Name: long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)
Uploaded: 2019-04-08T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

الكتاب نشعر بالامتنان للدكتور جوان ب الشركة التي تمول بنشر هذا العمل. أيضا، ممتنون المؤلفون إلى فنيين منطقة الحوض التجريبي في معهد "العلوم البحرية" في برشلونة (ICM-السفن) لمساعدتهم أثناء العمل التجريبي.
هذا العمل كان يدعمها المشروع ريتفيم (CTM2010-16274؛ والباحث الرئيسي: اغوزي J.) تأسست من قبل وزارة العلوم الإسبانية والابتكار (ميسين)، ومنحة TIN2015-66951-C2-2-R من الإسبانية وزارة الاقتصاد والقدرة التنافسية.

الأنواع المستخدمة في هذه الدراسة ليست أنواع المهددة بالانقراض أو المحمية. أخذ العينات ومختبر تجارب يتبع التشريع الإسباني واللوائح (ICM-السفن) المؤسسية الداخلية فيما يتعلق بالرفق بالحيوان. وقد أجرى العينات الحيوانية بإذن السلطة المحلية (حكومة كاتالونيا الإقليمية).
1-الحيوان ا...

وأكدت نتائج الأداء والممثل الحصول عليها مع بروتوكول تتبع الفيديو صلاحيته للبحوث التطبيقية في مجال سلوك الحيوانات، مع التركيز بوجه خاص على التشكيل الاجتماعي وايقاعات circadian كوهوسيد الحيوانات. الكفاءة للكشف عن الحيوانات (69%) ودقة تمييز العلامة (89.5%) مقترنة بالخصائص السلوكية (أي بمعدل الحركة)...

في السنوات القليلة الماضية، قدمت التتبع الآلي يستند إلى صورة دقيقة للغاية من مجموعات البيانات التي يمكن استخدامها لاستكشاف المسائل الأساسية في تخصصات علم البيئة والسلوك1. يمكن استخدام هذه البيانات للتحليل الكمي لسلوك الحيوانات2،3. ومع ذلك، قد كل صورة المنهجية المستخدمة لتعقب الحيوانات وتقييم سلوك مواطن قوتها والقيود. في البروتوكولات تتبع المستندة إلى الصور التي تستخدم المعلومات المكانية من الإطارات السابقة في فيلم لتعقب الحيوانات4،،من56، يمكن إدخال أخطاء عندما عبر مسارات اثنين من الحيوانات. هذه الأخطاء هي عموما لا رجعة فيه، وتنتشر عبر الزمن. وعلى الرغم من التقدم الحسابية التي تخفض أو تقريبا القضاء على هذه المشكلة5،7، هذه التقنيات لا تزال بحاجة بيئات تجريبية متجانسة لدقة تعريف الحيوانات وتتبع.
توظيف علامات يمكن تعريفه بشكل فريد في الحيوانات يتجنب هذه الأخطاء، ويتيح تعقب طويل الأجل للأفراد الذين يتم تحديدهم. علامات تستخدم على نطاق واسع (مثلالرموز الشريطية ورموز ريال قطري) موجودة في الصناعة والتجارة، ويمكن تحديدها باستخدام تقنيات رؤية الكمبيوتر المعروفة، مثل زيادة الواقع (مثلاً، أرتاج8) ومعايرة الكاميرا (مثلاً، كالتاج9 ). سبق استخدمت الحيوانات المعلمة للدراسات السلوكية الفائق في الأنواع الحيوانية المختلفة، للمثال،3 من النمل أو النحل10، ولكن بعض هذه النظم السابقة ليست الأمثل للاعتراف بالعلامات معزولة3.
بروتوكول التعقب المعروضة في هذه الورقة مناسبة خاصة لتعقب الحيوانات في صور قناة واحدة، مثل الأشعة تحت الحمراء (IR) خفيفة أو الضوء أحادي اللون (خاصة، يمكننا استخدام الضوء الأزرق). ولذلك لا تستخدم طريقة وضع رموز الألوان، يجري أيضا للتطبيق في البيئات الأخرى حيث توجد قيود في الإضاءة. وبالإضافة إلى ذلك، نحن نستخدم علامات مخصصة مصممة لكي لا تخل جراد البحر، وفي الوقت نفسه، تسمح للتسجيل مع كاميرات منخفضة التكلفة. وعلاوة على ذلك، تقوم الطريقة المستخدمة هنا على كشف العلامة مستقلة عن الإطار (.، أي الخوارزمية تعترف بوجود كل علامة في الصورة بغض النظر عن المسارات السابقة). تعتبر هذه الميزة ذات الصلة في التطبيقات حيث تغطي الحيوانات يمكن أن يكون مؤقتاً، أو قد تتقاطع المسارات الحيوانات.
تصميم العلامة يسمح استخدام مجموعات مختلفة من الحيوانات. حالما يتم تعيين المعلمات للأسلوب، فإنه يمكن نقلها إلى معالجة مشاكل أخرى تتبع الحيوانات دون الحاجة إلى تدريب مصنف معين (القشريات أو الرخويات الأخرى). هي القيود الرئيسية المصدرة للبروتوكول بحجم العلامة والحاجة إلى التمسك بالحيوان (مما يجعله غير مناسب للحشرات الصغيرة مثل الذباب والنحل، إلخ)، وعلى افتراض 2D لحركة الحيوانات. هذا القيد مهم، نظراً لأن الطريقة المقترحة يفترض حجم العلامة يظل ثابتاً. الحيوانات تتحرك بحرية في بيئة ثلاثية الأبعاد (مثل السمك) سوف تظهر علامة مختلفة الأحجام اعتماداً على المسافة للكاميرا.
والغرض من هذا البروتوكول توفير منهجية سهلة الاستخدام لتتبع الحيوانات كلمات متعددة على مدى فترة طويلة من الزمن (أيام أو أسابيع) في سياق ثنائي الأبعاد. ويستند النهج المنهجي استخدام برمجيات المصدر المفتوح والأجهزة. تراخيص البرمجيات الحرة والمفتوحة المصدر التكيفات والتعديلات، وإعادة توزيعها مجاناً؛ ولذلك، يحسن البرنامج الذي تم إنشاؤه في كل خطوة11،12.
البروتوكول المعروضة هنا يركز على مختبر لتتبع وتقييم النشاط الحركي للحيوانات المائية الأربعة في خزان لمدة 5 أيام. ملفات الفيديو المسجلة من صورة الوقت الفاصل بين s 1 وجمعها في شريط فيديو في 20 الإطارات لكل ثانية (1 يوم مسجل تحتل حوالي 1 ح فيديو). جميع تسجيلات الفيديو يتم بوستبروسيسيد تلقائياً للحصول على مواقف الحيوان، تطبيق خوارزميات وطرق رؤية الكمبيوتر. أن البروتوكول يسمح بالحصول على كميات كبيرة من بيانات، تجنب الشرح اليدوي، الذي أظهر أن يكون الوقت كثيفة ومضنية في ورقات التجريبية السابقة13تتبع.
نحن نستخدم جراد البحر النرويج (النرويجي نيفروبس) لدراسة الحالة؛ وهكذا، نوفر الظروف المختبرية إبلاغها للحفاظ عليها. جراد البحر أداء إيقاعات ظهور الجحر مدروسة التي تخضع لسيطرة ال14،الإيقاعية على مدار الساعة15، وعند كوهوسيد، وهي تشكل هيمنة التسلسل الهرمي16،17. ومن ثم، النموذج المعروض هنا مثال جيد للباحثين المهتمين بتحوير السلوك مع التركيز بوجه خاص على إيقاعات سيركاديان الاجتماعية.
المنهجية المقدمة هنا ويرد بسهولة ويمكن تطبيقها على الأنواع الأخرى إذا لم يكن هناك إمكانية للتمييز بين الحيوانات مع العلامات الفردية. الحد الأدنى من المتطلبات لاستنساخ هذا نهج في المختبر (ط) غرف متحاور للإعداد التجريبية؛ (ثانيا) إمدادات المياه مستمرة؛ (الثالث) آليات مراقبة درجة حرارة المياه؛ (رابعا) نظام تحكم بضوء؛ (ت) كاميرا USB وجهاز كمبيوتر قياسية.
نستخدم في هذا البروتوكول، بيثون18 و OpenCV19 (الكمبيوتر رؤية المكتبة مفتوحة المصدر). ونحن نعتمد على عمليات سريعة ويشيع التطبيقية (سواء من حيث التنفيذ والتنفيذ)، مثل خلفية الطرح20 والصورة العتبة21،22.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:860px;" width="860">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Tripod 475</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">A0673528</td>
			<td style="width:307px;">Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Articulated Arm 143</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">D0057824</td>
			<td>Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camera USB 2.0 uEye LE</td>
			<td style="width:113px;">iDS</td>
			<td style="width:123px;">UI-1545LE-M</td>
			<td>https://en.ids-imaging.com/store/products/cameras/usb-2-0-cameras/ueye-le.html</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:317px;">Fish Eye Len C-mount f=6mm/F1.4</td>
			<td style="width:113px;">Infaimon</td>
			<td style="width:123px;">Standard Optical&#160;</td>
			<td style="width:307px;">https://www.infaimon.com/es/estandar-6mm</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:317px;">Glass Fiber Tank 1500x700x300 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Black Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Tank</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>5 Wood Strips 50x50x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>10 Wood Strips 25x25x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Stainless Steel Screws</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>As many as necessary for fix wood strips structures</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">PC</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2-cores CPU, 4GB RAM, 1 GB Graphics, 500 GB HD</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">External Storage HDD</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2 TB capacity desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">iSPY Sotfware for Windows PC</td>
			<td style="width:113px;">iSPY</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.ispyconnect.com/download.aspx</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Zoneminder Software Linux PC</td>
			<td style="width:113px;">Zoneminder</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://zoneminder.com/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">OpenCV 2.4.13.6 Library</td>
			<td style="width:113px;">OpenCV</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://opencv.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Python 2.4</td>
			<td style="width:113px;">Python</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.python.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camping Icebox</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Plastic Tray</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Cyanocrylate Gel</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>To glue tag&#8217;s&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 black PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 white PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Tag&#8217;s &#216; 40 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Maked with black &#38; white PVC plastic sheet</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Blue Strid Led Ligts (480 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m IR Strid Led Ligts (850 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">6m&#160; Methacrylate Pipes &#216; 15 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Enclosed Strid Led</td>
		</tr>
		<tr height="23">
			<td height="23" style="height:23px;width:317px;">4 PVC Elbow&#160; 45o &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Flexible PVC Pipe &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 PVC Screwcap &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 O-ring &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Female PVC socket glue / thread &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">10 m DC 12V Electric Cable</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Ligt Power Supply DC 12V 300 w</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">MOSFET, RFD14N05L, N-Canal, 14 A, 50 V, 3-Pin, IPAK (TO-251)</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>325-7580</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">Diode, 1N4004-E3/54, 1A, 400V, DO-204AL, 2-Pines</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>628-9029</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse Holder</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>336-7851</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">2 Way Power Terminal 3.81mm</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>220-4658</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Capacitor 220 &#181;F 200 V</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>440-6761</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Resistance 2K2 7W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>485-3038</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse 6.3x32mm 3A</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>413-210</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Arduino Uno Atmel Atmega 328 MCU board</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>715-4081</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Prototipe Board CEM3,3 orific.,RE310S2</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>728-8737</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">DC/DC converter,12Vin,+/-5Vout 100mA 1W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>689-5179</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2 SERA T8 blue moonlight fluorescent bulb 36 watts</td>
			<td style="width:113px;">SERA</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Discontinued / Light isolated facility</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)

نقدم بروتوكول ذات الصلة بأسلوب التعقب بالفيديو على أساس الطرح الخلفية والصورة العتبة التي تجعل من الممكن تعقب الحيوانات كوهوسيد على حدة. نحن اختبار تتبع الروتين مع أربعة كوهوسيد النرويج الكركند (النرويجي نيفروبس) تحت ظروف الضوء الظلام لمدة 5 أيام. جراد البحر قد تم معلم على حدة. الإعداد التجريبية وتتبع التقنيات المستخدمة تستند كلياً على برمجيات المصدر المفتوح. مقارنة الإخراج تتبع مع الكشف عن دليل يشير إلى أن جراد البحر تم بشكل صحيح الكشف عن 69% الأوقات. كان بين الكركند تم الكشف عنه بشكل صحيح، العلامات الفردية بشكل صحيح وحدد 89.5 في المائة الأوقات. نظراً لمعدل الإطارات المستخدمة في البروتوكول ومعدل حركة الكركند، أداء تتبع الفيديو ذات نوعية جيدة، ودعم النتائج الممثل سريان البروتوكول في إنتاج بيانات قيمة للاحتياجات البحثية (الفرد شغل الفضاء أو أنماط النشاط الحركي). البروتوكول المعروضة هنا يمكن تخصيصها بسهولة، وهو، ومن ثم يمكن نقلها إلى الأنواع الأخرى حيث يمكن تتبع كل من العينات في مجموعة قيمة للإجابة على أسئلة البحث.

نحن يدوياً شيدت مجموعة فرعية من البيانات التجريبية للتحقق من صحة تحليل الفيديو الآلي. حجم عينة من الإطارات 1,308 بمستوى ثقة 99 في المائة (وهو تدبير أمني أن يبين ما إذا كانت العينة يعبر بدقة عن السكان، وضمن لها هامش الخطأ) ومع هامش خطأ قدرة 4% (وهي النسبة مئوية التي توضح هذه المق...

Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus

نقدم هنا بروتوكولا لتعقب الحيوانات على حدة على مدى فترة طويلة من الزمن. ويستخدم الكمبيوتر رؤية أساليب تحديد مجموعة من العلامات المركبة يدوياً باستخدام مجموعة من جراد البحر كدراسة حالة، في نفس الوقت توفير المعلومات بشأن كيفية البيت، التلاعب، ووضع علامة جراد البحر.

تتبع الفيديو الطويلة الأجل من الحيوانات المائية كوهوسيد: دراسة حالة من "النشاط الحركي اليومي" "النرويج جراد البحر" (النرويجي نيفروبس)

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

يسمح هذا البروتوكول بأتمتة تتبع الحيوانات المتعددة. استخدام تسمية بسيطة لتحديد كل أداة تحليل معرف للكشف عن العلامات. هذا البروتوكول يقلل بشكل كبير من عدد الساعات المطلوبة لتحليل تسجيلات الفيديو باستخدام بيانات leskey.لتقدير أكثر دقة الإكمال من الدراسات التجريبية. الحيوانات في بيئات أخرى يمكن أن تكون الموسومة بطريقة مماثلة يمكن تتبعها مع بروتوكولات مماثلة توفير التطبيق في علم الكروموبيولوجيا، والبيئة، والبحوث الفيروسية أو علم الأعصاب. لقد قدمنا تصميم الأجهزة ولغة البرمجة مفتوحة المصدر وتوفير نموذج نوصي المستخدمين اعتماد في البروتوكولات لتعلم لغة البرمجة بيثون.لبناء علامة للحيوان المستهدف، قطع أولا أربع دوائر قطرها 40 ملليمتر من ورقة بلاستيكية سوداء، واثنين من مثلثات متساوية الأضلاع من جانب 26 ملليمتر واثنين من دوائر قطرها 26 ملليمتر من ورقة PVC البلاستيكية البيضاء. وضع علامة على مركز مثلث أبيض واحد ودائرة بيضاء واحدة. و نصنع حفرة 10 مليمترات عند كل علامةثم الغراء شكل واحد أبيض في وسط كل من الدوائر السوداء الأربعة. لإعداد المنطقة التجريبية، ضع المصابيح الأشعة تحت الحمراء الظلام في الخزان. إبقاء أضواء الأشعة تحت الحمراء في جميع الأوقات.المقبل، ضع ضوء الضوء الأزرق أضواء LED في خزان الألياف الزجاجية المعدلة التي تحتوي على الرمال وأربعة مرنة خوابر الأنابيب البلاستيكية، وربط الأضواء إلى جهاز لإدارة فترة الصورة. عندما تم وضع جميع الأضواء، ضع مدخل مياه البحر المبردة في زاوية واحدة من الخزان، مع منفذ المقابلة في الزاوية المقابلة. تأكد من أن مدخلات مياه البحر يتم إعدادها بمعدل تدفق حوالي 4 لترات في الدقيقة.احيط الغرفة بستارة سوداء لتوفير العزل الكامل عن الضوء الخارجي. ضع ترايبود مجهز بكاميرا الويب إلى جانب الساحة التجريبية ، مع الكاميرا 130 سنتيمترًا فوق ووسط الساحة التجريبية. قم بتوصيل الكاميرا بجهاز كمبيوتر خارج الستارة، وضبط معلمات تسجيل الفيديو وفقًا لخصائص الأنواع، مع التأكد من إنشاء طابع زمني، بما في ذلك التاريخ في فيديو الفاصل الزمني، من أجل التسجيل السلوكي في نهاية المطاف.لوضع علامة على الحيوانات، أضف 7 درجة مئوية من الماء إلى صندوق الثلج مع مقصورات مغمورة، ووضع 4 جراد البحر في 4 مقصورات منفصلة. بعد السماح لكبستر للتأقلم لمدة 30 دقيقة، نقل جراد البحر واحد على صينية من الجليد المسحوق لمدة خمس دقائق، واستخدام الورق absorptive لتجفيف الجزء العلوي من cephalothorax جراد البحر غير المزمولول. وضع قطرة من الغراء التجفيف السريع على carapace المجففة واضغط على علامة الغراء لمدة 20 ثانية، حتى يصلب الغراء.ثم العودة جراد البحر إلى مقصورتها في صندوق الثلج، وتسمية الحيوانات الثلاثة الأخرى بنفس الطريقة. عندما تم تصنيف جميع جراد البحر، ضع الكركند مرة أخرى في زنزانتهم لمدة 24 ساعة. في اليوم التالي، استخدم نفس صندوق الثلج لنقل الكركند من مرفق التأقلم إلى الغرفة التجريبية، وبدء تسجيل الفيديو.تنفيذ خطوات وضع العلامات ونقلها في ظل ظروف الضوء الأحمر لتجنب تلف شعاعي لسرطان البحر للمستقبلات. قد لا تحتاج أنواع المياه الإضافية أو الأنواع البرية إلى هذه الرعاية. ثم الحصول على صورة خلفية متوسطة من خمس دقائق من الفيديو أو من الإطارات الأولية 100 قبل إدخال الحيوانات واحدا تلو الآخر في خزان التجريب داخل مقصورات كل منها من الماء، وانتظر جراد البحر للخروج من مقصوراتها.ومن بين اجمالى عدد الحيوانات التى تم احصاءها فى هذه التجربة التمثيلية ، تمت مطابقة 79 فى المائة من اكتشافات الحيوانات بشكل صحيح من خلال البرنامج ، وتم تحديد 89.5 فى المائة من العلامات بشكل صحيح . فقط 3.8 في المئة من العلامات تم تصنيفها بشكل غير صحيح. ولكن الـ 6.6 في المائة المتبقية تقابل الإيجابيات الكاذبة.بعد الانتهاء من تحليل فيديو محدد، يمكن استخدام البيانات المواقف التي تم الحصول عليها لتقييم الأنماط السلوكية المختلفة من جراد البحر. على سبيل المثال، خريطة شغل المساحة، باستخدام تقدير كثافة القرنية ثنائي الأبعاد مع محور محاذاة بمرونة العادية kernal تقييمها على شبكة مربعة، يسمح المناطق التي جراد البحر تنفق نسبة مئوية أعلى من وقتهم لتكون ممثلة مع مخططات كثافة اللون عالية. ويمكن أيضا أن الإيقاعات النشاط اليومي من جراد البحر يمكن رسمها كما ملليمتر مغطاة في فترات عشرة دقيقة binned مع مرور الوقت.من المهم الحفاظ على المواصفات الدقيقة من حيث الحجم والشكل وتنفيذ دائمًا خطوة التحليل في الخلفية بدون واجهة مستخدم. يمكن توسيع نموذج تحليل الصور للنظر في مكونات محددة من القشريات للمساعدة في تحسين الدراسة السلوكية من حيث التفاعلات الحيوانية. تحدث هذه التفاعلات الاجتماعية الحيوانية المعقدة بطريقة مماثلة في بيئة فعلية تسمح بأسلوب البحث البيولوجي وجوانبه المهمة مع بعض التطبيقات للإيكولوجيا وعلم الأعصاب.

Research

JoVE Journal

Environment

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster (Nephrops norvegicus)

Determination of Microbial Extracellular Enzyme Activity in Waters, Soils, and Sediments using High Throughput Microplate Assays

تقرير من خارج الخلية الميكروبية نشاط انزيم في المياه، والتربة، والرواسب باستخدام إنتاجية عالية صفيحة ميكروسكوبية فحوصات

Much of the nutrient cycling and carbon  processing in natural environments occurs through the activity of extracellular  enzymes released by ...

Modifying the Bank Erosion Hazard Index (BEHI) Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

Modifying the Bank Erosion Hazard Index BEHI Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

تعديل مؤشر (الباهي) بروتوكول البنك تآكل المخاطر للتقييم السريع للStreambank تآكل في شمال شرق أوهايو

Understanding the source of pollution in a stream is vital to preserving, restoring, and maintaining the stream&#8217;s function and habitat it provides. ...

The Use of an Automated System (GreenFeed) to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

The Use of an Automated System GreenFeed to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

استخدام النظام الآلي (GreenFeed) لرصد المعوية الميثان وثاني أكسيد الكربون الانبعاثات الناتجة عن الحيوانات المجترة

Ruminant animals (domesticated or wild) emit methane (CH4) through enteric fermentation in their digestive tract and from decomposition of manure during ...

Alternative Method of Removing Otoliths from Sturgeon

طريقة بديلة لإزالة Otoliths من سمك الحفش

Extracting the otoliths (ear bones) from fish that have very thick skulls can be difficult and very time consuming. The common practice of making a ...

Field Experiments of Pollination Ecology: The Case of Lycoris sanguinea var. sanguinea

Field Experiments of Pollination Ecology: The Case of Lycoris sanguinea var. sanguinea

التجارب مجال التلقيح البيئة: حالة<em&gt; المذئبة الدموية لل</em&gt; فار.<em&gt; الدموية لل</em

Plant-pollinator interactions have been studied for approximately one hundred years. During that time, many field methods have been developed to clarify ...

Using Pharmacological Manipulation and High-precision Radio Telemetry to Study the Spatial Cognition in Free-ranging Animals

عن طريق التلاعب الدوائية وعالية الدقة راديو القياس عن بعد لدراسة الإدراك المكاني في الحيوانات الطليقة،

An animal&#39;s ability to perceive and learn about its environment plays a key role in many behavioral processes, including navigation, migration, ...

Development of New Methods for Quantifying Fish Density Using Underwater Stereo-video Tools

استحداث أساليب جديدة لقياس كثافة الأسماك باستخدام أدوات ستيريو-فيديو تحت الماء

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and ...

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

تربية والصيانة الطويلة الأجل من هوفيرفليس تيناكس اريستاليس "البحوث والدراسات"

With an estimated 6000 species worldwide, hoverflies are ecologically important as alternative pollinators to domesticated honeybees. However, they are ...

Experimental Protocol for Examining Behavioral Response Profiles in Larval Fish: Application to the Neuro-stimulant Caffeine

بروتوكول تجريبي لفحص ملفات تعريف الاستجابة السلوكية في الأسماك اليرقات: تطبيق على الكافيين منشط للأعصاب

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and ...

Combining Eye-tracking Data with an Analysis of Video Content from Free-viewing a Video of a Walk in an Urban Park Environment

الجمع بين بيانات تتبع العين مع تحليل محتوي الفيديو من مجانا-مشاهده فيديو للمشي في بيئة الحديقة الحضرية

As individuals increasingly live in cities, methods to study their everyday movements and the data that can be collected becomes important and valuable. ...