Name: a new straightforward method for lipophilicity (logp) measurement using 19f nmr spectroscopy
Uploaded: 2019-01-30T13:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about A New Straightforward Method for Lipophilicity logP Measurement using 19F NMR Spectroscopy at JoVE.com

ويمول هذا البحث كجزء من EPSRC منح الجيش الشعبي/K016938/1 والجيش الشعبي/P019943/1 (ZW، طالبات) وتحكيم تحويل "القضية" EPSRC/استرا زينيكا (بفج). جامعة ساوثهامبتون هو عن شكره لدعم إضافية. EPSRC كذلك شكر منحة قدرة أساسية الجيش الشعبي/K039466/1.

1-تقسيم
<ol><li>إضافة 4,4,4-تريفلوروبوتان-1-ol (مجمع العاشر، كاليفورنيا. 6.0 مغ) و 2,2,2-تريفلوروثانول (مرجع مجمع، كاليفورنيا. 3.0 مغ) إلى 10 مل على شكل كمثرى قارورة، تذوب في تفريق الأوكتانول- n([هبلك] الصف، كاليفورنيا. 2 مل)، وإضافة الماء ([هبلك] الصف، كاليفورنيا. 2 مل). ملاحظة: يتم تشغيل هذه التجربة في ?...

<ol>
	<li>Arnott, J. A., Planey, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+influence+of+lipophilicity+in+drug+discovery+and+design.">The influence of lipophilicity in drug discovery and design.</a> Expert Opinion on Drug Discovery. 7 (10), 863-875 (2012).</li><li>Lipinski, C. A., Lombardo, F., Dominy, B. W., Feeney, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Experimental+and+computational+approaches+to+estimate+solubility+and+permeability+in+drug+discovery+and+development+settings.">Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings.</a> Advanced Drug Delivery Reviews. 23 (1), 3-25 (1997).</li><li>Leeson, P. D., Springthorpe, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+influence+of+drug-like+concepts+on+decision-making+in+medicinal+chemistry.">The influence of drug-like concepts on decision-making in medicinal chemistry.</a> Nature Reviews Drug Discovery. 6, 881 (2007).</li><li>Perola, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+Analysis+of+the+Binding+Efficiencies+of+Drugs+and+Their+Leads+in+Successful+Drug+Discovery+Programs.">An Analysis of the Binding Efficiencies of Drugs and Their Leads in Successful Drug Discovery Programs.</a> Journal of Medicinal Chemistry. 53 (7), 2986-2997 (2010).</li><li>Tarcsay, A., Nyiri, K., Keseru, G. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Impact+of+Lipophilic+Efficiency+on+Compound+Quality.">Impact of Lipophilic Efficiency on Compound Quality.</a> Journal of Medicinal Chemistry. 55 (3), 1252-1260 (2012).</li><li>Tarcsay, &. #. 1. 9. 3. ;., Keser&#369;, G. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Contributions+of+Molecular+Properties+to+Drug+Promiscuity.">Contributions of Molecular Properties to Drug Promiscuity.</a> Journal of Medicinal Chemistry. 56 (5), 1789-1795 (2013).</li><li>. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> OECD Guidelines for Testing of Chemicals. , (1992).</li><li>Tsang, S. C., Yu, C. H., Gao, X., Tam, K. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preparation+of+nanomagnetic+absorbent+for+partition+coefficient+measurement.">Preparation of nanomagnetic absorbent for partition coefficient measurement.</a> International Journal of Pharmaceutics. 327 (1), 139-144 (2006).</li><li>Andersson, J. T., Schr&#228;der, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Method+for+Measuring+1-Octanol&#8722;Water+Partition+Coefficients.">A Method for Measuring 1-Octanol&#8722;Water Partition Coefficients.</a> Analytical Chemistry. 71 (16), 3610-3614 (1999).</li><li>Danielsson, L. -. G., Yu-Hui, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanized+determination+of+n-octanol/water+partition+constants+using+liquid-liquid+segmented+flow+extraction.">Mechanized determination of n-octanol/water partition constants using liquid-liquid segmented flow extraction.</a> Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. 12 (12), 1475-1481 (1994).</li><li>Scherrer, R. A., Donovan, S. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Automated+Potentiometric+Titrations+in+KCl/Water-Saturated+Octanol:+Method+for+Quantifying+Factors+Influencing+Ion-Pair+Partitioning.">Automated Potentiometric Titrations in KCl/Water-Saturated Octanol: Method for Quantifying Factors Influencing Ion-Pair Partitioning.</a> Analytical Chemistry. 81 (7), 2768-2778 (2009).</li><li>Poole, S. K., Poole, C. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Separation+methods+for+estimating+octanol-water+partition+coefficients.">Separation methods for estimating octanol-water partition coefficients.</a> Journal of Chromatography B. 797 (1), 3-19 (2003).</li><li>Ishihama, Y., Oda, Y., Uchikawa, K., Asakawa, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+Solute+Hydrophobicity+by+Microemulsion+Electrokinetic+Chromatography.">Evaluation of Solute Hydrophobicity by Microemulsion Electrokinetic Chromatography.</a> Analytical Chemistry. 67 (9), 1588-1595 (1995).</li><li>Jorabchi, K., Smith, L. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Single+Droplet+Separations+and+Surface+Partition+Coefficient+Measurements+Using+Laser+Ablation+Mass+Spectrometry.">Single Droplet Separations and Surface Partition Coefficient Measurements Using Laser Ablation Mass Spectrometry.</a> Analytical Chemistry. 81 (23), 9682-9688 (2009).</li><li>Kaliszan, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+structure-retention+relationships.">Quantitative structure-retention relationships.</a> Analytical Chemistry. 64 (11), 619A-631A (1992).</li><li>Mo, H., Balko, K. M., Colby, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+practical+deuterium-free+NMR+method+for+the+rapid+determination+of+1-octanol/water+partition+coefficients+of+pharmaceutical+agents.">A practical deuterium-free NMR method for the rapid determination of 1-octanol/water partition coefficients of pharmaceutical agents.</a> Bioorganic &amp; Medicinal Chemistry Letters. 20 (22), 6712-6715 (2010).</li><li>St&#233;en, E. J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+a+simple+proton+nuclear+magnetic+resonance-based+procedure+to+estimate+the+approximate+distribution+coefficient+at+physiological+pH+(logD7.4):+Evaluation+and+comparison+to+existing+practices.">Development of a simple proton nuclear magnetic resonance-based procedure to estimate the approximate distribution coefficient at physiological pH (logD7.4): Evaluation and comparison to existing practices.</a> Bioorganic &amp; Medicinal Chemistry Letters. 27 (2), 319-322 (2017).</li><li>Soulsby, D., Chica, J. A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determination+of+partition+coefficients+using+1H+NMR+spectroscopy+and+time+domain+complete+reduction+to+amplitude-frequency+table+(CRAFT)+analysis.">Determination of partition coefficients using 1H NMR spectroscopy and time domain complete reduction to amplitude-frequency table (CRAFT) analysis.</a> Magnetic Resonance in Chemistry. 55 (8), 724-729 (2017).</li><li>Tetko, I. V., Poda, G. I., Ostermann, C., Mannhold, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Accurate+In+Silico+log+Predictions:+One+Can't+Embrace+the+Unembraceable.">Accurate In Silico log Predictions: One Can't Embrace the Unembraceable.</a> QSAR &amp; Combinatorial Science. 28 (8), 845-849 (2009).</li><li>Waring, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipophilicity+in+drug+discovery.">Lipophilicity in drug discovery.</a> Expert Opinion on Drug Discovery. 5 (3), 235-248 (2010).</li><li>Linclau, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Investigating+the+Influence+of+(Deoxy)fluorination+on+the+Lipophilicity+of+Non-UV-Active+Fluorinated+Alkanols+and+Carbohydrates+by+a+New+log+P+Determination+Method.">Investigating the Influence of (Deoxy)fluorination on the Lipophilicity of Non-UV-Active Fluorinated Alkanols and Carbohydrates by a New log P Determination Method.</a> Angewandte Chemie International Edition. 55 (2), 674-678 (2016).</li><li>Derome, A. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Modern NMR Techniques for Chemistry Research. , (1997).</li><li>Claridge, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> High-Resolution NMR Techniques in Organic Chemistry. , (1999).</li><li>Zhang, F. -. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+analysis+of+sitagliptin+using+the+19F-NMR+method:+a+universal+technique+for+fluorinated+compound+detection.">Quantitative analysis of sitagliptin using the 19F-NMR method: a universal technique for fluorinated compound detection.</a> Analyst. 140 (1), 280-286 (2015).</li><li>Muller, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=When+is+a+trifluoromethyl+group+more+lipophilic+than+a+methyl+group?+partition+coefficients+and+selected+chemical+shifts+of+aliphatic+alcohols+and+trifluoroalcohols.">When is a trifluoromethyl group more lipophilic than a methyl group? partition coefficients and selected chemical shifts of aliphatic alcohols and trifluoroalcohols.</a> Journal of Pharmaceutical Sciences. 75 (10), 987-991 (1986).</li><li>Hansch, C., Leo, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Substituent constants for correlation analysis in chemistry and biology. , (1979).</li><li>Dillingham, E. O., Mast, R. W., Bass, G. E., Autian, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Toxicity+of+Methyl-+and+Halogen-Substituted+Alcohols+in+Tissue+Culture+Relative+to+Structure-Activity+Models+and+Acute+Toxicity+in+Mice.">Toxicity of Methyl- and Halogen-Substituted Alcohols in Tissue Culture Relative to Structure-Activity Models and Acute Toxicity in Mice.</a> Journal of Pharmaceutical Sciences. 62 (1), 22-30 (1973).</li><li>Leo, A., Hansch, C., Elkins, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Partition+coefficients+and+their+uses.">Partition coefficients and their uses.</a> Chemical Reviews. 71 (6), 525-616 (1971).</li><li>Fujita, T., Iwasa, J., Hansch, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+New+Substituent+Constant,+&#960;,+Derived+from+Partition+Coefficients.">A New Substituent Constant, &#960;, Derived from Partition Coefficients.</a> Journal of the American Chemical Society. 86 (23), 5175-5180 (1964).</li><li>Zhong-Xing, J., Xin, L., Eun-Kee, J., Bruce, Y. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Symmetry-Guided+Design+and+Fluorous+Synthesis+of+a+Stable+and+Rapidly+Excreted+Imaging+Tracer+for+19F+MRI.">Symmetry-Guided Design and Fluorous Synthesis of a Stable and Rapidly Excreted Imaging Tracer for 19F MRI.</a> Angewandte Chemie International Edition. 48 (26), 4755-4758 (2009).</li></ol>

البروتوكول، المذكورة في هذه الورقة أسلوب مباشر لسجل القياسف المركبات المفلورة. هذا الأسلوب المنطبق على المركبات المفلورة بسجل قيمةP من-3 إلى 3. لمزيد من ماء (تسجيلف <-3) أو مركبات محبتين (سجلP > 3)، هذا الأسلوب لا يزال يمكن استخدامها ولكن سيتطلب وقتاً أطول بكثير من الوقت التج...

الانجذاب هو معلمة الفيزيائية رئيسية من جزيئات المخدرات التي تؤثر على خصائص المرشحين المخدرات في العديد من الجوانب، بما في ذلك القابلية للذوبان في المخدرات والتوافر البيولوجي وسمية1. يتم قياس الانجذاب اللوغاريتم (logP) نسبة تركيزات المركب بعد التقسيم بين n-تفريق الأوكتانول والماء. تم اقتراح نطاقات الانجذاب الأمثل استناداً إلى البيانات الإحصائية التي تدار شفويا العقاقير، التي ليبينسكي في "حكم 5 '' هو المثال الأكثر شهرة2،3. وفي الواقع، أظهرت السيطرة على أجسام أساسية لتحسين آفاق المرشحين المخدرات. زيادة تقارب ملزم المخدرات بأجسام مرتفعة قد حددت كواحدة من المشاكل الرئيسية في مشاريع اكتشاف المخدرات خلال العقود القليلة الماضية، مما أدى إلى استنزاف زيادة معدلات3. ولذلك، اقترح أن التنمية الناجحة المخدرات يرتبط مع إبقاء الانجذاب الجزيئية للمرشحين المخدرات داخل الحدود المثلى خلال3،عملية التحسين تقارب4. وفي هذا الصدد، ومفاهيم جديدة (مثل مؤشرات الكفاءة محبتين) قد أدخلت5،6.
ومن ثم أهمية كبيرة لقياس دقة الانجذاب أثناء عملية تطوير العقاقير. وإلى جانب ذلك، توافر أساليب واضحة لقياس أجسام في الطلب كالبحوث الأساسية تهدف إلى تحديد الحلول لتسجيل التعديلف . العديد من أساليب المتبعة حاليا موجوداً للانجذاب التصميم1. الأسلوب القياسي 'يهز-قارورة (SF)'7والاختلافات يعملون عادة لقياس قيم سجلف مباشرة، التي تعتمد على مطيافية الأشعة فوق البنفسجية بالنسبة للتقدير الكمي في معظم الحالات. والعيب الرئيسي لهذا الأسلوب الكلاسيكي سادس هو طبيعته كثيفة العمالة. وبالإضافة إلى ذلك، قد يحدث تكوين المستحلبات، خاصة بالنسبة لمركبات عالية محبتين8،9. ووضعت عدة طرق للالتفاف حول هذه القضايا، كما هو الحال باستخدام تحليل تدفق حقن وأنابيب الغسيل الكلوي، إلخ. 9،10. غير أن أيا من هذه الأساليب واضحة أو قابلة للتطبيق بسهولة في المختبرات غير المتخصصة.
وهناك أيضا العديد من الأساليب غير المباشرة المتاحة للاستخدام، مثل وسائل الإعلام-المستندة إلى قياس الطيف الكتلي14، RP-[هبلك]-تعتمد طرق الكروماتوغرافي، ، معايرة فرق الجهد11، أساليب الغرواني الكهربي12،13 إلخ. هذه هي الأساليب غير المباشرة، كما يتم الحصول على قيم سجلف بمنحنيات المعايرة. من بين هذه الأساليب، الأسلوب RP-[هبلك] قد استخدمت على نطاق واسع لأنها سهلة الاستخدام وتوفير الوقت. ومع ذلك، الدقة يعتمد على مجموعة التدريب المستخدمة لإنشاء منحنى المعايرة، والانجذاب يقدر يعتمد على قسم النظام يستخدم13،15.
وهناك عدد من الأساليب المستندة إلى "الرنين المغناطيسي ح" 1ذكرت في الأدبيات لتحديد الانجذاب. مو et al. وضع طريقة لقياس سجلف استخدام 1"ح الرنين المغناطيسي النووي" دون المذيبات الديوتيريوم. المياه وتفريق الأوكتانول، كقسم المذيبات، استخدمت كمراجع للتحديد الكمي لتركيز ذائبة في كل مرحلة16. كما أفادت هيرث وزملاء العمل نهج، الذي حدث التجربة القسم مباشرة في أنبوب الرنين المغناطيسي، حيث تم جمع البيانات الرنين المغناطيسي من الطبقة السفلي د2س مائي قبل وبعد الاستخراج مع 1-معامل فصل الأوكتانول، للحصول على توزيع معامل17. وبالإضافة إلى ذلك، تستغل سولسبي et al. 1"ح الرنين المغناطيسي النووي" كأداة تحليلية، تحديد السعة للإشارات باستخدام الحد الكامل للبرمجيات الجدول مطال التردد. نسبة الاتساع في الطبقات على حد سواء أدى إلى معامل قسم قياس18. هذه الأساليب بسيطة نسبيا لاستخدام ولكن غالباً ما تتطلب معايرة مستويات السلطة والبقول انتقائية أو الاستخدام على شكل نبضات التدرج ضمان قمع المذيبات المناسبة وإشارة انتقائية.
يمكن أيضا الحصول على قيمP (تسدف) سجل المحسوبة للمركبات. وتتوفر العديد من طرق الحساب والبرمجيات المتاحة تجارياً. هذه القيم تسدف تستخدم عادة في صناعة الأدوية عند تقييم عدد كبير من جزيئات المخدرات. ومع ذلك، أخطاء كبيرة من القيم تسدف لا غير المألوف19،20.
متطلبات النشاط الأشعة فوق البنفسجية لتحليل تركيز وإنشاء منحنيات المعايرة لحساب سجلف تعوق تقدم البحوث في هذا المجال. على وجه الخصوص، وهذا هو الحال بالنسبة للمركبات الاليفاتيه غير نشط الأشعة فوق البنفسجية. مويتيس الاليفاتيه المشبعة بالفلور أصبحت أكثر جاذبية لتصميم المخدرات في السنوات الأخيرة، وتأثيرها على أجسام عموما في المجمع موضوع بحث في لدينا مجموعة21. وباﻹضافة إلى ذلك، 19و نواة نشطة الرنين المغناطيسي حساسة للغاية، مما يجعل 19"و الرنين المغناطيسي النووي" أداة مفيدة لتحليل المركبات المفلورة. كما أن لديها مجموعة تحول كيميائية أكبر مقارنة بمن 1ه. ولذلك، يجدر تطوير أسلوب مباشر لسجلف تصميم المركبات المفلورة غير نشط الأشعة فوق البنفسجية بالتحليل الطيفي "الرنين المغناطيسي النووي و" 19. ومن ثم، يتمثل الهدف العام لهذا الأسلوب تحقيق الانجذاب مريحة تصميم المركبات المفلورة.
المبدأ الرئيسي لدينا 19أسلوب "الرنين المغناطيسي النووي و" المستندة إلى إضافة مرجع مفلورة مجمع في التجربة (الشكل 1) القسم21. يتم تقسيم X المركب ومرجع مجمع (ref) بين الماء و نون-الأوكتانول. بعد اكويليبراتينج، يؤخذ قاسمة من كل مرحلة في أنبوب الرنين المغناطيسي النووي، ويتم تشغيل تجارب "الرنين المغناطيسي النووي و" 19على عينات الرنين المغناطيسي النووي على حد سواء. كثافة قمم الفلور غير متناسب إلى مجمع التركيز (ج) وعدد ذرات الفلور (ن) من المركبات. بين مجمع س والمرجع، يمكن الحصول على نسب لا يتجزأ لكلتا المرحلتين. يعرف النسبة في طبقة تفريق الأوكتانول- nρoct، و ρعبد القدير لطبقة المياه (مكافئ. 1). نسبة القيم ρ يساوي نسبة معاملات القسم (ف) X المركب والمرجع (مكافئ. 2). وهذا يؤدي إلى المعادلة النهائية (مكافئ. 4) لسجل القياسف س المجمع. ولذلك، بغية تحديد السجل قيمةP X مركب غير معروف، فقط دمج نسب (ρ ρ وأكتوبر aq) في تلزم كل الطبقات التي تقاس ب 19"و الرنين المغناطيسي".

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>NMR (400 MHz) with Bruker 5 mm SEF probe</td>
			<td>Bruker</td>
			<td>n/a</td>
			<td>AVIIIHD400</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NMR (400 MHz) with Bruker 5 mm SMART probe</td>
			<td>Bruker</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DrySyn Snowstorm reactor</td>
			<td>Asynt</td>
			<td>ADS13-S</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>recirculating chiller</td>
			<td>Asynt</td>
			<td>n/a</td>
			<td>model:Grant-LTC2</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>magnetic stirplate</td>
			<td>Asynt</td>
			<td>ADS-HP-NT</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ACD/NMR processor software</td>
			<td>ACD/Labs</td>
			<td>n/a</td>
			<td>ACD/NMR processor academic edition or ACD/Spectrus processor 2015</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a new straightforward method for lipophilicity (logp) measurement using 19f nmr spectroscopy

الفلورة أصبحت أداة فعالة لتحسين الخصائص الفيزيائية للمركبات الحيوية النشطة. أحد التطبيقات للأخذ بالفلور أن تعدل الانجذاب للمجمع. في مجموعتنا، نحن مهتمون بدراسة أثر الفلورة على أجسام فلوروهيدرينس الاليفاتيه والكربوهيدرات المفلورة. هذه ليست نشطة الأشعة فوق البنفسجية، أسفر عن تحديد أجسام صعبة. نقدم هنا، طريقة واضحة لقياس أجسام المركبات المفلورة بواسطة مطيافية "الرنين المغناطيسي النووي و" 19. يتطلب هذا الأسلوب لا الأشعة فوق البنفسجية-النشاط. كتلة ذائبة دقيقة، حجم المذيبات والكوة أيضا غير مطلوبة لقياسها. باستخدام هذا الأسلوب، قمنا بقياس ليبوفيليسيتيس لعدد كبير من الكانولس المفلورة والكربوهيدرات.

مجموعتان من البيانات كما تظهر تجارب التحكم في الشكل 221. استخدام 2,2,2-تريفلوروثانول كمرجع المجمع، قيم سجلف تم الحصول على 2-فلوروثانول وبينتافلوروبروبانول 3,3,3,2,2-0.75 و +1.20، على التوالي (الشكل 2A). في وقت لاحق، عازمة أجسام 2-فلورو?...

Watch this Scientific Journal Video about A New Straightforward Method for Lipophilicity logP Measurement using 19F NMR Spectroscopy at JoVE.com

A New Straightforward Method for Lipophilicity logP Measurement using 19F NMR Spectroscopy

الرواية، وتباين واضحة الأسلوب يهز قارورة وضعت لقياس دقة أجسام المركبات المفلورة مطيافية "الرنين المغناطيسي النووي و" 19.

أسلوب مباشر جديد لقياس أجسام (logP) باستخدام 19"و مطيافية الرنين المغناطيسي النووي"

Fluorination has become an effective tool to optimize physicochemical properties of bioactive compounds. One of the applications of fluorine introduction ...

لقد طورنا طريقة مباشرة لقياس الدهون من المركبات المحمومة باستخدام الفلور NMR وهو acrid بما فيه الكفاية لإعادة إنتاج نحن قياس الاختلافات الصغيرة في lipophilicity. يمكن استخدام هذه الطريقة لدراسة تأثير تكوين المركبات العضوية بشكل منهجي على التغيرات المتغيرة للليبوفيليا ، والتي تهم الكيمياء الطبية العامة. وتشمل مزايا هذا الأسلوب أن المركبات لا يجب أن يكون رد الفعل، وأنها لا يجب أن تكون نقية تماما.ليست هناك حاجة لقياس الكتلة أو وحدات التخزين الدقيقة، وليست هناك حاجة لإنشاء منحنيات المعايرة. وينبغي اختيار مركب مرجعي مناسب، وينبغي تجنب التلوث المتبادل لـ aliquot أثناء مرحلة أخذ العينات. في هذا الفيديو سوف نظهر المهارات العملية المناسبة لأخذ العينات، وختم أنبوب NMR، والاستخدام الصحيح لبرامج NMR لمعالجة البيانات.إضافة 6.0 ملليغرام من مركب X و 3.0 ملليغرام من المجمع المرجعي إلى قارورة 10 ملليلتر على شكل كمثرى. قم بحل المركبات في ما يقرب من مليلترين من HPLC-الصف ن-أوكتانول، وإضافة ملليلتر من المياه HPLC الصف. ضع القارورة داخل وعاء تحكم عليه درجة الحرارة فوق لوحة تحريك، واربط بمبرد إعادة تدوير.يُحرّك الخليط ثنائي الطور عند درجة حرارة 25 درجة مئوية لمدة ساعتين، مع سرعة تحريك ية عند 600 لفة في الدقيقة. اكويتبرات الخليط في 25 درجة مئوية بين عشية وضحاها للسماح لفصل المرحلة الكاملة. إصلاح القارورة إلى موقف معوجة مع المشبك.اتخاذ aliquot من حوالي 0.70 إلى 0.85 ملليلتر من كل من المياه وطبقات ن أوكتانول باستخدام حقن بلاستيكية قابلة للتخلص من المليلتر مع الإبر طويلة. لاتخاذ aliquot الماء، رسم ما يقرب من 0.02 ملليلتر من الهواء في حقنة قبل وضع الإبرة في الخليط. أثناء تحريك الإبرة من خلال طبقة n-Octanol العليا في طبقة الماء ، ادفع الهواء بلطف لمنع حل ن أوكتانول من دخول الإبرة.إزالة إبرة طويلة من الخليط. تخلص من كمية صغيرة من عينة الماء، تاركة حوالي 0.6 ملليلتر من العينة متروكة في الحقنة. مسح الإبرة بعناية مع الأنسجة الجافة، وحقن ما يقرب من 0.5 ملليلتر من عينة المياه في أنبوب NMR نظيفة.أغلق أنبوب NMR بسرعة بغطاء. بالنسبة لعينة ن-أوكتانول، قم بإزالة الإبرة الطويلة من طبقة n-Octanol. تخلص من كمية صغيرة من عينة n-Octanol، تاركةً حوالي 0.6 ملليلتر من العينة متروكة في الحقنة.بعد مسح الإبرة بعناية مع الأنسجة الجافة، وحقن ما يقرب من 0.5 ملليلتر من عينة ن-أوكتانول في أنبوب NMR نظيفة. أغلق أنبوب NMR بسرعة بغطاء. فحص بصريا كل من عينات ن أوكتانول والمياه لأي تلوث من المرحلة الأخرى.إلى كل أنبوب NMR، إضافة 0.1 ملليلتر من مذيب NMR deuterated التي هي غير قابلة للامتزاج مع كل من ن-أوكتانول والماء، لتمكين قفل إشارة أثناء اقتناء NMR. بالنسبة للمركبات ذات نقاط الغليان المنخفضة، قم بختم أنابيب NMR باستخدام موقد النفخ، وبعد التبريد عكس الأنبوب للتحقق من وجود أي تسرب. عكس بعناية أنابيب NMR مختومة أو غير مختومة 20 مرة للحصول على حل متجانس لتجارب F19 NMR.تشغيل تجارب الفلور NMR المنفصلة لتحديد التحولات الكيميائية للمركب X والمركب المرجعي في كل من عينات N-Octanol و NMR المائية. استخدم إعدادات معلمة NMR القياسية كما هو موضح في بروتوكول النص. قياس وقت الاسترخاء spin-lattice، أو T1، لنوية الفلور التشخيصية باستخدام تسلسل استرداد عكس.قياس مستوى الوقت المناسب تأخير النبض من القيم T1 التي تم الحصول عليها من أجل التكامل الدقيق NMR الكمية. تشغيل طيف F19 H1 سريع لإعداد المعلمات الأولية. قياس عرض النبض 90 درجة، ثم تعيين المعلمة لتجربة قياس T1، وتشغيل تجربة قياس T1 باستخدام تسلسل الانتعاش عكس.تشغيل تجارب الفلور NMR المنفصلة من البروتون مرة أخرى مع إعدادات المعلمة المعدلة. تعيين D1 ومركز نقطة إزاحة التردد بين اثنين من إشارات الفلور التشخيصية بحيث يمكن أن تكون متحمس على حد سواء على حد سواء النوى. أيضا، تعيين عرض الطيفية كـ 300 PPM، وتعيين عدد العابرين إلى 64.اضبط هذه القيم إذا كانت نسبة الإشارة إلى الضوضاء أعلى. معالجة البيانات التي تم الحصول عليها باستخدام ACD NMR الإصدار الأكاديمي المعالج، أو غيرها من برامج معالجة NMR مخصصة. افتح ملف بيانات NMR.ثم افتح المجلد pdata متبوعاً المجلد 1. حذف الملف 1r. العودة إلى ملف البيانات NMR ثم اسحب ملف FID في إطار معالج NMR ACD.انقر فوق زر وظيفة النافذة، حدد أسي، تعيين قيمة توسيع الخط كاثنين، وانقر فوق الزر "موافق". الآن، انقر فوق زر ملء صفر، وزيادة عدد النقاط إلى أربع مرات من عدد النقاط الأصلي عن طريق النقر على زر صغير بجوار الرقم، وانقر على زر الموافقة. حدد الزر تحويل fourier.بعد ذلك، انقر فوق زر المرحلة، ثم انقر فوق زر الماوس مراحل. انقر مع الاستمرار على زر الماوس الأيسر ، والمضي قدما لتحريك الماوس إلى الأمام أو إلى الوراء حتى يتم على مراحل بشكل صحيح ذروة الرئيسية من الطيف. الآن، انقر مع الاستمرار على زر الماوس الأيمن وتحريك الماوس إلى الأمام أو إلى الوراء حتى يتم مرحلياً على مراحل أخرى من الطيف.ثم، قم بالنقر فوق زر الماوس على مراحل والتكبير في المنطقة الطيفية مع قمم الفلور. انقر فوق الضبط الدقيق، وقم بإجراء تصحيح المرحلة إذا لزم الأمر كما هو موضح سابقًا، ثم انقر فوق زر التجزئة. انقر فوق زر الأساس، ثم زر الخيارات.حدد متوسط الطيف للنماذج التلقائية، واضبط عدد النقاط لعرض نصف المربع إذا لزم الأمر. انقر فوق "حسنا"، والسيارات، ثم انقر فوق زر علامة. بعد ذلك، انقر فوق التكامل، ودمج قمم الفلور التشخيصية، وانقر على زر التجزئة.وأخيراً، الحصول على نسب التكامل من عينات N-Octanol و NMR المياه واستخدامها في معادلة حساب logP للحصول على قيمة logP من X.Using المركب، 2، 2-تريفلورويثانول كمركب مرجعي، تم الحصول على قيمة لوبيرب قدرها 0.75 لفلوروينول اثنين، ووجدت قيمة لوبيرب إيجابية 1.20 ل3، 3، 3، 2، 2-pentafluoropropanol. وبعد ذلك، تم تحديد ليبوفيليكية اثنين من الفلورويثانول مرة أخرى، ولكن مع 3، 3، 3، 2، 2-pentafluoropropanol كمرجع. وكانت قيمة اللوبير مقاسة 0.76، التي كان لها فرق قدره 0.01 وحدة لوبير في حالة مقارنتها بالقيمة المقيسة باستخدام 2-2-2-trifluoroethanol كمرجع.وبالمثل، بالنسبة لـ CIS-2، 3-difluro-1، 4-البيوتان-ديول، فإن الفرق في قيم logP المقاسة باستخدام اثنين من الفلورويثانول والأيزومر العابر صغير جداً. وهذا يدل على قابلية التكرار الجيدة، وأن اختيار مركب المرجع ليس له تأثير على قياس logP. يتم هنا عرض أمثلة مختارة إضافية.كل هذه المركبات غير UV النشطة الأليفاتية، من الكربوهيدرات المفلورة، إلى الفلوراهيدرين، يمكن قياسها بسهولة مع هذه الطريقة. يمكن استخدام طرق PROTO NMR الأخرى إذا لم يحتوي مركبك على الفلور ، وإذا كان المركب يحتوي على Chromofor فوق البنفسجية ، فيمكن إجراء قياس logP باستخدام القياس الكمي للأشعة فوق البنفسجية. تم قياس ليبوفيليكية مجموعة واسعة من الفلوريوهيددرينات النشطة غير UV والكربوهيدرات ديوكسيفلورونيد.واستخدمت مكتبة البيانات التي تم الحصول عليها لتحديد الاتجاهات والقواعد المتعلقة بتأثير الفلور الليفاتيك على صبغة الدهون. أوكتانول والماء تشكل الحد الأدنى من المخاطر السلامة. وبطبيعة الحال، ينبغي دائما أن تؤخذ في الاعتبار المخاطر التي يتم قياسها والمجمع المرجعي.

Research

JoVE Journal

Chemistry

A New Straightforward Method for Lipophilicity (logP) Measurement using 19F NMR Spectroscopy

Structure and Coordination Determination of Peptide-metal Complexes Using 1D and 2D 1H NMR

Structure and Coordination Determination of Peptide-metal Complexes Using 1D and 2D 1H NMR

Copper (I) binding by metallochaperone transport proteins prevents copper oxidation and release of the toxic ions that may participate in harmful redox ...

Dependence of Laser-induced Breakdown Spectroscopy Results on Pulse Energies and Timing Parameters Using Soil Simulants

اعتماد نتائج الليزر التي يسببها انهيار الطيفي على الطاقات نبض ومعلمات التوقيت عن طريق المحاكاة التربة

The  dependence of some LIBS detection capabilities on lower pulse energies (&lt;100  mJ) and timing parameters were examined using synthetic silicate ...

Facile Synthesis of Worm-like Micelles by Visible Light Mediated Dispersion Polymerization Using Photoredox Catalyst

توليف سطحي من المذيلات تشبه دودة من الضوء المرئي وساطة التشتت البلمرة عن طريق Photoredox محفز

Presented herein is a protocol for the facile synthesis of worm-like micelles by visible light mediated dispersion polymerization. This approach begins ...

Spin Saturation Transfer Difference NMR (SSTD NMR): A New Tool to Obtain Kinetic Parameters of Chemical Exchange Processes

Spin Saturation Transfer Difference NMR SSTD NMR: A New Tool to Obtain Kinetic Parameters of Chemical Exchange Processes

تدور نقل التشبع الفرق NMR (SSTD NMR): أداة جديدة الحصول الحركية معلمات من عمليات التبادل الكيميائي

This detailed protocol describes the new Spin Saturation Transfer Difference Nuclear Magnetic Resonance protocol (SSTD NMR), recently developed in our ...

A Straightforward Method for Glucosinolate Extraction and Analysis with High-pressure Liquid Chromatography (HPLC)

A Straightforward Method for Glucosinolate Extraction and Analysis with High-pressure Liquid Chromatography HPLC

ومن الطرق المباشرة لGlucosinolate استخراج وتحليل مع الضغط العالي اللوني السائل (HPLC)

Glucosinolates are a well-studied and highly diverse class of natural plant compounds. They play important roles in plant resistance, rapeseed oil ...

NMR Spectroscopy as a Robust Tool for the Rapid Evaluation of the Lipid Profile of Fish Oil Supplements

NMR الطيفي كأداة قوية لتقييم السريع من الدهون الملف من السمك ملاحق النفط

The western diet is poor in n-3 fatty acids, therefore the consumption of fish oil supplements is recommended to increase the intake of these essential ...

Fabrication and Testing of Photonic Thermometers

تصنيع واختبار الحرارة الضوئية

In recent years, a push for developing novel silicon photonic devices for telecommunications has generated a vast knowledge base that is now being ...

Application and Methodology of the Non-destructive 19F Time-domain NMR Technique to Measure the Content in Fluorine-containing Drug Products

Application and Methodology of the Non-destructive 19F Time-domain NMR Technique to Measure the Content in Fluorine-containing Drug Products

التطبيق ومنهجية تقنية الرنين المغناطيسي المجال الوقت غير مدمرة 19و لقياس المحتوى الموجود في المنتجات الدوائية التي تحتوي على الفلور

Here, we describe a protocol developed by our group that uses low-field fluorine-19 (19F) time-domain (TD) nuclear magnetic resonance (NMR) to measure the ...

Simultaneous Measurement of HDAC1 and HDAC6 Activity in HeLa Cells Using UHPLC-MS

قياس واحد من HDAC1 والنشاط HDAC6 في الحلة الخلايا باستخدام أوهبلك--مرض التصلب العصبي المتعدد

The search for new histone deacetylase (HDAC) inhibitors is of increasing interest in drug discovery. Isoform selectivity has been in the spotlight since ...

Electrochemical Impedance Spectroscopy as a Tool for Electrochemical Rate Constant Estimation

المعاوقة الكهروكيميائية التحليل الطيفي كأداة لتقدير معدل الكهروكيميائية المستمر

Electrochemical impedance spectroscopy (EIS) was used for advanced characterization of organic electroactive compounds along with cyclic voltammetry (CV). ...