Name: long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)
Uploaded: 2019-04-08T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

Forfatterne er takknemlig til Dr. Joan B. selskapet som finansierte utgivelsen av dette arbeidet. Forfatterne er også takknemlig for teknikere av eksperimentelle akvariet sonen på Institutt for Marine Sciences i Barcelona (ICM-CSIC) for deres hjelp under eksperimentelle arbeidet.
Dette arbeidet ble støttet av RITFIM prosjektet (CTM2010-16274, rektor investigator: J. Aguzzi) grunnlagt av det spanske departementet for vitenskap og innovasjon (MICINN) og TIN2015-66951-C2-2-R stipend fra det spanske departementet for økonomi og konkurranseevne.

Arten brukes i denne studien er ikke en truede eller beskyttet art. Prøvetaking og laboratoriet eksperimenter fulgte den spanske lovgivningen og interne institusjonelle (ICM-CSIC) regler for dyrevelferd. Dyr prøvetaking ble gjennomført med tillatelse fra lokale myndigheter (regionale regjeringen of Catalonia).
1. dyr vedlikehold og prøvetaking
Merk: Følgende protokollen er basert på antagelsen om at forskerne kan smake N. norvegicus inn...

Ytelse og representant resultatene med video-sporing protokollen bekreftet sin gyldighet for anvendt forskning i feltet av animalsk oppførsel, med spesielt fokus på sosiale modulering og døgnrytme cohoused dyr. Effektiviteten av animalsk deteksjon (69%) og nøyaktigheten av tag diskriminering (89.5%) kombinert med atferdstrekkene (dvs. bevegelse rate) målet artene brukes her tyder på at denne protokollen er en perfekt løsning for langsiktige eksperimentelle studier (f.eks dager og uker). Videre protokollen tilbyr g...

I de siste årene, har automatisert image-basert sporing gitt svært nøyaktig datasett som kan brukes til å utforske grunnleggende spørsmål i økologi og atferd disipliner1. Disse datasett kan brukes for kvantitativ analyse dyr oppførsel2,3. Men har hvert bilde-metodene som er brukt for sporing av dyr og atferd evaluering sine styrker og svakheter. I bilde-baserte sporing protokoller som bruker romlig informasjon fra tidligere rammer i en film for å spore dyr4,5,6kan feil innføres når banene av to dyr krysser. Disse feilene er generelt irreversibel og overføres via tid. Til tross for beregningsorientert fremskritt som reduserer eller eliminerer nesten denne problem5,7, må disse teknikkene fortsatt homogen eksperimentelle miljøer for nøyaktig dyr identifikasjon og sporing.
Ansettelse av merker som kan identifiseres i dyr unngår disse feilene og gjør langsiktig sporing av identifiserte individer. Brukte markører (f.eks, strekkoder og QR-koder) finnes i næringslivet og kan identifiseres ved hjelp av velkjente datamaskinen visjon teknikker, som augmented reality (f.eks ARTag8) og kameraet kalibrering (f.eksCALTag9 ). Merket dyrene har tidligere blitt brukt for høy gjennomstrømming behavioral studies i forskjellige dyrearter, for eksempel, maur3 eller bier10, men noen av disse tidligere systemer ikke er optimalisert for å gjenkjenne isolert tags3.
Sporing protokollen presentert i dette papiret er spesielt egnet for sporing dyr i en kanal bilder, for eksempel infrarød (IR) lys eller monokromatisk lys (spesielt vi bruker blått lys). Derfor metoden utviklet ikke bruker fargesignaler, som også gjelder andre innstillinger der det er begrensninger i belysning. I tillegg bruker vi egendefinert koder utformet for ikke å forstyrre hummer, og samtidig, tillate registrering med rimelige kameraer. Videre metoden som brukes her er basert på ramme-uavhengig kode deteksjon (i.e., algoritmen gjenkjenner tilstedeværelsen av hver kode på bildet uavhengig av tidligere baner). Denne funksjonen er relevant i programmer der dyr kan være midlertidig okkludert, eller dyrenes baner kan krysser hverandre.
Den tag designen gjør bruken i forskjellige grupper av dyr. Når parameterne for metoden er angitt, kan den overføres for å takle andre dyr-sporing problemer uten behov for å trene en bestemt klassifiserer (andre krepsdyr eller snegler). Viktigste begrensningene for eksport protokollen er størrelsen på brikken og behovet for tilknytning til dyret (som gjør det uegnet for små insekter, som fluer, bier, etc.) og 2D forutsetning for dyr bevegelse. Denne betingelsen er betydelig, gitt at den foreslåtte metoden forutsetter den koden forblir konstant. Et dyr bevege seg fritt i et 3D-miljø (f.eks fisk) viser annen kode størrelser avhengig av dets avstand til kameraet.
Formålet med denne protokollen er å gi en brukervennlig metode for å spore flere merket dyr over lang tid (dvs., dager eller uker) i et 2D sammenheng. Metodisk tilnærming er basert på bruk av open source programvare og maskinvare. Gratis og åpen kildekode tillater tilpasninger, modifikasjoner og fri Redistribusjon; Derfor forbedrer utviklet programvaren på hvert trinn11,12.
Protokollen presenteres her fokuserer på et laboratorium satt opp til å spore og evaluere locomotor aktiviteten til fire akvatiske dyr i en tank i 5 dager. Videofiler er spilt inn fra en 1 s time-lapse bilde og samlet i en video ved 20 bilder per sekund (1 innspilte dag tar ca 1 h video). Alle video-opptak er automatisk postprocessed å få dyr posisjoner, søker datamaskinen visjon metoder og algoritmer. Protokollen lar å skaffe store mengder spore data, unngå deres manuell merknaden, som har vist seg å være tidkrevende og arbeidskrevende i tidligere eksperimentelle papirer13.
Vi bruker Sjøkreps (Nephrops norvegicus) for casestudie; dermed gir vi artsspesifikke laboratorieforhold beholde dem. Hummer utføre godt studert hule fremveksten rytmer som er under kontroll av circadian klokken14,15, og når cohoused, de danner dominans hierarki16,17. Derfor er modellen presentert her et godt eksempel for forskere interessert i sosiale modulering av opptreden med spesielt fokus på biologiske rytmer.
Metodikken presenteres her gjengis lett og kan brukes på andre arter hvis det er en mulighet til å skille mellom dyr med enkelte koder. Minimumskravene for å gjengi en slik tilnærming i laboratoriet er (i) isotermiske rom for eksperimentelle oppsett; (ii) en kontinuerlig vannforsyning; (iii) vann temperatur kontrollmekanismer; (iv) en lys kontrollsystem; (v) et USB-kamera og en standard datamaskin.
I denne protokollen bruker vi Python18 og OpenCV19 (åpen kilde Computer visjon Library). Vi er avhengig av rask og ofte brukte operasjoner (både når det gjelder implementering og gjennomføring), som bakgrunn subtraksjon20 og bilde terskelverdi21,22.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:860px;" width="860">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Tripod 475</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">A0673528</td>
			<td style="width:307px;">Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Articulated Arm 143</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">D0057824</td>
			<td>Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camera USB 2.0 uEye LE</td>
			<td style="width:113px;">iDS</td>
			<td style="width:123px;">UI-1545LE-M</td>
			<td>https://en.ids-imaging.com/store/products/cameras/usb-2-0-cameras/ueye-le.html</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:317px;">Fish Eye Len C-mount f=6mm/F1.4</td>
			<td style="width:113px;">Infaimon</td>
			<td style="width:123px;">Standard Optical&#160;</td>
			<td style="width:307px;">https://www.infaimon.com/es/estandar-6mm</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:317px;">Glass Fiber Tank 1500x700x300 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Black Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Tank</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>5 Wood Strips 50x50x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>10 Wood Strips 25x25x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Stainless Steel Screws</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>As many as necessary for fix wood strips structures</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">PC</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2-cores CPU, 4GB RAM, 1 GB Graphics, 500 GB HD</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">External Storage HDD</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2 TB capacity desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">iSPY Sotfware for Windows PC</td>
			<td style="width:113px;">iSPY</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.ispyconnect.com/download.aspx</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Zoneminder Software Linux PC</td>
			<td style="width:113px;">Zoneminder</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://zoneminder.com/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">OpenCV 2.4.13.6 Library</td>
			<td style="width:113px;">OpenCV</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://opencv.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Python 2.4</td>
			<td style="width:113px;">Python</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.python.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camping Icebox</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Plastic Tray</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Cyanocrylate Gel</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>To glue tag&#8217;s&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 black PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 white PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Tag&#8217;s &#216; 40 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Maked with black &#38; white PVC plastic sheet</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Blue Strid Led Ligts (480 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m IR Strid Led Ligts (850 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">6m&#160; Methacrylate Pipes &#216; 15 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Enclosed Strid Led</td>
		</tr>
		<tr height="23">
			<td height="23" style="height:23px;width:317px;">4 PVC Elbow&#160; 45o &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Flexible PVC Pipe &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 PVC Screwcap &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 O-ring &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Female PVC socket glue / thread &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">10 m DC 12V Electric Cable</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Ligt Power Supply DC 12V 300 w</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">MOSFET, RFD14N05L, N-Canal, 14 A, 50 V, 3-Pin, IPAK (TO-251)</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>325-7580</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">Diode, 1N4004-E3/54, 1A, 400V, DO-204AL, 2-Pines</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>628-9029</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse Holder</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>336-7851</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">2 Way Power Terminal 3.81mm</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>220-4658</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Capacitor 220 &#181;F 200 V</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>440-6761</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Resistance 2K2 7W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>485-3038</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse 6.3x32mm 3A</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>413-210</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Arduino Uno Atmel Atmega 328 MCU board</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>715-4081</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Prototipe Board CEM3,3 orific.,RE310S2</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>728-8737</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">DC/DC converter,12Vin,+/-5Vout 100mA 1W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>689-5179</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2 SERA T8 blue moonlight fluorescent bulb 36 watts</td>
			<td style="width:113px;">SERA</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Discontinued / Light isolated facility</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)

Vi presenterer en protokoll som er knyttet til en video-sporing teknikk basert på bakgrunnen subtraksjon og bilde terskelverdi som gjør det mulig å spore individuelt cohoused dyr. Vi testet sporing rutine med fire cohoused Sjøkreps (Nephrops norvegicus) under lys-mørke forhold i 5 dager. Hummer hadde blitt individuelt merket. Eksperimentell oppsettet og sporing teknikker brukes er helt basert på åpen kildekode-programvare. Sammenligning av sporing produksjon med en manuell oppdagelsen angir at hummerne var riktig oppdaget 69% av tiden. Blant det riktig oppdaget hummer, sine personlige koder var riktig identifisert 89.5% av tiden. Vurderer Rammehastigheten i protokollen og bevegelse frekvensen av hummer, ytelsen til video sporing har en god kvalitet og representant resultatene støtter gyldigheten av protokollen produsere verdifulle data for behov (enkelte plass personer eller locomotor aktivitet mønstre). Protokollen presenteres her kan enkelt tilpasses, og derfor, kan overføres til andre arter der individuelle sporing av eksemplarer i en gruppe kan være verdifulle for forskning spørsmål.

Vi bygget manuelt et delsett av eksperimentelle data å validere automatisk video analyse. En utvalgsstørrelsen 1,308 rammer med et sikkerhetsnivå på 99% (som er et mål som viser om prøven gjenspeiler befolkningen, i sin feilmarginen) og en feilmargin på 4% (som er en prosent som beskriver hvor nær det svar prøven ga er reell verdi i befolkningen) var tilfeldig valgt, og en manuell merknad av riktig identifisering av ROIs og riktig anerkjennelse av koden innenfor hver avkastning b...

Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus

Her presenterer vi en protokoll for å spore individuelt dyr over lang tid. Den bruker datamaskinen visjon metoder for å identifisere et sett med manuelt konstruert koder ved hjelp av en gruppe hummer som case study, samtidig gir informasjon om hvordan huset, manipulere, og merker hummer.

Langsiktig Video sporing av Cohoused akvatiske dyr: en Case studie av den daglige Locomotor aktiviteten til Sjøkreps (Nephrops norvegicus)

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

Denne protokollen tillater automatisering av sporing av flere dyr. Bruke en enkel etikett til å identifisere hvert dyr et ID-analyseverktøy for å oppdage kodene. Denne protokollen reduserer antall timer som trengs for å analysere videoopptakene ved hjelp av leskey-data betydelig.å estimere mer nøyaktige fullføringer fra eksperimentelle studier. Dyr i andre miljøer som kan merkes på lignende måte kan spores med lignende protokoller som gir anvendelse i kronologi, økologi, viral forskning eller nevrovitenskap. Vi har gitt maskinvaredesign og åpen kildekode programmeringsspråk og gir en modell vi anbefaler brukere å vedta i protokollene for å lære Python programmeringsspråk.For å konstruere en tag for måldyret, kutt først fire 40 millimeter diameter sirkler fra det svarte plastarket, og to 26 millimeter sidige likesidet trekanter og to 26 millimeter diameter sirkler fra et hvitt plast PVC-ark. Merk midten av en hvit trekant og en hvit sirkel. Og lag et 10 millimeter hull på hvert merke.Lim deretter en hvit form inn i midten av hver av de fire svarte sirklene. For å sette opp det eksperimentelle området, plasser infrarøde mørketidsdioder inn i tanken. Hold de infrarøde lysene på til enhver tid.Deretter plasserer du LED-lys for blått lys i en modifisert glassfibertank som inneholder sand og fire fleksible PVC-rørgraver, og kobler lysene til et apparat for håndtering av fotoperioden. Når alle lysene er plassert, plasserer du det avkjølte sjøvanninntaket i det ene hjørnet av tanken, med tilsvarende utløp i motsatt hjørne. Kontroller at sjøvanninngangen er satt opp med en strømningshastighet på ca. 4 liter per minutt.Omgi kammeret med en svart gardin for å gi full isolasjon fra eksternt lys. Plasser stativet utstyrt med webkameraet til siden av den eksperimentelle arenaen, med kameraet 130 centimeter over og i midten av den eksperimentelle arenaen. Koble kameraet til en datamaskin utenfor gardinen, og juster parametrene for videoopptaket i henhold til artene, og sørg for å lage et tidsstempel, inkludert datoen i time-lapse-videoen, for eventuell atferdspoeng.For å tagge dyrene, tilsett 7 grader Celsius vann til en isboks med nedsenkede rom, og legg 4 hummer i 4 separerte rom. Etter å ha tillatt hummerne å akklimatisere seg i ca 30 minutter, overføre en hummer til et brett med knust is i fem minutter, og bruk absorptivt papir for å tørke den øvre delen av den immobiliserte hummerens cephalothorax. Plasser en dråpe hurtigtørkende lim på den tørkede karapacen og trykk på taggen på limet i ca. 20 sekunder, til limet stivner.Deretter returnerer hummeren til rommet sitt i isboksen, og merker de tre andre dyrene på samme måte. Når alle hummerne er merket, legg hummerne tilbake i cellen i 24 timer. Neste dag bruker du den samme isboksen til å overføre hummerne fra akklimatiseringsanlegget til det eksperimentelle kammeret, og starte videoopptaket.Utfør tagging og overføring trinn under røde lysforhold for å unngå radial skade på hummer for reseptorene. Ytterligere vannarter eller terrestriske arter trenger kanskje ikke denne omsorgen. Deretter får du et gjennomsnittlig bakgrunnsbilde fra fem minutter med video eller fra de første 100 rammene før de introduserer dyrene en etter en i eksperimenteringstanken inne i sine respektive vannrom, og vent på at hummerne kommer ut av rommene sine.Av det totale antallet dyr som ble talt i dette representative eksperimentet, ble 79 prosent av dyredeteksjonene riktig matchet av programmet, og 89,5 prosent av kodene ble korrekt identifisert. Bare 3,8 prosent av kodene ble feil klassifisert. Men de resterende 6,6 prosent tilsvarende falske positive.Etter ferdigstillelse av en bestemt videoanalyse kan de oppnådde posisjonsdataene brukes til å evaluere hummerens ulike atferdsmønstre. For eksempel, plass belegg kart plotting, ved hjelp av en todimensjonal kernal tetthet estimering med en akse justert av variate normal kernal evaluert på et firkantet rutenett, gjør at områdene der hummerne tilbringer en høyere prosentandel av sin tid til å være representert med høy fargeintensitet tomter. Hummerens daglige aktivitetsrytmer kan også plottes som millimeter dekket med ti minutters binned intervaller over tid.Det er viktig å opprettholde nøyaktige spesifikasjoner når det gjelder størrelse og form og å alltid utføre binned analyse trinn i bakgrunnen uten brukergrensesnitt. Bildeanalysemodellen kan utvides for å se på bestemte komponenter i krepsdyrene for å bidra til å forbedre atferdsstudien når det gjelder dyreinteraksjoner. Disse komplekse dyresosiale interaksjonene forekommer på en lignende måte i et faktisk miljø som tillater stilen og viktige aspekter ved biologisk forskning med noen anvendelse for økologi og nevrovitenskap.

Research

JoVE Journal

Environment

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster (Nephrops norvegicus)

Determination of Microbial Extracellular Enzyme Activity in Waters, Soils, and Sediments using High Throughput Microplate Assays

Fastsettelse av Microbial Ekstracellulær enzymaktivitet i Waters, jord og sedimenter ved hjelp av høy gjennomstrømming for mikro Analyser

Much of the nutrient cycling and carbon  processing in natural environments occurs through the activity of extracellular  enzymes released by ...

Modifying the Bank Erosion Hazard Index (BEHI) Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

Modifying the Bank Erosion Hazard Index BEHI Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

Endring av Bank Erosjon Hazard Index (Behi) Protokoll for Rapid Assessment of Streambank Erosjon i Northeastern Ohio

Understanding the source of pollution in a stream is vital to preserving, restoring, and maintaining the stream&#8217;s function and habitat it provides. ...

The Use of an Automated System (GreenFeed) to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

The Use of an Automated System GreenFeed to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

Bruk av et automatisert system (GreenFeed) til Monitor Ente metan og utslipp av karbondioksid fra drøvtyggere

Ruminant animals (domesticated or wild) emit methane (CH4) through enteric fermentation in their digestive tract and from decomposition of manure during ...

Alternative Method of Removing Otoliths from Sturgeon

Alternativ metode for å fjerne otolitter fra Sturgeon

Extracting the otoliths (ear bones) from fish that have very thick skulls can be difficult and very time consuming. The common practice of making a ...

Field Experiments of Pollination Ecology: The Case of Lycoris sanguinea var. sanguinea

Field Experiments of Pollination Ecology: The Case of Lycoris sanguinea var. sanguinea

Feltforsøk av Pollinering Økologi: tilfelle av<em&gt; Lycoris sanguinea</em&gt; Var.<em&gt; sanguinea</em

Plant-pollinator interactions have been studied for approximately one hundred years. During that time, many field methods have been developed to clarify ...

Using Pharmacological Manipulation and High-precision Radio Telemetry to Study the Spatial Cognition in Free-ranging Animals

Bruke Farmakologisk Manipulasjon og høy presisjon Radio Telemetri å studere Spatial Cognition i frittgående dyr

An animal&#39;s ability to perceive and learn about its environment plays a key role in many behavioral processes, including navigation, migration, ...

Development of New Methods for Quantifying Fish Density Using Underwater Stereo-video Tools

Utvikling av nye metoder for å kvantifisere fisk tetthet med undervanns Stereo-video-verktøy

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and ...

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

Stell og langsiktig vedlikehold av råtten Blomsterfluer for undersøkelser

With an estimated 6000 species worldwide, hoverflies are ecologically important as alternative pollinators to domesticated honeybees. However, they are ...

Experimental Protocol for Examining Behavioral Response Profiles in Larval Fish: Application to the Neuro-stimulant Caffeine

Eksperimentell protokollen for å undersøke Behavioral respons profiler i larver fisk: programmet Nevro-stimulerende koffein

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and ...

Combining Eye-tracking Data with an Analysis of Video Content from Free-viewing a Video of a Walk in an Urban Park Environment

Kombinere eye-tracking data med en analyse av video innhold fra Free-visning en video av en tur i en urban Park miljø

As individuals increasingly live in cities, methods to study their everyday movements and the data that can be collected becomes important and valuable. ...