Name: comparing bibliometric analysis using pubmed, scopus, and web of science databases
Uploaded: 2019-10-24T12:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Comparing Bibliometric Analysis Using PubMed, Scopus, and Web of Science Databases at JoVE.com

Forfatterne vil gjerne takke deanship of Scientific Research for sitt fond for å støtte video produksjon for denne studien. Forfatterne vil også gjerne takke Dr. Aseel Hermanus, Institutt for engelsk språk og litteratur, The University of Jordan for engelsk språk gjennomgang av denne studien.

Merk: følgende er søkemetoder og et eksempel søk for hver metode er gitt. Merk at den delen som er relatert spesielt til bibliometric analyse er også levert.
1. PubMed
<ol><li>Velg Avansert søk fra PubMed hjemmeside (www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed).</li>
	<li>Angi ønsket søkeord i søkefeltet. Velg søketermer fra den medisinske emne overskriften (MeSH)-databasen. Følgende eksempel detaljer om hvordan du vurderer forskning i "Cancer".<ol>
<li>Åpne MeSH-databasen: https://www.ncbi.nlm.n...

<ol>
	<li>McGowan, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PRESS+peer+review+of+electronic+search+strategies:+2015+guideline+statement.">PRESS peer review of electronic search strategies: 2015 guideline statement.</a> Journal of Clinical Epidemiology. 75, 40-46 (2016).</li><li>Hood, W., Wilson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+literature+of+bibliometrics,+scientometrics,+and+informetrics.">The literature of bibliometrics, scientometrics, and informetrics.</a> Scientometrics. 52 (2), 291-314 (2001).</li><li>Bar-Ilan, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Citations+to+the+Introduction+to+infometrics+indexed+by+WOS,+Scopus+and+Google+Scholar.">Citations to the Introduction to infometrics indexed by WOS, Scopus and Google Scholar.</a> Scientometrics. 82 (3), 495-506 (2010).</li><li>Boudry, C., Baudouin, C., Mouriaux, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=International+publication+trends+in+dry+eye+disease+research:+A+bibliometric+analysis.">International publication trends in dry eye disease research: A bibliometric analysis.</a> The Ocular Surface. 16 (1), 173-179 (2018).</li><li>Kulkarni, A. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparisons+of+citations+in+Web+of+Science,+Scopus,+and+Google+Scholar+for+articles+published+in+general+medical+journals.">Comparisons of citations in Web of Science, Scopus, and Google Scholar for articles published in general medical journals.</a> Journal of the American Medical Association. 302 (10), 1092-1096 (2009).</li><li>AlRyalat, S. A., Malkawi, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=International+Collaboration+and+Openness+in+Jordanian+Research+Output:+A+10-year+Publications+Feedback.">International Collaboration and Openness in Jordanian Research Output: A 10-year Publications Feedback.</a> Publishing Research Quarterly. 34 (2), 265-274 (2018).</li><li>Falagas, M. E., Karavasiou, A. I., Bliziotis, I. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Estimates+of+global+research+productivity+in+virology.">Estimates of global research productivity in virology.</a> Journal of Medical Virology. 76 (2), 223-229 (2005).</li><li>Young, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The ALA glossary of library and information science. , (1983).</li><li>Broadus, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Toward+a+definition+of+bibliometrics.">Toward a definition of bibliometrics.</a> Scientometrics. 12 (5-6), 373-379 (1987).</li><li>Falagas, M. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+PubMed,+Scopus,+web+of+science,+and+Google+scholar:+strengths+and+weaknesses.">Comparison of PubMed, Scopus, web of science, and Google scholar: strengths and weaknesses.</a> The FASEB Journal. 22 (2), 338-342 (2008).</li><li>Guz, A. N., Rushchitsky, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Scopus:+A+system+for+the+evaluation+of+scientific+journals.">Scopus: A system for the evaluation of scientific journals.</a> International Applied Mechanics. 45 (4), 351 (2009).</li><li>Jacso, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=As+we+may+search-comparison+of+major+features+of+the+Web+of+Science,+Scopus,+and+Google+Scholar+citation-based+and+citation-enhanced+databases.">As we may search-comparison of major features of the Web of Science, Scopus, and Google Scholar citation-based and citation-enhanced databases.</a> CurrentScience. 89 (9), 1537-1547 (2005).</li><li>Li, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Citation+analysis:+Comparison+of+Web+of+Science,+Scopus,+Scifinder,+And+Google+Scholar.">Citation analysis: Comparison of Web of Science, Scopus, Scifinder, And Google Scholar.</a> Journal of Electronic Resources in Medical Libraries. 7 (3), 196-217 (2010).</li><li>Levine-Clark, M., Kraus, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Finding+chemistry+information+using+Google+Scholar:+a+comparison+with+Chemical+Abstracts+Service.">Finding chemistry information using Google Scholar: a comparison with Chemical Abstracts Service.</a> Science &amp; Technology Libraries. 27 (4), 3-17 (2007).</li><li>Gavel, Y., Iselid, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Web+of+Science+and+Scopus:+a+journal+title+overlap+study.">Web of Science and Scopus: a journal title overlap study.</a> Online Information Review. 32 (1), 8-21 (2008).</li><li>Harzing, A. W., Alakangas, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Google+Scholar,+Scopus+and+the+Web+of+Science:+a+longitudinal+and+cross-disciplinary+comparison.">Google Scholar, Scopus and the Web of Science: a longitudinal and cross-disciplinary comparison.</a> Scientometrics. 106 (2), 787-804 (2016).</li><li>Aghaei Chadegani, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A comparison between two main academic literature collections: Web of Science and Scopus databases. , (2013).</li><li>Testa, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Thomson+Reuters+journal+selection+process.">The Thomson Reuters journal selection process.</a> Transnational Corporations Review. 1 (4), 59-66 (2009).</li><li>Burnham, J. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Scopus database: a review. 3 (1), 1 (2006).</li><li>Small, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualizing+science+by+citation+mapping.">Visualizing science by citation mapping.</a> Journal of the American society for Information Science and Technology. 50 (9), 799-813 (1999).</li><li>Cobo, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Science+mapping+software+tools:+Review,+analysis,+and+cooperative+study+among+tools.">Science mapping software tools: Review, analysis, and cooperative study among tools.</a> Journal of the American Society for Information Science and Technology. 62 (7), 1382-1402 (2011).</li><li>. Statistical Yearbook – 60th issue Available from: <a target="_blank" href="https://unstats.un.org/unsd/publications/statistical-yearbook/">https://unstats.un.org/unsd/publications/statistical-yearbook/</a> (2018)</li><li>Mongeon, P., Paul-Hus, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+journal+coverage+of+Web+of+Science+and+Scopus:+a+comparative+analysis.">The journal coverage of Web of Science and Scopus: a comparative analysis.</a> Scientometrics. 106 (1), 213-228 (2016).</li></ol>

I denne studien, trinnene der PubMed, Scopus og Web of Science databaser brukes til å utføre en bibliometric analyse ble gitt. Det ble indikert at den hyggeligste og den enkleste verktøyet til å bruke for bibliometric analysetjenester er Web of Science; Imidlertid, dens ulempen er det alt dens tjenestene er ikke anvendelig gratis. PubMed er viet for biomedisinsk vitenskap og er tilknyttet flere andre National Library of Medicine (NLM) verktøy som kan bidra til å optimalisere analyse av biomedisinsk. Medisinsk emne ...

Klassisk, har forskere brukt litteratur databaser til å utføre litteraturgjennomgang for sine studier1. En annen bruk av disse litteratur databaser oppsto på slutten av 19th århundre, der forskerne analysert kroppen av litteratur, en bruk som har langsomt vokst siden2. I de siste ti årene, digitalisering litteratur og dannelsen av online litteratur databaser gitt en mulighet til forskere til å analysere kroppen av litteratur og forskning ytelse enkelt og effektivt. Et eksempel kan være å analysere forskningsresultatene for et dokument3, et emne4, en disiplin5, et land6, eller til og med en region i verden7. Denne typen analyser er kjent som bibliometric analyse. Heartsill Young definerte bibliometric analyse som bruk av statistiske metoder for å analysere en kropp av litteratur for å avdekke historisk utvikling8. Bibliometrics er med andre ord den kvantitative studien av publiserte enheter på grunnlag av sitat-og tekstanalyse9.
Ulike databaser brukes til å gjøre bibliometric analyse og hver database har ulike egenskaper og kan tilby ulike tjenester10. Foreløpig er de mest brukte litteratur databaser Web of Science and Scopus for nesten alle disipliner, begge bare tilgjengelig på et abonnement basis11, og PubMed for biomedisinsk og biovitenskap, en fritt tilgjengelig database10. Det er også Google Scholar, som kan være et enkelt verktøy for å håndtere, men det bør ikke brukes som et bibliometric analyseverktøy for tiden på grunn av noen mangler som sin uklare omfang og dekning, mangelen på referanse analyseverktøy, og inkludering av ikke-peer gjennomgått ikke-vitenskapelig innhold12,13. Videre mangler Google Scholar verktøyene for å utføre avanserte Søk og optimalisering av søkeord14.
Flere tidligere studier har sammenlignet funksjonene i de tidligere nevnte litteratur databasene for litteraturgjennomgangen3,5,10,12,13,15 ,16,17. Men i denne studien, det betyr at PubMed, Scopus, og Web of Science databaser brukes til å utføre en bibliometric analyse vil bli gitt, og fordeler og ulemper for hver av dem vil bli sammenlignet. Bibliometric analyse kan brukes til å analysere forskningen produksjonen i nesten hvilken som helst disiplin, så målgruppen vil være noen forsker som har til hensikt å analysere publisering trender. Et eksempel på å analysere en publikasjon trend i Jordan som et land vil bli presentert ved hjelp av hver database. Jordan ble valgt fordi gjør en bibliometric analyse for et land (i motsetning til et emne) er ikke veldig grei. I tillegg er Jordan, spesielt, er dårlig studert på en bibliometric måte som det kan være både et forfatternavn og et lands navn. Vi forklarer hvordan du kan overvinne en slik utfordring i søket.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:1267px;" width="1266">
	<tbody>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:216px;"></td>
			<td style="width:123px;">clarivate</td>
			<td style="width:344px;">N/A</td>
			<td style="width:584px;">Web of Science provider, where the access was provided by the subscription made by the University of Jordan.</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;"></td>
			<td>Elsevier</td>
			<td>N/A</td>
			<td>Scopus provider, where the access was provided by the subscription made by the University of Jordan.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

comparing bibliometric analysis using pubmed, scopus, and web of science databases

Litteratur databaser (dvs.PubMed, Scopus, og Web of Science) varierer i forhold til deres dekning, fokus, og verktøyet de gir. PubMed fokuserer hovedsaklig på biovitenskap og biomedisinsk disipliner, mens Scopus og Web of Science er tverrfaglige. Protokollen som er beskrevet i den aktuelle studien ble brukt til å søke etter publikasjoner fra jordanske forfattere i årene 2013-2017. I denne protokollen, hvordan du bruker hver database til å utføre denne typen søk er forklart i detalj. En Scopus søk resulterte i det høyeste antall dokumenter (11 444 dokumenter), etterfulgt av en Web of Science søk (10 943 dokumenter). PubMed resulterte i et mindre antall dokumenter på grunn av dens smalere omfang og dekning (4 363 dokumenter). Resultatene viser også en årlig trend i: (1) antall publikasjoner, (2) disipliner som har flest publikasjoner, (3) Samarbeidslandene, og (4) antall åpne tilgang publikasjoner. I kontrast har PubMed en sofistikert søkeord optimalisering tjeneste (dvs.medisinsk emne Heading, eller mesh), mens både Scopus og Web of Science gi søke analyseverktøy som kan produsere representative figurer. Endelig er funksjonene i hver database forklart i detalj og flere indekser som kan trekkes ut ved hjelp av søkeresultatene er gitt. Denne studien gir en base for å bruke litteratur databaser for bibliometric analyse.

Resultater fra PubMed-søk
Totalt 4 363 dokumenter ble hentet basert på søk utført i denne studien. Gratis full tekst var tilgjengelig for 1 767 dokumenter (40,5%). Inne 2013, en samlet sum 532 dokumenter var offentliggjort, 663 dokumenter inne 2014, 811 dokumenter inne 2015, 952 dokumenter inne 2016, og 1 405 dokumenter inne 2017.
Resultatene viser...

Watch this Scientific Journal Video about Comparing Bibliometric Analysis Using PubMed, Scopus, and Web of Science Databases at JoVE.com

Comparing Bibliometric Analysis Using PubMed, Scopus, and Web of Science Databases

Litteratur databaser brukes ofte til å vurdere publikasjoner i et bestemt, disiplin, land eller region i verden, en praksis som kalles bibliometric analyse. Den gjeldende protokollen detaljer hvordan du bruker PubMed, Scopus, og Web of Science databaser å gjøre bibliometric analyse.

Sammenligning av Bibliometric Analysis bruke PubMed, Scopus, og Web of Science databaser

Literature databases (i.e., PubMed, Scopus, and Web of Science) differ in terms of their coverage, focus, and the tool they provide. PubMed focuses mainly ...

Denne metoden kan bidra til å svare på viktige spørsmål i det bibliometriske analysefeltet om de tilgjengelige søkedatabasene og hvordan du velger den mest hensiktsmessige. Den største fordelen med denne protokollen er at den gir en trinnvis tilnærming til å bruke forskjellige databaser, slik at enhver forsker kan utføre en bibliometrisk analyse med hell. Hvis du vil analysere jordansk forskningsutdata i løpet av en femårsperiode mellom 1.Hvis du vil utelate alle dokumenter som er skrevet av en forsker ved navn Jordan fra et tilknyttet land som ikke er Jordan, skriver du inn Jordan i et annet felt og velger felttypen Forfatter. Velg IKKE-operatoren som kobling mellom de to feltene, og klikk Søk. Angi publiseringsdatoene fra mellom 1.For å analysere den jordanske forskningsproduksjonen i løpet av en femårsperiode mellom 1. Deretter skriver du inn Jordan som søkeord, og angir Tilknytningsland som søkefelt. Begrens søkevarigheten fra 2013 til 2017.Merk at fra 2013 betyr fra 1 januar 2013, og til 2017 betyr til 31 desember 2017. Begrens deretter dokumenttypen til Artikkel eller Gjennomgang, og klikk Søk. For å analysere den jordanske forskningsutdataene i løpet av en femårsperiode mellom 1 januar 2013 og 31 desember 2017, ved hjelp av Web of Science, åpne Web of Science-nettstedet og logg inn med riktig Web of Science-kontoinformasjon.Skriv inn Jordan i søkefeltet, og angi Adresse. Identifiser varigheten av søket som mellom 2013 og 2017, og klikk Søk. Begrens søket ved hjelp av artikkel- og gjennomgangsfiltrene, og velg for å analysere resultatene som er lagret i søkeloggen nå eller senere.Angi deretter om resultatene skal vises i en tabell, et visuelt trekart eller stolper. Her vises de årlige trendene i jordansk publisering i løpet av intervallet for fem år 2013 til 2017 i henhold til Scopus-søket og Web of Science-søket. Ifølge samarbeidslandet i Scopus-søket er USA det vanligste landet som jordanske forskere samarbeider med, etterfulgt av Saudi-Arabia og Storbritannia.Ifølge Web of Science-søket er USA det vanligste landet som jordanere samarbeider med, etterfulgt av Frankrike og Østerrike. Av de 10 vanligste disiplinene der jordanere har publisert, er medisin den vanligste, etterfulgt av ingeniørfag og samfunnsvitenskap i henhold til Scopus-søket. Ifølge Web of Science søk, av de 10 vanligste disipliner der jordanere har publisert, engineering, matematikk, og informatikk er de tre beste.Når du prøver denne protokollen, er det viktig å huske å velge riktig database før du starter analysen. PubMed er for eksempel kun viet til biomedisinsk vitenskap. Etter denne protokollen og etter at du har lastet ned resultatene i CSV-format, kan flere analysemetoder som en bibliometrisk tilordning utføres for romlig representasjon av resultatene.Etter utviklingen banet denne protokollen vei for forskere på alle felt for å utforske forskningstrendene i sine disipliner enkelt og effektivt.

Research

JoVE Journal

Medicine

Quantitative Analysis of Cancer Metastasis using an Avian Embryo Model

During metastasis cancer cells disseminate from the primary tumor, invade into surrounding tissues, and spread to distant organs. Metastasis is a complex ...

Transcriptomic Analysis of Human Retinal Surgical Specimens Using jouRNAl

Transcriptomic Analysis of Human Retinal Kirurgiske Prøver Bruke Journal

Retinal detachment (RD) describes a separation of the neurosensory retina  from the retinal pigmented epithelium (RPE). The RPE is essential for normal  ...

Clinicopathological Analysis of miRNA Expression in Breast Cancer Tissues by Using miRNA In Situ Hybridization

Clinicopathological Analysis of miRNA Expression in Breast Cancer Tissues by Using miRNA In Situ Hybridization

Clinicopathological Analyse av miRNA uttrykk i Breast Cancer vev ved hjelp miRNA<em&gt; In Situ</em&gt; Hybridisering

In this article, we describe a detailed protocol for miRNA detection in breast cancer tissue using in situ hybridization with a digoxigenin-labelled LNA ...

Strategic Endothelial Cell Tube Formation Assay: Comparing Extracellular Matrix and Growth Factor Reduced Extracellular Matrix

Strategisk endotelcelle Tube Dannelse analyse: Sammenligning ekstracellulær matriks og Growth Factor Redusert ekstracellulær matriks

Malignant tumors require a blood supply in order to survive and spread. These tumors obtain their needed blood from the patient's blood stream by ...

Video Movement Analysis Using Smartphones (ViMAS): A Pilot Study

Video Movement Analysis Using Smartphones ViMAS: A Pilot Study

Video Movement Analysis Bruke Smartphones (VIMAS): en pilotstudie

The use of smartphones in clinical practice is steadily increasing with the availability of low cost/freely available &#34;apps&#34; that could be used to ...

Comparing the Effects of Electronic Cigarette Vapor and Cigarette Smoke in a Novel In Vivo Exposure System

Comparing the Effects of Electronic Cigarette Vapor and Cigarette Smoke in a Novel In Vivo Exposure System

Sammenligning av effekten av elektronisk sigarettdamp og sigarettrøyk i en roman<em&gt; In vivo</em&gt; Eksponeringssystem

Electronic cigarettes (E-cigarettes) are being widely used, and growing in popularity. It is estimated that more than 9 million adults use them regularly. ...

Executing Complexity-Increasing Queries in Relational (MySQL) and NoSQL (MongoDB and EXist) Size-Growing ISO/EN 13606 Standardized EHR Databases

Executing Complexity-Increasing Queries in Relational MySQL and NoSQL MongoDB and EXist Size-Growing ISO/EN 13606 Standardized EHR Databases

Utfører kompleksitet økende spørringer i tilhørende (MySQL) og NoSQL (MongoDB og finnes) størrelse voksende ISO/EN 13606 standardisert EHR databaser

This research shows a protocol to assess the computational complexity of querying relational and non-relational (NoSQL (not only Structured Query ...

'Boden Food Plate': Novel Interactive Web-based Method for the Assessment of Dietary Intake

'Boden mat Plate': roman interaktiv Web-basert metode for vurdering av inntak

Different methods can be used in research to assess dietary intake, many of which are still paper-based. Written estimated food diaries are often utilized ...

Hydra, a Computer-Based Platform for Aiding Clinicians in Cardiovascular Analysis and Diagnosis

Hydra, en datamaskin plattform for hjelpe klinikere hjerte analyse og diagnose

Cardiovascular diseases (CVDs) are the leading cause of death throughout the world. The total risk of developing CVD is determined by the combined effect ...

Bio-energetics Investigation of Candida albicans Using Real-time Extracellular Flux Analysis

Bio-energetics Investigation of Candida albicans Using Real-time Extracellular Flux Analysis

Bio-energetikk undersøkelse av Candida albicans bruker Real-time ekstracellulære Flux analyse

Mitochondria are essential organelles for the cellular metabolism and survival. A variety of key events take place in mitochondria, such as cellular ...