Name: comparing bibliometric analysis using pubmed, scopus, and web of science databases
Uploaded: 2019-10-24T12:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Comparing Bibliometric Analysis Using PubMed, Scopus, and Web of Science Databases at JoVE.com

Авторы хотели бы поблагодарить управление научными исследованиями за его фонд для поддержки видео-продукции для этого исследования. Авторы также хотели бы поблагодарить д-ра Асиля Забина, кафедру английского языка и литературы, Иорданский университет за обзор английского языка этого исследования.

ПРИМЕЧАНИЕ: Следующие методы поиска и пример поиска для каждого метода предоставляется. Обратите внимание, что часть, связанная конкретно с библиометрическим анализом, также поставляется.
1. ПабМед
<ol><li>Выберите Расширенный поиск с домашней страницы PubMed (www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed)...

<ol>
	<li>McGowan, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PRESS+peer+review+of+electronic+search+strategies:+2015+guideline+statement.">PRESS peer review of electronic search strategies: 2015 guideline statement.</a> Journal of Clinical Epidemiology. 75, 40-46 (2016).</li><li>Hood, W., Wilson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+literature+of+bibliometrics,+scientometrics,+and+informetrics.">The literature of bibliometrics, scientometrics, and informetrics.</a> Scientometrics. 52 (2), 291-314 (2001).</li><li>Bar-Ilan, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Citations+to+the+Introduction+to+infometrics+indexed+by+WOS,+Scopus+and+Google+Scholar.">Citations to the Introduction to infometrics indexed by WOS, Scopus and Google Scholar.</a> Scientometrics. 82 (3), 495-506 (2010).</li><li>Boudry, C., Baudouin, C., Mouriaux, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=International+publication+trends+in+dry+eye+disease+research:+A+bibliometric+analysis.">International publication trends in dry eye disease research: A bibliometric analysis.</a> The Ocular Surface. 16 (1), 173-179 (2018).</li><li>Kulkarni, A. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparisons+of+citations+in+Web+of+Science,+Scopus,+and+Google+Scholar+for+articles+published+in+general+medical+journals.">Comparisons of citations in Web of Science, Scopus, and Google Scholar for articles published in general medical journals.</a> Journal of the American Medical Association. 302 (10), 1092-1096 (2009).</li><li>AlRyalat, S. A., Malkawi, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=International+Collaboration+and+Openness+in+Jordanian+Research+Output:+A+10-year+Publications+Feedback.">International Collaboration and Openness in Jordanian Research Output: A 10-year Publications Feedback.</a> Publishing Research Quarterly. 34 (2), 265-274 (2018).</li><li>Falagas, M. E., Karavasiou, A. I., Bliziotis, I. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Estimates+of+global+research+productivity+in+virology.">Estimates of global research productivity in virology.</a> Journal of Medical Virology. 76 (2), 223-229 (2005).</li><li>Young, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The ALA glossary of library and information science. , (1983).</li><li>Broadus, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Toward+a+definition+of+bibliometrics.">Toward a definition of bibliometrics.</a> Scientometrics. 12 (5-6), 373-379 (1987).</li><li>Falagas, M. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+PubMed,+Scopus,+web+of+science,+and+Google+scholar:+strengths+and+weaknesses.">Comparison of PubMed, Scopus, web of science, and Google scholar: strengths and weaknesses.</a> The FASEB Journal. 22 (2), 338-342 (2008).</li><li>Guz, A. N., Rushchitsky, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Scopus:+A+system+for+the+evaluation+of+scientific+journals.">Scopus: A system for the evaluation of scientific journals.</a> International Applied Mechanics. 45 (4), 351 (2009).</li><li>Jacso, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=As+we+may+search-comparison+of+major+features+of+the+Web+of+Science,+Scopus,+and+Google+Scholar+citation-based+and+citation-enhanced+databases.">As we may search-comparison of major features of the Web of Science, Scopus, and Google Scholar citation-based and citation-enhanced databases.</a> CurrentScience. 89 (9), 1537-1547 (2005).</li><li>Li, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Citation+analysis:+Comparison+of+Web+of+Science,+Scopus,+Scifinder,+And+Google+Scholar.">Citation analysis: Comparison of Web of Science, Scopus, Scifinder, And Google Scholar.</a> Journal of Electronic Resources in Medical Libraries. 7 (3), 196-217 (2010).</li><li>Levine-Clark, M., Kraus, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Finding+chemistry+information+using+Google+Scholar:+a+comparison+with+Chemical+Abstracts+Service.">Finding chemistry information using Google Scholar: a comparison with Chemical Abstracts Service.</a> Science &amp; Technology Libraries. 27 (4), 3-17 (2007).</li><li>Gavel, Y., Iselid, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Web+of+Science+and+Scopus:+a+journal+title+overlap+study.">Web of Science and Scopus: a journal title overlap study.</a> Online Information Review. 32 (1), 8-21 (2008).</li><li>Harzing, A. W., Alakangas, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Google+Scholar,+Scopus+and+the+Web+of+Science:+a+longitudinal+and+cross-disciplinary+comparison.">Google Scholar, Scopus and the Web of Science: a longitudinal and cross-disciplinary comparison.</a> Scientometrics. 106 (2), 787-804 (2016).</li><li>Aghaei Chadegani, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A comparison between two main academic literature collections: Web of Science and Scopus databases. , (2013).</li><li>Testa, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Thomson+Reuters+journal+selection+process.">The Thomson Reuters journal selection process.</a> Transnational Corporations Review. 1 (4), 59-66 (2009).</li><li>Burnham, J. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Scopus database: a review. 3 (1), 1 (2006).</li><li>Small, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualizing+science+by+citation+mapping.">Visualizing science by citation mapping.</a> Journal of the American society for Information Science and Technology. 50 (9), 799-813 (1999).</li><li>Cobo, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Science+mapping+software+tools:+Review,+analysis,+and+cooperative+study+among+tools.">Science mapping software tools: Review, analysis, and cooperative study among tools.</a> Journal of the American Society for Information Science and Technology. 62 (7), 1382-1402 (2011).</li><li>. Statistical Yearbook – 60th issue Available from: <a target="_blank" href="https://unstats.un.org/unsd/publications/statistical-yearbook/">https://unstats.un.org/unsd/publications/statistical-yearbook/</a> (2018)</li><li>Mongeon, P., Paul-Hus, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+journal+coverage+of+Web+of+Science+and+Scopus:+a+comparative+analysis.">The journal coverage of Web of Science and Scopus: a comparative analysis.</a> Scientometrics. 106 (1), 213-228 (2016).</li></ol>

В этом исследовании были предоставлены шаги, с помощью которых базы данных PubMed, Scopus и Web of Science используются для проведения библиометрического анализа. Было указано, что самым дружелюбным и самым простым инструментом для использования для библиометрического анализа услуг является Web of S...

Классически, исследователи использовали базы данных литературы для выполнения обзора литературы для своих исследований1. Другое использование этих баз данных литературы возникло в конце19-го века, где исследователи проанализировали тело литературы, использование которого медленно растет с2. В последние несколько десятилетий оцифровка литературы и формирование онлайновых баз данных литературы дали возможность исследователям легко и эффективно анализировать объем литературы и результаты исследований. Примером может быть анализ результатов исследований для документа3,предмет4,дисциплина5,страна6,или даже регион в мире7. Этот тип анализа известен как библиометрический анализ. Heartsill Янг определил библиометрический анализ как использование статистических методов для анализа тела литературы, чтобы выявить историческое развитие8. Другими словами, библиометрия – это количественное исследование опубликованных единиц на основе цитирования и анализа текста9.
Различные базы данных используются для библиометрического анализа, и каждая база данных имеет различные характеристики и может предоставлять различные услуги10. В настоящее время наиболее часто используемые базы данных литературы Web of Science и Scopus для почти всех дисциплин, как доступные только на основе подписки11, и PubMed для биомедицинских и медико-биологических наук, свободно доступная база данных10. Существует также Google Scholar, который может быть простым инструментом для обработки, но он не должен использоваться в качестве инструмента библиометрического анализа в настоящее время из-за некоторых недостатков, таких как его неясный охват и охват, отсутствие инструментов анализа цитирования, и его включение не-равный рассмотрено ненаучное содержание12,13. Кроме того, Google Scholar не хватает инструментов для выполнения расширенного поиска и оптимизации ключевых слов14.
Несколько предыдущих исследований сравнили особенности ранее упомянутых баз данных литературы для целей обзора литературы3,5,10,12,13,15 ,16,17. Однако в этом исследовании будут предоставлены средства, с помощью которых используются базы данных PubMed, Scopus и Web of Science для выполнения библиометрического анализа, а также будут сопоставлены плюсы и минусы для каждой из них. Библиометрический анализ может быть использован для анализа результатов исследований практически в любой дисциплине, поэтому целевой аудиторией будет любой исследователь, который намерен анализировать тенденции публикации. С использованием каждой базы данных будет представлен пример анализа тенденции публикации в Иордании как стране. Иордания была выбрана потому, что сделать библиометрический анализ для страны (в отличие от субъекта) не очень просто. Кроме того, Иордания, в частности, плохо изучена в библиометрическом виде, поскольку это может быть как имя автора, так и название страны. Мы объясняем, как преодолеть такой вызов в поиске.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:1267px;" width="1266">
	<tbody>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:216px;"></td>
			<td style="width:123px;">clarivate</td>
			<td style="width:344px;">N/A</td>
			<td style="width:584px;">Web of Science provider, where the access was provided by the subscription made by the University of Jordan.</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;"></td>
			<td>Elsevier</td>
			<td>N/A</td>
			<td>Scopus provider, where the access was provided by the subscription made by the University of Jordan.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

comparing bibliometric analysis using pubmed, scopus, and web of science databases

Литературные базы данных(т.е.PubMed, Scopus и Web of Science) различаются по охвату, фокусу и инструменту, который они предоставляют. PubMed фокусируется главным образом на науке о жизни и биомедицинских дисциплинах, в то время как Scopus и Web of Science являются многодисциплинарными. Протокол, описанный в текущем исследовании, использовался для поиска публикаций иорданских авторов в 2013-2017 годах. В этом протоколе подробно описано, как использовать каждую базу данных для проведения такого рода поиска. В результате поиска Scopus было выкуплено наибольшее количество документов (11 444 документа), за которым последовал поиск в Интернете (10 943 документа). В результате PubMed стало меньшее количество документов из-за более узкого охвата и охвата (4363 документа). Результаты также показывают ежегодную тенденцию в: (1) количество публикаций, (2) дисциплины, которые имеют большинство публикаций, (3) страны сотрудничества, и (4) число публикаций открытого доступа. В отличие от этого, PubMed имеет сложную службу оптимизации ключевых слов(т.е.,Заголовок медицинской темы, или MeSH), в то время как Scopus и Web of Science предоставляют инструменты анализа поиска, которые могут производить репрезентативные цифры. Наконец, элементы каждой базы данных подробно разъясняются, и предоставляются несколько индексов, которые могут быть извлечены с помощью результатов поиска. Данное исследование обеспечивает основу для использования литературных баз данных для библиометрического анализа.

Результаты поиска PubMed
На основе поиска, проведенного в ходе этого исследования, было изъято в общей сложности 4363 документа. Бесплатный полный текст был доступен для 1767 документов (40,5%). В 2013 году было опубликовано 532 документа, в...

Watch this Scientific Journal Video about Comparing Bibliometric Analysis Using PubMed, Scopus, and Web of Science Databases at JoVE.com

Comparing Bibliometric Analysis Using PubMed, Scopus, and Web of Science Databases

Базы данных по литературе обычно используются для оценки публикаций по определенному предмету, дисциплине, стране или региону мира, что является практикой, известной как библиометрический анализ. В текущем протоколе подробно описано, как использовать базы данных PubMed, Scopus и Web of Science для библиометрического анализа.

Сравнение библиометрического анализа с использованием баз данных PubMed, Scopus и Web of Science

Literature databases (i.e., PubMed, Scopus, and Web of Science) differ in terms of their coverage, focus, and the tool they provide. PubMed focuses mainly ...

Этот метод может помочь ответить на ключевые вопросы в области библиометрического анализа о доступных базах данных поиска и о том, как выбрать наиболее подходящий. Основным преимуществом этого протокола является то, что он обеспечивает пошаговой подход к использованию различных баз данных, так что любой исследователь может успешно выполнить библиометрический анализ. Для анализа результатов иорданских исследований в течение пятилетнего периода с 1 января 2013 года по 31 декабря 2017 года, используя PubMed, откройте форму Advanced Search и введите Иорданию в качестве поискового термина, указав Affiliation в качестве поля поиска.Чтобы исключить все документы, автором которого является исследователь по имени Иордания, из аффилированной страны, которая не является Иорданией, ввести Иорданию в другую область и выбрать автора полевого типа. Выберите оператора NOT в качестве разъема между двумя полями и нажмите Поиск. Укажите даты публикации с 1 января 2013 года по 31 декабря 2017 года в окне результатов и выберите статью и обзор журнала из типов статей.Для анализа результатов иорданских исследований в течение пятилетнего периода с 1 января 2013 года по 31 декабря 2017 года с помощью Scopus откройте веб-сайт Scopus и введите соответствующую информацию для входа в систему Elsevier. Далее введите Иорданию в качестве поискового термина и укажите страну Affiliation в качестве поля поиска. Ограничьте продолжительность поиска с 2013 по 2017 год.Отметим, что с 2013 года означает с 1 января 2013 года и до 2017 года означает до 31 декабря 2017 года. Затем ограничьте тип документа статьей или обзором и нажмите кнопку Поиск. Для анализа результатов иорданских исследований в течение пятилетнего периода с 1 января 2013 года по 31 декабря 2017 года с помощью Web of Science откройте веб-сайт Web of Science и войдите в систему с соответствующей информацией об учетной записи Web of Science.Введите Иорданию в поле поиска и укажите адрес. Определите продолжительность поиска в период с 2013 по 2017 год и нажмите Поиск. Ограничьте поиск с помощью фильтров article and Review и выберите для анализа результатов, сохраненных в истории поиска сейчас или позже.Затем укажите, должны ли результаты отображаться в таблице, визуальной карте дерева или барах. Здесь показаны годы в иорданском издании в течение пятилетнего интервала с 2013 по 2017 год в соответствии с поиском Scopus и поиском Web of Science. По данным страны сотрудничества в поиске Scopus, Соединенные Штаты Америки являются наиболее распространенной страной, с которой иорданские исследователи сотрудничают, а затем Саудовской Аравией и Великобританией.Согласно поиску Web of Science, Соединенные Штаты являются наиболее распространенной страной, с которой иорданцы сотрудничают, за которыми следуют Франция и Австрия. Из 10 наиболее распространенных дисциплин, в которых иорданцы опубликовали, медицина является наиболее распространенным, а затем инженерных и социальных наук в соответствии с поиском Scopus. Согласно поиску Web of Science, из 10 наиболее распространенных дисциплин, в рамках которых иорданцы опубликовали, инженерные, математические и компьютерные науки являются тройкой лидеров.При попытке этого протокола, важно помнить, чтобы выбрать соответствующую базу данных, прежде чем начать анализ. Например, PubMed посвящен только биомедицинским наукам. После этого протокола и после загрузки результатов в формате CSV для пространственного представления результатов могут быть выполнены дополнительные методы анализа, такие как библиометрическое отображение.После своего развития, этот протокол проложил путь для исследователей во всех областях, чтобы исследовать тенденции исследований в своих дисциплинах легко и эффективно.

Research

JoVE Journal

Medicine

Quantitative Analysis of Cancer Metastasis using an Avian Embryo Model

Количественный анализ рака метастазы использовании Птичий Модель эмбрионов

During metastasis cancer cells disseminate from the primary tumor, invade into surrounding tissues, and spread to distant organs. Metastasis is a complex ...

Transcriptomic Analysis of Human Retinal Surgical Specimens Using jouRNAl

Транскриптомных анализ человеческой сетчатки Хирургические образцы Использование Журнала

Retinal detachment (RD) describes a separation of the neurosensory retina  from the retinal pigmented epithelium (RPE). The RPE is essential for normal  ...

Clinicopathological Analysis of miRNA Expression in Breast Cancer Tissues by Using miRNA In Situ Hybridization

Clinicopathological Analysis of miRNA Expression in Breast Cancer Tissues by Using miRNA In Situ Hybridization

Анализ клинико-патологическими микроРНК выражения при раке молочной железы ТКАНЕЙ с помощью микроРНК<em&gt; В Ситу</em&gt; Гибридизация

In this article, we describe a detailed protocol for miRNA detection in breast cancer tissue using in situ hybridization with a digoxigenin-labelled LNA ...

Strategic Endothelial Cell Tube Formation Assay: Comparing Extracellular Matrix and Growth Factor Reduced Extracellular Matrix

Стратегическая эндотелиальных клеток Tube Формирование анализа: Сравнение внеклеточного матрикса и фактор роста Снижение внеклеточного матрикса

Malignant tumors require a blood supply in order to survive and spread. These tumors obtain their needed blood from the patient's blood stream by ...

Video Movement Analysis Using Smartphones (ViMAS): A Pilot Study

Video Movement Analysis Using Smartphones ViMAS: A Pilot Study

Видео Анализ движения, используя смартфоны (VIMAS): Пилотное исследование

The use of smartphones in clinical practice is steadily increasing with the availability of low cost/freely available &#34;apps&#34; that could be used to ...

Comparing the Effects of Electronic Cigarette Vapor and Cigarette Smoke in a Novel In Vivo Exposure System

Comparing the Effects of Electronic Cigarette Vapor and Cigarette Smoke in a Novel In Vivo Exposure System

Сравнение эффектов электронного сигаретного пара и сигаретного дыма в романе<em&gt; In Vivo</em&gt; Система экспозиции

Electronic cigarettes (E-cigarettes) are being widely used, and growing in popularity. It is estimated that more than 9 million adults use them regularly. ...

Executing Complexity-Increasing Queries in Relational (MySQL) and NoSQL (MongoDB and EXist) Size-Growing ISO/EN 13606 Standardized EHR Databases

Executing Complexity-Increasing Queries in Relational MySQL and NoSQL MongoDB and EXist Size-Growing ISO/EN 13606 Standardized EHR Databases

Выполнение повышения сложности запросов в реляционных (MySQL) и NoSQL (MongoDB и существуют) растущий размер баз данных ISO/EN 13606 стандартизированных EHR

This research shows a protocol to assess the computational complexity of querying relational and non-relational (NoSQL (not only Structured Query ...

'Boden Food Plate': Novel Interactive Web-based Method for the Assessment of Dietary Intake

«Еда Boden плита»: Роман интерактивные веб-метод для оценки рацион

Different methods can be used in research to assess dietary intake, many of which are still paper-based. Written estimated food diaries are often utilized ...

Hydra, a Computer-Based Platform for Aiding Clinicians in Cardiovascular Analysis and Diagnosis

Гидра, компьютер-платформа для помогая врачам в сердечно-сосудистой системы анализа и диагностики

Cardiovascular diseases (CVDs) are the leading cause of death throughout the world. The total risk of developing CVD is determined by the combined effect ...

Bio-energetics Investigation of Candida albicans Using Real-time Extracellular Flux Analysis

Bio-energetics Investigation of Candida albicans Using Real-time Extracellular Flux Analysis

Биоэнергетика расследование Candida albicans с помощью реального времени внеклеточного потока анализа

Mitochondria are essential organelles for the cellular metabolism and survival. A variety of key events take place in mitochondria, such as cellular ...