At studere RNA Interactors af Protein Kinase RNA-aktiveret under pattedyr cellecyklus

Vi præsenterer eksperimentelle metoder til at studere RNA-interactors af dobbelt-strenget RNA bindende protein kinase RNA-aktiveret (PKR) i løbet af pattedyr celle cyklus ved hjælp af HeLa celler. Denne metode udnytter formaldehyd bitmapgenkendelse RNA-PKR komplekser og immunoprecipitation til at berige PKR-bundet RNA'er. Disse RNA'er kan analyseres yderligere gennem høj overførselshastighed sekvensering eller qRT-PCR.