Name: measurement of energy metabolism in explanted retinal tissue using extracellular flux analysis
Uploaded: 2019-01-07T14:00:00
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Gnat1-/-を提供する、博士アレクサンダー Kolesnikov と博士ウラジミール ・ Kefalov に感謝マウス、有益なフィードバックとアドバイス、および、原稿を読んでします。
この作品は NIH EY025269 (RR)、ワシントン大学 - NIH DK020579 糖尿病研究センターによってサポートされていた (JRM と RR) を防ぐため失明 (RR)、Horncrest 財団 (RR)、JDRF (からキャリア開発賞の研究から、キャリア ・ デベロップメント賞JRM)、NIH DK101392 (CFS)、DK020579 (CFS)、DK056341 (CFS)、DK114233 (JRM)。

プロトコルはビジョン研究会、動物の使用は、眼科の文に従い、ワシントン大学によって承認されました。
1. 動物の準備
<ol><li>12 時間で標準的な住宅で動物を 12 時間ライト サイクルが暗い維持するには。実験開始は朝はライトが点灯直後に通常概日リズムの影響を避けるために時間を標準化します。</li>
</ol>2. ソリューションの準備
<ol><li>8.4 mg ダ?...

<ol>
	<li>Wong-Riley, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Energy+metabolism+of+the+visual+system.">Energy metabolism of the visual system.</a> Eye and brain. 2, 99-116 (2010).</li><li>Ames, A., Li, Y. Y., Heher, E. C., Kimble, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Energy+metabolism+of+rabbit+retina+as+related+to+function:+high+cost+of+Na++transport.">Energy metabolism of rabbit retina as related to function: high cost of Na+ transport.</a> The Journal of neuroscience: the official journal of the Society for Neuroscience. 12 (3), 840-853 (1992).</li><li>Warburg, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=On+the+origin+of+cancer+cells.">On the origin of cancer cells.</a> Science. 123 (3191), 309-314 (1956).</li><li>Wubben, T. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Photoreceptor+metabolic+reprogramming+provides+survival+advantage+in+acute+stress+while+causing+chronic+degeneration.">Photoreceptor metabolic reprogramming provides survival advantage in acute stress while causing chronic degeneration.</a> Scientific reports. 7 (1), 17863 (2017).</li><li>Du, J., Linton, J. D., Hurley, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Probing+Metabolism+in+the+Intact+Retina+Using+Stable+Isotope+Tracers.">Probing Metabolism in the Intact Retina Using Stable Isotope Tracers.</a> Methods in enzymology. 561, 149-170 (2015).</li><li>Felder, A. E., Wanek, J., Tan, M. R., Blair, N. P., Shahidi, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Method+for+Combined+Retinal+Vascular+and+Tissue+Oxygen+Tension+Imaging.">A Method for Combined Retinal Vascular and Tissue Oxygen Tension Imaging.</a> Scientific reports. 7 (1), 10622 (2017).</li><li>Hurley, J. B., Lindsay, K. J., Du, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glucose,+lactate,+and+shuttling+of+metabolites+in+vertebrate+retinas.">Glucose, lactate, and shuttling of metabolites in vertebrate retinas.</a> Journal of neuroscience research. 93 (7), 1079-1092 (2015).</li><li>Winkler, B. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glycolytic+and+oxidative+metabolism+in+relation+to+retinal+function.">Glycolytic and oxidative metabolism in relation to retinal function.</a> The Journal of general physiology. 77 (6), 667-692 (1981).</li><li>Pelletier, M., Billingham, L. K., Ramaswamy, M., Siegel, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Extracellular+flux+analysis+to+monitor+glycolytic+rates+and+mitochondrial+oxygen+consumption.">Extracellular flux analysis to monitor glycolytic rates and mitochondrial oxygen consumption.</a> Methods in enzymology. 542, 125-149 (2014).</li><li>Joyal, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Retinal+lipid+and+glucose+metabolism+dictates+angiogenesis+through+the+lipid+sensor+Ffar1.">Retinal lipid and glucose metabolism dictates angiogenesis through the lipid sensor Ffar1.</a> Nature medicine. 22 (4), 439-445 (2016).</li><li>Kooragayala, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantification+of+Oxygen+Consumption+in+Retina+Ex+Vivo+Demonstrates+Limited+Reserve+Capacity+of+Photoreceptor+Mitochondria.">Quantification of Oxygen Consumption in Retina Ex Vivo Demonstrates Limited Reserve Capacity of Photoreceptor Mitochondria.</a> Investigative ophthalmology &amp; visual science. 56 (13), 8428-8436 (2015).</li><li>Pearsall, E. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PPARalpha+is+essential+for+retinal+lipid+metabolism+and+neuronal+survival.">PPARalpha is essential for retinal lipid metabolism and neuronal survival.</a> BMC biology. 15 (1), 113 (2017).</li><li>Nicholls, D. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bioenergetic+profile+experiment+using+C2C12+myoblast+cells.">Bioenergetic profile experiment using C2C12 myoblast cells.</a> Journal of visualized experiments. (46), (2010).</li><li>Lobanova, E. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transducin+translocation+in+rods+is+triggered+by+saturation+of+the+GTPase-activating+complex.">Transducin translocation in rods is triggered by saturation of the GTPase-activating complex.</a> The Journal of neuroscience: the official journal of the Society for Neuroscience. 27 (5), 1151-1160 (2007).</li><li>Winkler, B. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+electroretinogram+of+the+isolated+rat+retina.">The electroretinogram of the isolated rat retina.</a> Vision research. 12 (6), 1183-1198 (1972).</li><li>Jastroch, M., Divakaruni, A. S., Mookerjee, S., Treberg, J. R., Brand, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mitochondrial+proton+and+electron+leaks.">Mitochondrial proton and electron leaks.</a> Essays in biochemistry. 47, 53-67 (2010).</li><li>Divakaruni, A. S., Paradyse, A., Ferrick, D. A., Murphy, A. N., Jastroch, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+and+interpretation+of+microplate-based+oxygen+consumption+and+pH+data.">Analysis and interpretation of microplate-based oxygen consumption and pH data.</a> Methods in enzymology. 547, 309-354 (2014).</li><li>Du, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phototransduction+Influences+Metabolic+Flux+and+Nucleotide+Metabolism+in+Mouse+Retina.">Phototransduction Influences Metabolic Flux and Nucleotide Metabolism in Mouse Retina.</a> The Journal of biological chemistry. 291 (9), 4698-4710 (2016).</li></ol>

OCR と ecar とは、記載された方法を使用してバイオアナライザーを用いた explanted 網膜組織に容易に測定します。このメソッドは、いくつかの重要なステップの他のグループのそれらから出発します。網膜組織はウィンクラー15によって最初に記述されている、世界中を enucleating することがなく大規模な角膜切開に分離されます。網膜の分離のこの方法は、組織キャプチャ板?...

網膜は中枢神経系に1で最もエネルギー要求の厳しい組織です。同じようなほとんどの組織は、ミトコンドリアの細胞質または経由で酸化的リン酸化で解糖系によってアデノシン三リン酸 (ATP) を生成します。1 分子のグルコースから ATP を生成する解糖作用上の酸化的リン酸化のエネルギッシュな利点は明らか: 36 分子の ATP 生成から、前者と後者から生成される ATP の 2 分子。したがって、網膜神経細胞は主にエネルギーをミトコンドリア呼吸に依存して、これはミトコンドリア2の密度が高いで反映されます。しかし、網膜もに大きく依存して解糖系機械酸素が豊富な場合も。好気性解糖系のこのプロセスは、オットーウォーバーグ3、かつて指摘した網膜のみ分裂組織代謝4のこの形のことができる人によってがん細胞で最初に説明だった。これらの初期の観測以来多くの分裂組織を酸化的リン酸化に加え解糖作用の度合いでその ATP の要求を満たすために従事するのに記載されています。
光伝導、視覚顔料リサイクル、視細胞外側セグメントとシナプスの活性の生合成は、光受容体、網膜で優勢な神経細胞のサブクラス内のすべてのエネルギー要求の厳しいプロセスです。積極的に彼らの電気に対するイオンと濃度勾配を輸送する必要がニューロン1で最も精力的にかかる。光受容体は、(すなわち、暗闇の中で)、刺激のない状態で脱分極が光刺激トリガー チャンネル閉鎖とその後過分極に対し意味で特異な神経細胞です。したがって、網膜は、暗闇の中は一般的に呼ばれるように、その脱分極や「暗電流」を維持するために ATP の大量を消費します。適応の観点からは、これら大量の ATP を供給の主要課題は、光軸を通して映像の明瞭さを維持するために有機体のための必要性です。モダンな生き物に見られる倒立網膜建築光のパスから視細胞を供給密な毛細血管網を保持して支配的な解決策であります。この自然なバイオ エンジニア リングの驚異は代謝の準備の面で絶壁で網膜を配置します。網膜に小さくても侮辱に需要へのエネルギー供給の微妙なバランスが中断される可能性が、視覚障害や失明のフランクはすぐに起こることがあります。
血管供給のタイトな制限と相まって、神経網膜のユニークなエネルギッシュな要求を与え病気中に網膜とその変化で ATP 消費量の正確な測定の理解と治療に大きな影響を与えますが網膜色素変性症、糖尿病網膜症などの失明状態。伝統的に、これらの測定は研究所代謝活性2,5,6、測定専用の握りから新たな研究のほとんどと、特注の高価な機器を必要とします。 7,8。技術は、特定の代謝物、標識前駆体、クラーク電極とメタボローム9のプロファイリングを使用して録音の酸素消費量を用いたトレーサー研究個々 の試金を含んでいます。
ハイスループット技術および商業のデバイスの可用性の向上が進み、レコード レチナール代謝する技術はますます入手しやすく現実的。ここで説明したメソッドが両方酸化的リン酸化を測定し、網膜を使用して解糖系仔組織と市販の細胞フラックス アナライザー9,10、11,12。このアナライザーは、酸素消費量 (OCR) と酸化的リン酸化と解糖系、それぞれ13の間接的な指標として細胞の酸性化率 (ecar と)、別々 に記録します。これらの測定は、水没して興味の組織に作成されたマイクロチャンバ内プローブによって行われます。以前に発行されたメソッドのこの適応では、膵ランゲルハンス島用に設計されたキャプチャ プレートを使用マウス網膜の小さい、円形のセクションで代謝活性を記録します。複数の薬理学的なエクスポー ジャーは、システムも各サンプルの 4 つの注入ポートが含まれるために、単一の記録の中に、組織に配信できます。Ecar と OCR の録音のために最適化された別のプロトコルでこのシステムを使用して、野生型網膜の反応 (Gnat1-/-)、トランスデューシン欠けている網膜と比較することで先天性定常夜盲症の原因人間14。

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:777px;" width="778">
	<tbody>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:337px;">Seahorse XF24 Extracellular Flux Analyzer</td>
			<td style="width:155px;">Agilent, Santa Clara, CA</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="80">
			<td height="80" style="height:80px;width:337px;">Seahorse XF24 Islet Capture FluxPak (includes: Islet Capture Microplate, Sensor Cartridge and Calibrant Solution)</td>
			<td>Agilent, Santa Clara, CA</td>
			<td>101174-100</td>
			<td style="width:167px;">Includes islet capture microplate, sensor cartridge and calibrant solution</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;">RPMI 1640 Media (Powdered medium)</td>
			<td>Millipore-Sigma</td>
			<td>R1383</td>
			<td style="width:167px;">RPMI 1640 Media with L-Glutamine and without glucose or sodium bicarbonate</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;">D-Glucose</td>
			<td>Millipore-Sigma</td>
			<td>G8270</td>
			<td style="width:167px;">1M D-Glucose filtered, for media preparation</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:337px;">Sodium pyruvate</td>
			<td>Corning</td>
			<td>25000CI</td>
			<td style="width:167px;">100 mM sodium pyruvate</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:337px;">Antimycin-A</td>
			<td>Millipore-Sigma</td>
			<td>A8674</td>
			<td style="width:167px;">Mitochondrial stress protocol component</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:337px;">FCCP</td>
			<td>Millipore-Sigma</td>
			<td>C2920</td>
			<td style="width:167px;">Mitochondrial stress protocol component</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:337px;">Rotenone</td>
			<td>Millipore-Sigma</td>
			<td>R8875</td>
			<td style="width:167px;">Mitochondrial stress protocol component</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:337px;">2-deoxyglucose</td>
			<td>Millipore-Sigma</td>
			<td>D6134</td>
			<td style="width:167px;">Glycolysis protocol component</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:337px;">1 mm skin biopsy punches with plunger</td>
			<td>Integra-Miltex</td>
			<td>33-31AA-P/25</td>
			<td style="width:167px;">Explanting retinal tissue tool</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:337px;">Dumont Mini-Forceps Straight</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>11200-10</td>
			<td style="width:167px;">Explanting retinal tissue tool</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:337px;">Dumont Medical #5/45 Forceps- Angled 45 degrees</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>11253-25</td>
			<td style="width:167px;">Explanting retinal tissue tool</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:337px;">Dumont #7 Forceps - Curved</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>11271-30</td>
			<td style="width:167px;">Explanting retinal tissue tool</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:337px;">Quant-iT Picogreen dsDNA Assay Kit</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>P7589</td>
			<td style="width:167px;">Loading normalization assay</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;">Trizma base (Tris base)</td>
			<td>Millipore-Sigma</td>
			<td>T6066</td>
			<td style="width:167px;">Component of lysis buffer</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;">Triton X-100 (polyethylene glycol tert-octylphenyl ether)</td>
			<td>Millipore-Sigma</td>
			<td>X100</td>
			<td style="width:167px;">Component of lysis buffer</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;">0.5M EDTA pH 8.0</td>
			<td>Ambion</td>
			<td>AM9262</td>
			<td style="width:167px;">Component of lysis buffer</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;">C57BL/6J mice&#160;</td>
			<td>Jackson Laboratories</td>
			<td>&#160;Strain 000664</td>
			<td style="width:167px;">Animals</td>
		</tr>
		<tr height="24">
			<td height="24" style="height:24px;">Gnat1-/- and background-matched Gnat1+/+&#160;</td>
			<td colspan="2">Vladimir Kefalov, PhD; Washington University School of Medicine</td>
			<td style="width:167px;">Animals</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

measurement of energy metabolism in explanted retinal tissue using extracellular flux analysis

高視力ビジョンが大きくエネルギー消費のプロセス、網膜が正確に視軸の透明性を維持しながらこのような要求を満たすためにいくつかのユニークな適応を開発しました。この微妙なバランスに摂動は、まばゆいばかりの病気、糖尿病網膜症などを引き起こします。したがって、病気中に網膜におけるエネルギー代謝の変化の理解は、ビジョンの損失の様々 な原因のための合理的な治療法の開発することが不可欠です。市販の細胞フラックス アナライザーの最近の出現より使いやすい網膜のエネルギー代謝の研究をしました。このプロトコルを記述するこのような酸素消費量 (OCR) の変化を定量化することでその 2 つの主要武器 - 酸化的リン酸化と解糖系 - を通じて網膜のエネルギー供給への貢献を測定する分析装置の使用および細胞外これらの経路のプロキシとして酸性化率 (ecar と)。この手法は、explanted 網膜組織、単一の実験で複数の薬理学的薬剤への応答の評価を促進することで容易に実行されます。棒の光受容器シグナリングに欠けている動物から網膜に代謝の署名は、このメソッドを使用して野生型コントロールと比較されます。このテクニックでの主な制限は、明順応と低エネルギー利用、網膜組織の重要な生理学的な考察を区別する能力の欠如です。

(図 1に要約) 説明したテクニックを使用すると、8 週齢野生型 (WT) マウスから網膜外植片は年齢と背景一致トランスデューシンnull マウス (Gnat1-/-) と比較されました。Gnat1-/-動物を 機械がないため環状ヌクレオチド ゲート光刺激への反応のイオン チャネル、彼らの棒の光受容体の光14でも脱?...

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Measurement of Energy Metabolism in Explanted Retinal Tissue Using Extracellular Flux Analysis

細胞外のフラックスを用いた Explanted 網膜組織のエネルギー代謝の測定

この手法では、酸素消費量と細胞外酸性化率 explanted マウス網膜組織細胞フラックス アナライザーを使用してリアルタイムの記録について説明します。

High acuity vision is a heavily energy-consuming process, and the retina has developed several unique adaptations to precisely meet such demands while ...

この方法は、生物学的サンプル間や薬理薬への暴露後に、レチン組織のエネルギー代謝がどのように異なるかなどの重要な質問に答えるのに役立ちます。この技術の主な利点は、解糖症と酸化リン酸化の両方の速度を測定するために、外植された有機的なレチナル組織を利用し、インビトロでのリアルタイム介入の評価を可能にすることです。細胞外フラックスアッセイの計測器を校正するには、まず24ウェルセンサーカートリッジの各ウェルに1ミリリットルのキャリブレーション溶液を追加し、Co2フリーインキュベーターで摂氏37度で一晩インキュベートします。ミトコンドリア応力プロトコルの添加剤、またはセンサーカートリッジの各インジェクターポートへの解糖プロトコルの負荷添加物は、ウェル内の体積変化に合わせて調整する。最初の井戸容積は450マイクロリットルと仮定すると、一般的なアッセイには、第1インジェクターポートへの添加剤45マイクロリットル、第2インに49.5マイクロリットル、3番目に54.5マイクロリットル、最後まで60マイクロリットルが含まれる。最初のいくつかの実験の間に、ポートAにベースメディアをロードして、ポート注入後に発生する組織移動アーティファクトの量を測定します。負荷のセンサープレートを、非Co2インキュベーターで37°Cで少なくとも60分間インキュベートします。新鮮なマウスのレチン組織を安楽死させたマウスで分離し始める。中型の湾曲した鉗子を使用して視神経で後部地球儀をつかみ、眼を下支にするために前方圧力を穏やかに加えます。きれいなカミソリの刃で、刃の単一の意図的なパスを使用して角膜を横切って手足を切開する手足を作成します。細かい角度のマクファーソンスタイルの鉗子を使用して、角膜切開部からレンズと前ヒロイド膜を表現するために後部地球儀をつまみます。鉗子でつまみ操作を繰り返して、神経の残りを表現します。次に、スプーンのような鉗子を使用して、角膜切開から離れてレチナを持ち上げます。3センチメートル皿、または6つのウェル組織培養クラスタープレートで直接温かい媒体にレチナを置きます。次に、細かい角度のマクファーソンのスタイル鉗子を2組使用して、残りの炎を残りの部分を離散させる。これは、レチナルカップの周辺での膜子をつかみ、中央に向かって引っ張り、全体として中央から膜炎体を最終的に取り除くことによって行われます。次に、網膜の光受容体表面から残存性網膜色素上皮を除去する。P1000ピペットチップをカミソリの刃で切り取り、転写中の繊細なレチナル組織への過度の外傷を防ぐために、およそ4ミリメートルの開口部を作成します。次いで、切り取ったピペットチップを使用して、単離したレチン組織を新鮮な培地に移す。最後に、プランジャーを装備した1ミリメートルの生検パンチを使用して、視神経の周りのレティナのパンチをカットします。レティナルパンチを清潔な媒体に置き、37°Cブロック、または加熱パッドに保管します。必要な数のパンチが収集されたら、かわいいP1000チップを使用して450マイクロリットルの媒体で個々のパンチを吸引し、37°Cヒートパッドまたはヒートブロック上の24ウェルアイレットキャプチャマイクロプレートに転送します。細かいストレート鉗子を使用して、マイクロプレートの中央にパンチを穏やかに操作します。パンチは同じ方向に向けて保管してください。例えば、神経節細胞側を上向きにします。各実験のために否定的な制御として役立つベース媒体の450マイクロリットルと3〜4つの空の井戸を取っておいた。気泡や過度の動きを避けながら、アイレットキャプチャメッシュインサートを各ウェルにそっと配置し、金属プランジャーまたはカットP1000ピペットチップで挿入物を固定します。マイクロチャンバは、典型的なマウスのretinaを収容するのに十分な深さを有するが、時折、メッシュ挿入物の機械欠陥は、画面挿入中に組織が過度に圧縮される原因となる。この場合は、この破砕された組織をメモし、そのサンプルを最終分析から除外します。37°Cの炭酸ガスフリーインキュベーターで組織プレートを少なくとも60分間インキュベートします。ミックス、重量、測定、および繰り返しコマンドを使用して、余分なセルラーフラックスアナライザをプログラムします。一例として、代表的なレチン組織の実験には、以下のものが含まれ得る。2分間混ぜ、2分待って、5分を計ります。この3つのステップを5~8回の間で行い、各化合物を注入した後に試験を行います。細胞外フラックスアナライザのプログラム開始ボタンを押し、画面の指示に従って、キャリブレーション用のセンサーカートリッジを挿入します。キャリブレーションの最後に、画面の指示に従って、校正用プレートを、レチナルサンプルを含むプレートに置き換え、プログラムをプログラムどおりに実行できるようにします。実行が完了したら、画面の指示に従って組織プレートを取り出します。実行の結果を表示し、データ ファイルを格納します。曲がった20ゲージ針と鉗子で、すべてのメッシュインサートを井戸から取り除き、後ろにレチナルパンチを残します。慎重に組織から培地を吸引し、0.5ミリリットルの冷リン酸緩衝生理食塩水で組織を2回洗浄する。2回目のPBS洗浄を吸引した後、各洗浄に100マイクロリットルの溶菌バッファーを加え、ピペットを上下に加えて組織を均質化します。最後に、Lys-EDTAバッファーの100マイクロリットルで溶出したサンプルを1対1に希釈し、希釈したサンプルの100マイクロリットルを96ウェルプレートに移すことによって、全二本鎖DNA含有量に基づいて入力レベルを定量化します。その後、各ウェルに検出バッファーの100マイクロリットルを追加し、2〜5分間混合します。最後に、480ナノメートルで励起した後の蛍光を定量し、標準曲線と比較して520ナノメートルで発光する。ウェル内のDNA含有量に対する生の細胞外フラックストを正規化します。塩基系において、5ミリのミュラーグルコースの存在下で、10ミリのミュラーピルビン酸の存在下で、細胞外酸性化速度によって測定される酸還流の速度に有意差がない。ワイル型動物由来のレチナル組織の間、または光刺激に応答して環状ヌクレオチドゲートイオンチャネルを閉じるための機械を欠いているマウスをノックアウトする。同様のパターンは、20ミリのミュラーグルコースおよび解糖抑制剤2DGを添加した後に見られる。これらのデータは、ベースラインからの小数変化を表すために数学的に変換され得る、 異なる実験的介入間のより良い比較を可能にする形式である。ベースラインにおける絶対酸素消費速度も、対照と変異型のレチン組織との間でも同等である。20ミリのミュラーグルコースの添加は、ミトコンドリア呼吸を増加させるが、絶対的な定量化の観点またはベースラインからの変化の点でグループ間で観察された変化はない。非結合剤である1ミリミュラーFCCPを添加することは、最大ミトコンドリア呼吸数を実証するために、コントロールおよび突然変異性の高グルコースとの高いレベルを上回るOCRを有意に増加させない。しかし、RAAカクテルを添加した後、両マウスからのシグナルは大幅に低下します。結論として、マウスの外植体における酸化リン酸化と解糖の割合を定量化する手法を示す。レチン組織の効率的な分離により、この技術は信頼性が高く、再び可能な測定を生み出します。アンカップリング剤などの露光のリアルタイム効果を評価できます。この手順に加えて、定量的RTPCRおよびウェスタンブロッティングのような他の方法は、解剖工程で単離された余剰組織に対して行われ、レチン代謝の研究に関連する並行情報を得ることができる。

Research

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Biology

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OLIgo Mass Profiling (OLIMP) of Extracellular Polysaccharides

OLIgo Mass Profiling OLIMP of Extracellular Polysaccharides

細胞外多糖のオリゴマスプロファイリング（オリンプ）

The direct contact of cells to the environment is mediated in many organisms by an extracellular matrix. One common aspect of extracellular matrices is ...

Quantitative Measurement of Invadopodia-mediated Extracellular Matrix Proteolysis in Single and Multicellular Contexts

シングルおよび多細胞コンテキストでInvadopodia媒介細胞外マトリックスタンパク分解の定量測定

Cellular invasion into local tissues is a process important in development and homeostasis.  Malregulated invasion and subsequent cell movement is ...

Multi-parameter Measurement of the Permeability Transition Pore Opening in Isolated Mouse Heart Mitochondria

単離ミトコンドリアマウス心臓における透水性遷移孔の開口部のマルチパラメータ測定

The mitochondrial permeability transition pore (mtPTP) is a non specific channel that forms in the inner mitochondrial membrane to transport solutes with ...

Techniques for the Analysis of Extracellular Vesicles Using Flow Cytometry

フローサイトメトリーを用いて細胞外小胞の分析のための技術

Extracellular Vesicles (EVs) are small, membrane-derived vesicles found in bodily fluids that are highly involved in cell-cell communication and help ...

Measurement of Extracellular Ion Fluxes Using the Ion-selective Self-referencing Microelectrode Technique

イオン選択自己参照微小電極法を用いた細胞外イオンフラックスの測定

Cells from animals, plants and single cells are enclosed by a barrier called the cell membrane that separates the cytoplasm from the outside. Cell layers ...

Measurement and Analysis of Extracellular Acid Production to Determine Glycolytic Rate

外酸生産の測定と解析は、解糖速度を決定するために

Extracellular measurement of oxygen consumption and acid production is a simple and powerful way to monitor rates of respiration and glycolysis1. Both ...

Isolation, Characterization, And High Throughput Extracellular Flux Analysis of Mouse Primary Renal Tubular Epithelial Cells

マウスの主な腎尿細管上皮細胞の分離と性質、高スループットの細胞フラックスの解析

Mitochondrial dysfunction in the renal tubular epithelial cells (TECs) can lead to renal fibrosis, a major cause of&#160;chronic kidney disease (CKD). ...

Laser-Capture Microdissection RNA-Sequencing for Spatial and Temporal Tissue-Specific Gene Expression Analysis in Plants

植物における空間的および時間的組織特異的な遺伝子発現解析のためのレーザー捕捉マイクロ解離RNAシーケンシング

The development of a complex multicellular organism is governed by distinct cell types that have different transcriptional profiles. To identify ...

Assessment of Cellular Bioenergetics in Mouse Hematopoietic Stem and Primitive Progenitor Cells using the Extracellular Flux Analyzer

細胞外フラックス分析装置を用いたマウス造血幹および原始前駆細胞における細胞生体エネルギーの評価

Under steady state, hematopoietic stem cells (HSCs) remain largely quiescent and are believed to be predominantly reliant on glycolysis to meet their ...