Name: automated image-based quantification of neutrophil extracellular traps using netquant
Uploaded: 2019-11-27T12:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Automated Image-Based Quantification of Neutrophil Extracellular Traps Using NETQUANT at JoVE.com

Çalışma Crafoord Vakfı (TM ve PN), İsveç Hükümeti Araştırma hibe (PN, TM), İsveç araştırma konseyi (PN) ve Groschinsky Vakfı (TM, PN) tarafından finanse edilmiştir.

Lund Üniversitesi etik komitesi Helsinki Bildirgesi (2013/728) uyarınca sağlıklı gönüllülerden venöz kan toplanmasını onayladı. Tüm gönüllüler yazılı bilgilendirilmiş onaylarını sundular.
1. Yoğunluk-Gradyan Santrifüj Kullanarak Periferik Kan Nötrofillerin İzolasyon
<ol><li>Heparin içeren tüplerde insan venöz kan toplamak ve tüpler oda sıcaklığına ulaşmak için izin. Not: Yeterince büyük hücreli bir pelet elde etmek için sağlıklı bir donörden en a...

<ol>
	<li>Nauseef, W. M., Borregaard, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neutrophils+at+work.">Neutrophils at work.</a> Nature Immunology. 15 (7), 602-611 (2014).</li><li>Borregaard, N., Cowland, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Granules+of+the+human+neutrophilic+polymorphonuclear+leukocyte.">Granules of the human neutrophilic polymorphonuclear leukocyte.</a> Blood. 89 (10), 3503-3521 (1997).</li><li>Nordenfelt, P., Tapper, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phagosome+dynamics+during+phagocytosis+by+neutrophils.">Phagosome dynamics during phagocytosis by neutrophils.</a> Journal of Leukocyte Biology. 90 (2), 271-284 (2011).</li><li>Brinkmann, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neutrophil+extracellular+traps+kill+bacteria.">Neutrophil extracellular traps kill bacteria.</a> Science. 303 (5663), 1532-1535 (2004).</li><li>Sorensen, O. E., Borregaard, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neutrophil+extracellular+traps+-+the+dark+side+of+neutrophils.">Neutrophil extracellular traps - the dark side of neutrophils.</a> Journal of Clinical Investigation. 126 (5), 1612-1620 (2016).</li><li>Yipp, B. G., Kubes, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=NETosis:+how+vital+is+it?.">NETosis: how vital is it?.</a> Blood. 122 (16), 2784-2794 (2013).</li><li>Jorch, S. K., Kubes, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+emerging+role+for+neutrophil+extracellular+traps+in+noninfectious+disease.">An emerging role for neutrophil extracellular traps in noninfectious disease.</a> Nature Medicine. 23 (3), 279-287 (2017).</li><li>Fuchs, T. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Novel+cell+death+program+leads+to+neutrophil+extracellular+traps.">Novel cell death program leads to neutrophil extracellular traps.</a> J Cell Biol. 176 (2), 231-241 (2007).</li><li>Mohanty, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+novel+mechanism+for+NETosis+provides+antimicrobial+defense+at+the+oral+mucosa.">A novel mechanism for NETosis provides antimicrobial defense at the oral mucosa.</a> Blood. 126 (18), 2128-2137 (2015).</li><li>Hakkim, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Activation+of+the+Raf-MEK-ERK+pathway+is+required+for+neutrophil+extracellular+trap+formation.">Activation of the Raf-MEK-ERK pathway is required for neutrophil extracellular trap formation.</a> Nature Chemical Biology. 7 (2), 75-77 (2011).</li><li>Brinkmann, V., Goosmann, C., Kuhn, L. I., Zychlinsky, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Automatic+quantification+of+in+vitro+NET+formation.">Automatic quantification of in vitro NET formation.</a> Frontiers in Immunology. 3, 413 (2012).</li><li>Coelho, L. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Automatic+determination+of+NET+(neutrophil+extracellular+traps)+coverage+in+fluorescent+microscopy+images.">Automatic determination of NET (neutrophil extracellular traps) coverage in fluorescent microscopy images.</a> Bioinformatics. 31 (14), 2364-2370 (2015).</li><li>Mohanty, T., Sorensen, O. E., Nordenfelt, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=NETQUANT:+Automated+Quantification+of+Neutrophil+Extracellular+Traps.">NETQUANT: Automated Quantification of Neutrophil Extracellular Traps.</a> Frontiers in Immunology. 8, 1999 (2017).</li><li>Kaplan, M. J., Radic, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neutrophil+extracellular+traps:+double-edged+swords+of+innate+immunity.">Neutrophil extracellular traps: double-edged swords of innate immunity.</a> Journal of Immunology. 189 (6), 2689-2695 (2012).</li><li>Cedervall, J., Olsson, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immunity+Gone+Astray+-+NETs+in+Cancer.">Immunity Gone Astray - NETs in Cancer.</a> Trends in Cancer. 2 (11), 633-634 (2016).</li><li>Ginley, B. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Computational+detection+and+quantification+of+human+and+mouse+neutrophil+extracellular+traps+in+flow+cytometry+and+confocal+microscopy.">Computational detection and quantification of human and mouse neutrophil extracellular traps in flow cytometry and confocal microscopy.</a> Scientific Reports. 7 (1), 17755 (2017).</li></ol>

NET oluşumu çeşitli nötrofil armamentarium için nispeten yeni bir ektir4 ve araştırma alanları geniş bir yelpazede NETTs inmasını incelemek için ilgi belirgin bir dalgalanma olmuştur5,7,14,15. İmmünfluoresan mikroskopi ve sonraki görüntü tabanlı nicelik kullanılarak görüntülerin elde edilmesi, NET'leri ölçmek için yaygın olarak kullanılan bir ...

Nötrofiller mikrobiyal patojenler1geniş bir yelpazede karşı doğuştan gelen konak savunma yanıtları önemli aracılar vardır. Onlar antimikrobiyal proteinler in geniş bir yelpazede içeren granülleri serbest bırakarak antimikrobiyal fonksiyonlarını yürütmek2, reaktif oksijen türleri üreten (ROS) ve hipoklorit1, ve fagositoz yoluyla3. Buna ek olarak, Brinkmann ve ark. 4 nötrofil ekstrasellüler tuzakları (NETs) tarafından nötrofiller tuzak ve işgalci patojenleri ortadan kaldırmak yeni bir mekanizma olarak tanımlanır. Onların keşfi biraz üzerinde bir on yıl önce4,NETs bulaşıcı5geniş bir yelpazede karıştığı edilmiştir,6 ve bulaşıcı olmayan7 morbiditeler. NET oluşumu aktif bir süreçtir ve granül türetilmiş antimikrobiyal proteinler ile kaplanmış kromatin DNA ekstrüzyon sonuçları8. NET oluşumu ile ilişkili hücresel ve nükleer morfolojiönemli değişikliklerden bazıları nükleer morfoloji kaybı, kromatin dekonsökonsilasyon, çekirdeğin sitoplazma granül proteinlerinin seferberliği ve nükleer ve hücresel çapı bir artış8,9.
Hücreden biraz daha büyük veya tek bir nötrofilden birkaç kat daha büyük yapılar olarak ortaya çıkabilecek web benzeri NET'ler, NETosis5,10'un göstergeleri olarak kabul edilir. Floresan mikroskobu kullanılarak, NET'ler DNA'yı 4',6-diamidino-2-fenilindole (DAPI) gibi floresan sonda ile probenerek ve nötrofil elastaz gibi NET'e bağlı proteinlere karşı immünfloresans boyama ile tespit edilebilir. DNA ve NET'e bağlı proteinler için örtüşen boyama alanlarının ölçülmesi, bir görüntüdeki NET'lerin altındaki toplam alanı belirler11.
NETs11,12floresan görüntü tabanlı nicelik gerçekleştirmek için görüntü analizi seçenekleri bir dizi kullanılabilir. Ancak bu yazılım seçenekleri, kullanıcı dostu ve/veya tam otomatik olmamak gibi sınırlamalar sunar. Bu makalede, tarafsız tam otomatik immünoreskence mikroskopi görüntü tabanlı NET nicelik gerçekleştirebilen serbestçe kullanılabilen bir uygulama olan NETQUANT13'ünişleyişini gösteriyoruz. Uygulama kullanıcı dostu bir grafik arabirimine (GUI) sahiptir ve tek hücreli analiz gerçekleştirebilir. Yazılım, DNA-NET'e bağlı belirteç, çekirdeğin kromatin dekonsiyomu ile ilişkili deformasyon ve DNA:NET'e bağlı protein oranındaki artışı alandaki morfolojik değişiklikleri algılayarak görüntüdeki NETozu ölçer. Birlikte ele alındığında, birden çok NET tanımı ölçütleri tarafsız bir şekilde çeşitli veri kümeleri arasında sıkı NET nicellik sağlar.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>BD Vacutainer Heparinised plastic tubes</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>367885</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Lymphoprep</td>
			<td>Axis-Shield</td>
			<td>114547</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RPMI-1640 with L-Glutamine</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>11835-030</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>50mL conical flasks</td>
			<td>Sarstedt</td>
			<td>62.547.004</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>15mL conical flasks</td>
			<td>Sarstedt</td>
			<td>62.554.002</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>12-well Tissue culture plates</td>
			<td>Falcon</td>
			<td>10626491</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>#1 Coverslips 10mm</td>
			<td>Menzel Glaser</td>
			<td>CS10100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glass slides</td>
			<td>Menzel Glaser</td>
			<td>631-0098</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Primary anti-human elastase</td>
			<td>DAKO</td>
			<td>DAKO rabbit 1373, contract immunization</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Secondary fluorophore conjugated goat anti-rabbit</td>
			<td>Life technologies</td>
			<td>A-11072, A-11070</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PROLONG-Gold Antifade reagent with DAPI</td>
			<td>Life technologies</td>
			<td>P36930</td>
			<td>Mounting medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Goat serum</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>G9023</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>79346</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Paraformaldehyde</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>158127</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triton X-100</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>T8787</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nikon Ti-E Epifluorescence microscope</td>
			<td>Nikon</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CCD camera</td>
			<td>Andor Zyla</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plan Apochromat 20x, 40x objectives</td>
			<td>Nikon</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Windows 10</td>
			<td>Microsoft</td>
			<td></td>
			<td>Operating system</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>macOS Sierra 10.12</td>
			<td>Apple</td>
			<td></td>
			<td>Operating system</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MATLAB</td>
			<td>Mathworks</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

automated image-based quantification of neutrophil extracellular traps using netquant

Nötrofil ekstrasellüler tuzakları (NETs) DNA ve granül türemiş antimikrobiyal proteinlerden oluşan web benzeri antimikrobiyal yapılardır. İmmünofloresan mikroskobu ve görüntü tabanlı nicelikselleştirme yöntemleri nötrofil ekstrasellüler tuzak oluşumunu hesaplamak için önemli araçlar olmaya devam etmektedir. Ancak, şu anda NETs ölçmek için kullanılabilir immünoresans tabanlı yöntemler için önemli sınırlamalar vardır. Görüntü tabanlı NET sayısallaştırmanın manuel yöntemleri genellikle özneldir, hataya yatkındır ve kullanıcılar, özellikle de deneyimsiz kullanıcılar için sıkıcıdır. Ayrıca, sayısallaştırma için mevcut yazılım seçenekleri ya yarı otomatik ya da çalışmadan önce eğitim gerektirir. Burada NETQUANT adı verilen NET oluşumunu değerlendirmek için otomatik immünoresaneses esaslı görüntü ölçme yönteminin uygulanmasını gösteriyoruz. Yazılımın kullanımı kolaydır ve kullanıcı dostu bir grafik kullanıcı arabirimine (GUI) sahiptir. Net oluşumunu tanımlamak için yüzey alanı ve DNA:NET marker protein oranı ve nükleer deformasyon gibi biyolojik olarak ilgili parametreleri dikkate alır. Ayrıca, bu araç serbestçe kullanılabilir bir uygulama olarak inşa edilmiştir ve tek hücreli çözünürlükte niceleme ve analiz sağlar.

5 x 105 nötrofil/mL 12 kuyulu bir plakaya yerleştirilen ve 20 nM PMA ile uyarılmış veya 150 dakika boyunca uyarılmamış olarak bırakılan kapaklara tohumlandı. Örnekler daha sonra birincil tavşan anti-insan nötrofil elastaz antikorları, ikincil keçi anti-tavşan florofor konjuge antikorlar ve DAPI kullanılarak lekelenmiştir - DNA lekeleri bir floresan etiketli boya (Ayrıntılar için Malzemeler Tablosu bakınız). Daha sonra epifloresan mikrosk...

Watch this Scientific Journal Video about Automated Image-Based Quantification of Neutrophil Extracellular Traps Using NETQUANT at JoVE.com

Automated Image-Based Quantification of Neutrophil Extracellular Traps Using NETQUANT

Burada, nötrofil ekstrasellüler tuzakları (NETTs) ve işletim NETQUANT, immünororesans görüntüleri NTs quantification için tam otomatik bir yazılım seçeneği oluşturmak için bir protokol salıyoruz.

NETQUANT Kullanarak Nötrofil Ekstrasellüler Tuzakların Otomatik Görüntü Tabanlı Niceliği

Neutrophil extracellular traps (NETs) are web-like antimicrobial structures consisting of DNA and granule derived antimicrobial proteins. ...

Burada NETS ve immünofloresan görüntüleri ölçmek için tam otomatik bir yaklaşım olan NETQUANT'ı sıyoruz. Bu, araştırmacıların birden çok kullanıcı ve koşullar tarafından oluşturulan verilerden karşılaştırılabilir görüntü analizi yapmalarında yardımcı olacaktır. Bu tekniğin avantajları kullanım kolaylığı, tek hücreli veri analizi, NET oluşumunu değerlendirmek için birden fazla kriter ve birden fazla görüntünün tarafsız analizidir.Analiz yazılımını yükleyin ve açın. Zenodo GitHub arşivinde veya Nordonfelt Lab web sitesinde güncel bir sürüm bulunabilir. Kurulum sekmesinde, kaynak menüsündeki yol al seçeneğini tıklatarak çözümleme için bir kaynak klasör seçin.Çözümlenecek görüntü dizilerini içeren klasörü seçin. Yine, hedef menüdeki yol al seçeneğini tıklatın ve görüntü çözümlemesi sonrasında verileri kaydetmek için hedef klasörü seçin. Daha sonra, ayrı kanal görüntüleri kullanırken, KANAL klasörlerini DNA kanalının nükleer DNA lekesi ile karşılık gelecek şekilde adlandırın ve NET kanalı görüntülerdeki nötrofil elastaz lekesini tasvir eder.Ayrıca, denetim görüntü dosyalarını içeren klasörü denetim olarak adlandırın. Ardından, resim bilgilerini yükle düğmesini tıklatın ve görüntü meta verilerini yazılıma yükleyin. Ardından kanal siparişi alt menüsünde, görüntülerde yer alan doğru kanal sırasını seçin.Bu, kazara eşleşmeleri önlemeye yardımcı olur. Şimdi ham verilerden birincil görüntü özellikleri elde etmek ve görüntüleri dönüştürmek için veri hazırla düğmesine tıklayın. Dönüştürülen görüntüler daha sonra örnek türleri alt menüsünde görünür.Örnek türü menüsüne tıklayın, alt menüden bir resim seçin ve sırasıyla DNA ve Nötrofil Ekstrasellüler Kapanı veya NET kanalına bölünmüş görüntüleri görüntülemek için görüntü verilerine tıklayın. Hücreleri kendi kanallarına segmente etmek için segmentasyon yöntemi sekmesini seçin ve hem DNA hem de NET kanalları için yöntem alt menüsünde bir yöntem seçin. Varsayılan segmentasyon yöntemi uyarlamalı olarak ayarlanır ve önerilen ayardır.Diğer seçenekler küresel kenar ve chanverse dahil olmak üzere yazılım mevcuttur. Yakın yere yerleştirilen hücreler veya NT'ler arasında ayrım yapmaya yardımcı olmak için bir havza seçeneği de eklenmiştir. Ayrıca segmentasyon sekmesinde, segment denetimi örnekleri seçeneğini tıklatın.Ardından örnek tür alt menüsünden PMA'yı seçin ve veri kümesinde yer alan tüm görüntülerin bölümletilmeye başlamak için toplu iş seçeneğini tıklayın. Ardından, örnek türü menüsündeki görüntüleri seçin ve segmentasyon sonrası oluşturulan DNA ve NET maskeleri için ikili görüntü maskelerini görselleştirmek ve doğrulamak için görüntü görüntü veri düğmesini tıklatın. Şimdi, analiz sekmesinde, denetim örneklerini analiz etmek için eşik belirleme düğmesini tıklatın.Daha sonra, sağ tarafta, örnek türünü PMA olarak değiştirin ve uyarılmış örneklerin analizini tamamlamak için hücre özelliklerini al düğmesini tıklatın. Ardından, örnek türü alt menüsünden bir resim seçin ve bindirmeyi ve görüntüdeki hücre sayısını ve NET oluşturan hücreleri görüntülemek için görüntü veri düğmesini tıklatın. Örnek türü alt menüsünden örneği seçerek başlayın.Tek tek görüntüler analiz için örnek türü alt menüsünden seçilebilir veya tüm toplu görüntü toplu seçeneğini seçerek analiz edilebilir. Seçildikten sonra, analizi tamamlamak için analiz NETs düğmesine tıklayın. Belirli bir örnek için en iyi sonuçları elde etmek için NET ölçütlerini el ile ayarlayın.Tanımlama kalitesini değerlendirmek için tanımlanan NET'leri orijinal görüntülerle karşılaştırın. Bu adım tamamlandıktan sonra, NET ölçütleri veri kümesindeki tüm görüntülere uygulanabilir. NET kriterlerinde yapılan tüm değişiklikler aynı anda tüm kontrol örneklerine de uygulanır.Görüntü sayısının, görüntü başına hücre sayısının ve görüntü başına NET'lerin yüzdesinin görüntülendiği hücre veri alt menüsündeki veri özetini inceleyin. Sonuç çıktılarını seçmek ve görüntülemek için çıktı sekmesini girin. Çıktının biçimini seçerek ve çıktı sonuçları düğmesine tıklayarak kontrol ve PMA tarafından işlenmiş örneklerin analizinden elde edilen çeşitli veri çıktılarını keşfedin ve karşılaştırın.Ardından, tek hücreli verileri keşfetmek için sonuç veri tablosu CSV dosyasını başlatın ve örneklerdeki NET alan dağılımını ve DNA'yı NET oranına görselleştirmek için sonuçlar PDF dosyalarını tıklayın. Kırmızı çizgi grafiklerdeki eşik değerini gösterir. Son olarak, NET alanını DNA'nın şekline göre belirlemek için sonuçlar bivariate dağıtım dosyasına tıklayın.Burada, kontrol nötrofillerinin 15 görüntüsü ve PMA uyarılmış nötrofillerin 15 görüntüsü 10 dakikanın altında analiz edildi. Toplam hücre sayısı sayıldı ve Nötrofil Ekstrasellüler Tuzaklı hücrelerin yüzdesi bu makalede açıklanan otomatik niceleme yöntemi kullanılarak belirlendi. Bu sonuçlar, PMA uyarılmış nötrofillerin kontrol örneklerinden daha geniş bir alana, nükleer deformasyonda artışa ve NET'e daha yüksek DNA oranına sahip olduğunu göstermektedir.Bir 3B grafikte birleştirildiğinde, PMA uyarılmış örnekler, kontrol örneklerinden daha sıkı gruplandırma alanlarını gösterme eğilimindedir. Yordamı denerken, iş akışı birden çok donör kullanılarak sınanmış olsa da, kullanıcının yazılım parametrelerine tek tek veri kümesine göre uygun şekilde karar vermesi önerilir.

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Neutrophil Extracellular Traps: How to Generate and Visualize Them

Nötrofil Ekstrasellüler Tuzaklar: Onları nasıl oluşturun ve görselleştirin için

Neutrophil granulocytes are the most abundant group of leukocytes in the peripheral blood. As professional phagocytes, they engulf bacteria and kill them ...

Simplified Human Neutrophil Extracellular Traps (NETs) Isolation and Handling

Simplified Human Neutrophil Extracellular Traps NETs Isolation and Handling

Basitleştirilmiş İnsan Nötrofil Ekstrasellüler Tuzaklar (NET) İzolasyon ve Taşıma

Neutrophil Extracellular Traps (NETs) have been recently identified as part of the neutrophil&#8217;s antimicrobial armamentarium. Apart from their role ...

Methods to Study Lipid Alterations in Neutrophils and the Subsequent Formation of Neutrophil Extracellular Traps

Yöntemler lipid Nötrofiller değişiklikler ve Nötrofil Ekstrasellüler Tuzaklar sonraki oluşumunu incelemek

Lipid analysis performed by high performance thin layer chromatography (HPTLC) is a relatively simple, cost-effective method of analyzing a broad range of ...

A Simple Fluorescence Assay for Quantification of Canine Neutrophil Extracellular Trap Release

Köpek Nötrofil Ekstrasellüler Trap Release Niceleme için Basit Floresan Testi

Neutrophil extracellular traps are networks of DNA, histones and neutrophil proteins released in response to infectious and inflammatory stimuli. Although ...

Visualizing Macrophage Extracellular Traps Using Confocal Microscopy

Makrofaj hücre dışı tuzaklar Confocal mikroskobu kullanılarak görüntülenmesi

A primary method used to define the presence of neutrophil extracellular traps (NETs) is confocal microscopy. We have modified established confocal ...

Identification of Neutrophil Extracellular Traps in Paraffin-Embedded Feline Arterial Thrombi using Immunofluorescence Microscopy

İmmünofluoresans Mikroskobu kullanılarak Parafin Gömülü Kedi Arteriyel Trombisinde Nötrofil Ekstrasellüler Tuzakların Belirlenmesi

Neutrophil extracellular traps (NETs), composed of cell-free DNA (cfDNA) and proteins like histones and neutrophil elastase (NE), are released by ...

Morphological and Compositional Analysis of Neutrophil Extracellular Traps Induced by Microbial and Chemical Stimuli

Mikrobiyal ve Kimyasal Uyaranlar Tarafından İndüklenen Nötrofil Hücre Dışı Tuzakların Morfolojik ve Bileşimsel Analizi

Neutrophils function as the first line of cellular defense in an innate immune response by employing diverse mechanisms, such as the formation of ...

Quantifying Myeloperoxidase-DNA and Neutrophil Elastase-DNA Complexes from Neutrophil Extracellular Traps by Using a Modified Sandwich ELISA

Nötrofil Hücre Dışı Tuzaklardan Miyeloperoksidaz-DNA ve Nötrofil Elastaz-DNA Komplekslerinin Modifiye Sandviç ELISA Kullanılarak Miktarının Belirlenmesi

Certain stimuli, such as microorganisms, cause neutrophils to release neutrophil extracellular traps (NETs), which are basically web-like structures ...

Staining and Imaging to Visualize Neutrophil Extracellular Traps

Immunofluorescence Imaging of Neutrophil Extracellular Traps in Human and Mouse Tissues

Neutrophil Extracellular Traps Imaging in Human and Mouse Tissues (Video) | JoVE

İnsan ve Fare Dokularında Nötrofil Hücre Dışı Tuzakların İmmünofloresan Görüntülemesi

Neutrophil extracellular traps (NETs) are released by neutrophils as a response to bacterial infection or traumatic tissue damage but also play a role in ...