Name: meta-analysis of voxel-based neuroimaging studies using seed-based d mapping with permutation of subject images (sdm-psi)
Uploaded: 2019-11-27T12:30:00
Duration: 6 min 26 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Meta-analysis of Voxel-Based Neuroimaging Studies using Seed-based d Mapping with Permutation of Subject Images SDM-PSI at JoVE.com

وكان هذا العمل مدعوما بعقد البحوث ميغيل سيرفيت MS14/00041 ومشروع البحوث PI14/00292 من الخطة الوطنية للتنمية والتنمية ، والصندوق الإنمائي الإقليمي الأوروبي (FEDER) ، والعقد السابق للدكتوراه FI16/00311. ولم يكن لدي الممولين اي دور في تصميم الدراسة واجراءها ؛ جمع البيانات وأدارتها وتحليلها وتفسيرها ؛ اعداد المخطوطة أو مراجعتها أو الموافقة عليها ؛ وقرار تقديم المخطوطة للنشر.

<ol>
	<li>Turkeltaub, P. E., Eden, G. F., Jones, K. M., Zeffiro, T. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Meta-analysis+of+the+functional+neuroanatomy+of+single-word+reading:+method+and+validation.">Meta-analysis of the functional neuroanatomy of single-word reading: method and validation.</a> Neuroimage. 16 (3 Pt 1), 765-780 (2002).</li><li>Laird, A. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ALE+meta-analysis:+controlling+the+false+discovery+rate+and+performing+statistical+contrasts.">ALE meta-analysis: controlling the false discovery rate and performing statistical contrasts.</a> Human Brain Mapping. 25 (1), 155-164 (2005).</li><li>Wager, T. D., Lindquist, M., Kaplan, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Meta-analysis+of+functional+neuroimaging+data:+current+and+future+directions.">Meta-analysis of functional neuroimaging data: current and future directions.</a> Social Cognitive and Affective Neuroscience. 2 (2), 150-158 (2007).</li><li>Radua, J., Mataix-Cols, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Voxel-wise+meta-analysis+of+grey+matter+changes+in+obsessive-compulsive+disorder.">Voxel-wise meta-analysis of grey matter changes in obsessive-compulsive disorder.</a> British Journal of Psychiatry. 195 (5), 393-402 (2009).</li><li>Eickhoff, S. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Coordinate-based+activation+likelihood+estimation+meta-analysis+of+neuroimaging+data:+a+random-effects+approach+based+on+empirical+estimates+of+spatial+uncertainty.">Coordinate-based activation likelihood estimation meta-analysis of neuroimaging data: a random-effects approach based on empirical estimates of spatial uncertainty.</a> Human Brain Mapping. 30 (9), 2907-2926 (2009).</li><li>Eickhoff, S. B., Bzdok, D., Laird, A. R., Kurth, F., Fox, P. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Activation+likelihood+estimation+meta-analysis+revisited.">Activation likelihood estimation meta-analysis revisited.</a> Neuroimage. 59 (3), 2349-2361 (2012).</li><li>Albajes-Eizagirre, A., Radua, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=What+do+results+from+coordinate-based+meta-analyses+tell+us?.">What do results from coordinate-based meta-analyses tell us?.</a> Neuroimage. 176, 550-553 (2018).</li><li>Albajes-Eizagirre, A., Solanes, A., Vieta, E., Radua, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Voxel-based+meta-analysis+via+permutation+of+subject+images+(PSI):+Theory+and+implementation+for+SDM.">Voxel-based meta-analysis via permutation of subject images (PSI): Theory and implementation for SDM.</a> Neuroimage. 186, 174-184 (2018).</li><li>Bossier, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Influence+of+Study-Level+Inference+Models+and+Study+Set+Size+on+Coordinate-Based+fMRI+Meta-Analyses.">The Influence of Study-Level Inference Models and Study Set Size on Coordinate-Based fMRI Meta-Analyses.</a> Frontiers in Neuroscience. 11, 745 (2017).</li><li>Radua, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+meta-analytic+method+for+neuroimaging+studies+that+combines+reported+peak+coordinates+and+statistical+parametric+maps.">A new meta-analytic method for neuroimaging studies that combines reported peak coordinates and statistical parametric maps.</a> European Psychiatry. 27 (8), 605-611 (2012).</li><li>Winkler, A. M., Ridgway, G. R., Webster, M. A., Smith, S. M., Nichols, T. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Permutation+inference+for+the+general+linear+model.">Permutation inference for the general linear model.</a> Neuroimage. 92, 381-397 (2014).</li><li>Smith, S. M., Nichols, T. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Threshold-free+cluster+enhancement:+addressing+problems+of+smoothing,+threshold+dependence+and+localisation+in+cluster+inference.">Threshold-free cluster enhancement: addressing problems of smoothing, threshold dependence and localisation in cluster inference.</a> Neuroimage. 44 (1), 83-98 (2009).</li><li>Radua, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Anisotropic+kernels+for+coordinate-based+meta-analyses+of+neuroimaging+studies.">Anisotropic kernels for coordinate-based meta-analyses of neuroimaging studies.</a> Frontiers in Psychiatry. 5, 13 (2014).</li><li>Albajes-Eizagirre, A., Solanes, A., Radua, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Meta-analysis+of+non-statistically+significant+unreported+effects.">Meta-analysis of non-statistically significant unreported effects.</a> Statistical Methods in Medical Research. 962280218811349, (2018).</li><li>Durnez, J., Moerkerke, B., Nichols, T. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Post-hoc+power+estimation+for+topological+inference+in+fMRI.">Post-hoc power estimation for topological inference in fMRI.</a> Neuroimage. 84, 45-64 (2014).</li><li>Fullana, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fear+extinction+in+the+human+brain:+A+meta-analysis+of+fMRI+studies+in+healthy+participants.">Fear extinction in the human brain: A meta-analysis of fMRI studies in healthy participants.</a> Neuroscience &amp; Biobehavioral Reviews. 88, 16-25 (2018).</li><li>Wise, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Common+and+distinct+patterns+of+grey-matter+volume+alteration+in+major+depression+and+bipolar+disorder:+evidence+from+voxel-based+meta-analysis.">Common and distinct patterns of grey-matter volume alteration in major depression and bipolar disorder: evidence from voxel-based meta-analysis.</a> Molecular Psychiatry. 22 (10), 1455-1463 (2017).</li><li>Radua, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multimodal+voxel-based+meta-analysis+of+white+matter+abnormalities+in+obsessive-compulsive+disorder.">Multimodal voxel-based meta-analysis of white matter abnormalities in obsessive-compulsive disorder.</a> Neuropsychopharmacology. 39 (7), 1547-1557 (2014).</li><li>He, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Meta-analytic+comparison+between+PIB-PET+and+FDG-PET+results+in+Alzheimer's+disease+and+MCI.">Meta-analytic comparison between PIB-PET and FDG-PET results in Alzheimer's disease and MCI.</a> Cell Biochemistry and Biophysics. 71 (1), 17-26 (2015).</li><li>Muller, V. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ten+simple+rules+for+neuroimaging+meta-analysis.">Ten simple rules for neuroimaging meta-analysis.</a> Neuroscience &amp; Biobehavioral Reviews. 84, 151-161 (2018).</li><li>Moher, D., Liberati, A., Tetzlaff, J., Altman, D. G., Group, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preferred+reporting+items+for+systematic+reviews+and+meta-analyses:+the+PRISMA+statement.">Preferred reporting items for systematic reviews and meta-analyses: the PRISMA statement.</a> British Medical Journal. 339, b2535 (2009).</li><li>Radua, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=What+causes+psychosis?+An+umbrella+review+of+risk+and+protective+factors.">What causes psychosis? An umbrella review of risk and protective factors.</a> World Psychiatry. 17, 49-66 (2018).</li></ol>

وليس لدي أصحاب البلاغ ما يكشفون عنه.

كما قدمت في وقت سابق ، معظم الأساليب التحليلية الفوقية المستندة إلى voxel استخدام اختبار لتقارب القمم التي لديها بعض القيود ، ومن ثم اجراء تصنيف ثنائي من الادله التي تستند حصرا علي قيم p.
في هذا البروتوكول ، ونحن بالتفصيل كيفيه اجراء التحليل التلوي القائم علي voxel باستخدام المبادرة ، التي لديها عدد من الميزات الايجابيه بما في ذلك اختبار الانحراف القياسية لتقييم الاهميه الاحصائيه للآثار. الاضافه إلى ذلك ، نعرض كيف يمكن تقدير قوه الادله باستخدام مجموعه من المعايير التي تتجاوز التصنيف الثنائي الذي يعتمد فقط علي مستوي واحد من الاهميه الاحصائيه.
لتسهيل النسخ المتماثل للتحليل التلوي المثال ، نحن نقدم البيانات المستخرجة بالفعل من المخطوطات من التحليل التلوي السابق. ومن المثير للاهتمام ، في مخطوطه هذا التحليل التلوي ، الادله "يبدو" اقوي من الادله التي وجدناها مع الأساليب المحدثة. ولذلك نقترح ان تؤخذ بحذر التقييمات غير المنتظمة للادله التي أجريت في التحليلات الفوقية السابقة المستندة إلى voxel.
نامل انه بعد هذا البروتوكول ، والتحليلات الفوقية التصوير العصبي توفر وصفا اغني وأكثر المحبب من الادله علي نتائج التصوير العصبي.

منذ إدخال التصوير بالرنين المغناطيسي ، نشرت مجتمع التصوير العصبي آلاف من الدراسات لركائز العصبية من الوظائف النفسانية والاضطرابات العصبية العقلية. لتلخيص هذه النتائج ، تم تطوير عده طرق1،2،3،4،5،6. الأصلي voxel القائم علي دراسات التصوير العصبي تقرير إحداثيات قمم الاهميه الاحصائيه (علي سبيل المثال ، في مقارنه بين حجم المادة الرمادية بين المرضي والضوابط) ، وأساليب التحليل التلوي عاده تقييم ما إذا كان هناك تقارب القمم في مناطق معينه من الدماغ.
ومع ذلك ، فقد أظهرنا سابقا ان هذه الاختبارات لتقارب القمم تعتمد علي افتراضات دقيقه قد تؤثر علي أنماط نتائج التحليل التلوي ودلالتها الاحصائيه7. وعلي وجه التحديد ، تفترض هذه الاختبارات ان voxels مستقله وان لديهم نفس احتمال الذروة "false" ، بينما في المسالة الرمادية الحقيقية ، وربط voxels مع جيرانهم واحتمال ان فوكسل لديه ذروه "كاذبه" يعتمد علي تكوين الانسجه. الاضافه إلى ذلك ، فانها تشمل أيضا مفارقات مثل ان الطاقة الاحصائيه يزيد في وجود عدد قليل من الآثار الحقيقية ، ويقلل عندما يكون هناك اثار حقيقية متعددة.
للتغلب علي هذه المشاكل ، قمنا بتطوير طريقه التي تنسب خرائط الدماغ من الآثار الاحصائيه لكل دراسة ومن ثم اجراء التحليل التلوي القياسية الآثار العشوائية لاختبار رسميا ما إذا كانت الآثار تختلف عن الصفر. وتسمي هذه الطريقة "رسم الخرائط d القائم علي البذور مع الطفرة من الصور الموضوع" (القاعدة)8 والسمات الرئيسية لها ما يلي:
<ul><li>(ج) المحاسبة المتعلقة بكل من الزيادات والنقصان في حصيلة الفائدة (مثل التنشيط والتعطيل) بحيث تلغي النتائج المتناقضة كل منها4الأخرى ؛</li>
	<li>استخدام تقديرات حجم التاثير مع نمذجة الآثار العشوائية ، مما يزيد من الموثوقيه والأداء9؛</li>
	<li>التضمين المتزامن المحتمل للصور الاحصائيه ثلاثية الابعاد المتاحة (اي خرائط لقيم الاختبارات التائية)10؛</li>
	<li>اختبارات الطفرة المستندة إلى الموضوع مطابقه للاختبارات FSL "العشوائية" أداه11;</li>
	<li>استخدام إحصاءات تحسين المجموعات الخالية من العتبات12.</li>
</ul>وقد قمنا بالتفصيل والتحقق الكامل من الأساليب التي تم اتباعها في أماكن أخرى4،8،10،13،14.
الاضافه إلى ذلك ، فاننا نقترح عدم الاعتماد علي تصنيف ثنائي لل voxels استنادا إلى مستوي الاهميه الاحصائيه (مهم مقابل لا يستهان به) ولكن ، علي العكس من ذلك ، تقييم قوه الادله باستخدام مجموعه من المعايير22. ويؤدي اختزال الدلالة الاحصائيه الثنائية إلى ضعف السيطرة علي المعدلات السالبة الايجابيه والزائفة15، في حين ان المعايير تستخدم نطاقات من مستويات الدلالة الاحصائيه وتاخذ في الاعتبار كميه البيانات أو التحيزات المحتملة. والبرنامج المذكور يعيد العناصر اللازمة لاجراء هذا التصنيف8 ، التالي يمكن استخدامها لتوفير تصنيف أكثر دقه لقوه الادله.
هنا نعرض كيفيه اجراء تحليل تلوي للدراسات التصويرية العصبية المستندة إلى voxel باستخدام المبادرة. لتجسيد البروتوكول ، ونحن نستخدم البيانات من التحليل التلوي المنشورة من الدراسات التي تستند إلى فوكسيل التحوير التي حققت تشوات المادة الرمادية في المرضي الذين يعانون من اضطراب الوسواس القهري (الوسواس)4. ومع ذلك ، فاننا لن نستخدم الأساليب المستخدمة في هذا التحليل التلوي المبكر ، ولكن الإجراءات الحديثة المذكورة أعلاه. يمكن للقارئ تحميل البرنامج وهذه البيانات من موقعنا علي الإنترنت (<a href="http://www.sdmproject.com/" target="_blank">http://www.sdmproject.com/</a>) لتكرار التحليل.
يمكن لجميع الباحثين الذين يهدفون إلى اجراء تحليل تلوي للدراسات التصويرية العصبية المستندة إلى voxel اتباع هذا البروتوكول. ويمكن استخدام هذه الطريقة مع التصوير بالرنين المغناطيسي وظيفية (fmri ، علي سبيل المثال ، استجابه جريئه إلى التحفيز)16، فوكسيل القائم علي التحوير (vbm ، علي سبيل المثال ، حجم المادة الرمادية)17، التصوير موتر الانتشار (dti ، علي سبيل المثال ، تباين التباين)18، الاشعه المقطعية موقف الانبعاثات (PET ، علي سبيل المثال ، وشغل مستقبلات)19

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Computer</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>32- or 64-bit Windows, 64-bit Mac OSX, or 64-bit Linux</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

meta-analysis of voxel-based neuroimaging studies using seed-based d mapping with permutation of subject images (sdm-psi)

معظم الطرق لاجراء التحليل التلوي للدراسات التصوير العصبي المستندة إلى voxel لا تقييم ما إذا كانت الآثار ليست فارغه ، ولكن ما إذا كان هناك تقارب من قمم الاهميه الاحصائيه ، والحد من تقييم الادله إلى تصنيف ثنائي استنادا حصرا إلى القيم p (اي ان القيمة الاحصائيه لا يمكن ان تكون الا "ذات دلاله احصائيه" أو "غير ذات دلاله احصائيه"). هنا ، ونحن بالتفصيل كيفيه اجراء التحليل التلوي باستخدام القائمة علي البذور d الرسم مع الطفرة من الصور الموضوع (-المبادرة) ، وهو أسلوب جديد يستخدم اختبار الانحراف القياسية لتقييم ما إذا كانت الآثار ليست فارغه. ونعرض أيضا كيفيه تقدير قوه الادله وفقا لمجموعه من المعايير التي تراعي مجموعه من مستويات الاهميه الاحصائيه (من أكثر ليبرالية إلى أكثر تحفظا) ، وكميه البيانات أو الكشف عن التحيزات المحتملة (مثل تاثير الدراسة الصغيرة وزيادة الاهميه). لتجسيد هذا الاجراء ، ونحن بالتفصيل التوصيل من التحليل التلوي للدراسات فوكسيل القائم علي التحوير في اضطراب الوسواس القهري ، ونحن نقدم جميع البيانات المستخرجة بالفعل من المخطوطات للسماح للقارئ لتكرار التحليل التلوي سهوله. ويمكن أيضا ان تستخدم هذه المبادرة للتحليلات الفوقية للتصوير بالرنين المغناطيسي الوظيفي ، والتصوير الإشعاعي للنشر ، والاشعه المقطعية للانبعاثات ، والدراسات السطحية لقياس التحوير.

كما هو مبين في الخريطة فتحت في MRICron عند دراسة التحليل الرئيسي (الشكل 2، الخطوة 7.6) ، كان المرضي الذين يعانون من الوسواس القهري إحصائيا أصغر حجم المادة الرمادية في الظهر الظهرية الاماميه/القشرة الاماميه الإنسي. تفاصيل صفحه الويب المصاحبة ان الكتلة صغيره باعتدال (143 voxels) وتقع أساسا في منطقه برودمان 32 ، وان ذروه الكتلة هو في MNI [2 ، 32 ، 32] ، له قيمه z-4.97 والقيمة المضافة المصححة FWER من 0.01.
في صفحات الويب التي تم الحصول عليها في الخطوات 8.1 و 8.2 ، وانخفاض I2 الاحصائيه (1.5 ٪) يشير إلى عدم تجانس صغير جدا ، مؤامرة القمع لا تظهر التباينات (الشكل 3) ، وكل من اختبار لتاثير الدراسة الصغيرة واختبار لزيادة اهميه سلبيه. ومع ذلك ، فان الادله علي صغر حجم المادة الرمادية في القشرة الاماميه الظهرية ضعيفه باعتدال ، كما هو مبين في الخريطة المفتوحة في MRICron عند تقدير الادله ، وخاصه بسبب كميه محدوده من البيانات.
عندما كان التحليل الرئيسي دراسة باستخدام مستوي الدلالة الاحصائيه اقل صرامة (الخطوة 7.3) ، وأظهرت المرضي أيضا إحصائيا أكبر حجم المادة الرمادية في المخطط والجيروسكوبات الجدارية متفوقة (القيم p غير المصححة = 0.00006 و 0.0002 علي التوالي) ، ولكن الادله علي هذه التشوات ينبغي ان تعتبر أضعف.

<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/59841/59841fig01.jpg"> الشكل 1: النافذة الرئيسية لواجهه المستخدم الرسوميه للحزب الديمقراطي الاشتراكي-PSI اثناء التنفيذ المتوسط. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/59841/59841fig01large.jpg" target="_blank">يرجى النقر هنا لعرض نسخه أكبر من هذا الرقم.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/59841/59841fig02.jpg"> الشكل 2: مناطق حجم المادة الرمادية الصغيرة إحصائيا في المرضي الذين يعانون من اضطراب الوسواس القهري بالمقارنة مع الضوابط الصحية المتطابقة. يغطي المجموعة من دلاله احصائيه 143 [فواكسلس], يتلقى قمته في [ام ني] [2, 32, 32], ويتضمن في الأغلب ظهريه إماميه [كنجوليت]/[سثر] قشره إماميه, [بروكمان] منطقه 32. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/59841/59841fig02large.jpg" target="_blank">يرجى النقر هنا لعرض نسخه أكبر من هذا الرقم.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/59841/59841fig03.jpg"> الشكل 3: مؤامرة القمع لذروه المجموعة من حجم المادة الرمادية الصغيرة إحصائيا في القشرة الاماميه الظهرية. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/59841/59841fig03large.jpg" target="_blank">يرجى النقر هنا لعرض نسخه أكبر من هذا الرقم.</a>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td>حزم البرمجيات</td>
			<td>الترميز في البرمجيات</td>
		</tr>
<tr>
<td>الخرائط الاحصائيه الحدودية (SPM)</td>
			<td>Spm</td>
		</tr>
<tr>
<td>FMRIB مكتبه البرمجيات (FSL)</td>
			<td>fsl</td>
		</tr>
<tr>
<td>باقات أخرى</td>
			<td>الاخري</td>
		</tr>
<tr>
<td></td>
			<td></td>
		</tr>
<tr>
<td>مساحة مجسمه</td>
			<td>الترميز في البرمجيات</td>
		</tr>
<tr>
<td>معهد مونتريال للامراض العصبية (MNI)</td>
			<td>mni</td>
		</tr>
<tr>
<td>الخام تالايراش</td>
			<td>تل</td>
		</tr>
<tr>
<td>تحويل MNI إلى Talairach باستخدام بريت تحويل</td>
			<td>بريت</td>
		</tr>
</tbody></table>الجدول 1: قائمه بمجموعات البرمجيات والمساحات المجسمة التي تفهمها المبادرة.
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td></td>
			<td>يجب ان تكون القيم t موجبه عندما:</td>
			<td>يجب ان تكون قيم t سالبه عندما:</td>
		</tr>
<tr>
<td>عينه واحده من دراسات الرنين المغناطيسي</td>
			<td>المهمة > خط الأساس (التنشيط)</td>
			<td>المهمة < خط الأساس (التعطيل)</td>
		</tr>
<tr>
<td>دراسات بالرنين المغناطيسي بعينهين</td>
			<td>المرضي > الضوابط في المهمة > خط الأساس (فرط التنشيط)</td>
			<td>المرضي < الضوابط في المهمة > خط الأساس (نقص التنشيط)</td>
		</tr>
<tr>
<td></td>
			<td>المرضي < الضوابط في المهمة < خط الأساس (فشل التعطيل)</td>
			<td>المرضي > الضوابط في المهمة < خط الأساس (فرط التعطيل)</td>
		</tr>
<tr>
<td>دراستان لنموذجين VBM/FA</td>
			<td>المرضي > الضوابط (حجم أكبر/FA)</td>
			<td>المرضي < الضوابط (حجم أصغر/FA)</td>
		</tr>
</tbody></table>الجدول 2: علامة علي القيم t من القمم.

Watch this Scientific Journal Video about Meta-analysis of Voxel-Based Neuroimaging Studies using Seed-based d Mapping with Permutation of Subject Images SDM-PSI at JoVE.com

Meta-analysis of Voxel-Based Neuroimaging Studies using Seed-based d Mapping with Permutation of Subject Images SDM-PSI

نحن بالتفصيل كيفيه اجراء تحليل تلوي للدراسات التصوير العصبي المستندة إلى voxel باستخدام البذور القائمة علي رسم الخرائط d مع الطفرة من الصور الموضوع (الصورة).

التحليل التلوي لدراسات التصوير العصبي المستندة إلى Voxel باستخدام رسم الخرائط d القائم علي البذور مع الطفرة في الصور الموضوعة (المبادرة)

Most methods for conducting meta-analysis of voxel-based neuroimaging studies do not assess whether effects are not null, but whether there is a ...

رسم الخرائط d القائم على البذور هو طريقة لوضع دراسات التصوير العصبي التحليل الفوقي التي قد تبدو متناقضة. على سبيل المثال، نتائج دراسات تشوهات المادة الرمادية في الوسواس القهري. وقد قامت الطرق التحليلية السابقة عادة بتقييم ما إذا كانت الدراسات تدعم المزيد من القمم الإحصائية في سبب أو في آخر، في حين أن SDM-PSI تقيّم ما إذا كان هناك تأثير في سبب معين.وقد استخدم الباحثون في الغالب SDM للتحقيق في الركائز العصبية من الوظائف النفسية والاضطرابات العصبية والنفسية، والتي قد تشمل fMRI، VBM، DTI، PET أو دراسات SBM. استخدام SDM-PSI حتى الآن هو واضح جدا. ومع ذلك، فإن أهم الخطوات لإجراء تحليل تلوي صحيح هي تصميم خطة دقيقة للتحليل التلوي وجمع البيانات بعناية.لإجراء بحث شامل، افتح قاعدة البيانات ذات الاهتمام وأدخل كلمات رئيسية مختلفة تسمح بالبحث عن أي دراسة قد تستوفي معايير الإدراج. ثم قم بتسجيل عدد الدراسات التي تم استردادها وعدد الدراسات المستثناة لكل سبب. خذ بعين الاعتبار إنشاء مخطط تدفق PRISMA مع هذه الأرقام.بعد قراءة المخطوطات ذات الأهمية للعثور على البيانات المحددة التي يجب استخراجها، لتحويل قيم Z وقيم P إلى قيم T، انقر فوق تحويل القمم في برنامج SDM-PSI. ثم استخدام إيجابية T-القيم لذرا من زيادة وسلبية قيم T للقمر من انخفاض، وذلك باستخدام الجدول للحصول على إرشادات لكيفية تحديد علامة من القيم T. في دراستين عينة، يمكنك استخدام إيجابية قيم T عندما إشارة التصوير بالرنين المغناطيسي أعلى في المرضى مما كانت عليه في الضوابط.واستخدام السلبية T-القيم عندما إشارة التصوير بالرنين المغناطيسي هو أقل في المرضى مما كانت عليه في الضوابط. لإدخال البيانات في SDM-PSI، افتح واجهة مستخدم الرسوم SDM-PSI واغلق نافذة حول البداية. انقر فوق تغيير التحليل التلوي لتحديد دليل فارغ جديد للتحليل التلوي.انقر فوق محرر جدول SDM لإدخال معلومات عامة من الدراسات وفتح محرر نص لإنشاء ملف نصي لكل دراسة لكتابة الإحداثيات وقيم T للقمر. واسم الملف، برنامج البرمجيات المستخدمة والفضاء stereotactic. لـ المعالجة المسبقة للبيانات، انقر فوق الزر preprocessing، حدد طريقة الدراسات في مربع القائمة المسمى Modality واضغط موافق. ثم انتظر عدة دقائق في حين أن برنامج تغيير الصور موضوع حساب خرائط الحدود السفلى والعليا من أحجام تأثير المحتملة.لإجراء التحليل الرئيسي، انقر فوق الزر "الوسط" واضغط على موافق. بعد أن أجرى SDM-PSI في التسريب المتعدد والتحليل التلوي، انقر فوق Threshold، وحدد قيم P غير المصححة للتحليل الرئيسي وانقر فوق موافق. SDM-PSI تلقائيا فتح MRIcron لتصور النتائج وصفحة على شبكة الإنترنت مع تقرير مفصل عن النتائج. انقر فوق تصحيح الأخطاء من ناحية العائلة لتحديد التحليل الرئيسي في مربع القائمة وانقر فوق موافق. سيقوم برنامج SDM-PSI بإجراء اختبار التباديل على مدار عدة ساعات أو أيام. في نهاية الباقي، انقر فوق عتبة، حدد تصحيح TFCE للتحليل الرئيسي وانقر فوق موافق. سيقوم البرنامج تلقائيا بفتح MRIcron لتصور النتائج وصفحة ويب مع تقرير مفصل عن التحليل.بالنسبة إلى التغايرية، وتحيز النشر والدرجات، انقر فوق استخراج، حدد ذروة من التحليل الرئيسي واضغط موافق. سيقوم البرنامج تلقائيا بفتح صفحة ويب مع إحصاءات هذا P.Record الإحصائية I-التربيعية غير المتجانسة. بعد ذلك انقر فوق زر اختبار التحيز، حدد ذروة من التحليل الرئيسي وانقر فوق موافق. سيقوم البرنامج تلقائيا بفتح صفحة ويب مع مؤامرة قمع ونتائج اختبار لتأثير دراسة صغيرة واختبار للأهمية الزائدة. ثم انقر فوق الزر تقدير الأدلة من مربع الأدوات العلوي.حدد التحليل الرئيسي من مربع القائمة وانقر فوق موافق لعرض النتائج. كما لوحظ في هذه الخرائط التمثيلية ، يكون لدى المرضى الذين يعانون من الوسواس القهري حجم مادة رمادية أصغر بشكل ملحوظ إحصائيًا في القشرة الأمامية الخلفية. الكتلة صغيرة معتدلة و بشكل رئيسي يقع في منطقة برودمان 32 مع ذروة الكتلة في MNI اثنين، 32، 32 مع قيمة Z من 4.97 ومعدل خطأ الأسرة من الحكمة تصحيح قيمة P-0.01.في تحليل البيانات هذا، يشير انخفاض ا-i تربيع الإحصائية إلى عدم تجانس صغير جداً ولا تظهر مؤامرة القمع عدم التناسق. وتتمثل الجوانب الرئيسية للتحليل التلوي الناجح في وضع معايير واضحة للتضمين والاستبعاد، وجمع البيانات بعناية وعدم قصر النتائج على قيم P. يتضمن SDM-PSI النموذج الخطي العام الذي يمكن للمستخدمين إجراء الانحدارات التلوي أو ضغط التعريف لمجموعات الدراسات أو عند مقارنتها بالتحليل.وكان للعديد من التحليلات التلويّة الخاصة بالنظم الخاصة بالنظم الخاصة تأثير كبير على مجالاتها المحددة. على سبيل المثال، كشفت عدة تحليلات تلوية آثار مثيرة للاهتمام من المنشطات على تشوهات الدماغ لوحظ في ADHD.

Research

JoVE Journal

Neuroscience

Meta-analysis of Voxel-Based Neuroimaging Studies using Seed-based d Mapping with Permutation of Subject Images (SDM-PSI)

Functional Mapping with Simultaneous MEG and EEG

تعيين وظيفي مع MEG الفورية وEEG

We use magnetoencephalography (MEG) and electroencephalography (EEG) to locate and determine the temporal evolution in brain areas involved in the ...

Basics of Multivariate Analysis in Neuroimaging Data

أساسيات التحليل متعدد المتغيرات في البيانات تصوير الأعصاب

Multivariate analysis techniques for neuroimaging data have recently received increasing attention as they have many attractive features that cannot be ...

Mapping Inhibitory Neuronal Circuits by Laser Scanning Photostimulation

رسم الدوائر العصبية المثبطة بواسطة المسح الضوئي ليزر ضوئي

Inhibitory neurons are crucial to cortical function. They comprise about 20% of the entire cortical neuronal population and can be further subdivided into ...

Functional Neuroimaging Using Ultrasonic Blood-brain Barrier Disruption and Manganese-enhanced MRI

تصوير الأعصاب وظيفية عن طريق الموجات فوق الصوتية تعطيل حاجز الدم في الدماغ والتصوير بالرنين المغناطيسي المنغنيز معززة لل

Although mice are the dominant model system for studying the genetic and molecular underpinnings of neuroscience, functional neuroimaging in mice remains ...

Characterizing the Composition of Molecular Motors on Moving Axonal Cargo Using "Cargo Mapping" Analysis

تميز التركيب الجزيئي للسيارات على محور عصبي نقل البضائع عن طريق &quot;شحن رسم الخرائط&quot; تحليل

Understanding the mechanisms by which molecular motors coordinate their activities to transport vesicular cargoes within neurons requires the quantitative ...

3-D Imaging and Analysis of Neurons Infected In Vivo with Toxoplasma gondii

3-D Imaging and Analysis of Neurons Infected In Vivo with Toxoplasma gondii

التصوير 3-D وتحليل الخلايا العصبية المصابة<em&gt; في فيفو</em&gt; مع<em&gt; التوكسوبلازما</em

Toxoplasma gondii is an obligate, intracellular parasite with a broad host range, including humans and rodents. In both humans and rodents, Toxoplasma ...

Preparation of Acute Brain Slices Using an Optimized N-Methyl-D-glucamine Protective Recovery Method

Preparation of Acute Brain Slices Using an Optimized N-Methyl-D-glucamine Protective Recovery Method

إعداد شرائح الدماغ الحادة باستخدام محسن N-الميثيل-د-أسلوب استرداد واقية جلوكاميني

This protocol is a practical guide to the N-methyl-D-glucamine (NMDG) protective recovery method of brain slice preparation. Numerous recent studies have ...

The Use of Trace Eyeblink Classical Conditioning to Assess Hippocampal Dysfunction in a Rat Model of Fetal Alcohol Spectrum Disorders

استخدام الاشراط الكلاسيكي اييبلينك تتبع لتقييم هيبوكامبال الخلل في نموذج الفئران من اضطرابات طيف الكحول الجنيني

Neonatal rats were administered a relatively high concentration of ethyl alcohol (11.9% v/v) during postnatal days 4-9, a time when the fetal brain ...

Live Images of GLUT4 Protein Trafficking in Mouse Primary Hypothalamic Neurons Using Deconvolution Microscopy

صور حية من GLUT4 البروتين الاتجار بالماوس الخلايا العصبية طائي الأولية باستخدام الفحص المجهري Deconvolution

Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a global health crisis which is characterized by insulin signaling impairment and chronic inflammation in peripheral ...

Neuroimaging Field Methods Using Functional Near Infrared Spectroscopy (NIRS) Neuroimaging to Study Global Child Development: Rural Sub-Saharan Africa

Neuroimaging Field Methods Using Functional Near Infrared Spectroscopy NIRS Neuroimaging to Study Global Child Development: Rural Sub-Saharan Africa

حقل نيورويماجينج أساليب استخدام وظيفية قرب Neuroimaging مطيافية الأشعة تحت الحمراء (التقارير) لدراسة وضع الطفل العالمي: أفريقيا جنوب الصحراء الريفية

Portable neuroimaging approaches provide new advances to the study of brain function and brain development with previously inaccessible populations and in ...