Name: automated measurements of sleep and locomotor activity in mexican cavefish
Uploaded: 2019-03-21T14:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Automated Measurements of Sleep and Locomotor Activity in Mexican Cavefish at JoVE.com

Bu eser NIGMS Ödülü GM127872 ACK, NINDS Ödülü 105072 ERD ve ACK ve bildirim için NSF Ödülü 1656574 tarafından desteklenmiştir

Not: sistemleri larva ve yetişkin davranış takibi için ayarlayın.
1. larvalar için bir uyku sistemi oluşturmak
Not: Birden çok kızılötesi (IR) aydınlatma, akrilik IR ışık Difüzörler, dahil olmak üzere ekipman parçaları ışık otomatik izleme çocuksu balık yaşlı 4 gün sonrası döllenme (dpf) aracılığıyla 30 dpf A. mexicanus ile larva için izleme sistemi gerektirir denetimleri (zamanlayıcılar), bilgisayar, kame...

<ol>
	<li>Keene, A. C., Duboue, E. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+origins+and+evolution+of+sleep.">The origins and evolution of sleep.</a> The Journal of Experimental Biology. , (2018).</li><li>Joiner, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Unraveling+the+Evolutionary+Determinants+of+Sleep.">Unraveling the Evolutionary Determinants of Sleep.</a> Current Biology. 26 (20), R1073-R1087 (2016).</li><li>Allada, R., Siegel, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Unearthing+the+phylogenetic+roots+of+sleep.">Unearthing the phylogenetic roots of sleep.</a> Current biology. 18, R670-R679 (2008).</li><li>Sehgal, A., Mignot, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetics+of+sleep+and+sleep+disorders.">Genetics of sleep and sleep disorders.</a> Cell. 146, 194-207 (2011).</li><li>Campbell, S. S., Tobler, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Animal+sleep:+a+review+of+sleep+duration+across+phylogeny.">Animal sleep: a review of sleep duration across phylogeny.</a> Neuroscience and Biobehavioral Reviews. 8, 269-300 (1984).</li><li>Raizen, D. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lethargus+is+a+Caenorhabditis+elegans+sleep-like+state.">Lethargus is a Caenorhabditis elegans sleep-like state.</a> Nature. 451, 569-572 (2008).</li><li>Geissmann, Q., Rodriguez, L. G., Beckwith, E. J., French, A. S., Jamasb, A. R., Gilestro, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ethoscopes:+An+Open+Platform+For+High-Throughput+Ethomics.">Ethoscopes: An Open Platform For High-Throughput Ethomics.</a> bioRxiv. , 113647 (2017).</li><li>Garbe, D. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Context-specific+comparison+of+sleep+acquisition+systems+in+Drosophila.">Context-specific comparison of sleep acquisition systems in Drosophila.</a> Biology Open. 4 (11), (2015).</li><li>Branson, K., Robie, A. A., Bender, J., Perona, P., Dickinson, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+ethomics+in+large+groups+of+Drosophila.">High-throughput ethomics in large groups of Drosophila.</a> Nature Methods. 6 (6), 451-457 (2009).</li><li>Gilestro, G. F., Cirelli, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PySolo:+A+complete+suite+for+sleep+analysis+in+Drosophila.">PySolo: A complete suite for sleep analysis in Drosophila.</a> Bioinformatics. 25, 1466-1467 (2009).</li><li>Swierczek, N. A., Giles, A. C., Rankin, C. H., Kerr, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+behavioral+analysis+in+C.+elegans.">High-throughput behavioral analysis in C. elegans.</a> Nature Methods. 8 (7), 592-598 (2011).</li><li>Branson, K., Robie, A. A., Bender, J., Perona, P., Dickinson, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+ethomics+in+large+groups+of+Drosophila.">High-throughput ethomics in large groups of Drosophila.</a> Nature Methods. 6, 451-457 (2009).</li><li>Rihel, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Zebrafish+behavioral+profiling+links+drugs+to+biological+targets+and+rest/wake+regulation.">Zebrafish behavioral profiling links drugs to biological targets and rest/wake regulation.</a> Science (New York, N.Y.). 327, 348-351 (2010).</li><li>Yoshizawa, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Distinct+genetic+architecture+underlies+the+emergence+of+sleep+loss+and+prey-seeking+behavior+in+the+Mexican+cavefish.">Distinct genetic architecture underlies the emergence of sleep loss and prey-seeking behavior in the Mexican cavefish.</a> BMC Biology. 13, (2015).</li><li>Chiu, C. N., Prober, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+zebrafish+sleep+and+arousal+states:+current+and+prospective+approaches.">Regulation of zebrafish sleep and arousal states: current and prospective approaches.</a> Frontiers in Neural Circuits. 7 (April), 58 (2013).</li><li>Elbaz, I., Foulkes, N. S., Gothilf, Y., Appelbaum, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Circadian+clocks,+rhythmic+synaptic+plasticity+and+the+sleep-wake+cycle+in+zebrafish.">Circadian clocks, rhythmic synaptic plasticity and the sleep-wake cycle in zebrafish.</a> Frontiers in Neural Circuits. 7, (2013).</li><li>Dubou&#233;, E. R., Keene, A. C., Borowsky, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evolutionary+convergence+on+sleep+loss+in+cavefish+populations.">Evolutionary convergence on sleep loss in cavefish populations.</a> Current Biology. 21, 671-676 (2011).</li><li>Beale, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Circadian+rhythms+in+Mexican+blind+cavefish+Astyanax+mexicanus+in+the+lab+and+in+the+field.">Circadian rhythms in Mexican blind cavefish Astyanax mexicanus in the lab and in the field.</a> Nature Communications. 4, 2769 (2013).</li><li>Keene, A. C., Yoshizawa, M., McGaugh, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Biology and Evolution of the Mexican Cavefish. , (2015).</li><li>Jeffery, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regressive+evolution+in+Astyanax+cavefish.">Regressive evolution in Astyanax cavefish.</a> Annual Review of Genetics. 43, 25-47 (2009).</li><li>Gross, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+complex+origin+of+Astyanax+cavefish.">The complex origin of Astyanax cavefish.</a> BMC Evolutionary Biology. 12, 105 (2012).</li><li>Aspiras, A., Rohner, N., Marineau, B., Borowsky, R., Tabin, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Melanocortin+4+receptor+mutations+contribute+to+the+adaptation+of+cavefish+to+nutrient-poor+conditions.">Melanocortin 4 receptor mutations contribute to the adaptation of cavefish to nutrient-poor conditions.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 112 (31), 9688 (2015).</li><li>Jaggard, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+lateral+line+confers+evolutionarily+derived+sleep+loss+in+the+Mexican+cavefish.">The lateral line confers evolutionarily derived sleep loss in the Mexican cavefish.</a> Journal of Experimental Biology. 220 (2), (2017).</li><li>Jaggard, J. B., Stahl, B. A., Lloyd, E., Prober, D. A., Duboue, E. R., Keene, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hypocretin+underlies+the+evolution+of+sleep+loss+in+the+Mexican+cavefish.">Hypocretin underlies the evolution of sleep loss in the Mexican cavefish.</a> eLife. , e32637 (2018).</li><li>Hinaux, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Developmental+Staging+Table+for+Astyanax+mexicanus+Surface+Fish+and+Pacho+&#180;n+Cavefish.">A Developmental Staging Table for Astyanax mexicanus Surface Fish and Pacho &#180;n Cavefish.</a> Zebrafish. 8 (4), 155-165 (2011).</li><li>Bill, B. R., Petzold, A. M., Clark, K. J., La Schimmenti, ., Ekker, S. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+primer+for+morpholino+use+in+zebrafish.">A primer for morpholino use in zebrafish.</a> Zebrafish. 6 (1), 69-77 (2009).</li><li>Bilandzija, H., Ma, L., Parkhurst, A., Jeffery, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+potential+benefit+of+albinism+in+Astyanax+cavefish:+downregulation+of+the+oca2+gene+increases+tyrosine+and+catecholamine+levels+as+an+alternative+to+melanin+synthesis.">A potential benefit of albinism in Astyanax cavefish: downregulation of the oca2 gene increases tyrosine and catecholamine levels as an alternative to melanin synthesis.</a> Plos One. 8 (11), e80823 (2013).</li><li>Yokogawa, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+sleep+in+zebrafish+and+insomnia+in+hypocretin+receptor+mutants.">Characterization of sleep in zebrafish and insomnia in hypocretin receptor mutants.</a> PLoS Biology. 5, 2379-2397 (2007).</li><li>Appelbaum, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sleep-wake+regulation+and+hypocretin-melatonin+interaction+in+zebrafish.">Sleep-wake regulation and hypocretin-melatonin interaction in zebrafish.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 21942-21947 (2009).</li><li>Singh, C., Oikonomou, G., Prober, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Norepinephrine+is+required+to+promote+wakefulness+and+for+hypocretin-induced+arousal+in+zebrafish.">Norepinephrine is required to promote wakefulness and for hypocretin-induced arousal in zebrafish.</a> eLife. 4 (September), (2015).</li><li>Elipot, Y., Hinaux, H., Callebert, J., R&#233;taux, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evolutionary+shift+from+fighting+to+foraging+in+blind+cavefish+through+changes+in+the+serotonin+network.">Evolutionary shift from fighting to foraging in blind cavefish through changes in the serotonin network.</a> Current Biology. 23 (1), 1-10 (2013).</li><li>Bell, M. A., Foster, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The evolutionary biology of the threespine stickleback. 584, (1994).</li><li>Seehausen, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=African+cichlid+fish:+a+model+system+in+adaptive+radiation+research.">African cichlid fish: a model system in adaptive radiation research.</a> Proceedings of Biological Sciences/The Royal Society. 273 (1597), 1987-1998 (1597).</li><li>Basolo, A. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Female+preference+predates+the+evolution+of+the+sword+in+swordtail+fish.">Female preference predates the evolution of the sword in swordtail fish.</a> Science. 250, 808-810 (1990).</li></ol>

Bu iletişim kuralı uyku ve larva ve yetişkin cavefish Lokomotor aktivite miktarının için özel bir sistem açıklar. Cavefish uyku yönetmelik1genetik ve nöral temeli araştırmak için kullanılan uyku evrimi çalışmak için önde gelen bir model olarak ortaya çıkmıştır. Bu iletişim kuralı kritik adımlarda aydınlatma duruma getirilmesi ve video kalitesi doğru izleme sağlamak için uyku ölçmek için gerekli. Toplama ve burada açıklanan analiz sistemi tamamen işlevsel, bir?...

Uyku hayvanlar alemi, fonksiyonel, fizyolojik ve davranışsal düzeyleri1,2,3boyunca son derece korunmuş. Uyku memeli laboratuvar hayvanlarda genellikle electroencephalograms kullanarak değerlendirilir, Elektrofizyolojik kayıtlar küçük genetik olarak mükellef modeli sistemlerinde daha az pratik ve böylece uyku tipik olarak davranış3 üzerinde karşılaştırılmasıyla ölçülmüştür , 4. davranışsal özellikleri uyku ile ilişkili hayvanlar alemi son derece korunmuş ve artmış uyarılma eşik, uyarılma ve uzun süreli davranış sendika5ile reversibility dahil. Bu önlemlerin uyku sıra--dan belgili tanımlık yuvarlak kurt, C. elegans, ile insanlar6hayvanlarda karakterize etmek için kullanılabilir.
Uyku karakterize etmek için davranışsal sendika kullanımı otomatik izleme yazılımı gerektirir. Yazılım izleme, etkinlik ve hareketsizlik dönemleri birkaç gün üzerinden belirlenir ve uzun süre kullanılmadığında uyku7,8gibi sınıflandırılır. Son yıllarda, birden fazla izleme sistemi küçük genetik olarak mükellef model sistemleri bir çeşitlilik arasında etkinlik veri edinme için geliştirilmiştir; solucanlar, meyve sinekleri ve balık9,10,11de dahil olmak üzere. Bu programlar hayvan davranışları, açık kaynak ücretsiz ve ticari olarak mevcut yazılım7,12,13,14 dahil olmak üzere otomatik izleme için sağlayan yazılım eşlik eder . Bu sistemler ve onların esneklik farklı verimli tarama ve uyku fenotipleri çok sayıda genetik olarak iyileştirilebilir modellerinde karakterizasyonu için izin.
Zebra balığı, Danio rerio, uykusunda genetik incelenmesi çok sayıda gen ve uyku15,16düzenleyen sinir devreleri tanımlaması için açmıştır. Bu ise daha az omurgalı laboratuvar hayvanı uykusunda nöral temeli soruşturma için güçlü bir sistem olması koşuluyla nasıl uyku geliştikçe hakkında bilinen ve ne kadar doğal varyasyon yönetmelik uyku katkıda bulunmaktadır. Meksika cavefish, Astyanax mexicanus (a. mexicanus), uyku, Lokomotor aktivite ve sirkadiyen ritim17,18dramatik farklılıklar gelişmiştir. Sierra Del Abra bölgenin etrafında nüfus kuzeydoğu Meksika19,20,21gözlü yüzey balık Meksika ve Güney Teksas ve en az 29 nehirler yaşamaktadır mağara gibi balıkların adlı biri yok. Dikkat çekici, uyku kaybı, dahil olmak üzere birçok davranış farklılıkları bağımsız olarak birden çok cavefish nüfus14,22yılında çıkmıştır görünmektedir. Bu nedenle, cavefish, uyku, sirkadiyen ve sosyal davranışlar yakınsak evrim soruşturma için bir model sağlar.
Bu iletişim kuralı uyku ve aLokomotor davranış ölçmek için bir sistem açıklar. mexicanus larva ve yetişkinler. Aydınlık ve karanlık koşullarda hayvanların video kaydı için özel olarak oluşturulmuş kızılötesi tabanlı kayıt sistemi sağlar. Piyasada bulunan yazılım etkinliğini ölçmek için kullanılabilir ve özel makrolar hareketsizlik çeşitli yönlerini ölçmek ve uyku dönemleri belirlemek için kullanılır. Bu iletişim kuralı da uyku ve sosyal davranışlar arasındaki etkileşimler incelemek olanağı sağlayan bir tank içinde birden fazla hayvan etkinliğini izlemek için deneysel değişiklikleri açıklar. Bu sistemler ölçü uyku, sirkadiyen davranış ve Zebra balığı ve takımıdır dahil olmak üzere ek balık türlerinin Lokomotor aktivite için uygulanabilir.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>12V power adaptor</td>
			<td>Environmental Lights</td>
			<td>24 Watt 12 VDC Power Supply</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acrylic dividers (adults)</td>
			<td>TAP Plastic</td>
			<td></td>
			<td>Order sheets in sizes as needed</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Adult infrared light power source</td>
			<td>Environmnental Lights 24 Watt 12 VDC Power Supply</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Battery pack</td>
			<td>CyberPower</td>
			<td>CP850PFCLCD</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Camera lens (adult)</td>
			<td>Navitar Zoom 7000</td>
			<td>Zoom 7000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Camera lens (larval)</td>
			<td>Fujian 35mm f/1.7</td>
			<td>B01CHX7668</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Camera lens adapter</td>
			<td>d</td>
			<td>1524219</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Camera mount</td>
			<td>CowboyStudio Super Clamp</td>
			<td>B002LV7X1K</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fish tank</td>
			<td>Deep Blue Professional</td>
			<td>ADB11006</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Heat sink (adult)</td>
			<td>M-D Building products</td>
			<td>SKU: 61085</td>
			<td>Cut to fit</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Heat sink (larval)</td>
			<td>M-D Building products</td>
			<td>SKU: 57000</td>
			<td>Cut to fit</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Infrared lights (adults)</td>
			<td>Environmental Lights Infrared 850 nm 5050 LED strip</td>
			<td>irrf850-5050-60-reel</td>
			<td>Cut to fit</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Infrared lights (larval)</td>
			<td>LED World</td>
			<td>B00MO9H7H4</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IR-diffusing acrylic</td>
			<td>TAP Plastic</td>
			<td></td>
			<td>Order sheets in sizes as needed</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Laptop/computer</td>
			<td>N/A</td>
			<td>N/A</td>
			<td>Any laptop will work.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LED light</td>
			<td>Chanzon 10 High Power Led Chip 3W White (6000K-6500K/600mA-700mA/DC 3V-3.4V/3 Watt)</td>
			<td>B06XKTRSP7</td>
			<td>Use with Chanzon 25pcs 1W 3W 5W LED Heat Sink (2 pin Black) Aluminum Base Plate Panel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>light timer</td>
			<td>Century 24 Hour Plug-in Mechanical Timer Grounded</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plastic wall mount for IR</td>
			<td>Everbilt Plastic pegboard</td>
			<td>Model # 17961</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Power cable</td>
			<td>BNTECHGO 22 Gauge Silicone Wire</td>
			<td>B01K4RPE0Y</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Power source</td>
			<td>Rapid LED</td>
			<td>MOONLIGHT DRIVER (350MA)</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tissue culture plates</td>
			<td>Fisherbrand</td>
			<td colspan="2">12-well (FB012928) 24-well (FB012929)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tripod Ball head</td>
			<td>Demon DB-44</td>
			<td>B00TQ54CZO</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>USB Hardrive</td>
			<td>Seagate 3TB backup</td>
			<td>STDT3000100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>USB Webcam</td>
			<td>Microsoft LifeCam</td>
			<td>Q2F-00014</td>
			<td>Purchase on Amazon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Wall mount for camera</td>
			<td>LDR Industries 1/2&#34; Steel pipe</td>
			<td>307 12X36</td>
			<td>Mounted on wall with Flange and 90 degree pipe elbow. Could also use a tripod to hold camera.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

automated measurements of sleep and locomotor activity in mexican cavefish

Kültürlenebilen uyku yükseltilmiş uyarılma eşik dahil, Uyku yoksunluğu takip rebound ve davranışsal hareketsizlik dönemlerinde konsolide son derece korunmuş davranış özellikleri ile karakterizedir. Meksika cavefish Astyanax mexicanus (A. mexicanus), özelliği evrim çevre pertürbasyon karşılık olarak çalışmak için bir model var. A. mexicanus gözlü yüzey-konut formları ve sağlam morfolojik ve davranışsal farklılıklar içeren birden çok kör mağaralarda yaşayan nüfus olduğu gibi adlı biri yok. Uyku kaybı birden çok, cavefish bağımsız olarak gelişti nüfus oluştu. Bu iletişim kuralı için uyku ve yüzey balık ve A. mexicanus mağara Lokomotor aktivite miktarının bir metodoloji açıklar. Bir hafta veya daha uzun bir süre için ayrı ayrı muhafaza larva veya yetişkin balık davranış görüntüleme için uygun maliyetli bir video izleme sistemi sağlar. Sistem yaşında 4 gün sonrası döllenme yoluyla yetişkinliğe balık için uygulanabilir. Yaklaşım aynı zamanda tek bir alanda birden çok balık kaydederek sosyal etkileşimler uyku üzerinde etkileri ölçmek için adapte edilebilir. Davranış kayıtları, veri kullanarak izleme yazılımı otomatik analiz ve uyku analiz süresi, dersin uzunluğu ve dersin numarası da dahil olmak üzere birden çok uyku değişken ölçmek özel komut dosyaları kullanılarak işlenir. Bu sistem ölçü uyku, sirkadiyen davranış ve neredeyse herhangi bir balık türleri Zebra balığı ve takımıdır gibi Lokomotor aktivite için uygulanabilir.

Larva yaşları 4-30 dpf güvenilir bir şekilde kapalı şekil 1' de açıklanan özel yapı sistemindeki kaydedilebilir. Sistem IR ve görünür aydınlatma çeşitli koşullarda görünür ışık (şekil 1A), aydınlık ve karanlık koşullarda kayıtları için izin vermek için içerir. Videolar sonra izleme yazılımı (şekil 1BC) kullanılarak analiz ve özel uyku makro (bkz...

Watch this Scientific Journal Video about Automated Measurements of Sleep and Locomotor Activity in Mexican Cavefish at JoVE.com

Automated Measurements of Sleep and Locomotor Activity in Mexican Cavefish

Bu iletişim kuralı Lokomotor davranış ve Meksika cavefish uykusunda miktarının için metodoloji ayrıntıları. Önceki analizlere bu davranışları sosyal yer alan balık ölçmek için genişletilir. Bu sistem uyku ve aktivite diğer balık türleri çalışmak için yaygın olarak uygulanabilir.

Uyku ve Meksika Cavefish Lokomotor aktivite otomatik ölçümleri

Across phyla, sleep is characterized by highly conserved behavioral characteristics that include elevated arousal threshold, rebound following sleep ...

Bu protokol herhangi bir balık popülasyonundaki uyku ve aktiviteyi ölçmek için kullanılabilir ve uyku regülasyonlarını incelemek için kullanılan model sistemlerin sayısını genişletme potansiyeline sahiptir. Bu tekniğin avantajı esnekliğidir. Örneğin, balıklar çeşitli arena boyutlarında veya tek ildeki veya grup lu deneylerde izlenebilir.Bu sistemde uyku ölçme gücü yüksek iş gücü ilaç veya genetik tarama için yöntemin amenability olduğunu. Bu yöntemi, önemli ölçüde farklı uyku fenotiplerini gösteren iki farklı mağara balığı popülasyonunda uykuevriminin incelenmesine uyguladık. Davranışsal görüntüleme için bir sistem kurmak zor olsa da, sistemimiz larva ve erişkin balıkları incelemek için uygun maliyetli bir yöntem sunmaktadır.Larva A.mexicanus'ta uyku ve sirkadiyen ritimleri incelemek için lokomotor davranışı doğru bir şekilde izlemek için sistemi oluşturmak için, larva takip sistemi için bir platform oluşturmak için 0.33 santimetre kalınlığında beyaz işaret akrilik kullanın. Kayıt platformlarını, balık içeren arenaların davranışsal izleme deneyleri sırasında yer alacağı ışıklı kare ısı lavabonun üzerine yerleştirin ve optimum aydınlatma ve kontrast için kızılötesi ni yaymak için hayvan gövdesindeki ışıklar arasında kutunun içine ikinci bir akrilik yerleştirin. Tüm larva izleme aşamasını ve aydınlatmayı kapalı bir plastik tüpün içine yerleştirin.Lensi deneysel olarak uygun bir web kamerasından çıkarmak için döner bir alet kullanın. İç gövdeyi çıkarmak için kameranın arka daki küçük vidaları çıkarın ve lensin geri kalanını gevşetmek için kameranın gövdesindeki küçük vidaları çıkarın. Lensi kestikten sonra kalan lens gövdesinin herhangi bir kısmını çıkarmak için küçük bir tornavida kullanın.Ve şarj-coupled cihazın veya CCD muhafaza üst kısmında mavi ışık yayan diyot kaldırın. Daha sonra, iki dış vidayı orijinal konumlarına geri vidalamadan önce iç gövdeyi orijinal yönüyle döndürün. Kameranın bir lens adaptörüeşlik edene kadar ekstra plastik yumuşatma yuvarlak bir plastik yönlendirme bit imal etmek için kameranın içini yönlendirmek için küçük bir testere kullanın.Kamerayla doğrudan temas etmeden kameranın içine mümkün olduğunca yakın bir kızılötesi geçiş filtresi tonu tonuyla kameranın arkasına doğru 35 milimetrelik sabit lensin adaptörünün vidasını verin. Daha sonra kamera yı ve lensi, sahne ve ışıkları barındıran tüpün üst kısmındaki kapağın içine delinmiş deliğe yerleştirin ve USB'yi hayvanların kaydedeceği bilgisayara takın. Yetişkin balıklar için bir uyku sistemi oluşturmak için, ilk yaklaşık 46 santimetre aralıklarla kızılötesi şeritler kesti.Ve kızılötesi ışığı yaymak için 46'ya 5'lik 0,32 santimetre lik ışık geçişi beyaz işaret akrilik levhayı her kızılötesi ışık şeridinin tam önüne yerleştirin. Daha sonra tüm tankları arkaya monte edilmiş kızılötesi aydınlatmayı destekleyen bir rafa yerleştirin ve tek tek arenalar oluşturmak için opak plastik bölücüler ve 10 litrelik cam tanklar kullanın. Meksika tetra balığının lokomotor aktivitesini kaydetmek için 4-6 post-fertilizasyon balığı 24 kuyulu doku plakasının bireysel kuyularına, ve altı kuyulu doku plakasının bireysel kuyularında 20-30 post-fertilizasyon ait.Bölücüler olsun veya olmasın, 10 litrelik tank başına beş yetişkine kadar sosyal bir ortamda yetişkin tetra uyku su ve aktivite kaydetmek için. Bu temsili deneyde, üç bağımsız mağara balığı popülasyonundan larva balıkları yüzey balıklarına göre uykuda önemli bir azalma göstermiştir. Uyku da önemli ölçüde yetişkin Pachon, Molino ve Tinaja mağara balık yüzey balık göre azaltılmış olarak test edilen tüm çağlar boyunca bu uyku üretimi tutarlıdır.Özellikle, sosyal konut sağlam mağara balık popülasyonları bir bodrum etkisi nedeniyle Pacho mağara balık uyku etkilemeden yüzey balık uyku azalttı. Balık kayıt yaparken kamera aydınlatmaarka göre balık sinyalini geliştirmek için en uygun olduğundan emin olmak için alınmalıdır. Metinde tam olarak açıklanan ve herhangi bir laboratuar ayarı için uygun olması gereken bu protokol için bazı temel komut satırı kodlaması gereklidir.Bu protokol uyku evrimi hakkında çok sayıda soruya yol açmıştır ve şu anda uyuşturucu ekranları için kullanılmakta olan, uyku davranışı izlemek, ve sosyal davranış uyku nasıl etkilediğini anlamak.

Research

JoVE Journal

Behavior

Mouse Short- and Long-term Locomotor Activity Analyzed by Video Tracking Software

Fare Kısa ve Uzun Vadeli Lokomotor Aktivite video Takip Yazılımı ile Analiz

Locomotor  activity (LMA) is a simple and easily performed measurement of behavior in mice  and other rodents. Improvements in video tracking software ...

Automated Visual Cognitive Tasks for Recording Neural Activity Using a Floor Projection Maze

Zemin Projeksiyon Maze kullanma Kayıt Sinir Aktivitesi otomatik Görsel Bilişsel Görevler

Neuropsychological tasks used in primates to investigate mechanisms of learning and memory are typically visually guided cognitive tasks. We have ...

Eye Tracking, Cortisol, and a Sleep vs. Wake Consolidation Delay: Combining Methods to Uncover an Interactive Effect of Sleep and Cortisol on Memory

Eye Tracking, Kortizol, ve Wake Konsolidasyon Gecikme vs Uyku: Memory Uyku ve Kortizol bir Etkileşimli Etkisi ortaya çıkarın Yöntemleri birleştiren

Although rises in cortisol can benefit memory consolidation, as can sleep soon after encoding, there is currently a paucity of literature as to how these ...

Behavioral and Locomotor Measurements Using an Open Field Activity Monitoring System for Skeletal Muscle Diseases

İskelet Kası Hastalıkları Açık Saha Aktivite İzleme Sisteminin Kullanılması Davranış ve Hareket Ölçümleri

The open field activity monitoring system comprehensively assesses locomotor and behavioral activity levels of mice. It is a useful tool for assessing ...

Use of the Open Field Maze to Measure Locomotor and Anxiety-like Behavior in Mice

Açık Alan Maze Kullanım Fare lokomotor ve Anksiyete-benzeri Davranışı Tedbir

Animal models have proven to be invaluable to researchers trying to answer questions regarding the mechanisms of behavior. The Open Field Maze is one of ...

Manipulation of Epileptiform Electrocorticograms (ECoGs) and Sleep in Rats and Mice by Acupuncture

Manipulation of Epileptiform Electrocorticograms ECoGs and Sleep in Rats and Mice by Acupuncture

Akupunktur ile Sıçan ve Farelerde Epileptiform Electrocorticograms (ECoGs) Manipülasyon ve Uyku

Ancient Chinese literature has documented that acupuncture possesses efficient therapeutic effects on epilepsy and insomnia. There is, however, little ...

Using a Split-belt Treadmill to Evaluate Generalization of Human Locomotor Adaptation

Split-kemer koşu bandı kullanarak genelleme insan Lokomotor uyum değerlendir

Understanding the mechanisms underlying locomotor learning helps researchers and clinicians optimize gait retraining as part of motor rehabilitation. ...

Noninvasive, High-throughput Determination of Sleep Duration in Rodents

Uyku süresi Rodents noninvaziv, yüksek üretilen iş belirlenmesi

Traditionally, sleep is monitored by an electroencephalogram (EEG). EEG studies in rodents require surgical implantation of the electrodes followed by a ...

A High-performance Liquid Chromatography Measurement of Kynurenine and Kynurenic Acid: Relating Biochemistry to Cognition and Sleep in Rats

Kynurenine ve Kynurenic asit yüksek performanslı sıvı kromatografi ölçüsü: Biyokimya biliş ve uyku sıçanlarda ilişkin

The kynurenine pathway (KP) of tryptophan degradation has been implicated in psychiatric disorders. Specifically, the astrocyte-derived metabolite ...

Chronic Sleep Deprivation in Mouse Pups by Means of Gentle Handling

Kronik uykusuzluk Mouse aracılığıyla yumuşak kauçuk sersemler

Sleep is critical for proper development and neural plasticity. Moreover, abnormal sleep patterns are characteristic of many neurodevelopmental disorders. ...