Name: the barnacle balanus improvisus as a marine model - culturing and gene expression
Uploaded: 2018-08-08T14:00:00
Duration: 7 min 47 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about The Barnacle Balanus improvisus as a Marine Model - Culturing and Gene Expression at JoVE.com

وأيد هذا البحث منحة عام 2017-04559 من مجلس البحوث السويدية (VR) ومشروع الاتحاد الأوروبي دعم الواجهة البحرية إلى بلومبرغ أندرس. على وجه الخصوص، إنشاء مرفق تثقيف، على مر السنوات، حظي بدعم من المنح لكل جونسون R. من وكالات التمويل التالية: صندوق الضمان الاجتماعي (المؤسسة السويدية للبحوث الاستراتيجية) من خلال برنامج "العلوم البحرية" والتكنولوجيا و MISTRA من خلال برنامج "الرسام البحرية". برنتسون كينت بدور فعال في المراحل الأولى من إعداد كولتورينجفاسيليتي. مزيد من التمويل لإنشاء مرفق تثقيف قد تأتي من المركز "علم الأحياء التطوري البحرية" (www.cemeb.science.gu.se)، وهو يؤيد بمنحه لينيوس من FORMAS مجالس الأبحاث السويدية والواقع الافتراضي.

<ol>
	<li>Darwin, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A monograph of the sub-class Cirripedia, with figures of all species. The Balanidae (or sessile cirripedes); the Verrucidae, etc., etc., etc. , (1854).</li><li>Lind, U., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+aquaporins+from+the+euryhaline+barnacle+Balanus+improvisus+reveals+differential+expression+in+response+to+changes+in+salinity.">Analysis of aquaporins from the euryhaline barnacle Balanus improvisus reveals differential expression in response to changes in salinity.</a> PLoS ONE. 12 (7), 0181192 (2017).</li><li>Lind, U., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+characterization+of+the+alpha-subunit+of+Na+/K++ATPase+from+the+euryhaline+barnacle+Balanus+improvisus+reveals+multiple+genes+and+differential+expression+of+alternative+splice+variants.">Molecular characterization of the alpha-subunit of Na+/K+ ATPase from the euryhaline barnacle Balanus improvisus reveals multiple genes and differential expression of alternative splice variants.</a> PLoS ONE. 8, 77069 (2013).</li><li>Fyhn, H. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Holeuryhalinity+and+its+mechanisms+in+a+cirriped+crustacean,+Balanus+improvisus.">Holeuryhalinity and its mechanisms in a cirriped crustacean, Balanus improvisus.</a> Comparative Biochemistry and Physiology - Part A: Comparative Physiology. 53 (1), 19-30 (1976).</li><li>Wrange, A. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+story+of+a+hitchhiker:+population+genetic+patterns+in+the+invasive+barnacle+Balanus+(Amphibalanus)+improvisus+Darwin+1854.">The story of a hitchhiker: population genetic patterns in the invasive barnacle Balanus (Amphibalanus) improvisus Darwin 1854.</a> PLoS ONE. 11 (1), 0147082 (2016).</li><li>Berntsson, K. M., Jonsson, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Temporal+and+spatial+patterns+in+recruitment+and+succession+of+a+temperate+marine+fouling+assemblage:+a+comparison+of+static+panels+and+boat+hulls+during+the+boating+season.">Temporal and spatial patterns in recruitment and succession of a temperate marine fouling assemblage: a comparison of static panels and boat hulls during the boating season.</a> Biofouling. 19 (3), 187-195 (2003).</li><li>Lind, U., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Octopamine+receptors+from+the+barnacle+Balanus+improvisus.+are+activated+by+the+alpha2-adrenoceptor+agonist+medetomidine.">Octopamine receptors from the barnacle Balanus improvisus. are activated by the alpha2-adrenoceptor agonist medetomidine.</a> Molecular Pharmacology. 78 (2), 237-248 (2010).</li><li>Semmler, H., Hoeg, J. T., Scholtz, G., Wanninger, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Three-dimensional+reconstruction+of+the+naupliar+musculature+and+a+scanning+electron+microscopy+atlas+of+nauplius+development+of+Balanus+improvisus+(Crustacea:+Cirripedia:+Thoracica).">Three-dimensional reconstruction of the naupliar musculature and a scanning electron microscopy atlas of nauplius development of Balanus improvisus (Crustacea: Cirripedia: Thoracica).</a> Arthropod Structure &amp; Development. 38 (2), 135-145 (2009).</li><li>Anderson, D. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Barnacles - structure, function, development and evolution. , (1994).</li><li>Kennedy, V. S., DiCosimo, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Subtidal+distribution+of+barnacles+in+Chesapeake+Bay,+Maryland.">Subtidal distribution of barnacles in Chesapeake Bay, Maryland.</a> Estuaries. 6, 95-101 (1983).</li><li>Dreanno, C., Kirby, R. R., Clare, A. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Locating+the+barnacle+settlement+pheromone:+spatial+and+ontogenetic+expression+of+the+settlement-inducing+protein+complex+of+Balanus+amphitrite.">Locating the barnacle settlement pheromone: spatial and ontogenetic expression of the settlement-inducing protein complex of Balanus amphitrite.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 273, 2721-2728 (2006).</li><li>Rittschoff, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cues+and+context:+larval+responses+to+physical+and+chemical+cues.">Cues and context: larval responses to physical and chemical cues.</a> Biofouling. 12 (1-3), 31-44 (1998).</li><li>Berntsson, K. M., Jonsson, P. R., Lejhall, M., Gatenholm, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+behavioural+rejection+of+micro-textured+surfaces+and+implications+for+recruitment+by+the+barnacle+Balanus+improvisus.">Analysis of behavioural rejection of micro-textured surfaces and implications for recruitment by the barnacle Balanus improvisus.</a> Journal of Experimental Marine BIology and Ecology. 251 (1), 59-83 (2000).</li><li>Gamfeldt, L., Wall&#233;n, J., Jonsson, P. R., Berntsson, K. M., Havenhand, J. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Increasing+intraspecific+diversity+enhances+settling+success+in+a+marine+invertebrate.">Increasing intraspecific diversity enhances settling success in a marine invertebrate.</a> Ecology. 86, 3219-3224 (2005).</li><li>Rittschof, D., Clare, A. S., Gerhart, D. J., Sister Avelin, M., Bonaventura, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Barnacle+in+vitro+assays+for+biologically+active+substances:+toxicity+and+settlement+inhibition+assays+using+mass+cultured+Balanus+amphitrite+amphitrite+Darwin.">Barnacle in vitro assays for biologically active substances: toxicity and settlement inhibition assays using mass cultured Balanus amphitrite amphitrite Darwin.</a> Biofouling. 6 (2), 115-122 (1992).</li><li>Pansch, C., Schaub, I., Havenhand, J., Wahl, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Habitat+traits+and+food+availability+determine+the+response+of+marine+invertebrates+to+ocean+acidification.">Habitat traits and food availability determine the response of marine invertebrates to ocean acidification.</a> Global Change Biology. 20 (3), 765-777 (2014).</li><li>Guillard, R. R. L., Smith, W. L., Chanley, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Culture+of+phytoplankton+for+feeding+marine+invertebrates.">Culture of phytoplankton for feeding marine invertebrates.</a> Culture of marine invertebrate animals. , 22-60 (1975).</li><li>Wrange, A. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Importance+of+plasticity+and+local+adaptation+for+coping+with+changing+salinity+in+coastal+areas:+a+test+case+with+barnacles+in+the+Baltic+Sea.">Importance of plasticity and local adaptation for coping with changing salinity in coastal areas: a test case with barnacles in the Baltic Sea.</a> BMC Evolutionary Biology. 14, 156 (2014).</li><li>Bacchetti De Gregoris, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Construction+of+an+adult+barnacle+(Balanus+amphitrite)+cDNA+library+and+selection+of+reference+genes+for+quantitative+RT-PCR+studies.">Construction of an adult barnacle (Balanus amphitrite) cDNA library and selection of reference genes for quantitative RT-PCR studies.</a> BMC Molecular Biology. 10, 62 (2009).</li><li>Winnebeck, E. C., Millar, C. D., Warman, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Why+does+insect+RNA+look+degraded.">Why does insect RNA look degraded.</a> Journal of Insect Science. 10, 159 (2010).</li><li>Panova, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=DNA+extraction+protocols+for+whole-genome+sequencing+in+marine+organisms.">DNA extraction protocols for whole-genome sequencing in marine organisms.</a> Methods in Molecular BIology. 1452, 13-44 (2016).</li><li>Berglin, M., Larsson, A., Jonsson, P., Paul Gatenholm, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+adhesion+of+the+barnacle,+Balanus+improvisus,+to+poly(dimethylsiloxane)+fouling-release+coatings+and+poly(methyl+methacrylate)+panels:+the+effect+of+barnacle+size+on+strength+and+failure+mode.">The adhesion of the barnacle, Balanus improvisus, to poly(dimethylsiloxane) fouling-release coatings and poly(methyl methacrylate) panels: the effect of barnacle size on strength and failure mode.</a> Journal of Adhesion Science and Technology. 15, 1485-1502 (2001).</li><li>Larsson, A. I., Granhag, L. M., Jonsson, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Instantaneous+flow+structures+and+opportunities+for+larval+settlement:+barnacle+larvae+swim+to+settle.">Instantaneous flow structures and opportunities for larval settlement: barnacle larvae swim to settle.</a> PLoS ONE. 11, 0158957 (2016).</li><li>Toth, G. B., Lindeborg, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Water-soluble+compounds+from+the+breadcrumb+sponge+Halichondria+panicea.+deter+attachment+of+the+barnacle+Balanus+improvisus.">Water-soluble compounds from the breadcrumb sponge Halichondria panicea. deter attachment of the barnacle Balanus improvisus.</a> Marine Ecology Progress Series. 354, 125-132 (2008).</li><li>Pansch, C., Jonsson, P. R., Berglin, M., Pinori, E., Wrange, A. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+flow-through+bioassay+for+testing+low-emission+antifouling+coatings.">A new flow-through bioassay for testing low-emission antifouling coatings.</a> Biofouling. 33 (8), 613-623 (2017).</li><li>Walne, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Observation+of+food+value+of+7+species+of+algae+to+larvae+of+Ostrea+edulis+1.+Feeding+experiments.">Observation of food value of 7 species of algae to larvae of Ostrea edulis 1. Feeding experiments.</a> Journal of the Marine Biological Associateion of the UK. 43, 767-784 (1963).</li><li>Sandnes, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Real-time+monitoring+and+automatic+density+control+of+large-scale+microalgal+cultures+using+near+infrared+(NIR)+optical+density+sensors.">Real-time monitoring and automatic density control of large-scale microalgal cultures using near infrared (NIR) optical density sensors.</a> Journal of Biotechnology. 122 (2), 209-215 (2006).</li><li>Neufeldt, C. J., Palmer, A. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Precisely+proportioned:+intertidal+barnacles+alter+penis+form+to+suit+coastal+wave+action.">Precisely proportioned: intertidal barnacles alter penis form to suit coastal wave action.</a> Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences. 275, 1081-1087 (2008).</li><li>Dunstan, G., Volkman, J., Barrett, S., Leroi, J., Jeffrey, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Essential+polyunsaturated+fatty+acids+from+14+species+of+diatom+(Bacillariophyceae).">Essential polyunsaturated fatty acids from 14 species of diatom (Bacillariophyceae).</a> Phytochemistry. 35, 155-161 (1994).</li><li>Jonsson, P. R., Berntsson, K., Andr&#233;, C., W&#228;ngberg, S. -. &. #. 1. 9. 7. ;. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Larval+growth+and+settlement+of+the+European+oyster+(Ostrea+edulis)+as+a+function+of+food+quality+measured+as+fatty+acid+composition.">Larval growth and settlement of the European oyster (Ostrea edulis) as a function of food quality measured as fatty acid composition.</a> Marine Biology. 134 (3), 559-570 (1999).</li><li>Comps, M., Bonami, J. R., Vago, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Virus-disease+of+Portuguese+oyster+(Crassostrea+angulata.+lmk).">Virus-disease of Portuguese oyster (Crassostrea angulata. lmk).</a> Comptes rendus hebdomadaires des s&#233;ances de l'Acad&#233;mie des Sciences. S&#233;rie D, Sciences naturelles. 282, 1991-1993 (1976).</li><li>Segarra, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+and+description+of+a+particular+Ostreid+herpesvirus.+1+genotype+associated+with+massive+mortality+outbreaks+of+Pacific+oysters,+Crassostrea+gigas,+in+France+in+2008.">Detection and description of a particular Ostreid herpesvirus. 1 genotype associated with massive mortality outbreaks of Pacific oysters, Crassostrea gigas, in France in 2008.</a> Virus Research. 153 (1), 92-99 (2010).</li><li>Suquet, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Survival,+growth+and+reproduction+of+cryopreserved+larvae+from+a+marine+invertebrate,+the+Pacific+oyster+(Crassostrea+gigas).">Survival, growth and reproduction of cryopreserved larvae from a marine invertebrate, the Pacific oyster (Crassostrea gigas).</a> PLoS ONE. 9 (4), 93486 (2014).</li><li>Mart&#237;nez-P&#225;ramo, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cryobanking+of+aquatic+species.">Cryobanking of aquatic species.</a> Aquaculture. 472, 156-177 (2017).</li><li>Anil, A. C., Tulaskar, A. S., Khandeparkar, D. C., Wagh, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cryopreservation+of+Balanus+amphitrite+nauplii.">Cryopreservation of Balanus amphitrite nauplii.</a> Cryobiology. 34, 131-140 (1997).</li><li>Oo, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cryopreservation+of+nauplius+larvae+of+the+barnacle,+Balanus+amphitrite+Darwin.">Cryopreservation of nauplius larvae of the barnacle, Balanus amphitrite Darwin.</a> Fisheries Science. 64, 857-860 (1998).</li><li>Lin, H. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=First+study+on+gene+expression+of+cement+proteins+and+potential+adhesion-related+genes+of+a+membranous-based+barnacle+as+revealed+from+next-generation+sequencing+technology.">First study on gene expression of cement proteins and potential adhesion-related genes of a membranous-based barnacle as revealed from next-generation sequencing technology.</a> Biofouling. 30 (2), 169-181 (2014).</li></ol>

الكتاب ليس لها علاقة بإعلان.

البرنقيل هي القشريات البحرية مع بالغ لاطئة والعوالق، وتخترق اليرقات. معظم الأنواع 1,200 من الإوز تعيش في المياه الضحلة وكثير كثيرا ما يتعرض للملوحة منخفضة. أحد الأنواع، أوزة خليج يرتجل بالانوس (أمفيبالانوس) (إيمبروفيسوس)، يمكن أن يتسامح مع ما يقرب من المياه العذبة، وتشارلز داروين ووصف هذا النوع من تيار صغير في مصب نهر ريو دي لابلاتا في أوروغواي1. يجعل التسامح الشديد الملوحة تولو إيمبروفيسوس باء- نموذج ذات أهمية خاصة لدراسة آليات أوسموريجولاتوري2،3. هذا أوزة تفضل ظروف الملوحة ولكن قادر على العيش في المياه مع الملوحة من حوالي 1.6 الأمير سلطان ليصل إلى 40 جامعة الأمير سلطان4. فمن الأنواع أوزة الوحيدة الموجودة في بحر البلطيق الملوحة. ويعتقد أن تنشأ من الساحل الشرقي للقارة الأمريكية إيمبروفيسوس باء- لكن اليوم وجدت في جميع أنحاء العالم بسبب تشتت الشحن5. هو كائن قاذورات رئيسية ويوجد عادة في الصخور، والأرصفة، وبدن السفينة، وذلك للمصلحة العامة لفهم آليات الآخذين في الإنشاءات في المياه البحرية والمائلة للملوحة6،7.
على غرار معظم الإوز الأخرى، إيمبروفيسوس باء- هيرمافروديتيك مع تبادل الخبرات؛ يحدث التكاثر عن طريق التزاوج بين الأفراد المجاورة استخدام القضيب ممدود والإخصاب داخلي. فترة الإنجاب أساسا من أيار/مايو إلى أيلول/سبتمبر. وقد إيمبروفيسوس سبع مراحل اليرقات البحرية (ستة النوبليوس تليها مرحلة سيبريد واحدة8). البوابات البويضة المخصبة إلى يرقة ناوبليوس التي تخترق ويغذي في عمود الماء لتصل إلى عدة أسابيع قبل الصوف إلى يرقة سيبريد غير تغذية. يستخدم إشارات متعددة إلى العثور على موقع مناسب لتسوية سيبريد ويخضع ثم تحول إلى أوزة الأحداث لاطئة9. الأنواع التي يمكن أن تكون مثقف في المختبر وعمر 1 – 2 سنة في البحر (2 – 3 سنوات في مختبر الثقافة). في المتوسط، إيمبروفيسوس باء- ينمو إلى 10 ملم في القطر (بحد أقصى يبلغ حوالي 20 ملم)، ويصل إلى أقصى ارتفاع حوالي 6 مم (على الرغم من أنه يمكن أن يزداد طولاً في ظروف مزدحمة). يمكن أن تكون الأنواع التي حددتها شل حتى كلسية السلس (أبيض أو رمادي)، قاعدة كلسية منقوشة إشعاعيا لصفيحة شل، والشكل1،لوحات تيرجال10.
أوزة إيمبروفيسوس باء- لديها العديد من الميزات مفيدة كنموذج للدراسات أوسموريجوليشن، مع تركيز على الآليات الجزيئية والفيزيولوجية وكذلك التفاعلات الإيكولوجية وعواقب التطوري. فإنه يستخدم أيضا على نطاق واسع كنموذج للتحقيقات المتعلقة بتسوية الأحياء، ولا سيما فيما يتعلق بالبحوث المضادة للحشف على السفن والآليات المشاركة7،11،،من1213. ومع ذلك، التفريخ الموسمية الطبيعية غلة عرض لا يمكن التنبؤ بها لليرقات سيبريد للدراسات. القدرة على ثقافة هذه أوزة من خلال دورة حياته كلها على مدار السنة ولذا، موردا رئيسيا لتمكين أنواع مختلفة من الدراسات الجزيئية والميكانيكية. وبالإضافة إلى ذلك، يسمح وجودها في المياه البحرية/المالحة في العالم للجمع بين الميدانية والدراسات التجريبية. الإكثار يمكن أن تنتج أيضا أسر النسب المعروفة ل تثقيف طويلة الأجل14، ووقت جيل لبضعة أشهر قد يسمح تطور تجريبية على المدى الطويل. تتوفر أيضا مشروع جينوم والعديد من ترانسكريبتوميس، وقد استخدمت هذه الموارد لاستنساخ عدة جينات (مثلاً، الجينات ذات أهمية في أوسموريجوليشن)2،3.
والهدف من هذا البروتوكول لوصف كيفية إنشاء والحفاظ على ثقافة أوزة إيمبروفيسوس باء- طوال السنة من أجل إجراء دراسات التعبير الجيني على البالغين أو يرقات لهذا الكائن. ريتشوف et al. 15 وصف موجز لطريقة لاستزراع الإوز من الإفراج عن الوظيفة إلى تسوية سيبريدس للأنواع Balanus amphitrite. البروتوكول قد تم تكييفه لاستزراع كل سنة-الجولة من إيمبروفيسوس باء في Tjärnö مختبر الأبحاث البحرية (السويد)، ويرد وصف مفصل لكل الخطوات في خط الإنتاج، بما في ذلك الإنتاج وتربية أوزة اليرقات، فضلا عن إدارة الأعلاف للكبار واليرقات. لمحة عامة للإجراء الكامل، انظر الشكل 1. استخدام نظام تثقيف هو مثال مع بعض الهياكل التجريبية المشتركة ويتضح في دراسات الجينوم الوظيفي نا+/K+ ATPase وأكوابورينس، توضيح وظائفها الممكنة في، أوسموريجوليشن2 3. من الضروري في بعض الأحيان لدراسة التعبير الجيني في أنسجة محددة، وسيتم تغطية بعض أساسيات التشريح أوزة. بإمدادات جيدة من مياه عالية الجودة، استزراع أوزة إيمبروفيسوس باء، ويحتمل أن تكون العديد من الأنواع الأخرى، ينبغي أن يكون من الممكن في مختبرات البحرية في جميع أنحاء العالم.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:1244px;" width="1243">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:341px;">Plexiglas (poly-methyl methacrylate) panels</td>
			<td style="width:364px;">Plastic produkter, Bromma, Sweden</td>
			<td style="width:153px;"></td>
			<td style="width:385px;">transparent glas</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">1.5-L PET bottle</td>
			<td style="width:364px;"></td>
			<td style="width:153px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Artemia</td>
			<td>INVE Aquaculture, Belgium</td>
			<td style="width:153px;"></td>
			<td>We have tested different companies; this is really the best one</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Skeletonema marinoi (CCAP strain 1077/5)</td>
			<td style="width:364px;">CCAP (Culture Collection of Algae and Protozoa); Scotland&#160;</td>
			<td style="width:153px;">strain 1077/5</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Chaetoceros simplex var. gracilis (CCAP strain 1085/3)</td>
			<td style="width:364px;">CCAP (Culture Collection of Algae and Protozoa); Scotland&#160;</td>
			<td style="width:153px;">strain 1085/3</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Millipore cartridge filter system</td>
			<td style="width:364px;">Millipore&#160;</td>
			<td style="width:153px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">cartridge with a nominal pore size of 0.2 &#181;m</td>
			<td style="width:364px;">Millipore&#160;</td>
			<td style="width:153px;">cartridge CWSS01S03</td>
			<td>High capacity for large volumes</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">polycarbonate bottle</td>
			<td style="width:364px;">Nalgene</td>
			<td style="width:153px;"></td>
			<td>autoclavable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">RNA later</td>
			<td style="width:364px;">Qiagen</td>
			<td style="width:153px;">76106</td>
			<td>&#160;Fixation solution to preserve RNA</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;">TURBO DNA-free Kit</td>
			<td style="width:364px;">Invitrogen/Thermofisher Scientific&#160;&#160;</td>
			<td>AM1907</td>
			<td>DNAse kit to remove DNA from prepared RNA</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">iScript cDNA Synthesis Kit</td>
			<td style="width:364px;">Biorad</td>
			<td>1708890</td>
			<td>cDNA synthesis kit</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">SYBR Green supermix</td>
			<td style="width:364px;">Biorad</td>
			<td>1708880</td>
			<td>Dye for QPCR</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:341px;">RNeasy minikit</td>
			<td style="width:364px;">Qiagen</td>
			<td>74104</td>
			<td>RNA extraction of adults or many cyprids</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:341px;">Soft tissue homogenising CK 14, 2 ml tubes</td>
			<td style="width:364px;">Precellys</td>
			<td style="width:153px;">KT03961-1-003.2</td>
			<td>Ceramic beads for homogenisation</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:341px;">RNeasy micro kit</td>
			<td style="width:364px;">Qiagen</td>
			<td style="width:153px;">74004</td>
			<td>RNA extraction of few cyprids</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

the barnacle balanus improvisus as a marine model - culturing and gene expression

البرنقيل هي القشريات البحرية مع بالغ لاطئة والعوالق، وتخترق اليرقات. أوزة إيمبروفيسوس بالانوس (أمفيبالانوس) ذات أهمية خاصة كنموذج لدراسة آليات أوسموريجولاتوري بسبب التسامح الشديد للملوحة منخفضة. ويستخدم أيضا على نطاق واسع كنموذج لتسوية الأحياء، ولا سيما فيما يتعلق بالبحوث المضادة للحشف على السفن. ومع ذلك، التفريخ الموسمية الطبيعية غلة عرض لا يمكن التنبؤ بها لليرقات سيبريد للدراسات. يرد على بروتوكول لاستزراع كل سنة-الجولة من إيمبروفيسوس باء- وقد وضعت ووصف مفصل لكل الخطوات في خط الإنتاج (أي، وإنشاء ثقافات الكبار على الألواح، وجمع وتربية أوزة اليرقات، وإدارة الأعلاف للكبار واليرقات). الوصف أيضا إرشاداً بشأن استكشاف الأخطاء وإصلاحها ويناقش المعلمات حرجة (مثلإزالة التلوث، وإنتاج الأعلاف عالية الجودة، والقوى العاملة اللازمة وأهمية جودة مياه البحر). كل دفعة من النظام بتثقيف أقصى غلة النوبليوس 12,000 تقريبا، ويمكن تقديم أربع دفعات في غضون أسبوع، حيث يمكن أن تنتج ما يصل إلى اليرقات 50,000 تقريبا كل أسبوع. الطريقة المستخدمة للثقافة إيمبروفيسوس باء- ، على الأرجح، إلى حد كبير، كما ينطبق على غيرها من اللافقريات البحرية مع سويمينجلارفاي مجاناً. يتم عرض البروتوكولات لتشريح الأنسجة المختلفة من البالغين، فضلا عن إنتاج الحمض النووي الريبي عالية الجودة للدراسات المتعلقة بالتعبير الجيني. وهو أيضا وصف الكبار كيف مثقف وتربية سيبريدس يمكن أن تستخدم في طائفة واسعة من النماذج التجريبية لدراسة التعبير الجيني فيما يتعلق بالعوامل الخارجية. ويتضح استخدام الإوز المستزرعة في التعبير الجيني مع دراسات الأدوار الممكنة أوسموريجولاتوري نا+/K+ أتباسي وأقوابورينس.

وصف الإجراء لاستزراع الإوز الكبار من إيمبروفيسوس باء، ما يصل إلى أربع دفعات من ناوبليوس يمكن إنتاج اليرقات في الأسبوع. فإنه سيكون من الممكن جمع اليرقات nauplius تقريبا كل ليلة، ولكن هذا يتطلب المزيد من الناس والبنية التحتية (مع كثير من الإوز في الأمهات، ثقافة سوف الإفراج اليرقات بشكل مستمر). يظهر عامل تحد إضافي لإنتاج اليرقات على توافر الأعلاف عالية الجودة، لا سيما فيما يتعلق دياتوم Skeletonema. أقصى، يتألف كل دفعة من نظام تثقيف النوبليوس 12,000 تقريبا، حتى تصل إلى الوظيفة 50,000 في الأسبوع يمكن أن يكون مثقف. ومع ذلك، قد يكون بضعة أسابيع هناك ما يصل إلى عشرة إضعاف اليرقات أقل أنتجت. بالغ واحد يمكن أن تنتج اليرقات 7,000 تصل إلى كل يوم14، مما يعني أن البالغين 1-2 يتم الإفراج اليرقات لكل دفعة. في غضون أسبوع، سوف تتطور حوالي 70 – 90% للوظيفة التي تم جمعها إلى سيبريدس (الغلة تقريبا 30,000 سيبريدس في الأسبوع، الحد الأقصى) التي يمكن استخدامها للدراسات الجزيئية وفحوصات التسوية.
وينبغي التشديد على أن هناك اختلافات في ميزات سيبريد بين دفعات، وعموما، هناك الاختلافات الكبيرة بين دفعات من ضمن مجموعات. على سبيل المثال، يختلف نجاح تسوية في فحوصات التسوية بين 30 و 70 في المائة لدفعات مختلفة. على الأرجح، يحدث هذا بسبب التباينات الوراثية الفردية بين أزواج معينة من البالغين الإفراج اليرقات أثناء فترات أخذ العينات المختلفة. وبطبيعة الحال، من المستحسن أن التجارب المتكررة (replicates البيولوجية) ينبغي أن تشمل سيبريدس من عدد من دفعات إذا كانت بيانات عامة أكثر حول النتائج بذل. يضع التباين دفعة لدفعة المطالب على التصميم التجريبي، حيث ينبغي أن يطبق ضوابط سليمة ونورماليزيشنز في دراسات التعبير الجيني. لكن حتى بعد أن تم تنفيذ العديد من الإجراءات الإحصائية التطبيع التي تقلل إلى حد كبير من التباين بين الدفعات، بعض الآثار المترتبة على الدفعة عادة ما زال واضحا (بيانات غير منشورة).
بعد البروتوكول المتوفرة، فمن الممكن الحصول على، في المتوسط، 500 نانوغرام من الحمض النووي الريبي عالية الجودة من سيبريدس 20 قدر ضئيل، بغض النظر عن مرحلة التسوية أوزة (الجدول 1). عادة ما يتم قياس نوعية الجيش الملكي النيبالي كالنسبة بين قمم 18S و 28S (الموضع المتوقع من قمم اثنين ترد في الشكل 4). ومع ذلك، في حالة الإوز وكثير من المفصليات الأخرى، الرنا الريباسي 28S ينهار عند تسخينها (كجزء من أسلوب التحليل) وترحيل جنبا إلى جنب مع ذروة 18S20. وهذا السبب هناك، من حيث المبدأ، ذروة الرنا الريباسي واحدة واحدة في هذا النوع من التحليل للاوز. فمن الواضح من هذا الاختبار (الشكل 4) أن تجانس واسطة حبات السيراميك يوفر الجيش الملكي النيبالي بأعلى درجات النزاهة وهو، لذلك، طريقة الاختيار. الجيش الملكي النيبالي كافية في كمية ونوعية لإنشاء مكتبات تسلسل عالية الجودة للتسلسل، وينتج في متوسط 70 مليون على ما يلي كل عينة (عدد القراءات، بالطبع، يعتمد على مستوى الإرسال المتعدد أثناء التسلسل). كمية الحمض النووي الريبي أيضا كافية لتحليل التعبير توليف و qPCR كدنا لعدد كبير من الجينات.
يبين الشكل 5 النتيجة من تحليلات قبكر من أكوابورينس ومن غ+/K+ أتباسي (NAK1) لصق المتغيرات، حيث تم التحقيق في التعبير التغييرات استجابة للتغيرات في البيئة العظة2،3. مقارنة التعبير النسبي منذ فترة طويلة وقصيرة لصق المتغيرات ليظهر NAK1 شقين سيزيد مرناً NAK1 طويلة في الملوحة منخفضة بالنسبة NAK قصيرة (الشكل 5ألف). وهكذا، تشير البيانات إلى أن الربط بديلة يجعل النموذج الطويل السائد تحت ظروف الملوحة منخفضة. وفي حالة أكوابورينس، فمن الواضح أن بارالوجس نقل المياه هما AQP1 و AQP2 عرض التعبير التفاضلية (الشكل 5ب). على وجه الخصوص، في النسيج عباءة، فإنه من الواضح أن AQP1 أسفل ينظم إلى حد كبير في انخفاض الملوحة، الذي لا ينظر ل AQP2. بدلاً من ذلك، يظهر AQP2 تعبير زيادة طفيفة في مستويات أقل، ولكن في سوما. هذه النتائج توفر قاعدة للتحقيقات للأدوار الوظيفية لمختلف الناقلين أيون إيمبروفيسوس (ب) وأكوابورينس في أوسموريجوليشن أوزة.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57825/57825fig1.jpg"> الشكل 1 : لمحة عامة عن الجامع استزراع الداخلي واستخراج الحمض النووي الريبي لدراسات التعبير الجيني في البالغين- الشروع في نشر ثقافة جديدة، يعلق على إطار اللوحات والمنتشرة في البحر في 1-عمق 3 م. بعد عدة أسابيع، توضع اللوحات مع الكبار/الأحداث عمودياً في رفوف في علب في المختبر. كل علبة تحمل لوحات حوالي 40 مع البالغين. مع ما يقرب من 100 من الكبار كل فريق في ≈ مجموع الأفراد البالغين 4,000 تربى كل علبة. البرنقيل الكبار هي التي تتغذى على الارتيميا ويمكن الاحتفاظ بالسنة-حولها. وتتجمع اليرقات nauplius عدة مرات في الأسبوع من الصواني عبر الترشيح من خلال غربال. يتم نقل الوظيفة التي تم جمعها إلى دلاء تبقى عند 26 درجة مئوية في حمام مائي وتتغذى على الطحالب المجهرية. النوبليوس وتربى حتى أنهم تساقط في سيبريدس غير التغذية، التي يتم جمعها من قبل التصفية. يمكن إنشاء أفرقة جديدة في المختبر بتسوية سيبريدس في الألواح، أما لتوفير لوحات جديدة للسنة-حول الثقافة، أو لاستخدامها لمجموعة عمليات تجريبية محددة مع الظروف الخارجية المتغيرة. ثم يتم استخراج الحمض النووي الريبي من الأحداث/الكبار في نهاية التجربة أو في نقاط زمنية محددة. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/57825/57825fig1large.jpg" target="_blank">الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57825/57825fig2.jpg"> الشكل 2 : صور لبعض الخطوات الهامة في عملية تثقيف. (أ) هذه الصورة يظهر الإطارات مع الأفرقة المعنية بجمع السكان الجدد من الميدان. (ب) هذه الصورة يبين الأفرقة مع الإوز الكبار من إيمبروفيسوس باء في الرفوف التي توضع في الصواني. وتوضع اللوحات حوالي 2 سم عن بعضها البعض. (ج) هذه الصورة يظهر الصواني مع أوزة لوحات وخزان التغذية إلى اليسار. من كل علبة، وهناك منفذ حيث توضع في ثقب سيتا لجمع اليرقات ناوبليوس. (د) يوضح هذه الصورة إنتاج الارتيميا لإطعام الإوز الكبار. (ﻫ) هذه الصورة يبين تربية النوبليوس في دلاء توضع في حمام مائي بتعيين إلى 26 درجة مئوية. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/57825/57825fig2large.jpg" target="_blank">الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57825/57825fig3.jpg"> الشكل 3 : وصفاً للخطوات الأولية تسلخ من الإوز الكبار: إزالة الجسم من شل به. (أ) الاستيلاء على إحدى لوحات أوبيركولار عن طريق إدراج الملقط بلطف من خلال الفتحة. سحب بلطف لإزالة اللوحة وفضح الحيوان. (ب) سحب الحيوان بالاستيلاء على الجزء سوما فقط أدناه سيري. (ج) هذا الفريق يوضح تشريح الإوز بلوط عموما. عباءة والبويضات المخصبة المحتملة (في المبيض) البقاء في تجويف قذيفة عندما يتم سحب الجسم. مذكرة بشأن تشريح أوزة (لحساب أكثر تعمقاً، انظر أندرسون)9: لوحات الحائط من أوزة منحدر إلى الداخل، ومعا، تشكل مخروط مثل بركان. فتحه، الفتحة، مغطى بلوحات أوبيركولار اثنين، والتي تشكل الباب، أو أوبيركولوم، لإغلاق الفتحة. بلوط الإوز عموما قد طبق القاعدية كلسية ملتصق بشدة التحتية؛ ومع ذلك، تفتقر بعض الأنواع من الإوز هذه اللوحة الجيرية (مثلاً، بالانويديس س.). تفرز الإوز الهيكل الخارجي من عباءة حزن المصطبغة (حسب). على السطح الخارجي لعباءة مزدوج الطبقات هو متكلسة لتصبح جامدة، بينما هو لا متكلسة السطح الداخلي لعباءة وهو بالتالي مرنة. داخل الفتحة، موجودة سيري في موقف تراجع. هذه هي الملاحق الصدر الإوز استخدامها لتغذية تعليق. المبايض يقع بالقرب من القاعدة لاوزة، بينما الخصيتين تكمن في سوما. وقد تم اعتماد هذا الرقم من بانوفا et al. 21 وتم نشرة بإذن من سبرينغر. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/57825/57825fig3large.jpg" target="_blank">الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57825/57825fig4.jpg"> الشكل 4 : تصميم السلامة الرنا الريباسي بالتفريد جل الشعرية. أعد الجيش الملكي النيبالي بطريقتين مختلفة التجانس: sonication (A) و (ب) حبات السيراميك. يقف وحدة على المحور الصادي، فو، لوحدات الأسفار. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/57825/57825fig4large.jpg" target="_blank">الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-</a>
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57825/57825fig5.jpg"> الشكل 5 : نتائج التعبير الجيني من دراستين مختلفتين من المورثات الهامة أوسموريجوليشن في إيمبروفيسوس. (أ) هذا الفريق يظهر التعبير التفاضلية قياسا قبكر متغيرات لصق نا+المستويات/K+ أتباسي NAK1 في الاستجابة لمختلف الملوحة و pCO2 3. في علاج الملوحة منخفضة، يتم زيادة التعبير عن isoform طويلة (NAK1-L) بالنسبة للمدى القصير (ANOVA، ف < 0.001). (ب) هذا الفريق يظهر التعبير عن أكوابورينس في البالغين من إيمبروفيسوس باء- أثناء تعرضهم لشتى الملوحة2. واستخدمت لتحديد مستويات التعبير أكوابورين بالنسبة إلى أكتين qPCR. كانت المحتضنة الأفراد الكبار في الملوحة مختلفة 3 (الأمير سلطان 3 و 20 و 33) لمدة 14 يوما. لإعداد الجيش الملكي النيبالي، تم فصل سوما وسيرى، وعباءة الكبار. تبين أشرطة الخطأ في كلا الرقمين، الانحراف المعياري. * * و * * * تشير إلى مستوى من الأهمية (ANOVA)، 0.01 و 0.001، على التوالي. وقد تم تعديل هذه الأرقام من ليند et al. 2 , 3-تنشر أرقام سواء بإذن من "أحد بلوس". <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/57825/57825fig5large.jpg" target="_blank">الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-</a>
<table fo:keep-together.within-page="1"><tbody>
<tr>
<td>مرحلة التسوية</td>
			<td>المبلغ الإجمالي للحمض النووي الريبي (الحرس الوطني)</td>
		</tr>
<tr>
<td>السباحة الحرة</td>
			<td>512</td>
		</tr>
<tr>
<td>الاستكشاف: البحث عن وثيقة</td>
			<td>518</td>
		</tr>
<tr>
<td>سيبريد المرفقة</td>
			<td>550</td>
		</tr>
<tr>
<td>حديثا ومغيرة الأحداث</td>
			<td>832</td>
		</tr>
</tbody></table>الجدول 1: غلة من الحمض النووي الريبي. هذا الجدول يوضح كمية الحمض النووي الريبي المستخرج مع مجموعة إعداد الجيش الملكي النيبالي من تجمعات الأفراد سيبريد 20 التي تم جمعها في مراحل مختلفة أثناء عملية التسوية.

Watch this Scientific Journal Video about The Barnacle Balanus improvisus as a Marine Model - Culturing and Gene Expression at JoVE.com

The Barnacle Balanus improvisus as a Marine Model - Culturing and Gene Expression

أوزة إيمبروفيسوس بالانوس (أمفيبالانوس) نموذج لدراسة أوسموريجوليشن والمضادة للحشف على السفن. بيد التفريخ الموسمية الطبيعية غلة عرض لا يمكن التنبؤ بها لليرقات سيبريد. هنا، هو وصف بروتوكول لاستزراع كل سنة-الجولة من إيمبروفيسوس باء ، بما في ذلك إنتاج اليرقات. ويتضح استخدام الإوز المستزرعة في دراسات التعبير الجيني.

أوزة إيمبروفيسوس بالانوس "نموذج البحرية"-استزراع و "التعبير الجيني"

Barnacles are marine crustaceans with a sessile adult and free-swimming, planktonic larvae. The barnacle Balanus (Amphibalanus) improvisus is particularly ...

Research

JoVE Journal

Environment

The Barnacle Balanus improvisus as a Marine Model - Culturing and Gene Expression

Transient Gene Expression in Tobacco using Gibson Assembly and the Gene Gun

عابر التعبير الجيني في التبغ باستخدام الجمعية جيبسون وجين غون

In order to target a single protein to multiple subcellular organelles, plants typically duplicate the relevant genes, and express each gene separately ...

Unraveling the Unseen Players in the Ocean - A Field Guide to Water Chemistry and Marine Microbiology

كشف اللاعبين غير مرئي في المحيط - دليل ميداني للكيمياء المياه وعلم الأحياء المجهرية البحرية

Here we introduce a series of thoroughly tested and well standardized research protocols adapted for use in remote marine environments. The sampling ...

A Fish-feeding Laboratory Bioassay to Assess the Antipredatory Activity of Secondary Metabolites from the Tissues of Marine Organisms

مختبر الأحيائي تغذية الأسماك لتقييم آخر Antipredatory من المركبات الثانوية من الأنسجة من الكائنات البحرية

Marine chemical ecology is a young discipline, having emerged from the collaboration of natural products chemists and marine ecologists in the 1980s with ...

VacuSIP, an Improved InEx Method for In Situ Measurement of Particulate and Dissolved Compounds Processed by Active Suspension Feeders

VacuSIP, an Improved InEx Method for In Situ Measurement of Particulate and Dissolved Compounds Processed by Active Suspension Feeders

VacuSIP، وتحسين أسلوب INEX ل<em&gt; في الموقع</em&gt; قياس الجسيمات والمذاب المركبات التي تتم معالجتها بواسطة مغذيات تعليق النشطة

Benthic suspension feeders play essential roles in the functioning of marine ecosystems. By filtering large volumes of water, removing plankton and ...

Development of New Methods for Quantifying Fish Density Using Underwater Stereo-video Tools

استحداث أساليب جديدة لقياس كثافة الأسماك باستخدام أدوات ستيريو-فيديو تحت الماء

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and ...

Methods for Image-based Surveys of Benthic Macroinvertebrates and Their Habitat Exemplified by the Drop Camera Survey for the Atlantic Sea Scallop

أساليب لإجراء الدراسات الاستقصائية المستندة إلى الصور ماكروينفيرتيبراتيس القاعية وموئلها يتجلى في إسقاط الاستقصاء الكاميرا التقوقع البحر المحيط الأطلسي

Underwater imaging has long been used in the field of marine ecology but decreasing costs of high-resolution cameras and data storage have made the ...

In Situ Hybridization Techniques for Paraffin-Embedded Adult Coral Samples

In Situ Hybridization Techniques for Paraffin-Embedded Adult Coral Samples

في الموقع تقنيات التهجين لعينات المرجان الكبار جزءا لا يتجزأ من البارافين

Corals are important ocean invertebrates that are critical for overall ocean health as well as human health. However, due to human impacts such as rising ...

Individual Culturing of Tigriopus Copepods and Quantitative Analysis of Their Mate-guarding Behavior

Individual Culturing of Tigriopus Copepods and Quantitative Analysis of Their Mate-guarding Behavior

استزراع الفردية الكانفاس تيجريوبوس والتحليل الكمي لسلوكهم حراسة ماتي

Copepods of the genus Tigriopus, which are common zooplankton in rocky tide pools, show precopulatory mate-guarding behavior where a male clasps a ...

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster (Nephrops norvegicus)

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus

تتبع الفيديو الطويلة الأجل من الحيوانات المائية كوهوسيد: دراسة حالة من "النشاط الحركي اليومي" "النرويج جراد البحر" (النرويجي نيفروبس)

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

Microfocus X-ray CT (microCT) Imaging of Actinia equina (Cnidaria), Harmothoe sp. (Annelida), and Xenoturbella japonica (Xenacoelomorpha)

Microfocus X-ray CT microCT Imaging of Actinia equina Cnidaria, Harmothoe sp. Annelida, and Xenoturbella japonica Xenacoelomorpha

ميكروفوكس الأشعة السينية CT (microCT) التصوير من أكتينيا إكوينا (Cnidaria)، Harmothoe sp. (Annelida)، وXenoturbella japonica (Xenacoelomorpha)

Traditionally, biologists have had to rely on destructive methods such as sectioning in order to investigate the internal structures of opaque organisms. ...