Name: a new straightforward method for lipophilicity (logp) measurement using 19f nmr spectroscopy
Uploaded: 2019-01-30T13:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about A New Straightforward Method for Lipophilicity logP Measurement using 19F NMR Spectroscopy at JoVE.com

Bu araştırma parçası EPSRC hibe EP/K016938/1 ve EP/P019943/1 (ZW, Rotasyonlarla) ve bir EPSRC/AstraZeneca durumda dönüşüm Ödülü (BFJ) finanse edilmektedir. Southampton Üniversitesi ek destek için teşekkür etti. EPSRC daha fazla çekirdek yeteneği hibe EP/K039466/1 Teşekkür etti.

1. bölümleme
<ol><li>4,4,4-trifluorobutan-1-ol eklemek (X, ca. bileşik 6.0 mg) ve 2,2,2-trifluoroethanol (başvuru bileşik, ca. 3.0 mg) armut biçimli bir 10 mL şişe için n- octanol içinde erimesi (HPLC sınıf, ca. 2 mL) ve su ekleyin (HPLC sınıf, ca. 2 mL). Not: Bu deneme nüsha çalıştırılır. Su ve n- octanol bileşik çözünürlük kontrol edilmelidir. Bölüm için kullanılan bileşik miktarı dikkatle oversaturation bahçedeki herhangi bir katmanda önlemek için dikkate alı...

<ol>
	<li>Arnott, J. A., Planey, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+influence+of+lipophilicity+in+drug+discovery+and+design.">The influence of lipophilicity in drug discovery and design.</a> Expert Opinion on Drug Discovery. 7 (10), 863-875 (2012).</li><li>Lipinski, C. A., Lombardo, F., Dominy, B. W., Feeney, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Experimental+and+computational+approaches+to+estimate+solubility+and+permeability+in+drug+discovery+and+development+settings.">Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings.</a> Advanced Drug Delivery Reviews. 23 (1), 3-25 (1997).</li><li>Leeson, P. D., Springthorpe, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+influence+of+drug-like+concepts+on+decision-making+in+medicinal+chemistry.">The influence of drug-like concepts on decision-making in medicinal chemistry.</a> Nature Reviews Drug Discovery. 6, 881 (2007).</li><li>Perola, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+Analysis+of+the+Binding+Efficiencies+of+Drugs+and+Their+Leads+in+Successful+Drug+Discovery+Programs.">An Analysis of the Binding Efficiencies of Drugs and Their Leads in Successful Drug Discovery Programs.</a> Journal of Medicinal Chemistry. 53 (7), 2986-2997 (2010).</li><li>Tarcsay, A., Nyiri, K., Keseru, G. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Impact+of+Lipophilic+Efficiency+on+Compound+Quality.">Impact of Lipophilic Efficiency on Compound Quality.</a> Journal of Medicinal Chemistry. 55 (3), 1252-1260 (2012).</li><li>Tarcsay, &. #. 1. 9. 3. ;., Keser&#369;, G. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Contributions+of+Molecular+Properties+to+Drug+Promiscuity.">Contributions of Molecular Properties to Drug Promiscuity.</a> Journal of Medicinal Chemistry. 56 (5), 1789-1795 (2013).</li><li>. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> OECD Guidelines for Testing of Chemicals. , (1992).</li><li>Tsang, S. C., Yu, C. H., Gao, X., Tam, K. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preparation+of+nanomagnetic+absorbent+for+partition+coefficient+measurement.">Preparation of nanomagnetic absorbent for partition coefficient measurement.</a> International Journal of Pharmaceutics. 327 (1), 139-144 (2006).</li><li>Andersson, J. T., Schr&#228;der, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Method+for+Measuring+1-Octanol&#8722;Water+Partition+Coefficients.">A Method for Measuring 1-Octanol&#8722;Water Partition Coefficients.</a> Analytical Chemistry. 71 (16), 3610-3614 (1999).</li><li>Danielsson, L. -. G., Yu-Hui, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanized+determination+of+n-octanol/water+partition+constants+using+liquid-liquid+segmented+flow+extraction.">Mechanized determination of n-octanol/water partition constants using liquid-liquid segmented flow extraction.</a> Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. 12 (12), 1475-1481 (1994).</li><li>Scherrer, R. A., Donovan, S. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Automated+Potentiometric+Titrations+in+KCl/Water-Saturated+Octanol:+Method+for+Quantifying+Factors+Influencing+Ion-Pair+Partitioning.">Automated Potentiometric Titrations in KCl/Water-Saturated Octanol: Method for Quantifying Factors Influencing Ion-Pair Partitioning.</a> Analytical Chemistry. 81 (7), 2768-2778 (2009).</li><li>Poole, S. K., Poole, C. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Separation+methods+for+estimating+octanol-water+partition+coefficients.">Separation methods for estimating octanol-water partition coefficients.</a> Journal of Chromatography B. 797 (1), 3-19 (2003).</li><li>Ishihama, Y., Oda, Y., Uchikawa, K., Asakawa, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+Solute+Hydrophobicity+by+Microemulsion+Electrokinetic+Chromatography.">Evaluation of Solute Hydrophobicity by Microemulsion Electrokinetic Chromatography.</a> Analytical Chemistry. 67 (9), 1588-1595 (1995).</li><li>Jorabchi, K., Smith, L. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Single+Droplet+Separations+and+Surface+Partition+Coefficient+Measurements+Using+Laser+Ablation+Mass+Spectrometry.">Single Droplet Separations and Surface Partition Coefficient Measurements Using Laser Ablation Mass Spectrometry.</a> Analytical Chemistry. 81 (23), 9682-9688 (2009).</li><li>Kaliszan, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+structure-retention+relationships.">Quantitative structure-retention relationships.</a> Analytical Chemistry. 64 (11), 619A-631A (1992).</li><li>Mo, H., Balko, K. M., Colby, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+practical+deuterium-free+NMR+method+for+the+rapid+determination+of+1-octanol/water+partition+coefficients+of+pharmaceutical+agents.">A practical deuterium-free NMR method for the rapid determination of 1-octanol/water partition coefficients of pharmaceutical agents.</a> Bioorganic &amp; Medicinal Chemistry Letters. 20 (22), 6712-6715 (2010).</li><li>St&#233;en, E. J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+a+simple+proton+nuclear+magnetic+resonance-based+procedure+to+estimate+the+approximate+distribution+coefficient+at+physiological+pH+(logD7.4):+Evaluation+and+comparison+to+existing+practices.">Development of a simple proton nuclear magnetic resonance-based procedure to estimate the approximate distribution coefficient at physiological pH (logD7.4): Evaluation and comparison to existing practices.</a> Bioorganic &amp; Medicinal Chemistry Letters. 27 (2), 319-322 (2017).</li><li>Soulsby, D., Chica, J. A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determination+of+partition+coefficients+using+1H+NMR+spectroscopy+and+time+domain+complete+reduction+to+amplitude-frequency+table+(CRAFT)+analysis.">Determination of partition coefficients using 1H NMR spectroscopy and time domain complete reduction to amplitude-frequency table (CRAFT) analysis.</a> Magnetic Resonance in Chemistry. 55 (8), 724-729 (2017).</li><li>Tetko, I. V., Poda, G. I., Ostermann, C., Mannhold, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Accurate+In+Silico+log+Predictions:+One+Can't+Embrace+the+Unembraceable.">Accurate In Silico log Predictions: One Can't Embrace the Unembraceable.</a> QSAR &amp; Combinatorial Science. 28 (8), 845-849 (2009).</li><li>Waring, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipophilicity+in+drug+discovery.">Lipophilicity in drug discovery.</a> Expert Opinion on Drug Discovery. 5 (3), 235-248 (2010).</li><li>Linclau, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Investigating+the+Influence+of+(Deoxy)fluorination+on+the+Lipophilicity+of+Non-UV-Active+Fluorinated+Alkanols+and+Carbohydrates+by+a+New+log+P+Determination+Method.">Investigating the Influence of (Deoxy)fluorination on the Lipophilicity of Non-UV-Active Fluorinated Alkanols and Carbohydrates by a New log P Determination Method.</a> Angewandte Chemie International Edition. 55 (2), 674-678 (2016).</li><li>Derome, A. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Modern NMR Techniques for Chemistry Research. , (1997).</li><li>Claridge, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> High-Resolution NMR Techniques in Organic Chemistry. , (1999).</li><li>Zhang, F. -. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+analysis+of+sitagliptin+using+the+19F-NMR+method:+a+universal+technique+for+fluorinated+compound+detection.">Quantitative analysis of sitagliptin using the 19F-NMR method: a universal technique for fluorinated compound detection.</a> Analyst. 140 (1), 280-286 (2015).</li><li>Muller, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=When+is+a+trifluoromethyl+group+more+lipophilic+than+a+methyl+group?+partition+coefficients+and+selected+chemical+shifts+of+aliphatic+alcohols+and+trifluoroalcohols.">When is a trifluoromethyl group more lipophilic than a methyl group? partition coefficients and selected chemical shifts of aliphatic alcohols and trifluoroalcohols.</a> Journal of Pharmaceutical Sciences. 75 (10), 987-991 (1986).</li><li>Hansch, C., Leo, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Substituent constants for correlation analysis in chemistry and biology. , (1979).</li><li>Dillingham, E. O., Mast, R. W., Bass, G. E., Autian, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Toxicity+of+Methyl-+and+Halogen-Substituted+Alcohols+in+Tissue+Culture+Relative+to+Structure-Activity+Models+and+Acute+Toxicity+in+Mice.">Toxicity of Methyl- and Halogen-Substituted Alcohols in Tissue Culture Relative to Structure-Activity Models and Acute Toxicity in Mice.</a> Journal of Pharmaceutical Sciences. 62 (1), 22-30 (1973).</li><li>Leo, A., Hansch, C., Elkins, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Partition+coefficients+and+their+uses.">Partition coefficients and their uses.</a> Chemical Reviews. 71 (6), 525-616 (1971).</li><li>Fujita, T., Iwasa, J., Hansch, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+New+Substituent+Constant,+&#960;,+Derived+from+Partition+Coefficients.">A New Substituent Constant, &#960;, Derived from Partition Coefficients.</a> Journal of the American Chemical Society. 86 (23), 5175-5180 (1964).</li><li>Zhong-Xing, J., Xin, L., Eun-Kee, J., Bruce, Y. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Symmetry-Guided+Design+and+Fluorous+Synthesis+of+a+Stable+and+Rapidly+Excreted+Imaging+Tracer+for+19F+MRI.">Symmetry-Guided Design and Fluorous Synthesis of a Stable and Rapidly Excreted Imaging Tracer for 19F MRI.</a> Angewandte Chemie International Edition. 48 (26), 4755-4758 (2009).</li></ol>

Gazetede açıklanan günlükP ölçüm Fluor bileşikleri için basit bir yöntem protokolüdür. Bu yöntem için Fluor bileşikleri bir logP değeri ile 3 -3 üzerinden geçerlidir. Daha fazla bilgi için hidrofilik (P oturum < -3) ya da lipofilik bileşikler (günlükP > 3), bu yöntem hala kullanılabilir ama iyi bir sinyal / gürültü oranı elde etmek için genişletilmiş geçişler sayısını gerektiğinde daha fazla NMR deney zaman gerektirecektir. Bu nedenle, bu yöntem bi...

Lipophilicity ilaç adaylarının uyuşturucu çözünürlük, bioavailability ve toksisite1de dahil olmak üzere birçok yönden özelliklerini etkileyen bir anahtar fizikokimyasal ilaç molekülleri parametresidir. Lipophilicity n-octanol ve su bölümleme sonra bileşik konsantrasyonları oranını logaritması (logP) ölçülür. En iyi lipophilicity aralıkları önerdi 5 Lipinski's "kuralı '' en ünlü örnek2,3olduğu sözlü olarak yönetilen ilaçların istatistiki verilere dayalı. Gerçekten de, lipophilicity kontrol ilaç adaylarının umudu geliştirmek için temel olarak göstermiştir. Uyuşturucu bağlama benzeşimi tarafından yükseltilmiş lipophilicity artan uyuşturucu keşif projelerinde ana sorunlardan biri olarak son birkaç yılda yüksek yıpratma oranları3' e lider olduğu belirlendi. Bu nedenle, başarılı ilaç geliştirme sırasında benzeşimi en iyi duruma getirme işlemi3,4moleküler lipophilicity ilaç adaylarının en uygun sınırları içinde tutma ile ilişkili olduğunu sürülmüştür. Bu bağlamda, yeni kavramlar (örneğin lipofilik verimlilik endeksi) tanıttı5,6olmuştur.
Böylece doğru lipophilicity ilaç geliştirme süreci sırasında ölçmek için büyük önem taşımaktadır. Ayrıca, temel araştırma olarak talep lipophilicity ölçüm için basit yöntemleri durumu olduğunu amaçları için çözümler tanımlamak için oturumP modülasyon. Şu anda, çok sayıda kurulan yöntemleri lipophilicity belirlenmesi1için erişilebilir. Standart 'shake-şişesi (SF)' Yöntem7ve türevlerini yaygın olarak günlükP değerleri doğrudan, hangi miktar için UV-VIS spektroskopisi bağlıdır çoğu durumda ölçmek için istihdam edilmektedir. Bu klasik SF yöntemin olumsuz yanı, emek yoğun doğası olduğunu. Buna ek olarak, emülsiyonlar oluşumu, özellikle son derece lipofilik bileşikler8,9için oluşabilir. Akış enjeksiyon analiz, diyaliz boru, vbkullanarak gibi bu tür sorunları aşmak için çeşitli yöntemler geliştirilmiştir. 9,10. Ancak, bu yöntemlerden hiçbiri olmayan uzman laboratuvarlarda basit veya kolayca uygulanabilir.
Orada da birçok dolaylı Yöntem için kullanımı, potentiometric titrasyon11, elektroforetik Yöntem12,13, kromatografik yöntemler RP-HPLC tabanlı, kütle spektrometresi temelli yöntemleri14, gibi vb. GünlükP değerleri kalibrasyon eğrileri tarafından elde edilen gibi bunlar dolaylı yöntemlerdir. Çünkü Kullanıcı dostu ve zaman kazandıran bu yöntemler arasında RP-HPLC yöntemi yaygın olarak kullanılmıştır. Yine de, onun doğruluğunu kalibrasyon eğrisi kurmak için kullanılan eğitim kümesi üzerinde bağlıdır ve tahmini lipophilicity bölümü kullanılan sistem13tarihinde,15bağlıdır.
Lipophilicity tayini için literatürde bildirilen 1H NMR tabanlı yöntemleri vardır. Mo ve ark. 1H NMR deuterated çözücüler olmadan kullanarak günlükP ölçü için bir yöntem geliştirdi. Su ve octanol, Bölüm solvent olarak referans olarak her aşama16çözünen konsantrasyon miktar için kullanılmıştır. Herth ve iş arkadaşları tarafından bölümü deneme nerede NMR veri alt D2O sulu katmanın önce ve sonra dağıtım elde etmek için 1-octanol ile ekstraksiyon toplanmıştır doğrudan bir NMR tüp içinde oluştuğu bir yaklaşım da bildirdi katsayısı17. Ayrıca, Soulsby ve ark. 1H NMR sinyallerin genlik genlik frekanslı tablo yazılımı için tam azaltma kullanarak belirleme bir analiz aracı olarak kullandı. Her iki katmanı genlikleri oranını ölçülen bölüm18katsayısı yol açtı. Bu yöntemler kullanmak ama genellikle uygun çözelti bastırılması sağlamak ve seçicilik sinyal için degrade bakliyat şeklinde seçici bakliyat ve güç seviyeleri kalibrasyonu veya kullanımı gerektirir nispeten kolaydır.
Bileşikler için hesaplanan günlükP (takunyaP) değerleri de edinilebilir. Birkaç hesaplama yöntemleri ve ticari olarak mevcut yazılım mevcuttur. Çok sayıda ilaç molekülleri değerlendirirken bu takunyaP değerleri ilaç endüstrisinde yaygın olarak kullanılır. Ancak, takunyaP değerleri gelen büyük hatalar nadir19,20değildir.
UV-etkinlik konsantrasyon analizi için gereksinimleri ve kalibrasyon eğrileri günlükP hesaplaması için kurulması bu alanda araştırma ilerleme engel. Özellikle, UV etkin olmayan alifatik bileşikler için durum böyle. Fluorlu alifatik moieties son yıllarda giderek ilaç tasarımı için cazip hale gelmiştir ve tesisin genel lipophilicity onların etkisi bizim grup21bir araştırma konusu. Buna ek olarak, 19F 19F NMR Fluor bileşikleri analiz etmek için yararlı bir araç yapmak son derece hassas bir NMR aktif çekirdek olduğunu. Ayrıca 1H. kıyasla daha geniş bir kimyasal üst karakter aralığı vardır Bu nedenle, 19F NMR spektroskopisi tarafından günlüğüP kararlılık UV etkin olmayan Fluor bileşikleri için basit bir yöntem geliştirmek için faydalıdır. Bu nedenle, bu yöntem genel amacı Fluor bileşikleri belirlenmesi uygun lipophilicity ulaşmaktır.
Bizim 19F NMR tabanlı yöntemi anahtar bölümü deneme (Şekil 1)21' bileşik bir flüorlu başvuru eklemek için ilkedir. Bileşik X ve başvuru bileşik (ref) su ve n- octanol arasında bölümlendirilir. Sıcaklığına sonra bir aliquot her aşamasından bir NMR tüp içine alınır ve 19F NMR deneyler her iki NMR örnekleri üzerinde çalıştırılır. Flor doruklarına yoğunluğunu konsantrasyon (C) ve flor atomları bileşikler (n) sayısı bileşik orantılıdır. Bileşik X ve ref arasında ayrılmaz oranları her iki aşama için elde edilebilir. N- octanol katmanında oranı ρ tanımlanırEkimve ρaq su katmanı (EQ 1) için. ρ değerleri oranı bileşik X ve ref (EQ 2) bölüm katsayıları (P) oranı eşittir. Bu günlük bileşik XP ölçümü için son Denklem (EQ 4) yol açar. Bu nedenle, günlük bilinmeyen bir bileşik X, sadece entegrasyon oranları (ρEkim ve ρaq)P değerini belirlemek için her iki katmanı 19tarafından F NMR ölçülecek ihtiyaç vardır.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>NMR (400 MHz) with Bruker 5 mm SEF probe</td>
			<td>Bruker</td>
			<td>n/a</td>
			<td>AVIIIHD400</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NMR (400 MHz) with Bruker 5 mm SMART probe</td>
			<td>Bruker</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DrySyn Snowstorm reactor</td>
			<td>Asynt</td>
			<td>ADS13-S</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>recirculating chiller</td>
			<td>Asynt</td>
			<td>n/a</td>
			<td>model:Grant-LTC2</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>magnetic stirplate</td>
			<td>Asynt</td>
			<td>ADS-HP-NT</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ACD/NMR processor software</td>
			<td>ACD/Labs</td>
			<td>n/a</td>
			<td>ACD/NMR processor academic edition or ACD/Spectrus processor 2015</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a new straightforward method for lipophilicity (logp) measurement using 19f nmr spectroscopy

Fluorination biyoaktif bileşiklerin Fizikokimyasal özellikleri optimize etmek için etkili bir araç haline gelmiştir. Flor giriş uygulamalardan biri lipophilicity bahçedeki modüle etmektir. Bizim grupta fluorination lipophilicity alifatik fluorohydrins ve Fluor karbonhidratlar üzerinde etkisinin çalışmada ilgilendi. UV-aktif, zorlu bir lipophilicity tayini çıkan bunlar değil. Burada, 19F NMR spektroskopisi tarafından Fluor bileşikleri lipophilicity ölçümü için basit bir yöntem mevcut. Bu yöntem hiçbir UV-etkinlik gerektirir. Doğru çözünen kitle, solvent ve aliquot birim değildir ayrıca ölçülecek gerekli. Bu yöntemi kullanarak, çok sayıda flüorlu oluşturur ve karbonhidrat lipophilicities ölçülür.

Kontrol deneyleri Şekil 221' de gösterilen gibi iki veri türlerini belirler. 2,2,2-trifluoroethanol başvuru bileşik kullanarak, günlükP değerleri 2-fluoroethanol ve 3,3,3,2,2-pentafluoropropanol için-0.75 ve +1.20, anılan sıraya göre elde edilmiştir (Şekil 2A). Daha sonra 2-fluoroethanol lipophilicity yine ama 3,3,3,2,2-pentafluoropropanol ile (P değeri +1.20 önceki, deney...

Watch this Scientific Journal Video about A New Straightforward Method for Lipophilicity logP Measurement using 19F NMR Spectroscopy at JoVE.com

A New Straightforward Method for Lipophilicity logP Measurement using 19F NMR Spectroscopy

Bir roman ve shake-balon yönteminin basit varyasyon Fluor bileşikleri doğru lipophilicity ölçüm için 19F NMR spektroskopisi tarafından geliştirilmiştir.

19F NMR spektroskopi kullanarak Lipophilicity (logP) ölçüm için yeni bir basit Yöntem

Fluorination has become an effective tool to optimize physicochemical properties of bioactive compounds. One of the applications of fluorine introduction ...

Biz lipophilicity küçük farklılıkları ölçmek çoğaltmak için yeterince acrid flor NMR kullanarak frenetic bileşiklerin lipophilicity ölçümü için basit bir yöntem geliştirdik. Bu yöntem, genel tıbbi kimyada ilgi çekici olan, çözülmüş değişen lipophilicity değişiklikleri üzerinde organik bileşiklerin oluşumunun etkisini sistematik olarak incelemek için kullanılabilir. Bu yöntemin avantajları bileşiklerin reaktif olması gerekmez ve tamamen saf olmak zorunda değildir.Tam kütle veya hacimleri ölçmeye gerek yoktur ve kalibrasyon eğrileri oluşturmaya gerek yoktur. Uygun bir Referans Bileşimi seçilmeli ve örnekleme aşamasında aliquotun çapraz kontaminasyonundan kaçınılmalıdır. Bu videoda örnekleme, NMR tüp sızdırmazlığı ve veri işleme için NMR yazılımının doğru kullanımı için uygun pratik becerileri göstereceğiz.10 mililitrelik armut şeklindeki bir şişeye 6,0 miligram Bileşik X ve 3,0 miligram Referans Bileşiğek ekleyin. HPLC dereceli n-Otonol yaklaşık iki mililitre bileşikleri çözün ve HPLC dereceli su iki mililitre ekleyin. Şişeleri bir karıştırma plakasının üzerinde sıcaklık kontrollü bir haznenin içine yerleştirin ve yeniden dolaşan bir soğutucuya bağlanın.Biphasik karışımı 25 derecede iki saat boyunca karıştırın ve karıştırma hızı 600 RPM olarak ayarlayın. Tam faz ayrımı için izin vermek için karışımı bir gecede 25 santigrat derecede dengeleyin. Şişeyi bir kelepçeyle retort standına sabitle.Uzun iğneler ile bir mililitre tek kullanımlık plastik şırınga kullanarak su ve n-Oktanol katmanları yaklaşık 0,70 ila 0,85 mililitre bir aliquot alın. Su aliquot almak için, karışımı içine iğne koymadan önce şırınga içine hava yaklaşık 0,02 mililitre çekin. İğneyi üst n-Oktanol tabakasından su tabakasına doğru hareket ettirirken, n-Oktanol çözeltisinin iğneye girmesini önlemek için yavaşça havayı dışarı itin.Karışımdan uzun iğne çıkarın. Şırıngada yaklaşık 0,6 mililitre numune bırakarak az miktarda su numunesi atın. İğneyi kuru dokuyla dikkatlice silin ve temiz bir NMR tüpüne yaklaşık 0,5 mililitre su numunesi enjekte edin.NMR tüpünü bir kapakla hızla kapatın. n-Oktanol örneği için, n-Oktanol tabakasından uzun iğne çıkarın. Az miktarda n-Oktanol numunesini atın ve şırıngada yaklaşık 0,6 mililitre numune bırakarak.İğneyi kuru dokuyla dikkatlice sildikten sonra, temiz bir NMR tüpüne yaklaşık 0,5 mililitre n-Oktanol numunesi enjekte edin. NMR tüpünü bir kapakla hızla kapatın. N-Oktanol ve su örneklerini diğer fazdan kaynaklanan kirlenmeler için görsel olarak inceleyin.Her NMR tüpüne, NMR alımı sırasında sinyal kilidini etkinleştirmek için hem n-Oksanol hem de su ile yanlış çıkarılabilen, 0,1 mililitre deuterated NMR çözücü ekleyin. Düşük kaynama noktaları olan bileşikler için, bir blowtorch kullanarak NMR tüpleri mühür, ve herhangi bir sızıntı ları kontrol etmek için tüp ters soğutma sonra. F19 NMR deneyleri için homojen bir çözüm elde etmek için mühürlü veya mühürlü olmayan NMR tüplerini 20 kez dikkatlice ters çevirin.N-Otokanol ve su NMR örneklerinde X bileşik ve Referans Bileşiğin kimyasal kaymalarını belirlemek için proton ayrılmış flor NMR deneylerini çalıştırın. Metin protokolünde listelenen standart NMR parametre ayarlarını kullanın. Bir ters kurtarma dizisi kullanarak tanısal flor çekirdekleri için spin-kafes gevşeme süresini veya T1'i ölçün.Doğru nicel NMR entegrasyonu için elde edilen T1 değerlerinden uygun darbe gecikme süresini ölçün. İlk parametreleri ayarlamak için hızlı bir F19 H1 spektrumu çalıştırın. 90 derece darbe genişliğini ölçün, ardından T1 ölçüm deneyi için parametreyi ayarlayın ve t1 ölçüm denemesini ters kurtarma sırasını kullanarak çalıştırın.Ayarlanmış parametre ayarlarıyla proton ayrılmış flor NMR deneylerini tekrar çalıştırın. D1'i ayarlayın ve her iki çekirdeğin de eşit derecede heyecanlı olabilmesi için iki tanısal flor sinyali arasındaki frekans dengeleme noktasını ortala. Ayrıca, spektral genişlik 300 PPM olarak ayarlayın ve geçici sayısını 64 olarak ayarlayın.Daha yüksek bir sinyal-gürültü oranı gerekiyorsa bu değerleri ayarlayın. Elde edilen verileri ACD NMR İşlemci Akademik Sürümü veya diğer özel NMR işleme yazılımını kullanarak işleyin. NMR veri dosyasını açın.Ardından pdata klasörünü açın ve ardından klasör 1'i takip edin. 1r dosyasını silin. NMR veri dosyasına dönün ve FID dosyasını ACD NMR İşlemci penceresine sürükleyin.Pencere işlevi düğmesini tıklatın, üstel seçin, satırı iki olarak genişletin ve tamam düğmesini tıklatın. Şimdi, sıfır dolum düğmesini tıklatın, sayının yanındaki küçük bir düğmeyi tıklatarak puan sayısını orijinal puan sayısının dört katına yükseltin ve tamam düğmesini tıklatın. Fourier dönüşümü düğmesini seçin.Ardından, aşama düğmesini tıklatın ve sonra fare phasing düğmesini tıklatın. Sol fare düğmesini tıklatın ve fareyi ileri veya geri hareket ettirin, ta ki spektrumun ana zirvesi düzgün bir şekilde aşamalı olana kadar. Şimdi, sağ fare düğmesini tıklatın ve fareyi ileri veya geri hareket ettirin, ta ki spektrumun diğer zirveleri düzgün bir şekilde aşamalı olana kadar.Ardından, fare nin phasing düğmesini un-click ve flor zirveleri ile spektral alana yakınlaştırmak. İnce ayar'ı tıklatın, daha önce açıklandığı gibi gerekirse faz düzeltmesini gerçekleştirin ve ardından onay düğmesini tıklatın. Taban çizgisi düğmesini ve ardından seçenekler düğmesini tıklatın.Otomatik modeller için spektrum ortalamasını seçin, gerekirse kutu yarım genişlik için puan sayısını ayarlayın. Tamam'ı, otomatik'i ve ardından onay düğmesini tıklatın. Ardından, tümleştirmeyi tıklatın, tanılama flor zirvelerini tümleştirin ve onay düğmesini tıklatın.Son olarak, n-Oktanol ve su NMR örneklerinden entegrasyon oranlarını elde etmek ve logP hesaplama denkleminde kullanarak Bileşik X.Using 2, 2, 2-Trifloroetanol'ün referans bileşimi olarak logP değerini elde etmek için, iki floroetanol için 0,75 logP değeri elde edildi ve 3, 3, 3, 3, 2, 2-pentaproporiçin 0,75 logP değeri elde edildi ve logP değeri 1.20 bulundu. Daha sonra, iki floroetanol lipophililisite tekrar tespit edildi, ancak referans olarak 3, 3, 3, 2, 2-pentafluoropropanol ile. Ölçülen logP değeri 0.76 idi ve referans olarak 2-2-2-trifloroetanol kullanılarak ölçülen değerle karşılaştırıldığında sadece 0,01 logP birimi farkı vardı.Aynı şekilde, cis-2, 3-difluro-1, 4-bütan-diol için, iki floroetanol ve trans-izomer kullanılarak ölçülen logP değerleri arasındaki fark çok küçüktür. Bu iyi tekrarlanabilirlik gösterir ve Referans Bileşik seçimi logP ölçümü üzerinde etkisi yoktur. Seçilen ek örnekler burada gösterilmiştir.Florlu karbonhidratlardan florohidrinlere kadar tüm bu UV dışı aktif allophatic bileşikler bu yöntemle kolayca ölçülebilir. Diğer proto NMR tabanlı yöntemler, eğer bileşiğiniz flor içermiyorsa ve bileşik UV Kromofor içeriyorsa, logP ölçümü UV ölçümü kullanılarak yapılabilir. UV olmayan aktif florohidrinler ve deoksifluonated karbonhidratlar geniş bir yelpazede lipophilicity ölçüldü.Elde edilen veri kitaplığı, alifatik florun lipophilisite üzerindeki etkisine ilişkin eğilimleri ve kuralları belirlemek için kullanılmıştır. Otonol ve su minimum güvenlik tehlikesi oluşturur. Tabii ki, ölçülen tehlikeler ve Referans Bileşik her zaman dikkate alınmalıdır.

Research

JoVE Journal

Chemistry

A New Straightforward Method for Lipophilicity (logP) Measurement using 19F NMR Spectroscopy

Structure and Coordination Determination of Peptide-metal Complexes Using 1D and 2D 1H NMR

Structure and Coordination Determination of Peptide-metal Complexes Using 1D and 2D 1H NMR

Copper (I) binding by metallochaperone transport proteins prevents copper oxidation and release of the toxic ions that may participate in harmful redox ...

Dependence of Laser-induced Breakdown Spectroscopy Results on Pulse Energies and Timing Parameters Using Soil Simulants

Toprak benzerleri kullanılarak Darbe Enerjileri ve Zamanlama Parametreleri Lazer kaynaklı Dağılımı Spektroskopisi Sonuçlarının Bağımlılığı

The  dependence of some LIBS detection capabilities on lower pulse energies (&lt;100  mJ) and timing parameters were examined using synthetic silicate ...

Facile Synthesis of Worm-like Micelles by Visible Light Mediated Dispersion Polymerization Using Photoredox Catalyst

Photoredox Katalizörü kullanarak görünür ışık aracılığı ile dispersiyon polimerleştirilmesi ile solucan gibi miseller Facile sentezi

Presented herein is a protocol for the facile synthesis of worm-like micelles by visible light mediated dispersion polymerization. This approach begins ...

Spin Saturation Transfer Difference NMR (SSTD NMR): A New Tool to Obtain Kinetic Parameters of Chemical Exchange Processes

Spin Saturation Transfer Difference NMR SSTD NMR: A New Tool to Obtain Kinetic Parameters of Chemical Exchange Processes

Spin Doygunluk Transferi Farkı NMR (SSTD NMR): Yeni Bir Aracı Kimyasal Değişim Süreçlerinin Kinetik Parametrelerinin Elde

This detailed protocol describes the new Spin Saturation Transfer Difference Nuclear Magnetic Resonance protocol (SSTD NMR), recently developed in our ...

A Straightforward Method for Glucosinolate Extraction and Analysis with High-pressure Liquid Chromatography (HPLC)

A Straightforward Method for Glucosinolate Extraction and Analysis with High-pressure Liquid Chromatography HPLC

Yüksek basınçlı Sıvı Kromatografi ile Glukosinolat Ekstraksiyon ve Analiz A Basit Yöntemi (HPLC)

Glucosinolates are a well-studied and highly diverse class of natural plant compounds. They play important roles in plant resistance, rapeseed oil ...

NMR Spectroscopy as a Robust Tool for the Rapid Evaluation of the Lipid Profile of Fish Oil Supplements

Balık Yağı Takviyeler Lipid Profilinin Rapid Değerlendirilmesi için Sağlam Aracı Olarak NMR Spektroskopisi

The western diet is poor in n-3 fatty acids, therefore the consumption of fish oil supplements is recommended to increase the intake of these essential ...

Fabrication and Testing of Photonic Thermometers

İmalat ve fotonik termometreler test

In recent years, a push for developing novel silicon photonic devices for telecommunications has generated a vast knowledge base that is now being ...

Application and Methodology of the Non-destructive 19F Time-domain NMR Technique to Measure the Content in Fluorine-containing Drug Products

Application and Methodology of the Non-destructive 19F Time-domain NMR Technique to Measure the Content in Fluorine-containing Drug Products

Uygulama ve tahribatsız 19F saat-alan NMR tekniği metodolojisi Flor içeren ilaç ürünleri içeriğindeki ölçmek için

Here, we describe a protocol developed by our group that uses low-field fluorine-19 (19F) time-domain (TD) nuclear magnetic resonance (NMR) to measure the ...

Simultaneous Measurement of HDAC1 and HDAC6 Activity in HeLa Cells Using UHPLC-MS

Eş zamanlı ölçüm HDAC1 ve HDAC6 faaliyete HeLa hücreleri kullanarak UHPLC-MS

The search for new histone deacetylase (HDAC) inhibitors is of increasing interest in drug discovery. Isoform selectivity has been in the spotlight since ...

Electrochemical Impedance Spectroscopy as a Tool for Electrochemical Rate Constant Estimation

Elektrokimyasal empedans spektroskopisi elektrokimyasal oranı sürekli tahmini için bir araç olarak

Electrochemical impedance spectroscopy (EIS) was used for advanced characterization of organic electroactive compounds along with cyclic voltammetry (CV). ...