Name: inverse probability of treatment weighting (propensity score) using the military health system data repository and national death index
Uploaded: 2020-01-08T12:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Inverse Probability of Treatment Weighting Propensity Score using the Military Health System Data Repository and National Death Index at JoVE.com

המחקר שדווח בפרסום זה נתמך על ידי המרכז הלאומי לקידום מדעי העבר של המכון הלאומי לבריאות תחת מספר הפרס UL1 TR002345. התוכן הינו באחריות המחברים בלבד ואינו מייצג בהכרח את ההשקפות הרשמיות של המכון הלאומי לבריאות.
כתב ויתור: בנוסף, ההשקפות המובעות במאמר זה הן של המחבר בלבד, ואין לפרש אותן לייצוג בכל דרך שהיא של ממשלת ארצות הברית, מחלקת ההגנה של ארצות הברית, או מחלקת ארצות ה צבא. הזיהוי של מוצרים ספציפיים או מכשור מדעי נחשב לחלק בלתי נפרד מהמאמצים המדעיים ואינו מהווה אישור לתמיכה או משתמעת מצד המחבר, משרד ההגנה או כל סוכנות מרכיבים.

הפרוטוקול הבא עוקב אחר ההנחיות של ועדות האתיקה האנושית המוסדית שלנו.
1. הגדרת הקבוצה
<ol><li>קבע והגדר בבירור את קריטריוני ההכללה וההדרה של המחזור המתוכנן באמצעות 1) הרישום או 2 נקודות נתונים שניתן לחלץ מ-MDR כגון קודים מנהליים לאבחנות או הליכים (כלומר, כל המטופלים עם יותר משני טי...

<ol>
	<li>Concato, J., Shah, N., Horwitz, R. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Randomized,+controlled+trials,+observational+studies,+and+the+hierarchy+of+research+designs.">Randomized, controlled trials, observational studies, and the hierarchy of research designs.</a> New England Journal of Medicine. 342 (25), 1887-1892 (2000).</li><li>Austin, P. C., Platt, R. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Survivor+treatment+bias,+treatment+selection+bias,+and+propensity+scores+in+observational+research.">Survivor treatment bias, treatment selection bias, and propensity scores in observational research.</a> Journal of Clinical Epidemiology. 63 (2), 136-138 (2010).</li><li>Sturmer, T., Wyss, R., Glynn, R. J., Brookhart, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Propensity+scores+for+confounder+adjustment+when+assessing+the+effects+of+medical+interventions+using+nonexperimental+study+designs.">Propensity scores for confounder adjustment when assessing the effects of medical interventions using nonexperimental study designs.</a> Journal of Internal Medicine. 275 (6), 570-580 (2014).</li><li>Schermerhorn, M. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Long-Term+Outcomes+of+Abdominal+Aortic+Aneurysm+in+the+Medicare+Population.">Long-Term Outcomes of Abdominal Aortic Aneurysm in the Medicare Population.</a> New England Journal of Medicine. 373 (4), 328-338 (2015).</li><li>Williams, R. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Propensity-Matched+Analysis+Between+Standard+Versus+Tapered+Oral+Vancomycin+Courses+for+the+Management+of+Recurrent+Clostridium+difficile+Infection.">A Propensity-Matched Analysis Between Standard Versus Tapered Oral Vancomycin Courses for the Management of Recurrent Clostridium difficile Infection.</a> Open Forum Infectious Diseases. 4 (4), (2017).</li><li>Mitchell, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Impact+of+Statins+on+Cardiovascular+Outcomes+Following+Coronary+Artery+Calcium+Scoring.">Impact of Statins on Cardiovascular Outcomes Following Coronary Artery Calcium Scoring.</a> Journal of the American College of Cardiology. 72 (25), 3233-3242 (2018).</li><li>Rush, T., McGeary, M., Sicignano, N., Buryk, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+plateau+in+new+onset+type+1+diabetes:+Incidence+of+pediatric+diabetes+in+the+United+States+Military+Health+System.">A plateau in new onset type 1 diabetes: Incidence of pediatric diabetes in the United States Military Health System.</a> Pediatric Diabetes. 19 (5), 917-922 (2018).</li><li>Rhon, D. I., Greenlee, T. A., Marchant, B. G., Sissel, C. D., Cook, C. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comorbidities+in+the+first+2+years+after+arthroscopic+hip+surgery:+substantial+increases+in+mental+health+disorders,+chronic+pain,+substance+abuse+and+cardiometabolic+conditions.">Comorbidities in the first 2 years after arthroscopic hip surgery: substantial increases in mental health disorders, chronic pain, substance abuse and cardiometabolic conditions.</a> British Journal of Sports Medicine. , (2018).</li><li>Mitchell, J., Paisley, R., Moon, P., Novak, E., Villines, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Coronary+Artery+Calcium+Score+and+Long-term+Risk+of+Death,+Myocardial+Infarction+and+Stroke:+The+Walter+Reed+Cohort+Study.">Coronary Artery Calcium Score and Long-term Risk of Death, Myocardial Infarction and Stroke: The Walter Reed Cohort Study.</a> Journal of the American College of Cardiology: Cardiovascular Imaging. , (2017).</li><li>McCormick, N., Lacaille, D., Bhole, V., Avina-Zubieta, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Validity+of+myocardial+infarction+diagnoses+in+administrative+databases:+a+systematic+review.">Validity of myocardial infarction diagnoses in administrative databases: a systematic review.</a> PLoS ONE. 9 (3), e92286 (2014).</li><li>Huo, J., Yang, M., Tina Shih, Y. -. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sensitivity+of+Claims-Based+Algorithms+to+Ascertain+Smoking+Status+More+Than+Doubled+with+Meaningful+Use.">Sensitivity of Claims-Based Algorithms to Ascertain Smoking Status More Than Doubled with Meaningful Use.</a> Value in Health. , (2017).</li><li>Nayan, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+value+of+complementing+administrative+data+with+abstracted+information+on+smoking+and+obesity:+A+study+in+kidney+cancer.">The value of complementing administrative data with abstracted information on smoking and obesity: A study in kidney cancer.</a> Canadian Urological Association Journal. 11 (6), 167-171 (2017).</li><li>Birman-Deych, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Accuracy+of+ICD-9-CM+codes+for+identifying+cardiovascular+and+stroke+risk+factors.">Accuracy of ICD-9-CM codes for identifying cardiovascular and stroke risk factors.</a> Medical Care. 43 (5), 480-485 (2005).</li><li>Preen, D. B., Holman, C. D., Spilsbury, K., Semmens, J. B., Brameld, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Length+of+comorbidity+lookback+period+affected+regression+model+performance+of+administrative+health+data.">Length of comorbidity lookback period affected regression model performance of administrative health data.</a> Journal of Clinical Epidemiology. 59 (9), 940-946 (2006).</li><li>Rector, T. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Specificity+and+sensitivity+of+claims-based+algorithms+for+identifying+members+of+Medicare+Choice+health+plans+that+have+chronic+medical+conditions.">Specificity and sensitivity of claims-based algorithms for identifying members of Medicare+Choice health plans that have chronic medical conditions.</a> Health Services Research. 39 (6 Pt 1), 1839-1857 (2004).</li><li>Hern&#225;n, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Observational+studies+analyzed+like+randomized+experiments:+an+application+to+postmenopausal+hormone+therapy+and+coronary+heart+disease.">Observational studies analyzed like randomized experiments: an application to postmenopausal hormone therapy and coronary heart disease.</a> Epidemiology (Cambridge, Mass.). 19 (6), 766-779 (2008).</li><li>Austin, P. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+relative+ability+of+different+propensity+score+methods+to+balance+measured+covariates+between+treated+and+untreated+subjects+in+observational+studies.">The relative ability of different propensity score methods to balance measured covariates between treated and untreated subjects in observational studies.</a> Medical Decision Making. 29 (6), 661-677 (2009).</li><li>Robins, J. M., Hernan, M. A., Brumback, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Marginal+structural+models+and+causal+inference+in+epidemiology.">Marginal structural models and causal inference in epidemiology.</a> Epidemiology. 11 (5), 550-560 (2000).</li><li>Robins, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Marginal+structural+models.">Marginal structural models.</a> 1997 Proceedings of the American Statistical Association, section on Bayesian statistical science. , 1-10 (1998).</li><li>Thoemmes, F., Ong, A. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Primer+on+Inverse+Probability+of+Treatment+Weighting+and+Marginal+Structural+Models.">A Primer on Inverse Probability of Treatment Weighting and Marginal Structural Models.</a> Emerging Adulthood. 4 (1), 40-59 (2016).</li><li>Xu, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Use+of+stabilized+inverse+propensity+scores+as+weights+to+directly+estimate+relative+risk+and+its+confidence+intervals.">Use of stabilized inverse propensity scores as weights to directly estimate relative risk and its confidence intervals.</a> Value in Health: the Journal of the International Society for Pharmacoeconomics and Outcomes Research. 13 (2), 273-277 (2010).</li><li>Cowper, D. C., Kubal, J. D., Maynard, C., Hynes, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+primer+and+comparative+review+of+major+US+mortality+databases.">A primer and comparative review of major US mortality databases.</a> Annals of Epidemiology. 12 (7), 462-468 (2002).</li><li>Skopp, N. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+a+methodology+to+validate+National+Death+Index+retrieval+results+among+a+cohort+of+U.S.+service+members.">Evaluation of a methodology to validate National Death Index retrieval results among a cohort of U.S. service members.</a> Annals of epidemiology. 27 (6), 397-400 (2017).</li><li>Buck, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> 2015 ICD-9-CM for Hospitals, Volumes 1, 2, &#38; 3, Professional Edition. , (2015).</li><li>Buck, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> 2018 ICD-10-CM for Hospitals, Professional Edition. , (2018).</li><li>Guo, S., Fraser, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Propensity Score Analysis: Statistical Methods and Applications, Second Edition. , (2015).</li><li>Elixhauser, A., Steiner, C., Harris, D. R., Coffey, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comorbidity+measures+for+use+with+administrative+data.">Comorbidity measures for use with administrative data.</a> Medical Care. 36 (1), 8-27 (1998).</li><li>Charlson, M. E., Pompei, P., Ales, K. L., MacKenzie, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+method+of+classifying+prognostic+comorbidity+in+longitudinal+studies:+development+and+validation.">A new method of classifying prognostic comorbidity in longitudinal studies: development and validation.</a> Journal of Chronic Diseases. 40 (5), 373-383 (1987).</li><li>Deyo, R. A., Cherkin, D. C., Ciol, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Adapting+a+clinical+comorbidity+index+for+use+with+ICD-9-CM+administrative+databases.">Adapting a clinical comorbidity index for use with ICD-9-CM administrative databases.</a> Journal of Clinical Epidemiology. 45 (6), 613-619 (1992).</li><li>Austin, P. C., Stuart, E. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+performance+of+inverse+probability+of+treatment+weighting+and+full+matching+on+the+propensity+score+in+the+presence+of+model+misspecification+when+estimating+the+effect+of+treatment+on+survival+outcomes.">The performance of inverse probability of treatment weighting and full matching on the propensity score in the presence of model misspecification when estimating the effect of treatment on survival outcomes.</a> Statistical Methods in Medical Research. 26 (4), 1654-1670 (2017).</li><li>Austin, P. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Balance+diagnostics+for+comparing+the+distribution+of+baseline+covariates+between+treatment+groups+in+propensity-score+matched+samples.">Balance diagnostics for comparing the distribution of baseline covariates between treatment groups in propensity-score matched samples.</a> Statistics in Medicine. 28 (25), 3083-3107 (2009).</li></ol>

ניתוח רטרוספקטיבי באמצעות ערכות נתונים ניהוליות גדולות מספקות חלופה יעילה וחסכונית כאשר מבחנים מבוקרים אקראיים אינם אפשריים. ערכת הנתונים המתאימה יהיה תלוי באוכלוסיה ובמשתנים של עניין, אבל MDR היא אופציה אטרקטיבית כי אין לו את ההגבלות הגיל שראו עם נתוני הביטוח הרפואי. עם כל ערכת נתונים, ח?...

אקראי, פלסבו מבחנים מחקרים הם עיצוב המחקר החזק ביותר כדי לכמת את היעילות של הטיפול, אבל הם לא תמיד ריאלי בשל דרישות עלות וזמן או חוסר שיווי בין קבוצות הטיפול1. במקרים אלה, עיצוב רטרוספקטיבי באמצעות נתונים ניהוליים בקנה מידה גדול ("נתונים גדולים") מספק בדרך כלל חלופה יעילה וחסכונית, אם כי היעדר אקראיות מציג בחירת הטיפול הטיה2. הטיית בחירת הטיפול מתרחשת במחקרים שאינם אקראיים כאשר החלטת הטיפול תלויה בתכונות טרום טיפול המשויכות לתוצאת הריבית. מאפיינים אלה ידועים כגורמים מייסדים.
מכיוון שתוצאות הנטייה למזער את ההטיה על ידי איזון המייסדים הידועים בין קבוצות הטיפול, הם הפכו להיות פופולריים יותר ויותר3. עשרות נטיה שימשו כדי להשוות גישות כירורגית4 ו משטרי רפואי5. לאחרונה, השתמשנו בניתוח נטיה של נתונים ממאגר הנתונים של מערכת הבריאות הצבאית של ארצות הברית (MDR) כדי להעריך את ההשפעה של סטטינים במניעה ראשונית של תוצאות לב וכלי דם מבוסס על הנוכחות והחומרה של סידן עורק כלילי6.
Mdr, מנוצל בתדירות נמוכה יותר מאשר מערכת הנתונים רפואי ו-VA למטרות מחקר, מכיל מידע מקיף מנהלי ורפואי תביעות מן השירותים אשפוז ומחוץ לשירות פעיל בצבא, גמלאים, ואחרים משרד ההגנה (משרד ההגנה) ממוטבים בריאות וניזונים שלהם. מסד הנתונים כולל שירותים הניתנים ברחבי העולם במתקני הטיפול הצבאי בארה ב או במתקנים אזרחיים היחויבו בידי משרד ההגנה. מסד הנתונים כולל נתוני מרקחת מלאים מאז 1 באוקטובר, 2001. נתוני מעבדה זמינים מ 2009 אבל הוא מוגבל רק למתקני טיפול צבאי. בתוך MDR, גדודים הוגדרו עם שיטות כולל שימוש בקודים האבחון (למשל, סוכרת בשעה7) או קודי ההליך (למשל, ניתוח ארתרוסקופי8). לחילופין, ניתן להתאים את הקבוצה המוגדרת מבחוץ של מוטבים זכאים, כגון רישום, כדי לקבל נתונים של תוכנית בסיסית ומעקב9. שלא כמו רפואי, MDR כולל חולים בכל הגילאים. זה גם פחות מוטה כלפי זכרים מאשר מסד הנתונים VA מאז הוא כולל ניזונים. לעומת זאת, הגישה ל-MDR מוגבלת. באופן כללי, רק חוקרים החברים במערכת הבריאות הצבאית יכולים לבקש גישה, מקבילה לדרישות השימוש במסד הנתונים של VA. חוקרים שאינם ממשלתיים המבקשים גישה לנתוני מערכות בריאות צבאיות חייבים לעשות זאת באמצעות הסכם שיתוף נתונים תחת פיקוחם של נותן החסות הממשלתי.
בעת שימוש בערכת נתונים ניהולית, חשוב לזכור את המגבלות והעוצמות של קידוד ניהולי. הרגישות והספציפיות של הקוד יכולות להשתנות בהתאם לאבחנה הקשורה, בין אם מדובר באבחנה ראשית או משנית, או בין אם מדובר בקובץ בלתי מטופל או באשפוז. קודים inpatient עבור אוטם שריר הלב חריפה מדווחים בדרך כלל עם ערכים ניבוי חיובי על 90%10, אבל השימוש בטבק הוא לעתים קרובות מקודד11. לקידוד מסוג זה יכול להיות או לא השפעה משמעותית על תוצאות המחקר12. בנוסף, מספר קודים עבור תנאי נתון עשויים להתקיים עם רמות משתנות של קורלציה למחלה בשאלה13. צוות חקירה צריך לבצע חיפוש ספרות מקיפה וסקירה של הסיווג הבינלאומי של המחלה, המהדורה התשיעית, השינוי הקליני (ICD-9 ס מ) ו/או ICD-10-ס מ מדריכים קידוד כדי להבטיח את הקודים המתאימים נכללים במחקר.
מספר שיטות יכולות להיות מועסקים כדי לשפר את הרגישות והדיוק של קודי האבחון להגדיר תנאי הימור. יש לכלול תקופת "מבט אחורי" מתאימה כדי ליצור מטיות בסיסיות. תקופת המראה האחורית כוללת את שירותי האשפוז והחוץ הניתנים לפני הכניסה ללימודים. תקופה של שנה אחת עשויה להיות מיטבית14. בנוסף, הדרישה לשתי תביעות נפרדות במקום תביעה אחת יכולה להגביר את הפרטים, תוך הגדלת נתוני הקידוד עם הנתונים הפרמצבטיים יכולים לשפר את הרגישות15. בחר ביקורות של תרשימים ידניים בחלק מהנתונים ניתן להשתמש כדי לוודא דיוק של אסטרטגיית הקידוד.
לאחר שהיו מוגדרים ומוערך עבור הקבוצה המדובר, ציון הנטייה יכול לשמש כדי לאזן את ההבדלים בין קבוצות הטיפול. תוצאת הנטייה נגזרת מההסתברות שהחולה מוקצה לטיפול המבוסס על הקושתנים הידועים. חשבונאות עבור טיפול זה הנטייה מפחית את האפקט כי covariates יש על הקצאת טיפול ומסייע ליצור אומדן אמיתי של אפקט הטיפול על התוצאה. בעוד ציונים הנטייה לא בהכרח לספק תוצאות מעולה מודלים סטטיסטי, הם מאפשרים הערכה של אם קבוצות מטופלים מטופל הם דומים לאחר החלת הציון הנטייה3. חוקרי המחקר יכולים לנתח את ההבדלים הסטנדרטיים המוחלט של covariates לפני ואחרי ההתאמה התאמה או ההסתברות ההופכית לטיפול במשקל (IPTW) כדי להבטיח מייסדים ידועים כבר מאוזנת בין קבוצות. וחשוב מכך, לא ניתן לאזן בין מייסדים לא ידועים, והאדם צריך להיות מודע לפוטנציאל של הסכמה שיורית.
כאשר מבוצע כראוי, אף, ציונים הנטייה הם כלי רב עוצמה שיכול לנבא ולשכפל את התוצאות של מבחנים אקראיים מבוקרים16. של שיטות הנטייה הזמינות, התאמה ו-IPTW מועדפות בדרך כלל17. בתוך IPTW, חולים משוקלל על ידי הנטייה שלהם או הסתברות לטיפול. ייצוב משקולות מומלץ בדרך כלל על פני משקולות גלם, בעוד קיצוץ של המשקולות יכול להיחשב גם18,19,20,21.
ברגע שקבוצות הלימוד מאוזנות, ייתכן שיעקבו אחריהן עד לתוצאת העניין. מחקרים העושים שימוש בנתונים ניהוליים עשויים להיות מעוניינים בתוצאות כגון שיעורי readmission וניתוחי זמן-לאירוע. במחקרים המתעניינים בתמותה, מאגר הנתונים של מערכת הבריאות הצבאית כולל שדה מעמד חיוני שניתן להרחיב באמצעות מדד המוות הלאומי (ndi)22,23. ה-NDI הוא מסד נתונים מרוכז של רישומי מוות ממשרדי המדינה המנוהל על ידי המרכז לבקרת מחלות. החוקרים יכולים לבקש מעמד חיוני בסיסי ו/או סיבת מוות ספציפית המבוססת על תעודת הפטירה.
הפרוטוקול הבא מפרט את תהליך ניהול מחקר מסד נתונים ניהולי באמצעות MDR מוגבר עם מידע התמותה מ-NDI. היא מפרטת את השימוש ב-IPTW לאיזון הבדלים בסיסיים בין שתי קבוצות טיפול כולל קוד SAS ופלט לדוגמה.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>CD Burner (for NDI Request)</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Computer</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Putty.exe</td>
			<td>Putty.org</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SAS 9.4</td>
			<td>SAS Institute Cary, NC</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>WinSCP or other FTP software</td>
			<td><a href="https://winscp.net/eng/index.php" target="_blank">https://winscp.net/eng/index.php</a></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

inverse probability of treatment weighting (propensity score) using the military health system data repository and national death index

כאשר מבחנים אקראיים מבוקרים אינם ריאלי, לימודים רטרוספקטיבי באמצעות נתונים גדולים לספק חלופה יעילה וחסכונית, למרות שהם נמצאים בסיכון להטיה בחירת הטיפול. הטיית בחירת הטיפול מתרחשת במחקר לא אקראי כאשר בחירת הטיפול מבוססת על מאפייני טרום טיפול המשויכים גם עם התוצאה. מאפיינים אלה של טרום טיפול, או מייסדים, יכולים להשפיע על הערכה של השפעת הטיפול על התוצאה. ציוני הנטייה למזער הטיה זו על ידי איזון המקימים הידועים בין קבוצות הטיפול. ישנן מספר גישות לביצוע ניתוחי ניקוד הנטייה, כולל הניקוד הנטייה, התאמת נטייה, ההסתברות ההופכית של הטיפול מקלול (IPTW). מתוארים כאן הוא השימוש IPTW לאזן התחלואה הבסיסית בתוך קבוצה של חולים במסגרת מאגר הנתונים של מערכת הבריאות הצבאית של ארה ב (MDR). Mdr הוא מקור נתונים אופטימלי יחסית, כפי שהוא מספק את הקבוצה המלאה שבה מידע כמעט מלא על אשפוז ושירותים החוץ זמין עבור המוטבים זכאים. המתואר להלן הוא השימוש MDR בתוספת עם מידע ממדד המוות הלאומי לספק נתונים חזקים התמותה. בנוסף, מסופקים הצעות לשימוש בנתונים ניהוליים. לבסוף, הפרוטוקול משתף קוד SAS לשימוש ב-IPTW כדי לאזן מייסדים ידועים ולהתוות את פונקציית השכיחות המצטברת עבור תוצאת הריבית.

עם השלמת IPTW, שולחנות או מגרשים של הבדלים סטנדרטיים מוחלטים ניתן ליצור באמצעות קוד המאקרו stddiff או קוד המאקרו asdplot, בהתאמה. איור 1 מציג דוגמה של איזון מתאים בקבוצה גדולה של 10,000 משתתפים באמצעות מאקרו asdplot. לאחר היישום של הציון הנטייה, ההבדלים מתוקננת מוחלטים הו...

Watch this Scientific Journal Video about Inverse Probability of Treatment Weighting Propensity Score using the Military Health System Data Repository and National Death Index at JoVE.com

Inverse Probability of Treatment Weighting Propensity Score using the Military Health System Data Repository and National Death Index

כאשר מבחנים אקראיים מבוקרת אינם ריאלי, טיפול רפואי מקיף מקור נתונים כמו מאגר הנתונים של מערכת הבריאות הצבאית מספק חלופה אטרקטיבית עבור ניתוחים רטרוספקטיבי. שילוב נתוני התמותה ממדד המוות הלאומי ואיזון הבדלים בין קבוצות באמצעות שקלול הנטייה מסייעת להפחית את הביסים הטבועים בעיצובים רטרוספקטיבי.

ההסתברות ההופכית לטיפול שקלול (ציון נטייה) באמצעות מאגר הנתונים של מערכת הבריאות הצבאית ואת מדד המוות הלאומי

When randomized controlled trials are not feasible, retrospective studies using big data provide an efficient and cost-effective alternative, though they ...

בעבר, השתמשנו במאגר המידע הצבאי של שירותי הבריאות כדי לקבוע אילו חולים ירוויחו הכי הרבה מטיפול בסטטינים כדי לעזור להפחית את סיכוייהם להתקף לב בעתיד. הפרוטוקול שלנו מציע מפת דרכים לכל ספק רפואי שמעוניין להשתמש בנתונים גדולים כדי לענות על שאלות קליניות משלו ונוהג להיות מיושם על מספר רחב היקף וכמעט בלתי מוגבל של נושאים. לאחר קבלת אישור מוועדת הבדיקה המוסדית, השלם בקשה להסכם שיתוף נתונים, ודאג לציין את שדות הנתונים והקבצים המבוקשים בגליון העבודה של עקירות DRT MDR.ציין אם הצוות מבקש מנתח נתונים, לספק את הנתונים הגולמיים או אם הצוות ייגש ישירות ל- MDR והאם הבקשה היא למשיכה חד-פעמיים של נתונים או אם משיכות רגילות מתבקשות מדי יום, מדי חודש או מדי שנה. כדי לגשת ישירות ל- MDR, מלא את בקשת ההרשאה של MDR בטפסי MDR-CS-2875. בעת גישה ישירה ל- MDR, בצע את ההוראות לגישה ל- MDR ולשימוש בו, כולל דרישות התוכנה ותוכניות SAS לדוגמה הזמינות במדריך למשתמשי MDR ובמדריך הפונקציונלי של MDR.כדי להשיג נתוני מוטב MDR נוספים עבור קבוצת המחשבים שלך, רכוש את קבצי ה- VM6 מהשרת והתמזג עם קובץ הקוהורטה שלך. השתמש בשמות משתנים שונים בקבצי ציור וקוהורטה של נתוני VM6 עבור שמות מטופלים ותאריכי לידה כדי לסייע בבדיקה הבאה של שגיאות לאחר המיזוג. כמו ערכי מסד נתונים הם אף פעם לא לגמרי ללא שגיאה, להשתמש בקוד כדי ליצור מראש בדיקות שגיאות לאחר כל שלב מרכזי, בנוסף לבדיקת יומן התוכנית פלט עבור כל חששות פוטנציאליים.בעת השוואת שמות מקובץ הקוהורטה לקובץ VM6, התאם רק את שלוש האותיות הראשונות כדי לשפר את היעילות ולהפחית שגיאות שווא שעלולות להתעורר עם הבדלים באיות או בריווח בין קבצים. לאחר מכן סקור את קובץ נתוני השגיאה, ביצוע סקירה ידנית של רשומת הבריאות לפי הצורך, כדי לבדוק אם קיימות שגיאות אחרות של דאגה. עבור חילוץ נתונים רלוונטיים, השג את נתוני הגזע והמין מקבצי המוטבים של VM6, מזג תאריך זה עם קובץ הקוהורטה ובדוק אם קיימות שגיאות כפי שהוכח זה בלבד.השג נתוני מוות מקובץ האב למוות, מזג את הנתונים עם קובץ הקוהורטה ובדוק אם קיימות שגיאות. לאחר מכן השג קבצי נתונים נוספים לפי הצורך עבור הניתוח. עבור מיזוג נתונים ובניית קבצים מסכמים, חלץ את התחלואה הבסיסית באמצעות קודי ICD-9-CM או ICD-10-CM מהתקופה שלפני תאריך האינדקס.טיפול גם בזכאותם של המטופלים למערכת הבריאות הצבאית בתקופת הבסיס כפי שאומת בתיק המוטב של VM6. חפש בקודי האבחון הבסיסיים בקבצי האשפוז ו/או האשפוז כדי לקבוע את התחלואה הבסיסית במהלך תקופת 12 החודשים הבסיסית לפני תאריך האינדקס. אם אתה משתמש בתחלואה של Elixhauser, השתמש בתוכנה הזמינה ממסד הנתונים של עלות שירותי הבריאות וניצול פרוייקט, הקפד לשנות את שמות משתני האבחון והקבצים לפי הצורך.כדי לקבוע תאריך סיום מחקר עבור כל המטופלים כניתוך למעקב עבור חולים שאין להם הוכח את התוצאה של עניין, לחפש את קובץ המוטב VM6 כדי להבטיח את הזכאות לשירותי בריאות עד תאריך סיום המחקר. אם חשוב להגביל את המחקר למשתמשים פעילים במערכת הבריאות, ללא תלות בזכאות, ואז לקבוע את הקשר הרפואי האחרון בתוך קבצי הנתונים ולצונזר את המטופלים באותו תאריך. כאשר כל המידע הדרוש נרכש, צור מזהה מטופל אקראי עבור כל מטופל באמצעות Ranuni.כדי לדגמן את ההסתברות לטיפול השתמש בהתקדמות לוגיסטית כדי לחשב את המשקולות מההסתברות החזויה. לאחר מכן לייצב את ציון הנטייה על ידי חלוקת הציון לפי המשקל הממוצע. כדי לאמת את האיזון לאחר החלת ההסתברות ההופכית של טיפול בשקלול מאקרו ההידול הסטנדרטי מפשט את ההבדלים הממוצעים המחשוביים הסטנדרטיים עבור הבדלים חיים לפני ואחרי שקלול ב- SAS.כדי ליצור התוויית פונקציית שכיחות מצטברת ב- PROC PHREG, הפנו לקובץ קובריאט כדי לציין ערכי קובריאט לשימוש בעת יצירת ההתוויה בתחביר PROC PHREG, השתמשו בהצהרת המשקל כדי לציין את משתנה ציון הנטייה הסטנדרטי והשתמשו בהצהרה הבסיסית כדי לציין את הערכים עבור קובריאטים בסיסיים כדי להתוות את פונקציית השכיחות המצטברת. לאחר מכן ציין את השכבות לשימוש עבור ההתוויה באמצעות ROWID. כאן, דוגמה לאיזון מתאים בקבוצה גדולה של 10000 משתתפים באמצעות מאקרו התוויית ההפרש הסטנדרטי המוחלט כפי שמוצג.לאחר יישום ציון הנטייה, ההבדלים הסטנדרטיים המוחלטים צומצמו באופן משמעותי. כאן, ניתן לראות את התוצאות הלא מוצלחות של ניסיון לאזן קובריאטים בקבוצה של 100 משתתפים. בדוגמה זו, PROC PHREG עם משקלים סטנדרטיים של ציון נטייה שימשו ליצירת עלילה פונקציית שכיחות מצטברת, וחשפו כי בניתוח זה, קבוצת הביקורת הלא מטופלת הדגימה מספר גדול יותר של אירועים והפגינו הישרדות גרועה יחסית מאשר הקבוצה המטופלת.משרד ההגנה כולל מוטבים של משרד ההגנה, לרבות גמלאים ובני משפחה. אז זה לא מוגבל רק לחולים מעל גיל 65, וזה לא מוגבל רק ליוצאי צבא. פרוטוקול זה מספק נקודת התחלה לשימוש ב- MDR.וסקירת הטכניקה הסטטיסטית יכולה לעזור לחסל הטיות שיכולות להיות מהותיות בסוג זה של מחקר.

Research

JoVE Journal

Medicine

Inverse Probability of Treatment Weighting (Propensity Score) using the Military Health System Data Repository and National Death Index

Use of Animal Model of Sepsis to Evaluate Novel Herbal Therapies

שימוש במודל של בעלי חיים אלח דם להערכת טיפולים צמחים רומן

Sepsis refers to a systemic inflammatory response syndrome resulting from a microbial infection. It has been routinely simulated in animals by several ...

Intraoperative Detection of Subtle Endometriosis: A Novel Paradigm for Detection and Treatment of Pelvic Pain Associated with the Loss of Peritoneal Integrity

איתור intraoperative של אנדומטריוזיס העדין: פרדיגמה חדשה לאיתור וטיפול בכאב באגן הקשורים לפגיעה בשלמות פריטונאלית

Endometriosis is a  common disease affecting 40 to 70% of reproductive-aged women with chronic  pelvic pain (CPP) and/or infertility. The purpose of this ...

Probe-based Confocal Laser Endomicroscopy of the Urinary Tract: The Technique

Endomicroscopy בדיקה מבוסס Confocal ליזר בדרכי השתן: הטכניקה

Probe-based  confocal laser endomicroscopy (CLE) is an emerging optical imaging technology  that enables real-time in vivo microscopy of mucosal surfaces ...

Identification of Disease-related Spatial Covariance Patterns using Neuroimaging Data

זיהוי של דפוסי שונות משותפת מרחביים הקשורות למחלה באמצעות נתונים הדמייה

The scaled subprofile model (SSM)1-4 is a multivariate PCA-based algorithm that identifies major sources of variation in patient and control group brain ...

Noninvasive Intratracheal Intubation to Study the Pathology and Physiology of Mouse Lung

פולשנית Intratracheal אינטובציה ללמוד פתולוגיה והפיזיולוגיה של עכבר ריאות

The use of a model that mimics the condition of lung diseases in humans is critical for studying the pathophysiology and/or etiology of a particular ...

Human Vastus Lateralis Skeletal Muscle Biopsy Using the Weil-Blakesley Conchotome

Human Vastus Lateralis Skeletal Muscle Biopsy Using the Weil-Blakesley Conchotome

בן אנוש<em&gt; Vastus lateralis</em&gt; ביופסיה בשרירי השלד שימוש וייל-בלייסלי Conchotome

Percutaneous muscle biopsy using the Weil-Blakesley conchotome is well established in both clinical and research practice. It is a safe, effective and ...

A Method of Trigonometric Modelling of Seasonal Variation Demonstrated with Multiple Sclerosis Relapse Data

שיטה של ​​טריגונומטריות מידול של וריאציה עונתית הפגין עם טרשת נפוצה Relapse נתונים

This report describes a novel Stata-based application of trigonometric regression modelling to  55 years of multiple sclerosis relapse data from 46 ...

Network Analysis of Foramen Ovale Electrode Recordings in Drug-resistant Temporal Lobe Epilepsy Patients

ניתוח רשת של הקלטות אלקטרודה foramen ovale בחולים עמידים בפני תרופות Temporal Lobe אפילפסיה

Approximately 30% of epilepsy patients are refractory to antiepileptic drugs. In these cases, surgery is the only alternative to eliminate/control ...

Drug Repurposing Hypothesis Generation Using the "RE:fine Drugs" System

דור שערה ותרופות repurposing שימוש &quot;RE: סמים בסדר&quot; מערכת

The promise of drug repurposing is that existing drugs may be used for new disease indications in order to curb the high costs and time for approval. The ...

Using Retinal Imaging to Study Dementia

באמצעות הדמיה ברשתית ללמוד דמנציה

The retina offers a unique &#8220;window&#8221; to study pathophysiological processes of dementia in the brain, as it is an extension of the central ...