Name: automated measurements of sleep and locomotor activity in mexican cavefish
Uploaded: 2019-03-21T14:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Automated Measurements of Sleep and Locomotor Activity in Mexican Cavefish at JoVE.com

Ce travail a été soutenu par NIGM prix GM127872 ACK, NINDS prix 105072 ERD et ACK et NSF prix 1656574 d’accusé de réception.

Remarque : Mettre en place les systèmes pour le suivi comportemental chez les larves et les adultes.
1. construction d’un système de sommeil pour les larves
Remarque : Le système de surveillance pour le suivi des larve à travers les poissons juvéniles âgés de 4 jours après la fécondation (dpf) par le biais de dpf 30 a. mexicanus nécessite automatisé de multiples pièces d’équipement, y compris l’éclairage infrarouge (IR),...

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	<li>Keene, A. C., Duboue, E. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+origins+and+evolution+of+sleep.">The origins and evolution of sleep.</a> The Journal of Experimental Biology. , (2018).</li><li>Joiner, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Unraveling+the+Evolutionary+Determinants+of+Sleep.">Unraveling the Evolutionary Determinants of Sleep.</a> Current Biology. 26 (20), R1073-R1087 (2016).</li><li>Allada, R., Siegel, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Unearthing+the+phylogenetic+roots+of+sleep.">Unearthing the phylogenetic roots of sleep.</a> Current biology. 18, R670-R679 (2008).</li><li>Sehgal, A., Mignot, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetics+of+sleep+and+sleep+disorders.">Genetics of sleep and sleep disorders.</a> Cell. 146, 194-207 (2011).</li><li>Campbell, S. S., Tobler, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Animal+sleep:+a+review+of+sleep+duration+across+phylogeny.">Animal sleep: a review of sleep duration across phylogeny.</a> Neuroscience and Biobehavioral Reviews. 8, 269-300 (1984).</li><li>Raizen, D. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lethargus+is+a+Caenorhabditis+elegans+sleep-like+state.">Lethargus is a Caenorhabditis elegans sleep-like state.</a> Nature. 451, 569-572 (2008).</li><li>Geissmann, Q., Rodriguez, L. G., Beckwith, E. J., French, A. S., Jamasb, A. R., Gilestro, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ethoscopes:+An+Open+Platform+For+High-Throughput+Ethomics.">Ethoscopes: An Open Platform For High-Throughput Ethomics.</a> bioRxiv. , 113647 (2017).</li><li>Garbe, D. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Context-specific+comparison+of+sleep+acquisition+systems+in+Drosophila.">Context-specific comparison of sleep acquisition systems in Drosophila.</a> Biology Open. 4 (11), (2015).</li><li>Branson, K., Robie, A. A., Bender, J., Perona, P., Dickinson, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+ethomics+in+large+groups+of+Drosophila.">High-throughput ethomics in large groups of Drosophila.</a> Nature Methods. 6 (6), 451-457 (2009).</li><li>Gilestro, G. F., Cirelli, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PySolo:+A+complete+suite+for+sleep+analysis+in+Drosophila.">PySolo: A complete suite for sleep analysis in Drosophila.</a> Bioinformatics. 25, 1466-1467 (2009).</li><li>Swierczek, N. A., Giles, A. C., Rankin, C. H., Kerr, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+behavioral+analysis+in+C.+elegans.">High-throughput behavioral analysis in C. elegans.</a> Nature Methods. 8 (7), 592-598 (2011).</li><li>Branson, K., Robie, A. A., Bender, J., Perona, P., Dickinson, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+ethomics+in+large+groups+of+Drosophila.">High-throughput ethomics in large groups of Drosophila.</a> Nature Methods. 6, 451-457 (2009).</li><li>Rihel, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Zebrafish+behavioral+profiling+links+drugs+to+biological+targets+and+rest/wake+regulation.">Zebrafish behavioral profiling links drugs to biological targets and rest/wake regulation.</a> Science (New York, N.Y.). 327, 348-351 (2010).</li><li>Yoshizawa, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Distinct+genetic+architecture+underlies+the+emergence+of+sleep+loss+and+prey-seeking+behavior+in+the+Mexican+cavefish.">Distinct genetic architecture underlies the emergence of sleep loss and prey-seeking behavior in the Mexican cavefish.</a> BMC Biology. 13, (2015).</li><li>Chiu, C. N., Prober, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+zebrafish+sleep+and+arousal+states:+current+and+prospective+approaches.">Regulation of zebrafish sleep and arousal states: current and prospective approaches.</a> Frontiers in Neural Circuits. 7 (April), 58 (2013).</li><li>Elbaz, I., Foulkes, N. S., Gothilf, Y., Appelbaum, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Circadian+clocks,+rhythmic+synaptic+plasticity+and+the+sleep-wake+cycle+in+zebrafish.">Circadian clocks, rhythmic synaptic plasticity and the sleep-wake cycle in zebrafish.</a> Frontiers in Neural Circuits. 7, (2013).</li><li>Dubou&#233;, E. R., Keene, A. C., Borowsky, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evolutionary+convergence+on+sleep+loss+in+cavefish+populations.">Evolutionary convergence on sleep loss in cavefish populations.</a> Current Biology. 21, 671-676 (2011).</li><li>Beale, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Circadian+rhythms+in+Mexican+blind+cavefish+Astyanax+mexicanus+in+the+lab+and+in+the+field.">Circadian rhythms in Mexican blind cavefish Astyanax mexicanus in the lab and in the field.</a> Nature Communications. 4, 2769 (2013).</li><li>Keene, A. C., Yoshizawa, M., McGaugh, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Biology and Evolution of the Mexican Cavefish. , (2015).</li><li>Jeffery, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regressive+evolution+in+Astyanax+cavefish.">Regressive evolution in Astyanax cavefish.</a> Annual Review of Genetics. 43, 25-47 (2009).</li><li>Gross, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+complex+origin+of+Astyanax+cavefish.">The complex origin of Astyanax cavefish.</a> BMC Evolutionary Biology. 12, 105 (2012).</li><li>Aspiras, A., Rohner, N., Marineau, B., Borowsky, R., Tabin, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Melanocortin+4+receptor+mutations+contribute+to+the+adaptation+of+cavefish+to+nutrient-poor+conditions.">Melanocortin 4 receptor mutations contribute to the adaptation of cavefish to nutrient-poor conditions.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 112 (31), 9688 (2015).</li><li>Jaggard, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+lateral+line+confers+evolutionarily+derived+sleep+loss+in+the+Mexican+cavefish.">The lateral line confers evolutionarily derived sleep loss in the Mexican cavefish.</a> Journal of Experimental Biology. 220 (2), (2017).</li><li>Jaggard, J. B., Stahl, B. A., Lloyd, E., Prober, D. A., Duboue, E. R., Keene, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hypocretin+underlies+the+evolution+of+sleep+loss+in+the+Mexican+cavefish.">Hypocretin underlies the evolution of sleep loss in the Mexican cavefish.</a> eLife. , e32637 (2018).</li><li>Hinaux, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Developmental+Staging+Table+for+Astyanax+mexicanus+Surface+Fish+and+Pacho+&#180;n+Cavefish.">A Developmental Staging Table for Astyanax mexicanus Surface Fish and Pacho &#180;n Cavefish.</a> Zebrafish. 8 (4), 155-165 (2011).</li><li>Bill, B. R., Petzold, A. M., Clark, K. J., La Schimmenti, ., Ekker, S. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+primer+for+morpholino+use+in+zebrafish.">A primer for morpholino use in zebrafish.</a> Zebrafish. 6 (1), 69-77 (2009).</li><li>Bilandzija, H., Ma, L., Parkhurst, A., Jeffery, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+potential+benefit+of+albinism+in+Astyanax+cavefish:+downregulation+of+the+oca2+gene+increases+tyrosine+and+catecholamine+levels+as+an+alternative+to+melanin+synthesis.">A potential benefit of albinism in Astyanax cavefish: downregulation of the oca2 gene increases tyrosine and catecholamine levels as an alternative to melanin synthesis.</a> Plos One. 8 (11), e80823 (2013).</li><li>Yokogawa, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+sleep+in+zebrafish+and+insomnia+in+hypocretin+receptor+mutants.">Characterization of sleep in zebrafish and insomnia in hypocretin receptor mutants.</a> PLoS Biology. 5, 2379-2397 (2007).</li><li>Appelbaum, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sleep-wake+regulation+and+hypocretin-melatonin+interaction+in+zebrafish.">Sleep-wake regulation and hypocretin-melatonin interaction in zebrafish.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 21942-21947 (2009).</li><li>Singh, C., Oikonomou, G., Prober, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Norepinephrine+is+required+to+promote+wakefulness+and+for+hypocretin-induced+arousal+in+zebrafish.">Norepinephrine is required to promote wakefulness and for hypocretin-induced arousal in zebrafish.</a> eLife. 4 (September), (2015).</li><li>Elipot, Y., Hinaux, H., Callebert, J., R&#233;taux, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evolutionary+shift+from+fighting+to+foraging+in+blind+cavefish+through+changes+in+the+serotonin+network.">Evolutionary shift from fighting to foraging in blind cavefish through changes in the serotonin network.</a> Current Biology. 23 (1), 1-10 (2013).</li><li>Bell, M. A., Foster, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The evolutionary biology of the threespine stickleback. 584, (1994).</li><li>Seehausen, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=African+cichlid+fish:+a+model+system+in+adaptive+radiation+research.">African cichlid fish: a model system in adaptive radiation research.</a> Proceedings of Biological Sciences/The Royal Society. 273 (1597), 1987-1998 (1597).</li><li>Basolo, A. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Female+preference+predates+the+evolution+of+the+sword+in+swordtail+fish.">Female preference predates the evolution of the sword in swordtail fish.</a> Science. 250, 808-810 (1990).</li></ol>

Ce protocole décrit un système personnalisé pour quantifier le sommeil et l’activité locomotrice dans agassizii larvaire et adulte. Agassizii ont émergé comme un modèle pour l’étude de l’évolution du sommeil qui peut être utilisé pour étudier le fondement génétique et les neurones du sommeil règlement1. Les étapes critiques de ce protocole comprennent l’optimisation de l’éclairage et la qualité vidéo afin d’assurer un suivi précis qui est nécessaire pour quantifier...

Sommeil est hautement conservée tout au long du règne animal à des niveaux physiologiques, fonctionnelle et comportementale1,2,3. Tandis que le sommeil chez les animaux de laboratoire chez les mammifères est généralement évaluée au moyen des électroencéphalogrammes, des enregistrements électrophysiologiques sont moins pratiques dans des systèmes modèles génétiquement prêtent petit et donc sommeil est généralement mesurée selon le comportement3 , 4. caractéristiques comportementales associées au sommeil sont fortement conservés dans tout le règne animal et inclure le seuil d’excitation accrue, réversibilité avec stimulation et prolongée de quiescence comportementale5. Ces mesures peuvent servir à caractériser le sommeil chez les animaux allant de la ver nématode, c. elegans, à travers les humains6.
L’utilisation de quiescence comportementale pour caractériser le sommeil nécessite le logiciel de suivi automatisé. Avec le logiciel de suivi, des périodes d’activité et d’immobilité sont déterminées pendant plusieurs jours, et longues périodes d’inactivité sont classées comme dormir7,8. Ces dernières années, plusieurs systèmes de suivi ont été développés pour l’acquisition des données d’activité parmi une diversité de systèmes de petits modèles génétiquement susceptibles ; y compris les vers, les mouches des fruits et poisson9,10,11. Ces programmes sont accompagnés d’un logiciel qui permet un suivi automatisé du comportement animal, y compris les freeware open source et des logiciels disponibles dans le commerce7,12,13,14 . Ces systèmes se distinguent par leur souplesse et permettant un dépistage efficace et caractérisation des phénotypes de sommeil dans les nombreux modèles génétiquement amendables.
Une enquête génétique du sommeil dans le poisson-zèbre, Danio rerio, a abouti à l’identification de nombreux gènes et des circuits neuronaux qui régulent le sommeil15,16. Tandis que ceci a fourni un système puissant pour étudier les bases neurales de sommeil chez des animaux vertébrés de laboratoire, est beaucoup moins connu sur la façon dont le sommeil évolue et comment naturel variation contribue règlement de sommeil. Le mexicain spelaea, Astyanax mexicanus (A. mexicanus), ont évolué des différences spectaculaires dans le sommeil, l’activité locomotrice et rythmes circadiens17,18. Ces poissons existent comme les poissons de surface eyed qui peuplent les rivières du Sud du Texas et le Mexique et au moins 29 cave les populations autour de la région de la Sierra Del Abra du Nord-est du Mexique19,20,21. Remarquablement, les nombreuses différences de comportement, y compris la perte de sommeil, semblent sont apparues indépendamment dans plusieurs agassizii populations14,22. Par conséquent, agassizii fournit un modèle pour l’étude de l’évolution convergente du sommeil, rythme circadien et des comportements sociaux.
Ce protocole décrit un système pour mesurer le sommeil et le comportement locomoteur a. mexicanus larves et les adultes. Un système d’enregistrement infrarouge sur mesure permet pour l’enregistrement vidéo des animaux dans des conditions claires et foncées. Logiciel disponible dans le commerce peut être utilisé pour mesurer l’activité et des macros personnalisées sont utilisées pour quantifier plusieurs aspects d’inactivité et de déterminer les périodes de sommeil. Ce protocole décrit également les modifications expérimentales pour le suivi de l’activité de plusieurs animaux dans un réservoir, permettant d’examiner les interactions entre le sommeil et les comportements sociaux. Ces systèmes peuvent servir à mesure sommeil, le comportement de rythme circadien et l’activité locomotrice chez les espèces de poissons supplémentaires y compris le poisson-zèbre et les épinoches.

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	<tbody>
		<tr>
			<td>12V power adaptor</td>
			<td>Environmental Lights</td>
			<td>24 Watt 12 VDC Power Supply</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acrylic dividers (adults)</td>
			<td>TAP Plastic</td>
			<td></td>
			<td>Order sheets in sizes as needed</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Adult infrared light power source</td>
			<td>Environmnental Lights 24 Watt 12 VDC Power Supply</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Battery pack</td>
			<td>CyberPower</td>
			<td>CP850PFCLCD</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Camera lens (adult)</td>
			<td>Navitar Zoom 7000</td>
			<td>Zoom 7000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Camera lens (larval)</td>
			<td>Fujian 35mm f/1.7</td>
			<td>B01CHX7668</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Camera lens adapter</td>
			<td>d</td>
			<td>1524219</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Camera mount</td>
			<td>CowboyStudio Super Clamp</td>
			<td>B002LV7X1K</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fish tank</td>
			<td>Deep Blue Professional</td>
			<td>ADB11006</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Heat sink (adult)</td>
			<td>M-D Building products</td>
			<td>SKU: 61085</td>
			<td>Cut to fit</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Heat sink (larval)</td>
			<td>M-D Building products</td>
			<td>SKU: 57000</td>
			<td>Cut to fit</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Infrared lights (adults)</td>
			<td>Environmental Lights Infrared 850 nm 5050 LED strip</td>
			<td>irrf850-5050-60-reel</td>
			<td>Cut to fit</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Infrared lights (larval)</td>
			<td>LED World</td>
			<td>B00MO9H7H4</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IR-diffusing acrylic</td>
			<td>TAP Plastic</td>
			<td></td>
			<td>Order sheets in sizes as needed</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Laptop/computer</td>
			<td>N/A</td>
			<td>N/A</td>
			<td>Any laptop will work.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LED light</td>
			<td>Chanzon 10 High Power Led Chip 3W White (6000K-6500K/600mA-700mA/DC 3V-3.4V/3 Watt)</td>
			<td>B06XKTRSP7</td>
			<td>Use with Chanzon 25pcs 1W 3W 5W LED Heat Sink (2 pin Black) Aluminum Base Plate Panel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>light timer</td>
			<td>Century 24 Hour Plug-in Mechanical Timer Grounded</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plastic wall mount for IR</td>
			<td>Everbilt Plastic pegboard</td>
			<td>Model # 17961</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Power cable</td>
			<td>BNTECHGO 22 Gauge Silicone Wire</td>
			<td>B01K4RPE0Y</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Power source</td>
			<td>Rapid LED</td>
			<td>MOONLIGHT DRIVER (350MA)</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tissue culture plates</td>
			<td>Fisherbrand</td>
			<td colspan="2">12-well (FB012928) 24-well (FB012929)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tripod Ball head</td>
			<td>Demon DB-44</td>
			<td>B00TQ54CZO</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>USB Hardrive</td>
			<td>Seagate 3TB backup</td>
			<td>STDT3000100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>USB Webcam</td>
			<td>Microsoft LifeCam</td>
			<td>Q2F-00014</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Wall mount for camera</td>
			<td>LDR Industries 1/2&#34; Steel pipe</td>
			<td>307 12X36</td>
			<td>Mounted on wall with Flange and 90 degree pipe elbow. Could also use a tripod to hold camera.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

automated measurements of sleep and locomotor activity in mexican cavefish

À travers des phylums, sommeil se caractérise par des caractéristiques comportementales hautement conservées qui incluent le seuil d’excitation élevé, rebondissement après privation de sommeil et consolidés des périodes d’immobilité comportementale. Le mexicain spelaea, Astyanax mexicanus (a. mexicanus), est un modèle pour l’étude de l’évolution du trait en réponse aux perturbations environnementales. A. mexicanus existe comme dans eyed surface vivant dans les formes et de multiples populations cavernicoles aveugles qui ont des différences morphologiques et comportementales robustes. La perte de sommeil s’est produite dans les populations multiples, agassizii évolué indépendamment. Ce protocole décrit une méthode pour quantifier le sommeil et l’activité locomotrice dans a. mexicanus grotte et poissons de surface. Un système de vidéosurveillance rentable permet l’imagerie comportementale de poissons larvaires ou adultes hébergés individuellement pour des périodes d’une semaine ou plus. Le système peut être appliqué pour des poissons âgés de 4 jours après la fécondation à l’âge adulte. L’approche peut aussi être adaptée pour mesurer les effets d’interactions sociales sur le sommeil en enregistrant plusieurs poissons dans une arène unique. Suite à des enregistrements comportements, données sont analysées à l’aide automatique de logiciel de suivi et analyse de sommeil est traitée à l’aide de scripts personnalisés qui quantifient les multiples variables de sommeil, y compris la durée, la longueur de bout et nombre de combat. Ce système peut être appliqué à la mesure de sommeil, le comportement circadienne et l’activité locomotrice dans presque toute espèce de poissons dont le poisson-zèbre et les épinoches.

Âge des larves que DPF 4-30 peut être enregistrées de façon fiable dans le système fermé de mesure décrit à la Figure 1. Le système comprend deux IR et l’éclairage visible permettant des enregistrements dans des conditions claires et foncées, dans diverses conditions de lumière visibles (Figure 1 a). Les vidéos sont ensuite analysées à l’aide du logiciel de suivi (Figure 1 b<strong...

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Automated Measurements of Sleep and Locomotor Activity in Mexican Cavefish

Ce protocole décrit en détail la méthodologie utilisée pour quantifier le comportement locomoteur et dormir dans l’agassizii mexicain. Les analyses antérieures sont étendues pour mesurer ces comportements chez les poissons socialement logés. Ce système peut être largement appliqué pour étudier le sommeil et l’activité chez d’autres espèces de poissons.

Mesures automatisées de sommeil et de l’activité locomotrice dans Agassizii mexicain

Across phyla, sleep is characterized by highly conserved behavioral characteristics that include elevated arousal threshold, rebound following sleep ...

Ce protocole peut être utilisé pour quantifier le sommeil et l’activité dans n’importe quelle population de poissons et a le potentiel d’augmenter le nombre de systèmes modèles utilisés pour étudier la régulation du sommeil. L’avantage de cette technique est sa flexibilité. Par exemple, les poissons peuvent être suivis dans une variété de tailles d’arénas ou dans des expériences logées ment ou en groupe.Une force de mesurer le sommeil dans ce système est l’amenability de la méthode pour le médicament à haut débit ou le criblage génétique. Nous avons appliqué cette méthode à l’étude de l’évolution du sommeil dans deux populations différentes de poissons des cavernes qui démontrent des phénotypes du sommeil radicalement différents. Bien qu’il puisse être difficile d’établir un système d’imagerie comportementale, notre système fournit une méthode rentable pour l’étude des poissons larvaire et adultes.Pour construire le système pour suivre avec précision le comportement locomoteur pour étudier le sommeil et les rythmes circadiens dans larvaire A.mexicanus, utilisez 0,33 centimètre d’épaisseur acrylique signe blanc pour construire une plate-forme pour le système de suivi larvaire. Placez la plate-forme d’enregistrement sur le dessus de l’évier de chaleur carré allumé sur lequel les arènes contenant du poisson résideront pendant les expériences de suivi comportemental, et placez un deuxième acrylique à l’intérieur de la boîte entre les lumières dans le logement animal pour diffuser l’infrarouge pour un éclairage et un contraste optimaux. Placez toute la phase de suivi larvaire et l’éclairage mis en place dans un tube en plastique fermé.Utilisez un outil rotatif pour retirer l’objectif d’une webcam adaptée à l’expérimentation. Retirez les petites vis à l’arrière de la caméra pour enlever le boîtier intérieur, et retirez les petites vis à l’intérieur du corps de la caméra pour desserrer le reste de l’objectif. Utilisez un petit tournevis pour enlever toutes les parties du boîtier de la lentille qui sont laissées après avoir coupé la lentille.Et retirez la diode électroluminescente bleue sur la partie supérieure de l’appareil couplé à la charge ou du boîtier CCD. Ensuite, retournez le boîtier intérieur à son orientation d’origine avant de visser les deux vis extérieures dans leurs positions d’origine. Utilisez une petite scie pour acheminer l’intérieur de l’appareil photo pour permettre à l’appareil photo d’être équipé d’un morceau de routage en plastique arrondi lissant le plastique supplémentaire jusqu’à ce qu’il puisse accompagner un adaptateur de lentille.Installez un filtre de passage infrarouge à l’intérieur de la caméra aussi près que possible du CCD sans entrer en contact direct avec la caméra, et vissez l’adaptateur d’une lentille fixe de 35 millimètres à l’avant de la caméra à l’arrière de l’objectif. Placez ensuite la caméra et l’objectif dans le trou percé dans le couvercle en haut du tube qui abrite la scène et les lumières, et fixez l’USB à l’ordinateur sur lequel les animaux seront enregistrés. Pour construire un système de sommeil pour les poissons adultes, coupez d’abord des bandes infrarouges à des intervalles d’environ 46 centimètres.Et placez un 46 par cinq par 0,32 centimètre 9%lumière passer feuille acrylique signe blanc directement en face de chaque bande de lumière infrarouge pour diffuser la lumière infrarouge. Placez ensuite tous les réservoirs sur un support qui supporte l’éclairage infrarouge monté à l’arrière, et utilisez des séparateurs en plastique opaques et des réservoirs en verre de 10 litres pour créer des arènes individuelles. Pour enregistrer l’activité locomotrice des poissons tetra mexicains placer le jour quatre à six poissons post-fertilisation dans les puits individuels d’une plaque de tissu de 24 puits, et jours 20 à 30 après la fécondation dans les puits individuels d’une plaque de tissu de six puits.Pour enregistrer le sommeil et l’activité des tétras adultes dans une maison sociale jusqu’à cinq adultes par réservoir de 10 litres avec ou sans les diviseurs. Dans cette expérience représentative, les poissons larvaux de trois populations indépendantes de poissons des cavernes ont montré une réduction significative du sommeil par rapport aux poissons de surface. Cette production de sommeil est constante à travers tous les âges testés que le sommeil a également été considérablement réduit chez les poissons adultes Pachon, Molino, et Tinaja grotte par rapport aux poissons de surface.Notamment, les logements sociaux ont fortement réduit le sommeil dans les poissons de surface sans affecter le sommeil dans les poissons des cavernes de Pacho probablement en raison d’un effet de sous-sol dans les populations de poissons des cavernes. Lors de l’enregistrement du poisson, il faut veiller à ce que l’éclairage de la caméra soit optimal pour améliorer le signal du poisson par rapport à l’arrière-plan. Un certain codage de ligne de commande de base est nécessaire pour ce protocole qui est entièrement décrit dans le texte et devrait être approprié à n’importe quel réglage de laboratoire.Ce protocole a conduit à de nombreuses questions sur l’évolution du sommeil et est actuellement utilisé pour les écrans de drogue, suivre le comportement du sommeil, et de comprendre comment le comportement social affecte le sommeil.

Research

JoVE Journal

Behavior

Mouse Short- and Long-term Locomotor Activity Analyzed by Video Tracking Software

Souris à court et à long terme de l&#39;activité locomotrice analysées par un logiciel de suivi de la vidéo

Locomotor  activity (LMA) is a simple and easily performed measurement of behavior in mice  and other rodents. Improvements in video tracking software ...

Recherche

Sciences du comportement

Automated Visual Cognitive Tasks for Recording Neural Activity Using a Floor Projection Maze

Tâches cognitives visuels automatisés pour l&#39;enregistrement de neurones activité en utilisant une projection au sol Maze

Neuropsychological tasks used in primates to investigate mechanisms of learning and memory are typically visually guided cognitive tasks. We have ...

Eye Tracking, Cortisol, and a Sleep vs. Wake Consolidation Delay: Combining Methods to Uncover an Interactive Effect of Sleep and Cortisol on Memory

Eye Tracking, cortisol, et un sommeil vs Wake Retard de consolidation: La combinaison de méthodes pour découvrir un effet interactif de sommeil et le cortisol sur la mémoire

Although rises in cortisol can benefit memory consolidation, as can sleep soon after encoding, there is currently a paucity of literature as to how these ...

Behavioral and Locomotor Measurements Using an Open Field Activity Monitoring System for Skeletal Muscle Diseases

Les mesures comportementales et locomotrices grâce à un système de surveillance d&#39;activité en plein champ pour les maladies musculaires squelettiques

The open field activity monitoring system comprehensively assesses locomotor and behavioral activity levels of mice. It is a useful tool for assessing ...

Use of the Open Field Maze to Measure Locomotor and Anxiety-like Behavior in Mice

L&#39;utilisation de l&#39;Open Field Maze mesurer locomoteur et de l&#39;anxiété comme comportement chez la souris

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Manipulation of Epileptiform Electrocorticograms (ECoGs) and Sleep in Rats and Mice by Acupuncture

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