Name: quantitative examination of antibiotic susceptibility of neisseria gonorrhoeae aggregates using atp-utilization commercial assays and live/dead staining
Uploaded: 2019-02-08T14:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining at Jo

Dit werk werd gesteund door een subsidie van de National Institute of Health W.S. AI123340 te D.C.S.. L.-C.W., J.W., AC, en E.N. werden ondersteund in het onderdeel/deelname aan "The eerstejaars innovatie & onderzoek Experience"-programma gefinancierd door de Universiteit van Maryland. De financiers had geen rol in de studie ontwerp, gegevensverzameling en analyse, besloten tot bekendmaking van, of de bereiding van het manuscript. Wij erkennen de UMD CBMG Imaging Core voor alle microscopie experimenten.

1. algemeen onderhoud van GC stammen
<ol><li>Strijk N. gonorrhoeae -stammen op GCK agar met 1% Kellogg18 (tabel 1, tabel 2) uit de vriezer voorraden aanvult en incubeer 37 ° C met 5% CO2 voor 16-18 h. gebruik MS11 uiting van fase-variabele Opa (MS11Opa +), geen Opa (MS11ΔOpa), of een afgekapte LOS (MS11ΔLgtE).</li>
	<li>Kies zorgvuldig pili negatieve (kolonie zonder donkere rand) of positieve (kolonie met donkere rand) kolonies van elke stam op basis van d...

<ol>
	<li>den Heijer, C. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+comprehensive+overview+of+urogenital,+anorectal+and+oropharyngeal+Neisseria+gonorrhoeae+testing+and+diagnoses+among+different+STI+care+providers:+a+cross-sectional+study.">A comprehensive overview of urogenital, anorectal and oropharyngeal Neisseria gonorrhoeae testing and diagnoses among different STI care providers: a cross-sectional study.</a> BMC Infectious Diseases. 17 (1), (2017).</li><li>Hein, K., Marks, A., Cohen, M. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Asymptomatic+gonorrhea:+prevalence+in+a+population+of+urban+adolescents.">Asymptomatic gonorrhea: prevalence in a population of urban adolescents.</a> The Journal of Pediatrics. 90 (4), 634-635 (1977).</li><li>Hananta, I. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gonorrhea+in+Indonesia:+High+Prevalence+of+Asymptomatic+Urogenital+Gonorrhea+but+No+Circulating+Extended+Spectrum+Cephalosporins-Resistant+Neisseria+gonorrhoeae+Strains+in+Jakarta,+Yogyakarta,+and+Denpasar,+Indonesia.">Gonorrhea in Indonesia: High Prevalence of Asymptomatic Urogenital Gonorrhea but No Circulating Extended Spectrum Cephalosporins-Resistant Neisseria gonorrhoeae Strains in Jakarta, Yogyakarta, and Denpasar, Indonesia.</a> Sexually Transmitted Diseases. 43 (10), 608-616 (2016).</li><li>Chlamydia, W. H. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chlamydia+trachomatis,+Neisseria+gonorrhoeae,+syphilis+and+Trichomonas+vaginalis.+Methods+and+results+used+by+WHO+to+generate+2005+estimates.+World+Health+Organisation,+2011.+Prevalence+and+incidence+of+selected+sexually+transmitted+infections.">Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, syphilis and Trichomonas vaginalis. Methods and results used by WHO to generate 2005 estimates. World Health Organisation, 2011. Prevalence and incidence of selected sexually transmitted infections.</a> World Health Organisation. , (2011).</li><li>Mayor, M. T., Roett, M. A., Uduhiri, K. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Diagnosis+and+management+of+gonococcal+infections.">Diagnosis and management of gonococcal infections.</a> American Family Physician. 86 (10), 931-938 (2012).</li><li>Alirol, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multidrug-resistant+gonorrhea:+A+research+and+development+roadmap+to+discover+new+medicines.">Multidrug-resistant gonorrhea: A research and development roadmap to discover new medicines.</a> PLOS Medicine. 14 (7), (2017).</li><li>Workowski, K. A., Bolan, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sexually+transmitted+diseases+treatment+guidelines,+2015.">Sexually transmitted diseases treatment guidelines, 2015.</a> MMWR Recommendations and Reports. 64, 1-137 (2015).</li><li>Lahra, M. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cooperative+Recognition+of+Internationally+Disseminated+Ceftriaxone-Resistant+Neisseria+gonorrhoeae+Strain.">Cooperative Recognition of Internationally Disseminated Ceftriaxone-Resistant Neisseria gonorrhoeae Strain.</a> Emerging Infectious Diseases. 24 (4), (2018).</li><li>Wi, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antimicrobial+resistance+in+Neisseria+gonorrhoeae:+Global+surveillance+and+a+call+for+international+collaborative+action.">Antimicrobial resistance in Neisseria gonorrhoeae: Global surveillance and a call for international collaborative action.</a> PLOS Medicine. 14 (7), 1002344 (2017).</li><li>Singh, S., Singh, S. K., Chowdhury, I., Singh, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Understanding+the+Mechanism+of+Bacterial+Biofilms+Resistance+to+Antimicrobial+Agents.">Understanding the Mechanism of Bacterial Biofilms Resistance to Antimicrobial Agents.</a> Open Microbiology Journal. 11, 53-62 (2017).</li><li>Greiner, L. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilm+Formation+by+Neisseria+gonorrhoeae.">Biofilm Formation by Neisseria gonorrhoeae.</a> Infection and Immunity. 73 (4), 1964-1970 (2005).</li><li>Zollner, R., Oldewurtel, E. R., Kouzel, N., Maier, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phase+and+antigenic+variation+govern+competition+dynamics+through+positioning+in+bacterial+colonies.">Phase and antigenic variation govern competition dynamics through positioning in bacterial colonies.</a> Scientific Reports. 7 (1), (2017).</li><li>Stein, D. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Expression+of+Opacity+Proteins+Interferes+with+the+Transmigration+of+Neisseria+gonorrhoeae.+across+Polarized+Epithelial+Cells.">Expression of Opacity Proteins Interferes with the Transmigration of Neisseria gonorrhoeae. across Polarized Epithelial Cells.</a> PLoS One. 10 (8), 0134342 (2015).</li><li>LeVan, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Construction+and+characterization+of+a+derivative+of+Neisseria+gonorrhoeae+strain+MS11+devoid+of+all+opa+genes.">Construction and characterization of a derivative of Neisseria gonorrhoeae strain MS11 devoid of all opa genes.</a> Journal of Bacteriology. 194 (23), 6468-6478 (2012).</li><li>Merritt, J. H., Kadouri, D. E., O'Toole, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Growing+and+analyzing+static+biofilms.">Growing and analyzing static biofilms.</a> Curr Protoc Microbiol. , (2005).</li><li>Peeters, E., Nelis, H. J., Coenye, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+multiple+methods+for+quantification+of+microbial+biofilms+grown+in+microtiter+plates.">Comparison of multiple methods for quantification of microbial biofilms grown in microtiter plates.</a> Journal of Microbiological Methods. 72 (2), 157-165 (2008).</li><li>White, L. A., Kellogg, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neisseria+Gonorrhoeae+Identification+in+Direct+Smears+by+a+Fluorescent+Antibody-Counterstain+Method.">Neisseria Gonorrhoeae Identification in Direct Smears by a Fluorescent Antibody-Counterstain Method.</a> Journal of Applied Microbiology. 13, 171-174 (1965).</li><li>Swanson, J., Kraus, S. J., Gotschlich, E. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Studies+on+gonococcus+infection.+I.+Pili+and+zones+of+adhesion:+their+relation+to+gonococcal+growth+patterns.">Studies on gonococcus infection. I. Pili and zones of adhesion: their relation to gonococcal growth patterns.</a> Journal of Experimental Medicine. 134 (4), 886-906 (1971).</li><li>Herten, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+in+Vitro+Quantification+of+S.+aureus+Biofilms+on+Vascular+Graft+Surfaces.">Rapid in Vitro Quantification of S. aureus Biofilms on Vascular Graft Surfaces.</a> Frontiers in Microbiology. 8, 2333 (2017).</li><li>Gracia, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vitro+development+of+Staphylococcus+aureus+biofilms+using+slime-producing+variants+and+ATP-bioluminescence+for+automated+bacterial+quantification.">In vitro development of Staphylococcus aureus biofilms using slime-producing variants and ATP-bioluminescence for automated bacterial quantification.</a> Luminescence. 14 (1), 23-31 (1999).</li><li>Webb, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+death+in+Pseudomonas+aeruginosa+biofilm+development.">Cell death in Pseudomonas aeruginosa biofilm development.</a> Journal of Bacteriology. 185 (15), 4585-4592 (2003).</li><li>Jurcisek, J. A., Dickson, A. C., Bruggeman, M. E., Bakaletz, L. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vitro+biofilm+formation+in+an+8-well+chamber+slide.">In vitro biofilm formation in an 8-well chamber slide.</a> Journal of visualized experiments. (47), (2011).</li><li>Wang, L. C., Litwin, M., Sahiholnasab, Z., Song, W., Stein, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neisseria+gonorrhoeae+Aggregation+Reduces+Its+Ceftriaxone+Susceptibility.">Neisseria gonorrhoeae Aggregation Reduces Its Ceftriaxone Susceptibility.</a> Antibiotics (Basel). 7 (2), (2018).</li><li>Lebeaux, D., Ghigo, J. M., Beloin, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilm-related+infections:+bridging+the+gap+between+clinical+management+and+fundamental+aspects+of+recalcitrance+toward+antibiotics.">Biofilm-related infections: bridging the gap between clinical management and fundamental aspects of recalcitrance toward antibiotics.</a> Microbiology and Molecular Biology Reviews. 78 (3), 510-543 (2014).</li><li>Hall-Stoodley, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Towards+diagnostic+guidelines+for+biofilm-associated+infections.">Towards diagnostic guidelines for biofilm-associated infections.</a> FEMS Immunology and Medical Microbiology. 65 (2), 127-145 (2012).</li></ol>

Bacteriën kunnen vormen biofilms tijdens infectie van het menselijk lichaam. Traditionele MIC testen kan niet overeen met de concentratie die nodig zijn voor de uitroeiing van bacteriën in een biofilm. Om te testen antimicrobiële stoffen effecten op een biofilm, kunnen de methoden op basis van biofilm biomassa evenals plating CFUs verkeerde als gevolg van de impact van biofilm structuur. Bijvoorbeeld, werkt de plating-methode alleen als de biofilm kan worden verstoord. Vandaar, de CFU verkregen kan lager zijn dan het ...

Gonorroe is dat een seksueel overdraagbare infecties (SOA)1. Neisseria gonorrhoeae (GC), een gram-negatieve bacterie diplococcal, is de verwekker van de ziekte. Symptomen van genitale infectie kunnen leiden tot pijn tijdens het plassen, gegeneraliseerde genitale pijn en urethrale kwijting. -Infectie is vaak asymptomatisch2,3,4,5, en dit zorgt voor uitgebreide kolonisatie. Deze onbehandelde infecties zijn een belangrijke gezondheids-zorg, zoals ze het potentieel hebben om de transmissie van het organisme en dit kan leiden tot complicaties, zoals pelvic inflammatory disease (PID) en verspreid gonococcal infectie (DGI)6. Antibiotica-resistente gonorroe is een belangrijke volksgezondheid crisis en een toenemende sociaal-economische last7. Verminderde gevoeligheid voor cefalosporines heeft geresulteerd in behandeling regime verandering van een enkel antibioticum naar dual therapie, die azithromycine of doxycycline met ceftriaxone8 combineert. De grotere mislukking van ceftriaxone en azithromycine9,10, in combinatie met asymptomatische infecties, benadrukt de noodzaak voor het begrijpen van gonorroe behandeling mislukkingen.
De minimale remmende concentratie (MIC) test, met inbegrip van agar verdunning en disc diffusie proeven, is gebruikt als de standaard medische test voor het identificeren van de weerstand tegen een antibioticum. Het is echter onduidelijk of de MIC test bacteriële resistentie tegen antibiotica in vivo weerspiegelt. De vorming van bacteriële biofilms draagt bij tot het voortbestaan van de bacteriën in aanwezigheid van de bactericide concentraties van antibiotica: het testen van de MIC is niet in staat om te ontdekken dit effect11. Omdat GC biofilms op mucosal oppervlakken12 vormen kan, we veronderstellen dat antibiotica gevoeligheid binnen aggregaten zou verschillen van die in afzonderlijke GC gezien. Bovendien, hebben studies aangetoond dat drie variabele oppervlakte moleculen, Pili, dekking-geassocieerde proteïne (Opa fasen), en lipooligosaccharides (LOS), die tussen bacterie interacties regelen, tot verschillende formaat aggregaten13, leiden 14 , 15. de bijdrage van deze componenten tot resistentie tegen antibiotica is niet onderzocht vanwege het ontbreken van goede methoden.
Momenteel zijn er verschillende methoden voor het meten van biofilm uitroeiing. De meest gebruikte kwantitatieve methode is door het meten van de veranderingen in de biomassa met behulp van crystal violet kleuring van16. De methode vereist echter aanzienlijke experimentele manipulatie, die mogelijk fouten in experiment herhaald17 genereren kunt. De live/dead kleuringstechniek gebruikt hier kunt visualisatie van levende en dode bacteriën en hun verdeling binnen de biofilm. Echter kan de structuur van de biofilm opleveren als een fysieke barrière die kleurstofpenetratie vermindert. Daarom, om te kwantificeren live/dode bacteriën binnen een groep, de kleuring is beperkt tot kleine biofilms of zijn voorloper-microcolonies of samenvoegingen. Andere methoden, met inbegrip van de agar verdunning en schijf diffusie proeven, kunnen niet voor het meten van de effecten van aggregatie. Te onderzoeken GC gevoeligheid binnen aggregatie na antibiotica blootstelling, een ideale methode zou moeten hebben zowel een kwantitatieve bepaling dat kan meten bacteriën leven en visualiseren van hun distributie.
De hier beschreven procedure combineert een ATP-benutting-meting en een leven/dood kleuring assay aan kwantitatief en visueel onderzoekt de GC gevoeligheid binnen aggregaten in aanwezigheid van antibiotica.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:837px;" width="837">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">100x Kellogg&#39;s supplement</td>
			<td style="width:229px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Agar</td>
			<td style="width:229px;">United States Biological</td>
			<td style="width:119px;">A0930</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">BacTiter Assay&#160;</td>
			<td style="width:229px;">Promega</td>
			<td style="width:119px;">G8232</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Ceftriaxone</td>
			<td style="width:229px;">TCI</td>
			<td style="width:119px;">C2226</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Difco GC medium base&#160;</td>
			<td style="width:229px;">BD</td>
			<td style="width:119px;">228950</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ferric nitrate, nonahydrate&#160;</td>
			<td style="width:229px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">254223-10G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Glucose</td>
			<td style="width:229px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP350-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">L-glutamine Crystalline Powder</td>
			<td style="width:229px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP379-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">BacLight live/dead staining</td>
			<td style="width:229px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">L7012</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">MS11 Neisseria gonorrhoeae strain</td>
			<td style="width:229px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>kindly provided by Dr. Herman Schneider, Walter Reed Army Institute for Research</td>
		</tr>
		<tr height="26">
			<td height="26" style="height:26px;width:323px;">Potassium phosphate dibasic (K2HPO4)</td>
			<td style="width:229px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">P290-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="26">
			<td height="26" style="height:26px;">Potassium phosphate monobasic (KH2PO4)</td>
			<td style="width:229px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP329-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Proteose Peptone&#160;</td>
			<td style="width:229px;">BD Biosciences</td>
			<td align="right" style="width:119px;">211693</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Sodium chloride (NaCl)</td>
			<td style="width:229px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">S671-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Soluble Starch</td>
			<td style="width:229px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">S9765</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Thiamine pyrophosphate</td>
			<td style="width:229px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">C8754-5G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Equipment</td>
			<td style="width:229px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Petri Dishes</td>
			<td style="width:229px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">25384-302</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">8-well coverslip-bottom chamber&#160;</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">155411</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">96-well tissue culture plates&#160;</td>
			<td>Corning, Falcon</td>
			<td style="width:119px;">3370</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:323px;">Biosafety Cabinet (NU-425-600 Class II, A2 Laminar Flow Biohazard Hood)</td>
			<td style="width:229px;">Nuaire</td>
			<td style="width:119px;">32776</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="26">
			<td height="26" style="height:26px;width:323px;">CO2 Incubator</td>
			<td style="width:229px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">&#160;Model 3530</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:323px;">Confocal microscope equipped with live imaging chamber</td>
			<td style="width:229px;">Leica</td>
			<td style="width:119px;">SP5X</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Corning&#160; 96 Well Black Polystyrene Microplate&#160;</td>
			<td style="width:229px;">Corning</td>
			<td style="width:119px;">3904</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Glomax Illuminator&#160;</td>
			<td style="width:229px;">Promega</td>
			<td style="width:119px;">E6521</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Pipette tips (0.1-10 &#181;L)</td>
			<td style="width:229px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">02-717-133</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Pipette tips (1000 &#181;L)</td>
			<td>VWR</td>
			<td style="width:119px;">83007-382</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Pipette tips (200 &#181;L)</td>
			<td style="width:229px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">53509-007</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Spectrophotometer Ultrospec 2000 UV</td>
			<td style="width:229px;">Pharmacia Biotech</td>
			<td style="width:119px;">80-2106-00</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Sterile 15 ml conical tubes</td>
			<td style="width:229px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">21008-216</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:323px;">Sterile Microcentrifuge Tubes (1.7 mL)</td>
			<td style="width:229px;">Sorenson BioScience</td>
			<td style="width:119px;">16070</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Sterile polyester-tipped applicators</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>23-400-122</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:323px;">Sonicator</td>
			<td style="width:229px;">Kontes</td>
			<td style="width:119px;">Equivelent to 9110001</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

quantitative examination of antibiotic susceptibility of neisseria gonorrhoeae aggregates using atp-utilization commercial assays and live/dead staining

De opkomst van antibiotica resistente Neisseria gonorrhoeae (GC) is een wereldwijd gezondheidsbedreiging en wijst op de noodzaak om te identificeren van individuen die niet van de behandeling. Deze gram-negatieve bacterie veroorzaakt gonorroe uitsluitend bij mensen. Tijdens de infectie is het kundig voor formulier aggregaten en/of biofilms. De minimale remmende concentratie (MIC) test wordt gebruikt om te bepalen van de gevoeligheid voor antibiotica en definiëren passende behandeling. Het mechanisme van de uitroeiing in vivo en haar relatie tot laboratoriumresultaten zijn echter niet bekend. Een methode die bespreekt hoe de GC aggregatie beïnvloedt antibiotische gevoeligheid en toont de relatie tussen de totale omvang en antibiotische gevoeligheid werd ontwikkeld. Wanneer GC aggregaat, ze meer resistent tegen antibiotica doden zijn, surviving met de bacteriën in het midden ceftriaxone behandeling beter dan die in de periferie. De gegevens wijzen erop dat N. gonorrhoeae aggregatie zijn gevoeligheid voor ceftriaxone, die niet wordt weerspiegeld met behulp van de standaard agar plaat gebaseerde MIC methoden kan verminderen. De methode die wordt gebruikt in deze studie zal de onderzoekers voor het testen van bacteriële gevoeligheid onder klinisch relevante voorwaarden toestaan.

Twee methoden werden gebruikt: een ATP gebruik assay en een kwantitatieve analyse voor de kleuring van leven/dood. De resultaten kunnen worden gecombineerd of afzonderlijk gebruikt voor de behandeling van bacteriële voortbestaan binnen aggregaten na behandeling met antibiotica. De ATP gebruik assay gebleken voor het meten van nauwkeurig levensvatbare bacteriën in S. aureus biofilms20,21. Hier, werd MS11Opa + Pil + spann...

Watch this Scientific Journal Video about Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining at Jo

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

Een eenvoudige ATP-metende assay en leven/dood kleuring methode dienden te kwantificeren en te visualiseren van Neisseria gonorrhoeae voortbestaan na de behandeling met ceftriaxone. Dit protocol kan worden uitgebreid tot de antimicrobiële gevolgen van een antibioticum en kan worden gebruikt voor het definiëren van de minimale remmende concentratie van antibiotica in bacteriële biofilms.

Kwantitatieve onderzoek van antibiotische gevoeligheid van Neisseria gonorrhoeae met behulp van aggregaten ATP-gebruik commerciële testen en Live/Dead vlekken

The emergence of antibiotic resistant Neisseria gonorrhoeae (GC) is a worldwide health threat and highlights the need to identify individuals who fail ...

Deze techniek stelt ons in staat om antibiotica gevoeligheid te meten onder meer klinisch relevante omstandigheden. De techniek stelt ons ook in staat om de ware antibioticaconcentratie te bepalen die bacteriën in aggregaten kan doden. Deze techniek kan worden toegepast op het bepalen van de concentratie die nodig is voor het elimineren van GC aggregaten.De methode kan ook worden toegepast op het meten van de antimicrobiële gevoeligheid van alle bacteriën die in staat is om aggregaten te vormen. Let goed op de lyse-stappen om ervoor te zorgen dat de lyse compleet is. Anders zal de ATP-meettest het aantal levensvatbare bacteriën onderschatten.Visualisatie van deze methode zal andere onderzoekers in staat stellen om dit experiment te volgen en te repliceren met consistentie. Begin met het strepen neisseria gonorrhoeae, of GC stammen, op GCK agar aangevuld met 1%Kellogg voor een 16 tot 18-uurs incubatie bij 37 graden Celsius en 5% kooldioxide. De volgende ochtend, gebruik maken van een lichtmicroscoop om zorgvuldig te selecteren pili-negatieve kolonies zonder donkere randen of pili-positieve kolonies met donkere randen van elke plaat, en streep de geplukte kolonies op nieuwe GCK platen voor een 16 tot 18-uurs cultuur op 37 graden Celsius en 5% kooldioxide.De volgende ochtend, gebruik maken van een steriele applicator om GC kolonies te verzamelen van elke plaat en resuspend elk wattenstaafje in warme bouillon aangevuld met 4,2% natriumbicarbonaat en 1%Kellogg oplossing. Meet de optische dichtheid op 650 nanometer, of OD650, om de concentratie van de zwevende bacteriën te bepalen en de GC-concentratie aan te passen op ongeveer één keer 10 tot de acht kolonievormende eenheden per milliliter. Voeg vervolgens 99 microliters van de GC-suspensie toe aan individuele putten van een 96-putplaat en laat de bacteriën zes uur lang opgaan bij 37 graden Celsius en 5%kooldioxide.Voeg aan het einde van de incubatie een microliter van serieel verdunde ceftriaxon toe aan elke put, waardoor sommige putten onbehandeld blijven om te dienen als bedieningselementen en de plaat nog 24 uur terug te brengen naar de couveuse. De volgende dag, sonicate de schorsing in elke put drie keer op 144 watt en 20 kilohertz voor vijf seconden per sonicatie en voeg 100 microliters van commercieel beschikbare ATP gebruik gloed reagens aan elke put. Breng voorzichtig 150 microliter mengsel van elke put over in individuele putten van een nieuwe 96-bron zwarte microplaat en meet de absorptie van elke put op 560 nanometer op een plaatlezer.Bereken vervolgens de overlevingskans met de verhouding van de meting verkregen na seriële antibioticabehandeling tot de meting van de onbehandelde putten. Voor visualisatie van de levende/dode GC aggregaten, gebruik een steriele applicator om GC te verzamelen van de 's nachts gekweekte platen en resuspend de GC in voorverwarmd GCP medium aangevuld met 1%Kellogg. Meet de OD650 door spectrofotometrie en pas de concentratie aan ongeveer één keer 10 aan de zeven kolonievormende eenheden per milliliter.Voeg vervolgens 198 microliters GC-suspensie toe in acht-goed coverslip-bottom kamers en broed de kamers uit op 37 graden Celsius en 5% kooldioxide gedurende zes uur. Behandel de bacteriën aan het einde van de incubatie met twee microliter ceftriaxon per aggregatieaandoening en breng de kamers terug naar de couveuse voor de juiste experimentele incubatieperiode. Voeg aan het einde van de incubatie 0,6 microliter levende/dode kleuroplossing toe in elke put en breng de kamers nog 20 minuten terug naar de couveuse.Gebruik vervolgens een confocale microscoop om z-serie beelden te verkrijgen. Open voor het meten van de grootte van de GC-aggregaten de eerste afbeelding in ImageJ en selecteer lijnen uit de vrije hand om het gebied van elke aggregatie in de afbeelding te omcirkelen. Klik op analyseren en meten.De grootte van de aggregaten wordt aangegeven onder de gebiedskolom. Voor kwantificering van de fluorescentieintensiteitsverhouding van de levende tot dode kleuring in elk aggregaat, klikt u op analyseren en instellen van metingen en controleer de geïntegreerde dichtheid in het pop-upvenster. Klik op OK en klik op afbeelding, kleur en kanalen.Selecteer kleur en kanaal een als de fluorescentie voor dode bacteriën vlekken. Selecteer lijnen uit de vrije hand om het gebied van elke aggregatie te omcirkelen en klik op analyseren en meten om de fluorescentieintensiteitsverhouding voor elk aggregaat in de geïntegreerde dichtheidskolom te verkrijgen. Selecteer kanaal twee voor de fluorescentie voor de levende bacteriële kleuring en meet de fluorescentieintensiteit in elk aggregaat zoals zojuist is aangetoond.Verdeel vervolgens de live fluorescentieintensiteitsgegevens door de gegevens over de dode fluorescentieintensiteit om de live tot dode fluorescentieintensiteit te verkrijgen. In dit representatieve experiment werden niet-samengevoegde pili-positieve, geaggregeerde pili-positieve of geaggregeerde en verstoorde pili-positieve bacteriën behandeld met seriële verdunningen van ceftriaxon vóór het meten van hun ATP-niveaus. Vooraf afgesproken GC toonde een aanzienlijk hogere overleving aan dan niet-geaggregeerde of aggregatie verstoorde GC wanneer behandeld met gelijke concentraties ceftriaxon of hoger.Pili-positieve stammen die grotere aggregaten vormen vertoonden de hoogste ATP-niveaus na ceftriaxonbehandeling in vergelijking met de gemuteerde stammen. Ongeacht de geteste stam, levend / dood vlekken voor de behandeling met antibiotica bleek dode bacteriën grotendeels gelegen op de buitenste lagen van de cultuur, terwijl levende GC werden geïdentificeerd voornamelijk binnen de kern van ceftriaxon behandelde aggregaten. Zoals verwacht vormden pili-positieve bacteriën de grootste aggregaten, terwijl pili-negatieve culturen de kleinste vormden.Met name pili-positieve aggregaten waren nog in leven in hun kernlagen na behandeling met antibiotica, terwijl GC in de kleine, losse mutant aggregaten dood waren. Op basis van de grootte en overleving van de GC kan een correlatiegrafiek worden uitgezet om de relatie tussen de aggregatiegrootte en de overleving van antibiotica van de bacteriën te onderzoeken. Sonicatie is belangrijk om ervoor te zorgen dat ATP van elke individuele bacterie wordt vrijgegeven binnen de nauw gebonden aggregaten.Anders zijn de metingen niet consistent. Het is belangrijk om de bacteriën te plaaten nadat ze aggregaat en worden behandeld met antibiotica om zowel de levensvatbare als de replicatie-geschikte bacteriën te meten. De techniek meet de bacteriën aggregatie invloed op antibiotica gevoeligheid waardoor onderzoekers om betere geneesmiddelen te ontwikkelen voor de behandeling van ziekten.

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei

Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei

Onderzoek van de telomeren G-overhang Structuur in Trypanosoma brucei</em

The telomere G-overhang structure has been identified in many eukaryotes including yeast, vertebrates, and Trypanosoma brucei. It serves as the substrate ...

Visualisation and Quantification of Intracellular Interactions of Neisseria meningitidis and Human &alpha;-actinin by Confocal Imaging

Visualisation and Quantification of Intracellular Interactions of Neisseria meningitidis and Human ÃƒÅ½Ã‚Â±-actinin by Confocal Imaging

Visualisatie en kwantificering van intracellulaire interacties van Neisseria meningitidis En Human α-actinine door Confocale Imaging

The Opc protein of Neisseria meningitidis (Nm, meningococcus) is a surface-expressed integral outer membrane protein, which can act as an adhesin and an ...

Quantitative Analyses of all Influenza Type A Viral Hemagglutinins and Neuraminidases using Universal Antibodies in Simple Slot Blot Assays

Kwantitatieve analyses van alle Influenza A Virale Hemagglutinins en neuraminidases gebruik van Universal Antistoffen Type in de eenvoudige Slot Blot Assays

Hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA) are two surface proteins of influenza viruses which are known to play important roles in the viral life cycle ...

Examination of Thymic Positive and Negative Selection by Flow Cytometry

Onderzoek van thymus positieve en negatieve selectie via flowcytometrie

A healthy immune system requires that T cells respond to foreign  antigens while remaining tolerant to self-antigens. Random rearrangement of the  T cell ...

Preparation of a Blood Culture Pellet for Rapid Bacterial Identification and Antibiotic Susceptibility Testing

Voorbereiding van een Bloed Cultuur Pellet voor snelle identificatie van bacteriën en antibiotica gevoeligheid testen

Bloodstream infections and sepsis are a major cause of morbidity and mortality. The successful outcome of patients suffering from bacteremia depends on a ...

Qualitative and Quantitative Assays for Detection and Characterization of Protein Antimicrobials

Kwalitatieve en Kwantitatieve Testen voor detectie en karakterisering van proteïne Antimicrobials

Initial evaluations of large microbial libraries for potential producers of novel antimicrobial proteins require both qualitative and quantitative methods ...

Targeting Biofilm Associated Staphylococcus aureus Using Resazurin Based Drug-susceptibility Assay

Targeting Biofilm Associated Staphylococcus aureus Using Resazurin Based Drug-susceptibility Assay

Gericht op biofilm geassocieerde<em&gt; Staphylococcus aureus</em&gt; Met behulp van Resazurin Gebaseerd Drug-gevoeligheid Assay

Most pathogenic bacteria are able to form biofilms during infection, but due to the difficulty of manipulating and assessing biofilms, the vast majority ...

Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment

Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment

Onderzoek van Host Phenotypes in<em&gt; Gambusia affinis</em&gt; Na een behandeling met antibiotica

The commonality of antibiotic usage in medicine means that understanding the resulting consequences to the host is vital. Antibiotics often decrease host ...

Quantitative Polymerase Chain Reaction-based Analyses of Murine Intestinal Microbiota After Oral Antibiotic Treatment

Kwantitatieve Polymerase Chain Reaction gebaseerde Analyses van lymfkliertest intestinale Microbiota na behandeling met mondelinge antibiotica

The gut microbiota has a central influence on human health. Microbial dysbiosis is associated with many common immunopathologies such as inflammatory ...

Antibiotic Dereplication Using the Antibiotic Resistance Platform

Antibiotica-Dereplicatie met behulp van het antibioticumresistentie platform

One of the main challenges in the search for new antibiotics from natural product extracts is the re-discovery of common compounds. To address this ...