Name: modeling the size spectrum for macroinvertebrates and fishes in stream ecosystems
Uploaded: 2019-07-30T14:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Modeling the Size Spectrum for Macroinvertebrates and Fishes in Stream Ecosystems at JoVE.com

O financiamento para este trabalho foi prestado pela National Science Foundation (Grant DEB-1553111) e pela Fundação Eppley para a investigação científica. Este manuscrito é a contribuição da VUC Rice Rivers Center #89.

Todos os métodos descritos aqui foram aprovados pelo Comitê institucional de cuidados e uso de animais (IACUC) da Virginia Commonwealth University.
1. recolha e processamento de amostras de peixe
<ol><li>Isolando os peixes dentro do alcance do estudo para criar uma Assembléia de peixes fechados
	<ol>
<li>Identifique o ascendente e a jusante (a direção é relativa a um topógrafo que enfrenta "upstream" e contra a corrente de água) extremidades do alcan...

Este protocolo de espectros de tamanho atáxico pode ser usado para quantificar e modelar a estrutura de tamanho dentro das comunidades de peixes e invertebrados de fluxo. Os estudos de espectros de tamanho prévio em ecossistemas de fluxo variaram de pesquisa descritiva básica39,40 a comparações ao longo de um perfil longitudinal do Rio41 e entre distintas regiões biogeográficas42. Comparações sazonais foram...

As relações de dimensionamento do tamanho do corpo, como a associação positiva entre a massa corporal e a taxa metabólica, são bem conhecidas no nível do organismo individual e agora estão sendo estudadas em níveis mais elevados de organização1,2,3 . Essas relações alométricas são, na maioria das vezes, funções de poder-lei da forma y = amb, onde y é a variável de interesse (por exemplo, metabolismo, abundância, ou tamanho do intervalo de casa), M é a massa corporal de uma única ou média individual, b é um coeficiente de dimensionamento e a é uma constante. Para conveniência estatística, os dados Y e M são muitas vezes transformados em log antes da análise, em seguida, modelado com equações lineares do formulário log (y) = log (a) + b log (M), onde b e log ( a) tornar-se a inclinação do modelo linear e interceptar, respectivamente.
O espectro de tamanho é um tipo de relação alométrica que prevê a densidade (D, o número de indivíduos por unidade de área) ou biomassa (B, a massa somada de indivíduos por unidade de área) em função de M (ver seção 4 para adicional informações sobre o uso de estimativas de D ou B "normalizadas".) Como outras relações de dimensionamento entre m e D ou entre m e B, o espectro de tamanho desempenha um papel central na ecologia básica e aplicada. A nível populacional, os biólogos frequentemente interpretam relações negativas de D <img alt="Image 1" src="/files/ftp_upload/59945/59945img01.jpg"> </img> M como evidência de sobrevivência dependente de densidade ou como modelos de capacidade de transporte do ecossistema (ou seja, a "regra de autodiluição")4, a 5. A nível comunitário, as relações B <img alt="Image 1" src="/files/ftp_upload/59945/59945img01.jpg"> </img> M podem ser utilizadas para estudar os efeitos de nível de sistema de perturbações antropogênicas, como a pesca de tamanho seletivo6,7. O dimensionamento alométrico de D e B com M também é fundamental para esforços recentes para unir a ecologia populacional, comunitária e ecossistêmica2,8,9.  
Uma característica particularmente importante do espectro de tamanho é o fato de que é inteiramente ataxic9,10. Este ponto é fácil de perder ao comparar gráficos de dispersão de dados de D <img alt="Image 1" src="/files/ftp_upload/59945/59945img01.jpg"> </img> m ou B <img alt="Image 1" src="/files/ftp_upload/59945/59945img01.jpg"> </img> m , mas a distinção entre os modelos taxic e ataxic é uma crítica. Em modelos taxic, um único valor de M é usado para representar a massa corporal média de cada indivíduo de uma determinada espécie ou táxons11. Em modelos ataxic, todos os indivíduos dentro de um conjunto de dados são particionados entre uma série de intervalos de tamanho de corpo ou M Bins, independentemente de sua identidade taxonômica12. Este último, abordagem atáxica é vantajoso em ecossistemas aquáticos onde muitos táxons exibem um crescimento indeterminado e experimentam uma ou mais mudanças ontogenéticas no comportamento alimentar; nesses casos, uma única média de M de nível de espécie irá obscurecer o fato de que uma espécie pode preencher diferentes papéis funcionais ao longo de sua história de vida9,13,14. 
Aqui, nós apresentamos um protocolo completo para quantificar o espectro do tamanho dentro dos córregos e dos rios wadable. O protocolo começa com métodos de amostragem de campo para coletar os peixes necessários e os dados de macroinvertebrados bentônicos. Os peixes serão recolhidos através de um processo de amostragem de "depleção de três passagens". A abundância será então estimada a partir dos dados de depleção com o método Zippin15. Na amostragem de depleção, os peixes individuais dentro de um alcance de estudo fechado (ou seja, os indivíduos não podem entrar nem deixar o alcance fechado) são removidos do alcance através de três amostras sucessivas. Assim, o número de peixes remanescentes será progressivamente esgotado. A partir dessa tendência de depleção, a abundância total dentro do alcance do estudo pode ser estimada em seguida, convertida em D (em peixes por m2), usando a área de superfície conhecida do alcance do estudo. Os macroinvertebrados bentônicos serão coletados com amostradores de área fixa padrão, então identificados e medidos em laboratório.
Em seguida, os dados combinados de peixes e macroinvertebrados serão divididos entre as caixas de tamanho. Tradicionalmente, a escala de oitava ou log2 (ou seja, intervalos de duplicação) foi usada para definir os limites do compartimento de tamanho16. Uma vez estabelecida uma lista de compartimentos de tamanho, o particionamento de macroinvertebrados bentônicos individuais entre seus respectivos compartimentos de tamanho é simples porque os invertebrados são diretamente enumerados como números de indivíduos por unidade de área. No entanto, estimar as abundâncias de peixes dentro das caixas de tamanho é mais abstrata, pois essas estimativas são inferidas dos dados de depleção. Portanto, são fornecidas instruções detalhadas para estimar a abundância de peixes dentro de compartimentos de tamanho, independentemente da identidade taxonômica, de dados de amostra de depleção.
Finalmente, a regressão linear será usada para modelar o espectro de tamanho. Este protocolo é inteiramente compatível com o método original, geral de Kerr e Dickie16 e idêntico aos métodos usados por McGarvey e por Kirk, 201817 em um estudo de espectros do tamanho dos peixes e do invertebrados em córregos de Virgínia Ocidental. Usando este protocolo, os investigadores podem segurar que seus resultados são diretamente comparáveis com outros estudos que constroem em cima de Kerr e Dickie16, acelerando desse modo uma compreensão larga e robusta do tamanho de corpo que escala relacionamentos na água doce ecossistemas e os mecanismos que os conduzem.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Chest waders</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Personal protective equipment for use during electrofishing. Do NOT use &#39;breatheable&#39; waders as electrical current will pass through them.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Rubber lineman&#39;s gloves</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Personal protective equipment for use during electrofishing.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dip nets with fiberglass poles</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to capture stunned fishes during electrofishing.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Backpack electrofishing unit</td>
			<td>Smith-Root; Halltech; Midwest Lake Management; Aqua Shock Solutions</td>
			<td>www.smith-root.com; www.halltechaquatic.com; https://midwestlake.com; https://aquashocksolutions.com/</td>
			<td>Backpack electrofishers are currently manufactured and distributed by four independent companies in North America. Prices and warranty/technical support are the most important factors in choosing a vendor.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Block nets/seines (&#215;2)</td>
			<td>Duluth Nets</td>
			<td>https://duluthfishnets.com/</td>
			<td>Necessary length will depend on stream width. 3/8 inch mesh is recommended.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cam-action utility straps with 1 inch nylon webbing (&#215;4)</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to secure/anchor block nets. Available at auto supply, hardware, and department stores.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Large tent stakes (&#215;4)</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to secure/anchor block nets. Available at camping and department stores.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>5 gallon plastic buckets (&#215;5)</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to hold and transport fish during electrofishing. Available at hardware and paint supply stores.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>10-20 gallon totes (&#215;3)</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used as livewells, sedation tanks, and recovery bins for captured fishes. Available at hardware and department stores.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Battery powered &#39;bait bucket&#39; aeration pumps</td>
			<td>Cabelas</td>
			<td>IK-019008</td>
			<td>Used to aerate fish holding bins during field processing.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fish anesthesia (Tricaine-S)</td>
			<td>Syndel</td>
			<td>www.syndel.com</td>
			<td>Used to sedate fishes for field processing. Tricaine-S is regulated by the U.S. Food and Drug Administration.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Folding camp table and chairs</td>
			<td>Cabelas</td>
			<td>IK-518976; IK-552777</td>
			<td>Used to process fish samples.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pop-up canopy</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used as necessary for sun and rain protection.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fish measuring board</td>
			<td>Wildco</td>
			<td>3-118-E40</td>
			<td>Used to measure fish lengths.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Battery powered field scale with weighing dish</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to weigh fishes. Must weigh be accurate to 0.1 or 0.01 grams.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Clear plastic wind/rain baffle</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to shield scale in rainy or windy conditions. Must be large enough to cover the scale and a weighing dish.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>White plastic or enamel examination trays</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Trays are essential for examining fishes in the field.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Stainless steel forceps</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Forceps are helpful when examining small fishes and in transfering invertebrates to specimen jars.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hand magnifiers</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Magnification is often helpful when identifying fish specimens in the field.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fish identification keys</td>
			<td>n/a</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Laminated keys that are custom prepared for specific locations are most effective.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Datasheets printed on waterproof paper</td>
			<td>Rite in the Rain</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Waterproof paper is essential when working with aquatic specimens.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Retractable fiberglass field tapes</td>
			<td>Lufkin</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used to measure stream channel dimensions.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Surber sampler or Hess sampler</td>
			<td>Wildco</td>
			<td>3-12-D56; 3-16-C52</td>
			<td>Either of these fixed-area benthic samplers will work well in shallow streams with gravel or pebble substrate.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>70% ethanol or isopropyl alcohol</td>
			<td>Multiple options</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Used as invertebrate preservative.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Widemouth invertebrate specimen jars (20-32 oz.)</td>
			<td>U.S. Plastic Corp.</td>
			<td>67712</td>
			<td>Any widemouth plastic jars will work but these particular jars are durable and inexpensive.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

modeling the size spectrum for macroinvertebrates and fishes in stream ecosystems

O espectro de tamanho é uma relação de escala inversa, alométrica entre a massa corporal média (M) e a densidade (D) de indivíduos dentro de uma comunidade ecológica ou Web de alimentos. É importante ressaltar que o espectro de tamanho assume que o tamanho individual, em vez das características comportamentais ou de história de vida da espécie, é o principal determinante da abundância dentro de um ecossistema. Assim, diferentemente das relações alométricas tradicionais que se concentram em dados de nível de espécie (por exemplo, tamanho do corpo da espécie média versus densidade populacional), as análises de espectros de tamanho são ' ataxic ' – espécimes individuais são identificados apenas pelo seu tamanho, sem consideração de identidade taxonômica. Os modelos de espectros de tamanho são representações eficientes de teias alimentares tradicionais e complexas e podem ser usados em contextos descritivos, bem como preditivos (por exemplo, prever respostas de grandes consumidores a mudanças nos recursos basais). Estudos empíricos de diversos ecossistemas aquáticos também relataram níveis moderados a altos de similaridade em inclinações de espectros de tamanho, sugerindo que processos comuns podem regular as abundâncias de pequenos e grandes organismos em ambientes muito diferentes. Este é um protocolo para modelar o espectro de tamanho de nível comunitário em fluxos wadable. O protocolo consiste em três etapas principais. Em primeiro lugar, coletar amostras de peixes e invertebrados bentônicos quantitativos que podem ser usados para estimar densidades locais. Em segundo lugar, padronizar os dados de peixes e invertebrados, convertendo todos os indivíduos em unidades atáxicas (i.e., indivíduos identificados por tamanho, independentemente da identidade taxonômica), e somando indivíduos dentro de silos de tamanho de log2 . Em terceiro lugar, use a regressão linear para modelar a relação entre as estimativas de M e D ataxic. Instruções detalhadas são fornecidas neste documento para concluir cada uma dessas etapas, incluindo software personalizado para facilitar a modelagem de espectros de estimativa e tamanho D .

Resultados exemplar, incluindo dados de campo originais, são apresentados para Slaunch Fork, Virgínia Ocidental, um pequeno riacho no sul da Virgínia Ocidental. Os resultados do modelo de espectros de tamanho adicional também são apresentados para outros dois córregos na mesma região: Camp Creek e Cabin Creek, Virgínia Ocidental. Estes são os três locais de estudo incluídos em McGarvey e Kirk17, mas os dados apresentados aqui são de novas amostras coletadas em maio 2015. Um exemplo tot...

Watch this Scientific Journal Video about Modeling the Size Spectrum for Macroinvertebrates and Fishes in Stream Ecosystems at JoVE.com

Modeling the Size Spectrum for Macroinvertebrates and Fishes in Stream Ecosystems

Este é um protocolo para modelar o espectro de tamanho (relação de dimensionamento entre massa individual e densidade populacional) para os dados combinados de peixes e invertebrados de córregos e rios wadable. Os métodos incluem: técnicas de campo para coletar amostras quantitativas de peixes e invertebrados; métodos de laboratório para padronizar os dados de campo; e análise estatística dos dados.

Modelagem do espectro de tamanho para macroinvertebrados e peixes em ecossistemas de fluxo

The size spectrum is an inverse, allometric scaling relationship between average body mass (M) and the density (D) of individuals within an ecological ...

O espectro de tamanho prevê abundância em função do tamanho individual. Pesquisas de espectros de tamanho sugerem forte semelhança nas abundâncias de organismos relativamente pequenos e grandes de diversos ecossistemas. Ao contrário das relações tradicionais de dimensionamento de abundância de tamanho que usam tamanhos médios de nível de espécie, os modelos de espectro de tamanho são ataxicos e podem explicar o tamanho de cada indivíduo dentro da amostra.O procedimento será Brandon Gravett, Sarah Headley e Giancarlo Racanelli, técnicos de campo. Depois de identificar as extremidades a montante e a jusante do alcance do estudo, marque as extremidades com fita de sinalização removível. Meça a largura do canal de fluxo molhado em cinco a 10 transectos distribuídos uniformemente ao longo da extensão do alcance do estudo, e estime a área total da superfície do estudo como a largura média do canal molhado multiplicada pelo comprimento total do alcance.Faça um nó de bowline solto em cada extremidade de um pedaço de corda de polipropileno e enrole a corda em torno de uma árvore, raiz, rocha grande ou outro objeto sólido nas extremidades para cima e para baixo do estudo alcançar como uma âncora. Alimente um laço através do outro para criar um ponto de ancoragem e encurtar ou alongar a âncora da corda adicionando ou removendo envoltórios ao redor do objeto de âncora, conforme necessário. Estabeleça um segundo ponto de ancoragem no lado oposto do fluxo como apenas demonstrado, e use um nó bowline para criar um laço nas linhas em cada um dos quatro cantos de uma rede de bloco de malha média e grosseira.Usando as correias de amarrar cam action, conecte ambos os lados da linha superior na rede do bloco até os pontos de ancoragem e insira os ganchos em cada extremidade da correia de amarrar nos laços nos cantos da rede do bloco e nos pontos de ancoragem. Puxe a corda livre da correia de amarrar para baixo através da fivela cam para apertar cada ponto de contato, e fixar a linha inferior da rede do bloco para o banco de fluxo com estacas de tenda. Coloque grandes rochas na lateral da rede voltadas rio acima para fixar a rede do bloco para baixo para estabelecer uma vedação com a parte inferior do córrego, tomando cuidado para que o topo da rede permaneça acima do nível da água.Em seguida, defina uma rede de segundo bloco no final a jusante do estudo, da mesma forma. Para realizar uma passagem de esgotamento amostral de amostragem de peixes, começando no final a jusante do alcance do estudo fechado, ligue o eletropesador da mochila e mova-se através do córrego na direção rio acima. Progrida lentamente, movendo-se lado a lado durante todo o alcance do estudo para garantir que todos os habitats no córrego sejam amostrados, e que os membros da tripulação de apoio sigam para coletar peixes atordoados com redes de mergulho à medida que são vistos.Transfira o peixe para baldes temporários, depois para banheiras de retenção arejadas. Use pequenas bombas de balde de isca alimentadas por bateria com pedras de aeração para garantir que os peixes capturados permaneçam saudáveis. Preste especial atenção a vários peixes pequenos e jovens do ano, pois são difíceis de detectar e capturar.O primeiro passe de esgotamento é completo quando a rede upstream é atingida. Para o processamento do primeiro peixe passe de esgotamento, use pequenas redes de mergulho para recuperar os peixes amostrados do tanque de retenção individualmente ou em pequenos lotes para identificação, e coloque os espécimes em bandejas brancas. Usando fórceps e uma lupa, identifique cada peixe, em seguida, meça seu comprimento total da ponta do focinho até o final da barbatana caudal em uma placa de medição, e pese-o em um equilíbrio de campo com uma precisão de 0,1 ou 0,01 gramas.Em seguida, registo da identidade da espécie e comprimento e peso total para cada espécime em folhas de dados impermeáveis. Uma vez processado, devolva os peixes a uma caixa de recuperação aerada separada antes de liberar todos os peixes rio abaixo da rede de blocos a jusante. Selecione os locais de amostra de macroinvertebrate benthic dentro dos limites do alcance amostral de peixes que são representativos dos principais tipos de habitats físicos observados no alcance do estudo.Coloque um dispositivo de amostragem de área fixa apropriado firmemente contra o fundo do fluxo com a rede de coleta de amostras orientada a jusante e mova grandes paralelepípedos conforme necessário para estabelecer um selo firme com o substrato. Use um pincel para esfregar vigorosamente o substrato dentro da área de amostragem por dois minutos, permitindo que macroinvertebrados benthicos desalojados fluam para a rede de amostras. Transfira o conteúdo da amostra da rede para um frasco de plástico e preserve os espécimes em álcool isopropílico de 70%.Em seguida, rotule o frasco e armazene-o em um local seguro para posterior transferência para o laboratório. Quando todos os dados de macroinvertebrate benthic e peixes foram devidamente formatados e plotados, uma clara relação negativa entre a massa corporal individual e a densidade normalizada é muitas vezes aparente. Este espectro de tamanho reflete uma transição previsível dos menores e mais abundantes invertebrados, como mestiços e pequenas moscas-de-maio para caddisflies maiores e moscas de pedra para peixes, como mostrado aqui para amostras de Slaunch Fork, Virgínia Ocidental.Relações de espectro de tamanho semelhante foram detectadas para macroinvertebrados benthic em peixes em Camp Creek e Cabin Creek, dois outros córregos da Virgínia Ocidental, e a regressão linear foi usada para modelar a relação. As inclinações de espectro de tamanho foram todas entre 1,7 e 1,8 com intervalos de confiança de 95%. Essa semelhança indica que a abundância diminui à medida que o tamanho do corpo aumenta a taxas aproximadamente iguais nos três córregos.No entanto, as diferentes interceptações de espectro de tamanho diferente revelam que as diferenças na densidade geral são variáveis entre os córregos, mas as maiores densidades observadas em Camp Creek e densidades muito menores medidas em Cabin Creek. À medida que o número de estudos de espectro de tamanho cresce, testes críticos dos efeitos de diferentes influências ambientais no espectro de tamanho se tornarão possíveis. É importante lembrar que todo trabalho de campo implica algum risco e que a eletropesia, em particular, pode ser perigosa.Por isso, é essencial que todos os membros da tripulação sejam devidamente treinados.

Research

JoVE Journal

Environment

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Compreender orgânico dissolvido Matéria Biogeoquímica Através<em&gt; In Situ</em&gt; Nutrientes Manipulações no córrego Ecossistemas

Dissolved organic matter (DOM) is a highly diverse mixture of molecules providing one of the largest sources of energy and nutrients to stream ecosystems. ...

Ambiente

Experimental Methods of Dust Charging and Mobilization on Surfaces with Exposure to Ultraviolet Radiation or Plasmas

Métodos experimentais de poeira e mobilização sobre superfícies com exposição à radiação ultravioleta ou Plasmas de

Electrostatic dust transport has been hypothesized to explain a number of observations of unusual planetary phenomena. Here, it is demonstrated using ...

Ecosystem Fabrication (EcoFAB) Protocols for The Construction of Laboratory Ecosystems Designed to Study Plant-microbe Interactions

Ecosystem Fabrication EcoFAB Protocols for The Construction of Laboratory Ecosystems Designed to Study Plant-microbe Interactions

Protocolos de fabricação (EcoFAB) ecossistema para a construção de ecossistemas de laboratório projetado para estudar interações planta-micróbio

Beneficial plant-microbe interactions offer a sustainable biological solution with the potential to boost low-input food and bioenergy production. A ...

Bioindication Testing of Stream Environment Suitability for Young Freshwater Pearl Mussels Using In Situ Exposure Methods

Bioindication Testing of Stream Environment Suitability for Young Freshwater Pearl Mussels Using In Situ Exposure Methods

Bioindicação teste de adequação de ambiente de fluxo para jovens de água doce da pérola mexilhões usando métodos de exposição em Situ

Knowledge of habitat suitability for freshwater mussels is an important step in the conservation of this endangered species group. We describe a protocol ...

Methods for Image-based Surveys of Benthic Macroinvertebrates and Their Habitat Exemplified by the Drop Camera Survey for the Atlantic Sea Scallop

Métodos para pesquisas com base em imagem de macroinvertebrados bentônicos e seu Habitat, exemplificado pela pesquisa câmera Drop para o Oceano Atlântico Vieira

Underwater imaging has long been used in the field of marine ecology but decreasing costs of high-resolution cameras and data storage have made the ...

Experimental Study of the Relationship Between Particle Size and Methane Sorption Capacity in Shale

Estudo experimental da relação entre o tamanho de partícula e capacidade de adsorção de metano em xisto

The amount of adsorbed shale gas is a key parameter used in shale gas resource evaluation and target area selection, and it is also an important standard ...

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster (Nephrops norvegicus)

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus

Acompanhamento a longo prazo de vídeo de animais aquáticos, Cohoused: um estudo de caso da atividade locomotora diária do lagostim (Nephrops norvegicus)

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

Combined Size and Density Fractionation of Soils for Investigations of Organo-Mineral Interactions

Tamanho combinado e fracionamento de densidade de solos para as investigações de interações de Organo-Mineral

Combined size and density fractionation (CSDF) is a method used to physically separate soil into fractions differing in particle size and mineralogy. CSDF ...

Measuring the Shape and Size of Activated Sludge Particles Immobilized in Agar with an Open Source Software Pipeline

Medindo a forma e o tamanho das partículas de lodo ativado imobilizada em ágar com um Pipeline de Software de código aberto

Experimental bioreactors, such as those treating wastewater, contain particles whose size and shape are important parameters. For example, the size and ...

Combining Fluidic Devices with Microscopy and Flow Cytometry to Study Microbial Transport in Porous Media Across Spatial Scales

Combinando dispositivos fluidos com microscopia e citometria de fluxo para estudar transporte microbiano em mídia porosa em escalas espaciais

Understanding the transport, dispersion and deposition of microorganisms in porous media is a complex scientific task comprising topics as diverse as ...