Name: cell cycle analysis in the c. elegans germline with the thymidine analog edu
Uploaded: 2018-10-22T14:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Cell Cycle Analysis in the C. elegans Germline with the Thymidine Analog EdU at JoVE.com

Vi er taknemmelige for E. coli stock center MG1693; Wormbase; Byens Caenorhabditis genetik, som er finansieret af de nationale institutter for sundhed Office af forskning infrastruktur programmer (P40OD010440) til stammer; Zach Pincus for statistisk råd; Aiping Feng for reagenser; Luke Schneider, Andrea Scharf, Sandeep Kumar og John Brenner til uddannelse, rådgivning, støtte og nyttig diskussion; og Kornfeld og Schedl labs for feedback på dette håndskrift. Dette arbejde blev støttet i en del af National Institutes of Health [R01 AG02656106A1 til KK, R01 GM100756 til TS] og en National Science Foundation predoctoral fellowship [DGE-1143954 og DGE-1745038 til ZK]. Hverken National Institutes of Health eller National Science Foundation havde nogen rolle i udformningen af undersøgelsen, indsamling, analyse og fortolkning af data, og heller ikke i at skrive manuskriptet.

1. forberedelse af EdU-mærket bakterier
<ol><li>
Vokse en igangsætter kultur af MG1693. Escherichia coli (E. coli) MG1693 bærer en mutation i thyA.
	<ol>
<li>Streak ud E. coli MG1693 fra en frossen glycerol bestand på en 120 mm lysogeny bouillon (LB) agar petriskål. Kultur ved 37 ° C natten over.</li>
		<li>Podes fra to individuelle E. coli MG1693 kolonier i to identiske 4 mL rør af flydende LB. kultur ved 37 ° C i ~ 16 h. Bemærk: MG1693 vokser fint i LB ...

<ol>
	<li>Fox, P. M., Vought, V. E., Hanazawa, M., Lee, M. -. H., Maine, E. M., Schedl, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cyclin+E+and+CDK-2+regulate+proliferative+cell+fate+and+cell+cycle+progression+in+the+C.+elegans+germline.">Cyclin E and CDK-2 regulate proliferative cell fate and cell cycle progression in the C. elegans germline.</a> Development. 138 (11), 2223-2234 (2011).</li><li>Crittenden, S. L., Leonhard, K. A., Byrd, D. T., Kimble, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cellular+analyses+of+the+mitotic+region+in+the+Caenorhabditis+elegans+adult+germ+line.">Cellular analyses of the mitotic region in the Caenorhabditis elegans adult germ line.</a> Molecular biology of the cell. 17 (7), 3051-3061 (2006).</li><li>Seidel, H. S., Kimble, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell-cycle+quiescence+maintains+Caenorhabditis+elegans+germline+stem+cells+independent+of+GLP-1/Notch.">Cell-cycle quiescence maintains Caenorhabditis elegans germline stem cells independent of GLP-1/Notch.</a> eLife. 4, (2015).</li><li>Fox, P. M., Schedl, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+Germline+Stem+Cell+Differentiation+Following+Loss+of+GLP-1+Notch+Activity+in+Caenorhabditis+elegans.">Analysis of Germline Stem Cell Differentiation Following Loss of GLP-1 Notch Activity in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 201 (9), 167-184 (2015).</li><li>Kocsisova, Z., Kornfeld, K., Schedl, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+cycle+accumulation+of+the+proliferating+cell+nuclear+antigen+PCN-1+transitions+from+continuous+in+the+adult+germline+to+intermittent+in+the+early+embryo+of+C.+elegans.">Cell cycle accumulation of the proliferating cell nuclear antigen PCN-1 transitions from continuous in the adult germline to intermittent in the early embryo of C. elegans.</a> BMC Developmental Biology. 18 (1), (2018).</li><li>Salic, A., Mitchison, T. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+chemical+method+for+fast+and+sensitive+detection+of+DNA+synthesis+in+vivo.">A chemical method for fast and sensitive detection of DNA synthesis in vivo.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 105 (7), 2415-2420 (2008).</li><li>vanden Heuvel, S., Kipreos, E. T. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=elegans+Cell+Cycle+Analysis.">elegans Cell Cycle Analysis.</a> Methods in Cell Biology. , 265-294 (2012).</li><li>ThermoFisher. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Click-iT EdU Imaging Kits. , (2011).</li><li>Pazdernik, N., Schedl, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Germ Cell Development in C. elegans. , 1-16 (2013).</li><li>Hirsh, D., Oppenheim, D., Klass, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+the+reproductive+system+of+Caenorhabditis+elegans.">Development of the reproductive system of Caenorhabditis elegans.</a> Developmental Biology. 49 (1), 200-219 (1976).</li><li>Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+genetics+of+Caenorhabditis+elegans.">The genetics of Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 77 (1), 71-94 (1974).</li><li>Hansen, D., Schedl, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stem+cell+proliferation+versus+meiotic+fate+decision+in+Caenorhabditis+elegans.">Stem cell proliferation versus meiotic fate decision in Caenorhabditis elegans.</a> Advances in Experimental Medicine and Biology. 757, 71-99 (2013).</li><li>Jaramillo-Lambert, A., Ellefson, M., Villeneuve, A. M., Engebrecht, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differential+timing+of+S+phases,+X+chromosome+replication,+and+meiotic+prophase+in+the+C.+elegans+germ+line.">Differential timing of S phases, X chromosome replication, and meiotic prophase in the C. elegans germ line.</a> Developmental Biology. 308 (1), 206-221 (2007).</li><li>Agarwal, I., Farnow, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HOP-1+presenilin+deficiency+causes+a+late-onset+notch+signaling+phenotype+that+affects+adult+germline+function+in+Caenorhabditis+elegans.">HOP-1 presenilin deficiency causes a late-onset notch signaling phenotype that affects adult germline function in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 208 (2), 745-762 (2018).</li><li>Gumienny, T. L., Lambie, E., Hartwieg, E., Horvitz, H. R., Hengartner, M. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+control+of+programmed+cell+death+in+the+Caenorhabditis+elegans+hermaphrodite+germline.">Genetic control of programmed cell death in the Caenorhabditis elegans hermaphrodite germline.</a> Development. 126 (5), 1011-1022 (1999).</li><li>Hendzel, M. J., Wei, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mitosis-specific+phosphorylation+of+histone+H3+initiates+primarily+within+pericentromeric+heterochromatin+during+G2+and+spreads+in+an+ordered+fashion+coincident+with+mitotic+chromosome+condensation.">Mitosis-specific phosphorylation of histone H3 initiates primarily within pericentromeric heterochromatin during G2 and spreads in an ordered fashion coincident with mitotic chromosome condensation.</a> Chromosoma. 106 (6), 348-360 (1997).</li><li>Zetka, M. C., Kawasaki, I., Strome, S., M&#252; Ller, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synapsis+and+chiasma+formation+in+Caenorhabditis+elegans+require+HIM-3,+a+meiotic+chromosome+core+component+that+functions+in+chromosome+segregation.">Synapsis and chiasma formation in Caenorhabditis elegans require HIM-3, a meiotic chromosome core component that functions in chromosome segregation.</a> Genes &amp; development. 13 (17), 2258-2270 (1999).</li><li>Hansen, D., Hubbard, E. J. A., Schedl, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multi-pathway+control+of+the+proliferation+versus+meiotic+development+decision+in+the+Caenorhabditis+elegans+germline.">Multi-pathway control of the proliferation versus meiotic development decision in the Caenorhabditis elegans germline.</a> Developmental Biology. 268 (2), 342-357 (2004).</li><li>Crawley, O., Barroso, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cohesin-interacting+protein+WAPL-1+regulates+meiotic+chromosome+structure+and+cohesion+by+antagonizing+specific+cohesin+complexes.">Cohesin-interacting protein WAPL-1 regulates meiotic chromosome structure and cohesion by antagonizing specific cohesin complexes.</a> eLife. 5 (2), 1-26 (2016).</li><li>Zhao, H., Halicka, H. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=DNA+damage+signaling,+impairment+of+cell+cycle+progression,+and+apoptosis+triggered+by+5-ethynyl-2&#8242;-deoxyuridine+incorporated+into+DNA.">DNA damage signaling, impairment of cell cycle progression, and apoptosis triggered by 5-ethynyl-2&#8242;-deoxyuridine incorporated into DNA.</a> Cytometry Part A. 83 (11), 979-988 (2013).</li><li>Stiernagle, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maintenance+of+C.+elegans.">Maintenance of C. elegans.</a> WormBook. , 1-11 (2006).</li><li>Gervaise, A. L., Arur, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spatial+and+Temporal+Analysis+of+Active+ERK.">Spatial and Temporal Analysis of Active ERK.</a> in the C. elegans Germline. Journal of Visualized Experiments. 117 (117), e54901-e54901 (2016).</li><li>Vos, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> De Cell Counter Plugin. , (2015).</li><li>Schindelin, J., Arganda-Carreras, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fiji:+an+open-source+platform+for+biological-image+analysis.">Fiji: an open-source platform for biological-image analysis.</a> Nature Methods. 9 (7), 676-682 (2012).</li><li>Rasband, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> ImageJ. , (2016).</li><li>Michaelson, D., Korta, D. Z., Capua, Y., Hubbard, E. J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Insulin+signaling+promotes+germline+proliferation+in+C.+elegans.">Insulin signaling promotes germline proliferation in C. elegans.</a> Development. 137 (4), 671-680 (2010).</li><li>Qin, Z., Jane, E., Hubbard, A., Hubbard, E. J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Non-autonomous+DAF-16/FOXO+activity+antagonizes+age-related+loss+of+C.+elegans+germline+stem/progenitor+cells.">Non-autonomous DAF-16/FOXO activity antagonizes age-related loss of C. elegans germline stem/progenitor cells.</a> Nature communications. 6 (5), 7107 (2015).</li><li>Luo, S., Kleemann, G. A., Ashraf, J. M., Shaw, W. M., Murphy, C. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=TGFB+and+Insulin+Signaling+Regulate+Reproductive+Aging+via+Oocyte+and+Germline+Quality+Maintenance.">TGFB and Insulin Signaling Regulate Reproductive Aging via Oocyte and Germline Quality Maintenance.</a> Cell. 143 (2), 299-312 (2010).</li><li>Narbonne, P., Maddox, P. S., Labbe, J. -. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=daf-18/PTEN+locally+antagonizes+insulin+signalling+to+couple+germline+stem+cell+proliferation+to+oocyte+needs+in+C.+elegans.">daf-18/PTEN locally antagonizes insulin signalling to couple germline stem cell proliferation to oocyte needs in C. elegans.</a> Development. , 4230-4241 (2015).</li><li>Cinquin, A., Chiang, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intermittent+Stem+Cell+Cycling+Balances+Self-Renewal+and.">Intermittent Stem Cell Cycling Balances Self-Renewal and.</a> Senescence of the C. elegans Germ Line. PLoS Genetics. 12 (4), 1005985 (2016).</li><li>. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Invitrogen EdU (5-ethynyl-2’-deoxyuridine). , 1-7 (2010).</li><li>Tuttle, A. H., Rankin, M. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immunofluorescent+Detection+of+Two+Thymidine+Analogues+(CldU+and+IdU)+in+Primary+Tissue.">Immunofluorescent Detection of Two Thymidine Analogues (CldU and IdU) in Primary Tissue.</a> Journal of Visualized Experiments. 46 (46), e2166-e2166 (2010).</li></ol>

Forberedelse af EdU-mærket bakterier (trin 1) er afgørende for denne protokol, og det første punkt i forbindelse med fejlfinding. Wild-type unge voksne hermafroditter etiket meget pålideligt i en 4 h EdU-puls, hvilket gør dette en nyttig kontrol for hver ny batch af EdU-mærket bakterier. Derudover vil intakt EdU-mærket bakterier, som angiver tarmen (i ældre dyr eller visse svælget/kværn defekte mutanter) etiket med klik kemi og fremstår som lyse aflange puncta i tarmen. En alternativ teknik for mærkning herma...

I dyrenes udvikling skal hundreder, tusinder, millioner, milliarder, eller endog trillioner af celledelinger danne den voksne organisme. Cellecyklus, cellulære begivenheder sæt sammensat af G1 (gap), S (syntese), G2 (gap), og M (mitose) definerer serien af begivenheder, der er udført hver celledeling. Cellecyklus er dynamisk og bedst værdsat i realtid, som kan være teknisk vanskeligt. De teknikker præsenteret i denne protokol tillader en at foretage målinger af faserne og timing af cellecyklus fra stillbilleder.
Mærkning med nucleoside analoger som 5-ethynyl-2'-deoxyuridine (EdU) eller 5-bromo-2'-deoxyuridine (BrdU) er guldstandarden til at identificere S-fase i undersøgelserne af cellecyklus dynamics i Caenorhabditis elegans (C. elegans) voksen hermafrodit kønscelleoverførsel1,2,3,4,5. Både EdU og BrdU kan bruges i næsten alle genetiske baggrund, som de ikke stole på nogen genkonstruktion. Visualisere BrdU kræver skrappe kemiske behandling at afsløre antigener for anti-BrdU antistof farvning, der er ofte uforenelige med vurderingen af andre cellulære markører visualiseres ved farvning Co med ekstra antistoffer. Derimod visualisere EdU opstår ved klik kemi under milde forhold og er således kompatibel med antistof Co farvning6,7.
Specificiteten af etiketten er klar, da kerner kun optage thymidine (5-ethynyl-2'-deoxyuridine) analoger i DNA S-fasen. Visualisering foregår i faste væv. EdU etiketten er usynlig selv indtil en indeholder-holdige farvestof eller fluorophore reagerer kovalent med alkyn i EdU af kobber-katalyseret Klik kemi8. EdU mærkning kan give øjeblikkelig information hvorpå kerner er i S-fase, med en kort puls af mærkning. EdU kan også give dynamiske oplysninger, ved hjælp af puls-chase eller kontinuerlig mærkning; for eksempel, i en pulse-chase eksperiment, etiketten er fortyndet på hver celledeling eller opformeret som nondividing celler fremskridt gennem udvikling.
C. elegans hermafrodit kønscelleoverførsel er en kraftfuld modelsystem for undersøgelserne af signalering veje, stamceller, meiose og celle cyklus. Den voksne kønscelleoverførsel er en polariseret samlebånd med stamceller fundet i den distale ende efterfulgt af post og progression gennem meiotiske prophase, koordineret med faser af gametogenesis mere proksimalt (figur 1). På den proksimale ende, oocyter modne, er ægløsning og befrugtet og begynde embryogenese i livmoderen9,10,11. ~ 20 celle-diameter lang regionen nær den distale tip celle, som indeholder mitotically cykling kønscelleoverførsel stilken, stamceller og meiotiske S-fase celler men ikke cellerne i meiotiske prophase, kaldes stamfader zone2,4 , 9 , 12. cellemembraner giver ufuldstændig adskillelse mellem kerner i den distale kønscelleoverførsel, men zone stamceller gennemgå mitotiske celle cykling stort set uafhængigt af hinanden. Median mitotiske cellecyklus varigheden af kønscelleoverførsel stamceller zone i unge voksne hermafroditter er ~6.5 h; G1 fase er kort eller fraværende, og ubevægelighed er ikke observeret1,2,13. Kønscelleoverførsel stamcelle differentiering sker gennem hovedsagelig direkte differentiering og dermed mangler uddybning af transit divisioner4. Under differentiering i pachytene fase, omkring 4 ud af 5 kerner vil ikke danne oocytter, men i stedet gennemgå apoptose, handler som sygeplejerske celler ved at donere deres cytoplasmatisk indholdet at udvikle oocyt12,14 , 15.
Ud over mærkning celler i S-fase med nucleoside analoger, kan man identificere cellerne i mitosen og meiose bruger antistoffarvning. Kerner i mitosen er immunoreaktive til anti-phospho-Histon H3 (Ser10) antistof (kaldet pH3)7,16. Kerner i meiose er immunoreaktive til anti-ham-3 antistof (en meiotiske kromosom akse protein)17. Kerner i zonen Stamform kan identificeres ved fravær af HIM-3, tilstedeværelsen af nucleoplasmic REC-818eller tilstedeværelsen af WAPL-119. WAPL-1 intensitet er højest i den somatiske gonade, høj i zonen Stamform og lav under tidlige meiotiske prophases19. Flere cellecyklus målinger er muligt med et par variationer i protokollen: Jeg) identificere kerner i S-fase og måle S-fase indeks; II) identificere kerner i M-fase og måle M-fase indeks; III) afgøre, om kerner var i mitotiske eller meiotiske S-fase; IV) måle varigheden af G2; V) måle duartion af G2 + M + G1 faser; VI) foranstaltning sats af meiotiske post; VII) skøn sats af meiotiske progression.
Man kan lave flere cellecyklus målinger fra kun et par typer af våd-lab eksperimenter. Protokollen nedenfor beskriver en 30 min puls mærkning af fodring C. elegans voksen hermafroditter med EdU mærket bakterier og co mærkning M-fase celler ved farvning med anti-pH3 antistof og stamfader zone celler ved farvning med anti-WAPL-1 antistof. Kun ændringer i varigheden af EdU feed (trin 2,5), type af antistoffer ansat (trin 5), og analyser (trin 8.3) er påkrævet for de yderligere målinger.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:1019px;" width="1020">
	<tbody>
		<tr height="42">
			<td >E. coli MG1693</td>
			<td style="width:255px;">Coli Genetic Stock Center</td>
			<td style="width:255px;">6411</td>
			<td style="width:255px;">grows fine in standard unsupplemented LB</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">E. coli OP50</td>
			<td style="width:255px;">Caenorhabditis Genetics Center</td>
			<td style="width:255px;">OP50</td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:255px;">Click-iT EdU Alexa Fluor 488 Imaging Kit</td>
			<td style="width:255px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:255px;">C10337</td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">5-Ethynyl-2&#8242;-deoxyuridine</td>
			<td style="width:255px;">Sigma</td>
			<td style="width:255px;">900584-50MG</td>
			<td style="width:255px;">or use EdU provided in kit</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Glucose</td>
			<td style="width:255px;">Sigma</td>
			<td style="width:255px;">D9434-500G</td>
			<td style="width:255px;">D-(+)-Dextrose</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Thiamine (Vitamin B1)</td>
			<td style="width:255px;">Sigma</td>
			<td style="width:255px;">T4625-5G</td>
			<td style="width:255px;">Reagent Grade</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Thymidine</td>
			<td style="width:255px;">Sigma</td>
			<td style="width:255px;">T1895-1G</td>
			<td style="width:255px;">BioReagent</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Magnesium sulfate heptahydrate</td>
			<td style="width:255px;">Sigma</td>
			<td style="width:255px;">M1880-1KG</td>
			<td style="width:255px;">MgSO4, Reagent Grade</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Sodium Phosphate, dibasic, anhydrous</td>
			<td style="width:255px;">Fisher</td>
			<td style="width:255px;">BP332-500G</td>
			<td style="width:255px;">Na2HPO4</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Potassium Phosphate, monobasic</td>
			<td style="width:255px;">Sigma</td>
			<td style="width:255px;">P5379-500G</td>
			<td style="width:255px;">KH2PO4</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Ammonium Chloride</td>
			<td style="width:255px;">Sigma</td>
			<td style="width:255px;">A4514-500G</td>
			<td style="width:255px;">NH4Cl, Reagent Plus</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Bacteriological Agar</td>
			<td style="width:255px;">US Biological</td>
			<td style="width:255px;">C13071058</td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Calcium Chloride dihydrate</td>
			<td style="width:255px;">Sigma</td>
			<td style="width:255px;">C3881-500G</td>
			<td style="width:255px;">CaCl</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">LB Broth (Miller)</td>
			<td style="width:255px;">Sigma</td>
			<td style="width:255px;">L3522-1KG</td>
			<td style="width:255px;">Used at 25g/L</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Levamisole</td>
			<td style="width:255px;">Sigma</td>
			<td style="width:255px;">L9756-5G</td>
			<td style="width:255px;">0.241g/10ml</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Phosphate buffered saline</td>
			<td style="width:255px;">Calbiochem Omnipur</td>
			<td style="width:255px;">6506</td>
			<td style="width:255px;">homemade PBS works just as well</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Tween-20</td>
			<td style="width:255px;">Sigma</td>
			<td style="width:255px;">P1379-500ML</td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:255px;">16% Paraformaldehyde, EM-grade ampules</td>
			<td style="width:255px;">Electron Microscopy Sciences</td>
			<td style="width:255px;">15710</td>
			<td style="width:255px;">10ml ampules</td>
		</tr>
		<tr height="62">
			<td height="62" style="height:62px;width:255px;">100% methanol</td>
			<td style="width:255px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:255px;">A454-1L</td>
			<td style="width:255px;">Gold-label methanol is critical for proper morphology with certain antibodies</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Goat Serum</td>
			<td style="width:255px;">Gibco</td>
			<td style="width:255px;">16210-072</td>
			<td style="width:255px;">Lot 1671330</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">rabbit-anti-WAPL-1</td>
			<td style="width:255px;">Novus biologicals</td>
			<td style="width:255px;">49300002</td>
			<td style="width:255px;">Lot G3048-179A02, used at 1:2000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">mouse-anti-pH3 clone 3H10</td>
			<td style="width:255px;">Millipore</td>
			<td style="width:255px;">05-806</td>
			<td style="width:255px;">Lot#2680533, used at 1:500</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:255px;">goat-anti-rabbit IgG-conjugated Alexa Fluor 594</td>
			<td style="width:255px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:255px;">A11012</td>
			<td style="width:255px;">Lot 1256147, used at 1:400</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:255px;">goat-anti-mouse IgG-conjugated Alexa Fluor 647</td>
			<td style="width:255px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:255px;">A21236</td>
			<td style="width:255px;">Lot 1511347, used at 1:400</td>
		</tr>
		<tr height="62">
			<td height="62" style="height:62px;width:255px;">Vectashield antifade mounting medium containing 4&#39;,6-Diamidino-2-Phenylindole Dihydrochloride (DAPI)</td>
			<td style="width:255px;">Vector Laboratories</td>
			<td style="width:255px;">H-1200</td>
			<td style="width:255px;">mounting medium without DAPI can be used instead, following a separate DAPI incubation</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">nail polish</td>
			<td style="width:255px;">Wet n Wild</td>
			<td style="width:255px;">DTC450B</td>
			<td style="width:255px;">any clear nail polish should work</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">S-medium</td>
			<td style="width:255px;">various</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;">see wormbook.org for protocol</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">M9 buffer</td>
			<td style="width:255px;">various</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;">see wormbook.org for protocol</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:255px;">M9 agar</td>
			<td style="width:255px;">various</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;">same recipe as M9 buffer, but add 1.7% agar</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Nematode Growth Medium</td>
			<td style="width:255px;">various</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;">see wormbook.org for protocol</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">dissecting watch glass</td>
			<td style="width:255px;">Carolina Biological</td>
			<td style="width:255px;">42300</td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Parafilm laboratory film</td>
			<td style="width:255px;">Pechiney Plastic Packaging</td>
			<td style="width:255px;">PM-996</td>
			<td style="width:255px;">4 inch wide laboratory film</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">petri dishes</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;">60 mm diameter</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Long glass Pasteur pipettes</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">1ml centrifuge tubes</td>
			<td style="width:255px;">MidSci Avant</td>
			<td style="width:255px;">2926</td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Tips</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Serological pipettes</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">500 mL Erlenmyer flask</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Aluminum foil</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">25G 5/8&#8221; needles</td>
			<td style="width:255px;">BD PrecisionGlide&#160;</td>
			<td style="width:255px;">305122</td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">5ml glass centrifuge tube</td>
			<td style="width:255px;">Pyrex&#160;</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Borosilicate glass tubes 1ml</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">glass slides</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">no 1 coverslips 22 x 40 mm</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;">no 1.5 may work, also</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">37 &#176;C Shaker incubator</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Tabletop Centrifuge</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Clinical Centrifuge</td>
			<td style="width:255px;">IEC</td>
			<td style="width:255px;">428</td>
			<td style="width:255px;">with 6 swinging bucket rotor</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">Mini Centrifuge</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:255px;">20 &#176;C incubator</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="26">
			<td height="26" style="height:26px;width:255px;">4 &#176;C refrigerator</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:255px;">-20 &#176;C freezer</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="28">
			<td height="28" style="height:28px;width:255px;">Observer Z1 microscope</td>
			<td style="width:255px;">Zeiss</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:255px;">Plan Apo 63X 1.4 oil-immersion objective lens</td>
			<td style="width:255px;">Zeiss</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="60">
			<td height="60" style="height:60px;width:255px;">Ultraview Vox spinning disc confocal system</td>
			<td style="width:255px;">PerkinElmer&#160;</td>
			<td style="width:255px;"></td>
			<td style="width:255px;">Nikon spinning disc confocal system works very well, also, as described here: http://wucci.wustl.edu/Facilities/Light-Microscopy&#160;</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

cell cycle analysis in the c. elegans germline with the thymidine analog edu

Cellecyklus analyse i eukaryoter udnytter ofte kromosom morfologi, udtryk og/eller lokalisering af genprodukter, der kræves til forskellige faser i cellecyklus eller indarbejdelse af nucleoside analoger. Under S-fase, DNA polymeraser indarbejde thymidine analoger såsom EdU eller BrdU kromosomale DNA, markere cellerne for analyse. For C. elegans, nucleoside analog EdU er fodret til orme under regelmæssig kultur og er kompatibel med immunfluorescent teknikker. Kønscelleoverførsel af C. elegans er en kraftfuld modelsystem for undersøgelserne af signalering stier, stamceller, meiose og cellecyklus, fordi det er gennemsigtigt, genetisk letkøbt, og meiotiske prophase og cellulære differentiering/gametogenesis sker i en lineær forsamling-lignende måde. Disse funktioner gør EdU et fantastisk værktøj til at undersøge dynamiske aspekter af mitotically cykling celler og kønscelleoverførsel udvikling. Denne protokol beskriver hvordan man med held forberede EdU bakterier, fodre dem til vilde-type C. elegans hermafroditter, dissekere den hermafrodit gonade, pletten til EdU indbygning i DNA, pletten med antistoffer til at opdage forskellige cellecyklus og udviklingsmæssige markører, billede af gonade og analysere resultaterne. Protokollen beskriver variationer i metode og analyse til måling af S-fase indeks, M-fase indeks, G2 varighed, celle cyklus varighed, rente af meiotiske post og sats af meiotiske prophase progression. Denne metode kan tilpasses for at studere cellecyklus eller celle historie i andre væv, stadier, genetiske baggrunde og fysiologiske tilstande.

Da DNA-syntese er nødvendigt at indarbejde EdU, kan man konkludere, at EdU-mærket kerner gennemgik S-fase under tidsvindue EdU-mærkning. Man kan fortolke kerner at mærke i en 30 min fodring med EdU mærket bakterier som kerner i S-fase på tidspunktet for dissektion. Kerner, at mærke i en længere sammenhængende EdU fodring eksperiment kan have mærket tidligt i tidsvinduet og siden venstre S-fase, eller kan have mærket i den sene del af vinduet EdU tid. EdU signal lokaliserer Co m...

Watch this Scientific Journal Video about Cell Cycle Analysis in the C. elegans Germline with the Thymidine Analog EdU at JoVE.com

Cell Cycle Analysis in the C. elegans Germline with the Thymidine Analog EdU

En billeddannelse-baseret metode er beskrevet som kan bruges til at identificere S-fase og analysere cellecyklus dynamics i C. elegans hermafrodit kønscelleoverførsel ved hjælp af thymidine analog EdU. Denne metode kræver ingen transgener og er kompatibel med immunfluorescent farvning.

Cellecyklus analyse i C. elegans kønscelleoverførsel med Thymidine Analog EdU

Cell cycle analysis in eukaryotes frequently utilizes chromosome morphology, expression and/or localization of gene products required for various phases ...

Denne metode kan hjælpe med at besvare centrale spørgsmål om celle cyklus og kim linje stamcellepopulation dynamik i C.elegans. De vigtigste fordele ved denne teknik er, at det kræver ingen transgene, det er kompatibelt med immunfluorescerende farvning, og det kan ændres til at studere celler under mange forskellige betingelser. Jeg var meget begejstret, da jeg første gang så denne metode bliver brugt i Scheda lab.Selv om denne metode kan give indsigt i C.elegans celle cyklus, Det kan også anvendes til bredere spørgsmål om aldring, ernæring, eller ændrede genotyper. Generelt labs nye til denne metode kan kæmpe med den oprindelige idiodisprepation eller C.elegans hæmaxylin farvning. Begynd med at bruge steril teknik til at tilføje 200 mikroliter af 10 millimolar EdU i 100 milliliter M9 buffer og passende kosttilskud til fire milliliter frisk dyrket natten MG 1693 E.coli kultur.Gør idiodiscious kræver en delikat balance mellem EdU og thymidin tilskud. Da mængden af thymidin skal være tilstrækkelig til, at E coli kan vokse godt, mens mængden af EdU skal være tilstrækkelig til, at det robuste skjold mod nivellering kan udvænning. Efter højst 24 timer ved 37 grader Celsius og 200 RPM, brug steril teknik til at opdele kulturen mellem to til fire sterile 50 milliliter koniske rør til centrifugering.Resuspend pellatin fire milliliter frisk M9 buffer og bruge den samme pipette til at anvende omkring 8 dråber EdU mærket E Coli MG1693 opløsning til midten af individuelle rumtemperatur 60 milliliter M9 En vagt petriskåle. For at fodre EdU-mærkede bakterier til nematoderne skal du bruge frisk PBS til at vaske C.Elegans fra en nematode vækstmediumskål i et 1,5 milliliterrør og lade dyrene nøjes med tyngdekraften. Vask dyrene en til to gange med en milliliter PBS og brug en glasspeurpipette til at overføre nematoderne til midten af EdU-plænen i en lille dråbe PBS.Vent et par minutter for væsken, der skal absorberes og inkubere kulturen i mindst 30 minutter ved 20 grader Celsius i henhold til den eksperimentelle protokol. Ved slutningen af inkubationen skal du bruge to milliliter PBS til at skylle ormene fra EdU-kulturpladen i en glasdekerende skål. Efter dissektion og fiksering af nematode gonads som tidligere beskrevet, skyl en lille en milliliter borosilikatglas og en lang glas pasteur pipette med PBS suppleret med 0,1% tween 20 og bruge pipetten til at overføre de faste gonader til røret i en lille mængde PBS tween.Saml gonaderne ved centrifugering og brug en lang, trukket ud glas græspipette til at fjerne så meget supernatent som muligt uden at forstyrre gonad pellet. For EdU detektion, tilføje 100 microLiters af klik EdU cocktail til gonader og dække røret med laboratoriefilm for en 30 til 60 minutters inkubation ved stuetemperatur. Ved inkubationens afslutning vaskes gonaderne én gang med 100 mikroliter af reaktions skylningsbuffer og fire gange med en milliliter PBS tween.Efter den sidste vask tilsættes 25 mikroLiter af anti-fade monteringsmedium suppleret med DAPI til prøven. Mens mediet er afregning over gonads, placere en stor 2,5% agarose pad på en standard glas mikroskop dias. Samkopier derefter med et andet dias.Brug derefter en lang glaspandette og hold al væske og gonader i den smalle spids af pipetten for at minimere prøvetab, når gonaderne overføres til puden. Ved hjælp af en øjenvipper limet til en tandstikker, distribuere gonads over agarose pad og fjerne eventuelle støvpartikler. Derefter langsomt sænke en rektangulær glas dække glide på gonads, passe på at undgå luftbobler, og fjerne overskydende opløsning med et laboratorium væv.Optælling celler i tre dimensioner pålideligt tager nogle praksis. Brug af Fijis celletæller-plug-in og et script som markerer cellerne for at fjerne eventuelle dubletter hjælper med at gøre optællingerne reproducerbare. Efter at have ladet dækslet glide til at bosætte natten, skal du bruge celle counter plug-in og Fiji til manuelt at tælle hver kerne, mærkning hver enkelt kerne i henhold til tilstedeværelsen eller fraværet af fosforsten tre EdU eller pregenetor zone celle mærkning.EdU-signalet lokaliseres samtidig med DAPI-signal. I nogle kerner dækker EdU-signalet alle kromosomerne, mens EdU-signalet i andre kerner lokaliserer til et til to lyse punkta, sandsynligvis på X-kromosomet, som replikerer sent i S-fasen. EdU-signal fra en vellykket 30 minutters mærkning lokaliserer til cirka halvdelen af kernerne i prægenetoriseringszonen.Mens teknikken virker konsekvent i vilde type unge voksne dyr, en betydelig brøkdel af parret 5 dage gamle hermafroditter undlader at mærke i en 30 minutters EdU puls. Varigheden af G2 kan estimeres ved at analysere procentdelen af kerner i M-fasen, der er EdU-positive over tidsforløbet, hvilket gør det muligt at beregne medianen og den maksimale varighed af G2. Varigheden af G2 og G1 kan estimeres ud fra procentdelen af alle prægenetorationszonekerner, der er EdU-positive, hvilket gør det muligt at beregne den maksimale varighed af de kombinerede faser. Mens du forsøger denne procedure, er det vigtigt at huske at bruge det samme parti af EdU retter for at minimere inter-eksperimentelle variation.Efter denne procedure, andre metoder som farvning med yderligere antistoffer kan udføres eller besvare yderligere spørgsmål om celle cyklus, celle skæbne, eller signalering veje. Glem ikke, at arbejde med nuklecid analoger og parafermeldahyd kan være farligt, og at forholdsregler, såsom iført nitrol handsker, bør altid tages, mens du udfører denne procedure.

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

Cell Cycle Analysis in the C. elegans Germline with the Thymidine Analog EdU

Comprehensive Assessment of Germline Chemical Toxicity Using the Nematode Caenorhabditis elegans

Comprehensive Assessment of Germline Chemical Toxicity Using the Nematode Caenorhabditis elegans

Omfattende vurdering af Kimcellelinje kemiske toksicitet Brug nematoden<em&gt; Caenorhabditis elegans</em

Identifying the reproductive toxicity of the thousands of chemicals present in our environment has been one of the most tantalizing challenges in the ...

Visualization of Chondrocyte Intercalation and Directional Proliferation via Zebrabow Clonal Cell Analysis in the Embryonic Meckel&#8217;s Cartilage

Visualization of Chondrocyte Intercalation and Directional Proliferation via Zebrabow Clonal Cell Analysis in the Embryonic MeckelÃƒÂ¢Ã¢â€šÂ¬Ã¢â€žÂ¢s Cartilage

Visualisering af Chondrocyt Intercalation og Directional spredning via Zebrabow Klonal Cell Analysis i Embryonale Meckel s Brusk

Development of the vertebrate craniofacial structures requires precise coordination of cell migration, proliferation, adhesion and differentiation. ...

Analysis of Zebrafish Larvae Skeletal Muscle Integrity with Evans Blue Dye

Analyse af zebrafisk Larver Skeletmuskel Integritet med Evans blå farvestof

The zebrafish model is an emerging system for the study of neuromuscular disorders.  In the study of neuromuscular diseases, the integrity of the muscle ...

Spatial and Temporal Analysis of Active ERK in the C. elegans Germline

Spatial and Temporal Analysis of Active ERK in the C. elegans Germline

Rumlig og tidsmæssig analyse af Active ERK i<em&gt; C. elegans</em&gt; Kimcellelinje

The evolutionarily conserved&#160;extracellular signal transducing RTK-RAS-ERK pathway is an important kinase-signaling cascade that controls multiple ...

The C. elegans Intestine As a Model for Intercellular Lumen Morphogenesis and In Vivo Polarized Membrane Biogenesis at the Single-cell Level: Labeling by Antibody Staining, RNAi Loss-of-function Analysis and Imaging

The C. elegans Intestine As a Model for Intercellular Lumen Morphogenesis and In Vivo Polarized Membrane Biogenesis at the Single-cell Level: Labeling by Antibody Staining, RNAi Loss-of-function Analy

C. elegans tarmen som en Model for intercellulære Lumen morfogenese og In Vivo polariseret membran Biogenese på én celle niveau: mærkning af antistoffarvning, RNAi tab af funktion analyse og billedbehandling

Multicellular tubes, fundamental units of all internal organs, are composed of polarized epithelial or endothelial cells, with apical membranes lining the ...

Application of RNAi and Heat-shock-induced Transcription Factor Expression to Reprogram Germ Cells to Neurons in C. elegans

Application of RNAi and Heat-shock-induced Transcription Factor Expression to Reprogram Germ Cells to Neurons in C. elegans

Anvendelse af RNAi og Heat-shock-induceret transskription faktor udtryk til at omprogrammere kønsceller til neuroner i C. elegans

Studying the cell biological processes during converting the identities of specific cell types provides important insights into mechanism that maintain ...

Cell Aggregation Assays to Evaluate the Binding of the Drosophila Notch with Trans-Ligands and its Inhibition by Cis-Ligands

Cell Aggregation Assays to Evaluate the Binding of the Drosophila Notch with Trans-Ligands and its Inhibition by Cis-Ligands

Celle sammenlægning Assays til at evaluere bindingen af Drosophila Notch med Trans-ligander og dens hæmning af Cis-ligander

Notch signaling is an evolutionarily conserved cell-cell communication system used broadly in animal development and adult maintenance. Interaction of the ...

Three-dimensional Rendering and Analysis of Immunolabeled, Clarified Human Placental Villous Vascular Networks

Tre-dimensionelle gengivelse og analyse af Immunolabeled, klarere menneskelige placenta villøs vaskulære netværk

Nutrient and gas exchange between mother and fetus occurs at the interface of the maternal intervillous blood and the vast villous capillary network that ...

Computational Analysis of the Caenorhabditis elegans Germline to Study the Distribution of Nuclei, Proteins, and the Cytoskeleton

Computational Analysis of the Caenorhabditis elegans Germline to Study the Distribution of Nuclei, Proteins, and the Cytoskeleton

Beregningsmæssige analyse af Caenorhabditis elegans kønscelleoverførsel at studere Distribution kerner, proteiner og cytoskelettet

The Caenorhabditis elegans (C. elegans) germline is used to study several biologically important processes including stem cell development, apoptosis, and ...

Isolation and Staining of Mouse Skin Keratinocytes for Cell Cycle Specific Analysis of Cellular Protein Expression by Mass Cytometry

Isolering og farvning af mus hud keratinocytter for celle cyklus specifik analyse af cellulært protein ekspression ved Massecytometri

The goal of this protocol is to detect and quantify protein expression changes in a cell cycle-dependent manner using single cells isolated from the ...