Name: chromogenic in situ hybridization as a tool for hpv-related head and neck cancer diagnosis
Uploaded: 2019-06-14T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Chromogenic In Situ Hybridization as a Tool for HPV-Related Head and Neck Cancer Diagnosis at JoVE.com

Yazarlar Hopital Européen Georges Pompidou ve Necker (Laurianne Chambolle, Elodie Michel ve Gisèle Legall) patolojisi bölümüne teşekkür; PARCC, Hopital Européen Georges Pompidou (Corinne Lesaffre) Histoloji platformu; Virginia Clark dil düzenleme için; Onun katkısı için Alexandra Elbakyan.

Protokol etik kuralları takip eder ve Etik Komite (Comité-de-Protection-des-personnes Ile-de-France-II, #2015-09-04) tarafından onaylanmıştır.
1. malzemelerin hazırlanması
<ol><li>
1x yıkama tamponunun hazırlanması
	<ol>
<li>Hazırlamak 3 L 1x yıkama tampon ekleyerek 2,94 L distile su ve bir şişe (60 mL) yıkama tampon (50x) ( malzeme tablosunabakın) büyük bir carboy. İyi karıştırın. Not: 1x yıkama tamponu önceden hazırlanabilir v...

<ol>
	<li>Lowy, D. R., Schiller, J. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reducing+HPV-associated+cancer+globally.">Reducing HPV-associated cancer globally.</a> Cancer Prevention Research.(Philadelphia, PA). 5 (1), 18-23 (2012).</li><li>Laban, S., Hoffmann, T. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Human+Papillomavirus+Immunity+in+Oropharyngeal+Cancer:+Time+to+Change+the+Game?.">Human Papillomavirus Immunity in Oropharyngeal Cancer: Time to Change the Game?.</a> Clinical Cancer Research. 24 (3), 505-507 (2018).</li><li>Wiest, T., Schwarz, E., Enders, C., Flechtenmacher, C., Bosch, F. X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Involvement+of+intact+HPV16+E6/E7+gene+expression+in+head+and+neck+cancers+with+unaltered+p53+status+and+perturbed+pRb+cell+cycle+control.">Involvement of intact HPV16 E6/E7 gene expression in head and neck cancers with unaltered p53 status and perturbed pRb cell cycle control.</a> Oncogene. 21 (10), 1510-1517 (2002).</li><li>Ndiaye, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HPV+DNA,+E6/E7+mRNA,+and+p16INK4a+detection+in+head+and+neck+cancers:+a+systematic+review+and+meta-analysis.">HPV DNA, E6/E7 mRNA, and p16INK4a detection in head and neck cancers: a systematic review and meta-analysis.</a> The Lancet Oncology. 15 (12), 1319-1331 (2014).</li><li>Mills, A. M., Dirks, D. C., Poulter, M. D., Mills, S. E., Stoler, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HR-HPV+E6/E7+mRNA+In+Situ+Hybridization.">HR-HPV E6/E7 mRNA In Situ Hybridization.</a> The American Journal of Surgical Pathology. 41 (5), 607-615 (2017).</li><li>Mendez-Pena, J. E., Sadow, P. M., Nose, V., Hoang, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RNA+chromogenic+in+situ+hybridization+assay+with+clinical+automated+platform+is+a+sensitive+method+in+detecting+high-risk+human+papillomavirus+in+squamous+cell+carcinoma.">RNA chromogenic in situ hybridization assay with clinical automated platform is a sensitive method in detecting high-risk human papillomavirus in squamous cell carcinoma.</a> Human Pathology. 63, 184-189 (2017).</li><li>Mirghani, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Diagnosis+of+HPV+driven+oropharyngeal+cancers:+Comparing+p16+based+algorithms+with+the+RNAscope+HPV-test.">Diagnosis of HPV driven oropharyngeal cancers: Comparing p16 based algorithms with the RNAscope HPV-test.</a> Oral Oncology. 62, 101-108 (2016).</li><li>Lewis, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Human+Papillomavirus+Testing+in+Head+and+Neck+Carcinomas:+Guideline+From+the+College+of+American+Pathologists.">Human Papillomavirus Testing in Head and Neck Carcinomas: Guideline From the College of American Pathologists.</a> Archives of Pathology &amp; Laboratory Medicine. 142 (5), 559-597 (2018).</li><li>Mills, A. M., Coppock, J. D., Willis, B. C., Stoler, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HPV+E6/E7+mRNA+In+Situ+Hybridization+in+the+Diagnosis+of+Cervical+Low-grade+Squamous+Intraepithelial+Lesions+(LSIL).">HPV E6/E7 mRNA In Situ Hybridization in the Diagnosis of Cervical Low-grade Squamous Intraepithelial Lesions (LSIL).</a> The American Journal of Surgical Pathology. 42 (2), 192-200 (2018).</li><li>El-Naggar, A., Chan, J. K. C., Grandis, J. R., Takata, T., Slootweg, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> WHO Classification of Head and Neck Tumours. , (2017).</li><li>Ang, K. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Human+papillomavirus+and+survival+of+patients+with+oropharyngeal+cancer.">Human papillomavirus and survival of patients with oropharyngeal cancer.</a> The New England Journal of Medicine. 363 (1), 24-35 (2010).</li><li>Badoual, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PD-1-expressing+tumor-infiltrating+T+cells+are+a+favorable+prognostic+biomarker+in+HPV-associated+head+and+neck+cancer.">PD-1-expressing tumor-infiltrating T cells are a favorable prognostic biomarker in HPV-associated head and neck cancer.</a> Cancer Research. 73 (1), 128-138 (2013).</li><li>Outh-Gauer, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immunotherapy+in+head+and+neck+cancers:+a+new+challenge+for+immunologists,+pathologists+and+clinicians.">Immunotherapy in head and neck cancers: a new challenge for immunologists, pathologists and clinicians.</a> Cancer Treatment Reviews. 65, 54-64 (2018).</li><li>Mirghani, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Diagnosis+of+HPV-driven+head+and+neck+cancer+with+a+single+test+in+routine+clinical+practice.">Diagnosis of HPV-driven head and neck cancer with a single test in routine clinical practice.</a> Modern Pathology. 28 (12), 1518-1527 (2015).</li><li>Bishop, J. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+Transcriptionally+Active+High-risk+HPV+in+Patients+With+Head+and+Neck+Squamous+Cell+Carcinoma+as+Visualized+by+a+Novel+E6/E7+mRNA+In+Situ+Hybridization+Method.">Detection of Transcriptionally Active High-risk HPV in Patients With Head and Neck Squamous Cell Carcinoma as Visualized by a Novel E6/E7 mRNA In Situ Hybridization Method.</a> The American Journal of Surgical Pathology. 36 (12), 1874-1882 (2012).</li><li>Hsieh, M. -. S., Lee, Y. -. H., Jin, Y. -. T., Huang, W. -. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Strong+SOX10+expression+in+human+papillomavirus-related+multiphenotypic+sinonasal+carcinoma:+report+of+6+new+cases+validated+by+high-risk+human+papillomavirus+mRNA+in+situ+hybridization+test.">Strong SOX10 expression in human papillomavirus-related multiphenotypic sinonasal carcinoma: report of 6 new cases validated by high-risk human papillomavirus mRNA in situ hybridization test.</a> Human Pathology. 82, 264-272 (2018).</li><li>Shi, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparative+Prognostic+Value+of+HPV16+E6+mRNA+Compared+With+In+Situ+Hybridization+for+Human+Oropharyngeal+Squamous+Carcinoma.">Comparative Prognostic Value of HPV16 E6 mRNA Compared With In Situ Hybridization for Human Oropharyngeal Squamous Carcinoma.</a> Journal of Clinical Oncology. 27 (36), 6213-6221 (2009).</li><li>Kuo, K. -. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+biomarkers+of+human+papillomavirus+infection+in+tonsillar+squamous+cell+carcinoma&#8212;molecular+basis+and+predicting+favorable+outcome.">The biomarkers of human papillomavirus infection in tonsillar squamous cell carcinoma&#8212;molecular basis and predicting favorable outcome.</a> Modern Pathology. 21 (4), 376-386 (2008).</li><li>Augustin, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+the+efficacy+of+the+four+tests+(p16+immunochemistry,+PCR,+DNA+and+RNA+In+situ+Hybridization)+to+evaluate+a+Human+Papillomavirus+infection+in+head+and+neck+cancers:+a+cohort+of+348+French+squamous+cell+carcinomas.">Evaluation of the efficacy of the four tests (p16 immunochemistry, PCR, DNA and RNA In situ Hybridization) to evaluate a Human Papillomavirus infection in head and neck cancers: a cohort of 348 French squamous cell carcinomas.</a> Human Pathology. , (2018).</li><li>Jung, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biological+and+clinical+relevance+of+transcriptionally+active+human+papillomavirus+(HPV)+infection+in+oropharynx+squamous+cell+carcinoma.">Biological and clinical relevance of transcriptionally active human papillomavirus (HPV) infection in oropharynx squamous cell carcinoma.</a> International Journal of Cancer. 126 (8), 1882-1894 (2009).</li><li>Augustin, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HPV+RNA+CISH+score+identifies+two+prognostic+groups+in+a+p16+positive+oropharyngeal+squamous+cell+carcinoma+population.">HPV RNA CISH score identifies two prognostic groups in a p16 positive oropharyngeal squamous cell carcinoma population.</a> Modern Pathology. , (2018).</li><li>Evans, M. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HPV+E6/E7+RNA+In+Situ+Hybridization+Signal+Patterns+as+Biomarkers+of+Three-Tier+Cervical+Intraepithelial+Neoplasia+Grade.">HPV E6/E7 RNA In Situ Hybridization Signal Patterns as Biomarkers of Three-Tier Cervical Intraepithelial Neoplasia Grade.</a> PLOS ONE. 9 (3), e91142 (2014).</li><li>Dreyer, J. H., Hauck, F., Oliveira-Silva, M., Barros, M. H. M., Niedobitek, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+HPV+infection+in+head+and+neck+squamous+cell+carcinoma:+a+practical+proposal.">Detection of HPV infection in head and neck squamous cell carcinoma: a practical proposal.</a> Virchows Archiv. 462 (4), 381-389 (2013).</li><li>Bingham, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RNAscope+in+situ+hybridization+confirms+mRNA+integrity+in+formalin-fixed,+paraffin-embedded+cancer+tissue+samples.">RNAscope in situ hybridization confirms mRNA integrity in formalin-fixed, paraffin-embedded cancer tissue samples.</a> Oncotarget. , (2017).</li></ol>

Satın alınan bir kit ile gerçekleştirilen HPV RNA CıSH, viral transkriptlerin tespiti için güçlü bir araçtır ve aktif HPV enfeksiyonu gösterir. El ile gerçekleştirilen, protokolün adımları genel olarak kolaylıkla takip edilir ve satın alınan Kit uygundur. Bu teknik, bir kerede 19 histolojik numune artı bir kontrol slayt boyama sağlar ve tahlil etrafında sürer 8 h. Aksi belirtilmediği sürece örnekleri adımları arasında kuru izin vermek için önemli değildir. Ön tedavi koşulu işlenmiş do...

HPV RNA CıSH, orofarenks veya uterus serviks gibi çeşitli konumlarda benign veya malign lezyonlarda önemli olabilecek aktif HPV enfeksiyonunun tespiti için güçlü bir araçtır. Aktif bir HPV enfeksiyonunun tespiti, HPV kaynaklı bir lezyonun tanısını destekleyebilir ve böylece tedavi ve prognozunu etkileyebilir.
HPV en sık cinsel yolla bulaşan enfeksiyondur ve 100 ' den fazla viral genotip1tanımlanmıştır. Şematik olarak, genotiplerde 6 ve 11 gibi düşük riskli genotipler, genital siğiller, tekrarlayan solunum papillomatozu ve diğer benign lezyonlara neden olduğu bilinmektedir, ancak en servikal kanserlerden 16 ve 18 genotip gibi yüksek riskli genotipler de sorumludur ve anal kanserler ve bölgesel epidemiyolojik veri2tarafından muhasebeleştirilir olarak değişken oranlarda hnscc onkogeninde rol oynar.
HPV enfeksiyonunun algılanması için çeşitli araçlar mevcuttur. Yüksek riskli HPV enfeksiyonu, E6 ve E73' ün viral Onkojenik proteinlerinin ifadesine yol açtıkları Için, E6 ve E7 transkriptlerinin tespiti, aktıf HPV enfeksiyon tanımlaması için altın standart olarak yaygın olarak görülebilir4. HPV RNA CıSH, çeşitli HıPV ile ilgili hastalıklardan muzdarip hastalarından oldukça kolay elde edilen FFPE örneklerinde gerçekleştirilebilir. Performansı, serviks, anüs ve vajinanın içinde Skuam intraepitelyal neoplazisinde ve serviks, anüs ve üst Aerodigestive yolu5' te invazif skuanöz hücre karsinomunda değerlendirildi:% 98 ' den fazla duyarlılık elde etti HPV DNA polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) arasında-pozitif durumlarda. Bu biraz daha iyi P16 immünostat (93%) ve HPV DNA In situ hibridizasyon (DNA ISH: 97%), daha yaygın olarak kullanılır. 57, baş ve boyun bölgesinden kaynaklanan Skuam Hücre Karsinomu (SCC), HPV DNA ıSH ile karşılaştırıldığında genital bölge, cilt ve idrar yollarının başka bir kohort, HPV RNA CıSH daha iyi duyarlılık elde (100% karşı 88%) ve özgüllük (% 87 karşı 74%)6.
P16 immünostasyon HPV enfeksiyonu tarafından (ancak sadece) neden olabilir hücre döngüsü bozulması yansıtan dolaylı bir işaretidir4,7. Bu uygun maliyetli test iyi duyarlılık ve negatif tahmin değeri vardır ve orofarenks kanserinde yüksek riskli HPV enfeksiyonu bir vekil Marker olarak tavsiye edilir (OPC) tarafından Amerikan patologlar Koleji (CAP) ve Birliği tarafından Uluslararası Kanser kontrolü (UıCC)8.
Bu yazıda yalnızca HNSCC 'de HPV 'nin saptanmasına odaklanmasına karşın, HPV RNA CıSH, HPV enfeksiyonu içeren diğer çeşitli koşullarda klinik olarak ilgilidir. Örneğin, bu teknik, morfolojik olarak belirsiz vakalar için serviks (LSIL, önceden servikal intraepitelyal neoplazi, Grade 1 [CıN1] olarak bilinen) düşük dereceli skuayöz intraepitelyal lezyonların tanısı doğruluğunu artırabilir9. Orofaringeal SCC ile ilgili olarak, HPV RNA cısh HPV ilişkili SCC tanımlaması sağlar, HPV ilgisiz orofarengeal SCC TNM sınıflandırması baş ve boyun kanseri son sekizinci baskısında farklı olarak etiketli (Uluslararası Kanser Birliği Kontrol [UıCC])10. HPV ile ilgili SCC daha uzun hayatta kalma ve gelişmiş radyoterapi ve HPV ilgisiz SCC11,12,13daha kemoterapi hassasiyeti ile daha iyi bir prognoz sergilediği için, HPV enfeksiyonu tespiti hasta yönetimi14,15. Ayrıca HPV RNA CıSH, HPV ile ilgili multiphenotipfik sinonazal karsinoma tanısı için HPV DNA CıSH16' dan daha yüksek sinyalle kullanılabilir. Birden çok değişkenli analizler, E6 ve E7 transkriptlerinin algılanması, Orofaringeal SCC genel olarak7,15,17,18 ve en iyi prognoz ile ilişkilidir. P16-pozitif orofarengeal SCC19,20alt grubu.
Burada, üreticiden elde edilen bir kit ile FFPE slaytlarında gerçekleştirilen manuel HPV RNA CıSH protokolünü sunuyoruz.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Hematoxylin solution, Gill No. 1</td>
			<td>Merck</td>
			<td>GHS132</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HybEZ Oven (110v)</td>
			<td>Advanced Cell Diagnostics Inc.</td>
			<td>321710</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HybEZ slide rack</td>
			<td>Advanced Cell Diagnostics Inc.</td>
			<td>300104</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ImmEdge Hydrophobic Barrier Pen</td>
			<td>Advanced Cell Diagnostics Inc.</td>
			<td>310018</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAscope 2.5 HD Detection Reagents-BROWN</td>
			<td>Advanced Cell Diagnostics Inc.</td>
			<td>322310</td>
			<td>This kit includes amplification reagents AMP1, AMP2, AMP3, AMP4, AMP5 and AMP6, and detection reagents DAB-A and DAB-B</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAscope 3-Plex Negative Control Probe</td>
			<td>Advanced Cell Diagnostics Inc.</td>
			<td>320871</td>
			<td>DAPB</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAscope 3-Plex Positive Control Probe</td>
			<td>Advanced Cell Diagnostics Inc.</td>
			<td>320861</td>
			<td>PPIB</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAscope H202 &#38; Protease Plus Reagent</td>
			<td>Advanced Cell Diagnostics Inc.</td>
			<td>322330</td>
			<td>Hydrogen Peroxyde x2 and Protease Plus x 1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAscope Probe- HPV16/18</td>
			<td>Advanced Cell Diagnostics Inc.</td>
			<td>311121</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAscope Target Retrieval Reagents</td>
			<td>Advanced Cell Diagnostics Inc.</td>
			<td>322000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAscope Wash Buffer Reagents</td>
			<td>Advanced Cell Diagnostics Inc.</td>
			<td>310091</td>
			<td>Wash Buffer 50X x4</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

chromogenic in situ hybridization as a tool for hpv-related head and neck cancer diagnosis

Human papilloma virüsü (HPV) enfeksiyonu, alkol ve tütün ile ilgili opscc 'den daha iyi bir sonuç ile ilişkili olma eğilimindedir Orofaringeal skuayöz Hücre Karsinomu (opscc) bir alt türü için önemli bir risk faktörüdür. HPV viral RNA 'nın kromojenik in situ hibridizasyon (cish), Onkojenik proteinlerin E6 ve E7 viral transkriptlerinin yarı niceliksel değerlendirilmesi ve iyi bir uzamsal çözünürlüğe sahip bir in situ görselleştirme sağlar. Bu teknik, tümör HPV enfekte hücrelerde HPV transkripsiyon görselleştirme ile aktif bir enfeksiyon tanısı sağlar. Bu tekniğin bir avantajı, tümörle bitişik olmayan neoplastik HPV enfekte hücrelerden kontaminasyondan kaçınmak. Genel olarak, iyi tanı performansları aktif HPV enfeksiyon tanımlaması için altın standardı olarak kabul etmiştir. Hücre proteinleri ile E6 ve E7 viral protein etkileşiminin sorun ve p53 için zorunlu olduğu için, HPV RNA cısh işlevsel olarak ilgilidir ve aktif Onkojenik HPV enfeksiyonunu akut yansıtır. Bu teknik, "düşük" veya "yüksek" HPV transkripsiyon düzeylerinin HPV ile ilgili P16 pozitif baş ve boyun kanseri hastalarında iki prognoz grubunun tanımlanmasına yardımcı olduğu için klinik olarak da ilgilidir. Burada, üreticiden elde edilen bir kit ile formalin-fixed parafin-Embedded (FFPE) slaytlarında gerçekleştirilen manuel HPV RNA CıSS protokolünü sunuyoruz. Kromojenik vahiy yerine, RNA içinde situ hibridizasyon da floresan Vahiy (RNA balık) ile yapılabilir. Ayrıca konvansiyonel immünostasyon ile birlikte olabilir.

Burada açıklandığı gibi, baş ve boyun skuayöz hücre kanserinde, bir olgu sitoplazmada veya tümör hücrelerinin çekirdeklerinde kahverengi daktiform lekemesinde olumlu düşünülebilir. Çoğu çalışmada, sinyal "pozitif" veya "algılanmadı"14olarak kabul edilir. Sinyal semiquantification yöntemleri rapor edilmiştir ama takımlar arasındaki standardizasyon eksikliği. Örneğin, bazı çalışmalarda, sinyaller 1 + olarak 1 +-3 tümör hücresi başına nokta, 2 + ile 4 – 9 tüm...

Watch this Scientific Journal Video about Chromogenic In Situ Hybridization as a Tool for HPV-Related Head and Neck Cancer Diagnosis at JoVE.com

Chromogenic In Situ Hybridization as a Tool for HPV-Related Head and Neck Cancer Diagnosis

Human papilloma virüsü (HPV) RNA kromojenik in situ hibridizasyon tümörlerde aktif insan papilloma virüsü Enfeksiyon algılama için altın standartlarından biri olarak kabul edilir. HPV E6-E7 mRNA ifadesinin lokalizasyonu ve sinyalinin seminiceliksel değerlendirilmesi ile görselleştirilmesini sağlar.

Kromojenik In situ hybridization HPV Ile Ilgili baş ve boyun kanseri tanısı için bir araç ss

Human papillomavirus (HPV) infection is a major risk factor for a subtype of oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC), which tends to be associated ...

HPV RNA CISH aktif bir human papilloma virüs enfeksiyonu nun saptanmasına izin verir. Yerinde hibridizasyon HPV RNA'yı hedef aldığından bu teknik virüsün aktif transkripsiyonunun görüntülenmesine olanak sağlar. Bu kesin mekansal çözünürlük ve iyi tanı performansları vardır.HPV'nin saptanması orofarengeal skuamöz hücreli karsinom veya servikal neoplazi gibi HPV'ye bağlı çeşitli lezyonların tanısını destekleyebilir. Ayrıca prognoz üzerinde bir etkisi olabilir. Tamponlar ve karşı boyama reaktifleri hazırladıktan sonra, 630 mililitre distile suya 70 mililitre 10x hedef alma reaktifi ekleyerek büyük bir kabın içinde bir x hedef alma reaktifi hazırlayın.Manyetik karıştırıcı ile bir ısıtma plakası üzerine beher yerleştirin ve alüminyum folyo ile kaplayın. 100 santigrat derecede 10-15 dakika kaynatın ve 30 dakikadan uzun kaynatın. Daha önce deparafinize edilmiş ve slayt rafına yerleştirilen doku bölümleri ile slaytlarda peroksidaz aktivitesini engellemek için, her slayta hidrojen peroksit örneği kapsayacak kadar dört ila altı damla ekleyin ve oda sıcaklığında 10 dakika kuluçkaya yatırın.Slaytları iki dakika boyunca iki kez oda sıcaklığında distile suda yıkayın. RNA doku bölümlerinde RNA doku sınırları kırmak için, ilk bir pençe kullanarak kaynayan bir x TRR alüminyum folyo çıkarın ve karıştırma durdurmak. Slayt rafını yavaşça ve çok dikkatli bir şekilde batırın.Kabı tekrar alüminyum folyo ile kapatın ve 15 dakika kuluçkaya yatırın. Hemen distile su banyosu için sıcak slayt raf aktarmak ve iki dakika boyunca yıkamapençe kullanın. Slaytları daha sonra taze %100 etanolde iki dakika boyunca yıkayın ve oda sıcaklığında iki dakika kurumasını bekleyin.Daha sonra, her numunenin etrafına bir bariyer çizmek için hidrofobik bariyer kalemkullanın ve en az beş dakika kurumasını bekleyin. Proteaz sindirim için, nem kontrollü tepsiye slaytlar yerleştirin ve örnek başına Proteaz Plus yaklaşık dört damla ekleyin. Tepsiyi bir kapakla kapatın ve 40 derecede 30 dakika hibritleştirme fırınına takın.Tepsiyi fırından çıkarın ve slayt rafını çıkarın. Her seferinde bir slayt çalışma, hızlı bir şekilde herhangi bir fazla sıvı kaldırmak ve distile su ile dolu bir boyama çanağı batırılmış slayt rafına slayt yerleştirin. Sürekli ajitasyon ile oda sıcaklığında distile suda iki dakika boyunca iki kez slaytlar yıkayın.Hibritleştirmeye başlamak için, fazla sıvıyı çıkarmak ve slayt rafına geri yerleştirmek için slaytlara dokunun ve hafifçe vurun. Önceden ısıtılmış HPV probu fırından çıkarın ve her bölümü tamamen kapsayacak şekilde yaklaşık dört damla ekleyin. Tepsinin üzerini kapakla kapatın ve 40 derecede iki saat fırına takın.Kuluçkayı tamamladıktan sonra tepsiyi fırından çıkarın ve slayt rafını çıkarın. Her seferinde bir slayt, hızlı bir şekilde herhangi bir fazla sıvı kaldırmak ve slayt bir x yıkama tampon ile dolu bir boyama çanak batık slayt rafına yerleştirin, sürekli ajitasyon ile oda sıcaklığında iki dakika boyunca slaytyıkama, ve taze bir x yıkama tampon ile tekrarlayın. Slaytlardan fazla sıvıyı çıkarmak için dokunun ve hafifçe vurun ve slayt rafına tekrar yerleştirin.Her bölümü tamamen kapsayacak şekilde bölüm başına yaklaşık dört damla oda sıcaklığında AMP1 ekleyin. Tepsinin üzerini kapakla kapatın ve 40 derecede 30 dakika fırına takın. Tepsiyi fırından çıkardıktan sonra kaydırma rafını çıkarın.Bir seferde bir slayt çalışma, hızlı bir şekilde herhangi bir fazla sıvı kaldırmak ve slayt rafta bir x yıkama tampon ile dolu bir boyama çanağı batık yerleştirin, sürekli ajitasyon ile oda sıcaklığında iki dakika yıkama, ve taze bir x yıkama tampon ile tekrarlayın. Her dab-A ve DAB-B çözeltisinin aynı sayıda damlasını uygun büyüklükteki bir tüpe dağıtarak her bölüm başına yaklaşık 120 mikrolitre DAB substratı ve girdap yapın. Slayt rafından her bir slaytı teker teker alın ve fazla sıvıyı çıkarmak için dokunun ve kaydırağını geri yerleştirin.Pipet her doku bölümü üzerine DAB karışımı yaklaşık 120 mikrolitre, bölümlerin kaplı olduğundan emin olun. Oda sıcaklığında 10 dakika kuluçkaya yatvere ve karşı boyama ile devam edin. Cam çıta başına bir damla montaj ortamı yerleştirin ve ardından çıtaları kaydıraklara yerleştirin ve havanın kurumasını bekleyin.Birkaç saat sonra, makalede açıklandığı gibi optik mikroskop kullanarak değerlendirmeye devam edin. Burada açıklandığı gibi baş ve boyun skuamöz hücreli karsinom, sitoplazmada veya tümör hücrelerinin çekirdeklerinde kahverengi punktikform boyama varlığı pozitif bir olgu yu tanımladı. Sonuçlar iki skora ayrıldı: RNA CISH yüksek ve düşük puan 20x hedefi ile gözlendi.Tümör hücrelerinin %50'sinin altında gözlendiğinde rna CISH skoru boyama düşük kabul edilir ve hücre yüzeyinin %80'inden azını kaplar. Diğer taraftan, Lekeli kanser hücrelerinin %50'sinden fazlasında veya tümör hücrelerinin %30'undan fazlasında %80'i aşan boyama yüzeyi ile Gözlendiğinde RNA CISH skoru yüksektir. Hibritizasyon için slaytların kurumasına asla izin vermemeliyiz.Sondayı önceden ısıtmayı unutmayın. Her örnek için, RNA kalitesini değerlendirmek için pozitif ve negatif kontrol gerçekleştirin.

Research

JoVE Journal

Genetics

Detection of Copy Number Alterations Using Single Cell Sequencing

Tek Hücre sıralama kullanarak Kopya sayısı Değişmeler Algılama

Detection of genomic changes at single cell resolution is important for characterizing genetic heterogeneity and evolution in normal tissues, cancers, and ...

Detection of Inter-chromosomal Stable Aberrations by Multiple Fluorescence In Situ Hybridization (mFISH) and Spectral Karyotyping (SKY) in Irradiated Mice

Detection of Inter-chromosomal Stable Aberrations by Multiple Fluorescence In Situ Hybridization mFISH and Spectral Karyotyping SKY in Irradiated Mice

Çoklu Floresan Inter-kromozomal Kararlı sapmaları Algılama<em&gt; In Situ</em&gt; Hibridizasyon (mFISH) ve ışınlanmış Farelerde Spektral Karyotipik (SKY)

Ionizing radiation (IR) induces numerous stable and unstable chromosomal aberrations. Unstable aberrations, where chromosome morphology is substantially ...

A Standard Methodology to Examine On-site Mutagenicity As a Function of Point Mutation Repair Catalyzed by CRISPR/Cas9 and SsODN in Human Cells

Yerinde mutagenisitesinin CRISPR/Cas9 ve SsODN insan hücrelerinde tarafından katalize nokta mutasyon onarım bir fonksiyonu olarak incelemek için standart bir metodoloji

Combinatorial gene editing using CRISPR/Cas9 and single-stranded oligonucleotides is an effective strategy for the correction of single-base point ...

High Resolution Fluorescent In Situ Hybridization in Drosophila Embryos and Tissues Using Tyramide Signal Amplification

High Resolution Fluorescent In Situ Hybridization in Drosophila Embryos and Tissues Using Tyramide Signal Amplification

Yüksek çözünürlüklü Floresan Situ hibridizasyon Drosophila embriyo ve Tyramide sinyal güçlendirme kullanarak doku

In our efforts to determine the patterns of expression and subcellular localization of Drosophila RNAs on a genome-wide basis, and in a variety of ...

Profiling DNA Replication Timing Using Zebrafish as an In Vivo Model System

Profiling DNA Replication Timing Using Zebrafish as an In Vivo Model System

Zebra balığı bir Vivo içinde Model sistemi olarak kullanarak DNA çoğaltma zamanlaması profil oluşturma

DNA replication timing is an important cellular characteristic, exhibiting significant relationships with chromatin structure, transcription, and DNA ...

Canalostomy As a Surgical Approach to Local Drug Delivery into the Inner Ears of Adult and Neonatal Mice

Canalostomy yerel ilaç dağıtım yetişkin ve Neonatal farelerin iç kulaklarına bir cerrahi yaklaşım olarak

Local delivery of therapeutic drugs into the inner ear is a promising therapy for inner ear diseases. Injection through semicircular canals (canalostomy) ...

Visualization of Microbiota in Tick Guts by Whole-mount In Situ Hybridization

Visualization of Microbiota in Tick Guts by Whole-mount In Situ Hybridization

Kene bağırsaklar tarafından bütün-mount Situ hibridizasyon Microbiota görselleştirme

Infectious diseases transmitted by arthropod vectors continue to pose a significant threat to human health worldwide. The pathogens causing these ...

Single Molecule Fluorescence In Situ Hybridization (smFISH) Analysis in Budding Yeast Vegetative Growth and Meiosis

Single Molecule Fluorescence In Situ Hybridization smFISH Analysis in Budding Yeast Vegetative Growth and Meiosis

Tek molekül floresans In Situ hibridizasyon (smFISH) analizi Budding Maya bitkisel büyüme ve mayoz

Single molecule fluorescence in situ hybridization (smFISH) is a powerful technique to study gene expression in single cells due to its ability to detect ...

Quantitative Analysis of Alternative Pre-mRNA Splicing in Mouse Brain Sections Using RNA In Situ Hybridization Assay

Quantitative Analysis of Alternative Pre-mRNA Splicing in Mouse Brain Sections Using RNA In Situ Hybridization Assay

Kantitatif analiz alternatif Pre-mRNA RNA In Situ hibridizasyon tahlil kullanarak fare beyin bölümlerde Uçbirleştirme

Alternative splicing (AS) occurs in more than 90% of human genes. The expression pattern of an alternatively spliced exon is often regulated in a cell ...

Tissue-specific miRNA Expression Profiling in Mouse Heart Sections Using In Situ Hybridization

Tissue-specific miRNA Expression Profiling in Mouse Heart Sections Using In Situ Hybridization

Doku özgü miRNA ifade profil oluşturma In Situ hibridizasyon fareyle kalp bölümleri içinde

micro-RNAs (miRNAs) are single-stranded RNA transcripts that bind to messenger RNAs (mRNAs) and inhibit their translation or promote their degradation. To ...