Name: modeling the size spectrum for macroinvertebrates and fishes in stream ecosystems
Uploaded: 2019-07-30T14:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Modeling the Size Spectrum for Macroinvertebrates and Fishes in Stream Ecosystems at JoVE.com

Finansieringen af dette arbejde blev ydet af National Science Foundation (Grant DEB-1553111) og Eppley Foundation for videnskabelig forskning. Dette manuskript er VCU Rice Rivers Center bidrag #89.

Alle metoder, der er beskrevet her, er blevet godkendt af den institutionelle dyrepleje-og brugs Komité (IACUC) fra Virginia Commonwealth University.
1. indsamling og forarbejdning af fiske prøver
<ol><li>Isolering af fisk inden for undersøgelsens rækkevidde for at skabe en lukket fiske samling
	<ol>
<li>Identificer upstream og downstream (retning er i forhold til en landmåler står "upstream" og mod vandstrømmen) ender af undersøgelsen rækkevidde de...

Denne ataxic size Spectra protokol kan bruges til at kvantificere og modellere størrelse struktur inden for samfund af Stream fisk og hvirvelløse dyr. Spektrer i tidligere størrelser i vandløb har varierede fra grundlæggende beskrivende forskning39,40 til sammenligninger langs en langsgående flod profil41 og blandt særskilte biogeografiske regioner42. Sæson sammenligninger er blevet udført...

Kropsstørrelse skalering relationer, såsom den positive Association mellem Body Mass og metaboliske sats, er velkendt på det individuelle organisme niveau og er nu undersøgt på højere niveauer af organisation1,2,3 . Disse allometriske relationer er oftest Power-Law funktioner i form Y = aMb, hvor Y er den variabel af interesse (f. eks metabolisme, overflod, eller Home Range størrelse), M er kroppen massen af en enkelt eller gennemsnitlige individuel, b er en skaleringskoefficient, og a er en konstant. For statistisk bekvemmelighed, Y og M data er ofte log-transformeret før analyse derefter modelleret med lineære ligninger af formularen log (y) = log (a) + b log (M), hvor b og log ( a) blive den lineære model hældning og skæring, hhv.
Størrelses spektret er en type allometrisk forhold, der forudsiger tæthed (D, antallet af individer pr. arealenhed) eller biomasse (B, den summerede masse af individer pr. arealenhed) som en funktion af M (Se afsnit 4 for yderligere oplysninger om anvendelsen af» normaliserede « D -eller B -estimater.) Ligesom andre Skaleringsforhold mellem m og D eller mellem m og Bspiller størrelses spektret en central rolle i grundlæggende og anvendt økologi. På populationsniveau fortolker biologer ofte negative D <img alt="Image 1" src="/files/ftp_upload/59945/59945img01.jpg"> </img> M -relationer som tegn på densitet-afhængig overlevelse eller som modeller for økosystem bærende kapacitet (dvs. "selv fortyndende regel")4, 5. På fællesskabsplan kan B <img alt="Image 1" src="/files/ftp_upload/59945/59945img01.jpg"> </img> M -relationer anvendes til at studere virkninger på systemniveau af antropogene forstyrrelser, såsom størrelsesselektiv fiskeri6,7. Allometrisk skalering af D og B med M er også centrale for de seneste bestræbelser på at forene befolkning, samfund, og økosystem økologi2,8,9.  
En særlig vigtig egenskab ved størrelses spektret er det faktum, at det er helt ataxic9,10. Dette punkt er let at gå glip af, når man sammenligner scatterplots af D <img alt="Image 1" src="/files/ftp_upload/59945/59945img01.jpg"> </img> m eller B <img alt="Image 1" src="/files/ftp_upload/59945/59945img01.jpg"> </img> m data, men sondringen mellem taxic og ataxic modeller er en kritisk. I taxic-modeller anvendes en enkelt M -værdi til at repræsentere den gennemsnitlige kropsmasse for hver enkelt person af en given art eller taxa11. I ataxic-modeller er alle personer i et datasæt partitioneret blandt en serie af krops størrelsesintervaller eller M -placeringer, uanset deres taksonomiske identitet12. Sidstnævnte, ataxic tilgang er fordelagtig i akvatiske økosystemer, hvor mange taxa udviser ubestemt vækst og oplever en eller flere ontogenetiske forskydninger i fodring adfærd; i disse tilfælde, en enkelt art-niveau M gennemsnit vil sløre det faktum, at en art kan udfylde forskellige funktionelle roller i hele sin livshistorie9,13,14. 
Her præsenterer vi en komplet protokol for at kvantificere størrelses spektret inden for vade lige vandløb og floder. Protokollen indledes med metoder til prøvetagning af Mark for at indsamle de nødvendige oplysninger om fisk og bentiske makroinvertebrat. Fisk vil blive indsamlet gennem en "tre-pass-udtynding" prøveudtagnings proces. Overflod vil derefter blive anslået fra de udtynding data med zippin metode15. Ved udtynding af prøveudtagning er individuelle fisk inden for en lukket undersøgelse (dvs. enkeltpersoner kan hverken komme ind i eller forlade den vedlagte rækkevidde) fjernet fra Reach gennem tre på hinanden følgende prøver. Antallet af tilbageværende fisk vil således gradvis blive opbrugt. Fra denne udtynding tendens, samlede overflod inden for undersøgelsens rækkevidde kan anslås derefter omdannes til D (i fisk pr m2), ved hjælp af den kendte overfladeareal af undersøgelsen Reach. Bentiske makroinvertebrater vil blive indsamlet med standard samplere med fast areal og derefter identificeret og målt i laboratoriet.
Dernæst vil de kombinerede fiske-og makroinvertebratdata blive partitioneret mellem størrelses siloer. Traditionelt, den oktav eller log2 skala (dvs., fordoblings intervaller) er blevet brugt til at indstille størrelse placering grænser16. Når der er fastlagt en liste over størrelses placeringer, er opdeling af individuelle bentiske makroinvertebrater blandt deres respektive størrelses beholdere ligetil, fordi hvirvelløse dyr er direkte optalt som antal individer pr. arealenhed. Det er imidlertid mere abstrakt at anslå fiskemængder i størrelses beholdere, fordi disse estimater udledes af de udtynding data. Der gives derfor detaljerede anvisninger til at anslå fiske tætheden i størrelses beholdere, uanset taksonomisk identitet, fra udtynding af prøve data.
Endelig vil lineær regression blive brugt til at modellere størrelses spektret. Denne protokol er fuldt kompatibel med den oprindelige, generelle metode Kerr og Dickie16 og identisk med de metoder, der anvendes af McGarvey og Kirk, 201817 i en undersøgelse af fisk og hvirvelløse størrelse Spectra i West Virginia vandløb. Ved at bruge denne protokol, kan efterforskere forsikre, at deres resultater er direkte sammenlignelige med andre undersøgelser, der bygger på Kerr og Dickie16, og dermed accelerere en bred og robust forståelse af kropsstørrelse skalering relationer i ferskvand økosystemer og de mekanismer, der kører dem.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Chest waders</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Personal protective equipment for use during electrofishing. Do NOT use &#39;breatheable&#39; waders as electrical current will pass through them.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Rubber lineman&#39;s gloves</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Personal protective equipment for use during electrofishing.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dip nets with fiberglass poles</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to capture stunned fishes during electrofishing.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Backpack electrofishing unit</td>
			<td>Smith-Root; Halltech; Midwest Lake Management; Aqua Shock Solutions</td>
			<td>www.smith-root.com; www.halltechaquatic.com; https://midwestlake.com; https://aquashocksolutions.com/</td>
			<td>Backpack electrofishers are currently manufactured and distributed by four independent companies in North America. Prices and warranty/technical support are the most important factors in choosing a vendor.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Block nets/seines (&#215;2)</td>
			<td>Duluth Nets</td>
			<td>https://duluthfishnets.com/</td>
			<td>Necessary length will depend on stream width. 3/8 inch mesh is recommended.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cam-action utility straps with 1 inch nylon webbing (&#215;4)</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to secure/anchor block nets. Available at auto supply, hardware, and department stores.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Large tent stakes (&#215;4)</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to secure/anchor block nets. Available at camping and department stores.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>5 gallon plastic buckets (&#215;5)</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to hold and transport fish during electrofishing. Available at hardware and paint supply stores.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>10-20 gallon totes (&#215;3)</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used as livewells, sedation tanks, and recovery bins for captured fishes. Available at hardware and department stores.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Battery powered &#39;bait bucket&#39; aeration pumps</td>
			<td>Cabelas</td>
			<td>IK-019008</td>
			<td>Used to aerate fish holding bins during field processing.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fish anesthesia (Tricaine-S)</td>
			<td>Syndel</td>
			<td>www.syndel.com</td>
			<td>Used to sedate fishes for field processing. Tricaine-S is regulated by the U.S. Food and Drug Administration.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Folding camp table and chairs</td>
			<td>Cabelas</td>
			<td>IK-518976; IK-552777</td>
			<td>Used to process fish samples.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pop-up canopy</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used as necessary for sun and rain protection.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fish measuring board</td>
			<td>Wildco</td>
			<td>3-118-E40</td>
			<td>Used to measure fish lengths.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Battery powered field scale with weighing dish</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to weigh fishes. Must weigh be accurate to 0.1 or 0.01 grams.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Clear plastic wind/rain baffle</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to shield scale in rainy or windy conditions. Must be large enough to cover the scale and a weighing dish.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>White plastic or enamel examination trays</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Trays are essential for examining fishes in the field.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Stainless steel forceps</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Forceps are helpful when examining small fishes and in transfering invertebrates to specimen jars.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hand magnifiers</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Magnification is often helpful when identifying fish specimens in the field.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fish identification keys</td>
			<td>n/a</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Laminated keys that are custom prepared for specific locations are most effective.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Datasheets printed on waterproof paper</td>
			<td>Rite in the Rain</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Waterproof paper is essential when working with aquatic specimens.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Retractable fiberglass field tapes</td>
			<td>Lufkin</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to measure stream channel dimensions.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Surber sampler or Hess sampler</td>
			<td>Wildco</td>
			<td>3-12-D56; 3-16-C52</td>
			<td>Either of these fixed-area benthic samplers will work well in shallow streams with gravel or pebble substrate.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>70% ethanol or isopropyl alcohol</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used as invertebrate preservative.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Widemouth invertebrate specimen jars (20-32 oz.)</td>
			<td>U.S. Plastic Corp.</td>
			<td>67712</td>
			<td>Any widemouth plastic jars will work but these particular jars are durable and inexpensive.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

modeling the size spectrum for macroinvertebrates and fishes in stream ecosystems

Størrelses spektret er et inverteret, allometrisk Skaleringsforhold mellem gennemsnitlig kropsmasse (M) og tætheden (D) af individer i et økologisk fællesskab eller fødevare nettet. Vigtigere, størrelsen spektrum antager, at individuel størrelse, snarere end arter ' adfærdsmæssige eller livshistorie karakteristika, er den primære afgørende for overflod i et økosystem. I modsætning til traditionelle allometriske relationer, der fokuserer på Arts data (f. eks. den gennemsnitlige Arts størrelse i forhold til befolkningstætheden), er størrelses spektre analyser således» ataxic «– individuelle prøver identificeres kun ved deres størrelse, uden hensyntagen til taksonomisk identitet. Size Spectra modeller er effektive repræsentationer af traditionelle, komplekse mad webs og kan bruges i beskrivende såvel som prædiktive sammenhænge (f. eks, forudsige svar fra store forbrugere til ændringer i basale ressourcer). Empiriske undersøgelser fra forskellige akvatiske økosystemer har også rapporteret moderat til høj grad af lighed i størrelse Spectra skråninger, hvilket tyder på, at fælles processer kan regulere overflod af små og store organismer i meget forskellige miljøer. Dette er en protokol, der skal modellere størrelses spektret på fællesskabsniveau i Vadehavet. Protokollen består af tre hovedtrin. For det første indsamle kvantitative bentiske fisk og hvirvelløse prøver, der kan anvendes til at estimere lokale tæthedsgrader. For det andet, standardisere de fisk og hvirvelløse data ved at omdanne alle individer til ataxic enheder (dvs. personer identificeret ved størrelse, uanset taksonomisk identitet), og opsummering personer i log2 størrelse siloer. For det tredje, brug lineær regression til at modellere forholdet mellem ataxic M og D estimater. Detaljerede instruktioner er angivet heri for at fuldføre hver af disse trin, herunder brugerdefineret software til at lette D estimering og størrelse Spectra modellering.

Eksempelresultater, herunder oprindelige feltdata, præsenteres for Slaunch fork, West Virginia, en Lillestrøm i det sydlige West Virginia. Yderligere størrelse Spectra modelresultater er også præsenteret for to andre vandløb i samme region: Camp Creek og Cabin Creek, West Virginia. Disse er de tre studiesteder, der indgår i McGarvey og Kirk17, men data præsenteret her er fra nye prøver indsamlet i maj 2015. En fuldt bearbejdet, manuel eksempel på størrelsen Spectra modellering proces er...

Watch this Scientific Journal Video about Modeling the Size Spectrum for Macroinvertebrates and Fishes in Stream Ecosystems at JoVE.com

Modeling the Size Spectrum for Macroinvertebrates and Fishes in Stream Ecosystems

Dette er en protokol, der skal modellere størrelses spektret (Skaleringsforhold mellem individuel masse og befolkningstæthed) for kombinerede fiske-og hvirvelløse data fra Vadehavet og vandløb. Metoderne omfatter: felt teknikker til indsamling af kvantitative fisk og hvirvelløse prøver; Lab metoder til at standardisere feltdata; og statistisk dataanalyse.

Modellering af størrelses spektret for makroinvertebrater og fisk i strøm økosystemer

The size spectrum is an inverse, allometric scaling relationship between average body mass (M) and the density (D) of individuals within an ecological ...

Størrelsesspektret forudsiger tæthed som en funktion af individuel størrelse. Størrelsesspektreforskning tyder på stærk lighed i overfloden af relativt små og store organismer fra forskellige økosystemer. I modsætning til traditionelle størrelse overflod skalering relationer, der bruger arter niveau gennemsnitlige størrelser, størrelse spektrum modeller er ataxic og kan tage højde for størrelsen af hver enkelt i prøven.Demonstration af proceduren vil være Brandon Gravett, Sarah Headley, og Giancarlo Racanelli, felt teknikere. Når du har identificeret de forudgående og nedstrøms ender af undersøgelsens rækkevidde, skal du markere enderne med aftageligt markeringsbånd. Mål bredden af den våde strømkanal ved fem til 10 transekts fordelt jævnt langs undersøgelsens længde, og anslå det samlede overfladeareal af undersøgelsens rækkevidde som den gennemsnitlige vådkanalbredde ganget med rækkeviddens samlede længde.Lav en løs bowline knude i hver ende af et stykke polypropylen reb og wrap rebet omkring et træ, rod, stor sten, eller andre faste objekt på op og nedstrøms ender af undersøgelsen nå som et anker. Før den ene løkke gennem den anden for at oprette et ankerpunkt og forkorte eller forlænge rebankeret ved at tilføje eller fjerne ombrydes omkring ankerobjektet efter behov. Etablere et andet ankerpunkt på den modsatte side af åen som netop demonstreret, og brug en bowline knude til at skabe en løkke i linjerne på hver af de fire hjørner af en medium til grov mesh blok net.Brug Cam Action tie-down stropper, forbinde begge sider af den øverste linje i bloknettet til ankerpunkter, og indsætte krogene i hver ende af tie-down rem i løkkerne i hjørnerne af blokken nettet og ankerpunkter. Træk den frie bindestrop gennem Cam-spændet for at stramme hvert kontaktpunkt, og fastgør bloknettets bundlinje til åbanken med teltpæle. Placer store sten på siden af nettet vender opstrøms for at pin bloknettet ned for at etablere en forsegling med bunden af åen, idet der skal være, at toppen af nettet forbliver over vandstanden.Derefter indstille en anden blok netto i den nedstrøms ende af undersøgelsen nå på samme måde. For at udføre en fisk prøveudtagning udtynding pass, der begynder i den nedstrøms ende af den lukkede undersøgelse rækkevidde, tænde rygsæk elektrofisker og bevæge sig gennem strømmen i opstrøms retning. Fremskridt langsomt, bevæger sig fra side til side i hele undersøgelsen nå at sikre, at alle de in-stream levesteder er samplet, og har støtte besætningsmedlemmer følge for at indsamle bedøvet fisk med dip net, som de er spottet.Overfør fisken i midlertidige spande, derefter til beædte bedrift badekar. Brug små batteridrevne agn spand pumper med befrugtning sten for at sikre, at de tilfangetagne fisk forblive sunde. Vær især opmærksom på forskellige små, unge-of-year fisk, da de er vanskelige at få øje på og fange.Det første udtyndingspas er færdigt, når opstrømsnettet er nået. Til behandling af den første udtyndingsfisk anvendes små dipnet til at hente de fisk, der udtages prøver af, fra bedriftstanken individuelt eller i små partier til identifikation, og prøverne anbringes i hvide bakker. Brug af snævle og et forstørrelsesglas, identificere hver fisk, derefter måle dens samlede længde fra spidsen af snuden til slutningen af halefinnen på et målebræt, og veje det på en feltbalance med en 0,1 eller 0,01-gram præcision.Derefter registreres artens identitet og samlede længde og vægt for hver prøve på vandtætte datablade. Når fiskene er forarbejdet, returneres de til en separat genvindingsspand til beæddet, før alle fisk nedstrøms for det nedstrøms bloknet frigives. Vælg bentiske makrovertebratprøveområder inden for grænserne af fiskeprøvetagningsået, som er repræsentative for de vigtigste typer fysiske levesteder, der blev observeret i undersøgelsens rækkevidde.Der anbringes en passende fast prøveudtagningsanordning mod strømbunden med prøvetagningsnettet orienteret nedstrøms, og flytte store brosten efter behov for at etablere en fast forsegling med underlaget. Brug en børste til kraftigt at skrubbe underlaget i prøvetagningsområdet i to minutter, så forrykkede bentiske makroinhvirvelløse dyr kan glide ind i prøvenettet. Prøveindholdet overføres fra nettet til en plastkrukke, og prøverne opbevares i 70 % isopropylalkohol.Derefter mærke krukken og gemme det på et sikkert sted for senere overførsel til laboratoriet. Når alle bentiske makroinvertebrate og fisk data er blevet korrekt formateret og plottet, en klar negativ sammenhæng mellem de enkelte kropsmasse og normaliseret tæthed er ofte synlige. Denne størrelse spektrum afspejler en forudsigelig overgang fra de mindste og mest rigelige hvirvelløse dyr såsom midges og små mayflies til større caddisflies og stenfluer til fisk som vist her for prøver fra Slaunch Fork, West Virginia.Lignende størrelse spektre relationer blev opdaget for bentiske makroinvertebrates i fisk i Camp Creek og Cabin Creek, to andre West Virginia vandløb, og lineær regression blev brugt til at modellere forholdet. Størrelsen spektre skråninger var alle mellem 1,7 og 1,8 med overlappende 95% konfidensintervaller. Denne lighed indikerer, at overfloden falder, efterhånden som kropsstørrelsen stiger med omtrent lige satser i alle tre streams.Men de forskellige størrelse spektre aflytninger afslører, at forskelle i den samlede tæthed er varierende mellem vandløb, men de højeste tætheder observeret i Camp Creek og meget lavere tætheder målt i Cabin Creek. Efterhånden som antallet af spektreundersøgelser vokser, vil kritiske test af virkningerne af forskellige miljømæssige påvirkninger på størrelsesspektret blive mulige. Det er vigtigt at huske på, at alt feltarbejde indebærer en vis risiko, og at især elektrofiskeri kan være farligt.Det er derfor vigtigt, at alle besætningsmedlemmer er ordentligt uddannet.

Research

JoVE Journal

Environment

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Forståelse opløste organiske stoffer Biogeokemi Gennem<em&gt; In Situ</em&gt; Næringsstof Manipulationer i Stream Ecosystems

Dissolved organic matter (DOM) is a highly diverse mixture of molecules providing one of the largest sources of energy and nutrients to stream ecosystems. ...

Experimental Methods of Dust Charging and Mobilization on Surfaces with Exposure to Ultraviolet Radiation or Plasmas

Eksperimentelle metoder til støv opladning og mobilisering på overflader med eksponering for Ultraviolet stråling eller plasmaer

Electrostatic dust transport has been hypothesized to explain a number of observations of unusual planetary phenomena. Here, it is demonstrated using ...

Ecosystem Fabrication (EcoFAB) Protocols for The Construction of Laboratory Ecosystems Designed to Study Plant-microbe Interactions

Ecosystem Fabrication EcoFAB Protocols for The Construction of Laboratory Ecosystems Designed to Study Plant-microbe Interactions

Økosystem fabrikation (EcoFAB) protokoller for byggeri Laboratory økosystemers designet til at studere plante-mikrobe interaktioner

Beneficial plant-microbe interactions offer a sustainable biological solution with the potential to boost low-input food and bioenergy production. A ...

Bioindication Testing of Stream Environment Suitability for Young Freshwater Pearl Mussels Using In Situ Exposure Methods

Bioindication Testing of Stream Environment Suitability for Young Freshwater Pearl Mussels Using In Situ Exposure Methods

Bioindication afprøvning af Stream miljø egnethed for unge ferskvands perle muslinger med In Situ eksponering metoder

Knowledge of habitat suitability for freshwater mussels is an important step in the conservation of this endangered species group. We describe a protocol ...

Methods for Image-based Surveys of Benthic Macroinvertebrates and Their Habitat Exemplified by the Drop Camera Survey for the Atlantic Sea Scallop

Metoder til Image-baserede undersøgelser af bentiske Macroinvertebrates og deres levesteder, eksemplificeret ved slip kamera undersøgelse til Atlanten havet kammusling

Underwater imaging has long been used in the field of marine ecology but decreasing costs of high-resolution cameras and data storage have made the ...

Experimental Study of the Relationship Between Particle Size and Methane Sorption Capacity in Shale

Eksperimentel undersøgelse af forholdet mellem partikelstørrelse og metan Sorption kapacitet i skifer

The amount of adsorbed shale gas is a key parameter used in shale gas resource evaluation and target area selection, and it is also an important standard ...

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster (Nephrops norvegicus)

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus

Langsigtet Video sporing af Cohoused vanddyr: et casestudie af den daglige bevægeapparatet aktivitet af jomfruhummer (Nephrops norvegicus)

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

Combined Size and Density Fractionation of Soils for Investigations of Organo-Mineral Interactions

Samlet størrelse og tæthed fraktionering af jord for undersøgelser af Organo-Mineral interaktioner

Combined size and density fractionation (CSDF) is a method used to physically separate soil into fractions differing in particle size and mineralogy. CSDF ...

Measuring the Shape and Size of Activated Sludge Particles Immobilized in Agar with an Open Source Software Pipeline

Måling af form og størrelse af aktiveret slam partikler immobiliseret i Agar med en Open Source Software-rørledningen

Experimental bioreactors, such as those treating wastewater, contain particles whose size and shape are important parameters. For example, the size and ...

Combining Fluidic Devices with Microscopy and Flow Cytometry to Study Microbial Transport in Porous Media Across Spatial Scales

Kombinere fluidic enheder med mikroskopi og flow cytometri at studere mikrobiel transport i porøse medier på tværs af rumlige skalaer

Understanding the transport, dispersion and deposition of microorganisms in porous media is a complex scientific task comprising topics as diverse as ...