Name: long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)
Uploaded: 2019-04-08T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

Författarna vill tacka Dr Joan B. företaget som finansierade publiceringen av detta arbete. Även är författarna tacksam till tekniker av den experimentella akvarium zonen vid Institutet för marina vetenskaper i Barcelona (ICM-CSIC) för deras hjälp under det experimentella arbetet.
Detta arbete stöds av projektet RITFIM (CTM2010-16274; Projektledare: J. Aguzzi) grundades av det spanska ministeriet för vetenskap och Innovation (MICINN) och TIN2015-66951-C2-2-R bidraget från det spanska ministeriet för ekonomi och konkurrenskraft.

De arter som används i denna studie är inte en utrotningshotade eller skyddade arter. Provtagning och laboratorie experiment följde spanska lagstiftningen och interna institutionella (ICM-CSIC) föreskrifter om djurskydd. Djur provtagning utfördes med tillstånd av den lokala myndigheten (regionala regeringen i Katalonien).
1. animaliskt underhåll och provtagning
Obs: Följande protokoll är baserad på antagandet att forskare kan provet N. n...

Prestanda och representativa resultat av protokollet video-tracking bekräftade dess giltighet för tillämpad forskning inom djurens beteende, med särskilt fokus på sociala modulering och dygnsrytmen av cohoused djur. Effektiviteten i animal detection (69%) och riktigheten av taggen diskriminering (89,5%) tillsammans med de beteendemässiga egenskaperna (dvs. rörelse ränta) det målarter som används här tyder på att detta protokoll är en perfekt lösning för långsiktig experimentella studier (t.ex., dagar och ...

Under de senaste åren, har automatiserade image-baserad spårning lämnat mycket noggranna datamängder som kan användas för att utforska grundläggande frågor i ekologi och beteende discipliner1. Dessa datamängder kan användas för kvantitativ analys av djurens beteende2,3. Varje bild-metod som används för att spåra djur och beteende utvärdering har dock sina styrkor och begränsningar. I image-baserad spårning protokoll som använder spatial information från föregående bildrutor i en film för att spåra djur4,5,6, kan fel införas när sökvägarna för två djur korsa. Dessa fel är vanligen oåterkalleliga och spridits genom tid. Trots computational framsteg som minskar eller nästan eliminera detta problem5,7, behöver dessa tekniker fortfarande homogen experimentella miljöer för korrekt identifiering och spårning.
Anställning av märken som kan identifieras unikt djur undviker dessa fel och tillåter långsiktiga spårning av identifierade individer. Allmänt använda markörer (t.ex., streckkoder och QR-koder) finns i industri- och handelskammare och kan identifieras med hjälp av välkända dator vision tekniker, såsom augmented reality (t.ex. ARTag8) och kamerakalibrering (t.ex., CALTag9 ). Taggad djur har tidigare använts för hög genomströmning beteendevetenskapliga studier i olika djurarter, för exempel, myror3 eller bin10, men några av dessa tidigare system inte är optimerad för att erkänna isolerade Taggar3.
Spårning protokollet presenteras i denna uppsats är speciellt lämplig för att spåra djur i en kanal bildspråk, såsom infraröd (IR) ljus eller monokromatiskt ljus (särskilt, vi använder blått ljus). Därför använder inte metoden utvecklats färg cues, som också gäller för andra inställningar där det finns begränsningar i belysningen. Dessutom använder vi anpassade taggar utformade så att störa hummer och samtidigt tillåta inspelning med billiga kameror. Dessutom den metod som används här är baserad på ram-oberoende tag upptäckt (i.e., algoritmen erkänner förekomsten av varje tagg i bilden oavsett tidigare trajectoriesen). Denna funktion är relevanta i applikationer där djur kan vara tillfälligt ockluderas eller djurens banor kan överlappa.
Tag designen tillåter dess användning i olika grupper av djur. När parametrarna för metoden är inställda, kan det överföras för att ta itu med andra djur-tracking problem utan att behöva utbildning en specifik klassificerare (andra kräftdjur eller snäckor). De viktigaste begränsningarna exporterande protokollet är storleken på etiketten och behovet för fastsättning på djuret (vilket gör den inte lämplig för små insekter, såsom flugor, bin, etc.) och 2D antagandet för djurens förflyttning. Denna begränsning är betydande, eftersom den föreslagna metoden förutsätter tagg storlek förblir konstant. Ett djur som rör sig fritt i en 3D-miljö (t.ex. fisk) skulle visa olika tag storlekar beroende på avstånd till kameran.
Syftet med detta protokoll är att tillhandahålla en användarvänlig metod för att spåra flera märkta djur under en lång tid (dagar eller veckor) i ett 2D sammanhang. Metoden som är baserad på användning av öppen programvara och maskinvara. Fri och öppen källa mjukvaran tillåter anpassningar, ändringar och gratis omfördelning; Därför förbättrar genererade programvaran varje steg11,12.
Protokollet presenteras här fokuserar på ett laboratorium att spåra och utvärdera rörelseaktivitet fyra vattenlevande djur i en tank för 5 dagar. Videofiler inspelade från en 1 s time-lapse image och sammanställas i en video på 20 bildrutor per sekund (1 inspelade dag upptar cirka 1 h video). Alla videoinspelningar är automatiskt postprocessed att erhålla djurens positioner, tillämpa dator vision metoder och algoritmer. Protokollet tillåter att få stora mängder spåra data, undvika deras manuell anteckning, som har visat sig vara tidskrävande och mödosam i tidigare experimentella papper13.
Vi använder havskräfta (Nephrops norvegicus) för fallstudien; Således, vi tillhandahåller artspecifika laboratorieförhållanden att upprätthålla dem. Humrar utföra väl studerat håla uppkomsten rytmer som är under kontroll av dygnsrytm klockan14,15, och när cohoused, de bildar dominans hierarki16,17. Därför, den modell som presenteras här är ett bra exempel för forskares sociala moduleringen av beteende med särskilt fokus på dygnsrytmen.
Metoden presenteras här återges enkelt och kan tillämpas på andra arter om det finns en möjlighet att skilja mellan djur med enskilda Taggar. Minimikraven för att återge en sådan strategi i laboratoriet är (i) isotermiska rum för experimentell inställningar; (ii) en kontinuerlig vattenförsörjning; (iii) vatten temperatur kontrollmekanismer; (iv) ett system för ljusstyrning. (v) en USB-kamera och en vanlig dator.
I detta protokoll använder vi Python18 och OpenCV19 (öppen källkod dator Vision Library). Vi förlitar oss på snabb och allmänt tillämpade åtgärder (både när det gäller genomförande), såsom bakgrund subtraktion20 och bild tröskelvärde21,22.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:860px;" width="860">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Tripod 475</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">A0673528</td>
			<td style="width:307px;">Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Articulated Arm 143</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">D0057824</td>
			<td>Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camera USB 2.0 uEye LE</td>
			<td style="width:113px;">iDS</td>
			<td style="width:123px;">UI-1545LE-M</td>
			<td>https://en.ids-imaging.com/store/products/cameras/usb-2-0-cameras/ueye-le.html</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:317px;">Fish Eye Len C-mount f=6mm/F1.4</td>
			<td style="width:113px;">Infaimon</td>
			<td style="width:123px;">Standard Optical&#160;</td>
			<td style="width:307px;">https://www.infaimon.com/es/estandar-6mm</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:317px;">Glass Fiber Tank 1500x700x300 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Black Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Tank</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>5 Wood Strips 50x50x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>10 Wood Strips 25x25x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Stainless Steel Screws</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>As many as necessary for fix wood strips structures</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">PC</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2-cores CPU, 4GB RAM, 1 GB Graphics, 500 GB HD</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">External Storage HDD</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2 TB capacity desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">iSPY Sotfware for Windows PC</td>
			<td style="width:113px;">iSPY</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.ispyconnect.com/download.aspx</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Zoneminder Software Linux PC</td>
			<td style="width:113px;">Zoneminder</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://zoneminder.com/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">OpenCV 2.4.13.6 Library</td>
			<td style="width:113px;">OpenCV</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://opencv.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Python 2.4</td>
			<td style="width:113px;">Python</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.python.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camping Icebox</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Plastic Tray</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Cyanocrylate Gel</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>To glue tag&#8217;s&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 black PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 white PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Tag&#8217;s &#216; 40 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Maked with black &#38; white PVC plastic sheet</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Blue Strid Led Ligts (480 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m IR Strid Led Ligts (850 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">6m&#160; Methacrylate Pipes &#216; 15 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Enclosed Strid Led</td>
		</tr>
		<tr height="23">
			<td height="23" style="height:23px;width:317px;">4 PVC Elbow&#160; 45o &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Flexible PVC Pipe &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 PVC Screwcap &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 O-ring &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Female PVC socket glue / thread &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">10 m DC 12V Electric Cable</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Ligt Power Supply DC 12V 300 w</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">MOSFET, RFD14N05L, N-Canal, 14 A, 50 V, 3-Pin, IPAK (TO-251)</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>325-7580</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">Diode, 1N4004-E3/54, 1A, 400V, DO-204AL, 2-Pines</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>628-9029</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse Holder</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>336-7851</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">2 Way Power Terminal 3.81mm</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>220-4658</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Capacitor 220 &#181;F 200 V</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>440-6761</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Resistance 2K2 7W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>485-3038</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse 6.3x32mm 3A</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>413-210</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Arduino Uno Atmel Atmega 328 MCU board</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>715-4081</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Prototipe Board CEM3,3 orific.,RE310S2</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>728-8737</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">DC/DC converter,12Vin,+/-5Vout 100mA 1W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>689-5179</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2 SERA T8 blue moonlight fluorescent bulb 36 watts</td>
			<td style="width:113px;">SERA</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Discontinued / Light isolated facility</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)

Vi presenterar ett protokoll som relaterade till en video-tracking-teknik utifrån bakgrunden subtraktion och bild tröskelvärde som gör det möjligt att individuellt spåra cohoused djur. Vi testade rutinen spårning med fyra cohoused havskräftor (Nephrops norvegicus) ljus-mörker villkor under 5 dagar. Hummer hade märkts individuellt. Den experimentella setup och de spårning tekniker som används är helt baserad på öppen källkod. Jämförelse av spårning utdata med en manuell identifiering antyder att hummer var korrekt upptäckt 69% av gånger. Bland korrekt identifierade hummer, deras enskilda Taggar var korrekt identifierade 89,5% av gånger. Med tanke på den bildhastighet som används i protokollet och andelen rörelse av hummer, prestanda för video spårning har en god kvalitet, och de representativa resultat stöder giltigheten av protokollet i producerar värdefulla data för forskningsbehov (individuell utrymme beläggning eller rörelseaktivitet mönster). Det protokoll som presenteras här kan enkelt anpassas och är därför överlåtbara till andra arter där enskilda spårning av prover i en grupp kan vara värdefulla för att besvara forskningsfrågor.

Vi konstruerade manuellt en delmängd av de experimentella data att validera den automatiserade videoanalys. En stickprovsstorlek på 1.308 ramar med en konfidensnivå på 99% (vilket är ett mått på säkerhet som visar huruvida provet återspeglar befolkningens, inom dess felmarginalen) och en felmarginal på 4% (som är en procentsats som beskriver hur nära den svar provet gav är att det verkliga värdet i befolkningen) valdes slumpmässigt, och en manuell annotering av korrekt iden...

Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus

Här presenterar vi ett protokoll för att individuellt spåra djur över en lång tidsperiod. Den använder datorseende metoder för att identifiera en uppsättning manuellt byggyta Taggar med hjälp av en grupp av hummer som fallstudie, samtidigt ger information om hur man hus, manipulera och markera hummer.

Långsiktiga Video spårning av Cohoused vattenlevande djur: en fallstudie av den daglig rörelseaktivitet på havskräfta (Nephrops norvegicus)

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

Detta protokoll tillåter automatisering av spårning av flera djur. Med hjälp av en enkel etikett för att identifiera varje djur ett ID-analysverktyg för att upptäcka taggarna. Detta protokoll minskar avsevärt antalet timmar som behövs för att analysera videoinspelningarna med hjälp av leskey-data.att uppskatta mer exakta kompletteringar från de experimentella studierna. Djur i andra miljöer som kan märkas på liknande sätt kan spåras med liknande protokoll som ger tillämpning i chronobiology, ekologi, viral forskning eller neurovetenskap. Vi har tillhandahållit hårdvaran design och öppen källkod programmeringsspråk och ger en modell vi rekommenderar användare anta i protokollen för att lära Python programmeringsspråk.För att konstruera en tagg för målet djuret, först skära fyra 40 millimeter diameter cirklar från den svarta plastfolie, och två 26 millimeter siddilstorala trianglar och två 26 millimeter diameter cirklar från en vit plast PVC-ark. Markera mitten av en vit triangel och en vit cirkel. Och gör ett 10 millimeters hål vid varje märke.Lim sedan en vit form i mitten av var och en av de fyra svarta cirklarna. För att ställa in det experimentella området, placera infraröda mörka tids-lysdioder i tanken. Håll infrarött lamporna tända hela tiden.Därefter placerar blå ljustid LED-lampor i en modifierad glasfibertank som innehåller sand och fyra flexibla PVC-rörhålor och anslut lamporna till en apparat för hantering av fotoperioden. När alla lampor har placerats, placera kylda havsvatten inloppet i ett hörn av tanken, med motsvarande utlopp i motsatt hörn. Kontrollera att sjövatteninsatsen är inställd med en flödeshastighet på ca 4 liter per minut.Omge kammaren med en svart gardin för att ge full isolering från yttre ljus. Placera stativet utrustat med webbkameran till sidan av den experimentella arenan, med kameran 130 centimeter ovanför och i centrum av den experimentella arenan. Anslut kameran till en dator utanför gardinen, och justera parametrarna för videoinspelningen enligt artens egenskaper, se till att skapa en tidsstämpel, inklusive datumet i time-lapse video, för eventuell beteendemässiga scoring.För att märka djuren, tillsätt 7 graders Celsius vatten till en islåda med nedsänkta fack, och placera 4 hummer i 4 separerade fack. Efter att ha tillåtit hummer att acklimatisera sig i ca 30 minuter, överföra en hummer på en bricka med krossad is i fem minuter, och använda absorptivt papper för att torka den övre delen av den immobiliserade hummer cephalothorax. Placera en droppe snabbtorkande lim på den torkade ryggskölden och tryck fast taggen på limmet i ca 20 sekunder, tills limmet hårdnar.Sedan tillbaka hummer till sitt fack i icebox, och märka de andra tre djuren på samma sätt. När alla hummer har märkts, placera hummer tillbaka i sin cell i 24 timmar. Nästa dag, använd samma islåda för att överföra hummer från acklimatisering anläggningen till experimentkammaren, och inleda videoinspelning.Utför taggnings- och överföringsstegen under de röda ljusförhållandena för att undvika radiella skador på hummern för receptorerna. Ytterligare vattenarter eller landlevande arter kanske inte behöver denna vård. Sedan få en genomsnittlig bakgrundsbild från fem minuter video eller från de första 100 bildrutorna innan du introducerar djuren en efter en i experimenttanken inuti sina respektive avdelningar med vatten, och vänta på att hummern kommer ut ur sina fack.Av det totala antalet djur som räknades i detta representativa experiment matchades 79 procent av djurupptäckterna korrekt av programmet och 89,5 procent av taggarna identifierades korrekt. Endast 3,8 procent av taggarna var felaktigt klassificerade. Men resterande 6,6 procent motsvarar falska positiva.Efter slutförandet av en specifik videoanalys, kan de erhållna positionerna data användas för att utvärdera de olika beteendemönster av hummer. Till exempel utrymme beläggning karta plottning, med hjälp av en tvådimensionell kernal densitet uppskattning med en axel som justeras genom variaate normal kernal utvärderas på ett fyrkantigt rutnät, gör att de områden där hummer spenderar en högre andel av sin tid som skall representeras med hög färgintensitet tomter. Hummerns dagliga aktivitetsrytm kan också ritas som millimeter täckta med tio minuters binnedintervall över tiden.Det är viktigt att behålla exakta specifikationer när det gäller storlek och form och att alltid utföra binned analyssteg i bakgrunden utan användargränssnitt. Bildanalysmodellen kan utökas för att titta på specifika komponenter i kräftdjuren för att hjälpa till att förbättra beteendestudien när det gäller interaktioner från djur. Dessa komplexa djur sociala interaktioner sker på ett liknande sätt i en faktisk miljö som möjliggör stil och viktiga aspekter av biologisk forskning med viss tillämpning för ekologi och neurovetenskap.

Research

JoVE Journal

Environment

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster (Nephrops norvegicus)

Determination of Microbial Extracellular Enzyme Activity in Waters, Soils, and Sediments using High Throughput Microplate Assays

Fastställande av mikrobiell extracellulär enzymaktivitet i Vatten, Jord och sediment med hjälp av hög genomströmning mikroplattor Analyser

Much of the nutrient cycling and carbon  processing in natural environments occurs through the activity of extracellular  enzymes released by ...

Modifying the Bank Erosion Hazard Index (BEHI) Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

Modifying the Bank Erosion Hazard Index BEHI Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

Modifiera banken Erosion Hazard index (BEHI) Protokoll för snabb bedömning av Streambank Erosion i nordöstra Ohio

Understanding the source of pollution in a stream is vital to preserving, restoring, and maintaining the stream&#8217;s function and habitat it provides. ...

The Use of an Automated System (GreenFeed) to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

The Use of an Automated System GreenFeed to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

Användning av ett automatiserat system (GreenFeed) för att övervaka Enteric metan och koldioxid utsläpp från idisslare

Ruminant animals (domesticated or wild) emit methane (CH4) through enteric fermentation in their digestive tract and from decomposition of manure during ...

Alternative Method of Removing Otoliths from Sturgeon

Alternativ metod för att avlägsna otoliter från Sturgeon

Extracting the otoliths (ear bones) from fish that have very thick skulls can be difficult and very time consuming. The common practice of making a ...

Field Experiments of Pollination Ecology: The Case of Lycoris sanguinea var. sanguinea

Field Experiments of Pollination Ecology: The Case of Lycoris sanguinea var. sanguinea

Fältförsök pollinering Ecology: fallet<em&gt; Lycoris sanguinea</em&gt; Var.<em&gt; sanguinea</em

Plant-pollinator interactions have been studied for approximately one hundred years. During that time, many field methods have been developed to clarify ...

Using Pharmacological Manipulation and High-precision Radio Telemetry to Study the Spatial Cognition in Free-ranging Animals

Använda Farmakologisk manipulation och med hög precision Radio Telemetry att studera Spatial Cognition i frigående djur

An animal&#39;s ability to perceive and learn about its environment plays a key role in many behavioral processes, including navigation, migration, ...

Development of New Methods for Quantifying Fish Density Using Underwater Stereo-video Tools

Utveckling av nya metoder för kvantifiering av fisk densitet med undervattens Stereo-video verktyg

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and ...

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

Uppfödning och långsiktigt underhåll av Eristalis tenax familjen blomflugor för forskarstudier

With an estimated 6000 species worldwide, hoverflies are ecologically important as alternative pollinators to domesticated honeybees. However, they are ...

Experimental Protocol for Examining Behavioral Response Profiles in Larval Fish: Application to the Neuro-stimulant Caffeine

Experimentellt protokoll för att pröva beteendemässiga svar profiler i Larval fisk: ansökan till Neuro-stimulerande koffein

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and ...

Combining Eye-tracking Data with an Analysis of Video Content from Free-viewing a Video of a Walk in an Urban Park Environment

Kombinera Eye-tracking data med en analys av video innehåll från Free-Visa en video av en promenad i en urban Park miljö

As individuals increasingly live in cities, methods to study their everyday movements and the data that can be collected becomes important and valuable. ...