Name: inverse probability of treatment weighting (propensity score) using the military health system data repository and national death index
Uploaded: 2020-01-08T12:00:00
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本出版物中报告的研究得到了国家卫生研究院国家促进转化科学中心的支持，奖励编号为UL1 TR002345。内容完全由作者负责，不一定代表国家卫生研究院的官方观点。
免责声明：此外，本文中表达的观点仅是作者的观点，不应被解释为以任何方式代表美国政府、美国国防部或美国国防部的观点。军队。特定产品或科学仪器的识别被视为科学努力的组成部分，并不构成作者、国防部或任何组成部分机构的认可或默示认可。

以下议定书遵循我们机构人类伦理委员会的指导方针。
1. 定义队列
<ol><li>使用 1） 注册表或 2） 数据点确定并明确定义计划队列的包含和排除标准，这些数据点可以从 MDR 中提取，例如诊断或程序的管理代码（即，所有患者超过两个心房颤动的门诊诊断或住院诊断）。<ol>
<li>如果使用注册表，请包括两个或多个患者标识符，以便与军事卫生系统数据存储库进行精确匹配，例?...

<ol>
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当随机对照试验不可行时，使用大型管理数据集的回顾性分析提供了一种高效且经济高效的替代方法。适当的数据集将取决于感兴趣的人口和变量，但 MDR 是一个有吸引力的选项，没有在医疗保险数据中看到的年龄限制。对于任何数据集，熟悉其布局和数据字典非常重要。在此过程中，应小心谨慎，确保捕获完整的数据，并准确匹配和合并数据。
诊断代码应使用现有文献定义...

随机的安慰剂对照试验是最有力的研究设计，以量化治疗的有效性，但由于成本和时间要求或治疗组1之间缺乏装备，它们并不总是可行的。在这些情况下，使用大规模管理数据（"大数据"）的回顾性队列设计通常提供高效且经济高效的替代方案，但缺乏随机化引入了治疗选择偏差2。当治疗决定依赖于与感兴趣的结果相关的预治疗特征时，治疗选择偏差发生在非随机研究中。这些特征被称为混杂因素。
由于倾向分数通过平衡治疗组之间的已知混淆来最小化这种偏见，它们变得越来越受欢迎。倾向分数被用来比较手术方法4和医疗方案5。最近，我们使用美国军事卫生系统数据存储库（MDR）的数据倾向分析，根据冠状动脉钙6的存在和严重程度，评估他汀类药物在心血管结果初级预防方面的影响。
MDR 的使用频率低于医疗保险和 VA 数据集用于研究目的，包含从为现役军人、退休人员和其他国防部 （DoD） 医疗保健受益人及其家属提供的住院和门诊服务中提供的综合行政和医疗索赔信息。该数据库包括在美国军事治疗设施或向国防部收费的民用设施向全世界提供的服务。该数据库包括自 2001 年 10 月 1 日以来的完整药房数据。实验室数据可从2009年提供，但仅限于军事治疗设施。在MDR中，队列被定义的方法包括使用诊断代码（例如，糖尿病7）或程序代码（例如，关节镜手术8）。或者，外部定义的合格受益人群体（如登记处）可以与 MDR 进行匹配，以获得基线和后续数据9。与医疗保险不同，MDR 包括所有年龄段的患者。它比VA数据库对男性的偏见要小，因为它包括受抚养者。但是，对 MDR 的访问有限。通常，只有作为军事卫生系统成员的调查员才能请求访问，类似于使用 VA 数据库的要求。寻求获取军事卫生系统数据的非政府研究人员必须通过在政府赞助者的监督下通过数据共享协议进行访问。
使用任何管理数据集时，请务必牢记管理编码的局限性和优点。代码的灵敏度和特异性可能因相关诊断而异，无论是初级诊断还是二级诊断，还是住院或门诊档案。急性心肌梗死的住院代码一般准确报告，预测值超过90%，但烟草使用往往被编码为11。这种编码可能对研究结果产生有意义的影响，也可能没有影响。此外，给定条件的几个代码可能存在与问题13中的疾病有不同程度的相关性。调查小组应对《国际疾病分类》、《第九次修订本》、《临床修改（ICD-9-CM）》和/或ICD-10-CM编码手册进行全面的文献检索和审查，以确保研究包括适当的编码。
可采用多种方法提高诊断代码的灵敏度和准确性，以定义合并条件。应列入适当的"回顾"期，以确定基线合并症。回诊期包括入学前提供的住院和门诊服务。一年的周期可能是最佳的14年。此外，需要两个单独的声明，而不是一个单一的索赔可以增加特异性，而补充编码数据与药物数据可以提高灵敏度15。选择对部分数据的手动图表审核可用于验证编码策略的准确性。
一旦为相关人群定义和评估合并症，就可以使用倾向评分来平衡治疗组之间协变量的差异。倾向评分来自患者被分配到基于已知协变量的治疗的概率。考虑这种倾向治疗可以减少协变量对治疗分配的影响，并有助于对治疗结果产生更真实的估计。虽然倾向分数不一定能为多变量模型提供卓越的结果，但它们确实允许评估经过处理和未经处理的群体在应用倾向分数3后是否具有可比性。研究研究者可以分析在倾向匹配或治疗权重（IPTW）的逆概率前后协变量的绝对标准化差异，以确保已知的混杂物在组之间得到平衡。重要的是，未知的混淆可能不平衡，人们应该意识到剩余混淆的可能性。
然而，当正确执行时，倾向分数是一个强大的工具，可以预测和复制随机对照试验的结果16。在现有的倾向评分技术中，匹配和IPTW通常首选17。在IPTW内，患者按其治疗倾向或概率加权。稳定重量通常建议超过原始重量，而修剪重量也可以被认为是18，19，20，21。
一旦研究组是平衡的，他们可能会跟随，直到感兴趣的结果。利用行政数据进行的研究可能对重新接纳率和事件时间分析等结果感兴趣。在有关死亡率的研究中，军事卫生系统数据库包括一个生命状态领域，可以使用国家死亡指数（NDI）22、23进一步扩展。NDI 是一个集中的数据库，由疾病控制中心管理，由州办事处提供死亡记录信息。调查人员可以根据死亡证明要求基本的生命状态和/或具体死因。
以下协议详细介绍了使用 MDR 进行管理数据库研究的过程，该研究增加了来自 NDI 的死亡率信息。它详细介绍了 IPTW 的使用以平衡两个治疗组之间的基线差异，包括 SAS 代码和示例输出。

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>CD Burner (for NDI Request)</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Computer</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Putty.exe</td>
			<td>Putty.org</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SAS 9.4</td>
			<td>SAS Institute Cary, NC</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>WinSCP or other FTP software</td>
			<td><a href="https://winscp.net/eng/index.php" target="_blank">https://winscp.net/eng/index.php</a></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

inverse probability of treatment weighting (propensity score) using the military health system data repository and national death index

当随机对照试验不可行时，使用大数据的回顾性研究提供了一种高效且经济高效的替代方案，尽管它们存在治疗选择偏差的风险。当治疗选择基于也与结果相关的预治疗特征时，治疗选择偏差发生在非随机研究中。这些治疗前特征，或混淆，可以影响评估治疗对结果的影响。倾向分数通过平衡治疗组之间的已知混淆，将这种偏差降至最低。执行倾向性分数分析的方法有几种方法，包括倾向评分、倾向匹配和治疗权重的反向概率 （IPTW） 分层。此处介绍的是使用 IPTW 来平衡美国军事卫生系统数据存储库 （MDR） 中一组患者的基线合并症。MDR 是一个相对最佳的数据源，因为它提供了一个包含的队列，其中向符合条件的受益人提供几乎完整的住院和门诊服务信息。下文概述了使用《孕产妇死亡率报告》补充国家死亡指数信息，以提供可靠的死亡率数据。还提供了使用管理数据的建议。最后，该协议共享一个SAS代码，用于使用IPTW来平衡已知的混淆，并绘制感兴趣的结果的累积入射函数。

完成 IPTW 后，可以使用 stddiff 宏代码或 asdplot 宏代码分别生成绝对标准化差异的表或图。图 1显示了使用 asdplot 宏在 10，000 名参与者中适当平衡的示例。应用倾向分数后，绝对标准化差异显著缩小。用于绝对标准化差值的截止点有些任意，尽管经常使用 0.1，表示两个组之间的差异可以忽略不计。在小群体中，适当的平衡更难实现。图...

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Inverse Probability of Treatment Weighting Propensity Score using the Military Health System Data Repository and National Death Index

当随机对照试验不可行时，像军事卫生系统数据存储库这样的综合卫生保健数据源为回顾性分析提供了有吸引力的替代方案。纳入国家死亡指数的死亡率数据，并使用倾向权重平衡群体之间的差异，有助于减少追溯设计中固有的偏见。

使用军事卫生系统数据存储库和国家死亡指数进行治疗加权的反向概率（概率评分）

When randomized controlled trials are not feasible, retrospective studies using big data provide an efficient and cost-effective alternative, though they ...

过去，我们使用军事医疗保健数据库来帮助确定哪些患者将从他汀类药物治疗中受益最大，从而帮助减少他们未来心脏病发作的机会。我们的协议为任何有兴趣使用大数据回答自己临床问题的医疗提供商提供了路线图，并可应用于范围远、数量几乎无限的主题。在获得机构审查委员会的批准后，完成数据共享协议申请，注意在 DRT MDR 提取工作表上指定请求的数据字段和文件。指定团队是请求数据分析员、提供原始数据，还是团队将直接访问 MDR，请求是一次数据拉取，还是每天、每月或每年请求定期拉取。要直接访问 MDR，请填写 MDR-CS-2875 表格中的 MDR 授权请求。直接访问 MDR 时，请按照有关访问和使用 MDR 的说明操作，包括 MDR 用户指南和 MDR 功能指南中提供的软件要求和 SAS 程序示例。要获取队列的其他 MDR 受益人数据，请从服务器获取 VM6 文件，然后与队列文件合并。在 VM6 数据绘制和队列文件中使用不同的变量名称来处理患者姓名和出生日期，以帮助在合并后的后续检查错误。由于数据库条目永远不会完全没有错误，因此除了检查程序日志和输出是否有任何潜在问题外，还使用代码在每个主要步骤后预形成错误检查。将队列文件中的名称与 VM6 文件进行比较时，仅匹配前三个字母，以提高效率并减少因文件之间的拼写或间距差异而可能出现的任何错误。然后查看错误数据文件，根据需要对运行状况记录进行手动检查，以检查其他有关错误。有关数据提取，请从 VM6 受益文件获取种族和性别数据，将此日期与队列文件合并，并检查刚才显示的错误。从死亡主文件中获取死亡数据，将数据与队列文件合并并检查错误。然后根据需要获取分析的其他数据文件。对于数据合并和求和文件构造，使用 ICD-9-CM 或 ICD-10-CM 代码从索引日期之前的时间段提取基线合并症。如VM6受益人档案中核实的基线期间，注意患者有资格在军事医疗系统工作。搜索门诊和/或住院文件中的基线诊断代码，在索引日期之前的基线 12 个月内确定基线合并症。如果使用 Elixhauser 合并症，请使用医疗保健成本和利用率项目数据库中的可用软件，确保根据需要修改诊断变量和文件的名称。要为所有患者设置研究结束日期，作为未证明兴趣结果的患者随跟的截止时间，请搜索 VM6 受益人文件，以确保通过研究结束日期获得医疗保健资格。如果将研究限制在医疗保健系统的活跃用户（与资格无关）很重要，则确定数据文件中的最后一个医疗保健联系人，并在该日期对患者进行审查。获得所有必要的信息后，使用 Ranuni 为每位患者生成随机患者标识符。要对处理概率进行建模，请使用逻辑进度计算预测概率的权重。然后通过将分数除以均重来稳定倾向分数。在应用对标准差分值宏进行正反概率处理后验证平衡，简化了 SAS 权重之前和之后共方数的计算标准化均值差异。若要在 PROC PHREG 中生成累积发生率函数图，请引用协变量文件以指定在 PROC PHREG 语法中生成绘图时要使用的协变量值，使用权重语句指定标准化的倾向分数变量，并使用基线语句指定基线协变量的值以绘制累积发生率函数。然后指定要使用 ROWID 用于绘图的地层。此处，使用绝对标准化差分图宏的 10000 名参与者中适当平衡的示例。倾向性分数应用后，绝对标准化差异显著缩小。在这里，可以观察到尝试平衡100名参与者的协变量的不成功结果。在此示例中，使用具有标准化倾向评分权重的 PROC PHREG 生成累积发生率函数图，表明在此分析中，未经处理的对照组显示的事件数量较大，存活率比接受治疗组相对差。MDR包括国防部的受益人，包括退休人员和家庭成员。因此，它并不仅限于65周万岁的患者，也不限于退伍军人。该协议提供了使用MDR的起点。统计技术概述可以帮助消除在这类研究中固有的偏差。

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Probe-based Confocal Laser Endomicroscopy of the Urinary Tract: The Technique

基于探测器的激光共聚焦激光显微内镜对泌尿道的技术

Probe-based  confocal laser endomicroscopy (CLE) is an emerging optical imaging technology  that enables real-time in vivo microscopy of mucosal surfaces ...

Identification of Disease-related Spatial Covariance Patterns using Neuroimaging Data

鉴定的使用神经影像学数据的与疾病-相关的的空间协方差模式

The scaled subprofile model (SSM)1-4 is a multivariate PCA-based algorithm that identifies major sources of variation in patient and control group brain ...

Noninvasive Intratracheal Intubation to Study the Pathology and Physiology of Mouse Lung

无创性气管内插管，以研究小鼠肺的病理生理

The use of a model that mimics the condition of lung diseases in humans is critical for studying the pathophysiology and/or etiology of a particular ...

Human Vastus Lateralis Skeletal Muscle Biopsy Using the Weil-Blakesley Conchotome

Human Vastus Lateralis Skeletal Muscle Biopsy Using the Weil-Blakesley Conchotome

人的<em&gt;股外侧肌</em&gt;骨骼肌活检使用韦尔 - Blakesley Conchotome

Percutaneous muscle biopsy using the Weil-Blakesley conchotome is well established in both clinical and research practice. It is a safe, effective and ...

A Method of Trigonometric Modelling of Seasonal Variation Demonstrated with Multiple Sclerosis Relapse Data

季节变化的三角建模的方法证明与多发性硬化症复发数据

This report describes a novel Stata-based application of trigonometric regression modelling to  55 years of multiple sclerosis relapse data from 46 ...

Network Analysis of Foramen Ovale Electrode Recordings in Drug-resistant Temporal Lobe Epilepsy Patients

在耐药性颞叶癫痫患者卵圆孔电极记录的网络分析

Approximately 30% of epilepsy patients are refractory to antiepileptic drugs. In these cases, surgery is the only alternative to eliminate/control ...

Drug Repurposing Hypothesis Generation Using the "RE:fine Drugs" System

药品再利用产生假设使用“RE：精药品”系统

The promise of drug repurposing is that existing drugs may be used for new disease indications in order to curb the high costs and time for approval. The ...

Using Retinal Imaging to Study Dementia

利用视网膜成像研究痴呆

The retina offers a unique &#8220;window&#8221; to study pathophysiological processes of dementia in the brain, as it is an extension of the central ...