Name: quantitative examination of antibiotic susceptibility of neisseria gonorrhoeae aggregates using atp-utilization commercial assays and live/dead staining
Uploaded: 2019-02-08T14:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining at Jo

وأيد هذا العمل منحة من "المعهد الوطني للصحة" D.C.S. وكان AI123340. لام-C.W.، وشوبان، ميلان، وتم دعم E.N. في جزء/المشاركة في برنامج "السنة الأولى الابتكار البحوث تجربة" الممول من جامعة ميريلاند. وكان الممولين أي دور في قرار دراسة التصميم وجمع البيانات، والتحليل، ونشر، أو إعداد المخطوطة. ونعترف "كبمج الخفة التصوير الأساسية" لجميع تجارب الفحص المجهري.

1-العام الحفاظ على سلالات GC
<ol><li>متتالية السلالات البنية أ. أجار جك مع 1% كيلوغ يكمل18 (الجدول 1، الجدول 2) من الأرصدة المجمدة واحتضان 37 درجة مئوية مع 5% CO2 ل 16-18 h. MS11 استخدام التعبير عن أوبا متغير المرحلة (MS11Opa +)، لا يوجد قانون التلوث النفطي (MS11ΔOpa)، أو لوس مبتوراً (...

<ol>
	<li>den Heijer, C. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+comprehensive+overview+of+urogenital,+anorectal+and+oropharyngeal+Neisseria+gonorrhoeae+testing+and+diagnoses+among+different+STI+care+providers:+a+cross-sectional+study.">A comprehensive overview of urogenital, anorectal and oropharyngeal Neisseria gonorrhoeae testing and diagnoses among different STI care providers: a cross-sectional study.</a> BMC Infectious Diseases. 17 (1), (2017).</li><li>Hein, K., Marks, A., Cohen, M. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Asymptomatic+gonorrhea:+prevalence+in+a+population+of+urban+adolescents.">Asymptomatic gonorrhea: prevalence in a population of urban adolescents.</a> The Journal of Pediatrics. 90 (4), 634-635 (1977).</li><li>Hananta, I. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gonorrhea+in+Indonesia:+High+Prevalence+of+Asymptomatic+Urogenital+Gonorrhea+but+No+Circulating+Extended+Spectrum+Cephalosporins-Resistant+Neisseria+gonorrhoeae+Strains+in+Jakarta,+Yogyakarta,+and+Denpasar,+Indonesia.">Gonorrhea in Indonesia: High Prevalence of Asymptomatic Urogenital Gonorrhea but No Circulating Extended Spectrum Cephalosporins-Resistant Neisseria gonorrhoeae Strains in Jakarta, Yogyakarta, and Denpasar, Indonesia.</a> Sexually Transmitted Diseases. 43 (10), 608-616 (2016).</li><li>Chlamydia, W. H. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chlamydia+trachomatis,+Neisseria+gonorrhoeae,+syphilis+and+Trichomonas+vaginalis.+Methods+and+results+used+by+WHO+to+generate+2005+estimates.+World+Health+Organisation,+2011.+Prevalence+and+incidence+of+selected+sexually+transmitted+infections.">Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, syphilis and Trichomonas vaginalis. Methods and results used by WHO to generate 2005 estimates. World Health Organisation, 2011. Prevalence and incidence of selected sexually transmitted infections.</a> World Health Organisation. , (2011).</li><li>Mayor, M. T., Roett, M. A., Uduhiri, K. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Diagnosis+and+management+of+gonococcal+infections.">Diagnosis and management of gonococcal infections.</a> American Family Physician. 86 (10), 931-938 (2012).</li><li>Alirol, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multidrug-resistant+gonorrhea:+A+research+and+development+roadmap+to+discover+new+medicines.">Multidrug-resistant gonorrhea: A research and development roadmap to discover new medicines.</a> PLOS Medicine. 14 (7), (2017).</li><li>Workowski, K. A., Bolan, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sexually+transmitted+diseases+treatment+guidelines,+2015.">Sexually transmitted diseases treatment guidelines, 2015.</a> MMWR Recommendations and Reports. 64, 1-137 (2015).</li><li>Lahra, M. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cooperative+Recognition+of+Internationally+Disseminated+Ceftriaxone-Resistant+Neisseria+gonorrhoeae+Strain.">Cooperative Recognition of Internationally Disseminated Ceftriaxone-Resistant Neisseria gonorrhoeae Strain.</a> Emerging Infectious Diseases. 24 (4), (2018).</li><li>Wi, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antimicrobial+resistance+in+Neisseria+gonorrhoeae:+Global+surveillance+and+a+call+for+international+collaborative+action.">Antimicrobial resistance in Neisseria gonorrhoeae: Global surveillance and a call for international collaborative action.</a> PLOS Medicine. 14 (7), 1002344 (2017).</li><li>Singh, S., Singh, S. K., Chowdhury, I., Singh, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Understanding+the+Mechanism+of+Bacterial+Biofilms+Resistance+to+Antimicrobial+Agents.">Understanding the Mechanism of Bacterial Biofilms Resistance to Antimicrobial Agents.</a> Open Microbiology Journal. 11, 53-62 (2017).</li><li>Greiner, L. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilm+Formation+by+Neisseria+gonorrhoeae.">Biofilm Formation by Neisseria gonorrhoeae.</a> Infection and Immunity. 73 (4), 1964-1970 (2005).</li><li>Zollner, R., Oldewurtel, E. R., Kouzel, N., Maier, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phase+and+antigenic+variation+govern+competition+dynamics+through+positioning+in+bacterial+colonies.">Phase and antigenic variation govern competition dynamics through positioning in bacterial colonies.</a> Scientific Reports. 7 (1), (2017).</li><li>Stein, D. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Expression+of+Opacity+Proteins+Interferes+with+the+Transmigration+of+Neisseria+gonorrhoeae.+across+Polarized+Epithelial+Cells.">Expression of Opacity Proteins Interferes with the Transmigration of Neisseria gonorrhoeae. across Polarized Epithelial Cells.</a> PLoS One. 10 (8), 0134342 (2015).</li><li>LeVan, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Construction+and+characterization+of+a+derivative+of+Neisseria+gonorrhoeae+strain+MS11+devoid+of+all+opa+genes.">Construction and characterization of a derivative of Neisseria gonorrhoeae strain MS11 devoid of all opa genes.</a> Journal of Bacteriology. 194 (23), 6468-6478 (2012).</li><li>Merritt, J. H., Kadouri, D. E., O'Toole, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Growing+and+analyzing+static+biofilms.">Growing and analyzing static biofilms.</a> Curr Protoc Microbiol. , (2005).</li><li>Peeters, E., Nelis, H. J., Coenye, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+multiple+methods+for+quantification+of+microbial+biofilms+grown+in+microtiter+plates.">Comparison of multiple methods for quantification of microbial biofilms grown in microtiter plates.</a> Journal of Microbiological Methods. 72 (2), 157-165 (2008).</li><li>White, L. A., Kellogg, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neisseria+Gonorrhoeae+Identification+in+Direct+Smears+by+a+Fluorescent+Antibody-Counterstain+Method.">Neisseria Gonorrhoeae Identification in Direct Smears by a Fluorescent Antibody-Counterstain Method.</a> Journal of Applied Microbiology. 13, 171-174 (1965).</li><li>Swanson, J., Kraus, S. J., Gotschlich, E. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Studies+on+gonococcus+infection.+I.+Pili+and+zones+of+adhesion:+their+relation+to+gonococcal+growth+patterns.">Studies on gonococcus infection. I. Pili and zones of adhesion: their relation to gonococcal growth patterns.</a> Journal of Experimental Medicine. 134 (4), 886-906 (1971).</li><li>Herten, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+in+Vitro+Quantification+of+S.+aureus+Biofilms+on+Vascular+Graft+Surfaces.">Rapid in Vitro Quantification of S. aureus Biofilms on Vascular Graft Surfaces.</a> Frontiers in Microbiology. 8, 2333 (2017).</li><li>Gracia, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vitro+development+of+Staphylococcus+aureus+biofilms+using+slime-producing+variants+and+ATP-bioluminescence+for+automated+bacterial+quantification.">In vitro development of Staphylococcus aureus biofilms using slime-producing variants and ATP-bioluminescence for automated bacterial quantification.</a> Luminescence. 14 (1), 23-31 (1999).</li><li>Webb, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+death+in+Pseudomonas+aeruginosa+biofilm+development.">Cell death in Pseudomonas aeruginosa biofilm development.</a> Journal of Bacteriology. 185 (15), 4585-4592 (2003).</li><li>Jurcisek, J. A., Dickson, A. C., Bruggeman, M. E., Bakaletz, L. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vitro+biofilm+formation+in+an+8-well+chamber+slide.">In vitro biofilm formation in an 8-well chamber slide.</a> Journal of visualized experiments. (47), (2011).</li><li>Wang, L. C., Litwin, M., Sahiholnasab, Z., Song, W., Stein, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neisseria+gonorrhoeae+Aggregation+Reduces+Its+Ceftriaxone+Susceptibility.">Neisseria gonorrhoeae Aggregation Reduces Its Ceftriaxone Susceptibility.</a> Antibiotics (Basel). 7 (2), (2018).</li><li>Lebeaux, D., Ghigo, J. M., Beloin, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilm-related+infections:+bridging+the+gap+between+clinical+management+and+fundamental+aspects+of+recalcitrance+toward+antibiotics.">Biofilm-related infections: bridging the gap between clinical management and fundamental aspects of recalcitrance toward antibiotics.</a> Microbiology and Molecular Biology Reviews. 78 (3), 510-543 (2014).</li><li>Hall-Stoodley, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Towards+diagnostic+guidelines+for+biofilm-associated+infections.">Towards diagnostic guidelines for biofilm-associated infections.</a> FEMS Immunology and Medical Microbiology. 65 (2), 127-145 (2012).</li></ol>

يمكن أن تشكل البكتيريا الأغشية الحيوية أثناء الإصابة بجسم الإنسان. اختبار هيئة التصنيع العسكري التقليدي قد لا تعكس تركيز اللازمة للقضاء على البكتيريا في بيوفيلم. لاختبار تأثيرات مضادات الميكروبات في بيوفيلم، يمكن أن تكون أساليب تستند بيوفيلم الكتلة الأحيائية، فضلا عن تصفيح كفوس خاطئة ب...

مرض السيلان مشترك تنتقل العدوى (STI)1. النيسرية البنية (GC)، بكتيريا سلبية الغرام ديبلوكوككال، هو المسبّب لهذا المرض. يمكن أن ينتج أعراض العدوى التناسلية الألم أثناء التبول والأم الأعضاء التناسلية المعمم واحليلي التفريغ. العدوى في كثير من الأحيان أعراض2،3،،من45، وهذا يسمح لاستعمار الموسعة. هذه الإصابات غير المعالجة مصدر قلق رئيسيا لصحة، كما لديهم إمكانات لتسهيل انتقال الكائن الحي، وهذا يمكن أن يؤدي إلى مضاعفات مثل مرض التهاب الحوض (PID) ونشر العدوى بالمكورات البنية (DGI)6. مرض السيلان مقاومة للمضادات الحيوية هو أزمة صحية عامة رئيسية وزيادة أعباء الاقتصادية والاجتماعية7. وادي انخفاض قابلية السيفالوسبورينات تغيير نظام العلاج من المضادات الحيوية واحد العلاج المزدوج، الذي يجمع بين الدوكسيسيكلين أو الأزيتروميسين مع سيفترياكسون8. عدم زيادة سيفترياكسون والازيتروميسين9،10، بالاقتران مع أعراض العدوى، ويسلط الضوء على الحاجة إلى فهم حالات فشل معالجة مرض السيلان.
اختبار تركيز الحد الأدنى المثبطة (MIC)، بما في ذلك أجار تمييع والقرص الاختبارات نشرها، قد استخدمت كمعيار اختبار طبي لتحديد المقاومة للمضادات الحيوية. بيد أنه من غير الواضح إذا كان اختبار هيئة التصنيع العسكري ويعكس البكتيرية المقاومة للمضادات الحيوية المجراة. تكوين الأغشية الحيوية البكتيرية يسهم في بقاء البكتيريا حضور جراثيم تركيزات المضادات الحيوية: اختبار هيئة التصنيع العسكري غير قادر على الكشف عن هذا الأثر11. لأنه يمكن أن تشكل GC الأغشية الحيوية على الأسطح المخاطية12، نحن افترض أن المضادات الحيوية حساسية ضمن المجاميع ستكون مختلفة عن التي ينظر إليها في GC الفردية. بالإضافة إلى ذلك، وقد أظهرت الدراسات أن المرحلة ثلاث جزيئات السطح المتغير، بيلي، المرتبطة بالتعتيم البروتين (أوبا) وليبوليجوساكتشاريديس (لوس)، التي تنظم التفاعلات بين البكتيريا، يؤدي إلى مجاميع مختلفة الحجم13، 14 , 15-لم تنظر بمساهمة من هذه المكونات إلى مقاومة المضادات الحيوية نظراً لعدم وجود الأساليب المناسبة.
حاليا، هناك عدة طرق لقياس القضاء على بيوفيلم. الأسلوب الكمي الأكثر استخداماً بقياس التغيرات في الكتلة الحيوية باستخدام الكريستال البنفسجي تلطيخ16. ومع ذلك، يتطلب الأسلوب التلاعب التجريبية الهامة، التي يمكن أن تولد يحتمل أن تكون الأخطاء في تكرار تجربة17. يعيش الميت المصبوغة الطريقة المستخدمة هنا يسمح التصور البكتيريا الحية والميتة وتوزيعها داخل بيوفيلم. ومع ذلك، يمكن أن تشكل هيكل بيوفيلم كحاجز مادي يقلل من اختراق الصبغة. ولذلك، لتحديد البكتيريا يعيش الميت ضمن مجموعة، تلطيخ يقتصر على الأغشية الحيوية الصغيرة أو السلائف-ميكروكولونيس أو المجموعات. الأساليب الأخرى، بما في ذلك أجار القرص وتمييع نشر الاختبارات، ليست قادرة على قياس آثار التجميع. دراسة قابلية GC داخل التجميع بعد التعرض للمضادات الحيوية، طريقة مثالية تحتاج إلى أن يكون كل تحليل كمي التي يمكن قياس تعيش البكتيريا وتصور توزيعها.
يجمع بين الإجراء الموضح هنا قياس استخدام ATP والعيش/ميت تلطيخ الاعتداء على الكمية وبصريا دراسة قابلية GC ضمن المجاميع حضور المضادات الحيوية.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:837px;" width="837">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">100x Kellogg&#39;s supplement</td>
			<td style="width:229px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Agar</td>
			<td style="width:229px;">United States Biological</td>
			<td style="width:119px;">A0930</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">BacTiter Assay&#160;</td>
			<td style="width:229px;">Promega</td>
			<td style="width:119px;">G8232</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Ceftriaxone</td>
			<td style="width:229px;">TCI</td>
			<td style="width:119px;">C2226</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Difco GC medium base&#160;</td>
			<td style="width:229px;">BD</td>
			<td style="width:119px;">228950</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ferric nitrate, nonahydrate&#160;</td>
			<td style="width:229px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">254223-10G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Glucose</td>
			<td style="width:229px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP350-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">L-glutamine Crystalline Powder</td>
			<td style="width:229px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP379-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">BacLight live/dead staining</td>
			<td style="width:229px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">L7012</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">MS11 Neisseria gonorrhoeae strain</td>
			<td style="width:229px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>kindly provided by Dr. Herman Schneider, Walter Reed Army Institute for Research</td>
		</tr>
		<tr height="26">
			<td height="26" style="height:26px;width:323px;">Potassium phosphate dibasic (K2HPO4)</td>
			<td style="width:229px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">P290-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="26">
			<td height="26" style="height:26px;">Potassium phosphate monobasic (KH2PO4)</td>
			<td style="width:229px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP329-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Proteose Peptone&#160;</td>
			<td style="width:229px;">BD Biosciences</td>
			<td align="right" style="width:119px;">211693</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Sodium chloride (NaCl)</td>
			<td style="width:229px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">S671-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Soluble Starch</td>
			<td style="width:229px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">S9765</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Thiamine pyrophosphate</td>
			<td style="width:229px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">C8754-5G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Equipment</td>
			<td style="width:229px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Petri Dishes</td>
			<td style="width:229px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">25384-302</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">8-well coverslip-bottom chamber&#160;</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">155411</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">96-well tissue culture plates&#160;</td>
			<td>Corning, Falcon</td>
			<td style="width:119px;">3370</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:323px;">Biosafety Cabinet (NU-425-600 Class II, A2 Laminar Flow Biohazard Hood)</td>
			<td style="width:229px;">Nuaire</td>
			<td style="width:119px;">32776</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="26">
			<td height="26" style="height:26px;width:323px;">CO2 Incubator</td>
			<td style="width:229px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">&#160;Model 3530</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:323px;">Confocal microscope equipped with live imaging chamber</td>
			<td style="width:229px;">Leica</td>
			<td style="width:119px;">SP5X</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Corning&#160; 96 Well Black Polystyrene Microplate&#160;</td>
			<td style="width:229px;">Corning</td>
			<td style="width:119px;">3904</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Glomax Illuminator&#160;</td>
			<td style="width:229px;">Promega</td>
			<td style="width:119px;">E6521</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Pipette tips (0.1-10 &#181;L)</td>
			<td style="width:229px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">02-717-133</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Pipette tips (1000 &#181;L)</td>
			<td>VWR</td>
			<td style="width:119px;">83007-382</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Pipette tips (200 &#181;L)</td>
			<td style="width:229px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">53509-007</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Spectrophotometer Ultrospec 2000 UV</td>
			<td style="width:229px;">Pharmacia Biotech</td>
			<td style="width:119px;">80-2106-00</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Sterile 15 ml conical tubes</td>
			<td style="width:229px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">21008-216</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Sterile Microcentrifuge Tubes (1.7 mL)</td>
			<td style="width:229px;">Sorenson BioScience</td>
			<td style="width:119px;">16070</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Sterile polyester-tipped applicators</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>23-400-122</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:323px;">Sonicator</td>
			<td style="width:229px;">Kontes</td>
			<td style="width:119px;">Equivelent to 9110001</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

quantitative examination of antibiotic susceptibility of neisseria gonorrhoeae aggregates using atp-utilization commercial assays and live/dead staining

ظهور مقاومة للمضادات الحيوية النيسرية البنية (GC) تهديدا لصحة في جميع أنحاء العالم ويسلط الضوء على الحاجة إلى تحديد الأفراد الذين يمتنعون عن العلاج. تسبب هذه البكتيريا سلبية الغرام السيلان حصرا في البشر. خلال العدوى، أنها قادرة على مجاميع النموذج و/أو الأغشية الحيوية. اختبار تركيز الحد الأدنى المثبطة (MIC) يستخدم لتحديد قابلية للمضادات الحيوية وتحديد العلاج المناسب. ومع ذلك، إليه المجراة في استئصال وعلاقتها بالنتائج المختبرية غير معروفة. وقد وضعت أسلوب الذي يدرس كيفية تجميع GC يؤثر على قابلية المضادات الحيوية ويبين العلاقة بين المساحة الإجمالية وقابلية المضادات الحيوية. عندما GC إجمالاً، فأكثر مقاومة للمضادات الحيوية من القتل، مع البكتيريا في الوسط الباقين على قيد الحياة سيفترياكسون معاملة أفضل من تلك الموجودة في المحيط. وتشير البيانات إلى أن تجميع البنية أ. يمكن أن تقلل من قابليتها سيفترياكسون، الذي ينعكس في عدم استخدام أساليب أجار القياسية المستندة إلى لوحة هيئة التصنيع العسكري. تسمح الطريقة المستخدمة في هذه الدراسة الباحثين لاختبار قابلية البكتيرية في ظل الظروف ذات الصلة سريرياً.

واستخدمت طريقتين: فحص استخدام ATP ومقايسة المصبوغة العيش/قتيلا. النتائج يمكن أما مجتمعة أو منفردة المستخدمة لبحث بقاء البكتيرية ضمن المجاميع بعد العلاج بالمضادات الحيوية. لقد ثبت الفحص استخدام ATP لقياس البكتيريا قادرة على البقاء بدقة في المذهبة س. الأغشية الحيوية<sup c...

Watch this Scientific Journal Video about Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining at Jo

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

الإنزيم ATP قياس بسيط ويعيش/الميت تلطيخ الأسلوب استخدمت لتحديد ووضع تصور لبقاء النيسرية البنية بعد العلاج مع سيفترياكسون. هذا البروتوكول يمكن أن تمتد إلى دراسة آثار مضادات الميكروبات أي المضادات الحيوية ويمكن استخدامها لتعريف الحد الأدنى المثبطة تركيز المضادات الحيوية في الأغشية الحيوية البكتيرية.

فحص كمية "من قابلية المضادات الحيوية" النيسرية البنية التجارية استخدام ATP "باستخدام المجاميع فحوصات" و "تلطيخ" لايف/الميت

The emergence of antibiotic resistant Neisseria gonorrhoeae (GC) is a worldwide health threat and highlights the need to identify individuals who fail ...

هذه التقنية تسمح لنا بقياس قابلية المضادات الحيوية في ظل ظروف أكثر ملاءمة سريريا. كما تسمح لنا هذه التقنية بتحديد التركيز الحقيقي للمضادات الحيوية الذي يمكن أن يقتل البكتيريا في المجاميع. ويمكن تطبيق هذه التقنية على تحديد التركيز اللازم للقضاء على مجاميع GC.ويمكن أيضا أن تطبق هذه الطريقة لقياس قابلية مضادات الميكروبات من أي بكتيريا قادرة على تشكيل المجاميع. إيلاء اهتمام دقيق للخطوات تحلل لضمان اكتمال تحلل. وإلا فإن ATP قياس المقايسة يقلل من عدد البكتيريا قابلة للحياة.وسيسمح التصور لهذه الطريقة للباحثين الآخرين بمتابعة وتكرار هذه التجربة باتساق. تبدأ من قبل streaking Neisseria السيلان، أو سلالات GC، على GCK أجار تكملها 1٪ كيلوغ لاحتضان 16 إلى 18 ساعة في 37 درجة مئوية و 5٪ ثاني أكسيد الكربون. في صباح اليوم التالي ، استخدم مجهرًا خفيفًا لتحديد المستعمرات السلبية بعناية دون حواف داكنة أو مستعمرات إيجابية بيلي مع حواف داكنة من كل لوحة ، و streak المستعمرات المختارة على لوحات GCK جديدة لثقافة 16 إلى 18 ساعة عند 37 درجة مئوية و 5٪ ثاني أكسيد الكربون.في صباح اليوم التالي، استخدم قضيب معقمة لجمع مستعمرات GC من كل لوحة و resuspend كل مسحة في مرق دافئ تكملها 4.2٪ بيكربونات الصوديوم و 1٪ محلول كيلوغ. قياس الكثافة البصرية في 650 نانومتر، أو OD650، لتحديد تركيز البكتيريا المعلقة وضبط تركيز GC إلى حوالي مرة واحدة 10 إلى ثمانية وحدات القولون تشكيل لكل ملليلتر. بعد ذلك، أضف 99 ميكرولترات من تعليق GC إلى آبار فردية من لوحة 96 بئرًا والسماح للبكتيريا بتجميعها عند 37 درجة مئوية و5٪ من ثاني أكسيد الكربون لمدة ست ساعات.في نهاية الحضانة، إضافة ميكرولتر واحد من ceftriaxone المخفف تسلسليا إلى كل بئر ترك بعض الآبار دون علاج لتكون بمثابة ضوابط والعودة لوحة إلى الحاضنة لمدة 24 ساعة أخرى. في اليوم التالي، sonicate التعليق في كل بئر ثلاث مرات في 144 واط و 20 كيلوهيرتز لمدة خمس ثوان في صوتنة وإضافة 100 microliters المتاحة تجاريا ATP استخدام كاشف توهج لكل بئر. نقل بعناية 150 ميكرولترات من الخليط من كل بئر إلى آبار فردية من لوحة صغيرة سوداء جديدة 96-well وقياس امتصاص كل بئر في 560 نانومتر على قارئ لوحة.ثم، حساب معدل البقاء على قيد الحياة من نسبة القراءة التي تم الحصول عليها بعد العلاج بالمضادات الحيوية المسلسل إلى القراءة من الآبار غير المعالجة. للتصور من المجاميع GC الحية / الميتة، واستخدام قضيب عقيم لجمع GC من لوحات مثقف بين عشية وضحاها و resuspend GC في متوسط GCP مسبق الدفء تستكمل مع 1٪ كيلوغ. قياس OD650 بواسطة القياس الطيفي وضبط التركيز إلى ما يقرب من واحد مرات 10 إلى وحدات تشكيل مستعمرة سبعة لكل ملليلتر.بعد ذلك، أضف 198 ميكروليتر من تعليق GC إلى غرف ثمانية آبار من أسفل الغطاء وتحتضن الغرف عند 37 درجة مئوية و5٪ من ثاني أكسيد الكربون لمدة ست ساعات. في نهاية الحضانة، علاج البكتيريا مع اثنين من ميكرولترات من سيفترياكسون لكل حالة تجميع وإعادة الغرف إلى الحاضنة لفترة الحضانة التجريبية المناسبة. في نهاية الحضانة، إضافة 0.6 ميكرولترات من العيش / الميت تلطيخ حل في كل بئر والعودة الغرف إلى الحاضنة لمدة 20 دقيقة إضافية.ثم، استخدام المجهر confocal للحصول على الصور سلسلة ع. لقياس حجم مجاميع GC، افتح الصورة الأولى في ImageJ وحدد خطوطًا حرة لتدور حول مساحة كل تجميع في الصورة. انقر فوق تحليل وقياس.وسيُشار إلى حجم المجاميع تحت عمود المنطقة. لتحديد كمي من نسبة كثافة الفلوريسنس من البقع الحية إلى الميتة في كل تجميع، انقر فوق تحليل وتعيين القياسات والتحقق من الكثافة المتكاملة في النافذة المنبثقة. انقر فوق موافق وانقر على الصورة واللون وأداة القنوات.حدد اللون والقناة الأولى باعتبارها الفلوريسنس لبكتيريا ميتة تلطيخ. حدد خطوطًا حرة للدائرة في مساحة كل تجميع وانقر فوق التحليل والمقياس للحصول على نسبة كثافة الفلوريسين لكل تجميع في عمود الكثافة المتكامل. حدد القناة الثانية للفلوريسنس للبقعة البكتيرية الحية وقياس كثافة الفلوريسين في كل تجميع كما هو موضح للتو.ثم تقسيم بيانات كثافة الفلوريسنس الحية من قبل بيانات كثافة الفلوريسنس الميتة للحصول على نسبة كثافة الفلورسين الحية إلى الميتة. في هذه التجربة التمثيلية، تم التعامل مع البكتيريا الإيجابية غير المُزكَّمة، أو البيلي المجمعة أو المجمعة والملتبة بالبكتيريا الإيجابية البيلية مع التخفيفات التسلسلية من سيفترياكسون قبل قياس مستويات ATP الخاصة بها. أظهر GC المُجَرَّز مسبقاً بقاء أعلى بكثير من غير المجمع أو التجميع الذي تعطل GC عند معالجته بتركيزات متساوية من سيفترياكسون أو أعلى.أظهرت السلالات الإيجابية بيلي التي تشكل مجاميع أكبر أعلى مستويات ATP بعد العلاج ceftriaxone مقارنة سلالات متحولة. بغض النظر عن سلالة اختبارها، حية / ميتة تلطيخ قبل العلاج بالمضادات الحيوية كشفت البكتيريا الميتة تقع إلى حد كبير في الطبقات الخارجية من الثقافة، في حين تم تحديد GC الحية أساسا ضمن جوهر المجاميع المعالجة ceftriaxone. كما هو متوقع، شكلت البكتيريا الإيجابية بيلي أكبر المجاميع، في حين شكلت الثقافات السلبية بيلي أصغر.وتجدر الإشارة إلى أن المجاميع الإيجابية بيلي كانت لا تزال على قيد الحياة في طبقاتها الأساسية بعد العلاج بالمضادات الحيوية، في حين أن GC في المجاميع الصغيرة فضفاضة متحولة كانت ميتة. استناداً إلى حجم وبقاء GC، يمكن رسم رسم بياني ارتباط لدراسة العلاقة بين حجم التجميع وبقاء المضادات الحيوية للبكتيريا. سونيكيشن مهم للتأكد من أن يتم تحرير ATP من كل بكتيريا فردية داخل المجاميع ملزمة بإحكام.وإلا فإن القياسات لن تكون متسقة. من المهم أن لوحة البكتيريا بعد تجميعها ويتم علاجها بالمضادات الحيوية لقياس كل من البكتيريا القابلة للحياة وقادرة على النسخ المتماثل. هذه التقنية يقيس تأثير تجميع البكتيريا على قابلية المضادات الحيوية مما يسمح للباحثين لتطوير أدوية أفضل لعلاج الأمراض.

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei

Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei

النظر في هيكل G - المتراكمة في التيلومير المثقبية البروسية</em

The telomere G-overhang structure has been identified in many eukaryotes including yeast, vertebrates, and Trypanosoma brucei. It serves as the substrate ...

Visualisation and Quantification of Intracellular Interactions of Neisseria meningitidis and Human &alpha;-actinin by Confocal Imaging

Visualisation and Quantification of Intracellular Interactions of Neisseria meningitidis and Human ÃƒÅ½Ã‚Â±-actinin by Confocal Imaging

التخيل والكمي لالتفاعلات داخل الخلايا النيسرية السحائية والإنسان α - actinin بواسطة التصوير متحد البؤر

The Opc protein of Neisseria meningitidis (Nm, meningococcus) is a surface-expressed integral outer membrane protein, which can act as an adhesin and an ...

Quantitative Analyses of all Influenza Type A Viral Hemagglutinins and Neuraminidases using Universal Antibodies in Simple Slot Blot Assays

نوع التحاليل الكمية للجميع الأنفلونزا من Hemagglutinins الفيروسية وNeuraminidases باستخدام الاجسام المضادة العالمي في فتحة بسيطة فحوصات لطخة

Hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA) are two surface proteins of influenza viruses which are known to play important roles in the viral life cycle ...

Examination of Thymic Positive and Negative Selection by Flow Cytometry

دراسة التوتة اختيار الإيجابية والسلبية من قياس التدفق الخلوي

A healthy immune system requires that T cells respond to foreign  antigens while remaining tolerant to self-antigens. Random rearrangement of the  T cell ...

Preparation of a Blood Culture Pellet for Rapid Bacterial Identification and Antibiotic Susceptibility Testing

إعداد ثقافة بيليه الدم الجرثومي السريع لتحديد واختبار حساسية المضادات الحيوية

Bloodstream infections and sepsis are a major cause of morbidity and mortality. The successful outcome of patients suffering from bacteremia depends on a ...

Qualitative and Quantitative Assays for Detection and Characterization of Protein Antimicrobials

فحوصات النوعية والكمية للكشف وتوصيف مضادات الميكروبات البروتين

Initial evaluations of large microbial libraries for potential producers of novel antimicrobial proteins require both qualitative and quantitative methods ...

Targeting Biofilm Associated Staphylococcus aureus Using Resazurin Based Drug-susceptibility Assay

Targeting Biofilm Associated Staphylococcus aureus Using Resazurin Based Drug-susceptibility Assay

استهداف بيوفيلم أسوشيتد<em&gt; المكورات العنقودية الذهبية</em&gt; استخدام ريسازورين استنادا الفحص المخدرات-القابلية

Most pathogenic bacteria are able to form biofilms during infection, but due to the difficulty of manipulating and assessing biofilms, the vast majority ...

Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment

Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment

دراسة الظواهر المضيف في<em&gt; affinis الجمبوزيا</em&gt; وبعد المضادات الحيوية العلاج

The commonality of antibiotic usage in medicine means that understanding the resulting consequences to the host is vital. Antibiotics often decrease host ...

Quantitative Polymerase Chain Reaction-based Analyses of Murine Intestinal Microbiota After Oral Antibiotic Treatment

تحليلات تستند إلى سلسلة من ردود الفعل بوليميريز الكمية الحجمية المعوية مورين بعد العلاج بالمضادات الحيوية عن طريق الفم

The gut microbiota has a central influence on human health. Microbial dysbiosis is associated with many common immunopathologies such as inflammatory ...

Antibiotic Dereplication Using the Antibiotic Resistance Platform

المضادات الحيوية Dereplication باستخدام منصة مقاومه المضادات الحيوية

One of the main challenges in the search for new antibiotics from natural product extracts is the re-discovery of common compounds. To address this ...