Name: long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)
Uploaded: 2019-04-08T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

Yazarlar bu eserin yayın finanse Dr. Joan B. şirket için minnettarız. Ayrıca, Yazarlar deneysel çalışmaları sırasında deniz Bilimler Enstitüsü Barselona (ICM-CSIC) deneysel akvaryum bölgenin kendi yardım teknisyenleri için minnettarız.
Bu eser RITFIM projesi tarafından desteklenmiştir (CTM2010-16274; yürütücü: J. Aguzzi) İspanyol Bakanlığı bilim ve yenilik (MICINN) ve İspanyolca Bakanlığı Ekonomi ve rekabet TIN2015-66951-C2-2-R hibe tarafından kurulmuş.

Bu çalışmada kullanılan türler bir nesli tehlike altında olan veya korunan türler değildir. Örnekleme, laboratuvar deneyleri İspanyol mevzuat ve hayvan refahı ile ilgili iç kurumsal (ICM-CSIC) kuralları izledi. Hayvan örnekleme yerel otorite (Katalonya bölgesel hükümet) izni ile yapılmıştır.
1. hayvan bakım ve örnekleme
Not: Aşağıdaki Protokolü araştırmacılar zarar vermemek için photoreceptors23ge...

Video izleme protokolü ile elde edilen performans ve temsilcisi sonuçları odaklı sosyal modülasyon ve sirkadiyen ritim cohoused hayvanların belirli bir hayvan davranış alanında uygulamalı araştırma için geçerliliğini doğruladı. Hayvan algılama (% 69) verimliliğini ve etiket ayrımcılık (%89,5) doğruluğu kullanılan hedef türler davranış özellikleri (yani, hareket hızı) ile birleştiğinde burada bu Protokolü (örneğin, gün ve hafta) uzun vadeli deneysel çalışmalar için mükemmel bir ç...

Son birkaç yılda, ekoloji ve davranış disiplinleri1temel soruları keşfetmek için kullanılan son derece hassas veri kümeleri otomatik görüntü tabanlı izleme sağlamıştır. Bu veri kümeleri için kantitatif analiz hayvan davranışları2,3kullanılabilir. Ancak, her görüntü metodoloji hayvanlar ve davranış değerlendirme izlemek için kullanılan onun güçlü ve sınırlamalar vardır. İki hayvan yolları geçerken hayvanlar4,5,6izlemek için bir film önceki kare uzamsal bilgileri kullanın yansıma tabanlı izleme protokolleri içinde hatalar tanıttı olabilir. Bu hatalar genellikle geri alınamaz ve zaman içinde yaymak. Azaltan veya ortadan kaldıran neredeyse bu sorun5,7sayısal gelişmeler rağmen bu teknikler hala doğru hayvan kimlik ve izleme için homojen deneysel ortamlar gerekir.
Hayvanlarda benzersiz tanımlanabilir işaretleri istihdam bu hataları önler ve saptanan bireylerin uzun vadeli izlenmesini sağlar. Yaygın olarak kullanılan işaretleri (örneğin, barkod ve QR kodları) sanayi ve ticaret var ve tanınmış bilgisayar vizyon yöntemlerle augmented gibi tanımlanabilir gerçeklik (örneğin, ARTag8) ve kamera kalibrasyon (örneğin, CALTag9 ). İçin örnek, karıncalar3 ya da arıların10ama bazı önceki bu sistemleri izole Etiketler3tanımak için optimize edilmiş değildir tagged hayvanlar daha önce farklı hayvan türleri, yüksek üretilen iş davranış araştırmaları kullanılmıştır.
Bu raporda sunulan izleme Protokolü tek kanallı görüntüleri, kızılötesi (IR) ışık veya monokromatik ışık gibi hayvanlarda izlemek için özellikle uygundur (özellikle, mavi ışık kullanın). Bu nedenle, geliştirilen yöntem renk cues, aynı zamanda diğer ayarları geçerli olmak kullanmaz aydınlatma kısıtlamaları orada. Ayrıca, özelleştirilmiş etiketler şekilde değil ıstakoz rahatsız ve aynı zamanda düşük maliyetli kameralar ile kayda izin için tasarlanmış kullanın. Ayrıca, burada kullanılan bu yöntem çerçeve bağımsız etiket algılama üzerinde dayanır (i.e., algoritma her etiket önceki yörüngeleri ne olursa olsun görüntüdeki varlığını tanır). Uygulamaların nerede hayvanlar geçici olarak tıkandı veya hayvanların yörüngeleri kesiştiği ilgili bir özelliktir.
Etiket design hayvanlar farklı gruplar halinde kullanımı sağlar. Yönteminin parametreleri ayarladığınızda, (diğer kabuklular veya gastropodlar) belirli bir sınıflandırıcının eğitim gerek kalmadan diğer hayvan izleme sorunları çözmek için aktarılabilir. Protokol ihracat ana etiket ve eki (hangi geçici o sinekler, arılar, vb gibi küçük böcekler için uygun değildir) hayvan ihtiyacını ve hayvan hareketi için 2D varsayım boyutunu sınırlamalardır. Etiket boyutu sabit kalır önerilen yöntem varsayar göz önüne alındığında bu sınırlama, önemlidir. Bir 3D ortamda (örneğin, Balık) serbestçe hareket hayvan uzaklığı kameraya bağlı olarak farklı etiket boyutları gösterir.
Bu iletişim kuralının amacı bir uzun süre (örneğin, gün veya hafta) bir 2D içerik içinde birden çok tagged hayvanlar izlemek için kullanıcı dostu bir yöntem sağlamaktır. Metodolojik yaklaşım açık kaynak yazılım ve donanım kullanımına dayanır. Ücretsiz ve açık kaynak yazılım uyarlama, değişiklikler ve ücretsiz yeniden dağıtım izin verir; Bu nedenle, oluşturulan yazılım her adım11,12, geliştirir.
Protokol burada izlemek ve 5 gün boyunca dört hayvanlar bir su tankında Lokomotor aktivite değerlendirmek için bir laboratuar üzerinde duruluyor sundu. Video dosyalarını bir 1 s hızlandırılmış görüntü kaydedilir ve bir video (1 kayıtlı gün yaklaşık 1 h video kaplar) saniyede 20 kare ile derlenmiş. Tüm video kayıtları bilgisayar vizyon yöntemler ve algoritmalar uygulama hayvan pozisyonları elde etmek için otomatik olarak postprocessed. Protokol izleme verilerini zaman yoğun ve önceki deneysel kağıtları13' te zahmetli olduğu gösterilmiştir el ile onların ek açıklama kaçınarak, büyük miktarlarda almak sağlanır.
Norveç ıstakoz (Nephrops norvegicus) vaka çalışması için kullanın; Böylece, biz onları korumak için species-specific laboratuvar koşulları sağlamak. Istakoz sirkadiyen saat14,15denetiminde olan iyi okudu yuva ortaya çıkması ritimleri gerçekleştirmek ve cohoused zaman, onlar egemenlik hiyerarşi16,17oluşturur. Bu nedenle, burada sunulan model davranış sirkadiyen ritim belirli odaklanarak sosyal modülasyonu ile ilgilenen araştırmacılar için iyi bir örnektir.
Burada sunulan metodolojisi kolaylıkla tekrar oluşturulur ve hayvanları tek tek etiketleri ile ayırt etmek için bir ihtimal varsa diğer türler için uygulanabilir. Böyle bir yaklaşım laboratuvarda çoğaltılması için gereken minimum gereksinimleri (ı) deneysel kurulum; izotermal odalar vardır (ii) bir sürekli su kaynağı; (iii) su sıcaklığı kontrol mekanizmaları; (iv) bir ışık kontrol sistemi; (v) bir USB kamera ve standart bir bilgisayar.
Bu protokol için Python18 ve OpenCV19 (açık kaynak bilgisayar vizyon kütüphane) kullanın. Hızlı ve yaygın olarak uygulanan işlemleri (uygulama ve yürütme açısından hem de), arka plan çıkarma20 ve görüntü eşik21,22gibi güveniyor.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:860px;" width="860">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Tripod 475</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">A0673528</td>
			<td style="width:307px;">Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Articulated Arm 143</td>
			<td style="width:113px;">Manfrotto</td>
			<td style="width:123px;">D0057824</td>
			<td>Discontinued</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camera USB 2.0 uEye LE</td>
			<td style="width:113px;">iDS</td>
			<td style="width:123px;">UI-1545LE-M</td>
			<td>https://en.ids-imaging.com/store/products/cameras/usb-2-0-cameras/ueye-le.html</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:317px;">Fish Eye Len C-mount f=6mm/F1.4</td>
			<td style="width:113px;">Infaimon</td>
			<td style="width:123px;">Standard Optical&#160;</td>
			<td style="width:307px;">https://www.infaimon.com/es/estandar-6mm</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:317px;">Glass Fiber Tank 1500x700x300 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Black Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Tank</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>5 Wood Strips 50x50x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Wood Structure Felt Fabric</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>10 Wood Strips 25x25x250 mm</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Stainless Steel Screws</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>As many as necessary for fix wood strips structures</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">PC</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2-cores CPU, 4GB RAM, 1 GB Graphics, 500 GB HD</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">External Storage HDD</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>2 TB capacity desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">iSPY Sotfware for Windows PC</td>
			<td style="width:113px;">iSPY</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.ispyconnect.com/download.aspx</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Zoneminder Software Linux PC</td>
			<td style="width:113px;">Zoneminder</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://zoneminder.com/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">OpenCV 2.4.13.6 Library</td>
			<td style="width:113px;">OpenCV</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://opencv.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Python 2.4</td>
			<td style="width:113px;">Python</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>https://www.python.org/</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Camping Icebox</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Plastic Tray</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Cyanocrylate Gel</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>To glue tag&#8217;s&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 black PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">1 white PVC plastic sheet (1 mm thickness)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Tag&#39;s construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Tag&#8217;s &#216; 40 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Maked with black &#38; white PVC plastic sheet</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Blue Strid Led Ligts (480 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m IR Strid Led Ligts (850 nm)</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Waterproof as desirable</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">6m&#160; Methacrylate Pipes &#216; 15 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Enclosed Strid Led</td>
		</tr>
		<tr height="23">
			<td height="23" style="height:23px;width:317px;">4 PVC Elbow&#160; 45o &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">3 m Flexible PVC Pipe &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 PVC Screwcap &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4 O-ring &#216; 63 mm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">4 Female PVC socket glue / thread &#216; 63 mm</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:307px;">Burrow construction</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">10 m DC 12V Electric Cable</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Ligt Power Supply DC 12V 300 w</td>
			<td style="width:113px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">MOSFET, RFD14N05L, N-Canal, 14 A, 50 V, 3-Pin, IPAK (TO-251)</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>325-7580</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:317px;">Diode, 1N4004-E3/54, 1A, 400V, DO-204AL, 2-Pines</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>628-9029</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse Holder</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>336-7851</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">2 Way Power Terminal 3.81mm</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>220-4658</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Capacitor 220 &#181;F 200 V</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>440-6761</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Resistance 2K2 7W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>485-3038</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Fuse 6.3x32mm 3A</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>413-210</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Arduino Uno Atmel Atmega 328 MCU board</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>715-4081</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">Prototipe Board CEM3,3 orific.,RE310S2</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>728-8737</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:317px;">DC/DC converter,12Vin,+/-5Vout 100mA 1W</td>
			<td>RS Components</td>
			<td>689-5179</td>
			<td>Light Control Mechanism</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2 SERA T8 blue moonlight fluorescent bulb 36 watts</td>
			<td style="width:113px;">SERA</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td>Discontinued / Light isolated facility</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

long-term video tracking of cohoused aquatic animals: a case study of the daily locomotor activity of the norway lobster (nephrops norvegicus)

Biz arka plan çıkarma ve ayrı ayrı cohoused hayvanları izlemek olanak sağlar görüntü eşik dayalı bir video izleme tekniği ile ilgili bir protokol mevcut. Dört cohoused Norveç ıstakoz (Nephrops norvegicus) ile izleme rutin 5 gün boyunca ışık-karanlık koşullarda test ettik. Istakoz tek tek etiketli. Deneysel kurulum ve izleme teknikleri kullanılan tamamen açık kaynak yazılım üzerinde temel alır. El ile algılama ile izleme çıktısının karşılaştırma ıstakoz doğru olduğunu gösterir % 69 kez algılandı. Arasında doğru bir şekilde tespit edilen ıstakoz, onların bireysel etiketleri doğru olduğunu %89,5 kez tanımlanmış. Göz önüne alındığında iletişim kuralında kullanılan kare hızı ve ıstakoz hareket hızı, video izleme performansı iyi bir kalite sahiptir ve araştırma ihtiyaçları (birey için değerli veri üretiminde protokol geçerliliğini temsilcisi sonuçları destek Uzay doluluk veya Lokomotor aktivite desen). Burada sunulan Protokolü kolayca özelleştirilebilir ve, bu nedenle, nereye örneklerin bir gruptaki bireysel izleme-ebilmek var olmak araştırma soruları yanıtlamak için değerli diğer türler için transfer edilebilir.

Otomatik video analiz doğrulamak için deneysel verilerin bir alt kümesini el ile inşa edilmiştir. 1,308 çerçeveler bir güven düzeyi % 99 (nüfus, resminizde bir hata sınırı içinde örnek iyi yansıtacak olup olmadığını gösterir güvenlik ölçüsü olan) ve hata % 4'lük payı ile bir örnek boyutu (ne kadar yakın açıklayan yüzde olduğu yanıttır örnek verdi nüfus gerçek değerine) rastgele seçilmiştir, ve el ile ek açıklama ROIs doğru tanımlaması ve her ...

Watch this Scientific Journal Video about Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus at JoVE.com

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus

Burada tek tek hayvan uzun bir süre boyunca izlemek için bir iletişim kuralı mevcut. Vaka çalışması, aynı anda nasıl evine, bilgi veren bir grup ıstakoz kullanarak el ile oluşturulmuş etiketleri kümesini tanımlamak için yöntemleri işlemek ve ıstakoz işaretlemek bilgisayarlı görme kullanır.

Cohoused suda yaşayan hayvanların uzun süreli Video izleme: Norveç ıstakoz (Nephrops norvegicus) ve günlük Lokomotor aktivite bir vaka çalışması

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

Bu protokol, birden fazla hayvanın takibinin otomasyonuna olanak sağlar. Etiketleri algılamak için her hayvanı tanımlamak için basit bir etiket kullanmak. Bu protokol, leskey verilerini kullanarak video kayıtlarını çözümlemek için gereken saat sayısını önemli ölçüde azaltır.deneysel çalışmalardan daha doğru tamamlamaları tahmin etmek. Benzer şekilde etiketlenebilecek diğer ortamlardaki hayvanlar kronobiyoloji, ekoloji, viral araştırma veya nöroloji uygulamaları sağlayan benzer protokollerle takip edilebilir. Donanım tasarımı ve açık kaynak programlama dilini sağladık ve kullanıcıların Python programlama dilini öğrenmek için protokollerde benimsemelerini önerdiğimiz bir model sunduk.Hedef hayvan için bir etiket oluşturmak için, ilk siyah plastik levha dört 40 milimetre çapında daireler kesti, ve iki 26 milimetre taraflı eşkenar üçgen ve iki 26 milimetre çapında daireler beyaz plastik PVC levha. Bir beyaz üçgenin ortasını ve bir beyaz daireyi işaretleyin. Ve her bir işarette 10 milimetrelik bir delik aç.Sonra dört siyah dairelerin her birinin ortasına bir beyaz şekil tutkallayın. Deneysel alanı kurmak için, kızılötesi karanlık zaman LED'lerini tankın içine yerleştirin. Kızılötesi ışıkları her zaman açık tutun.Daha sonra, mavi ışık zamanı LED ışıklarını kum ve dört esnek PVC boru yuvası içeren modifiye fiberglas tanka yerleştirin ve ışıkları fotoğraf dönemini yönetmek için bir cihaza bağlayın. Tüm ışıklar yerleştirildiğinde, soğutulmuş deniz suyu girişini tankın bir köşesine, karşı köşede ilgili priz ile yerleştirin. Deniz suyu girişidakikada yaklaşık 4 litre bir akış hızında kurulmuş olup olmadığını kontrol edin.Dış ışıktan tam izolasyon sağlamak için siyah bir perde ile oda surround. Web kamerasıyla donatılmış tripodu, 130 santimetre yukarıda ve deneysel arenanın ortasına yerleştirin. Kamerayı perdenin dışındaki bir bilgisayara bağlayın ve video kaydının parametrelerini türün özelliklerine göre ayarlayın ve nihai davranışsal puanlama için hızlandırılmış videodaki tarih de dahil olmak üzere bir zaman damgası oluşturduğunuzdan emin olun.Hayvanları etiketlemek için, batık bölmeleri olan bir buzkutusuna 7 derece su ekleyin ve 4 ayrı bölmeye 4 ıstakoz yerleştirin. ıstakoz yaklaşık 30 dakika alışmak için izin verdikten sonra, beş dakika boyunca ezilmiş buz bir tepsi üzerine bir ıstakoz aktarın ve immobilize ıstakoz sefalosaks üst kısmını kurutmak için absorptive kağıt kullanın. Kurutulmuş karaayak üzerine hızlı kurutma tutkal bir damla yerleştirin ve tutkal sertleşir kadar, yaklaşık 20 saniye boyunca tutkal üzerine etiketi basın.Sonra ıstakozbuz kutusundakendi bölmesine dönmek ve aynı şekilde diğer üç hayvan etiket. Tüm ıstakozlar etiketlendiğinde, ıstakozları 24 saat boyunca ceplerine geri yerleştirin. Ertesi gün, aynı buzlukta ıstakozları alışma tesisinden deney odasına transfer etmek ve video kaydını başlatmak için kullanın.Reseptörler için ıstakoz radyal hasarı önlemek için kırmızı ışık koşulları altında etiketleme ve transfer adımları yürütmek. Ek su türleri veya karasal türler bu bakıma gerek olmayabilir. Daha sonra, hayvanları kendi su bölmelerinin içindeki deney tankına tek tek sokmadan önce beş dakikalık videodan veya ilk 100 kareden ortalama bir arka plan görüntüsü elde edin ve ıstakozların bölmelerinden çıkmasını bekleyin.Bu temsili deneyde sayılan toplam hayvan sayısının yüzde 79'u program tarafından doğru bir şekilde eşleşti ve etiketlerin yüzde 89,5'i doğru bir şekilde tanımlandı. Etiketlerin sadece yüzde 3.8'i yanlış sınıflandırıldı. Ama geri kalan yüzde 6.6 yanlış pozitiflere karşılık geliyor.Belirli bir video analizi tamamlandıktan sonra, elde edilen pozisyonlar verileri ıstakozların farklı davranış kalıplarını değerlendirmek için kullanılabilir. Örneğin, uzay doluluk haritası çizimi, kare ızgara üzerinde değerlendirilen değişken normal çekirdek tarafından hizalanmış bir eksenle iki boyutlu kernal yoğunluk tahmini kullanarak, ıstakozların zamanlarının daha yüksek bir yüzdesini yüksek renk yoğunluğu çizimleriyle temsil etmek için harcadıkları alanlara olanak sağlar. Istakozgünlük aktivite ritimleri de milimetre zaman içinde on dakikalık binned aralıklarla kaplı olarak çizilebilir.Boyut ve şekil açısından kesin özellikleri korumak ve kullanıcı arabirimi olmadan arka planda binned çözümleme adımını her zaman yürütmek önemlidir. Görüntü analizi modeli hayvan etkileşimleri açısından davranışsal çalışma geliştirmeye yardımcı olmak için kabukluların belirli bileşenleri bakmak için genişletilebilir. Bu karmaşık hayvan sosyal etkileşimleri ekoloji ve nöroloji için bazı uygulama ile biyolojik araştırma tarzı ve önemli yönlerini sağlayan gerçek bir ortamda benzer bir şekilde meydana gelir.

Research

JoVE Journal

Environment

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster (Nephrops norvegicus)

Determination of Microbial Extracellular Enzyme Activity in Waters, Soils, and Sediments using High Throughput Microplate Assays

Yüksek Verimli Mikroplate Tahliller kullanarak Waters, Topraklar ve tortulları Mikrobiyal Ekstrasellüler Enzim Aktivitesi Belirlenmesi

Much of the nutrient cycling and carbon  processing in natural environments occurs through the activity of extracellular  enzymes released by ...

Modifying the Bank Erosion Hazard Index (BEHI) Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

Modifying the Bank Erosion Hazard Index BEHI Protocol for Rapid Assessment of Streambank Erosion in Northeastern Ohio

Kuzeydoğu Ohio Streambank Erozyon Hızlı Değerlendirme Banka Erozyon Tehlike İndeksi (Behi) Protokolü değiştirme

Understanding the source of pollution in a stream is vital to preserving, restoring, and maintaining the stream&#8217;s function and habitat it provides. ...

The Use of an Automated System (GreenFeed) to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

The Use of an Automated System GreenFeed to Monitor Enteric Methane and Carbon Dioxide Emissions from Ruminant Animals

Bir Otomatik Sistem (GreenFeed) Kullanımı Ruminant Animals Enterik Metan ve Karbon Dioksit Emisyonları izlemek için

Ruminant animals (domesticated or wild) emit methane (CH4) through enteric fermentation in their digestive tract and from decomposition of manure during ...

Alternative Method of Removing Otoliths from Sturgeon

Sturgeon gelen otolitler Çıkarma Alternatif Yöntem

Extracting the otoliths (ear bones) from fish that have very thick skulls can be difficult and very time consuming. The common practice of making a ...

Field Experiments of Pollination Ecology: The Case of Lycoris sanguinea var. sanguinea

Field Experiments of Pollination Ecology: The Case of Lycoris sanguinea var. sanguinea

Tozlaşma Ekoloji Saha Deneyleri: Örneği<em&gt; Lycoris sanguinea</em&gt; Var.<em&gt; sanguinea</em

Plant-pollinator interactions have been studied for approximately one hundred years. During that time, many field methods have been developed to clarify ...

Using Pharmacological Manipulation and High-precision Radio Telemetry to Study the Spatial Cognition in Free-ranging Animals

Serbest değişen Hayvanlarda Mekansal Biliş Eğitim için Farmakolojik Manipülasyon ve Yüksek hassasiyet Radyo Telemetri kullanma

An animal&#39;s ability to perceive and learn about its environment plays a key role in many behavioral processes, including navigation, migration, ...

Development of New Methods for Quantifying Fish Density Using Underwater Stereo-video Tools

Sualtı Stereo video araçları kullanarak balık yoğunluğu miktarının için yeni yöntemler geliştirilmesi

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and ...

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

Yetiştirme ve araştırma çalışmaları için Eristalis tenax Hoverflies uzun vadeli bakım

With an estimated 6000 species worldwide, hoverflies are ecologically important as alternative pollinators to domesticated honeybees. However, they are ...

Experimental Protocol for Examining Behavioral Response Profiles in Larval Fish: Application to the Neuro-stimulant Caffeine

Davranışsal yanıt profilleri larva balık incelenmesi için deneysel protokol: nöro-uyarıcı kafein uygulamaya

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and ...

Combining Eye-tracking Data with an Analysis of Video Content from Free-viewing a Video of a Walk in an Urban Park Environment

Göz izleme verilerini ücretsiz video Içeriğinin analiziyle birleştirme-kentsel park ortamında bir yürüyüşe video görüntüleme

As individuals increasingly live in cities, methods to study their everyday movements and the data that can be collected becomes important and valuable. ...