Name: the barnacle balanus improvisus as a marine model - culturing and gene expression
Uploaded: 2018-08-08T14:00:00
Duration: 7 min 47 s
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इस अनुसंधान अनुदान 2017-04559 स्वीडिश अनुसंधान परिषद (वी. आर.) और यूरोपीय संघ समर्थित परियोजना SEAFRONT से ऐंडर्स Blomberg को समर्थन किया गया था । विशेष रूप से, संवर्धन सुविधा की स्थापना के वर्षों में, निंनलिखित धन एजेंसियों से प्रति R. Jonsson को अनुदान द्वारा समर्थित किया गया है: SSF (स्वीडिश सामरिक अनुसंधान के लिए फाउंडेशन) के माध्यम से कार्यक्रम समुद्री विज्ञान और प्रौद्योगिकी और कार्यक्रम के माध्यम से MISTRA समुद्री पेंट. केंट Berntsson culturingfacility की स्थापना के प्रारंभिक चरणों में महत्वपूर्ण भूमिका निभाई थी । संवर्धन सुविधा की स्थापना के लिए अतिरिक्त धन केंद्र से समुद्री विकासवादी जीवविज्ञान (www.cemeb.science.gu.se), जो स्वीडिश अनुसंधान परिषदों के प्रपत्र और वीआर से एक लिनिअस अनुदान द्वारा समर्थित है से आया है ।

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	<li>Darwin, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A monograph of the sub-class Cirripedia, with figures of all species. 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I., Granhag, L. M., Jonsson, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Instantaneous+flow+structures+and+opportunities+for+larval+settlement:+barnacle+larvae+swim+to+settle.">Instantaneous flow structures and opportunities for larval settlement: barnacle larvae swim to settle.</a> PLoS ONE. 11, 0158957 (2016).</li><li>Toth, G. B., Lindeborg, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Water-soluble+compounds+from+the+breadcrumb+sponge+Halichondria+panicea.+deter+attachment+of+the+barnacle+Balanus+improvisus.">Water-soluble compounds from the breadcrumb sponge Halichondria panicea. deter attachment of the barnacle Balanus improvisus.</a> Marine Ecology Progress Series. 354, 125-132 (2008).</li><li>Pansch, C., Jonsson, P. R., Berglin, M., Pinori, E., Wrange, A. 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C., Tulaskar, A. S., Khandeparkar, D. C., Wagh, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cryopreservation+of+Balanus+amphitrite+nauplii.">Cryopreservation of Balanus amphitrite nauplii.</a> Cryobiology. 34, 131-140 (1997).</li><li>Oo, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cryopreservation+of+nauplius+larvae+of+the+barnacle,+Balanus+amphitrite+Darwin.">Cryopreservation of nauplius larvae of the barnacle, Balanus amphitrite Darwin.</a> Fisheries Science. 64, 857-860 (1998).</li><li>Lin, H. 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लेखकों की घोषणा करने के लिए कुछ नहीं है.

बार्नाकाल एक sessile वयस्क और नि: शुल्क तैराकी, planktonic लार्वा के साथ समुद्री क्रसटेशियन हैं । बार्नाकाल की १,२०० प्रजातियों में से अधिकांश उथले पानी निवास और कई बार कम लवणता को उजागर कर रहे हैं । एक प्रजाति, बे barnacle Balanus (Amphibalanus) सुधार (बी improvisus), लगभग मीठे पानी बर्दाश्त कर सकते है और चार्ल्स डार्विन1उरुग्वे में रियो डी ला मुहाना के Plata में एक छोटी सी धारा से इस प्रजाति का वर्णन किया । चरम सहिष्णुता tolow लवणता बनाता है बी improvisus osmoregulatory तंत्र2,3के अध्ययन के लिए एक विशेष रूप से प्रासंगिक मॉडल । इस barnacle खारे शर्तों को पसंद करता है, लेकिन लगभग १.६ पीएसयू से salinities के साथ पानी में रहने में सक्षम है ४० पीएसयू4के रूप में उच्च के रूप में । यह खारे बाल्टिक सागर में पाई जाने वाली एकमात्र barnacle प्रजाति है । B. improvisus को अमेरिकी महाद्वीप के पूर्वी तट से उत्पंन माना जाता है लेकिन आज5शिपिंग द्वारा फैलाव के कारण दुनिया भर में पाया जाता है । यह एक प्रमुख जमता जीव है और आमतौर पर चट्टानों, जेटीएस पर पाया जाता है, और नाव पतवार, और समुद्री और खारे पानी6,7में निर्माण पर जमता के तंत्र को समझने के लिए सामान्य ब्याज की इसलिए है ।
सबसे अंय बार्नाकाल के समान, B. improvisus पार निषेचन के साथ उभयलिंगी है; प्रजनन एक लंबी लिंग और आंतरिक निषेचन का उपयोग कर पड़ोसी व्यक्तियों के बीच सहवास के माध्यम से होता है । प्रजनन काल मुख्यत: मई से सितंबर तक होता है । B. improvisus सात pelagic लार्वा चरण (छह nauplii एक cyprid चरण8के बाद) है । निषेचित अंडे एक nauplius लार्वा जो मुक्त तैराकी है और पानी के कॉलम में फ़ीड के लिए कई हफ्तों के लिए एक गैर में molting से पहले cyprid लार्वा खिला में रची । cyprid कई cues का उपयोग करता है बसने के लिए एक उपयुक्त साइट खोजने के लिए और फिर एक sessile किशोर barnacle9में कायापलट । इस प्रजाति को प्रयोगशाला में प्रसंस्कृत किया जा सकता है और समुद्र में १-२ वर्ष की आयु (प्रयोगशाला संस्कृति में २-३ वर्ष) होती है. औसत पर, B. improvisus व्यास में 10 मिमी के लिए बढ़ता है (लगभग 20 मिमी की एक अधिकतम के साथ) और लगभग 6 मिमी की एक अधिकतम ऊंचाई तक पहुँच जाता है (हालांकि यह भीड़ की स्थिति के तहत लंबे विकसित कर सकते हैं). प्रजातियों अपनी चिकनी कैल्शियम युक्त भी खोल (सफेद या भूरा), शैल प्लेट के रेडियल नमूनों कैल्शियम युक्त आधार है, और tergal प्लेटें1,10के आकार के द्वारा पहचाना जा सकता है ।
barnacle बी improvisus osmoregulation के अध्ययन के लिए एक मॉडल के रूप में कई लाभप्रद विशेषताएं है, आणविक और शारीरिक तंत्र और साथ ही पारिस्थितिक बातचीत और विकासवादी परिणामों पर ध्यान देने के साथ । यह भी व्यापक रूप से बसने जीव विज्ञान की जांच के लिए एक मॉडल के रूप में प्रयोग किया जाता है, विशेष रूप से antifouling अनुसंधान के संबंध में और तंत्र7,11,12,13शामिल हैं । हालांकि, प्राकृतिक मौसमी अंडे के अध्ययन के लिए cyprid लार्वा की एक अप्रत्याशित आपूर्ति उपज । अपने पूरे जीवनचक्र के माध्यम से इस barnacle को संस्कृति की क्षमता सभी वर्ष दौर है, इसलिए आणविक और यंत्रवत अध्ययन के विभिंन प्रकारों को सक्षम करने के लिए एक प्रमुख परिसंपत्ति है । इसके अलावा, दुनिया भर में समुद्री/खारे पानी में अपनी उपस्थिति क्षेत्र और प्रयोगात्मक अध्ययन का एक संयोजन के लिए अनुमति देता है । नियंत्रित प्रजनन भी लंबी अवधि संवर्धन14के लिए ज्ञात वंशावली के परिवारों का उत्पादन कर सकते हैं, और कुछ महीनों की एक पीढ़ी के समय दीर्घकालिक प्रयोगात्मक विकास की अनुमति दे सकते हैं । वहां भी एक मसौदा जीनोम और कई transcriptomes उपलब्ध है, और इन संसाधनों के कई जीन की क्लोनिंग के लिए इस्तेमाल किया गया है (जैसे, osmoregulation में महत्व के जीन)2,3।
इस प्रोटोकॉल का उद्देश्य कैसे स्थापित करने के लिए और barnacle बी improvisus की एक संस्कृति को बनाए रखने के लिए साल भर में आदेश में वयस्कों या इस जीव के लार्वा पर जीन अभिव्यक्ति अध्ययन करने के लिए वर्णन है । Rittschof एट अल. 15 संक्षेप में Balanus amphitrite प्रजातियों के लिए cyprids के निपटान के लिए nauplii की रिहाई से संवर्धन बार्नाकाल के लिए एक विधि का वर्णन किया । प्रोटोकॉल Tjärnö समुद्री अनुसंधान प्रयोगशाला (स्वीडन) में improvisus के सभी वर्ष दौर संवर्धन के लिए अनुकूलित किया गया है, और उत्पादन लाइन में सभी चरणों का एक विस्तृत विवरण उल्लिखित है, उत्पादन और barnacle के पालन सहित लार्वा, और साथ ही वयस्कों और लार्वा के लिए फ़ीड के प्रशासन । पूर्ण कार्यविधि के ओवरव्यू के लिए, चित्र 1देखें । संवर्धन प्रणाली का उपयोग कुछ आम प्रयोगात्मक सेट अप के साथ उदाहरण है और Na+/K+ ATPase और aquaporins के कार्यात्मक जीनोमिक्स अध्ययनों में सचित्र, elucidating2में उनके संभावित कार्यों, 3. इसके लिए कभी-कभार विशिष्ट ऊतकों में जीन की अभिव्यक्ति की जांच आवश्यक होती है, और barnacle विच्छेदन की कुछ मूलभूत बातें शामिल की जाएंगी. उच्च गुणवत्ता वाले समुद्री जल की एक अच्छी आपूर्ति के साथ, barnacle बी improvisusके संवर्धन, और संभावित कई अन्य प्रजातियों, दुनिया भर में समुद्री प्रयोगशालाओं में संभव होना चाहिए.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:1244px;" width="1243">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:341px;">Plexiglas (poly-methyl methacrylate) panels</td>
			<td style="width:364px;">Plastic produkter, Bromma, Sweden</td>
			<td style="width:153px;"></td>
			<td style="width:385px;">transparent glas</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">1.5-L PET bottle</td>
			<td style="width:364px;"></td>
			<td style="width:153px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Artemia</td>
			<td>INVE Aquaculture, Belgium</td>
			<td style="width:153px;"></td>
			<td>We have tested different companies; this is really the best one</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Skeletonema marinoi (CCAP strain 1077/5)</td>
			<td style="width:364px;">CCAP (Culture Collection of Algae and Protozoa); Scotland&#160;</td>
			<td style="width:153px;">strain 1077/5</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Chaetoceros simplex var. gracilis (CCAP strain 1085/3)</td>
			<td style="width:364px;">CCAP (Culture Collection of Algae and Protozoa); Scotland&#160;</td>
			<td style="width:153px;">strain 1085/3</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Millipore cartridge filter system</td>
			<td style="width:364px;">Millipore&#160;</td>
			<td style="width:153px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">cartridge with a nominal pore size of 0.2 &#181;m</td>
			<td style="width:364px;">Millipore&#160;</td>
			<td style="width:153px;">cartridge CWSS01S03</td>
			<td>High capacity for large volumes</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">polycarbonate bottle</td>
			<td style="width:364px;">Nalgene</td>
			<td style="width:153px;"></td>
			<td>autoclavable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">RNA later</td>
			<td style="width:364px;">Qiagen</td>
			<td style="width:153px;">76106</td>
			<td>&#160;Fixation solution to preserve RNA</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;">TURBO DNA-free Kit</td>
			<td style="width:364px;">Invitrogen/Thermofisher Scientific&#160;&#160;</td>
			<td>AM1907</td>
			<td>DNAse kit to remove DNA from prepared RNA</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">iScript cDNA Synthesis Kit</td>
			<td style="width:364px;">Biorad</td>
			<td>1708890</td>
			<td>cDNA synthesis kit</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">SYBR Green supermix</td>
			<td style="width:364px;">Biorad</td>
			<td>1708880</td>
			<td>Dye for QPCR</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:341px;">RNeasy minikit</td>
			<td style="width:364px;">Qiagen</td>
			<td>74104</td>
			<td>RNA extraction of adults or many cyprids</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:341px;">Soft tissue homogenising CK 14, 2 ml tubes</td>
			<td style="width:364px;">Precellys</td>
			<td style="width:153px;">KT03961-1-003.2</td>
			<td>Ceramic beads for homogenisation</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:341px;">RNeasy micro kit</td>
			<td style="width:364px;">Qiagen</td>
			<td style="width:153px;">74004</td>
			<td>RNA extraction of few cyprids</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

the barnacle balanus improvisus as a marine model - culturing and gene expression

बार्नाकाल एक sessile वयस्क और नि: शुल्क तैराकी, planktonic लार्वा के साथ समुद्री क्रसटेशियन हैं । barnacle Balanus (Amphibalanus) improvisus विशेष रूप से कम osmoregulatory के लिए अपनी चरम सहिष्णुता की वजह से लवणता तंत्र के अध्ययन के लिए एक मॉडल के रूप में प्रासंगिक है । यह भी व्यापक रूप से जीव बसने के एक मॉडल के रूप में प्रयोग किया जाता है, विशेष रूप से antifouling अनुसंधान के संबंध में । हालांकि, प्राकृतिक मौसमी अंडे के अध्ययन के लिए cyprid लार्वा की एक अप्रत्याशित आपूर्ति उपज । improvisus के सभी वर्ष दौर संवर्धन के लिए एक प्रोटोकॉल विकसित किया गया है और उत्पादन लाइन में सभी चरणों का एक विस्तृत विवरण उल्लिखित है (यानी, पैनलों पर वयस्क संस्कृतियों की स्थापना, संग्रह और के पीछे के barnacle लार्वा, और वयस्कों और लार्वा के लिए फ़ीड के प्रशासन । विवरण भी समस्या निवारण पर मार्गदर्शन प्रदान करता है और महत्वपूर्ण मापदंडों पर चर्चा (जैसे, संदूषण को हटाने, उच्च गुणवत्ता वाले फ़ीड के उत्पादन, जनशक्ति की जरूरत है, और उच्च गुणवत्ता के समुद्री जल के महत्व) । संवर्धन प्रणाली से प्रत्येक बैच से अधिक मोटे तौर पर १२,००० nauplii पैदावार और एक सप्ताह में चार बैचों वितरित कर सकते हैं, तो लगभग प्रति सप्ताह ५०,००० लार्वा के लिए उत्पादन किया जा सकता है । improvisus संस्कृति के लिए इस्तेमाल किया विधि है, शायद, एक बड़ी सीमा के लिए भी लागू अंय समुद्री अकशेरूकीय के साथ मुक्त-swimminglarvae । प्रोटोकॉल वयस्कों से विभिंन ऊतकों के विच्छेदन के लिए प्रस्तुत कर रहे है और साथ ही जीन अभिव्यक्ति पर अध्ययन के लिए उच्च गुणवत्ता आरएनए का उत्पादन । यह भी वर्णित है कि कैसे संस्कृतिपूर्ण वयस्कों और चांगली cyprids बाहरी कारकों के संबंध में जीन अभिव्यक्ति की जांच के लिए प्रयोगात्मक डिजाइन की एक विस्तृत सरणी में उपयोग किया जा सकता है । जीन एक्सप्रेशन में कल्चर्ड बार्नाकाल का उपयोग ना+/K+ ATPase और aquaporins की सम्भावित osmoregulatory भूमिकाओं के अध्ययनों से सचित्र है.

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The Barnacle Balanus improvisus as a Marine Model - Culturing and Gene Expression

barnacle Balanus (Amphibalanus) improvisus osmoregulation और antifouling के अध्ययन के लिए एक मॉडल है । हालांकि, प्राकृतिक मौसमी अंडे cyprid लार्वा की एक अप्रत्याशित आपूर्ति उपज । इधर, improvisus के ऑल ईयर राउंड संवर्धन के लिए एक प्रोटोकॉल बताया गया है, जिसमें लार्वा का उत्पादन भी शामिल है । जीन एक्सप्रेशन स्टडीज में कल्चरल बार्नाकाल का उपयोग सचित्र होता है.

एक समुद्री मॉडल के रूप में Barnacle Balanus improvisus -संवर्धन और जीन अभिव्यक्ति

Barnacles are marine crustaceans with a sessile adult and free-swimming, planktonic larvae. The barnacle Balanus (Amphibalanus) improvisus is particularly ...

Research

JoVE Journal

Environment

The Barnacle Balanus improvisus as a Marine Model - Culturing and Gene Expression

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Coस्टेडिम जलीय जानवरों की लंबी अवधि के वीडियो ट्रैकिंग: नॉर्वे लॉबस्टर के दैनिक चलन गतिविधि का एक मामला अध्ययन (नेफ्रोप्स norvegicus)

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

Microfocus X-ray CT (microCT) Imaging of Actinia equina (Cnidaria), Harmothoe sp. (Annelida), and Xenoturbella japonica (Xenacoelomorpha)

Microfocus X-ray CT microCT Imaging of Actinia equina Cnidaria, Harmothoe sp. Annelida, and Xenoturbella japonica Xenacoelomorpha

माइक्रोफोकस एक्स-रे सीटी (माइक्रोसीटी) एक्टीनिया इक्विना (क्निडरिया), हरमोथो एसपी (एनीलिडा), और जेनियोटरबेला जैपोनिका (जेनाकोलोमॉर्फा) की इमेजिंग

Traditionally, biologists have had to rely on destructive methods such as sectioning in order to investigate the internal structures of opaque organisms. ...