Name: fully human tumor-based matrix in three-dimensional spheroid invasion assay
Uploaded: 2019-05-07T14:45:00
Duration: 8 min 15 s
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著者は、この研究の資金に感謝します: シグリッド Jusélius 財団、フィンランド癌協会、ヘルシンキ大学中央病院の研究資金。著者らは、技術支援のためにヘルシンキ大学で Biomedicum イメージングユニットを承認しています。

1. 多細胞腫瘍スフェロイドの生成
注:このプロトコルは、ここでは UT-SCC-42A および-42B 細胞株と共に実証されているが、他の細胞株を用いて適用することもできる。
<ol><li>42B 細胞をリン酸緩衝生理食塩水 6 mL で洗浄し、0.05% トリプシン-EDTA (75 cm2 フラスコに 3 mL) を加え、フラスコを細胞培養インキュベーター (37 ° c、5% co2、95% の湿度) に2-5 分間置きます。</li>
	<li>細胞が顕微鏡下で取り外されていることを確認してください。その後、完全なダルベッコ改変イーグルミディアム (DMEM) 培地 (dmem + 10% ウシ胎児血清、100 U/mL ペニシリン、100μ g/mL ストレプトマイシン、250 ng/mL のアムホテリシン B、0.4 μ g/mL ヒドロコルチゾン、および50μ g/mL のアスコルビン酸) 酵素を中和する (6 mL の 75 cm2フラスコ) 細胞懸濁液を 15 mL の円錐状のチューブに移した。 注: 研究対象の細胞に適した細胞培養培地を選択してください。</li>
	<li>細胞懸濁液を 200 x gで5分間遠心します。</li>
	<li>上清を除去し、2-5 mL の完全な DMEM 中の細胞ペレットを懸濁させる。</li>
	<li>細胞を数えて、完全な DMEM で細胞懸濁液を2万細胞/ml の最終濃度に希釈します。 注:細胞株ごとに最適なセル数を決定する必要があります。</li>
	<li>1ウェルあたり1000細胞の最終的な濃度のために十分に、各超低接続96のウェル丸底プレートウェルに細胞懸濁液の50μ l を分配します。</li>
	<li>プレートを細胞培養インキュベーター (37 ° c、5% CO2、95% の湿度) に移します。4日後、倒立顕微鏡で腫瘍スフェロイド形成を目視で確認し、アッセイを進める。ウェルごとに1つのスフェロイドのみが存在することを確認します。 注:回転楕円体を形成するのにかかる時間は、異なる細胞株の間で変化する。</li>
</ol>2. 三次元スフェロイドの浸潤アッセイ
注:ウェルに添加するとゲルが1:1 希釈されるため、2倍の溶液を調製します。
<ol><li>37° c に維持された水浴中の氷およびフィブリノーゲン原液溶液に HMDM を融解する。それは完全に可溶化され、氷の上に溶液を入れていないまで、フィブリノーゲンを乱さないでください。降水が発生します。</li>
	<li>各試薬の適切な容量を混ぜ合わせます: 1mg/mL HMDM (最終濃度: 0.5 mg/mL)、0.6 U/ml トロンビン (最終濃度: 0.3 U/mL)、66.6 mg/mL アプロチニン (最終濃度: 33.3 ug/mL)、および 1 mg/mL のフィブリノーゲン (最終濃度: 0.5 mg/mL). 注:ウェルに混合物を分配し、迅速に動作する直前にフィブリノーゲンを追加します。それは数分でゲルを形成します。.一度にいくつかの井戸を扱います。</li>
	<li>各ウェルに50μ l のゲルを加えます。先端を井戸の内壁に向けて、ゆっくりと pipet ます。空気の泡 (逆ピペット操作を使用) を避け、回転楕円体を井戸の中心から動かさないようにしてください。</li>
	<li>プレートを細胞培養インキュベーターに戻し、HMDM/フィブリンマトリックスを30分間固化させ、ゲルの上部に各ウェルに100μ l の完全な DMEM をそっと加えます。</li>
</ol>3. イメージング
<ol><li>倒立光顕微鏡を用いてスフェロイドを毎日画像する。または、自動イメージングシステムを使用します。</li>
</ol>4. Ilastik による画像セグメンテーション
<ol><li>Ilastik を開き、[ピクセル分類] ワークフローを選択します (図 1A)。ユーザーが作成した注釈に基づいてピクセルを分類します。Ilastik プロジェクト (ilp) をコンピュータに保存します。</li>
	<li>解析用の画像を追加します。[入力データ] をクリックして新規追加し、画像を選択します (図 1B)。</li>
	<li>
フィーチャ選択の場合は、[フィーチャの選択] をクリックし、フィーチャを選択します (図 1C、赤の四角形)。 注:選択したフィーチャは、オブジェクトをバックグラウンドから分離するビジュアルプロパティにほぼ対応し、分類器のトレーニングに使用されます。<ol>
<li>ボックスをクリックしてフィーチャを選択します。選択したボックスが緑色に変わります (図 1C、青の四角形)。 注:ここでは、ユーザーは、いくつかの異なる機能の種類やスケールから選択することができます。色または輝度に基づいてオブジェクトを分離するには、色/輝度を選択する必要があります。明るさまたは色のグラデーションに基づいてオブジェクトを分離するには、[エッジ] を選択します。テクスチャは、イメージ内のオブジェクトに特殊なテクスチャの外観がある場合に重要な機能です。このアッセイでは、色/強度 (σ 0) とエッジ (σ 6) が使用されます。</li>
	</ol>
</li>
	<li>
トレーニングの場合は、[トレーニング] をクリックし、[トレーニング] セクションにラベル1とラベル 2 (図 1D、赤の四角形) という2つのラベルがあります。ラベルが1つしかない場合は、[ラベルを追加] を押して新しいラベルを追加します (図 1D、青の四角形)。
	<ol>
<li>ラベルの1つ (図 1d、黄) と、もう一方のラベルを持つセル (図 1d、青) を使用して、背景にマークを付けます。</li>
		<li>イメージの最初の 10% のためのソフトウェアを訓練してください。現在のビューから次の画像を選択します。</li>
		<li>セルと背景が (最初の画像の) マークされたら、ライブアップデート(図 1D、紫色の長方形) を押します。 注: 次の画像では、ilastik は前の画像に従って自動的に解析を実行します。</li>
	</ol>
</li>
	<li>トレーニングが完了し、ilastik がすべての画像を解析したら、[予測エクスポート] をクリックします。ソースから単純なセグメンテーションを選択します。確率やその他のものを選択しないでください (図 1E)。</li>
	<li>予測エクスポートセクション (図 1E) で、[イメージ設定のエクスポート] を選択してから目的の出力ファイル形式を選択します。[すべてエクスポート] をクリックしてラベル付けの結果をエクスポートします (図 1F)。ファイルは、元の画像と同じフォルダにエクスポートされます。 注: この実験では、. h5 形式が使用されます。</li>
</ol>5. フィジー ImageJ による地域分析
<ol><li>
スケール設定
	<ol>
<li>フィジー ImageJ の縮尺記号を使用して元の画像を開きます (図 2a)。イメージのサイズと寸法が分析されたイメージと同じであることを確認します。ライン選択ツールを使用して、既知の長さのラインを描画します (図 2B)。 注:このプロトコルは、フィジー ImageJ 1.51 (64 ビット) と ilastik rc を使用して実行されます。</li>
		<li>[解析と尺度の設定] をクリックします (図 2C)。[既知の距離] フィールドに既知の距離を設定し、適切な単位を設定し、[グローバル] をクリックします (図 2D)。</li>
	</ol>
</li>
	<li>
マクロのインストール
	<ol>
<li>プラグインilastikがインストールされていない場合は、次の手順に従います。ヘルプをクリックして更新...開いているウィンドウImageJ アップデータで、[更新サイトの管理] をクリックします。開いているウィンドウで更新サイトを管理し、ilastik の [次へ] をクリックし、[閉じる] をクリックします。次に、[ウィンドウImageJ アップデータの変更を適用] をクリックします。このプロセスには時間がかかることがあります。次のウィンドウは、テキストが正常に更新された情報になります。[ OK ] をクリックし、ImageJ を再起動します。</li>
		<li>プラグイン、マクロ、およびインストールをクリックします (図 3A)。次に、ijm ファイル (補足情報を参照) を選択し、「開く」をクリックします。 注:マクロは、特に面積を測定するために書かれました。ソフトウェアを開くたびに、マクロをインストールする必要があります。</li>
	</ol>
</li>
	<li>
エリア分析
	<ol>
<li>すべてのプラグインがインストールされているときに画像を分析します。プラグインをクリックし、 ilastikまでスクロールします (図 3C)。[インポート HDF5を選択し、ファイルを [h5] 形式で選択し、[開く] をクリックして LUT (図 3C、D) をロードして適用します。</li>
		<li>キーボード (マクロ) からaボタンを押すと、領域が集計ウィンドウに合計面積として表示されます (図 3E)。</li>
	</ol>
</li>
</ol>

<ol>
	<li>Jung, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+Spheroids+with+Enhanced+Aggressiveness+to+Mimic+Human+Liver+Cancer+In+vitro+and+In+Vivo.">Cell Spheroids with Enhanced Aggressiveness to Mimic Human Liver Cancer In vitro and In Vivo.</a> Scientific Reports. 7, 10499-10514 (2017).</li><li>Vinci, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Advances+in+establishment+and+analysis+of+three-dimensional+tumor+spheroid-based+functional+assays+for+target+validation+and+drug+evaluation.">Advances in establishment and analysis of three-dimensional tumor spheroid-based functional assays for target validation and drug evaluation.</a> BMC Biology. 10, 29 (2012).</li><li>Nath, S., Devi, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Three-dimensional+culture+systems+in+cancer+research:+Focus+on+tumor+spheroid+model.">Three-dimensional culture systems in cancer research: Focus on tumor spheroid model.</a> Pharmacology and Therapeutics. , 94-108 (2016).</li><li>Albanese, A., Lam, A. K., Sykes, E. A., Rocheleau, J. V., Chan, W. C. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tumour-on-a-chip+provides+an+optical+window+into+nanoparticle+tissue+transport.">Tumour-on-a-chip provides an optical window into nanoparticle tissue transport.</a> Nature Communications. 4, 2718 (2013).</li><li>Friedrich, J., Seidel, C., Ebner, R., Kunz-Schughart, L. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spheroid-based+drug+screen:+considerations+and+practical+approach.">Spheroid-based drug screen: considerations and practical approach.</a> Nature Protocols. 4, 309-324 (2009).</li><li>Berens, E. B., Holy, J. M., Riegel, A. T., Wellstein, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Cancer+Cell+Spheroid+Assay+to+Assess+Invasion+in+a+3D+Setting.">A Cancer Cell Spheroid Assay to Assess Invasion in a 3D Setting.</a> Journal of Visualized Experiments. (105), e53409 (2015).</li><li>Vinci, M., Box, C., Eccles, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Three-Dimensional+(3D)+Tumor+Spheroid+Invasion+Assay.">Three-Dimensional (3D) Tumor Spheroid Invasion Assay.</a> Journal of Visualized Experiments. (99), e52686 (2015).</li><li>Salo, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+novel+human+leiomyoma+tissue+derived+matrix+for+cell+culture+studies.">A novel human leiomyoma tissue derived matrix for cell culture studies.</a> BMC Cancer. 15, 981 (2015).</li><li>Nurmenniemi, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+novel+organotypic+model+mimics+the+tumor+microenvironment.">A novel organotypic model mimics the tumor microenvironment.</a> The American Journal of Pathology. 175, 1281-1291 (2009).</li><li>Salo, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Organotypic+three-dimensional+assays+based+on+human+leiomyoma-derived+matrices.">Organotypic three-dimensional assays based on human leiomyoma-derived matrices.</a> Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences. 373 (1737), 20160482 (2018).</li><li>Overall, C. M., Blobel, C. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+search+of+partners:+linking+extracellular+proteases+to+substrates.">In search of partners: linking extracellular proteases to substrates.</a> Nature Reviews Molecular Cell Biology. 8, 245-257 (2007).</li><li>Ahmed, T. A. E., Dare, E. V., Hincke, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fibrin:+a+versatile+scaffold+for+tissue+engineering+applications.">Fibrin: a versatile scaffold for tissue engineering applications.</a> Tissue Engineering Part B: Reviews. 14 (2), 199-215 (2008).</li><li>Hoornstra, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fermented+Lingonberry+Juice+Inhibits+Oral+Tongue+Squamous+Cell+Carcinoma+Invasion+In+vitro+Similarly+to+Curcumin.">Fermented Lingonberry Juice Inhibits Oral Tongue Squamous Cell Carcinoma Invasion In vitro Similarly to Curcumin.</a> In Vivo. 32, 1089-1095 (2018).</li></ol>

作者は何も開示することはありません。

提示された方法は、d 型ヒト腫瘍ベースのアッセイを提供して、母体のヒト腫瘍微小環境内の癌細胞の侵襲性を評価する。がん細胞の侵襲は、標準的な顕微鏡を用いた毎日のイメージングと、画像解析ソフトウェアによって容易に測定することができます。この方法は単なる増殖ではなく細胞浸潤を示す。
MSDM とは異なり、HMDM/フィブリンマトリックスは、任意の温度制御を必要としません。この方法は、特に1つのプレートから別にスフェロイドを転送する必要なく、実行するのは簡単です。それは唯一の技術的に敏感なステップ、マトリックスへのフィブリノーゲンの添加を持っています。フィブリノーゲンは数分後にゲル化し始めるので、フィブリノーゲンを加えると、一度にわずかな井戸をピペットで処理し、治療する必要があります。また、ピペット操作が高圧で行われる場合、スフェロイドを妨害して U 字型の中央位置から移動させるリスクもあります。回転楕円体の脱臼は、画像化および最終的に分析を複雑にすることができる。
アッセイは、HMDM またはフィブリノーゲンの濃度を変えることによって修飾することができます。細胞はまた、その後の分子研究のために固定および染色することができる。この方法は完全に自動化された形に変更することができますが、通常の顕微鏡と2つのオープンソースソフトウェアで行うこともでき、高価な装置は必要ありません。
従来の MSDM ベースの3D アッセイと比較して、このアッセイは細胞の浸潤特性をより良く表示することができます。MSDM のようなラミニンが豊富なマトリクスを含む基底膜で成長したスフェロイドは、実際の侵襲よりも癌細胞の増殖が多くなり、それが侵入能力が低いためにいくつかの癌細胞株における浸潤アッセイには適さない可能性がある。もう1つの頻繁に使用されるマトリックスである I 型コラーゲンは、3D 培養中にエッジから収縮する傾向があり、これは、回転楕円体の局在化およびウェルの画像化に影響を及ぼす。さらに、より多くの (HSC-3) およびより少ない (SCC-25) 攻撃的な舌の癌の細胞株の内因性の侵襲的特性の違いはモデル (子宮筋腫ディスクおよびその可溶性形態マトリックス)10、13。
HMDM はヒト平滑筋腫腫瘍の余った物質から抽出されるので、アッセイは MSDM を使用するよりも倫理的です。現在、HMDM は、多くの癌関連臨床アッセイ8、10に適していると思われる唯一の利用可能なヒト腫瘍由来 ECM 産物である。将来的には、動物の組織由来マトリックスをヒト腫瘍ベースのマトリックスに置き換えることができ、マトリックス生産のために動物を犠牲にする必要性を減らすことができる。
2D 細胞培養アッセイを3D 法で置き換えることで、がん細胞の挙動に関するより正確な情報が得られます。現在、いくつかの3D モデルと商業的なマトリックスがありますが、残念ながら、どれもすべてのがん細胞株に適していません。研究者は、特定のアッセイに最適なマトリックスを選択する必要があります。アッセイとマトリックスの最適なマッチングは困難な場合がありますが、結果の信頼性が大幅に向上する可能性があります。

従来の二次元 (2D) 細胞培養研究は、がん研究に大きく貢献してきました。現在、研究者は、インビボ条件1をよりよく模倣するために三次元 (3d) 細胞培養アッセイに向けてより多くシフトしている。3d 癌細胞培養は、細胞細胞および細胞マトリックス相互作用の点で複雑な腫瘍微小環境をより正確に反映し、遺伝子発現プロファイル、薬剤感受性、およびシグナル伝達経路活性2,3である。
いくつかの3d 細胞培養モデルは、腫瘍組織 explant、チップ上の腫瘍、多細胞腫瘍スフェロイドの3,4などの癌研究に使用されている。多細胞腫瘍スフェロイドは現在広く使用されており、ヒト腫瘍1,5におけるインビボ条件のいくつかの特徴を模倣している。スフェロイド径が500μ m を超えると、低酸素領域や壊死中心も有しており、このようにインビボ腫瘍状況2を表す。
多くの合成物 (例えば、ポリジメチルシロキサン) および動物由来の (例えば、ラットテールタイプ I コラーゲンおよびマウス肉腫由来マトリックス、マトリゲル、MSDM と称される) マトリクスが、3d 細胞培養アッセイ3、6のために開発された、 7、8。これまでのところ、市販のマトリクスはいずれもヒト腫瘍組織から生じたものではない。したがって、それらは、ヒト腫瘍微小環境の特徴を欠く、癌細胞浸潤プロセス8に著しい影響を及ぼす。
Myogel (ヒト子宮筋腫由来マトリックスは、HMDM と称される) をヒト子宮平滑筋腫腫瘍組織9から抽出する。HMDM のタンパク質含量は MSDM と大きく異なることが示されている。実際、HMDM タンパク質の 66% は、MSDM タンパク質とは異なります。一方、ラミニン、IV 型コラーゲン、ヘパラン硫酸プロテオグリカン、nidogen、および表皮成長因子などの一部のタンパク質は、両方のマトリクス10に存在している。さらに、マウスは酵素含量においてヒトとは異なり、ヒトはマウス11よりも78少ないプロテアーゼを有する。
フィブリンは、足場材料12として単独または他の材料と組み合わせて広く使用されてきた。3D 細胞培養アッセイにおいて、商業的に入手可能なヒトのフィブリノーゲンおよびトロンビンは、フィブリンヒドロゲル12を形成するように結合される。
このプロトコルは、以前に導入された3D 腫瘍スフェロイドの浸潤アッセイ7の改善を説明する。この新しいプロトコルは、マウス由来腫瘍マトリックスの代わりにヒト腫瘍由来マトリックスを適用する。また、ilastik およびフィジー ImageJ ソフトウェアを使用したイメージングおよび解析技術も含まれます。このプロトコルは、いくつかの異なる固形癌細胞株のスフェロイドアッセイに使用することができる。それは新しい抗癌療法を開発し、癌細胞の侵略に特定の分子の効果を研究するために生物学的に関連した用具を提供する。

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:791px;" width="790">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="35">
			<td height="35" style="height:35px;width:256px;">Amphotericin B solution</td>
			<td style="width:93px;">Merck</td>
			<td style="width:119px;">A2942</td>
			<td style="width:323px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:256px;">Aprotinin from bovine lung</td>
			<td style="width:93px;">Merck</td>
			<td style="width:119px;">A6279</td>
			<td>Measure the protein concentration before use.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ascorbic acid</td>
			<td style="width:93px;">Applichem</td>
			<td style="width:119px;">A1052</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:256px;">BioLite Cell Culture Treated Flasks</td>
			<td style="width:93px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:119px;">130190</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:256px;">DMEM/F-12</td>
			<td style="width:93px;">Gibco by Life Technologies</td>
			<td style="width:119px;">31330-038</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:256px;">DS-Fi2 Digital Camera</td>
			<td style="width:93px;">Nikon Instruments</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:256px;">DS-U3 Digital Camera Controller</td>
			<td style="width:93px;">Nikon Instruments</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:256px;">Eclipse TS100 Inverted Microscope</td>
			<td style="width:93px;">Nikon Instruments</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:256px;">Fetal bovine serum (FBS)</td>
			<td style="width:93px;">Gibco by Life Technologies</td>
			<td style="width:119px;">10270106</td>
			<td>Heat inactivate for 30 min at 56&#176;C in waterbath before use.</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:256px;">Fibrinogen, Plasminogen-Depleted, Human Plasma</td>
			<td style="width:93px;">Merck</td>
			<td style="width:119px;">341578</td>
			<td>Solubility: 25 mg/ml in H&#8322;O. Warm the H&#8322;O and the fibrinogen to 37&#176;C prior to dissolution. Do not disturb until the fibrinogen is completely solubilized. Stock solutions stored at -70&#176;C should be thawed in a water bath maintained at 37&#176;C.</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:256px;">Fiji ImageJ 1.51 image processing program</td>
			<td style="width:93px;">Freeware, NIH</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Hydrocortisone</td>
			<td style="width:93px;">Merck</td>
			<td style="width:119px;">H0888</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:256px;">Ilastik software for image classification and segmentation</td>
			<td style="width:93px;">Freeware</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:256px;">IncuCyte Zoom Live-Cell Analysis System</td>
			<td style="width:93px;">Essen BioScience</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:256px;">Myogel</td>
			<td style="width:93px;">Lab made</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;">Penicillin-Streptomycin</td>
			<td style="width:93px;">Gibco by Life Technologies</td>
			<td style="width:119px;">15140-122</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:256px;">Phosphate buffered saline (PBS)</td>
			<td style="width:93px;">Lab made</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:256px;">Scepter 2.0 Cell Counter</td>
			<td style="width:93px;">Merck</td>
			<td style="width:119px;">PHCC20040</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:256px;">Scepter Cell Counter Sensors, 60 &#181;m</td>
			<td style="width:93px;">Merck</td>
			<td style="width:119px;">PHCC60050</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:256px;">Thrombin from human plasma</td>
			<td style="width:93px;">Merck</td>
			<td style="width:119px;">T6884-100UN</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:256px;">Trypsin-EDTA (0.5%) 10X, no phenol red</td>
			<td style="width:93px;">Gibco by Life Technologies</td>
			<td style="width:119px;">15400054</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:256px;">Ultra-Low Attachment 96-Well Plate</td>
			<td style="width:93px;">Corning</td>
			<td style="width:119px;">7007</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:256px;">UT-SCC-42A and UT-SCC-42-B cell lines</td>
			<td style="width:93px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>The cell lines were established at the Department of Otorhinolaryngology-Head and Neck Surgery, Turku University Hospital (Turku, Finland).</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

fully human tumor-based matrix in three-dimensional spheroid invasion assay

二次元細胞培養ベースのアッセイは、体外癌研究において一般的に使用されています。しかし、それらは、腫瘍微小環境を形成するいくつかの基本的な要素を欠いている。より信頼性の高いインビトロ結果を得るために、いくつかの三次元 (3D) 細胞培養アッセイが導入されている。これらのアッセイは、癌細胞が細胞外マトリックスと相互作用することを可能にする。この相互作用は、細胞の形態と同様に、増殖および浸潤などの細胞の挙動に影響を与えます。さらに、この相互作用は、いくつかのプロおよび抗腫瘍化分子の発現を誘発または抑制する可能性がある。スフェロイド浸潤アッセイは、癌細胞浸潤を研究するための適切な 3D in vitro 法を提供するために開発された。現在、動物由来マトリックスは、マウス肉腫由来マトリックス (MSDM) およびラットテールタイプ I 型コラーゲンなど、主にスフェロイドの侵襲アッセイにおいて使用されている。ヒト腫瘍微小環境と動物由来マトリックスとの違いを考慮して、良性子宮平滑筋腫組織からヒト子宮筋腫由来マトリックス (HMDM) が開発された。HMDM が MSDM よりも癌細胞の遊走と浸潤を誘導することが示されている。このプロトコルは、HMDM/フィブリンマトリクスを使用して簡単で、再現性があり、かつ信頼性の高い3D ヒト腫瘍ベースのスフェロイドの侵襲アッセイを提供した。また、イメージングと分析に関する詳細な説明も含まれています。スフェロイドは HMDM/フィブリンマトリックス内の U 字形超低アタッチメントプレートに生育し、それを介して侵入する。侵略は ilastik およびフィジーの ImageJ ソフトウェアを使用して毎日イメージし、測定し、そして分析される。アッセイプラットフォームは、ヒト喉頭原発および転移性扁平上皮癌細胞株を用いて示された。しかし、このプロトコルは他の固形癌細胞株にも適している。

UT-42B (転移性喉頭 SCC 細胞株) を播種した4日後に、マトリックス (HMDM/フィブリン、MSDM、またはコラーゲン) を形成されたスフェロイドに添加し (0 日目)、侵襲を3日間モニタリングした。ここでの画像は、倒立顕微鏡を用いて毎日入手した (図 4)。
いったん埋め込まれると、HMDM/フィブリンマトリックス中の細胞は、1日後に急速に浸潤し始め、マトリックス中に伸長した (図 4A)。MSDM の細胞は周囲のマトリックスに侵入せず、代わりに非対称構造を形成した (図 4B)。一方、コラーゲン中の細胞は僅かに浸潤したが、マトリックス収縮により分析は困難であった (図 4C)。いくつかのコラーゲンウェルでは、スフェロイドは3日後にも消失した (図 4C)。
図 5は、初代喉頭 SCC 細胞株 UT − Scc −42a および対応する転移性細胞株 UT − Scc −42B の HMDM/フィブリンにおける細胞浸潤の定量化を図示する。HMDM/フィブリンスフェロイドの生細胞解析システムを用いて撮影されたビデオ (ムービー 1) は、マトリックス内の SCC 細胞の動きを示し、その後に他の細胞が鎖を形成する。
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/59567/59567fig1v2.jpg"> 図 1: 画像のセグメンテーション。Ilastik を使用した画像セグメンテーションの選択されたステップ。<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/59567/59567fig1v2large.jpg" target="_blank">この図の大規模なバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/59567/59567fig2.jpg"> 図 2: スケール設定。フィジー ImageJ を使用して、スケール設定の選択されたステップ。<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/59567/59567fig2large.jpg" target="_blank">この図の大規模なバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/59567/59567fig3.jpg"> 図 3: ImageJ を用いた侵入解析。フィジー ImageJ を使用して画像解析の選択されたステップ.<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/59567/59567fig3large.jpg" target="_blank">この図の大規模なバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/59567/59567fig4.jpg"> 図 4: UT-SCC-42B の細胞浸潤を3つの異なるマトリクスで行う。3D スフェロイドにおける SCC 細胞浸潤の代表的な画像。3日間の侵攻後、倒立顕微鏡を用いて画像を毎日撮影した。(A) HMDM/フィブリン、(B) MSDM、(C) コラーゲン。最後の列は3日目の侵攻の明確化を表しています。スケールバー = 200 μ m<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/59567/59567fig4large.jpg" target="_blank">この図の大規模なバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。</a>
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/59567/59567fig5.jpg"> 図 5: HMDM/フィブリンにおける SCC 細胞浸潤の定量化初代喉頭 UT − SCC −42A および対応する転移性喉頭 UT − 42B SCC 細胞株の浸潤を、ilastik およびフィジー ImageJ ソフトウェアを用いて分析した。結果は、3回の独立した実験の平均±標準偏差を、三連でそれぞれ示す。<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/59567/59567fig5large.jpg" target="_blank">この図の大規模なバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。</a>
<img alt="Video 1" src="/files/ftp_upload/59567/59567video1.jpg"> ビデオ 1:3 日間の HMDM/フィブリン内の SCC 細胞運動。<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/59567/Video_1.wmv" target="_blank">この動画を見るにはここをクリックしてください。(右クリックしてダウンロードします。</a>

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Fully Human Tumor-based Matrix in Three-dimensional Spheroid Invasion Assay

腫瘍の微小環境は、がんの成長と侵攻の不可欠な部分です。癌腫の進行を模倣するためには、生物学的に関連したヒトマトリックスが必要である。このプロトコルは、ヒト平滑筋腫ベースのマトリックスを適用することによって in vitro 三次元スフェロイドの侵襲アッセイの改善を導入する。このプロトコルは、コンピュータベースの細胞浸潤解析も導入している。

三次元スフェロイド浸潤アッセイにおける完全ヒト腫瘍ベースマトリクス

Two-dimensional cell culture-based assays are commonly used in in vitro cancer research. However, they lack several basic elements that form the tumor ...

すでにご存知のように、腫瘍微小環境はがんの増殖と浸潤に不可欠な部分です。癌腫の進行を模倣するには、生物学的に関連するヒト腫瘍マトリックスが必要です。これは、インビトロ浸潤アッセイに基づく唯一のヒト腫瘍マトリックスである。古典的なスフェロイドアッセイと比較して、この方法は温度感受性ではなく、スフェロイド伝達を必要としない。この技術は、頭頸部癌などの患者由来の固形癌サンプルに適しており、化学放射線療法を含む個別化医療に向けて拡張することができる。このヒト腫瘍ベースのマトリックスは、ハイスループット薬物検査、生細胞分析、創傷治癒、転写アッセイなど、いくつかの用途に既に使用されています。最も技術的に敏感なステップは、フィブリノーゲンのメソッドの取り扱いが追加されるので、最初に空の井戸でこのステップを練習することができます。行列の適切な処理を示すことは重要であり、メソッドを視覚的に表示することで分析が容易です。多細胞腫瘍スフェロイド生成の場合、完全培地の50マイクロリットルの細胞株から目的の細胞株から3番目の細胞に1回10回分配し、96ウェル超低付着ラウンドボトムプレートの各ウェルに入れます。その後、プレートを摂氏37度と5%の二酸化炭素細胞培養インキュベーターに4日間置き、反転顕微鏡で腫瘍回転楕円体形成を視覚的に確認します。3次元スフェロイド浸潤アッセイを設定するには、氷の上にヒトマイマ由来マトリックスを解凍し、37°Cの水浴でフィブリノーゲンストック溶液を解凍します。試薬が温まったら、完全な培地、ヒトマイマ由来マトリックス、トロンビン、アプロチニン、フィブリノーゲンの適切な量を混合し、マトリックス混合物を細胞に分配する直前にフィブリノーゲンを添加します。得られたゲルの50マイクロリットルを直ちにスフェロイド培養板の各ウェルに加え、先端を各ウェルの内壁に向け、細心部から回転楕円体を動かさずにピペットを減速させる。フィブリノーゲンは数分後にゲル化し始めるので、堅牢だが正確なリバースピペット化と一度に少数の井戸の治療が必要です。プレートを細胞培養インキュベーターに30分間戻し、ヒトマイマ由来マトリックスフィブリンゲルを固化させてから、各ゲルの上部に完全な培地の100マイクロリットルを静かに添加します。その後、毎日スフェロイドの侵入を画像化します。ilastik によるイメージセグメンテーションの場合は、オープンソースの画像分類およびセグメンテーションソフトウェアを開き、ピクセル分類ワークフローを選択します。ilastik プロジェクトをコンピューターに保存します。ピクセルは、ユーザーが作成した注釈に基づいて分類されます。[入力データ]および[新規追加]をクリックして、解析対象の画像を選択します。機能を選択するには、[機能の選択] および [フィーチャの選択] をクリックします。該当するボックスをクリックして、対象のフィーチャを選択します。選択したボックスが緑色に変わります。トレーニングの場合は、[トレーニング] をクリックします。[トレーニング] セクションには、ラベル 1 とラベル 2 の 2 つのラベルが表示されます。いずれかのラベルで背景をマークし、セルにもう一方のラベルを付けます。最初の画像内のすべてのセルと背景にラベルが付いている場合は、現在のビューから次の画像を選択し、画像の 10% がマークされるまでセルと背景をマークし続けます。次に、[ライブ更新] を選択して、すべての画像を分析します。トレーニングが完了し、ilastik がすべての画像を分析したら、[予測エクスポート] をクリックして[ソース] から [単純なセグメンテーション] を選択します。次に、[エクスポートイメージ設定を選択]から目的の出力ファイル形式を選択し、[すべてエクスポート]をクリックしてラベリングの結果をエクスポートします。ファイルは元のイメージと同じフォルダにエクスポートされます。エリア解析では、まず元の画像をフィジー ImageJ のスケール バーで開き、解析された画像と同じサイズとサイズを持つ画像を使用します。線の選択ツールを使用して、既知の長さの線を描画し、[解析してスケールを設定]をクリックします。次に、[既知の距離]フィールドに既知の距離を設定します。適切な単位を設定し、[グローバル]をクリックします。ilastik プラグインをインストールするには、「ヘルプと更新」をクリックし、ImageJ 更新ウィンドウで「更新サイトの管理」をクリックします。[変更を終了]、[閉じる]、および [変更を適用] の横にある をクリックします。数分後に、情報ウィンドウが表示され、正常に更新されたことを示すメッセージが表示されます。[OK] をクリックして、ImageJ を再起動します。次に、[プラグイン]、[マクロ]、および [インストール] をクリックして、カウンタを選択します。ijmファイル。次に、[開く] をクリックします。エリア分析を完了するには、[プラグイン] をクリックしてスクロールして ilastik を選択します。[HDF5 のインポート] を選択し、h5 形式のファイルを選択します。[開く] をクリックし、ルックアップ テーブルを読み込んで適用します。次に、キーボードの[A]ボタンをクリックすると、その領域がサマリーウィンドウに合計領域として表示されます。本代表的な実験では、転移性喉頭扁平上皮癌細胞株播種の4日後、形成されたスフェロイドにマトリックスを加え、逆顕微鏡で毎日浸潤を監視した。一度埋め込まれると、ヒトマイマ由来フィブリンマトリックス中の細胞は、1日後に急速に侵入し始め、次の2日間にわたってマトリックスに拡張された。マウス肉腫由来マトリックス中の細胞は周囲のマトリックスに侵入せず、非対称構造を形成した。コラーゲン中の細胞はわずかに浸入したが、マトリックス収縮のために分析が困難になった。いくつかの井戸では、スフェロイドは3日後に消えました。ここで、ヒトマイマ由来フィブリンマトリックスにおける一次および転移性喉頭扁平上皮癌細胞の浸潤の定量化が示されている。ヒトマイオマ由来フィブリンマトリクススフェロイド浸潤の生細胞解析は、時間の経過とともに他の細胞が続くマトリックス全体の鎖中の細胞の動きを明らかにする。マトリックスをウェルに追加する際には、回転楕円体を中央位置から移動しないように注意してください。この手順は、照射および癌薬などの特定の分子が侵入に与える影響を研究するために使用することができます。細胞は、その後の研究のために固定され、染色することができる。古典的なマウス肉腫モデルでは、細胞は主に増殖し、浸潤態様は最小限である。このヒト腫瘍ベースのマトリックスは、浸潤を誘発し、阻害研究をより効率的にする。

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Study of Viral Vectors in a Three-dimensional Liver Model Repopulated with the Human Hepatocellular Carcinoma Cell Line HepG2

ヒト肝細胞癌細胞株HepG2細胞と三次元肝モデルに再増殖におけるウイルスベクターの研究

This protocol describes the generation of a three-dimensional (3D) ex vivo liver model and its application to the study and development of viral vector ...

Moving Upwards: A Simple and Flexible In Vitro Three-dimensional Invasion Assay Protocol

Moving Upwards: A Simple and Flexible In Vitro Three-dimensional Invasion Assay Protocol

上に移動: シンプルかつ柔軟なIn Vitro三次元侵略試金のプロトコル

Although 3D invasion assays have been developed, the challenge remains to study cells without affecting the integrity of their microenvironment. ...

Analyzing the Communication Between Monocytes and Primary Breast Cancer Cells in an Extracellular Matrix Extract (ECME)-based Three-dimensional System

Analyzing the Communication Between Monocytes and Primary Breast Cancer Cells in an Extracellular Matrix Extract ECME-based Three-dimensional System

単球と細胞外マトリックスの主要な乳癌細胞間コミュニケーションを分析抽出 (ECME)-ベースの三次元システム

Embedded in the extracellular matrix (ECM), normal and neoplastic epithelial cells intimately communicate with hematopoietic and non-hematopoietic cells, ...

Generation of High-Throughput Three-Dimensional Tumor Spheroids for Drug Screening

創薬スクリーニングの高スループット三次元腫瘍回転楕円体の生成

Cancer cells have routinely been cultured in two dimensions (2D) on a plastic surface. This technique, however, lacks the true environment a tumor mass is ...

A Spheroid Killing Assay by CAR T Cells

車 T 細胞スフェロイド殺害アッセイ

Immunotherapy has become a field of growing interest in the fight against cancer otherwise untreatable. Among all immunotherapeutic methods, chimeric ...

Three-Dimensional Bone Extracellular Matrix Model for Osteosarcoma

骨肉腫に対する三次元骨細胞外マトリックス モデル

Osteosarcoma (OS) is the most common and a highly aggressive primary bone tumor. It is characterized with anatomic and histologic variations along with ...

A 3D Spheroid Model as a More Physiological System for Cancer-Associated Fibroblasts Differentiation and Invasion In Vitro Studies

がん関連線維芽細胞分化とインビトロ研究における侵入のためのより生理学的システムとしての3Dスフェロイドモデル

Defining the ideal model for an in vitro study is essential, mainly if studying physiological processes such as differentiation of cells. In the tumor ...

Characterization of the Effects of Migrastatic Inhibitors on 3D Tumor Spheroid Invasion by High-resolution Confocal Microscopy

高分解能共焦点顕微鏡による3D腫瘍スフェロイド侵入に対する移動性阻害剤の効果の特徴

Drug discovery and development in cancer research is increasingly being based on drug screens in a 3D format. Novel inhibitors targeting the migratory and ...

Evaluating Cell Death Using Cell-Free Supernatant of Probiotics in Three-Dimensional Spheroid Cultures of Colorectal Cancer Cells

大腸癌細胞の3次元スフェロイド培養におけるプロバイオティクスの細胞遊離上清を用いた細胞死の評価

This manuscript describes a protocol to evaluate cancer cell deaths in three dimensional (3D) spheroids of multicellular types of cancer cells using ...

Three-Dimensional In Vitro Biomimetic Model of Neuroblastoma Using Collagen-Based Scaffolds

Three-Dimensional In Vitro Biomimetic Model of Neuroblastoma Using Collagen-Based Scaffolds

コラーゲンベースの足場を用いた神経芽細胞腫の3次元 in vitro 生体模倣モデル

Neuroblastoma is the most common extracranial solid tumor in children, accounting for 15% of overall pediatric cancer deaths. The native tumor tissue is a ...