Name: ion mobility-mass spectrometry techniques for determining the structure and mechanisms of metal ion recognition and redox activity of metal binding oligopeptides
Uploaded: 2019-09-07T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Ion Mobility-Mass Spectrometry Techniques for Determining the Structure and Mechanisms of Metal Ion Recognition and Redox Activity of Metal Binding Oligopepti

وتستند هذه المواد إلى العمل الذي تدعمه المؤسسة الوطنية للعلوم بموجب 1764436، ودعم أجهزة NSF (MRI-0821247)، ومؤسسة ويلش (T-0014)، وموارد الحوسبة من وزارة الطاقة (TX-W-20090427-0004-50) وL3 Communications . نشكر مجموعة باور من جامعة كاليفورنيا - سانتا باربرا لتقاسم برنامج سيغما وAyobami Ilesanmi لإظهار هذه التقنية في الفيديو.

1- إعداد الكواشف
<ol><li>ثقافة ميثيلوسينوس trichosporium OB3b، عزل Cu(I)-خالية من MB-OB3b18،22،23،تجميد الجافة العينة وتخزينها في -80 درجة مئوية حتى استخدامها.</li>
	<li>توليف الببتيدات أمب (> 98٪ نقاء لamb1،أمب2،أمب4؛ > 70٪ نقاء لamb7)،تجميد ...

الخطوات الحاسمة: الحفاظ على سلوكيات مرحلة الحل للفحص عن طريق ESI-IM-MS يجب استخدام إعدادات ESI الآلية الأصلية التي تحافظ على قياس الببتيدات، وحالة الشحن، والهيكل التوافقي. بالنسبة للظروف المحلية، يجب تحسين الظروف في مصدر ESI مثل الفولتية المخروطية ودرجات الحرارة وتدفقات الغاز. أيضا،...

أيونات النحاس والزنك ضرورية للكائنات الحية وحاسمة للعمليات بما في ذلك الحماية من الأكسدة، ونمو الأنسجة، والتنفس، والكوليسترول، والتمثيل الغذائي للجلوكوز، وقراءة الجينوم1. لتمكين هذه الوظائف، ومجموعات مثل ثيوليت من سايس، إيميدازول له2،3،(أكثر نادرا) ثيوثير من الميثيونين، وcarboxylate من غلو وAsp إدراج المعادن بشكل انتقائي كعوامل مساعدة في المواقع النشطة لل الإنزيمات المعدنية. ويثير التشابه بين مجموعات التنسيق هذه سؤالاً مثيراً للاهتمام فيما يتعلق بكيفية إدراج الأربطة له وشركة Cys بشكل انتقائي إما Cu(I/II) أو Zn(II) لضمان الأداء الصحيح.
وغالبا ما يتم تنفيذ الربط الانتقائي عن طريق اكتساب والاتجار الببتيدات، التي تسيطر على الزنك (II) أو Cu(I/II) تركيزات أيون4. Cu (I/II) هو رد فعل للغاية ويسبب الضرر التأكسدي أو الربط السبتي للإنزيمات، لذلك يتم تنظيم تركيزها الحر بإحكام من قبل مرافقي النحاس والبروتينات التي تنظم النحاس التي تنقلها بأمان إلى مواقع مختلفة في الخلية وبإحكام السيطرة على التوازن5،6. اضطراب التمثيل الغذائي للنحاس أو التوازن هو متورط مباشرة في مرض Menkes وويلسون7 وكذلك السرطانات7 والاضطرابات العصبية، مثل بريون8 ومرض الزهايمر9.
ويرتبط مرض ويلسون مع زيادة مستويات النحاس في العينين والكبد وأجزاء من الدماغ، حيث ردود فعل الأكسدة من Cu (I / II) تنتج أنواع الأكسجين التفاعلية، مما تسبب في انحطاط الكبد والعصبية. علاجات إزالة معدن ثقيل الموجودة هي الأحماض الأمينية الصغيرة ثيول بينيسيلامين وثلاثي إيثيلينتيترامين. بدلا من ذلك، والببتيدات methanotrophic النحاس اكتساب methanobactin (ميغابايت)10،11 تظهر الإمكانات العلاجية بسبب تقاربها ملزمة عالية لCu(I)12. عندما تمت دراسة ميثانوباكتين (mb-OB3b) من ميثيلوسينوس trichosporium OB3b في نموذج حيواني لمرض ويلسون، تمت إزالة النحاس بكفاءة من الكبد وتفرز من خلال الصفراء13. في التجارب المختبرية أكدت أن MB-OB3b يمكن أن مخلب النحاس من metallothionein النحاس الواردة في الكبد cytosol13. وقد بحثت تقنيات التصوير بالتحليل الطيفي الكتلي للاستئصال بالليزر في التوزيع المكاني للنحاس في عينات كبد مرض ويلسون14و15و16، وأظهرت أن mb-OB3b يزيل النحاس مع فترات معالجة قصيرة من 8 أيام فقط17.
كما سيتم ربط MB-OB3b مع أيونات معدنية أخرى، بما في ذلك Ag(I) وAu(III) وPb(II) وMn(II) و Co(II) وFe(II) وNi(II) وZn(II)18و19. يتم عرض المنافسة على موقع الربط Cu(I) الفسيولوجية من قبل Ag(I) لأنه يمكن أن تحل محل Cu(I) من مجمع mb-OB3b، مع كل من Ag(I) و Ni(II) كما تظهر ملزمة لا رجعة فيها لMb التي لا يمكن إزاحتها من قبل Cu(I)19. في الآونة الأخيرة، وقد درست سلسلة من الماثانوبكتين البديلة (أمب) oligopeptides مع عزر 2His-2Cysملزمة 20،21،والزنك (II) وCu (I / II) خصائص ملزمة تتميز. تسلسل الأحماض الأمينية الأولية متشابهة، وأنها تحتوي على كل عزر 2His-2Cys، برو وأسيتيلاتي N-terminus. وهي تختلف أساسا عن MB-OB3b لأن عزر 2His-2Cys يحل محل موقعين ربط oxazolone enethiol من MB-OB3b.
يوفر التأين الكهربائي المقترن بقياس الطيف الكتلي للأيون (ESI-IM-MS) تقنية مفيدة قوية لتحديد خصائص الببتيدات الملزمة بالمعادن لأنها تقيس من الكتلة إلى الشحن(م/ض)والاصطدام المقطع العرضي (CCS) مع الحفاظ على كتلتهم، تهمة، وشكل المطابقة من مرحلة الحل. وm /z وCCS تتعلق بالببتيدات stoichiometry، حالة البروتونيشن، وشكل المطابقة. يتم تحديد قياس التبشّر لأن هوية وعدد كل عنصر موجود في الأنواع يتم تحديده بوضوح. التهمة الإجمالية لمجمع الببتيد تتعلق بحالة البروز للمواقع الحمضية والأساسية وحالة الأكسدة لأيون (أيون) المعادن. يعطي CCS معلومات عن الشكل المطابقة لمجمع الببتيد لأنه يقيس الحجم المتوسط التناوب الذي يتعلق بالهيكل الثالث للمجمع. حالة الشحن العام للمجمع هو أيضا وظيفة من درجة الحموضة ويؤثر على تقارب ربط أيون المعادن الببتيد لأن المواقع الأساسية أو الحمضية deprotonated مثل carboxyl، له، Cys وTyr هي أيضا مواقع ملزمة المحتملة لأيون المعادن. للتحليلات، يتم إعداد الببتيد وأيون المعادن في حلول مائية مع الحموضة المعدلة عن طريق تخفيف حمض الخليك المائي أو هيدروكسيد الأمونيوم. وهذا يسمح للاعتماد على الحموضة وانتقائية الأيون المعدنية التي سيتم تحديدها للبببتيد. وعلاوة على ذلك، يمكن استخدام الـ m/z وCCS التى يحددها ESI-IM-MS مع النمذجة الجزيئية B3LYP/LanL2DZ لاكتشاف نوع تنسيق أيون المعادن والهيكل الثالثي للمجمع. النتائج المبينة في هذه المقالة تكشف كيف ESI-IM-MS يمكن أن تميز الأداء الانتقائي مخلب مجموعة من الببتيدات أمب ومقارنتها بالببتيد النحاس ملزمة MB-OB3b.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>acetonitrile HPLC-grade</td>
			<td>Fisher Scientific (www.Fishersci.com)</td>
			<td>A998SK-4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ammonium hydroxide (trace metal grade)</td>
			<td>Fisher Scientific (www.Fishersci.com)</td>
			<td>A512-P500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>cobalt(II) chloride hexahydrate 99.99%</td>
			<td>Sigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com)</td>
			<td>255599-5G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>copper(II) chloride 99.999%</td>
			<td>Sigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com)</td>
			<td>203149-10G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>copper(II) nitrate hydrate 99.99%</td>
			<td>Sigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com)</td>
			<td>229636-5G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>designed amb1,2,3,4,5,6,7 peptides</td>
			<td>Neo BioLab (neobiolab.com)</td>
			<td></td>
			<td>designed peptides were synthized by order</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>designed amb5B,C,D,E,F peptides</td>
			<td>PepmicCo (www.pepmic.com)</td>
			<td></td>
			<td>designed peptides were synthized by order</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Driftscope 2.1 software program</td>
			<td>Waters (www.waters.com)</td>
			<td></td>
			<td>software analysis program</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Freeze-dried, purified, Cu(I)-free mb-OB3b</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>cultured and isolated in the lab of Dr. DongWon Choi (Biology Department, Texas A&#38;M-Commerce)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>glacial acetic acid (Optima grade)</td>
			<td>Fisher Scientific (www.Fishersci.com)</td>
			<td>A465-250</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Iron(III) Chloride Anhydrous 98%+</td>
			<td>Alfa Aesar (www.alfa.com)</td>
			<td>12357-09</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>lead(II) nitrate ACS grade</td>
			<td>Avantor (www.avantormaterials.com)</td>
			<td>128545-50G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>manganese(II) chloride tetrahydrate 99.99%</td>
			<td>Sigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com)</td>
			<td>203734-5G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MassLynx 4.1</td>
			<td>Waters (www.waters.com)</td>
			<td></td>
			<td>software analysis program</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>nickel chloride hexahydrate 99.99%</td>
			<td>Sigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com)</td>
			<td>203866-5G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>poly-DL-alanine</td>
			<td>Sigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com)</td>
			<td>P9003-25MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>silver nitrate 99.9%+</td>
			<td>Alfa Aesar (www.alfa.com)</td>
			<td>11414-06</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Waters Synapt G1 HDMS</td>
			<td>Waters (www.waters.com)</td>
			<td></td>
			<td>quadrupole - ion mobility- time-of-flight mass spectrometer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>zinc chloride anhydrous</td>
			<td>Alfa Aesar (www.alfa.com)</td>
			<td>A16281</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

ion mobility-mass spectrometry techniques for determining the structure and mechanisms of metal ion recognition and redox activity of metal binding oligopeptides

يمكن للأيونات الكهربائية (ESI) نقل الببتيد المائي المرحلة أو مجمع الببتيد إلى مرحلة الغاز مع الحفاظ على كتلته، والشحنة الإجمالية، والتفاعلات ملزمة للمعادن، والشكل المطابقة. يوفر اقتران ESI مع قياس الطيف الكتلي للتنقل أيون (IM-MS) تقنية مفيدة تسمح بالقياس المتزامن للبببببوب من الكتلة إلى الشحن (م/ض) والمقطع العرضي للتصادم (CCS) الذي يتعلق بالقياس إلى السطواط، حالة البروز، وشكل المطابقة. يتم التحكم في الشحنة الإجمالية لمجمع الببتيد من قبل protonation من 1) المواقع الحمضية والأساسية للبببتيد و 2) حالة الأكسدة من أيون (ق) المعادن. ولذلك، فإن حالة الشحن الكلي للمجمع هي وظيفة من درجة الحموضة من الحل الذي يؤثر على الببتيدات المعادن أيون تقارب ملزمة. بالنسبة لتحليلات ESI-IM-MS، يتم إعداد حلول الببتيد والأيونات المعدنية من حلول مائية فقط، مع ضبط درجة الحموضة مع حمض الخليك المائي المخفف أو هيدروكسيد الأمونيوم. وهذا يسمح للاعتماد على الحموضة وانتقائية الأيون المعدنية التي سيتم تحديدها لببتيد معين. وعلاوة على ذلك، يمكن استخدام م / ض وCCS من مجمع الببتيد مع B3LYP / LanL2DZ النمذجة الجزيئية لتمييز مواقع ملزمة لتنسيق أيون المعادن والهيكل الثالثي للمجمع. تظهر النتائج كيف يمكن لESI-IM-MS أن تميز الأداء الانتقائي لمجموعة من ببتيدات الميثانوباكتين البديلة ومقارنتها بالببتيد اتانوباكتين الملزم بالنحاس.

ربط المعادن من amb1 وأظهرت دراسة IM-MS20 من amb1 (الشكل 1A) أن كل من أيونات النحاس والزنك ملزمة لamb1 بطريقة تعتمد على درجة الحموضة(الشكل 2). ومع ذلك، النحاس والزنك ملزمة إلى amb1 من خلال آليات رد فعل مختلفة في مواق?...

Watch this Scientific Journal Video about Ion Mobility-Mass Spectrometry Techniques for Determining the Structure and Mechanisms of Metal Ion Recognition and Redox Activity of Metal Binding Oligopepti

Ion Mobility-Mass Spectrometry Techniques for Determining the Structure and Mechanisms of Metal Ion Recognition and Redox Activity of Metal Binding Oligopeptides

يمكن أن يتسم قياس الطيف الكتلي للأيون وتقنيات النمذجة الجزيئية بالأداء الانتقائي للربط المعدني للببتيدات المصممة الملزمة بالمعادن والببتيد المربط بالنحاس ميثانوباكتين. تطوير فئات جديدة من الببتيدات المعدنية مخلب يساعد على أن يؤدي إلى العلاجات للأمراض المرتبطة بسوء التوازن الأيون المعادن.

تقنيات قياس الطيف الكتلي للتنقل من أيون لتحديد بنية وآليات التعرف على الأيون المعدني ونشاط الأكسدة من Oligopeptides التجليد المعدني

Electrospray ionization (ESI) can transfer an aqueous-phase peptide or peptide complex to the gas-phase while conserving its mass, overall charge, ...

أيونات الحركة الكتلة الطيفية، أو IM-MS، تحديد أيونات المنتجات المختلفة من الأكسدة الحمراء المعتمدة على درجة الH وميثيل ملزمة تفاعل الببتيدات. مع النمذجة الجزيئية لهيكلها الثالثي ، يمكن تحديد ارتباط المعادن. يمكن IM-MS حل كل من أيونات المنتج وتحديد تكوينها الجزيئي من خلال قياس وقت واحد من كتلة إلى الشحنة والوصول وفيما يتعلق قياس stoichiometry، حالة البروتون، وهيكلها التشكل.وسوف تساعد تطوير فئات من الببتيدات المعدنية التهيج تؤدي إلى علاجات للأمراض المرتبطة باختلال التوازن الأيوني المعدني، مثل مينكيس ومرض ويلسون، والسرطان، ومرض الزهايمر. للبدء، تنظيف أنابيب مدخل ESI وعشوطة إبرة تماما مع حوالي 500 ميكرولترات من 0.1 حمض الخليك الجليدية الضرس، 0.1 الولي الأمونيوم هيدروكسيد، وأخيرا، المياه ديونيد. استخدام شروط ESI-IM-MS الأصلي كما هو موضح في بروتوكول النص لجمع أطياف IM-MS الإيونات السالبة والإيجابية من حل poly-DL-ألانين 10 جزء في المليون لمدة 10 دقائق لكل من هذه الدقائق.Pipette 200.0 ميكرولترات من 0.125 ميليمولار البديل الميثانول، أو حل amb، في 1.7 قنينة ملليلتر. تمييع مع 500 ميكرولترات من المياه ديوند وخلط الحل جيدا. ضبط درجة الحموضة من العينة إلى 3.0 بإضافة 50 ميكرولترات من 1.0 حمض الخلية المولية حل.أضف 200.0 ميكرولترات من أيونات المعادن 0.125 ملليمولر إلى العينة المعدلة حسب مستوى الـ PH. ثم، إضافة المياه deionized إلى إنتاج حجم النهائي من 1.00 ملليلتر من العينة. تخلط جيدا، والسماح للعينة لتكواسير لمدة 10 دقائق في درجة حرارة الغرفة.باستخدام حقنة الأنف حادة، واتخاذ 500 ميكرولترات من العينة وجمع السلبية والإيجابية ESI-IM-MS أطياف لمدة خمس دقائق لكل من. استخدم الـ 500 ميكرولترات المتبقية للعينة لتسجيل الرقم القياسي النهائي باستخدام أقطاب قياس الرقم الـ 4 الدقيقة معايرة. كرر هذه الخطوات، باستثناء لضبط الأس هيدروك مع أربعة، خمسة، ستة، سبعة، ثمانية، تسعة، أو 10، عن طريق إضافة كميات جديدة من حمض الخليك أو محلول هيدروكسيد الأمونيوم.جمع السلبية والإيون ESI-IM-MS أطياف الحلول الناتجة لمدة 10 دقائق لكل من. من أطياف IM-MS، تحديد الأنواع المشحونة من الميثانول البديل الموجودة من خلال مطابقتها لأنماط نظائرها النظرية من الكتلة إلى الشحنة. للقيام بذلك، افتح MassLynx وانقر على الكروماتوجرام لفتح إطار الكروم.انتقل إلى القائمة ملف وفتح لتحديد موقع وفتح ملف البيانات IM-MS. استخراج الطيف IM-MS بالنقر بزر الماوس الأيمن، وسحب عبر الكروماتوغرام، والإفراج. سيتم فتح نافذة الطيف، والتي تظهر طيف IM-MS.في نافذة الطيف، انقر على الأدوات ونموذج النظائر. في نافذة نميم النظائر، أدخل الصيغة الجزيئية لأنواع amb، وتحقق من مربع إظهار الأيونات المشحونة، وأدخل حالة الشحن. انقر فوق موافق. كرر هذه العملية لتحديد جميع الأنواع في طيف IM-MS، وتسجيل نطاق النظائر الشامل إلى الشحن.لكل نوع من أنواع الـ amb، قم بفصل أي نوع من الأنواع من قبيل الصدفة من الشامل إلى الشحن واستخرج توزيعات وقت الوصول، أو ATDs، باستخدام أنماط النظائر الشاملة إلى الشحن لتحديدها. افتح DriftScope وانقر على ملف وفتح لتحديد موقع وفتح ملف البيانات IM-MS. استخدام الماوس وانقر على اليسار لتكبير على نمط نظائر الشامل إلى تهمة من الأنواع amb.استخدم أداة التحديد وزر الماوس الأيسر لتحديد نمط النظائر. انقر فوق الزر قبول التحديد الحالي. لفصل أي الأنواع من قبيل الصدفة الشامل إلى تهمة، استخدم أداة الاختيار وزر الماوس الأيسر لتحديد وقت ATD الانحياز مع نمط النظائر من الأنواع amb.انقر فوق الزر قبول التحديد الحالي. لتصدير ATD، انتقل إلى ملف، تصدير إلى MassLynx. ثم حدد الاحتفاظ بوقت الانجراف وحفظ الملف إلى المجلد المناسب.في إطار الكروماتوغرافيا MassLynx، افتح الملف الذي تم تصديره. انقر على عملية ، دمج من القائمة ، والتحقق من ApexTrack الذروة التكامل مربع ، وانقر فوق موافق. سجل المركزية والمنطقة المتكاملة من ATD. بعد تكرار هذه العملية لجميع حفظ amb وبولي دل ألانين IM-MS ملفات البيانات، واستخدام ATD متكاملة لجميع أنواع amb المستخرجة إما الإيجابية أو الأيونات السالبة في كل نقطة المعايرة لتطبيع إلى مقياس النسبة المئوية النسبية.للقيام بذلك، أدخل هويات الأنواع amb و ATD المتكاملة الخاصة بها في كل رقم هـي في جدول بيانات. لكل درجة من السّكّر، استخدم مجموع الـ ATDات المتكاملة لتطبيع أنواع الـ AMB إلى مقياس النسبة المئوية. رسم كثافة في المئة من كل الأنواع amb مقابل درجة الH لإظهار كيف يختلف عدد السكان من كل نوع كدالة من درجة اله pH.باستخدام جدول بيانات، تحويل المقاطع العرضية الاصطدام من متعدد DL ألانين الأيونات السالبة والإيجابية تقاس في غاز عازلة الهيليوم إلى أقسام عرضية الاصطدام تصحيحها. ثم، تحويل متوسط أوقات الوصول من كاليبرانت بولي-DL-ألانين وأنواع المومب إلى أوقات الانجراف. سد مرات poly-DL-ألانين calibrants'الانجراف مقابل المقاطع العرضية الاصطدام تصحيحها.ثم، باستخدام أقل المربعات تناسب الانحدار، وتحديد القيم الرئيسية وB، حيث هو رئيس هو التصحيح لدرجة الحرارة، والضغط، ومعلمات المجال الكهربائي، و B يعوض عن تأثير غير الخطي لجهاز IM. باستخدام هذه القيم رئيس الوزراء وB مع قيمة مرات الانجراف المركزية، وتحديد المقاطع العرضية الاصطدام تصحيحها والأقسام العرضية تصادم بهم. هذه الطريقة توفر الاقسام العرضية اصطدام لأنواع الببتيد مع أخطاء مطلقة تقدر بنحو 2٪ باستخدام غاوسي مع غاوسفيو، ومستوى B3LYP LanL2DZ من النظرية، وتحديد موقع هندسة الأمثل المطابقة لجميع أنواع ممكنة من التنسيقات من الأنواع amb الشامل إلى تهمة لوحظ.ويتألف مستوى B3LYP LanL2DZ من النظرية من بيك ثلاثة محيط وظائف الهجين، ومجموعة الأساس Dunning، وإمكانات الأساسية الإلكترون. استخراج التحليلات الحرارية لكل من المطابقة الأمثل من ملف الإخراج غاوسي وحساب المقاطع العرضية الاصطدام النظرية باستخدام طريقة لينارد جونز تحجيم أيون من برنامج سيغما. من أدنى المطابقة للطاقة الحرة، وتحديد المطابقة التي يعرض لينارد جونز الاصطدام المقطع العرضي الذي يتفق مع المقطع العرضي تصادم IM-MS قياس.وتحدد هذه العملية الهيكل الثالثي ونوع التنسيق للمواتير التي لوحظت في التجربة. النمذجة الجزيئية يتطلب مقارنة الطاقة الحرة والاصطدام المقاطع العرضية من المطابقة مع مختلف مواقع chelating المعدنية، رابطة الدول المستقلة والسندات عبر الببتيد، والجسور الملح، والترابط الهيدروجين، والتفاعلات بي الموجبة. وأظهرت دراسة IM-MS للميثانول البديلة واحدة أنه استخرجت كل من النحاس والزنك أيونات بطريقة تعتمد على درجة الH، ولكن من خلال آليات رد فعل مختلفة ومواقع التنسيق.ولوحظ ربط الزنك (II) عند درجة هيدروكية أكبر من ستة، مما يشكل في المقام الأول مركباً واحداً مشحوناً سلباً، مما يشير إلى أن الزنك (II) كان بتنسيق رباعي الهيدرِلي من قبل الإيميدازولات واثنين من الثّيولات. النحاس (II) وكان مصحوبا بربط thiols تشكيل جسر كبريتيد. في درجة الأسكية أكبر من ستة، تم تشكيل النحاس واحد اتهم سلبا (II) مجمع، مما يدل على imidazole واثنين من النيتروجين أميد deprotonated كانت تنسق النحاس (II)ومع ذلك، أقل من درجة الH ستة، مضيفا النحاس (II) شكلت أيضا النحاس (I) واحد مشحونة إيجابية(I)المعقدة، فضلا عن النحاس واحد مشحونة إيجابية (II) مجمع فوق درجة اله.كما تظهر دراسات IM-MS لـ amb two و amb 4 أن التفاعلات النحاسية أعطت منتجات تختلف في أعداد جسور ثنائي الكبريتيد بين أو داخل الجزيئات، وعدد من النحاس (I) أو النحاس (II) أيونات، وعدد مواقع إزالة البروتون، والتي تغيرت كدالة للرقم الهئيني. وأظهرت نتيجة IM-MS مع النمذجة الجزيئية أن الميثانول البديل يمكن تنسيق ما يصل إلى ثلاثة نحاس (I) أيونات عبر ثيولاتي، إيميدازوليس، ومجموعات الكربوكسيلات. يجب اختيار إعدادات IM-MS الفعالة بعناية للحفاظ على قياس الببتيدات، وتوزيعات الشحن، والهياكل التكتكية، كما هو موضح في النص.مزيج من مجموعة أوسع من الحجم التي سوف تؤثر على التنسيق المعادن مثل التيروزين في حمض الأسبارتيك سوف تسمح بفهم أكبر للعلاقة بين الهيكل والوظيفة. IM-MS مع النمذجة الجزيئية أصبحت تقنيات بديلة لتسريع علم البلورات و NMR الطيفي لتحديد الهياكل التشكلية من البروتينات والحمض النووي والدهون، ومجمعاتها.

Research

Education

JoVE Journal

JoVE Core

Chemistry

Atoms and Elements

SCIENTISTS IN ACTION

Structure and Coordination Determination of Peptide-metal Complexes Using 1D and 2D 1H NMR

Structure and Coordination Determination of Peptide-metal Complexes Using 1D and 2D 1H NMR

Copper (I) binding by metallochaperone transport proteins prevents copper oxidation and release of the toxic ions that may participate in harmful redox ...

Anticancer Metal Complexes: Synthesis and Cytotoxicity Evaluation by the MTT Assay

المضادة للسرطان المعادن مجمعات: التجميعي والتقييم السمسة قبل الفحص الإنتقالي العسكري

Titanium (IV) and vanadium (V) complexes are highly potent anticancer agents. A challenge in their synthesis refers to their hydrolytic instability; ...

Analyzing the Photo-oxidation of 2-propanol at Indoor Air Level Concentrations Using Field Asymmetric Ion Mobility Spectrometry

تحليل الصور-أكسدة 2-بروبانول بتركيزات مستوى الهواء في الأماكن المغلقة باستخدام حقل أيون غير المتناظر التنقل قياس الطيف الكتلي

We demonstrate a versatile protocol to be used for determining the effectiveness of photocatalysts in degrading indoor air concentration (ppb) volatile ...

Determining the Chemical Composition of Corrosion Inhibitor/Metal Interfaces with XPS: Minimizing Post Immersion Oxidation

تحديد التركيب الكيميائي لالمانع للتآكل واجهات / المعادن مع XPS: التقليل المشاركة الغمر الأكسدة

An approach for acquiring more reliable X-ray photoelectron spectroscopy data from corrosion inhibitor/metal interfaces is described. More specifically, ...

Ligand-Mediated Nucleation and Growth of Palladium Metal Nanoparticles

يجند بوساطة التنو ونمو البلاديوم معدنية جسيمات نانوية

The size, size distribution and stability of colloidal nanoparticles are greatly affected by the presence of capping ligands. Despite the key contribution ...

Surface Functionalization of Metal-Organic Frameworks for Improved Moisture Resistance

الروغان السطحية من الأطر المعدنية العضوية لمقاومة الرطوبة محسنة

Metal-organic frameworks (MOFs) are a class of porous inorganic materials with promising properties in gas storage and separation, catalysis and sensing. ...

Imaging Corrosion at the Metal-Paint Interface Using Time-of-Flight Secondary Ion Mass Spectrometry

التصوير التاكل في واجهه الطلاء المعدني باستخدام مقياس الطيف الطيفي الثانوي لأيونات الطيران

Corrosion developed at the paint and aluminum (Al) metal-paint interface of an aluminum alloy is analyzed using time-of-flight secondary ion mass ...

Quantification of Metal Leaching in Immobilized Metal Affinity Chromatography

القياس الكمي للنض المعدني في الفصل اللوني لتقارب المعادن

Contamination of enzymes with metals leached from immobilized metal affinity chromatography (IMAC) columns poses a major concern for enzymologists, as ...

Identification and Quantification of Decomposition Mechanisms in Lithium-Ion Batteries; Input to Heat Flow Simulation for Modeling Thermal Runaway

تحديد وقياس آليات التحلل في بطاريات الليثيوم أيون ؛ مدخلات لمحاكاة تدفق الحرارة لنمذجة الهروب الحراري

The risks and possible accidents related to the normal use of lithium-ion batteries remain a serious concern. In order to get a better understanding of ...