Name: long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)
Uploaded: 2019-04-08T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

המחברים מודים על ד ר ג'ואן ב' החברה מימנה את הפרסום של עבודה זו. כמו כן, המחברים מודים על הטכנאים של אזור אקווריום ניסיוני-המכון למדעי הים בברצלונה (ICM-CSIC) על עזרתם במהלך העבודה ניסיוני.
עבודה זו נתמכה על ידי הפרויקט RITFIM (CTM2010-16274; החוקר הראשי: Aguzzi ג') נוסדה על ידי משרד המדע הספרדי חדשנות (MICINN) ואת המענק TIN2015-66951-C2-2-R ספרדית משרד הכלכלה ואת התחרותיות.

המשמש במחקר זה הוא לא מין בסכנת הכחדה או מוגן. ניסויים דגימה והמעבדה בעקבות את הספרדית לחקיקה ולתקנות פנימי מוסדיים (ICM-CSIC) בנושא רווחת בעלי חיים. דגימה חיה נערך באישורו של הרשות המקומית (הממשלה האזורית של קטלוניה).
1. בעלי חיים תחזוקה, דגימה
הערה: הפרוטו...

התוצאות נציג וביצועים שהושגו עם פרוטוקול מעקב וידאו אישר תוקפו למחקר יישומי בתחום של התנהגות בעלי חיים, עם דגש ספציפי על אפנון חברתית ומקצבים השעון הביולוגי של חיות cohoused. היעילות של זיהוי בעלי חיים (69%) את הדיוק של תג אפליה (89.5%) בשילוב עם ובמאפיינים התנהגותיים (קרי, קצב תנועה) של המין יעד משמ...

השנים האחרונות, מעקב אוטומטי המבוסס על תמונות סיפקה datasets ומדויקים, אשר יכול לשמש כדי לחקור שאלות בסיסיות דיסציפלינות אקולוגיה והתנהגות1. אלה נתונים (datasets) יכול לשמש לניתוח כמותי של התנהגות בעלי חיים2,3. עם זאת, כל מתודולוגיה התמונה המשמש למעקב אחר חיות והערכה התנהגות יש החוזקות והמגבלות שלו. ב מעקב מבוססת תמונה פרוטוקולים המשתמשים במידע מרחבי ממסגרות קודמות בסרט כדי לעקוב אחר חיות-4,-5,-6, יכול הציג שגיאות כאשר חצו הנתיבים של שתי חיות. שגיאות אלה הם בדרך כלל בלתי הפיך, להפיץ דרך הזמן. למרות ההתקדמות חישובית להפחית או למנוע כמעט5,זו בעיה7, שיטות אלה עדיין צריך סביבות ניסיוני הומוגנית זיהוי בעלי חיים מדויק ומעקב.
העבודה של סימני שיכול להיות מזוהה באופן ייחודי בבעלי חיים מונע שגיאות אלה ומאפשר את מעקב ארוך טווח של אנשים שזוהו. סמני בשימוש נרחב (למשל, ברקודים, קודי QR) קיימת תעשייה ומסחר, ניתן לזהות באמצעות טכניקות חזון המחשב ידועים, כגון augmented המציאות (למשל, ARTag8) וכיול המצלמה (למשל, CALTag9 ). מתויג חיות בעבר שימשו ללימודי התנהגותית תפוקה גבוהה מיני בעלי חיים שונים, עבור דוגמה, נמלים3 או דבורים10, אך חלק ממערכות קודמות אלה לא הממוטבות זיהוי תגים מבודד3.
פרוטוקול מעקב הציג נייר זה מתאים במיוחד למעקב אחר חיות דימות ערוץ אחד, כגון אינפרה-אדום (IR) אור או אור מונוכרומטי (במיוחד, אנו משתמשים אור כחול). לכן, השיטה שפותחה אינו משתמש רמזים צבע, להיות גם החלים על הגדרות אחרות היכן ישנם אילוצים ההארה. בנוסף, אנו משתמשים תגים מותאמים אישית שנועדה כדי לא להפריע הלובסטרים, במקביל, לאפשר הקלטה עם מצלמות בעלות נמוכה. יתר על כן, שיטת המשמשת כאן מבוססת על מסגרת עצמאית תג זיהוי (כלומר., האלגוריתם מזהה הנוכחות של כל תג בתמונה ללא קשר מסלולים הקודם). תכונה זו רלוונטי ביישומים שבהם בעלי חיים יכול להיות occluded באופן זמני, או מסלולים של בעלי החיים עלול מצטלבים.
העיצוב תג מאפשר את השימוש בקבוצות שונות של בעלי חיים. לאחר הגדרת הפרמטרים של השיטה, זה יכול להיות מועבר להתמודד עם בעיות למעקב אחר חיות אחרות ללא צורך הדרכה מסווג מסוים (אחרים סרטנים או חילזונות). המגבלות העיקריות של ייצוא בפרוטוקול הן הגודל את התג ואת הצורך מצורף החיה (מה שהופך אותו מתאים לא חרקים קטנים, כגון זבובים, דבורים, וכו '), ועל ההנחה 2D עבור תנועת בעלי חיים. אילוץ זה הוא משמעותי, בהתחשב בכך השיטה המוצעת מניחה שגודל התג נשאר קבוע. חיה לנוע בחופשיות בתוך סביבה תלת-ממד (למשל, דגים) יראה בגדלים שונים תג בהתאם המרחק שלו למצלמה.
המטרה של פרוטוקול זה נועד לספק מתודולוגיה ידידותי למשתמש למעקב אחר חיות מתויג מרובים על פני תקופה ארוכה של זמן (קרי, ימים או שבועות) בהקשר 2D. הגישה מתודולוגי מבוססת על השימוש בקוד פתוח תוכנה וחומרה. תוכנה חופשית וקוד מקור פתוח מאפשר עיבודים, שינויים, הפצה חופשית; לכן, התוכנה שנוצר משפר11,בכל שלב12.
הפרוטוקול הציג כאן מתמקדת מעבדה כדי לעקוב אחר ולהעריך את הפעילות גינקולוגיות של ארבעה בעלי חיים ימיים במיכל במשך 5 ימים. קבצי הווידאו רשמה מתמונת 1 s זמן לשגות, הידור וידאו 20 מסגרות לשנייה (1 יום מוקלטות תופסת כ 1 h של וידאו). כל הקלטות וידאו הם postprocessed באופן אוטומטי כדי לקבל תפקידים בעלי חיים, החלת המחשב חזון שיטות ואלגוריתמים. הפרוטוקול מאפשר קבלת כמויות גדולות של מידע, הימנעות שלהם ביאור ידני, אשר הוכח להיות אינטנסיבית, מייגעת ניירות ניסיוני הקודם13על המעקב.
אנו משתמשים הסרטן נורבגיה (Nephrops norvegicus) עבור מקרה המבחן; לכן, אנו מספקים תנאי מעבדה ספציפית כדי לשמור אותם. לובסטרים לבצע מקצבים הופעתה למחילה למד היטב כי הם תחת השליטה של ה-14,שעון היממה15, כאשר cohoused, הם יוצרים הדומיננטיות הירארכיה16,17. ומכאן, המודל המוצג כאן הוא דוגמה טובה עבור חוקרים המעוניינים אפנון החברתית של התנהגות עם דגש ספציפי על השעון הביולוגי.
המתודולוגיה המוצגת כאן היא משוחזר בקלות, ניתן להחיל על מינים אחרים, אם יש אפשרות להבחין בין חיות עם תגים בודדים. הדרישות המינימליות עבור שכפול גישה כזו במעבדה הם (i) חדרים איזותרמי עבור ההתקנה ניסיוני; (ii) אספקה רציפה; (iii) מנגנוני הבקרה של הטמפרטורה מים; (iv) מערכת בקרת אור; (v) מצלמת USB של מחשב רגיל.
ב פרוטוקול זה, אנו משתמשים פיתון18 ו- OpenCV19 (Open Source המחשב חזון Library). אנו מסתמכים על מהירה ושימושית בדרך כלל פעולות (הן מבחינת יישום וביצוע), כגון רקע חיסור20 והתמונה סף21,22.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:860px;" width="860">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Tripod 475</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">A0673528</td>
			<td style="width:307px;">Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Articulated Arm 143</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">D0057824</td>
			<td>Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camera USB 2.0 uEye LE</td>
			<td style="width:113px;">iDS</td>
			<td style="width:123px;">UI-1545LE-M</td>
			<td>https://en.ids-imaging.com/store/products/cameras/usb-2-0-cameras/ueye-le.html</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:317px;">Fish Eye Len C-mount f=6mm/F1.4</td>
			<td style="width:113px;">Infaimon</td>
			<td style="width:123px;">Standard Optical&#160;</td>
			<td style="width:307px;">https://www.infaimon.com/es/estandar-6mm</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:317px;">Glass Fiber Tank 1500x700x300 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Black Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Tank</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>5 Wood Strips 50x50x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>10 Wood Strips 25x25x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Stainless Steel Screws</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>As many as necessary for fix wood strips structures</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">PC</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2-cores CPU, 4GB RAM, 1 GB Graphics, 500 GB HD</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">External Storage HDD</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2 TB capacity desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">iSPY Sotfware for Windows PC</td>
			<td style="width:113px;">iSPY</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.ispyconnect.com/download.aspx</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Zoneminder Software Linux PC</td>
			<td style="width:113px;">Zoneminder</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://zoneminder.com/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">OpenCV 2.4.13.6 Library</td>
			<td style="width:113px;">OpenCV</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://opencv.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Python 2.4</td>
			<td style="width:113px;">Python</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.python.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camping Icebox</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Plastic Tray</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Cyanocrylate Gel</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>To glue tag&#8217;s&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 black PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 white PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Tag&#8217;s &#216; 40 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Maked with black &#38; white PVC plastic sheet</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Blue Strid Led Ligts (480 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m IR Strid Led Ligts (850 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">6m&#160; Methacrylate Pipes &#216; 15 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Enclosed Strid Led</td>
		</tr>
		<tr height="23">
			<td height="23" style="height:23px;width:317px;">4 PVC Elbow&#160; 45o &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Flexible PVC Pipe &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 PVC Screwcap &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 O-ring &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Female PVC socket glue / thread &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">10 m DC 12V Electric Cable</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Ligt Power Supply DC 12V 300 w</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">MOSFET, RFD14N05L, N-Canal, 14 A, 50 V, 3-Pin, IPAK (TO-251)</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>325-7580</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">Diode, 1N4004-E3/54, 1A, 400V, DO-204AL, 2-Pines</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>628-9029</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse Holder</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>336-7851</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">2 Way Power Terminal 3.81mm</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>220-4658</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Capacitor 220 &#181;F 200 V</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>440-6761</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Resistance 2K2 7W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>485-3038</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse 6.3x32mm 3A</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>413-210</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Arduino Uno Atmel Atmega 328 MCU board</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>715-4081</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Prototipe Board CEM3,3 orific.,RE310S2</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>728-8737</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">DC/DC converter,12Vin,+/-5Vout 100mA 1W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>689-5179</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2 SERA T8 blue moonlight fluorescent bulb 36 watts</td>
			<td style="width:113px;">SERA</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Discontinued / Light isolated facility</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)

אנו מציגים פרוטוקול הקשורים טכניקה מעקב וידאו בהתבסס על רקע חיסור סף התמונה ומאפשר לעקוב בנפרד חיות cohoused. בדקנו את השגרה מעקב עם ארבעה לובסטרים נורבגיה cohoused (Nephrops norvegicus) בתנאים אור-חושך במשך 5 ימים. הלובסטרים היה כבר מתויג בנפרד. את ניסיוני וההתקנה של טכניקות מעקב השתמשו מבוססים לחלוטין על תוכנת קוד פתוח. ההשוואה של הפלט מעקב עם זיהוי ידני מציין כי הלובסטרים היו כראוי זוהה 69% של הפעמים. בין הלובסטרים זוהה כראוי, תגים בודדים שלהם היו כראוי מזוהה 89.5% של הפעמים. בהתחשב את קצב המסגרות המשמשים את הפרוטוקול ואת קצב תנועה לובסטרים, הביצועים של מעקב וידאו יש באיכות טובה, התוצאות נציג תמיכה את תוקפו של הפרוטוקול בהפקת נתונים יקרי ערך לצורכי מחקר (הפרט תפוסת שטח או דפוסי הפעילות גינקולוגיות). פרוטוקול המובאות כאן ניתן להתאים אישית בקלות והוא, לפיכך, להעברה מינים אחרים שבהם המעקב בודדים של דגימות בקבוצה יכול להיות יקר למענה על שאלות המחקר.

אנחנו נבנה באופן ידני קבוצת משנה של הנתונים ניסיוני כדי לאמת את ניתוח וידאו אוטומטית. גודל דגימה של מסגרות 1,308 עם רמת ודאות של 99% (שהוא מדד של אבטחה שמראה אם המדגם משקף באופן מדויק את האוכלוסייה, בתוך מרווח הטעות שלה), מרווח קטן לטעות של 4% (שזה אחוז שמתאר כמה קרוב התגובה נתן ה...

Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus

כאן אנו מציגים פרוטוקול לעקוב בנפרד חיות על פני תקופה ארוכה של זמן. היא משתמשת ממוחשבת שיטות לזיהוי קבוצת תגים נבנה באופן ידני באמצעות קבוצה של לובסטרים כמו חקר מקרה, בד בבד עם מתן מידע כיצד הבית, להשפיע, וזכור הלובסטרים.

מעקב וידאו לטווח ארוך של בעלי חיים ימיים Cohoused: חקר מקרה של הפעילות גינקולוגיות יומי של הלובסטר של נורבגיה (Nephrops norvegicus)

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

פרוטוקול זה מאפשר אוטומציה של מעקב אחר בעלי חיים מרובים. שימוש בתווית פשוטה לזיהוי כל חיה ככלי לניתוח מזהה לזיהוי התגים. פרוטוקול זה מפחית באופן משמעותי את מספר השעות הדרושות לניתוח הקלטות הווידאו באמצעות נתוני leskey.כדי להעריך השלמות מדויקות יותר מהמחקרים הניסיוניים. בעלי חיים בסביבות אחרות שניתן לתייג באופן דומה ניתן לעקוב עם פרוטוקולים דומים מתן יישום כרונוביולוגיה, אקולוגיה, מחקר ויראלי או מדעי המוח. סיפקנו את עיצוב החומרה ואת שפת התכנות בקוד פתוח ומספקים מודל שאנו ממליצים למשתמשים לאמץ בפרוטוקולים כדי ללמוד שפת תכנות של Python.כדי לבנות תג עבור חיית היעד, חתך תחילה ארבעה עיגולים בקוטר 40 מ"מ מפניית הפלסטיק השחורה, ושני משולשי שיווי משקל צדדיים של 26 מילימטר ושני עיגולים בקוטר 26 מ"מ מסדין PVC מפלסטיק לבן. סמן את המרכז של משולש לבן אחד ועיגול לבן אחד. ולעשות חור של 10 מ"מ בכל סימן.לאחר מכן הדבק צורה לבנה אחת למרכז כל אחד מארבעת העיגולים השחורים. כדי להקים את אזור הניסוי, הנח נוריות זמן כהה אינפרא אדום לתוך המיכל. תשאיר את אורות האינפרא-אדום דולקים כל הזמן.לאחר מכן, הנח את אורות LED של אור כחול לתוך מיכל פיברגלס שונה המכיל חול וארבע מחפרות צינור PVC גמישות, וחבר את האורות למנגנונים לניהול תקופת הצילום. כאשר כל האורות הוצבו, למקם את הכניסה מי ים מקורר בפינה אחת של המיכל, עם השקע המתאים בפינה הנגדית. בדוק כי קלט מי הים מוגדר בקצב זרימה של כ 4 ליטר לדקה.הקיפו את התא בווילון שחור כדי לספק בידוד מלא מהאור החיצוני. מניחים את החצובה המצוידת במצלמת הרשת לצד הזירה הניסיונית, כשהמצלמה 130 ס"מ מעל ובמרכז הזירה הניסיונית. חבר את המצלמה למחשב מחוץ לווילון, והתאם את הפרמטרים של הקלטת הווידאו בהתאם למאפייני המין, הקפד ליצור חותמת זמן, כולל התאריך בסרטון זמן לשגות, עבור ניקוד התנהגותי בסופו של דבר.כדי לתייג את בעלי החיים, הוסיפו 7 מעלות מי צלזיוס לקופסת קרח עם תאים שקועים, והניחו 4 לובסטרים ב-4 תאים מופרדים. לאחר מתן אפשרות ללובסטרים להתאקלם במשך כ -30 דקות, מעבירים לובסטר אחד למגש קרח כתוש במשך חמש דקות, ולהשתמש בנייר אבסולפטי כדי לייבש את החלק העליון של cephalothorax של הלובסטר משותק. מניחים טיפה של דבק ייבוש מהיר על שריון מיובש ולחץ את התג על הדבק במשך כ 20 שניות, עד הדבק מתקשה.ואז להחזיר את הלובסטר לתא שלה בתיבת הקרח, ולתייג את שלושת בעלי החיים האחרים באותו אופן. כאשר כל הלובסטרים כבר שכותרתו, למקם את הלובסטרים בחזרה לתא שלהם במשך 24 שעות. למחרת, השתמש באותה קופסת קרח כדי להעביר את הלובסטרים ממתקן ההתאקלמות לתא הניסוי, וליזום את הקלטת הווידאו.בצע את שלבי התיוג וההעברה בתנאי האור האדום כדי למנוע נזק רדיאלי ללובסטר עבור הקולטנים. מיני מים נוספים או מינים יבשתיים עשויים שלא להזדקק לטיפול זה. לאחר מכן להשיג תמונת רקע ממוצעת מחמש דקות של וידאו או מתוך 100 מסגרות הראשוניות לפני החדרת בעלי החיים אחד אחד לתוך מיכל הניסוי בתוך תאי המים שלהם, ולחכות לובסטרים לצאת מהתאים שלהם.מתוך המספר הכולל של בעלי חיים שנספרו בניסוי מייצג זה, 79 אחוזים מזיהוי בעלי החיים הותאמו כראוי על ידי התוכנית, ו-89.5 אחוזים מהתגים זוהו כראוי. רק 3.8 אחוז מהתגים סווגו באופן שגוי. אבל 6.6 האחוזים הנותרים תואמים לחיוביות שגויות.לאחר השלמת ניתוח וידאו ספציפי, ניתן להשתמש בנתונים המתקבלים כדי להעריך את דפוסי ההתנהגות השונים של הלובסטרים. לדוגמה, התוויית מפת תפוסת חלל, באמצעות הערכת צפיפות ליבה דו-ממדית עם ציר המיושר על-ידי קרנל רגיל משתנה המוערך ברשת מרובעת, מאפשרת לאזורים שבהם הלובסטרים מבלים אחוז גבוה יותר מזמם להיות מיוצגים עם חלקות בעוצמת צבע גבוהה. ניתן גם לתכנן את מקצבי הפעילות היומיומיים של הלובסטרים כמילימטרים המכסים במרווחים של עשר דקות לאורך זמן.חשוב לשמור על מפרטים מדויקים מבחינת הגודל והצורה ולבצע תמיד את שלב הניתוח המאוכפל ברקע ללא ממשק משתמש. מודל ניתוח התמונה ניתן להרחיב להסתכל על מרכיבים ספציפיים של הסרטנים כדי לעזור לשפר את המחקר ההתנהגותי במונחים של אינטראקציות בעלי חיים. אינטראקציות חברתיות מורכבות אלה של בעלי חיים מתרחשות באופן דומה בסביבה ממשית ומאפשרות את הסגנון וההיבטים החשובים של המחקר הביולוגי עם יישום כלשהו לאקולוגיה ומדעי המוח.

Research

JoVE Journal

Environment

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster (Nephrops norvegicus)

Determination of Microbial Extracellular Enzyme Activity in Waters, Soils, and Sediments using High Throughput Microplate Assays

קביעת מיקרוביאלית התאית אנזים הפעילות במים, קרקעות, ומשקעים באמצעות מבחני Microplate תפוקה גבוהה

Much of the nutrient cycling and carbon  processing in natural environments occurs through the activity of extracellular  enzymes released by ...

Modifying the Bank Erosion Hazard Index (BEHI) Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

Modifying the Bank Erosion Hazard Index BEHI Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

שינוי פרוטוקול מדד סיכוני שחיקת בנק (BEHI) לראפיד הערכה של שחיקת Streambank בצפון מזרח אוהיו

Understanding the source of pollution in a stream is vital to preserving, restoring, and maintaining the stream&#8217;s function and habitat it provides. ...

The Use of an Automated System (GreenFeed) to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

The Use of an Automated System GreenFeed to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

השימוש במערכת אוטומטית (GreenFeed) לפקח פליטות המעיים מתאן ופחמן דו חמצני מבעלי חיים מעלה הגירה

Ruminant animals (domesticated or wild) emit methane (CH4) through enteric fermentation in their digestive tract and from decomposition of manure during ...

Alternative Method of Removing Otoliths from Sturgeon

שיטה חלופית של הסרת Otoliths מ חדקן

Extracting the otoliths (ear bones) from fish that have very thick skulls can be difficult and very time consuming. The common practice of making a ...

Field Experiments of Pollination Ecology: The Case of Lycoris sanguinea var. sanguinea

Field Experiments of Pollination Ecology: The Case of Lycoris sanguinea var. sanguinea

ניסויי שדה לאקולוגית אבקה: המקרה של<em&gt; Lycoris sanguinea</em&gt; Var.<em&gt; sanguinea</em

Plant-pollinator interactions have been studied for approximately one hundred years. During that time, many field methods have been developed to clarify ...

Using Pharmacological Manipulation and High-precision Radio Telemetry to Study the Spatial Cognition in Free-ranging Animals

באמצעות מניפולציה תרופתית ו-דיוק גבוה טלמטריה רדיו לחקר הקוגניציה המרחבי בעלי חיים חינם היריעה

An animal&#39;s ability to perceive and learn about its environment plays a key role in many behavioral processes, including navigation, migration, ...

Development of New Methods for Quantifying Fish Density Using Underwater Stereo-video Tools

פיתוח שיטות חדשות לכימות תנועת הדגים בצפיפות בכלים סטריאו-וידאו תת-מימי

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and ...

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

לגידול ואחזקה ארוך טווח של רקבן הבוץ Hoverflies למטרות מחקר

With an estimated 6000 species worldwide, hoverflies are ecologically important as alternative pollinators to domesticated honeybees. However, they are ...

Experimental Protocol for Examining Behavioral Response Profiles in Larval Fish: Application to the Neuro-stimulant Caffeine

נסיוני לבחינת תגובה התנהגותית פרופילים בדגים זחל: ליישום הקפאין נוירו-ממריץ

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and ...

Combining Eye-tracking Data with an Analysis of Video Content from Free-viewing a Video of a Walk in an Urban Park Environment

שילוב נתוני מעקב אחר עיניים באמצעות ניתוח של תוכן וידאו מחינם-צפייה בסרטון וידאו של טיול בסביבה של פארק עירוני

As individuals increasingly live in cities, methods to study their everyday movements and the data that can be collected becomes important and valuable. ...