Name: automated measurements of sleep and locomotor activity in mexican cavefish
Uploaded: 2019-03-21T14:00:00
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참고: 애벌레와 성인 행동 추적을 위한 시스템을 설정 합니다.
1. 애벌레에 대 한 수 면 시스템 구축
참고: 적외선 (IR) 조명, 아크릴 IR 빛 확산 기를 포함 하 여 장비의 여러 조각을 자동 빛 추적 30 dpf A. mexicanus 통해 청소년 물고기 세 일 게시물 수정 (dpf)를 통해 애벌레에 대 한 모니터링 시스템 필요 컨트롤 (타이머), 컴퓨터, 카메라, 및 배?...

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	<li>Keene, A. C., Duboue, E. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+origins+and+evolution+of+sleep.">The origins and evolution of sleep.</a> The Journal of Experimental Biology. , (2018).</li><li>Joiner, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Unraveling+the+Evolutionary+Determinants+of+Sleep.">Unraveling the Evolutionary Determinants of Sleep.</a> Current Biology. 26 (20), R1073-R1087 (2016).</li><li>Allada, R., Siegel, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Unearthing+the+phylogenetic+roots+of+sleep.">Unearthing the phylogenetic roots of sleep.</a> Current biology. 18, R670-R679 (2008).</li><li>Sehgal, A., Mignot, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetics+of+sleep+and+sleep+disorders.">Genetics of sleep and sleep disorders.</a> Cell. 146, 194-207 (2011).</li><li>Campbell, S. S., Tobler, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Animal+sleep:+a+review+of+sleep+duration+across+phylogeny.">Animal sleep: a review of sleep duration across phylogeny.</a> Neuroscience and Biobehavioral Reviews. 8, 269-300 (1984).</li><li>Raizen, D. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lethargus+is+a+Caenorhabditis+elegans+sleep-like+state.">Lethargus is a Caenorhabditis elegans sleep-like state.</a> Nature. 451, 569-572 (2008).</li><li>Geissmann, Q., Rodriguez, L. G., Beckwith, E. J., French, A. S., Jamasb, A. R., Gilestro, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ethoscopes:+An+Open+Platform+For+High-Throughput+Ethomics.">Ethoscopes: An Open Platform For High-Throughput Ethomics.</a> bioRxiv. , 113647 (2017).</li><li>Garbe, D. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Context-specific+comparison+of+sleep+acquisition+systems+in+Drosophila.">Context-specific comparison of sleep acquisition systems in Drosophila.</a> Biology Open. 4 (11), (2015).</li><li>Branson, K., Robie, A. A., Bender, J., Perona, P., Dickinson, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+ethomics+in+large+groups+of+Drosophila.">High-throughput ethomics in large groups of Drosophila.</a> Nature Methods. 6 (6), 451-457 (2009).</li><li>Gilestro, G. F., Cirelli, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PySolo:+A+complete+suite+for+sleep+analysis+in+Drosophila.">PySolo: A complete suite for sleep analysis in Drosophila.</a> Bioinformatics. 25, 1466-1467 (2009).</li><li>Swierczek, N. A., Giles, A. C., Rankin, C. H., Kerr, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+behavioral+analysis+in+C.+elegans.">High-throughput behavioral analysis in C. elegans.</a> Nature Methods. 8 (7), 592-598 (2011).</li><li>Branson, K., Robie, A. A., Bender, J., Perona, P., Dickinson, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+ethomics+in+large+groups+of+Drosophila.">High-throughput ethomics in large groups of Drosophila.</a> Nature Methods. 6, 451-457 (2009).</li><li>Rihel, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Zebrafish+behavioral+profiling+links+drugs+to+biological+targets+and+rest/wake+regulation.">Zebrafish behavioral profiling links drugs to biological targets and rest/wake regulation.</a> Science (New York, N.Y.). 327, 348-351 (2010).</li><li>Yoshizawa, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Distinct+genetic+architecture+underlies+the+emergence+of+sleep+loss+and+prey-seeking+behavior+in+the+Mexican+cavefish.">Distinct genetic architecture underlies the emergence of sleep loss and prey-seeking behavior in the Mexican cavefish.</a> BMC Biology. 13, (2015).</li><li>Chiu, C. N., Prober, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+zebrafish+sleep+and+arousal+states:+current+and+prospective+approaches.">Regulation of zebrafish sleep and arousal states: current and prospective approaches.</a> Frontiers in Neural Circuits. 7 (April), 58 (2013).</li><li>Elbaz, I., Foulkes, N. S., Gothilf, Y., Appelbaum, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Circadian+clocks,+rhythmic+synaptic+plasticity+and+the+sleep-wake+cycle+in+zebrafish.">Circadian clocks, rhythmic synaptic plasticity and the sleep-wake cycle in zebrafish.</a> Frontiers in Neural Circuits. 7, (2013).</li><li>Dubou&#233;, E. R., Keene, A. C., Borowsky, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evolutionary+convergence+on+sleep+loss+in+cavefish+populations.">Evolutionary convergence on sleep loss in cavefish populations.</a> Current Biology. 21, 671-676 (2011).</li><li>Beale, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Circadian+rhythms+in+Mexican+blind+cavefish+Astyanax+mexicanus+in+the+lab+and+in+the+field.">Circadian rhythms in Mexican blind cavefish Astyanax mexicanus in the lab and in the field.</a> Nature Communications. 4, 2769 (2013).</li><li>Keene, A. C., Yoshizawa, M., McGaugh, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Biology and Evolution of the Mexican Cavefish. , (2015).</li><li>Jeffery, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regressive+evolution+in+Astyanax+cavefish.">Regressive evolution in Astyanax cavefish.</a> Annual Review of Genetics. 43, 25-47 (2009).</li><li>Gross, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+complex+origin+of+Astyanax+cavefish.">The complex origin of Astyanax cavefish.</a> BMC Evolutionary Biology. 12, 105 (2012).</li><li>Aspiras, A., Rohner, N., Marineau, B., Borowsky, R., Tabin, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Melanocortin+4+receptor+mutations+contribute+to+the+adaptation+of+cavefish+to+nutrient-poor+conditions.">Melanocortin 4 receptor mutations contribute to the adaptation of cavefish to nutrient-poor conditions.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 112 (31), 9688 (2015).</li><li>Jaggard, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+lateral+line+confers+evolutionarily+derived+sleep+loss+in+the+Mexican+cavefish.">The lateral line confers evolutionarily derived sleep loss in the Mexican cavefish.</a> Journal of Experimental Biology. 220 (2), (2017).</li><li>Jaggard, J. B., Stahl, B. A., Lloyd, E., Prober, D. A., Duboue, E. R., Keene, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hypocretin+underlies+the+evolution+of+sleep+loss+in+the+Mexican+cavefish.">Hypocretin underlies the evolution of sleep loss in the Mexican cavefish.</a> eLife. , e32637 (2018).</li><li>Hinaux, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Developmental+Staging+Table+for+Astyanax+mexicanus+Surface+Fish+and+Pacho+&#180;n+Cavefish.">A Developmental Staging Table for Astyanax mexicanus Surface Fish and Pacho &#180;n Cavefish.</a> Zebrafish. 8 (4), 155-165 (2011).</li><li>Bill, B. R., Petzold, A. M., Clark, K. J., La Schimmenti, ., Ekker, S. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+primer+for+morpholino+use+in+zebrafish.">A primer for morpholino use in zebrafish.</a> Zebrafish. 6 (1), 69-77 (2009).</li><li>Bilandzija, H., Ma, L., Parkhurst, A., Jeffery, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+potential+benefit+of+albinism+in+Astyanax+cavefish:+downregulation+of+the+oca2+gene+increases+tyrosine+and+catecholamine+levels+as+an+alternative+to+melanin+synthesis.">A potential benefit of albinism in Astyanax cavefish: downregulation of the oca2 gene increases tyrosine and catecholamine levels as an alternative to melanin synthesis.</a> Plos One. 8 (11), e80823 (2013).</li><li>Yokogawa, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+sleep+in+zebrafish+and+insomnia+in+hypocretin+receptor+mutants.">Characterization of sleep in zebrafish and insomnia in hypocretin receptor mutants.</a> PLoS Biology. 5, 2379-2397 (2007).</li><li>Appelbaum, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sleep-wake+regulation+and+hypocretin-melatonin+interaction+in+zebrafish.">Sleep-wake regulation and hypocretin-melatonin interaction in zebrafish.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 21942-21947 (2009).</li><li>Singh, C., Oikonomou, G., Prober, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Norepinephrine+is+required+to+promote+wakefulness+and+for+hypocretin-induced+arousal+in+zebrafish.">Norepinephrine is required to promote wakefulness and for hypocretin-induced arousal in zebrafish.</a> eLife. 4 (September), (2015).</li><li>Elipot, Y., Hinaux, H., Callebert, J., R&#233;taux, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evolutionary+shift+from+fighting+to+foraging+in+blind+cavefish+through+changes+in+the+serotonin+network.">Evolutionary shift from fighting to foraging in blind cavefish through changes in the serotonin network.</a> Current Biology. 23 (1), 1-10 (2013).</li><li>Bell, M. A., Foster, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The evolutionary biology of the threespine stickleback. 584, (1994).</li><li>Seehausen, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=African+cichlid+fish:+a+model+system+in+adaptive+radiation+research.">African cichlid fish: a model system in adaptive radiation research.</a> Proceedings of Biological Sciences/The Royal Society. 273 (1597), 1987-1998 (1597).</li><li>Basolo, A. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Female+preference+predates+the+evolution+of+the+sword+in+swordtail+fish.">Female preference predates the evolution of the sword in swordtail fish.</a> Science. 250, 808-810 (1990).</li></ol>

이 프로토콜에서는 측정 수 면과 운동 활동 애벌레와 성인 cavefish에 대 한 사용자 지정 시스템을 설명 합니다. Cavefish는 수 면 수 면 규칙1의 유전과 신경 기초를 조사 하는 데 사용할 수 있습니다의 진화를 공부에 대 한 최고의 모델로 떠오르고 있다. 이 프로토콜의 중요 한 단계 점화의 최적화를 포함 하 고 정확한 추적을 보장 하기 위해서 비디오 품질은 수 면을 계량 하는 데 필?...

수 면이 높은 생리 기능과 행동 수준1,2,3에 동물의 왕국에 걸쳐 보존 됩니다. 일반적으로 포유류 실험실 동물 수 면 심장학을 사용 하 여 평가, electrophysiological 녹음은 작은 유전자 의무가 모델 시스템에서 덜 실용적 고 따라서 수 면은 일반적으로 측정 동작3 에 따라 , 4. 수 면과 관련 된 행동 특성 높은 동물의 왕국에 걸쳐 보존 및 증가 자극 임계값, 자극, 그리고 장시간된 행동 정지5가역을 포함. 이러한 조치는 인간6선 충 벌레 C. 선 충에서 배열 하는 동물에 잠의 특성을 사용할 수 있습니다.
수 면 하 행동 정지를 사용 하 여 자동화 된 추적 소프트웨어를 필요 합니다. 추적 소프트웨어, 활동과 부동의 기간 일 수를 통해 결정 하 고 비활동의 장기간7,8수 면으로 분류 됩니다. 최근 몇 년 동안, 여러 추적 시스템 개발 되었으며, 다양 한 작은 유전자 의무가 모델 시스템 중 활동 데이터 획득 웜, 과일 파리와 물고기9,,1011를 포함 하 여. 이 프로그램 프리웨어 오픈 소스와 상용 소프트웨어7,12,13,14 포함 하 여 동물의 행동의 자동화 된 추적에 대 한 수 있는 소프트웨어와 함께 제공 됩니다. . 이러한 시스템과 효율적인 검사 및 수 면 고기 수많은 유전자 amendable 모델의 특성에 대 한 허용 그들의 유연성에 다.
Zebrafish, Danio rerio, 수 면의 유전자 조사 수많은 유전자와 잠15,16을 조절 하는 신경 회로의 식별을 주도하 고 있다. 이 척추 동물 실험실 동물에 잠의 신경 기초 조사를 위한 강력한 시스템 훨씬 덜 이며 수 면 진화 하는 방법에 대 한 알려진 어떻게 자연 제공 하는 동안 유사 규제 자에 기여 한다. 멕시코 cavefish, Astyanax mexicanus (A. mexicanus), 수 면, 운동 활동 및 circadian 리듬17,18에 극적인 차이 진화 했다. 이 물고기는 멕시코와 남부 텍사스와 적어도 29의 강에 서식 하는 눈된 표면 물고기 동굴 북동 멕시코19,,2021의 시에라 델 Abra 지역의 인구 존재 합니다. 놀랍게도, 수 면 손실을를 포함 하 여 많은 행동 차이 등장 하지 독립적으로 여러 cavefish 인구14,22에 나타납니다. 따라서, cavefish 수 면, circadian, 그리고 사회적 행동의 수렴 진화를 조사에 대 한 모델을 제공 합니다.
이 프로토콜 수 면 및 A에서 운동 동작 측정을 위한 시스템을 설명 합니다. mexicanus 애벌레 고 어른입니다. 맞춤식 적외선 기반의 녹음 시스템 빛과 어두운 조건 하에서 동물의 비디오 녹화에 대 한 수 있습니다. 상용 소프트웨어를 사용 하 여 활동을 측정 하 고 사용자 정의 매크로 비활성의 여러 측면을 측정 하 고 수 면의 기간을 결정 하는 데 사용 됩니다. 이 프로토콜은 또한 수 면과 사회적 행동 간의 상호 작용을 검사 하는 기능을 제공 하는 탱크 내의 여러 동물의 활동을 추적 하기 위한 실험 수정을 설명 합니다. 이러한 시스템은 측정 자, circadian 동작 및 추가 어 종 zebrafish, sticklebacks 등에서 운동 활동에 적용할 수 있습니다.

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	<tbody>
		<tr>
			<td>12V power adaptor</td>
			<td>Environmental Lights</td>
			<td>24 Watt 12 VDC Power Supply</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acrylic dividers (adults)</td>
			<td>TAP Plastic</td>
			<td></td>
			<td>Order sheets in sizes as needed</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Adult infrared light power source</td>
			<td>Environmnental Lights 24 Watt 12 VDC Power Supply</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Battery pack</td>
			<td>CyberPower</td>
			<td>CP850PFCLCD</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Camera lens (adult)</td>
			<td>Navitar Zoom 7000</td>
			<td>Zoom 7000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Camera lens (larval)</td>
			<td>Fujian 35mm f/1.7</td>
			<td>B01CHX7668</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Camera lens adapter</td>
			<td>d</td>
			<td>1524219</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Camera mount</td>
			<td>CowboyStudio Super Clamp</td>
			<td>B002LV7X1K</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fish tank</td>
			<td>Deep Blue Professional</td>
			<td>ADB11006</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Heat sink (adult)</td>
			<td>M-D Building products</td>
			<td>SKU: 61085</td>
			<td>Cut to fit</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Heat sink (larval)</td>
			<td>M-D Building products</td>
			<td>SKU: 57000</td>
			<td>Cut to fit</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Infrared lights (adults)</td>
			<td>Environmental Lights Infrared 850 nm 5050 LED strip</td>
			<td>irrf850-5050-60-reel</td>
			<td>Cut to fit</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Infrared lights (larval)</td>
			<td>LED World</td>
			<td>B00MO9H7H4</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IR-diffusing acrylic</td>
			<td>TAP Plastic</td>
			<td></td>
			<td>Order sheets in sizes as needed</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Laptop/computer</td>
			<td>N/A</td>
			<td>N/A</td>
			<td>Any laptop will work.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LED light</td>
			<td>Chanzon 10 High Power Led Chip 3W White (6000K-6500K/600mA-700mA/DC 3V-3.4V/3 Watt)</td>
			<td>B06XKTRSP7</td>
			<td>Use with Chanzon 25pcs 1W 3W 5W LED Heat Sink (2 pin Black) Aluminum Base Plate Panel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>light timer</td>
			<td>Century 24 Hour Plug-in Mechanical Timer Grounded</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plastic wall mount for IR</td>
			<td>Everbilt Plastic pegboard</td>
			<td>Model # 17961</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Power cable</td>
			<td>BNTECHGO 22 Gauge Silicone Wire</td>
			<td>B01K4RPE0Y</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Power source</td>
			<td>Rapid LED</td>
			<td>MOONLIGHT DRIVER (350MA)</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tissue culture plates</td>
			<td>Fisherbrand</td>
			<td colspan="2">12-well (FB012928) 24-well (FB012929)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tripod Ball head</td>
			<td>Demon DB-44</td>
			<td>B00TQ54CZO</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>USB Hardrive</td>
			<td>Seagate 3TB backup</td>
			<td>STDT3000100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>USB Webcam</td>
			<td>Microsoft LifeCam</td>
			<td>Q2F-00014</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Wall mount for camera</td>
			<td>LDR Industries 1/2&#34; Steel pipe</td>
			<td>307 12X36</td>
			<td>Mounted on wall with Flange and 90 degree pipe elbow. Could also use a tripod to hold camera.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

automated measurements of sleep and locomotor activity in mexican cavefish

문의 전체 수 면 매우 보존된 행동 특성 포함 된 높은 흥분을 일으키는 임계값, 수 면 부족, 다음 반 등 기간 행동 부동의 통합 특징 이다. 멕시코 cavefish Astyanax mexicanus (A. mexicanus), 는 섭 동 환경에 대 한 응답 특성이 진화를 공부에 대 한 모델입니다. A. mexicanus 는 눈된 표면 주거 형태와 강력한 형태학과 행동의 차이 여러 장 님 동굴 주거 인구 존재 한다. 수 면 손실을 여러, 독립적으로 진화 cavefish 인구에서 발생 했습니다. 이 프로토콜 수 면과 표면 생선과 A. mexicanus 동굴에서 운동 활동을 측정 하는 방법론을 설명 합니다. 비용 효율적인 비디오 모니터링 시스템 1 주일 이상 기간에 대 한 개별적으로 보관 되어 애벌레 또는 성인 물고기의 행동 이미징 할 수 있습니다. 물고기 세 일 성인 기 통해 게시물 수정 시스템을 적용할 수 있습니다. 접근도 단일 분야에서 여러 물고기를 기록 하 여 수 면에 사회적 상호 작용의 효과 측정 하기 위한 적응 될 수 있다. 행동 기록, 다음 데이터 분석 사용 하 여 자동으로 소프트웨어를 추적 하 고 수 면 분석 기간, 가릴 길이 및 시 합 수를 포함 하 여 여러 수 면 변수를 계량 하는 사용자 지정된 스크립트를 사용 하 여 처리 됩니다. 이 시스템은 측정 자, circadian 동작 및 거의 모든 어 종 zebrafish, sticklebacks 등에서 운동 활동에 적용할 수 있습니다.

애벌레 연령대 4-30 dpf를 안정적으로 그림 1에 설명 된 사용자 지정 빌드 닫힌된 시스템에서 기록 될 수 있습니다. 시스템에는 적외선과 보이는 조명 조건 하에서 빛과 어둠, 다양 한 표시 빛 조건 (그림 1A)에서 녹음 수 있도록 포함 되어 있습니다. 동영상은 다음 추적 소프트웨어 (그림 1BC)를 사...

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Automated Measurements of Sleep and Locomotor Activity in Mexican Cavefish

이 프로토콜 운동 동작 및 멕시코 cavefish 수 면 측정 방법을 자세히 설명 합니다. 이전 분석은 사회적으로 지 내게 물고기에 이러한 행동을 측정 하기 위해 확장 됩니다. 이 시스템은 수 면과 다른 물고기 종에 있는 활동 연구에 널리 적용할 수 있습니다.

수 면과 운동 활동 멕시코 Cavefish에서의 자동화 된 측정

Across phyla, sleep is characterized by highly conserved behavioral characteristics that include elevated arousal threshold, rebound following sleep ...

이 프로토콜은 모든 물고기 집단에서 수면과 활동을 정량화하는 데 사용할 수 있으며 수면 조절을 연구하는 데 사용되는 모델 시스템의 수를 확장할 가능성이 있습니다. 이 기술의 장점은 유연성입니다. 예를 들어, 물고기는 다양한 경기장 크기 또는 노래가 보관된 또는 그룹 하우스 실험에서 추적할 수 있습니다.이 시스템에서 수면을 측정하는 강도는 높은 처리량 약물 또는 유전자 스크리닝을 위한 방법의 편의성입니다. 우리는 극적으로 다른 수면 표현형을 보여주는 동굴물고기의 두 개의 다른 인구에서 수면의 진화의 연구에이 방법을 적용했습니다. 행동 화상 진찰을 위한 시스템을 설치하는 것은 어려울 수 있더라도, 우리의 시스템은 애벌레와 성인 물고기를 공부하기 위한 비용 효과적인 방법을 제공합니다.larval A.mexicanus에서 수면과 circadian 리듬을 연구하기위한 운동 동작을 정확하게 추적하는 시스템을 구축하려면 0.33 센티미터 두께의 흰색 표지판 아크릴을 사용하여 애벌레 추적 시스템을위한 플랫폼을 구성하십시오. 동작 추적 실험 중에 물고기가 함유된 경기장이 있는 조명이 켜진 사각형 방열판 위에 레코딩 플랫폼을 배치하고, 동물 하우징의 조명 사이에 두 번째 아크릴을 배치하여 적외선을 확산하여 최적의 조명과 콘트라스트를 만듭니다. 전체 애벌레 추적 단계와 조명을 동봉 된 플라스틱 튜브 내에 설치합니다.로터리 도구를 사용하여 실험적으로 적합한 웹캠에서 렌즈를 제거합니다. 카메라 뒤쪽의 작은 나사를 제거하여 내부 하우징을 제거하고 카메라 본체 내부의 작은 나사를 제거하여 렌즈의 나머지 부분을 느슨하게 합니다. 작은 드라이버가 렌즈를 절단한 후 남은 렌즈 하우징의 일부를 제거합니다.그리고 충전 결합 장치 또는 CCD 하우징의 상단 부분에 파란색 발광 다이오드를 제거한다. 다음으로, 두 개의 외부 나사를 원래 위치로 다시 나사하기 전에 내부 하우징을 원래 방향으로 되돌려 보입니다. 작은 톱을 사용하여 카메라 내부를 라우팅하여 카메라가 렌즈 어댑터를 동반할 때까지 여분의 플라스틱을 부드럽게 하는 둥근 플라스틱 라우팅 비트가 장착될 수 있도록 합니다.카메라와 직접 접촉하지 않고 카메라 내부에 적외선 패스 필터를 설치하고 카메라 앞쪽에 있는 35mm 고정 렌즈의 어댑터를 렌즈 뒤쪽으로 나사로 고정합니다. 그런 다음 무대와 조명이 있는 튜브 상단의 뚜껑에 뚫은 구멍에 카메라와 렌즈를 넣고 동물이 기록될 컴퓨터에 USB를 부착합니다. 성인 물고기를위한 수면 시스템을 구성하기 위해 먼저 약 46 센티미터 간격으로 적외선 스트립을 잘라냅니다.그리고 적외선을 확산하기 위해 각 적외선 스트립 바로 앞에 흰색 사인 아크릴 시트를 46 by 5 ~ 0.32 센티미터 9 %의 라이트 패스. 그런 다음 모든 탱크를 후방 장착 적외선 조명을 지원하는 랙에 배치하고 불투명한 플라스틱 칸막이와 10리터 유리 탱크를 사용하여 개별 경기장을 만듭니다. 멕시코 테트라 어류장소의 운동 활성을 기록하기 위해 4일에서 6일 동안 수정 후 물고기를 24웰 티슈 플레이트의 개별 우물로 기록하고, 6웰 티슈 플레이트의 개별 우물에서 20~30일 후 수정을 기록한다.칸막이가 있거나 없는 10리터 탱크당 성인 5명까지 성인 테트라 수면과 활동을 기록합니다. 이 대표적인 실험에서 3개의 독립적인 동굴 물고기 집단에서 온 애벌레 물고기는 표면 물고기에 비해 수면의 현저한 감소를 나타냈다. 이 수면 생산은 수면이 또한 표면 물고기에 비해 성인 파촌, 몰리노 및 티나야 동굴 물고기에서 현저하게 감소했기 때문에 시험된 모든 연령대에 걸쳐 일관됩니다.특히, 사회 주택은 동굴 물고기 인구의 지하 효과로 인해 파초 동굴 물고기의 수면에 영향을 미치지 않고 표면 물고기의 수면을 강력하게 감소시다. 물고기주의를 녹음할 때 카메라 조명이 배경에 비해 물고기의 신호를 향상시키기 에 최적인지 확인하기 위해 주의를 기울여야 합니다. 텍스트에 완전히 설명되어 있고 모든 랩 설정에 따라 준수해야 하는 이 프로토콜에 대한 몇 가지 기본 명령줄 코딩이 필요합니다.이 프로토콜은 수면 진화에 대한 수많은 질문을 주도하고 현재 약물 화면에 사용되고있다, 수면 행동을 추적, 사회적 행동이 수면에 미치는 영향을 이해.

Research

JoVE Journal

Behavior

Mouse Short- and Long-term Locomotor Activity Analyzed by Video Tracking Software

마우스의 단기 및 장기 전위의 활동은 영상 추적 소프트웨어에 의해 분석

Locomotor  activity (LMA) is a simple and easily performed measurement of behavior in mice  and other rodents. Improvements in video tracking software ...

연구

행동분석학

Automated Visual Cognitive Tasks for Recording Neural Activity Using a Floor Projection Maze

바닥 투사 미로를 사용하여 녹음 신경 활동에 대한 자동화 된 시각인지 작업

Neuropsychological tasks used in primates to investigate mechanisms of learning and memory are typically visually guided cognitive tasks. We have ...

Eye Tracking, Cortisol, and a Sleep vs. Wake Consolidation Delay: Combining Methods to Uncover an Interactive Effect of Sleep and Cortisol on Memory

눈 추적, 코르티솔, 웨이크 통합 지연 대 절전 모드 : 메모리에 수면과 코르티솔의 상호 작용 효과를 폭로하는 방법을 결합

Although rises in cortisol can benefit memory consolidation, as can sleep soon after encoding, there is currently a paucity of literature as to how these ...

Behavioral and Locomotor Measurements Using an Open Field Activity Monitoring System for Skeletal Muscle Diseases

골격근 질환에 대한 열기 필드 활동 모니터링 시스템을 사용하여 행동 및 운동력 측정

The open field activity monitoring system comprehensively assesses locomotor and behavioral activity levels of mice. It is a useful tool for assessing ...

Use of the Open Field Maze to Measure Locomotor and Anxiety-like Behavior in Mice

열기 필드 미로의 사용은 마우스의 운동력과 불안 같은 행동을 측정하기 위해

Animal models have proven to be invaluable to researchers trying to answer questions regarding the mechanisms of behavior. The Open Field Maze is one of ...

Manipulation of Epileptiform Electrocorticograms (ECoGs) and Sleep in Rats and Mice by Acupuncture

Manipulation of Epileptiform Electrocorticograms ECoGs and Sleep in Rats and Mice by Acupuncture

침술에 의해 쥐와 마우스에서 간질 Electrocorticograms (ECoGs)의 조작 및 절전

Ancient Chinese literature has documented that acupuncture possesses efficient therapeutic effects on epilepsy and insomnia. There is, however, little ...

Using a Split-belt Treadmill to Evaluate Generalization of Human Locomotor Adaptation

인간의 운동 적응의 일반화를 평가 하는 분할 벨트 디딜 방 아를 사용 하 여

Understanding the mechanisms underlying locomotor learning helps researchers and clinicians optimize gait retraining as part of motor rehabilitation. ...

Noninvasive, High-throughput Determination of Sleep Duration in Rodents

수 면 기간 설치류의 비 침범 성, 높은 처리량 결정

Traditionally, sleep is monitored by an electroencephalogram (EEG). EEG studies in rodents require surgical implantation of the electrodes followed by a ...

A High-performance Liquid Chromatography Measurement of Kynurenine and Kynurenic Acid: Relating Biochemistry to Cognition and Sleep in Rats

Kynurenine 및 Kynurenic 산의 고성능 액체 크로마토그래피 측정: 생화학 인식 및 쥐에 수 면에 관한

The kynurenine pathway (KP) of tryptophan degradation has been implicated in psychiatric disorders. Specifically, the astrocyte-derived metabolite ...

Chronic Sleep Deprivation in Mouse Pups by Means of Gentle Handling

마우스에 만성 수 면 부족 통해 부드러운 새끼 처리

Sleep is critical for proper development and neural plasticity. Moreover, abnormal sleep patterns are characteristic of many neurodevelopmental disorders. ...