Name: isolation and quantitative evaluation of brush cells from mouse tracheas
Uploaded: 2019-06-12T13:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Isolation and Quantitative Evaluation of Brush Cells from Mouse Tracheas at JoVE.com

Biz Brigham ve kadın ınsan Immünoloji merkezi Flow Core akış cytometrik sıralama ile onun yardımı için adam Chicoine teşekkür ederiz. Bu çalışma, Ulusal Sağlık bağışları R01 HL120952 (N.A.B.), R01 AI134989 (N. A. B), U19 AI095219 (N.A.B., L. G. B) ve K08 AI132723 (L. G. B) ve Amerikan alerji, astım ve Immünoloji (AAAAI)/Amerikan Akciğer alerjisi tarafından destekleniyordu Solunum hastalığı Ödülü (N.A.B.), AAAAI Vakfı fakülte geliştirme Ödülü (L.G.B.) tarafından, Steven ve Judy Kaye genç yenilikçiler Ödülü (N.A.B.) tarafından, JoYcElYn C. Austen Fonu kadın hekim bilim adamları kariyer gelişimi için (L.G.B.), ve bir vinik ailesi (L.G.B.) tarafından cömert bağış.

Aşağıdaki denemeleri yapmadan önce, tüm hayvan bakım kullanımı ve protokollerinin kurumsal hayvan bakımı ve kullanım Komitesi (IAUC) tarafından onaylanması ve Ulusal Araştırma Konseyi 'nin "bakım ve Kullanım Kılavuzu "ile uyumlu olarak gerçekleştirildiğinden emin olun. Lab Animals " (8 . sürüm, 2011) ve gelmesi yönergeleri. Aşağıda açıklanan tüm prosedürler Brigham ve kadın Hastanesi 'nde kurumsal hayvan bakımı ve kullanım Komitesi tarafından incelenip onay...

<ol>
	<li>Tizzano, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nasal+chemosensory+cells+use+bitter+taste+signaling+to+detect+irritants+and+bacterial+signals.">Nasal chemosensory cells use bitter taste signaling to detect irritants and bacterial signals.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107 (7), 3210-3215 (2010).</li><li>Genovese, F., Tizzano, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microvillous+cells+in+the+olfactory+epithelium+express+elements+of+the+solitary+chemosensory+cell+transduction+signaling+cascade.">Microvillous cells in the olfactory epithelium express elements of the solitary chemosensory cell transduction signaling cascade.</a> PLoS One. 13 (9), 0202754 (2018).</li><li>Bankova, L. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+cysteinyl+leukotriene+3+receptor+regulates+expansion+of+IL-25-producing+airway+brush+cells+leading+to+type+2+inflammation.">The cysteinyl leukotriene 3 receptor regulates expansion of IL-25-producing airway brush cells leading to type 2 inflammation.</a> Science Immunology. 3 (28), (2018).</li><li>Krasteva, G., Canning, B. J., Papadakis, T., Kummer, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cholinergic+brush+cells+in+the+trachea+mediate+respiratory+responses+to+quorum+sensing+molecules.">Cholinergic brush cells in the trachea mediate respiratory responses to quorum sensing molecules.</a> Life Sciences. 91 (21-22), 992-996 (2012).</li><li>Nadjsombati, M. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+Succinate+by+Intestinal+Tuft+Cells+Triggers+a+Type+2+Innate+Immune+Circuit.">Detection of Succinate by Intestinal Tuft Cells Triggers a Type 2 Innate Immune Circuit.</a> Immunity. 49 (1), 33-41 (2018).</li><li>von Moltke, J., Ji, M., Liang, H. E., Locksley, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tuft-cell-derived+IL-25+regulates+an+intestinal+ILC2-epithelial+response+circuit.">Tuft-cell-derived IL-25 regulates an intestinal ILC2-epithelial response circuit.</a> Nature. 529 (7585), 221-225 (2016).</li><li>Deckmann, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bitter+triggers+acetylcholine+release+from+polymodal+urethral+chemosensory+cells+and+bladder+reflexes.">Bitter triggers acetylcholine release from polymodal urethral chemosensory cells and bladder reflexes.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111 (22), 8287-8292 (2014).</li><li>Liu, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Members+of+Bitter+Taste+Receptor+Cluster+Tas2r143/Tas2r135/Tas2r126+Are+Expressed+in+the+Epithelium+of+Murine+Airways+and+Other+Non-gustatory+Tissues.">Members of Bitter Taste Receptor Cluster Tas2r143/Tas2r135/Tas2r126 Are Expressed in the Epithelium of Murine Airways and Other Non-gustatory Tissues.</a> Frontiers in Physiology. 8, 849 (2017).</li><li>Krasteva, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cholinergic+chemosensory+cells+in+the+auditory+tube.">Cholinergic chemosensory cells in the auditory tube.</a> Histochemistry and Cell Biology. 137 (4), 483-497 (2012).</li><li>Krasteva, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cholinergic+chemosensory+cells+in+the+trachea+regulate+breathing.">Cholinergic chemosensory cells in the trachea regulate breathing.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108 (23), 9478-9483 (2011).</li><li>Montoro, D. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+revised+airway+epithelial+hierarchy+includes+CFTR-expressing+ionocytes.">A revised airway epithelial hierarchy includes CFTR-expressing ionocytes.</a> Nature. 560 (7718), 319-324 (2018).</li><li>Plasschaert, L. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+single-cell+atlas+of+the+airway+epithelium+reveals+the+CFTR-rich+pulmonary+ionocyte.">A single-cell atlas of the airway epithelium reveals the CFTR-rich pulmonary ionocyte.</a> Nature. 560 (7718), 377-381 (2018).</li><li>Dwyer, D. F., Barrett, N. A., Austen, K. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immunological+Genome+Project,+C.+Expression+profiling+of+constitutive+mast+cells+reveals+a+unique+identity+within+the+immune+system.">Immunological Genome Project, C. Expression profiling of constitutive mast cells reveals a unique identity within the immune system.</a> Nature Immunology. 17 (7), 878-887 (2016).</li><li>Howitt, M. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tuft+cells,+taste-chemosensory+cells,+orchestrate+parasite+type+2+immunity+in+the+gut.">Tuft cells, taste-chemosensory cells, orchestrate parasite type 2 immunity in the gut.</a> Science. 351 (6279), 1329-1333 (2016).</li><li>Bankova, L. G., Dwyer, D. F., Liu, A. Y., Austen, K. F., Gurish, M. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maturation+of+mast+cell+progenitors+to+mucosal+mast+cells+during+allergic+pulmonary+inflammation+in+mice.">Maturation of mast cell progenitors to mucosal mast cells during allergic pulmonary inflammation in mice.</a> Mucosal Immunology. 8 (3), 596-606 (2015).</li><li>Rock, J. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Basal+cells+as+stem+cells+of+the+mouse+trachea+and+human+airway+epithelium.">Basal cells as stem cells of the mouse trachea and human airway epithelium.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106 (31), 12771-12775 (2009).</li><li>Rock, J. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multiple+stromal+populations+contribute+to+pulmonary+fibrosis+without+evidence+for+epithelial+to+mesenchymal+transition.">Multiple stromal populations contribute to pulmonary fibrosis without evidence for epithelial to mesenchymal transition.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108 (52), 1475-1483 (2011).</li><li>Gerbe, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intestinal+epithelial+tuft+cells+initiate+type+2+mucosal+immunity+to+helminth+parasites.">Intestinal epithelial tuft cells initiate type 2 mucosal immunity to helminth parasites.</a> Nature. 529 (7585), 226-230 (2016).</li><li>Rock, J. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transmembrane+protein+16A+(TMEM16A)+is+a+Ca2+-regulated+Cl-+secretory+channel+in+mouse+airways.">Transmembrane protein 16A (TMEM16A) is a Ca2+-regulated Cl- secretory channel in mouse airways.</a> Journal of Biological Chemistry. 284 (22), 14875-14880 (2009).</li><li>Olsen, J. V., Ong, S. E., Mann, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trypsin+cleaves+exclusively+C-terminal+to+arginine+and+lysine+residues.">Trypsin cleaves exclusively C-terminal to arginine and lysine residues.</a> Molecular and Cellular Proteomics. 3 (6), 608-614 (2004).</li><li>Verma, S., Dixit, R., Pandey, K. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cysteine+Proteases:+Modes+of+Activation+and+Future+Prospects+as+Pharmacological+Targets.">Cysteine Proteases: Modes of Activation and Future Prospects as Pharmacological Targets.</a> Frontiers in Pharmacology. 7, 107 (2016).</li><li>Huettner, J. E., Baughman, R. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Primary+culture+of+identified+neurons+from+the+visual+cortex+of+postnatal+rats.">Primary culture of identified neurons from the visual cortex of postnatal rats.</a> Journal of Neuroscience. 6 (10), 3044-3060 (1986).</li><li>Kaiser, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dissociated+neurons+and+glial+cells+derived+from+rat+inferior+colliculi+after+digestion+with+papain.">Dissociated neurons and glial cells derived from rat inferior colliculi after digestion with papain.</a> PLoS One. 8 (12), 80490 (2013).</li><li>Aoyagi, T., Takeuchi, T., Matsuzaki, A., Kawamura, K., Kondo, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Leupeptins,+new+protease+inhibitors+from+Actinomycetes.">Leupeptins, new protease inhibitors from Actinomycetes.</a> Journal of Antibiotics (Tokyo). 22 (6), 283-286 (1969).</li><li>Kohanski, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Solitary+chemosensory+cells+are+a+primary+epithelial+source+of+IL-25+in+patients+with+chronic+rhinosinusitis+with+nasal+polyps.">Solitary chemosensory cells are a primary epithelial source of IL-25 in patients with chronic rhinosinusitis with nasal polyps.</a> The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 142 (2), 460-469 (2018).</li><li>Patel, N. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Solitary+chemosensory+cells+producing+interleukin-25+and+group-2+innate+lymphoid+cells+are+enriched+in+chronic+rhinosinusitis+with+nasal+polyps.">Solitary chemosensory cells producing interleukin-25 and group-2 innate lymphoid cells are enriched in chronic rhinosinusitis with nasal polyps.</a> International Forum of Allergy &amp; Rhinology. , (2018).</li><li>Kouzaki, H., O'Grady, S. M., Lawrence, C. B., Kita, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteases+induce+production+of+thymic+stromal+lymphopoietin+by+airway+epithelial+cells+through+protease-activated+receptor-2.">Proteases induce production of thymic stromal lymphopoietin by airway epithelial cells through protease-activated receptor-2.</a> The Journal of Immunology. 183 (2), 1427-1434 (2009).</li><li>Cambier, J. C., Vitetta, E. S., Kettman, J. R., Wetzel, G. M., Uhr, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=B-cell+tolerance.+III.+Effect+of+papain-mediated+cleavage+of+cell+surface+IgD+on+tolerance+susceptibility+of+murine+B+cells.">B-cell tolerance. III. Effect of papain-mediated cleavage of cell surface IgD on tolerance susceptibility of murine B cells.</a> The Journal of Experimental Medicine. 146 (1), 107-117 (1977).</li><li>Nishikado, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cysteine+protease+antigens+cleave+CD123,+the+alpha+subunit+of+murine+IL-3+receptor,+on+basophils+and+suppress+IL-3-mediated+basophil+expansion.">Cysteine protease antigens cleave CD123, the alpha subunit of murine IL-3 receptor, on basophils and suppress IL-3-mediated basophil expansion.</a> Biochemical and Biophysical Research Communications. 460 (2), 261-266 (2015).</li></ol>

Biz 40 dakika için yüksek doz dispaz tedavisi bir arada kısa papain tedavisi (30 dk) takip, trakeal sindirim ve fırça hücre yalıtımı için optimum bir protokol sağlar bulundu. Bu kombinasyon hem geniş sindirim önler ve fırça hücrelerinin en yüksek verim üretir, alternatif protokollere kıyasla.
Hematopoetik hücreler ayıklamak için akciğer sindirimi klasik kolajenaz IV15gibi hafif sindirim enzimleri üzerinde dayanırken, epitelyal hücrelerin yalıt...

Fırça hücreleri, acı tat reseptörlerinin ifadesi ve tat tomurcuğu hücrelerinde bulunan tat reseptörü dönüştürücü makinelerinin karakterize olduğu kemoduyusal epitelyal hücreler sınıfına aittir. Tat tomurcuk hücrelerinin aksine, kemoduyu epitelyal hücreler epitelyal yüzeylerde dağılmış ve burun epiteli hücreler (SCCS) ve microvillous hücreleri olarak adlandırılır1,2, trakea fırça hücreleri 3,4, ve tüft hücreler bağırsak5,6. Acı tat reseptörleri ve acı tat dönüştürücü makine ifade epitelyal hücreler de üretra7,8 ve işitsel tüp9bulunur. Hava yolu fırça hücreleri nörojenik ve bağışıklık havayolu yanıtlarında benzersiz işlevlere sahiptir. Onlar asetilkolin üreten kemoduyusal hücreler, acı bileşikler ve çekirdek algılama maddeleri gibi bakteriyel metabolitler ile aktivasyon üzerine koruyucu solunum refleksleri uyandıran10. Havayolu fırça hücreleri de Il-25 baskın hava yolu epitelyal kaynağıdır, hangi hava yolları3aeroallerjen-elicited tip 2 inflamasyon düzenler.
Alt hava yolu fırça hücrelerinin tam transkriptom karakterizasyonu ve çevresel uyaranlara yanıt onların düşük sayılar trakeal epitelyum ve büyük bronşi10ötesinde çok sınırlı sayıda ile sınırlıdır. Bağırsak epitelinin kemoduyusal hücrelerin izolasyonunda kullanılan teknikler, trakea 'dan orantılı olarak yüksek sayılar vermedi, muhtemelen sinir uçları ile trakeal fırça hücrelerinin samimi temasları nedeniyle10 veya diğer yapışkanslar ve sıkı kavşak proteinlerinin bileşimi gibi solunum mukozasında dokuya özgü faktörler. Tek hücreli RNA sıralama analizi için daha yüksek sayılarda trakeal fırça hücrelerinin başarılı bir şekilde yalıtılmasının son raporları, papain ile 2 h inkübasyon ya da pronase11,12ile 18 h inkübasyon kullanılmıştır. Sindirim enzimleri ile uzun kuluzlar hücre canlılığı azaltabilir ve sindirilmiş dokulardan hücrelerin transkripsiyonel profilini değiştirmek beri13, bu diğer chemosensory epitelyal nüfusu ile önyargı karşılaştırmalı analiz olabilir.
Burada, RNA sıralaması3için trakeal fırça hücrelerinin yalıtımına yönelik bir yöntem bildiriyoruz. Yüksek doz dispaz ile trakea tedavisi submukoza epitel ayırır. Papain ile epitelyal sac sonraki sindirim Bu yapısal hücrenin mükemmel iyileşme sağlar.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:749px;" width="749">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td>Antibodies</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">Anti-GFP (Polyclonal goat Ig)</td>
			<td style="width:101px;">Abcam</td>
			<td>cat# ab5450</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">APC anti-mouse CD326 (EpCAM)&#160; (G8.8)</td>
			<td style="width:101px;">Biolegend</td>
			<td style="width:136px;">cat#118214</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">APC Rat IgG2a, k isotype control</td>
			<td style="width:101px;">Biolegend</td>
			<td style="width:136px;">cat#400511</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">DAPI</td>
			<td style="width:101px;">Biolegend</td>
			<td style="width:136px;">cat#422801</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="80">
			<td height="80" style="height:80px;width:345px;">Donkey anti-goat IgG (H+L) Highly Cross-Adsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 488</td>
			<td style="width:101px;">Life Technologies/Molecular Probes</td>
			<td>cat#A-11055</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">Normal Goat IgG</td>
			<td style="width:101px;">R&#38;D Systems</td>
			<td style="width:136px;">cat#AB-108-C</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">Pacific Blue anti-mouse CD45 (30F-11)</td>
			<td style="width:101px;">Biolegend</td>
			<td style="width:136px;">cat#103126</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">Pacific Blue Rat IgG2b, k isotype control</td>
			<td style="width:101px;">Biolegend</td>
			<td style="width:136px;">cat#400627</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:345px;">TruStain FcX (anti-mouse CD16/32) Antibody</td>
			<td style="width:101px;">Biolegend</td>
			<td style="width:136px;">cat#101320</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td>Chemicals, Peptides, and Recombinant Proteins</td>
			<td style="width:167px;"></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:345px;">Dispase</td>
			<td style="width:101px;">Gibco</td>
			<td style="width:136px;">cat# 17105041&#160;</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">DNase I</td>
			<td style="width:101px;">Sigma&#160;</td>
			<td>cat# 10104159001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="104">
			<td height="104" style="height:104px;width:345px;">HEPES-Tyrode&#8217;s Buffer Without Calcium (10 mM HEPES, 135 mM NaCl, 2.8 mM KCl, 1 mM MgCl2, 12 mM NaHCO3, 0.4 mM NaH2PO4, 0.25% BSA, 5.5 mM Glucose. Prepared in 18.2 megohms water and filtered through 0.22 &#181;m filter</td>
			<td style="width:101px;">Boston BioProducts</td>
			<td style="width:136px;">cat# PY-912</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="82">
			<td height="82" style="height:82px;width:345px;">Tyrode&#8217;s Solution (HEPES-Buffered) 140 mM NaCl, 5 mM KCl, 25 mM HEPES, 2 mM CaCl2, 2 mM MgCl2 and 10 mM glucose. Prepared in 18.2 megohms water and filtered through 0.22 &#181;m filter. )</td>
			<td style="width:101px;">Boston BioProducts</td>
			<td style="width:136px;">cat# BSS-355</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">L-Cysteine</td>
			<td style="width:101px;">Sigma</td>
			<td style="width:136px;">cat# C7352</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">Leupeptin trifluoroacetate salt</td>
			<td style="width:101px;">Sigma</td>
			<td style="width:136px;">cat# L2023</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">Papain from papaya latex</td>
			<td style="width:101px;">Sigma</td>
			<td style="width:136px;">cat# P3125</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:345px;">Propidium iodide&#160;</td>
			<td style="width:101px;">Sigma</td>
			<td style="width:136px;">cat# P4170</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:345px;">Experimental Models: Organisms/Strains</td>
			<td style="width:101px;"></td>
			<td style="width:136px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">ChATBAC-eGFP (B6.Cg-Tg(RP23-268L19-EGFP)2Mik/J)</td>
			<td style="width:101px;">The Jackson Laboratory</td>
			<td style="width:136px;">7902</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:345px;">Equipment</td>
			<td style="width:101px;"></td>
			<td style="width:136px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:345px;">LSM 800 with Airyscan confocal system&#160;on a&#160;Zeiss Axio Observer Z1 Inverted Microscope</td>
			<td style="width:101px;">Zeiss</td>
			<td style="width:136px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">LSRFortessa</td>
			<td>BD</td>
			<td style="width:136px;">647465</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:345px;">Disposable equipment</td>
			<td style="width:101px;"></td>
			<td style="width:136px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:345px;">1.5 mL sterile tubes</td>
			<td style="width:101px;">Thomas Scientific</td>
			<td style="width:136px;">1157C86</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">5 mL Poysterene Round-bottom Tube, 12 x 75 mm style</td>
			<td style="width:101px;">Falcon</td>
			<td style="width:136px;">14-959-1A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">50 mL Polypropylene conical tube, 30 x 115 mm style</td>
			<td style="width:101px;">Falcon</td>
			<td style="width:136px;">352098</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:345px;">Feather Disposable Scalpel no.12</td>
			<td style="width:101px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:136px;">NC9999403</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:345px;">Petri dish, 100 x 15 mm Style</td>
			<td style="width:101px;">Falcon</td>
			<td style="width:136px;">351029</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:345px;">Sterile cell strainer, 100 &#956;m</td>
			<td style="width:101px;">Fisherbrand</td>
			<td style="width:136px;">cat#22363549</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

isolation and quantitative evaluation of brush cells from mouse tracheas

Trakeal fırça hücreleri, hava yolu lümeninden bağışıklık ve sinir sistemlerine sinyal iletimi için uygulanan kolinerjik kemoduyusal epitelyal hücrelerdir. Onlar bağırsak mukozasında tutam hücreleri, trakea fırça hücreleri ve burun mukozasında soliter kemoduyusal ve mikrovillöz hücreler içeren kemoduyusal epitelyal hücreler ailesinin bir parçasıdır. Farklı epitelyal bölmeler içindeki kemoduyusal hücreler anahtar hücre içi işaretçileri ve çekirdek transkripsiyonel imzayı paylaşır, aynı zamanda önemli transkripsiyonel heterojenliği de gösterir, muhtemelen yerel doku ortamını yansıtırlar. Tek hücreli süspansiyonların trakeal fırça hücrelerinin yalıtımı ayrıntılı olarak bu nadir epitelyal hücrelerin fonksiyonunu tanımlamak için gereklidir, ama onların yalıtım zorlu, potansiyel trakeal fırça hücreleri ve sinir uçları arasındaki yakın etkileşimi nedeniyle veya sıkı ve yapışır kavşak hava yolu özgü bileşimi nedeniyle. Burada, fare trakeal epitelyumdan fırça hücrelerinin yalıtımına yönelik bir prosedür açıklanmaktadır. Yöntem, submukoza gelen trakeal epitel ilk ayrımı dayanmaktadır, papain ile epitelyal levha bir sonraki kısa kuluçarı için izin. Bu prosedür, akış cytometrik sıralama ve uygulanabilir trakeal fırça hücrelerinin fonksiyonel analizi için hızlı ve kullanışlı bir çözüm sunar.

Bu yordam, RNA sıralama3için trakeal fırça hücrelerini yalıtmak için başarıyla uygulandı. 2 adımlı protokol (Şekil 1) ile doku trakea ve sindirim yalıtım sonra, hücreler toplanan ve PI ile ölü hücrelerin dışlama sonra floresan etiketli CD45 ve EpCAM ile lekelenmiş. İleri ve yan dağılım özelliklerine dayanarak ceketleri dışarı gating sonra, biz CD45 için düşük/negatif olarak fırça hücreleri tanımlanan, EpCAM için pozitif ve EGFP i...

Watch this Scientific Journal Video about Isolation and Quantitative Evaluation of Brush Cells from Mouse Tracheas at JoVE.com

Isolation and Quantitative Evaluation of Brush Cells from Mouse Tracheas

Fırça hücreleri naif fare trakea bulunan nadir kolinerjik kemoduyusal epitelyal hücrelerdir. Sınırlı sayılar nedeniyle, havayolu bağışıklık ve remodeling fonksiyonel rolünün ex vivo değerlendirilmesi zordur. Trakeal fırça hücrelerinin Akış sitometrisi ile yalıtımına yönelik bir yöntem tarif ediyoruz.

Fırça hücrelerinin Mouse tracheas 'tan izolasyon ve nicel değerlendirilmesi

Tracheal brush cells are cholinergic chemosensory epithelial cells poised to transmit signals from the airway lumen to the immune and nervous systems. ...

Biz trakeal fırça hücrelerinin izolasyon u için bir prosedür geliştirdi, kolin asetiltransferaz floresan muhabir farelerden nadir özel kemosensory epitel hücreleri. Bu yöntem, trakeal epitelin submukozadan ilk olarak ayrılmasına dayanır ve epitel tabakasının papain ile daha kısa sürede inkübasasına olanak sağlar. Bu, trakeal fırça hücrelerinin sağlam bir şekilde kurtarılmasını sağlar ve Fırça hücrelerinin RNA dizilimi ile izolasyon ve transkripsiyonel analizi için başarıyla kullanılmıştır.Sindirim enzimleri ile uzun kuluçka hücre canlılığını azaltabilir ve dokulardan izole hücrelerin transkripsiyonprofilini değiştirebilir. Burada trakeal epiteli dispase ile ayırıyoruz ve daha sonra kısa bir süre için papain ile kuluçkaya yatıyoruz ve uygun fırça hücrelerinin yüksek verimi elde ediyoruz. Yöntemimiz üst hava yolu epitel çalışmalarına katkıda bulunabilir.Aynı protokol, burun dokusu gibi diğer mukozal bölgelerden fırça hücrelerinin izole edilmesi için de uygulanabilir. Son derece tekrarlanabilir tekniğimizin gösterilmesi, akran bilim adamlarının trakeal fırça hücrelerini izole edip daha fazla araştırmalarına olanak sağlayacaktır. Bu prosedüre başlamak için, dispase sindirim çözeltisini hazırlamak için burada gösterilen son konsantrasyonlarda PBS'ye dispase ve DNase I ekleyin.Dispase tozu tamamen 37 santigrat derece bir su banyosunda çözelti ısınmadan önce çözülmüş olduğundan emin olun. Ardından, durdurma çözümü hazırlamak için DMEM'e %5 ısı yla inaktive EDILMIŞ FBS ekleyin. Tyrode I tampon hazırlamak için, kalsiyum olmadan HEPES Tyrode tampon papain ve L-sistein ekleyin.Tyrode II tampon hazırlamak için, mililitre başına iki mikrolitre konsantrasyonunda kalsiyum olmadan HEPES Tyrode tampon löpeptin ekleyin. FACS tampon hazırlamak için, kalsiyum olmadan Hank Dengeli Tuz Çözeltisi kullanın, magnezyum ve fenol kırmızı iki milimolar EDTA ve% 2 FBS ile takviye. Fare ötenazi sonra, genişletilmiş üst ve alt ekstremiteler ile supine pozisyonda bir cerrahi tahta üzerinde düzeltmek için 21 gauge iğneler kullanın.Bölgeyi dezenfekte etmek için kürkü %70 etanolle püskürtün. Düz forseps kullanarak, karın deri ve kürk kaldırın ve merkezinde bir kesi yapmak için kesme makas kullanın. Makas kullanarak, mandibula karın deri altı dokudan cilt ayırın.Forceps ile deri altı doku tutarken, karın duvarının merkezinde makas ile küçük bir kesi yapmak. Sonra V şeklinde bir kesi ile periton açın. Forceps kullanarak, yavaşça yan ince bağırsak hareket ettirin.Abdominal aort ve vena kava sını bulun ve hızlı eksanguiasyon alabilmek için diseksiyon makası ile bir kesi yapın. Diyaframı bul. 18 gauge iğne kullanarak, akciğerleri söndürmek için göğüs hemen altında diyafram bir açıklık yapmak.Keskin sivri düz diseksiyon makası kullanarak, dikkatle göğüs kafesi diyafram ayırmak için kaburga tabanı boyunca kesilmiş. Sternumun açıktaki ucunu kaldırmak için forsepsleri kullanın ve göğüs kafesinin tabanından boynuna kadar göğüs kafesini uzunlamasına kesin. Merkezi bir servikal kesi yapmak ve submandibular bezin iki lobları ayırmak için kısa düz makas kullanın.Bundan sonra, dikkatle çevreleyen bağ dokusu ve karina örten timus kaldırmak için ince nokta yüksek hassasiyetli forceps bir çift kullanın. Önce proksimal ucunu epiglottis seviyesinde ayırarak ve daha sonra trakeanın çatallanma düzeyinde distal ucunu keserek trakeayı serbest çesitsiz olarak ayırın. Epiglottis'i bulun ve epiglottan karinaya kadar trakeayı uzunlamasına kesin.Başlamak için, 37 santigrat derece önceden ısıtılmış dispase sindirim çözeltisi 750 mikrolitre içeren 1.5 mililitrelik bir tüp içine trakea yerleştirin. 200 RPM'de ve 40 dakika oda sıcaklığında bir çalkalayıcıda doğrudan ışığa ve kuluçkaya maruz kalmamayı azaltmak için tüpü alüminyum folyo ile kapatın. Daha sonra reaksiyonu durdurmak ve tüpü buza yerleştirmek için %5 FBS ile 750 mikrolitre DMEM ekleyin.Nefes borusunu Petri kabına aktar. Nefes borusunu epitel tarafı yukarı bakacak şekilde yönlendirin. Uzunlamasına olarak incelenmiş trakea, kıkırdak halkalar tarafından korunan yarı silindirik bir şekle sahiptir.Epitel içbükey yüzeyde. Düz forceps kullanarak, Petri kabına trakea epiglottis alanı tether ve trakea epitel kazımak için bir boyut 22 bertaraf neşter kullanın. Epitel tabakası yarı saydam bir tabaka olarak ayrılır.Epitel kıyma ve iki mililitrelik tüp epitel tabakası aktarmak için neşter kullanın. Petri kabını 750 mikrolitre Tyrode I tamponuyla durulayın ve bunu epitel tabakasını içeren tüpe aktarın. 30 dakika boyunca 200 RPM bir shaker üzerinde 37 santigrat derece doğrudan ışığa ve kuluçka yada maruz kalma azaltmak için alüminyum folyo ile tüp kapağı.Sonra soğuk Tyrode II tampon 750 mikrolitre ekleyin. Girdap 20-30 saniye boyunca şiddetle sindirilmiş doku. 18 kalibrelik bir iğneye bağlı bir şırınga kullanarak homojeni 10 kez triturate edin.Bundan sonra, 21 gauge iğne ye geçin ve 10 ila 20 kez daha triturate. Hücreleri 100 mikrometrelik bir süzgeçten 50 mililitrelik konik bir tüpe süzün. 30'a bir hacimsel oranda soğuk FACS tampon ekleyin.Santrifüj 350 kez g ve 10 dakika boyunca dört santigrat derecede. Supernatant atın ve soğuk FACS tampon pelet resuspend. Bu süspansiyonu 12'ye 75 milimetrelik polistiren tüpe aktarın.Santrifüj tekrar 350 kez g ve 10 dakika boyunca dört derece santigrat. Supernatant atın ve FACS tampon 100 mikrolitre pelet resuspend. Daha sonra, spesifik olmayan bağlanmayı engellemek ve 15 dakika boyunca buz üzerinde kuluçkaya yatmak için bir mikrolitre anti-fare CD1632 bloke edici antikor ekleyin.Daha sonra metin protokolünde belirtildiği gibi ilgili isotip kontrollerine antikor ekleyin. Doğrudan ışıktan korunurken 45 dakika boyunca buz üzerinde kuluçkaya yatın. Bundan sonra, soğuk FACS tampon 4,5 mililitre ekleyin ve karıştırın.Santrifüj 350 kez g ve dört santigrat derecede. Supernatant atın ve soğuk FACS tampon 300 mikrolitre pelet resuspend. Akış sitometrik sıralama hemen önce propidium iyodür ekleyin.Bu çalışmada, ChAT eGFP eGFP asetilkolin floresan muhabiri farelerin trakeal fırça hücreleri başarıyla RNA dizileme için izole edilmiştir. Hücreler enkazdan ileri ve yan dağılım açısıile tanımlanır. Doublets ileri dağılım yüksekliği ve genişliği ve yan dağılım yüksekliği ve genişliği kullanılarak dışlanır.Doublets yüksek genişlik değerlerine sahip hücrelerdir. Tek hücreler içinde, canlı hücreler propidium iyodür negatif popülasyon olarak tanımlanır. Canlı tek hücrelerde, CD45 düşük negatif hücreler iyotip kontrolüne göre tanımlanır.CD45 düşük negatif hücreler içinde, FITC kanalında da eGFP pozitif olan EpCAM pozitif hücreler fırça hücrelerinin popülasyonudur. Fırça hücre numaraları mikrobiyal metabolitlere ve protozoamaruz bırakılarak değiştirilir ve bu nedenle kurumsal mikrobiyotanın değişkenliğini yansıtır. Bu nedenle, akış sitometrik sıralama ile izole fırça hücrelerinin beklenen sayısını ölçmek için floresan mikroskobu ile fırça hücrelerinin sayısını tahmin öneririz.İzole edilmiş fırça hücrelerinin verimini belirlerken trakeanın epitel tabakasını düzgün bir şekilde ayırdığından emin olun. İzole trakeal fırça hücreleri RNA sıralama, hücre kültürü ve fonksiyonel analiz gibi tahliller geniş bir dizi kullanılabilir.

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Isolation of Mouse Peritoneal Cavity Cells

Fare Periton Boşluk Hücreleri İzolasyon

The peritoneal cavity is a membrane-bound and fluid-filled abdominal cavity of mammals, which contains the liver, spleen, most of the gastro-intestinal ...

Isolation of Mouse Lung Dendritic Cells

Fare Akciğer Dendritik Hücrelerinin İzolasyonu

Lung dendritic cells (DC) play a fundamental role in sensing invading pathogens 1,2 as well as in the control of tolerogenic responses 3 in the ...

Isolation and Characterization of Dendritic Cells and Macrophages from the Mouse Intestine

Fare Barsak ayrı dendritik hücreler ve makrofajlar İzolasyonu ve Karakterizasyonu

Within the intestine reside unique populations of innate and adaptive immune cells that are involved in promoting tolerance towards commensal flora and ...

A Quantitative Evaluation of Cell Migration by the Phagokinetic Track Motility Assay

Phagokinetic Parça Motilite Testi sayesinde Hücre Göç Kantitatif Değerlendirilmesi

Cellular motility is an important biological process for both unicellular and multicellular organisms. It is essential for movement of unicellular ...

Isolation of Lymphocytes from Mouse Genital Tract Mucosa

Fare Genital Sistemlerinin Mukozanin gelen Lenfosit İzolasyonu

Mucosal surfaces, including in the gastrointestinal, urogenital, and respiratory tracts, provide portals of entry for pathogens, such as viruses and ...

Isolation of Myeloid Dendritic Cells and Epithelial Cells from Human Thymus

İnsan Thymus ile myeloid dendritik hücreleri ve epitel hücreleri İzolasyonu

In this protocol we provide a method to isolate dendritic cells (DC) and epithelial cells (TEC) from the human thymus. DC and TEC are the major antigen ...

Isolation of Double Negative &#945;&#946; T Cells from the Kidney

Isolation of Double Negative ÃƒÅ½Ã‚Â±ÃƒÅ½Ã‚Â² T Cells from the Kidney

Böbrek gelen Çift Negatif αβ T Hücreleri İzolasyon

There is currently no standard protocol for the isolation of DN T cells from the non-lymphoid tissues despite their increasingly reported involvement in ...

Derivation of T Cells In Vitro from Mouse Embryonic Stem Cells

Derivation of T Cells In Vitro from Mouse Embryonic Stem Cells

T hücrelerinin türetilmesi<em&gt; İn Vitro</em&gt; Fare Embriyonik Kök Hücreleri

The OP9/OP9-DL1 co-culture system has become a well-established method for deriving differentiated blood cell types from embryonic and hematopoietic ...

High-throughput Quantitative Real-time RT-PCR Assay for Determining Expression Profiles of Types I and III Interferon Subtypes

Yüksek verim Kantitatif Gerçek zamanlı RT-PCR Testi Türleri I ve III İnterferon Alttipleriyle İfadesi Profilleri belirlenmesi için

Described in this report is a qRT-PCR assay for the analysis of seventeen human IFN subtypes in a 384-well plate format that incorporates highly specific ...

Isolation of Sertoli Cells and Peritubular Cells from Rat Testes

Sıçan Testislerindeki Sertoli Hücreleri İzolasyon ve peritübüler Hücreler

The testis, and in particular the male gamete, challenges the immune system in a unique way because differentiated sperm first appear at the time of ...