Name: long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)
Uploaded: 2019-04-08T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

Forfatterne er taknemmelig for, at Dr. Joan B. virksomheden, der finansierede udgivelsen af dette værk. Forfatterne er også taknemmelig for, at teknikere på zonen eksperimentelle akvarium til Institute of Marine Sciences i Barcelona (ICM-CSIC) for deres hjælp under det eksperimentelle arbejde.
Dette arbejde blev støttet af RITFIM projektet (CTM2010-16274, principal investigator: J. Aguzzi) blev grundlagt af den spanske ministerium for videnskab og Innovation (MICINN) og TIN2015-66951-C2-2-R grant fra det spanske ministerium for økonomi og konkurrenceevne.

De arter, der anvendes i denne undersøgelse er ikke en truede eller beskyttede arter. Prøveudtagning og laboratorieundersøgelser eksperimenter fulgte den spanske lovgivning og interne institutionelle (ICM-CSIC) bestemmelser vedrørende dyrevelfærd. Animalske prøvetagning blev gennemført med tilladelse fra den lokale myndighed (Cataloniens regionale regering).
1. animalsk vedligeholdelse og prøveudtagning
Bemærk: Følgende protokol er baseret p...

Ydeevne og repræsentant resultaterne med video-tracking protokol bekræftet sin gyldighed for anvendt forskning inden for dyreadfærd, med særlig fokus på sociale graduering og døgnrytmen cohoused dyr. Effektiviteten af animalsk påvisning (69%) og nøjagtigheden af tag forskelsbehandling (89,5%) kombineret med de adfærdsmæssige egenskaber (dvs. bevægelse sats) af de målarter, der anvendes her tyder på, at denne protokol er en perfekt løsning til langsigtet eksperimentelle forsøg (fx, dage og uger). Derudover ...

I de sidste par år, har automatiseret image-baseret sporing givet meget præcise datasæt, der kan bruges til at udforske grundlæggende spørgsmål i økologi og adfærd discipliner1. Disse datasæt kan bruges til kvantitativ analyse af dyrs adfærd2,3. Hvert billede metode bruges til sporing af dyr og adfærd evaluering har imidlertid sine styrker og begrænsninger. I image-baseret sporing protokoller, der bruger rumlig information fra tidligere rammer i en film til at spore dyr4,5,6, kan fejl indføres, når to dyr veje krydses. Disse fejl er normalt irreversible og udbrede gennem tiden. Trods beregningsmæssige forskud, der reducerer eller næsten eliminere dette problem5,7, skal disse teknikker stadig homogene eksperimenterende miljøer for nøjagtig identifikation og sporing.
Ansættelse af mærker, der kan identificeres entydigt i dyr undgår disse fejl og tillader langsigtet sporing af identificerede individer. Udbredte markører (fx, stregkoder og QR-koder) findes i industri og handel og kan identificeres ved hjælp af velkendte computer vision teknikker, såsom augmented reality (f.eks. ARTag8) og kamerakalibrering (f.eks.CALTag9 ). Tagged dyr har tidligere været brugt til høj overførselshastighed adfærdsmæssige undersøgelser i forskellige dyrearter, for eksempel, myrer3 eller bier10, men nogle af disse tidligere systemer ikke er optimeret til anerkende isolerede tags3.
Sporing protokollen præsenteret i dette papir er særligt velegnet til sporing af dyr i én-kanal billeder, såsom infrarød (IR) lys eller monokromatiske lys (især, vi bruger blåt lys). Derfor, metoden udviklet bruger ikke farve stikord, der også gælder for andre indstillinger, hvor der er begrænsninger i belysningen. Derudover bruger vi tilpassede tags designet for ikke at forstyrre hummere og samtidig, tillade optagelse med billige kameraer. Desuden den metode, der anvendes her er baseret på ramme-uafhængig tag påvisning (dvs.., algoritmen, der anerkender tilstedeværelsen af hvert mærke i billedet uanset de foregående baner). Denne funktion er relevante i applikationer hvor dyr kan være midlertidigt tilstoppet, eller dyrenes baner kan skærer hinanden.
Tag design tillader dets anvendelse i forskellige grupper af dyr. Når parametrene for metoden er indstillet, kan det overføres for at tackle andre dyret-tracking problemer uden behov for uddannelse en bestemt klassificering (andre krebsdyr eller havsnegle). De vigtigste begrænsninger eksporterende protokollen er størrelsen af tag og behovet for tilknytning til dyret, (hvilket gør det ikke egnet til små insekter, fluer, bier, etc.) og den 2D antagelse for dyrs bevægelse. Denne begrænsning er væsentlig, eftersom den foreslåede metode forudsætter tag størrelse forbliver konstant. Dyrets bevæger sig frit i et 3D miljø (f.eks. fisk) ville vise forskellige tag størrelser afhængig af dens afstand til kameraet.
Formålet med denne protokol er at give en brugervenlig metode til sporing af flere tagged dyr over en lang periode (dvs., dage eller uger) i forbindelse med 2D. Den metodiske tilgang er baseret på brugen af open source-software og hardware. Gratis og open source software tillader tilpasninger, ændringer og gratis omfordeling; Derfor forbedrer de genererede software på hvert trin11,12.
Protokollen præsenteres her fokuserer på et laboratorium, der er sat op til at registrere og evaluere bevægeapparatet aktiviteten af fire vanddyr i en tank i 5 dage. Video filer er optaget fra en 1 s time-lapse image og samlet i en video ved 20 frames per sekund (1 optaget dag fylder ca. 1 h video). Alle optagelser er automatisk postprocessed at få dyr positioner, anvendelse af computer vision metoder og algoritmer. Protokollen giver mulighed for at opnå store mængder for at spore data, undgå deres manuel anmærkning, som har vist sig at være tidskrævende og besværlige i tidligere eksperimentelle papirer13.
Vi bruger jomfruhummer (Nephrops norvegicus) til casestudie; Vi giver således, artsspecifikke laboratorieforhold at opretholde dem. Hummere udføre velundersøgte burrow fremkomsten rytmer, der er under kontrol af døgnrytmen ur14,15, og når cohoused, de danner dominans hierarki16,17. Modellen præsenteres her er derfor et godt eksempel for forskere interesseret i sociale modulation af adfærd med særlig fokus på døgnrytmen.
Den metode, der præsenteres her gengives let og kan anvendes til andre arter, hvis der er en mulighed for at skelne mellem dyr med individuelle tags. Mindstekrav til reproducering en sådan fremgangsmåde i laboratoriet er (i) isotermisk værelser for opsætningen af eksperimenterende; (ii) en løbende vandforsyning; (iii) vand temperatur kontrolmekanismer; (iv) en lys kontrolsystem; (v) et USB-kamera og en almindelig computer.
I denne protokol, kan vi bruge Python18 og OpenCV19 (Open Source Computer Vision bibliotek). Vi er afhængige af hurtigt og almindeligt anvendt operationer (både med hensyn til gennemførelse og udførelse), såsom baggrunden subtraktion20 og billede tærskel21,22.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:860px;" width="860">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Tripod 475</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">A0673528</td>
			<td style="width:307px;">Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Articulated Arm 143</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">D0057824</td>
			<td>Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camera USB 2.0 uEye LE</td>
			<td style="width:113px;">iDS</td>
			<td style="width:123px;">UI-1545LE-M</td>
			<td>https://en.ids-imaging.com/store/products/cameras/usb-2-0-cameras/ueye-le.html</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:317px;">Fish Eye Len C-mount f=6mm/F1.4</td>
			<td style="width:113px;">Infaimon</td>
			<td style="width:123px;">Standard Optical&#160;</td>
			<td style="width:307px;">https://www.infaimon.com/es/estandar-6mm</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:317px;">Glass Fiber Tank 1500x700x300 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Black Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Tank</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>5 Wood Strips 50x50x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>10 Wood Strips 25x25x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Stainless Steel Screws</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>As many as necessary for fix wood strips structures</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">PC</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2-cores CPU, 4GB RAM, 1 GB Graphics, 500 GB HD</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">External Storage HDD</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2 TB capacity desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">iSPY Sotfware for Windows PC</td>
			<td style="width:113px;">iSPY</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.ispyconnect.com/download.aspx</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Zoneminder Software Linux PC</td>
			<td style="width:113px;">Zoneminder</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://zoneminder.com/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">OpenCV 2.4.13.6 Library</td>
			<td style="width:113px;">OpenCV</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://opencv.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Python 2.4</td>
			<td style="width:113px;">Python</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.python.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camping Icebox</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Plastic Tray</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Cyanocrylate Gel</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>To glue tag&#8217;s&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 black PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 white PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Tag&#8217;s &#216; 40 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Maked with black &#38; white PVC plastic sheet</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Blue Strid Led Ligts (480 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m IR Strid Led Ligts (850 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">6m&#160; Methacrylate Pipes &#216; 15 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Enclosed Strid Led</td>
		</tr>
		<tr height="23">
			<td height="23" style="height:23px;width:317px;">4 PVC Elbow&#160; 45o &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Flexible PVC Pipe &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 PVC Screwcap &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 O-ring &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Female PVC socket glue / thread &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">10 m DC 12V Electric Cable</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Ligt Power Supply DC 12V 300 w</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">MOSFET, RFD14N05L, N-Canal, 14 A, 50 V, 3-Pin, IPAK (TO-251)</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>325-7580</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">Diode, 1N4004-E3/54, 1A, 400V, DO-204AL, 2-Pines</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>628-9029</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse Holder</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>336-7851</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">2 Way Power Terminal 3.81mm</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>220-4658</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Capacitor 220 &#181;F 200 V</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>440-6761</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Resistance 2K2 7W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>485-3038</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse 6.3x32mm 3A</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>413-210</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Arduino Uno Atmel Atmega 328 MCU board</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>715-4081</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Prototipe Board CEM3,3 orific.,RE310S2</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>728-8737</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">DC/DC converter,12Vin,+/-5Vout 100mA 1W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>689-5179</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2 SERA T8 blue moonlight fluorescent bulb 36 watts</td>
			<td style="width:113px;">SERA</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Discontinued / Light isolated facility</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)

Vi præsenterer en protokol, der er relateret til en video-tracking teknik baseret på den baggrund subtraktion og billede tærskel, der gør det muligt at individuelt spore cohoused dyr. Vi testede tracking rutinen med fire cohoused jomfruhummer (Nephrops norvegicus) på lys-mørke betingelser for 5 dage. Hummere havde blevet markeret individuelt. Opsætningen af eksperimenterende og tracking teknikker er udelukkende baseret på open source-software. Sammenligning af tracking output med en manuel registrering viser, at hummere var korrekt registreret 69% af gange. Blandt de korrekt registrerede hummere, deres individuelle tags blev korrekt identificeret 89,5% af gange. Overvejer framerate bruges i protokollen og den bevægelse af hummere, udførelsen af den video tracking har en god kvalitet, og de repræsentative resultater støtter gyldigheden af protokollen i producerer værdifulde data for forskningsbehov (individuel belægning eller bevægeapparatet aktivitet mønstre). Protokollen præsenteres her kan tilpasses nemt og er dermed kan overføres til andre arter, hvor den enkelte sporing af enheder i en gruppe kan være værdifulde for besvarelse af forskningsspørgsmål.

Vi bygget manuelt et undersæt af de eksperimentelle data til at validere den automatiserede videoanalyse. En stikprøve af 1.308 rammer med et konfidensniveau på 99%, (som er en målestok for sikkerhed, der viser om prøven præcist afspejler befolkningens, inden for dens fejlmargen) og en fejlmargen på 4% (hvilket er en procentdel, der beskriver hvor tæt den svar prøven gav er at den reelle værdi i befolkningen) var tilfældigt udvalgt, og en manuel anmærkning af den korrekte iden...

Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus

Her præsenterer vi en protokol for at individuelt spore dyr over en lang periode. Det bruger computer vision metoder til at identificere en række manuelt bygget tags ved hjælp af en gruppe af hummere som casestudie, samtidig giver oplysninger om, hvordan Parlamentet, manipulere, og markere hummere.

Langsigtet Video sporing af Cohoused vanddyr: et casestudie af den daglige bevægeapparatet aktivitet af jomfruhummer (Nephrops norvegicus)

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

Denne protokol giver mulighed for automatisering af sporing af flere dyr. Ved hjælp af en simpel etiket til at identificere hvert dyr et id-analyseværktøj til at opdage tags. Denne protokol reducerer det antal timer, der er nødvendigt for at analysere videooptagelserne ved hjælp af leskey-data, betydeligt.at vurdere mere nøjagtige afslutninger fra forsøgsundersøgelserne. Dyr i andre miljøer, der kan mærkes på samme måde, kan spores med lignende protokoller, der giver anvendelse i kronobiologi, økologi, viral forskning eller neurovidenskab. Vi har givet hardware design og open source programmeringssprog og give en model, vi anbefaler brugerne vedtage i protokollerne for at lære Python programmeringssprog.At konstruere et mærke til målet dyret, først skære fire 40 millimeter diameter cirkler fra den sorte plastfolie, og to 26 millimeter sidet ligesidet trekanter og to 26 millimeter diameter cirkler fra en hvid plast PVC-ark. Marker midten af en hvid trekant og en hvid cirkel. Og lav et 10 millimeter hul ved hvert mærke.Lim derefter en hvid figur ind i midten af hver af de fire sorte cirkler. Hvis du vil konfigurere forsøgsområdet, skal du placere infrarøde mørke led i tanken. Hold altid de infrarøde lys tændt.Dernæst skal du placere blåt lys tid LED-lys i en modificeret glasfiber tank, der indeholder sand og fire fleksible PVC rør huler, og forbinde lysene til et apparat til styring af fotoperioden. Når alle lysene er placeret, skal du placere det kølede havvandsindtag i det ene hjørne af tanken med den tilsvarende udløb i det modsatte hjørne. Kontroller, at havvandsindgangen er sat op med en strømningshastighed på ca. 4 liter i minuttet.Omgræns kammeret med et sort gardin for at give fuld isolation fra eksternt lys. Placer stativet udstyret med webkameraet til siden af den eksperimentelle arena, med kameraet 130 centimeter over og i midten af den eksperimentelle arena. Tilslut kameraet til en computer uden for gardinet, og juster parametrene for videooptagelsen i henhold til artens egenskaber, og sørg for at oprette et tidsstempel, herunder datoen i time-lapse-videoen, til eventuel adfærdsmæssig scoring.For at mærke dyrene, tilsæt 7 graders Celsius vand til en isboks med neddykkede rum, og læg 4 hummer i 4 adskilte rum. Efter at have ladet hummere til akklimatisere i ca 30 minutter, overføre en hummer på en bakke med knust is i fem minutter, og bruge absorptive papir til at tørre den øverste del af immobiliseret hummer cephalothorax. Placer en dråbe hurtigtørring lim på den tørrede rygskjold og tryk mærket på limen i ca 20 sekunder, indtil limen hærder.Derefter returnere hummer til sit rum i køleboksen, og mærke de tre andre dyr på samme måde. Når alle hummere er blevet mærket, placere hummere tilbage i deres celle i 24 timer. Den næste dag, bruge den samme icebox til at overføre hummere fra akklimatisering facilitet til forsøgskammeret, og indlede videooptagelse.Udfør tagging og overførsel trin under det røde lys betingelser for at undgå radiale skader på hummer for receptorerne. Yderligere vandarter eller terrestriske arter har måske ikke brug for denne pleje. Derefter få en gennemsnitlig baggrundsbillede fra fem minutters video eller fra de første 100 billeder, før du indfører dyrene én efter én i forsøgstanken inde i deres respektive rum af vand, og vente på hummere til at komme ud af deres rum.Af det samlede antal dyr, der tælles i dette repræsentative eksperiment, blev 79 procent af dyrenes afsløringer korrekt matchet af programmet, og 89,5 procent af mærkerne blev korrekt identificeret. Kun 3,8 procent af tags blev fejlagtigt klassificeret. Men de resterende 6,6 procent svarer til falske positiver.Efter afslutningen af en specifik videoanalyse kan de opnåede positioner data bruges til at evaluere de forskellige adfærdsmønstre af hummere. For eksempel, plads belægning kort plotte, ved hjælp af en to-dimensionel kernal tæthed skøn med en akse justeret ved variat normal kernal evalueret på et kvadratisk gitter, gør det muligt for de områder, hvor hummere tilbringe en højere procentdel af deres tid til at være repræsenteret med høj farveintensitet plots. Hummerenes daglige aktivitetsrytmer kan også afbildes som millimeter dækket med ti minutters skraldespande over tid.Det er vigtigt at opretholde nøjagtige specifikationer med hensyn til størrelse og form og altid udføre det binned analysetrin i baggrunden uden brugergrænseflade. Billedet analysemodel kan udvides til at se på specifikke komponenter i krebsdyr til at bidrage til at forbedre adfærdsmæssige undersøgelse i form af dyrs interaktioner. Disse komplekse dyr sociale interaktioner forekommer på en lignende måde i et virkeligt miljø, der tillader stil og vigtige aspekter af biologisk forskning med en vis anvendelse for økologi og neurovidenskab.

Research

JoVE Journal

Environment

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster (Nephrops norvegicus)

Determination of Microbial Extracellular Enzyme Activity in Waters, Soils, and Sediments using High Throughput Microplate Assays

Bestemmelse af Mikrobiel Extracellular enzymaktivitet i Vand, Jord og sediment ved hjælp af High Throughput Mikropladekrav Analyser

Much of the nutrient cycling and carbon  processing in natural environments occurs through the activity of extracellular  enzymes released by ...

Modifying the Bank Erosion Hazard Index (BEHI) Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

Modifying the Bank Erosion Hazard Index BEHI Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

Ændring af brederosion Hazard Index (Behi) Protokol til hurtig vurdering af Streambank Erosion i det nordøstlige Ohio

Understanding the source of pollution in a stream is vital to preserving, restoring, and maintaining the stream&#8217;s function and habitat it provides. ...

The Use of an Automated System (GreenFeed) to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

The Use of an Automated System GreenFeed to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

Brug af et automatiseret system (grovfoder) til Monitor Enteric metan og kuldioxid Emissioner fra drøvtyggere

Ruminant animals (domesticated or wild) emit methane (CH4) through enteric fermentation in their digestive tract and from decomposition of manure during ...

Alternative Method of Removing Otoliths from Sturgeon

Alternativ metode til at fjerne Otolither fra Sturgeon

Extracting the otoliths (ear bones) from fish that have very thick skulls can be difficult and very time consuming. The common practice of making a ...

Field Experiments of Pollination Ecology: The Case of Lycoris sanguinea var. sanguinea

Field Experiments of Pollination Ecology: The Case of Lycoris sanguinea var. sanguinea

Field Eksperimenter af Bestøvning Økologi: Sagen om<em&gt; Lycoris sanguinea</em&gt; Var.<em&gt; sanguinea</em

Plant-pollinator interactions have been studied for approximately one hundred years. During that time, many field methods have been developed to clarify ...

Using Pharmacological Manipulation and High-precision Radio Telemetry to Study the Spatial Cognition in Free-ranging Animals

Brug Farmakologisk manipulation og Høj præcision RF at studere den Spatial Cognition i fritgående dyr

An animal&#39;s ability to perceive and learn about its environment plays a key role in many behavioral processes, including navigation, migration, ...

Development of New Methods for Quantifying Fish Density Using Underwater Stereo-video Tools

Udvikling af nye metoder til kvantificering af fisk tæthed ved hjælp af undersøiske Stereo-video værktøjer

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and ...

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

Opdræt og langsigtede vedligeholdelse af Eristalis tenax Hoverflies for forskningsundersøgelser

With an estimated 6000 species worldwide, hoverflies are ecologically important as alternative pollinators to domesticated honeybees. However, they are ...

Experimental Protocol for Examining Behavioral Response Profiles in Larval Fish: Application to the Neuro-stimulant Caffeine

Forsøgsplan for behandlingen af adfærdsmæssige reaktion profiler i larve fisk: ansøgning til Neuro-stimulerende koffein

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and ...

Combining Eye-tracking Data with an Analysis of Video Content from Free-viewing a Video of a Walk in an Urban Park Environment

Kombination af Eye-tracking data med en analyse af videoindhold fra Free-visning af en video af en tur i et Urban Park miljø

As individuals increasingly live in cities, methods to study their everyday movements and the data that can be collected becomes important and valuable. ...