Name: bioindication testing of stream environment suitability for young freshwater pearl mussels using in situ exposure methods
Uploaded: 2018-09-05T15:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Bioindication Testing of Stream Environment Suitability for Young Freshwater Pearl Mussels Using In Situ Exposure Methods at JoVE.com

Michal Bílý och Ondřej P. Simon stöddes av bidrag från den tjeckiska universitet av Life Science [inre bevilja byrån av fakulteten miljövetenskap, CULS Prag (42110 1312 3175 (20164236))]. Stöd för Karel Douda kom från den tjeckiska vetenskapsstiftelsen (13-05872S). Uppgifter om bioindication och nuvarande förekomst av pärla musslorna samlades in under genomförandet av den tjeckiska handlingsplanen för Freshwater Pearl musslor förvaltas av byråns natur bevarande av Republiken Tjeckien, som finansieras av regeringen av den Tjeckien och finns på

1. mesh bur
Obs: Se figur 1.
<ol><li>Förbered materialet
	<ol>
<li>Förbered materialet för i-laboratoriet delen av experimentet: ~ 1-2 L floden vatten per mesh bur, mesh burar (1 plast huvuddel, 2 plast omslag, 2 ark av särskilda tekniska siktar med 340 µm porer, 4 bultar och 4 muttrar per bur), tång , Pasteur-pipetter, en digitalkamera, en sil, käppar, en Trinokulärt dissekera zoom stereo Mikroskop, ett kalibrering rutnät (Mikroskop ut...

<ol>
	<li>Goldberg, E. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+mussel+watch-a+first+step+in+global+marine+monitoring.">The mussel watch-a first step in global marine monitoring.</a> Marine Pollution Bulletin. 6 (7), 111-114 (1975).</li><li>Vaughn, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ecosystem+services+provided+by+freshwater+mussels.">Ecosystem services provided by freshwater mussels.</a> Hydrobiologia. , (2017).</li><li>Lopes-Lima, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Conservation+status+of+freshwater+mussels+in+Europe:+state+of+the+art+and+future+challenges.">Conservation status of freshwater mussels in Europe: state of the art and future challenges.</a> Biological Reviews. 92 (1), 572-607 (2017).</li><li>Strayer, D. L., Malcom, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Causes+of+recruitment+failure+in+freshwater+mussel+populations+in+southeastern+New+York.">Causes of recruitment failure in freshwater mussel populations in southeastern New York.</a> Ecological Applications. 22 (6), 1780-1790 (2012).</li><li>Douda, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+nitrate+nitrogen+pollution+on+Central+European+unionid+bivalves+revealed+by+distributional+data+and+acute+toxicity+testing.">Effects of nitrate nitrogen pollution on Central European unionid bivalves revealed by distributional data and acute toxicity testing.</a> Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems. 20 (2), 189-197 (2010).</li><li>Modesto, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fish+and+mussels:+importance+of+fish+for+freshwater+mussel+conservation.">Fish and mussels: importance of fish for freshwater mussel conservation.</a> Fish and Fisheries. , (2017).</li><li>Bauer, G., W&#228;chtler, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Ecology and evolution of the freshwater mussels Unionoida. 145, 1-394 (2001).</li><li>Neves, R. J., Widlak, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Habitat+ecology+of+juvenile+fresh-water+mussels+(Bivalvia,+Unionidae)+in+a+headwater+stream+in+Virginia.">Habitat ecology of juvenile fresh-water mussels (Bivalvia, Unionidae) in a headwater stream in Virginia.</a> American Malacological Bulletin. 5, 1-7 (1987).</li><li>&#352;vanyga, J., Simon, O. P., Min&#225;rikov&#225;, T., Spisar, O., B&#237;l&#253;, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Z&#225;chrann&#253; program pro perlorodku &#345;&#237;&#269;n&#237; v &#268;R (Action plan for the endangered freshwater pearl mussel in the Czech Republic). , (2013).</li><li>Schmidt, C., Vandr&#233;, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ten+years+of+experience+in+the+rearing+of+young+freshwater+pearl+mussels+(Margaritifera+margaritifera).">Ten years of experience in the rearing of young freshwater pearl mussels (Margaritifera margaritifera).</a> Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems. 20 (7), 735-747 (2010).</li><li>Gum, B., Lange, M., Geist, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+critical+reflection+on+the+success+of+rearing+and+culturing+juvenile+freshwater+mussels+with+a+focus+on+the+endangered+freshwater+pearl+mussel+(Margaritifera+margaritifera+L.).">A critical reflection on the success of rearing and culturing juvenile freshwater mussels with a focus on the endangered freshwater pearl mussel (Margaritifera margaritifera L.).</a> Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems. 21 (7), 743-751 (2011).</li><li>Denic, M., Taeubert, J. E., Lange, M., Thielen, F., Scheder, C., Gumpinger, C., Geist, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Influence+of+stock+origin+and+environmental+conditions+on+the+survival+and+growth+of+juvenile+freshwater+pearl+mussels+(Margaritifera+margaritifera)+in+a+cross-exposure+experiment.">Influence of stock origin and environmental conditions on the survival and growth of juvenile freshwater pearl mussels (Margaritifera margaritifera) in a cross-exposure experiment.</a> Limnologica. 50, 67-74 (2015).</li><li>&#268;ern&#225;, M., Simon, O. P., B&#237;l&#253;, M., Douda, K., Dort, B., Galov&#225;, M., Volfov&#225;, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Within-river+variation+in+growth+and+survival+of+juvenile+freshwater+pearl+mussels+assessed+by+in+situ+exposure+methods.">Within-river variation in growth and survival of juvenile freshwater pearl mussels assessed by in situ exposure methods.</a> Hydrobiologia. , (2017).</li><li>Denic, M., Taeubert, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trophic+relationships+between+the+larvae+of+two+freshwater+mussels+and+their+fish+hosts.">Trophic relationships between the larvae of two freshwater mussels and their fish hosts.</a> Invertebrate Biology. 134 (2), 129-135 (2015).</li><li>Douda, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Host-dependent+vitality+of+juvenile+freshwater+mussels:+implications+for+breeding+programs+and+host+evaluation.">Host-dependent vitality of juvenile freshwater mussels: implications for breeding programs and host evaluation.</a> Aquaculture. 445, 5-10 (2015).</li><li>Buddensiek, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+culture+of+juvenile+freshwater+pearl+mussels+Margaritifera+margaritifera+L.+in+cages:+a+contribution+to+conservation+programmes+and+the+knowledge+of+habitat+requirements.">The culture of juvenile freshwater pearl mussels Margaritifera margaritifera L. in cages: a contribution to conservation programmes and the knowledge of habitat requirements.</a> Biological Conservation. 74 (1), 33-40 (1995).</li><li>Hru&#353;ka, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Experience+of+semi-natural+breeding+program+of+freshwater+pearl+mussel+in+the+Czech+Republic.">Experience of semi-natural breeding program of freshwater pearl mussel in the Czech Republic.</a> Die Flussperlmuschel in Europa: Bestandssituation und Schutzma&#223;nahmen. , 69-75 (2001).</li><li>Barnhart, M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Buckets+of+muckets:+a+compact+system+for+rearing+juvenile+freshwater+mussels.">Buckets of muckets: a compact system for rearing juvenile freshwater mussels.</a> Aquaculture. 254 (1), 227-233 (2006).</li><li>Simon, O. P., Van&#237;&#269;kov&#225;, I., B&#237;l&#253;, M., Douda, K., Patzenhauerov&#225;, H., Hru&#353;ka, J., Pelt&#225;nov&#225;, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+status+of+freshwater+pearl+mussel+in+the+Czech+Republic:+several+successfully+rejuvenated+populations+but+the+absence+of+natural+reproduction.">The status of freshwater pearl mussel in the Czech Republic: several successfully rejuvenated populations but the absence of natural reproduction.</a> Limnologica. 50, 11-20 (2015).</li><li>. A language and environment for statistical computing Available from: <a target="_blank" href="https://www.r-project.org/">https://www.r-project.org/</a> (2013)</li><li>Hastie, L. C., Yang, M. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Conservation of the freshwater pearl mussel I: captive breeding techniques. 2, (2003).</li><li>Hru&#353;ka, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nahrungsanspr&#252;che+der+Flu&#223;perlmuschel+und+deren+halbnat&#252;rliche+Aufzucht+in+der+Tschechischen+Republik.">Nahrungsanspr&#252;che der Flu&#223;perlmuschel und deren halbnat&#252;rliche Aufzucht in der Tschechischen Republik.</a> Heldia. 4 (6), 69-79 (1999).</li><li>Scheder, C., Lerchegger, B., Jung, M., Csar, D., Gumpinger, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Practical+experience+in+the+rearing+of+freshwater+pearl+mussels+(Margaritifera+margaritifera):+advantages+of+a+work-saving+infection+approach,+survival,+and+growth+of+early+life+stages.">Practical experience in the rearing of freshwater pearl mussels (Margaritifera margaritifera): advantages of a work-saving infection approach, survival, and growth of early life stages.</a> Hydrobiologia. 735 (1), 203-212 (2014).</li><li>Braun, A., Auerswald, K., Geist, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Drivers+and+spatio-temporal+extent+of+hyporheic+patch+variation:+implications+for+sampling.">Drivers and spatio-temporal extent of hyporheic patch variation: implications for sampling.</a> PLoS ONE. 7 (7), e42046 (2012).</li><li>Franken, R. J. M., Storey, R. G., Williams, D. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biological,+chemical+and+physical+characteristics+of+downwelling+and+upwelling+zones+in+the+hyporheic+zone+of+a+north-temperate+stream.">Biological, chemical and physical characteristics of downwelling and upwelling zones in the hyporheic zone of a north-temperate stream.</a> Hydrobiologia. , 183-195 (2001).</li><li>Roley, S. S., Tank, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pore+water+physicochemical+constraints+on+the+endangered+clubshell+mussel+(Pleurobema+clava).">Pore water physicochemical constraints on the endangered clubshell mussel (Pleurobema clava).</a> Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 73 (12), 1712-1722 (2016).</li><li>Larson, J. H., Eckert, N. L., Bartsch, M. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intrinsic+variability+in+shell+and+soft+tissue+growth+of+the+freshwater+mussel+Lampsilis+siliquoidea.">Intrinsic variability in shell and soft tissue growth of the freshwater mussel Lampsilis siliquoidea.</a> PLoS ONE. 9 (11), e112252 (2014).</li><li>Lavictoire, L., Moorkens, E., Ramsey, A. D., Sinclair, W., Sweeting, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+substrate+size+and+cleaning+regime+on+growth+and+survival+of+captive-bred+juvenile+freshwater+pearl+mussels,+Margaritifera+(Linnaeus,+1758).">Effects of substrate size and cleaning regime on growth and survival of captive-bred juvenile freshwater pearl mussels, Margaritifera (Linnaeus, 1758).</a> Hydrobiologia. 766 (1), 89-102 (2015).</li><li>Hru&#353;ka, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Experience+of+semi-natural+breeding+programme+of+freshwater+pearl+mussel+in+the+Czech+Republic.">Experience of semi-natural breeding programme of freshwater pearl mussel in the Czech Republic.</a> Die Flussperlmuschel in Europa: Bestandssituation und Schutzmassnahmen. , 69-75 (2000).</li><li>Bayne, B. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Physiological+components+of+growth+differences+between+individual+oysters+(Crassostrea+gigas)+and+a+comparison+with+Saccostrea+commercialis.">Physiological components of growth differences between individual oysters (Crassostrea gigas) and a comparison with Saccostrea commercialis.</a> Physiological and Biochemical Zoology. 72 (6), 705-713 (1999).</li><li>Tamayo, D., Azpeitia, K., Markaide, P., Navarro, E., Ibarrola, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Food+regime+modulates+physiological+processes+underlying+size+differentiation+in+juvenile+intertidal+mussels+Mytilus+galloprovincialis.">Food regime modulates physiological processes underlying size differentiation in juvenile intertidal mussels Mytilus galloprovincialis.</a> Marine Biology. 163 (6), (2016).</li></ol>

Exponeringstid:
Även månads utsatta mesh burar Visa en synlig tillväxt som återspeglar skillnader mellan orterna (figur 3), så de är mycket användbara för snabb och enkel detektion av en tätort karakterisering. Relevansen av resultaten beror dock på kortsiktiga tillståndet av villkorar, som kan svänga. Särskilt kan korta regn händelser spela en roll. Däremot kan oförutsägbara episodiska föroreningar inte alltid registreras. I ort V (<strong class="x...

Exponeringen av experimentella organismer i situ med efterföljande utvärdering av deras tillstånd är ett möjligt sätt att få information om miljökvalitet och (speciellt) plats lämplighet för en art. Inom djur är en sådan bioindication tillämplig främst för små ryggradslösa djur som klarar leva i ett begränsat avgränsat utrymme. Unga stadier av musslor (Bivalvia) är en sådan lämplig organism grupp1.
Musslor i familjen målarmusslor är en mycket viktig komponent i akvatiska ekosystem2. Emellertid, dessa arter är ofta akut hotad, särskilt i bäckar och åar. Några av dem kännetecknas som 'paraply art' vars bevarande är nära relaterad till bevarande av hela strömmen biotopen och som kräver en omfattande strategi3. Dessa djur har en livscykel som är associerad med många miljö komponenter, från vatten kemi4,5 till förändringar i bestånden av fisk som tjänar som mussla larver värdar6. Eftersom musslan ungfisk representerar ofta en kritisk fas av mussla livscykel, är plats lämplighet för deras utveckling i detta skede avgörande för en framgångsrik arter befolkningsutvecklingen i en tätort.
Flodpärlmusslan (FWPM, Margaritifera margaritifera; Unionida, Bivalvia) är en akut hotad tvåskaliga förekommande i Oligotrofa Europeiska strömmar. Deras antal har sjunkit drastiskt under 20- talet över området förekomst. Det verkar som att den nuvarande nedgången i arter reproduktion i majoriteten av de centrala europeiska befolkningarna främst orsakas av mycket låg till noll överlevnad av ungfisk under de första åren av sitt liv. Det antas att juvenil FWPMs leva i många år i den grunda hyporheic zon7, där villkoren och deras variabilitet fortfarande inte är väl beskrivna. Dessutom tills deras andra levnadsåret har Ungfåglarna bara en dimension av upp till ca 1 mm, så de är mycket svåra att hitta i stora mängder sediment under naturliga förhållanden8. Experiment med fångenskap ungfisk är därför nödvändiga för att studera deras ekologi.
Inom tjeckiska handlingsplanen för Pearl flodpärlmusslan9, finns det tusentals ungfisk stigande varje år från ett delvis naturliga avelsprogram. Det finns dock en fråga som localities och livsmiljöer är lämpliga för framgångsrika befolkningen stöd genom dessa ungfisk eller för eventuell arter återinförande. In situ bioindications presenterar ett sätt att hitta svaret.
Trots att inkonsekventa överlevnaden av juvenil musslor i exponering burar observerades i några tidigare arbeten som ifrågasatte lämpligheten av juvenil musslor som bioindikatorer10, flera färska studier har bekräftat den tillämpligheten av juvenil exponering metoder för vattenkvalitet testning11,12,13. Det har dessutom visat att flera faktorer måste beaktas när man tolkar resultaten av dessa särskilda studier, såsom lager ursprung14 och de ihållande effekterna av larval villkor15.
Frågan är hur man installerar experimentella ungfisk i testade localities och hur man mest effektivt utvärdera deras tillstånd. Den första strikta tillämpningen av i situ exponering metoder med juvenil FWPMs publicerades av Buddensiek16. Juvenil FWPM individer hölls i ark burar, exponeras i det fri strömmande vattnet strömmar, och deras överlevnad och tillväxt kvantifierades efter flera veckors exponering. Metoden utvecklades ursprungligen som en semi konstgjorda avel metod, men författaren framhöll också dess tillämplighet för bedömning av krav på livsmiljö och vattenkvalitet. Även om FWPM juvenil överlevnad är naturligtvis mycket låg på en skala från månader/år och endast ett mycket litet antal djur kommer överleva, överlevnaden kan vara en bra markör för miljöpåverkan på en skala från flera veckor16. Över år av forskning utvecklades exponering metoder vidare håll experimentella juvenil mussla InStream-livsmiljöer och att utvärdera deras tillväxt och överlevnad priser; Dessa inkluderar sandiga fälten17, mussla silor utifrån en uppvällning princip18, och olika andra exponering burar (sammanfattas av tuggummi och kollegor)11. Eftersom ungdomar förekommer naturligt i grunt hyporheic zon7, är tillämpningen av experimentella enheter inom stream botten mycket önskvärt.
I vår artikel, vi beskriver användningen av två exponering enheter för FWPMs: jag) modified Buddensiek ark burar (”mesh burar”) gör det möjligt för bioindication testning under hyporheal förhållanden. och ii) Hruška sandiga lådor (”sandiga burar”). Protokollet beskrivs tillämpningen av båda metoderna i öppet vatten och hyporheic förhållanden (dvsfyra varianter av exponeringen beskrivs). Metoderna ändrades gradvis och expanderat under mer än 15 år av ansökan inom den tjeckiska handlingsplanen för Pearl flodpärlmusslan9 och verifierade av en uppsättning experiment.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>biological material maintenance and care</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Freshwater pearl mussel juveniles</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td>from a FWPM breeding programme</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic boxes</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>thermobox</td>
			<td>MERCI</td>
			<td>212,070,600,030</td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>field thermobox (ca25 l)</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td>cold box (insulated box) commonly used for food transport</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>river water</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Petri dishes</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic Pasteur pipettes with balloon bulb (droppers)</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td>hole diameter 1 mm</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>hydrogen peroxide</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic container (ca 50 l) for river water</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic tea strainer</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td>commonly used in kitchen</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>mesh cages construction</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>main plastic bodies</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plactic covers</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>special technical sieves 340 &#181;m</td>
			<td>Silk &#38;Progress</td>
			<td>UHELON 20 T</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>special technical sieves 100 &#181;m</td>
			<td>Silk &#38;Progress</td>
			<td>UHELON 67 M</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>rubber hose (diameter&#160; 5.5 mm)</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>steel bolts</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>steel nuts</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>spanner</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>steel spikes</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>pliers</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>beakers</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic dishes (ca. 25x15x3-5cm)</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>squirt bottle</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>field protocols</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>stationery</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic container</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>string</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>hammer</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>sandy cages construction and use</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>sieve 1 mm</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>sieve 2 mm</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>special technical sieves 340 &#181;m</td>
			<td>Silk &#38;Progress</td>
			<td>UHELON 20 T</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic boxes with tight-fitting lid</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>hot melt adhesive</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic box (ca 250 x 150 x 100 cm)</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>big plastic box (ca 25 l)</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>flat stone</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>net</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>river sand</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>round containers</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>magnifying glasses</td>
			<td>Carson</td>
			<td>Carson CP 60</td>
			<td>There ar many possibilities. This is one example only</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>cages installation and maintenance</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>field temperature dataloggers</td>
			<td>ONSET</td>
			<td>UA-001-64</td>
			<td>http://www.onsetcomp.com/products/data-loggers/ua-001-64</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>spade</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>toothbrush</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>experiment evaluation</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>trinocular dissecting zoom stereo microscope</td>
			<td>Bresser optic</td>
			<td>ICD 10x-160x</td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>digital camera/ electronic eyepiece</td>
			<td>Bresser optic</td>
			<td>MikroCamLab 5M</td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Calibration&#160; gird</td>
			<td>Am Scope</td>
			<td>SKU: MR100</td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>external power source with two movable light guides</td>
			<td>Arsenal</td>
			<td>K1309010150021</td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Image software</td>
			<td>ImageJ software</td>
			<td></td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>table processor</td>
			<td>MS excel</td>
			<td></td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

bioindication testing of stream environment suitability for young freshwater pearl mussels using in situ exposure methods

Kunskap om habitat lämplighet för sötvatten musslor är ett viktigt steg i bevarandet av denna utrotningshotade arter grupp. Vi beskriver ett protokoll för att utföra i situ juvenil exponering tester inom Oligotrofa floden avrinningsområden över en månad och tre månaders perioder. Två metoder (i båda ändringar) presenteras för att utvärdera andelen juvenil tillväxt och överlevnad. De metoder och ändringar variera i värde för den ort bioindication och varje har dess fördelar samt begränsningar. Metoden sandstranden bur fungerar med ett stort antal individer, men endast några av individerna mäts och resultaten utvärderas i bulk. I metoden mesh bur individerna hålls och mäts separat, men ett lågt enskilda nummer utvärderas. Öppet vatten exponering ändringen är relativt lätt att tillämpa. Det visar den juvenila tillväxten potential av platser och kan också vara effektiva för vatten toxicitetstester. Inom-säng exponering ändringen behöver en hög arbetsbelastning men är närmare villkoren i en juvenil natur och det är bättre för rapportering av verkliga lämpligheten av localities. Däremot, behövs mer replikeringar i denna ändring på grund av dess hög-hyporheic miljö variabilitet.

De fyra bioindication metoder (öppet vatten sandstranden burar, inom-säng sandstranden burar, öppna vatten mesh burar och inom-säng mesh burar) tillämpades för att undersöka miljön skick lämplighet för FWPMs i övre Vltava avrinningsområdet (Böhmerwald, Tjeckien Republiken). Denna flod representerar en FWPM kvarstående ort inom centrala Europa19. Här presenterar vi ett speciellt utvalda uppsättning resultat som illustrerar de viktigaste aspekterna av...

Watch this Scientific Journal Video about Bioindication Testing of Stream Environment Suitability for Young Freshwater Pearl Mussels Using In Situ Exposure Methods at JoVE.com

Bioindication Testing of Stream Environment Suitability for Young Freshwater Pearl Mussels Using In Situ Exposure Methods

In situ bioindications möjliggör bestämning av lämpligheten av en miljö för hotad mussla arter. Vi beskriver två metoder baserade på sötvatten pärla musslorna i burar juvenil exponering för Oligotrofa floden livsmiljöer. Båda metoderna genomförs i varianter för öppet vatten och hyporheic vattenmiljöer.

Bioindication provning av Stream miljö lämplighet för ung sötvatten pärla musslorna med i Situ exponering metoder

Knowledge of habitat suitability for freshwater mussels is an important step in the conservation of this endangered species group. We describe a protocol ...

Research

JoVE Journal

Environment

Bioindication Testing of Stream Environment Suitability for Young Freshwater Pearl Mussels Using In Situ Exposure Methods

EPA Method 1615. Measurement of Enterovirus and Norovirus Occurrence in Water by Culture and RT-qPCR. I. Collection of Virus Samples

EPA Metod 1615. Mätning av Enterovirus och Norovirus förekomst i vatten efter kultur och RT-qPCR. I. Insamling av virusprov

EPA Method 1615 was developed with a goal of providing a standard method for measuring enteroviruses and noroviruses in environmental and drinking waters. ...

EPA Method 1615. Measurement of Enterovirus and Norovirus Occurrence in Water by Culture and RT-qPCR. II. Total Culturable Virus Assay

EPA Method 1615 Mätning av Enterovirus och Norovirus förekomst i vatten efter kultur och RT-qPCR. II. Total odlingsbara virus Assay

A standardized method is required when national studies on virus occurrence in environmental and drinking waters utilize multiple analytical laboratories. ...

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Förståelse Upplöst Organiskt material Biogeochemistry Genom<em&gt; In Situ</em&gt; Närings manipulationer i Stream ekosystem

Dissolved organic matter (DOM) is a highly diverse mixture of molecules providing one of the largest sources of energy and nutrients to stream ecosystems. ...

Preparation of Authigenic Pyrite from Methane-bearing Sediments for In Situ Sulfur Isotope Analysis Using SIMS

Preparation of Authigenic Pyrite from Methane-bearing Sediments for In Situ Sulfur Isotope Analysis Using SIMS

Beredning av Authigenic pyrit från metan-bärande sediment för In Situ svavel isotopen analys använder SIMS

Different sulfur isotope compositions of authigenic pyrite typically result from the sulfate-driven anaerobic oxidation of methane (SO4-AOM) and ...

Development of New Methods for Quantifying Fish Density Using Underwater Stereo-video Tools

Utveckling av nya metoder för kvantifiering av fisk densitet med undervattens Stereo-video verktyg

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and ...

Experimental Methods of Dust Charging and Mobilization on Surfaces with Exposure to Ultraviolet Radiation or Plasmas

Experimentella metoder av damm laddning och mobilisering på ytor med exponering för ultraviolett strålning eller plasmor

Electrostatic dust transport has been hypothesized to explain a number of observations of unusual planetary phenomena. Here, it is demonstrated using ...

In Situ Hybridization Techniques for Paraffin-Embedded Adult Coral Samples

In Situ Hybridization Techniques for Paraffin-Embedded Adult Coral Samples

In Situ Hybridisering tekniker för Paraffin-inbäddat vuxen korall prover

Corals are important ocean invertebrates that are critical for overall ocean health as well as human health. However, due to human impacts such as rising ...

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster (Nephrops norvegicus)

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus

Långsiktiga Video spårning av Cohoused vattenlevande djur: en fallstudie av den daglig rörelseaktivitet på havskräfta (Nephrops norvegicus)

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

A New Portable In Vitro Exposure Cassette for Aerosol Sampling

A New Portable In Vitro Exposure Cassette for Aerosol Sampling

En ny bärbar In Vitro exponering kassett för Aerosol provtagning

This protocol introduces a new in vitro exposure system, capable of being worn, including its characterization and performance. Air-liquid interface (ALI) ...

Identifying Per- and Polyfluorinated Chemical Species with a Combined Targeted and Non-Targeted-Screening High-Resolution Mass Spectrometry Workflow

Att identifiera- och Polyfluorinated kemiska arter med en kombinerad riktade och icke-riktade-Screening högupplösande masspektrometri-arbetsflöde

Historical and emerging per- and polyfluoroalkyl substances (PFASs) have garnered significant interest from the public and government agencies from the ...