Name: rna next-generation sequencing and a bioinformatics pipeline to identify expressed line-1s at the locus-specific level
Uploaded: 2019-05-19T15:00:00
Duration: 11 min 4 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about RNA Next-Generation Sequencing and a Bioinformatics Pipeline to Identify Expressed LINE-1s at the Locus-Specific Level at JoVE.com

हम डॉ यान दांग DU145 प्रोस्टेट ट्यूमर कोशिकाओं के लिए शुक्रिया अदा करना चाहूंगा । हम सुपर कंप्यूटर लिपियों बनाने में उनके मार्गदर्शन और सलाह के लिए डॉ नाथन Ungerleider शुक्रिया अदा करना चाहूंगा । इस काम के कुछ NIH अनुदान R01 GM121812 पीडी, R01 AG057597 के लिए VPB, और 5TL1TR001418 टी के लिए द्वारा वित्त पोषित किया गया था । हम भी कैंसर क्रूसेडरों और Tulane कैंसर सेंटर Bioसूचनाविज्ञान कोर से समर्थन स्वीकार करना चाहते हैं ।

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लेखकों के पास खुलासा करने के लिए कुछ नहीं है ।

L1 गतिविधि के लिए आनुवंशिक क्षति और बीमारी के लिए योगदान अस्थिरता का कारण दिखाया गया है27,28,29। लगभग ५,००० पूर्ण लंबाई L1 प्रतियां के, केवल कुछ दर्जन विकास युवा L1s खाते के अधिकांश retrotransposition गतिविधि2। हालांकि, वहां सबूत है कि यहां तक कि कुछ पुराने, retroपक्षात्मकता-incompentent L1s अभी भी डीएनए हानिकारक प्रोटीन30का उत्पादन कर रहे हैं । L1s की भूमिका को पूरी तरह से जीनोमिक अस्थिरता और रोग में की सराहना करते हैं, locus-विशिष्ट स्तर पर L1 अभिव्यक्ति समझा जाना चाहिए । तथापि, एल 1 से संबंधित अन्य RNAs में शामिल दृश्यों की उच्च पृष्ठभूमि L1 प्रत्याक्रमण के लिए प्रामाणिक L1 अभिव्यक्ति की व्याख्या में एक महत्वपूर्ण चुनौती बन गया है. पहचान और इसलिए व्यक्तिगत L1 loci के अभिव्यक्ति पैटर्न को समझने में एक और चुनौती उनके दोहराव प्रकृति की वजह से होता है कि कई छोटे पढ़ने के दृश्यों की अनुमति नहीं एक अद्वितीय loci के लिए नक्शा है । इन चुनौतियों से उबरने के लिए, हमने आरएनए-एसईक्यू डेटा का उपयोग करते हुए व्यक्तिगत L1 loci की अभिव्यक्ति की पहचान करने में ऊपर वर्णित दृष्टिकोण विकसित किया ।
हमारे दृष्टिकोण उच्च स्तर फ़िल्टर (९९%) एल-1 दृश्यों से उत्पन्न होने वाले ट्रांसक्रिप् शनल शोर जो एल1 पश् चतरण से असंबंधित होते हैं, कई कदम उठाते हैं । पहले चरण में साइटोप्लाज्मिक आरएनए की तैयारी शामिल है । साइटोप्लाज्मिक आरएनए के लिए चयन करके, एल 1-संबंधित पढ़ता में पाया इंट्रानिक mRNA नाभिक में काफी समाप्त हो रहे हैं. अनुक्रमण पुस्तकालय की तैयारी में, एक और L1s को असंबंधित transcriptional शोर को कम करने के लिए उठाया कदम polyadenylated टेप का चयन शामिल हैं । यह गैर-mRNA प्रजातियों में पाया L1-संबंधित ट्रांसक्रिप्ट शोर निकालता है । एक अन्य चरण में, एंटीसेंस L1-संबंधित ट्रांस्क्रिप्ट को पहचानने और हटाने के लिए strand-विशिष्ट अनुक्रमण शामिल है. आरएनए-एसईक्यू ट्रांस्क्रिप्ट्स की संख्या की पहचान करते समय कार्यशील प्रमोटर क्षेत्रों के साथ पूर्ण-लंबाई L1s के लिए एनोटेशन का उपयोग, जो कि L1s को मैप करता है, पृष्ठभूमि शोर को भी समाप्त करता है जो अंयथा छोटे L1s से उत्पन्न होता है । अंत में, पिछले l1 अनुक्रमण के लिए असंबंधित L1 दृश्यों के transcriptional शोर को नष्ट करने में महत्वपूर्ण कदम पूर्ण लंबाई L1s के मैनुअल curation है के लिए मैप आरएनए Seq टेप की पहचान की है । मैनुअल curation प्रत्येक bioinformatically की पहचान के दृश्य शामिल है-होना करने के लिए अपने आसपास के जीनोमिक वातावरण के संदर्भ में L1 प्रकट व्यक्त की पुष्टि करने के लिए कि अभिव्यक्ति L1 प्रमोटर से निकलती है । इस दृष्टिकोण DU145, एक प्रोस्टेट ट्यूमर कोशिका रेखा के लिए लागू किया गया था । यहां तक कि सभी तैयारी से संबंधित कदम पृष्ठभूमि शोर को कम करने के लिए, L1 loci के लगभग ५०% की पहचान की bioinformatically में DU145 के रूप में अस्वीकार कर दिया गया L1 पृष्ठभूमि शोरअन्य transcriptional स्रोतों से शुरू विश्वसनीय परिणाम देने के लिए कठोरता पर बल देना । इस दृष्टिकोण मैनुअल curation का उपयोग कर श्रम गहन है, लेकिन इस पाइपलाइन के विकास में आवश्यक का मूल्यांकन करने और एक पूर्ण लंबाई L1 आसपास जीनोमिक पर्यावरण को समझने के लिए । अगले कदम curation नियमों के कुछ स्वचालित द्वारा आवश्यक मैनुअल curation की राशि को कम करने में शामिल हैं, हालांकि कारण जीनोमिक अभिव्यक्ति की अभी भी पूरी तरह से ज्ञात प्रकृति, संयुक्त राष्ट्र के संदर्भ में अभिव्यक्ति के स्रोतों एनोटेटिड जीनोम, कम के क्षेत्रों mappability, और यहां तक कि एक संदर्भ जीनोम के निर्माण के साथ शामिल कारकों उलझी यह पूरी तरह से इस समय L1 curation स्वचालित करने के लिए संभव नहीं है ।
अनुक्रमण के साथ व्यक्तिगत L1 loci की अभिव्यक्ति की पहचान करने में दूसरी चुनौती दोहराव L1 टेप के मानचित्रण से संबंधित है । इस संरेखण रणनीति में, यह आवश्यक है कि एक प्रतिलिपि को विशिष्ट रूप से संरेखित करना चाहिए और संदर्भ जीनोम में सह-linearly होना चाहिए ताकि मैप किया जा सके । ऐसे युग्मित-अंत दृश्यों के लिए चयन करके, जो इस बात का नक्शा तैयार करते हैं, कि संदर्भ जीनोम में पाए जाने वाले एल1 loci में विशिष्ट रूप से संरेखित ट्रांस्क्रिप्ट की मात्रा बढ़ जाती है । इस अनूठी मानचित्रण रणनीति एक एकल L1 locus के लिए विशेष रूप से पढ़ने के फोन मानचित्रण में विश्वास प्रदान करता है, हालांकि यह संभावित प्रत्येक पहचान की अभिव्यक्ति मात्रा underestimates-हो-प्रमाण के अनुसार व्यक्त की, दोहराव L1 । इस अंडरestimation के लिए लगभग सही करने के लिए, अपनी mappability के आधार पर प्रत्येक L1 लोकस के लिए एक "mappability" स्कोर विकसित किया गया था और विशिष्ट मैप किए गए प्रतिलिपि पढ़ता की संख्या के लिए लागू (चित्रा 6) । यह ध्यान देने योग्य है कि आदर्श रूप में, mappability पूर्ण कवरेज के लिए रन बनाए जाने चाहिए पूर्ण लंबाई L1 मिलान WGS नमूने के अनुसार पढ़ता है । यहां, हम HeLa कोशिकाओं के wgs का उपयोग करने के लिए फुलाने के लिए प्रत्येक l1 loci के mappability स्कोर निर्धारित करने के लिए या डिफ्लेट द DU145 प्रोस्टेट ट्यूमर कोशिका लाइनों में L1 loci को मानचित्रण पढ़ता है । इस mappability गणना एक क्रूड सुधार स्कोर है, लेकिन ' चुना ४०० के पूर्ण कवरेज mappability ' पढ़ता मन में ट्यूमर कोशिका लाइनों के गतिशील प्रकृति के साथ निर्धारित किया गया था । यह पूरक चित्रा 1में मनाया जा सकता है, कि वहां कुछ L1 wgs के साथ बहुत ही उच्च संख्या के साथ एल. ई. loci रहे है प्रतिचित्रित पढ़ता है । ये संभावना HeLa के भीतर दोहराया गुणसूत्र दृश्यों से आया है कि संदर्भ जीनोम, यही वजह है कि उन loci को पूरा mappability कवरेज का प्रतिनिधि नहीं चुना गया है के भीतर नहीं हैं । इसके बजाय यह निर्धारित किया गया था कि १००% पढ़ने के कवरेज के आसपास होता है ४०० पूरक चित्रा 1 के अनुसार पढ़ता है और तब माना जाता है कि इस औसत DU145 ट्यूमर प्रोस्टेट सेल लाइन के रूप में अच्छी तरह से करने के लिए लागू होता है ।
100-200 bp के साथ इस संरेखण रणनीति आरएनए-seq प्रौद्योगिकी से पढ़ता है भी प्राथमिकता के रूप में संदर्भ जीनोम के भीतर विकास पुराने L1s के लिए चयन के रूप में पुराने L1s समय अद्वितीय उत्परिवर्तनों कि उंहें और अधिक mappable बनाने पर जमा किया है । इस दृष्टिकोण, इसलिए सीमित संवेदनशीलता है जब यह L1s के रूप में के रूप में अच्छी तरह से गैर संदर्भ, बहुरूपी L1s के सबसे कम उंर की पहचान करने के लिए आता है । L1s के सबसे कम उंर की पहचान करने के लिए, हम का उपयोग करने का सुझाव 5 ' की दौड़ चयन L1 टेप और अनुक्रमण प्रौद्योगिकी PacBio की तरह है कि अब21पढ़ता है का उपयोग करें । यह और अधिक अद्वितीय मानचित्रण परमिट और इसलिए व्यक्त की पहचान, युवा L1s । आरएनए-एसईक्यू और PacBio दृष्टिकोण एक साथ का उपयोग कर प्रामाणिक रूप से व्यक्त की एक अधिक व्यापक सूची के लिए नेतृत्व कर सकते हैं L1s । प्रामाणिक रूप से व्यक्त की पहचान करने के लिए बहुरूपी L1s, पहले अगले कदम निर्माण और संदर्भ जीनोम में बहुरूपी दृश्यों की प्रविष्टि शामिल हैं ।
दोहराने दृश्यों का अध्ययन करने में जैविक और तकनीकी चुनौतियों महान हैं, हालांकि इसके बाद के संस्करण कठोर प्रक्रिया के साथ एल. एन. एन. ए. एन. आर. एन. ए.-अनुक्रमण प्रौद्योगिकी का उपयोग कर retrotransposition से संबंधित, ट्रांस्क्रिशनल पृष्ठभूमि शोर के बड़े स्तर पर और आत्मविश्वास से किया जा रहा है और इसरो व्यक्तिगत लोकस स्तर पर L1 अभिव्यक्ति पैटर्न और मात्रा की पहचान ।

रिट्रोपक्षारित्र दोहराए जाने वाले डीएनए तत्व हैं जो आरएनए मध्यवर्ती के माध्यम से कॉपी और पेस्ट तंत्र में जीनोम में "कूद" कर सकते हैं । पश्चपक्षाभ के एक उपसमुच्चय को दीर्घ अंतरास्पर्सयुक्त तत्वों-1 (रेखाओं/L1s) के रूप में जाना जाता है और यह मानव जीनोम का छठा अंग है, जिसकी 500, 0000 प्रतिलिपियाँ1हैं । उनकी बहुतायत के बावजूद, इन प्रतियों की सबसे दोषपूर्ण और केवल एक अनुमान के साथ काट रहे है 80-120 L1 तत्वों के लिए सक्रिय2सोचा । एक पूर्ण लंबाई L1 5 ' और 3 के साथ लंबाई में के बारे में 6 केबी है ' untranslated क्षेत्रों, एक आंतरिक प्रमोटर और एसोसिएटेड विरोधी भावना प्रमोटर, दो गैर अतिव्यापी खुले पढ़ने के फ्रेम (orfs), और एक संकेत और polya पूंछ3,4,5 . मनुष्यों में, L1s बड़े परिवारों के साथ विकासवादी युग द्वारा विशिष्ट subfamilies से बना रहे है समय के साथ अधिक अद्वितीय अनुक्रम परिवर्तन संचित होने सबसे कम उंर के उपपरिवार, L1HS6,7की तुलना में । L1s एक ही स्वायत्त, मानव रेट्रोट्रांसपोसंस और उनके orfs एक रिवर्स ट्रांसक्रिप्टेस, endonuclease, और आरएनपीएस के साथ आर. एन. ए.-बाध्यकारी और निगरानी के लिए एक प्रक्रिया में retrotranspose और जीनोम में डालने के लिए आवश्यक गतिविधियों को सांकेतिक शब्दों में बदलना करने के लिए कहा जाता है लक्ष्य primed रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन8,9,10,11,12।
L1s के प्रतिपक्षांतरण के कारण मानव जर्मलाइन रोगों के होने की सूचना मिली है, जिसमें सम्मिलन उत्परिवर्तनजनन, लक्ष्य-स्थल विलोपन और पुनर्व्यवस्था,13,14,15, 16. हाल ही में यह परिकल्पना की गई है कि L1s oncogenesis में एक भूमिका निभा सकता है और बढ़ अभिव्यक्ति और इस mutagenic तत्व की प्रविष्टि घटनाओं उपकला कैंसर . यह अनुमान लगाया गया है कि प्रत्येक २०० जन्मों में एक नई L1 प्रविष्टिहै । इसलिए सक्रियता से व्यक्त L1s के जीव विज्ञान को बेहतर ढंग से समझना अनिवार्य है । अन्य जीनों के प्रतिलिपियों में पाई गई दोषपूर्ण प्रतियों की पुनरावृत्तीय प्रकृति और प्रचुरता ने विश्लेषण के इस स्तर को चुनौतीपूर्ण बना दिया है ।
सौभाग्य से, उच्च throughput अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों के आगमन के साथ, प्रगति को पार्स किया गया है और प्रमाण के अनुसार locus-विशिष्ट स्तर पर L1s को व्यक्त करने की पहचान । वहां कैसे सबसे अच्छा आरएनए अगली पीढ़ी के अनुक्रमण का उपयोग L1s व्यक्त की पहचान करने पर भिंन दर्शन कर रहे हैं । वहां केवल दो उचित locus-विशिष्ट स्तर पर L1 टेप मानचित्रण के लिए सुझाव दिया दृष्टिकोण गया है । एक केवल संभावित ट्रांसक्रिप्शन कि L1 polyadenylation संकेत के माध्यम से पढ़ता है और flanking20दृश्यों में केंद्रित है । हमारा दृष्टिकोण L1 तत्वों के बीच छोटे अनुक्रम मतभेद का लाभ लेता है और केवल उन आरएनए-seq पढ़ता है कि विशिष्ट एक लोकस21करने के लिए नक्शे । इन दोनों पद्धतियों में प्रतिलेख स्तरों की मात्रा के संदर्भ में सीमाएं हैं । Quantitation संभावित रूप से प्रत्येक L1 लोकस21की ' अद्वितीय mappability ' के लिए एक सुधार जोड़ने, या अधिक जटिल एल्गोरिदम है कि एक विशिष्ट लोकस22के लिए अद्वितीय मैप नहीं किया जा सकता बहु-मैप reads पुनर्वितरित का उपयोग करके सुधारा जा सकता है । यहां, हम एक कदम दर कदम तरीके से आरएनए निष्कर्षण और अगली पीढ़ी के अनुक्रमण और bioसूचनाविज्ञान प्रोटोकॉल के लिए locus-विशिष्ट स्तर पर व्यक्त L1 तत्वों की पहचान में विस्तार होगा । हमारा दृष्टिकोण कार्यात्मक L1 तत्वों के जीवविज्ञान के हमारे ज्ञान का अधिकतम लाभ लेता है । इसमें यह जानना शामिल है कि कार्यात्मक L1 तत्वों L1 प्रमोटर से उत्पंन किया जाना चाहिए, L1 तत्व की शुरुआत में शुरू की, कोशिका द्रव्य में अनुवाद किया जाना चाहिए और है कि उनके टेप सह होना चाहिए रैखिक जीनोम के साथ । संक्षेप में, हम ताजा, साइटोप्लाज्मी आरएनए इकट्ठा, polyadenylated टेप के लिए चयन करें, और एक विशिष्ट नक्शा करने के लिए भूग्रस्त-विशेष आरएनए Seq विश्लेषण का उपयोग मानव संदर्भ जीनोम में L1 loci को पढ़ता है । ये गठबंधन पढ़ता है तो अभी भी व्यापक मैनुअल curation निर्धारित करने के लिए यदि ट्रांसक्रिप्ट पढ़ता एक लोकस के रूप में एक प्रमाण के रूप में व्यक्त l1 से पहले l1 प्रमोटर से आरंभ की आवश्यकता है । हम DU145 प्रोस्टेट ट्यूमर कोशिका रेखा के नमूने पर इस दृष्टिकोण को लागू करने के लिए यह कैसे दिखाता है एक अपेक्षाकृत कुछ सक्रिय रूप से निष्क्रिय प्रतियां के द्रव्यमान से L1 सदस्यों तहरीर दी ।

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>1 M HEPES</td>
			<td>Affymetrix</td>
			<td>AAJ16924AE</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>5 M NaCl</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>AM9760G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agilent bioanalyzer 2100</td>
			<td>Agilent technologies</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agilent RNA 6000 Nano Kit</td>
			<td>Agilent technologies</td>
			<td>5067-1511</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>bedtools.26.0</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/installation.html</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>bowtie-0.12.8</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>https://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie/0.12.8/</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cell scraper</td>
			<td>Olympus plastics</td>
			<td>25-270</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chloroform</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>C298-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Digitonin</td>
			<td>Research Products International Corp</td>
			<td>50-488-644</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethanol</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>A4094</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gibco (Phosphate Buffered Saline)</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>10-010-049</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Homogenizer</td>
			<td>Thomas Scientific</td>
			<td>BBI-8541906</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IGV 2.4</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>https://software.broadinstitute.org/software/igv/download</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Isopropanol</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>A416-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>mac2unix</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>https://sourceforge.net/projects/cs-cmdtools/files/mac2unix/</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Q-tips</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>23-400-122</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAse later solution</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>AM7022</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNaseZap RNase Decontamination Solution</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>AM9780</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>samtools-1.3</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>https://sourceforge.net/projects/samtools/files/</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>sratoolkit.2.9.2</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/Downloads</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SUPERase&#183;In RNase Inhibitor</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>AM2694</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trizol</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>15-596-018</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Water (DNASE, RNASE free)</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>BP2484100</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

rna next-generation sequencing and a bioinformatics pipeline to identify expressed line-1s at the locus-specific level

लंबे INterspersed तत्वों-1 (लाइंस/L1s) दोहराया तत्व है कि नकल कर सकते है और बेतरतीब ढंग से जीनोमिक अस्थिरता और mutagenesis में जिसके परिणामस्वरूप जीनोम में संमिलित कर रहे हैं । व्यक्तिगत स्तर पर L1 loci की अभिव्यक्ति पैटर्न को समझना इस mutagenic तत्व के जीव विज्ञान की समझ को उधार दे देंगे । इस स्वायत्त तत्व ऊपर ५००,००० प्रतियां के साथ मानव जीनोम का एक महत्वपूर्ण हिस्सा बना देता है, हालांकि ९९% काट रहे है और दोषपूर्ण । तथापि, दोषपूर्ण प्रतियों की उनकी बहुतायत और प्रबल संख्या से यह पता लगाना चुनौतीपूर्ण होता है कि एल1 से संबंधित L1s को अन्य जीनों के भाग के रूप में व्यक्त किया गया है । यह भी पहचान है जो विशिष्ट L1 लोकस तत्वों के दोहराव प्रकृति के कारण व्यक्त की है चुनौतीपूर्ण है । इन चुनौतियों से पार पाते हुए, हम लोकस विशिष्ट स्तर पर L1 अभिव्यक्ति की पहचान करने के लिए एक आरएनए-seq bioinformatic दृष्टिकोण प्रस्तुत करते हैं । संक्षेप में, हम साइटोप्लाज्मिक आरएनए इकट्ठा, polyadenylated टेप के लिए चुनते हैं, और भूग्रस्त विशिष्ट आरएनए-Seq विश्लेषण का उपयोग विशिष्ट नक्शा मानव संदर्भ जीनोम में L1 loci को पढ़ता है । हम अपने स्वयं के प्रमोटर से प्रतिलेखन की पुष्टि करने के लिए और प्रत्येक व्यक्ति l1 लोकस के mappability के लिए खाते के लिए मैप किए गए प्रतिलिपि को समायोजित पढ़ता विशिष्ट मैप के साथ प्रत्येक L1 लोकस नेत्रहीन उपपादरी । यह दृष्टिकोण एक प्रोस्टेट ट्यूमर सेल लाइन, DU145 करने के लिए लागू किया गया था, पूर्ण लंबाई L1 तत्वों की एक छोटी संख्या से अभिव्यक्ति का पता लगाने के लिए इस प्रोटोकॉल की क्षमता का प्रदर्शन करने के लिए ।

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RNA Next-Generation Sequencing and a Bioinformatics Pipeline to Identify Expressed LINE-1s at the Locus-Specific Level

आरएनए अगली पीढ़ी के अनुक्रमण और एक Bioसूचनातंत्र पाइप लाइन व्यक्त की पहचान करने के लिए-Locus-विशिष्ट स्तर पर 1s

यहां, हम एक bioinformatic दृष्टिकोण और विश्लेषण प्रस्तुत करने के लिए लोकस विशिष्ट स्तर पर लाइन-1 अभिव्यक्ति की पहचान ।

Long INterspersed Elements-1 (LINEs/L1s) are repetitive elements that can copy and randomly insert in the genome resulting in genomic instability and ...

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