterobacterial Strains Such As Escherichia Coli or Shigella flexneri (Video) | JoVE

Bir yoğun Transposon ekleme kütüphane kullanarak bakteriyel konjugasyon Escherichia Coli Enterobacterial suşları gibi veya Shigella flexneri oluşturulması

Transposon mutagenesis is a method that allows gene disruption via the random genomic insertion of a piece of DNA called a transposon. The protocol below ...

High-throughput Parallel Sequencing to Measure Fitness of Leptospira interrogans Transposon Insertion Mutants During Golden Syrian Hamster Infection

High-throughput Parallel Sequencing to Measure Fitness of Leptospira interrogans Transposon Insertion Mutants During Golden Syrian Hamster Infection (Video) | JoVE

Yüksek üretilen iş paralel sıralama ölçü Fitness Leptospira interrogans Transposon ekleme mutantlar sırasında altın Suriye Hamster enfeksiyon için

In this manuscript, we describe a transposon sequencing (Tn-Seq) technique to identify and quantify Leptospira interrogans mutants altered in fitness ...

Generation of In-Frame Gene Deletion Mutants in Pseudomonas aeruginosa and Testing for Virulence Attenuation in a Simple Mouse Model of Infection

Generation of In-Frame Gene Deletion Mutants in Pseudomonas aeruginosa and Testing for Virulence Attenuation in a Simple Mouse Model of Infection (Video) | JoVE

Pseudomonas aeruginosa In-Frame Gen Silme Mutantlar Üretimi ve Enfeksiyon Basit Bir Fare Modelinde Virülans Zayıflama sıiçin Test

Microorganisms are genetically versatile and diverse and have become a major source of many commercial products and biopharmaceuticals. Though some of ...