Name: long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)
Uploaded: 2019-04-08T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

Os autores agradecem à Dr. Joan B. empresa que financiou a publicação deste trabalho. Também, os autores agradecem aos técnicos da zona de aquário experimental no Instituto de Ciências marinhas em Barcelona (ICM-CSIC) por sua ajuda durante o trabalho experimental.
Este trabalho foi financiado pelo projeto RITFIM (CTM2010-16274; investigador principal: J. Aguzzi) fundada pelo Ministério espanhol de ciência e inovação (MICINN) e a concessão de TIN2015-66951-C2-2-R do Ministério espanhol de economia e competitividade.

As espécies utilizadas neste estudo não é uma espécie em extinção ou protegida. Experimentos de laboratório e de amostragem seguiram a legislação espanhola e o regulamento interno (ICM-CSIC) de institucional em matéria de bem-estar dos animal. Amostragem de animais foi realizada com a permissão da autoridade local (Governo Regional da Catalunha).
1. amostragem e manutenção animal
Nota: O seguinte protocolo baseia-se no pressuposto de que ...

Os resultados de desempenho e representante obtidos com o protocolo de controle de vídeo confirmaram sua validade para a investigação aplicada no domínio do comportamento animal, com um foco específico sobre modulação social e ritmos circadianos dos animais cohoused. A eficácia da detecção de animais (69%) e a precisão da discriminação marca (89,5%) juntamente com as características comportamentais (ou seja, taxa de circulação) das espécies-alvo usadas aqui sugerem que este protocolo é uma solução per...

Nos últimos anos, rastreamento automatizado baseado em imagem forneceu conjuntos de dados altamente precisos que podem ser usados para explorar questões básicas em ecologia e comportamento de disciplinas1. Esses conjuntos de dados podem ser usados para a análise quantitativa do comportamento animal2,3. No entanto, cada metodologia de imagem usada para controlar os animais e avaliação de comportamento tem seus pontos fortes e limitações. Nos protocolos de rastreamento com base em imagem que usa a informação espacial de quadros anteriores em um filme para controlar animais4,5,6, erros podem ser introduzidos quando cruzam os caminhos dos dois animais. Esses erros são geralmente irreversíveis e propagam-se através do tempo. Apesar dos avanços computacionais que reduzem ou quase eliminam este problema5,7, estas técnicas ainda precisam de ambientes homogêneos experimentais para rastreamento e identificação animal precisa.
O emprego de marcas que podem ser identificados exclusivamente em animais evita esses erros e permite o acompanhamento a longo prazo dos indivíduos identificados. Marcadores amplamente utilizados (por exemplo, códigos de barra e códigos QR) existem na indústria e comércio e podem ser identificados utilizando técnicas de visão de computador bem conhecidos, tais como aumentada realidade (por exemplo, ARTag8) e calibração da câmera (por exemplo, CALTag9 ). Animais marcados anteriormente têm sido utilizados para estudos comportamentais de alta produtividade em diferentes espécies animais, por exemplo, formigas3 ou abelhas10, mas alguns desses sistemas anteriores não são otimizadas para reconhecer tags isolado3.
O protocolo de rastreamento apresentado neste trabalho é especialmente adequado para rastreamento de animais, imagens de um canal, tais como infravermelho (IR) luz ou luz monocromática (particularmente, nós usamos luz azul). Portanto, o método desenvolvido não usa pistas de cor, sendo também aplicáveis a outras configurações onde há restrições em iluminação. Além disso, usamos etiquetas personalizadas concebidas de modo a para não perturbar as lagostas e, ao mesmo tempo, permitir a gravação com câmeras de baixo custo. Além disso, o método utilizado aqui é baseado na deteção de marca independente de quadro (i.., o algoritmo reconhece a presença de cada marca na imagem independentemente das trajectórias anteriores). Esse recurso é relevante em aplicações onde os animais podem ser ocluídos temporariamente ou trajetórias dos animais podem se cruzam.
O design da marca permite seu uso em diferentes grupos de animais. Uma vez que os parâmetros do método são definidos, pode ser transferida para resolver outros problemas de controle de animais sem a necessidade de formação de um classificador específico (outros crustáceos ou gastrópodes). As principais limitações de exportar o protocolo são do tamanho da marca e a necessidade de ligação com o animal (o que faz não é adequado para pequenos insetos, como moscas, abelhas, etc.) e o pressuposto 2D para a circulação de animais. Essa restrição é significativa, dado que o método proposto assume que o tamanho de etiqueta permanece constante. Um animal mover-se livremente em um ambiente 3D (por exemplo, peixe) iria mostrar tamanhos de marca diferente dependendo de sua distância para a câmera.
O propósito do presente protocolo é fornecer uma metodologia user-friendly para acompanhamento de vários animais marcados por um longo período de tempo (dias ou semanas), em um contexto 2D. A abordagem metodológica baseia-se na utilização de hardware e software de fonte aberta. O software livre e open source permite adaptações, modificações e redistribuição livre; Portanto, o software gerado melhora em cada etapa11,12.
O protocolo apresentado aqui se concentra em um laboratório criado para acompanhar e avaliar a atividade locomotora de quatro animais aquáticos em um tanque por 5 dias. Os arquivos de vídeo gravados a partir de uma imagem de lapso de tempo de 1 s e compilados em um vídeo em 20 frames por segundo (1 dia gravado ocupa cerca de 1 h de vídeo). Todas as gravações de vídeo são automaticamente pós-processada para obter posições animais, aplicação de algoritmos e métodos de visão de computador. O protocolo permite a obtenção de grandes quantidades de dados, evitando sua anotação manual, que foi mostrada para ser demorada e trabalhosa em anteriores trabalhos experimentais13de controle.
Nós usamos o lagostim (Nephrops norvegicus) para o estudo de caso; assim, nós fornecemos condições de laboratório específicas para mantê-los. Lagostas executam ritmos de surgimento de toca bem estudados que estão sob o controle do relógio circadiano14,15, e quando cohoused, formam a hierarquia de dominância16,17. Portanto, o modelo apresentado aqui é um bom exemplo para pesquisadores interessados na modulação do comportamento, com um foco específico sobre ritmos circadianos social.
A metodologia apresentada aqui é facilmente reproduzida e pode ser aplicada a outras espécies, se existe a possibilidade de distinguir entre animais com marcas individuais. Os requisitos mínimos para a reprodução de tal abordagem em laboratório são (i) isotérmicos quartos para a instalação experimental; (ii) um fornecimento contínuo de água; (iii) mecanismos de controle de temperatura de água; (iv) um sistema de controle de luz; (v) uma câmera USB e um computador padrão.
Neste protocolo, usamos Python18 e OpenCV19 (Open Source computador Vision Library). Contamos com rápido e comumente aplicadas as operações (tanto em termos de implementação e execução), tais como plano de fundo subtração20 e imagem limiarização21,22.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:860px;" width="860">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Tripod 475</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">A0673528</td>
			<td style="width:307px;">Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Articulated Arm 143</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">D0057824</td>
			<td>Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camera USB 2.0 uEye LE</td>
			<td style="width:113px;">iDS</td>
			<td style="width:123px;">UI-1545LE-M</td>
			<td>https://en.ids-imaging.com/store/products/cameras/usb-2-0-cameras/ueye-le.html</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:317px;">Fish Eye Len C-mount f=6mm/F1.4</td>
			<td style="width:113px;">Infaimon</td>
			<td style="width:123px;">Standard Optical&#160;</td>
			<td style="width:307px;">https://www.infaimon.com/es/estandar-6mm</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:317px;">Glass Fiber Tank 1500x700x300 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Black Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Tank</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>5 Wood Strips 50x50x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>10 Wood Strips 25x25x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Stainless Steel Screws</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>As many as necessary for fix wood strips structures</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">PC</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2-cores CPU, 4GB RAM, 1 GB Graphics, 500 GB HD</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">External Storage HDD</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2 TB capacity desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">iSPY Sotfware for Windows PC</td>
			<td style="width:113px;">iSPY</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.ispyconnect.com/download.aspx</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Zoneminder Software Linux PC</td>
			<td style="width:113px;">Zoneminder</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://zoneminder.com/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">OpenCV 2.4.13.6 Library</td>
			<td style="width:113px;">OpenCV</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://opencv.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Python 2.4</td>
			<td style="width:113px;">Python</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.python.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camping Icebox</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Plastic Tray</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Cyanocrylate Gel</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>To glue tag&#8217;s&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 black PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 white PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Tag&#8217;s &#216; 40 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Maked with black &#38; white PVC plastic sheet</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Blue Strid Led Ligts (480 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m IR Strid Led Ligts (850 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">6m&#160; Methacrylate Pipes &#216; 15 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Enclosed Strid Led</td>
		</tr>
		<tr height="23">
			<td height="23" style="height:23px;width:317px;">4 PVC Elbow&#160; 45o &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Flexible PVC Pipe &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 PVC Screwcap &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 O-ring &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Female PVC socket glue / thread &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">10 m DC 12V Electric Cable</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Ligt Power Supply DC 12V 300 w</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">MOSFET, RFD14N05L, N-Canal, 14 A, 50 V, 3-Pin, IPAK (TO-251)</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>325-7580</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">Diode, 1N4004-E3/54, 1A, 400V, DO-204AL, 2-Pines</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>628-9029</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse Holder</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>336-7851</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">2 Way Power Terminal 3.81mm</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>220-4658</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Capacitor 220 &#181;F 200 V</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>440-6761</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Resistance 2K2 7W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>485-3038</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse 6.3x32mm 3A</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>413-210</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Arduino Uno Atmel Atmega 328 MCU board</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>715-4081</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Prototipe Board CEM3,3 orific.,RE310S2</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>728-8737</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">DC/DC converter,12Vin,+/-5Vout 100mA 1W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>689-5179</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2 SERA T8 blue moonlight fluorescent bulb 36 watts</td>
			<td style="width:113px;">SERA</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Discontinued / Light isolated facility</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)

Apresentamos um protocolo relacionado a uma técnica de controle de vídeo baseada na limiarização de imagem que torna possível controlar individualmente os animais cohoused e subtração de fundo. Nós testamos a rotina de rastreamento com quatro cohoused lagostim (Nephrops norvegicus) sob condições de luz-escuridão durante 5 dias. As lagostas tinham sido marcadas individualmente. A instalação experimental e as técnicas de rastreamento utilizadas baseiam-se inteiramente sobre o software de código aberto. A comparação entre a saída de rastreamento com uma detecção manual indica que as lagostas eram corretamente detectado 69% das vezes. Entre as lagostas detectadas corretamente, suas marcas individuais foram corretamente identificados 89,5% das vezes. Considerando a taxa de quadros usados no protocolo e a taxa de circulação de lagostas, o desempenho de rastreamento o vídeo tem uma boa qualidade, e os resultados representativos suportam a validade do protocolo em produzir dados valiosos para as necessidades de pesquisa (individual ocupação de espaço ou padrões de atividade locomotora). O protocolo apresentado aqui pode ser facilmente personalizado e é, portanto, transferível para outras espécies, onde o acompanhamento individual de espécimes em um grupo pode ser valioso para responder às perguntas de pesquisa.

Nós construímos manualmente um subconjunto dos dados experimentais para validar a análise automatizada de vídeo. Um tamanho de amostra de 1.308 quadros com um nível de confiança de 99% (que é uma medida de segurança que mostra se a amostra reflete com precisão a população, dentro de sua margem de erro) e uma margem de erro de 4% (que é uma porcentagem que descreve como fechar o resposta a amostra deu é o valor real da população) foi aleatoriamente selecionado, e realizou-se...

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Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus

Aqui nós apresentamos um protocolo para controlar individualmente os animais durante um longo período de tempo. Ele usa a visão computacional, métodos para identificar um conjunto de marcas construídos manualmente usando um grupo de lagostas como estudo de caso, simultaneamente, fornecendo informações sobre como a casa, manipulam e marcam as lagostas.

Acompanhamento a longo prazo de vídeo de animais aquáticos, Cohoused: um estudo de caso da atividade locomotora diária do lagostim (Nephrops norvegicus)

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

Este protocolo permite a automação do rastreamento de vários animais. Usando um rótulo simples para identificar cada animal uma ferramenta de análise de identificação para detectar as tags. Este protocolo reduz significativamente o número de horas necessárias para analisar as gravações de vídeo usando dados leskey.para estimar conclusões mais precisas dos estudos experimentais. Animais em outros ambientes que podem ser marcados de forma semelhante podem ser rastreados com protocolos semelhantes que fornecem aplicação em cronobiologia, ecologia, pesquisa viral ou neurociência. Fornecemos o design de hardware e a linguagem de programação de código aberto e fornecemos um modelo que recomendamos que os usuários adotem nos protocolos para aprender a linguagem de programação Python.Para construir uma etiqueta para o animal alvo, primeiro corte quatro círculos de 40 milímetros de diâmetro da folha de plástico preta, e dois triângulos equiláteros laterais de 26 milímetros e dois círculos de 26 milímetros de diâmetro de uma folha de PVC de plástico branco. Marque o centro de um triângulo branco e um círculo branco. E faça um buraco de 10 milímetros em cada marca.Em seguida, cole uma forma branca no centro de cada um dos quatro círculos negros. Para configurar a área experimental, coloque LEDs de tempo escuro infravermelho no tanque. Mantenha as luzes infravermelhas acesas o tempo todo.Em seguida, coloque luzes LED de tempo de luz azul em um tanque de fibra de vidro modificado contendo areia e quatro tocas flexíveis de tubos de PVC, e conecte as luzes a um aparelho para gerenciar o período de fotos. Quando todas as luzes tiverem sido colocadas, posicione a entrada de água do mar gelada em um canto do tanque, com a tomada correspondente no canto oposto. Verifique se a entrada de água do mar está configurada a uma vazão de cerca de 4 litros por minuto.Cerque a câmara com uma cortina preta para fornecer isolamento total da luz externa. Coloque o tripé equipado com a câmera web ao lado da arena experimental, com a câmera 130 centímetros acima e no centro da arena experimental. Conecte a câmera a um computador fora da cortina e ajuste os parâmetros da gravação de vídeo de acordo com as características da espécie, certificando-se de criar um relógio, incluindo a data no vídeo de lapso de tempo, para uma eventual pontuação comportamental.Para marcar os animais, adicione água Celsius de 7 graus a uma geladeira com compartimentos submersos e coloque 4 lagostas em 4 compartimentos separados. Depois de permitir que as lagostas se aclimatar por cerca de 30 minutos, transfira uma lagosta para uma bandeja de gelo esmagado por cinco minutos e use papel absortivo para secar a parte superior do cefaláxula da lagosta imobilizada. Coloque uma gota de cola de secagem rápida na carapaça seca e pressione a etiqueta sobre a cola por cerca de 20 segundos, até que a cola endureça.Em seguida, devolva a lagosta ao seu compartimento na geladeira, e rotule os outros três animais da mesma maneira. Quando todas as lagostas tiverem sido rotuladas, coloque as lagostas de volta em suas celas por 24 horas. No dia seguinte, use a mesma geladeira para transferir as lagostas da instalação de aclimatação para a câmara experimental, e iniciar a gravação de vídeo.Execute as etapas de marcação e transferência sob as condições de luz vermelha para evitar danos radiais à lagosta para os receptores. Espécies adicionais de água ou espécies terrestres podem não precisar desse cuidado. Em seguida, obtenha uma imagem de fundo média de cinco minutos de vídeo ou dos 100 quadros iniciais antes de introduzir os animais um a um no tanque de experimentação dentro de seus respectivos compartimentos de água, e esperar que as lagostas saiam de seus compartimentos.Do total de animais contados neste experimento representativo, 79% das detecções de animais foram corretamente comparadas pelo programa, e 89,5% das etiquetas foram corretamente identificadas. Apenas 3,8% das etiquetas foram classificadas incorretamente. Mas os 6,6% restantes correspondem a falsos positivos.Após a conclusão de uma análise de vídeo específica, os dados das posições obtidas podem ser utilizados para avaliar os diferentes padrões comportamentais das lagostas. Por exemplo, a traçação do mapa de ocupação espacial, usando uma estimativa de densidade kernal bidimensional com um eixo alinhado por variado kernal normal avaliado em uma grade quadrada, permite que as áreas em que as lagostas gastam uma porcentagem maior de seu tempo para serem representadas com parcelas de alta intensidade de cor. Os ritmos diários de atividade das lagostas também podem ser traçados como milímetros cobertos em intervalos de dez minutos binned ao longo do tempo.É importante manter as especificações exatas em termos de tamanho e forma e sempre executar a etapa de análise binned em segundo plano sem interface de usuário. O modelo de análise de imagem pode ser expandido para olhar componentes específicos dos crustáceos para ajudar a melhorar o estudo comportamental em termos de interações animais. Essas complexas interações sociais animais ocorrem de forma semelhante em um ambiente real, permitindo o estilo e aspectos importantes da pesquisa biológica com alguma aplicação para ecologia e neurociência.

Research

JoVE Journal

Environment

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster (Nephrops norvegicus)

Determination of Microbial Extracellular Enzyme Activity in Waters, Soils, and Sediments using High Throughput Microplate Assays

Determinação da Microbial Extracelular Enzyme actividade nas águas, solos e sedimentos, utilizando alta taxa de transferência de microplaca Ensaios

Much of the nutrient cycling and carbon  processing in natural environments occurs through the activity of extracellular  enzymes released by ...

Ambiente

Modifying the Bank Erosion Hazard Index (BEHI) Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

Modifying the Bank Erosion Hazard Index BEHI Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

Modificando o Index (BEHI) Protocolo Banco Erosão Hazard para Avaliação Rápida de Streambank Erosão na Northeastern Ohio

Understanding the source of pollution in a stream is vital to preserving, restoring, and maintaining the stream&#8217;s function and habitat it provides. ...

The Use of an Automated System (GreenFeed) to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

The Use of an Automated System GreenFeed to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

O uso de um sistema automatizado (GreenFeed) para monitorar entérica de metano e dióxido de carbono As emissões dos ruminantes

Ruminant animals (domesticated or wild) emit methane (CH4) through enteric fermentation in their digestive tract and from decomposition of manure during ...

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Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

Criação e manutenção de longo prazo de Eristalis tenax Hoverflies para estudos de investigação

With an estimated 6000 species worldwide, hoverflies are ecologically important as alternative pollinators to domesticated honeybees. However, they are ...

Experimental Protocol for Examining Behavioral Response Profiles in Larval Fish: Application to the Neuro-stimulant Caffeine

Protocolo experimental pela análise de perfis de resposta comportamental em peixes Larval: aplicação para a Neuro-estimulantes cafeína

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and ...

Combining Eye-tracking Data with an Analysis of Video Content from Free-viewing a Video of a Walk in an Urban Park Environment

Combinando dados de rastreamento de olhos com uma análise de conteúdo de vídeo de livre-visualizando um vídeo de uma caminhada em um ambiente de parque urbano

As individuals increasingly live in cities, methods to study their everyday movements and the data that can be collected becomes important and valuable. ...