Name: immunoglobulin g n-glycan analysis by ultra-performance liquid chromatography
Uploaded: 2020-01-18T12:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Immunoglobulin G N-Glycan Analysis by Ultra-Performance Liquid Chromatography at JoVE.com

Bu çalışma, Çin Ulusal Doğa Bilimleri Vakfı (81673247 & 81872682) ve Avustralya-Çin İşbirlikçi Hibe (NH & MRC - APP1112767 -NSFC 81561128020) tarafından desteklenmiştir.

Protokolde yer alan tüm konular Sermaye Tıp Üniversitesi Etik Komitesi tarafından onaylanmıştır, Pekin, Çin12. Çalışmanın başında her konudan yazılı bilgilendirilmiş onay alındı.
1. IgG izolasyon
<ol><li>Bağlayıcı tampon (fosfat tamponlu salin, PBS): 1x PBS (pH = 7.4), nötralize tampon: 10x PBS (pH = 6.6-6.8), elüent: 0.1 M formik asit (pH = 2.5), elüent için çözelti nötralize: 1 ammonium bikarbonat, depolanan% 20: etanol + 20 mM Tris + 0,...

<ol>
	<li>Kolarich, D., Lepenies, B., Seeberger, P. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glycomics,+glycoproteomics+and+the+immune+system.">Glycomics, glycoproteomics and the immune system.</a> Current Opinion in Chemical Biology. 16, 214 (2012).</li><li>Cummings, R., Pierce, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Challenge+and+Promise+of+Glycomics.">The Challenge and Promise of Glycomics.</a> Chemistry Biology. 21 (1), (2014).</li><li>Shade, K. T. C., Anthony, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antibody+Glycosylation+and+Inflammation.">Antibody Glycosylation and Inflammation.</a> Antibodies. 2, 392 (2013).</li><li>Gudelj, I., Lauc, G., Pezer, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immunoglobulin+G+glycosylation+in+aging+and+diseases.">Immunoglobulin G glycosylation in aging and diseases.</a> Cellular Immunology. 333, 65 (2018).</li><li>Huffman, J. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparative+performance+of+four+methods+for+high-throughput+glycosylation+analysis+of+immunoglobulin+G+in+genetic+and+epidemiological+research.">Comparative performance of four methods for high-throughput glycosylation analysis of immunoglobulin G in genetic and epidemiological research.</a> Molecular Cellular Proteomics. 13, 1598 (2014).</li><li>Stockmann, H., Adamczyk, B., Hayes, J., Rudd, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Automated,+high-throughput+IgG-antibody+glycoprofiling+platform.">Automated, high-throughput IgG-antibody glycoprofiling platform.</a> Analytical Chemistry. 85, 8841 (2013).</li><li>Kristic, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glycans+are+a+novel+biomarker+of+chronological+and+biological+ages.">Glycans are a novel biomarker of chronological and biological ages.</a> Journals of Gerontology. Series A, Biological Sciences Medical Sciences. 69, 779 (2014).</li><li>Nikolac, P. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+association+between+galactosylation+of+immunoglobulin+G+and+body+mass+index.">The association between galactosylation of immunoglobulin G and body mass index.</a> Progress in Neuropsychopharmacology Biological Psychiatry. 48, 20 (2014).</li><li>Liu, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+changes+of+immunoglobulin+G+N-glycosylation+in+blood+lipids+and+dyslipidaemia.">The changes of immunoglobulin G N-glycosylation in blood lipids and dyslipidaemia.</a> Journal of Translational Medicine. 16, 235 (2018).</li><li>Lemmers, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=IgG+glycan+patterns+are+associated+with+type+2+diabetes+in+independent+European+populations.">IgG glycan patterns are associated with type 2 diabetes in independent European populations.</a> Biochimica Biophysica Acta General Subjects. 1861, 2240 (2017).</li><li>Wang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Association+Between+Glycosylation+of+Immunoglobulin+G+and+Hypertension:+A+Multiple+Ethnic+Cross-Sectional+Study.">The Association Between Glycosylation of Immunoglobulin G and Hypertension: A Multiple Ethnic Cross-Sectional Study.</a> Medicine (Baltimore). 95, e3379 (2016).</li><li>Liu, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ischemic+stroke+is+associated+with+the+pro-inflammatory+potential+of+N-glycosylated+immunoglobulin+G.">Ischemic stroke is associated with the pro-inflammatory potential of N-glycosylated immunoglobulin G.</a> Journal of Neuroinflammation. 15, 123 (2018).</li><li>Russell, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+N-glycosylation+of+immunoglobulin+G+as+a+novel+biomarker+of+Parkinson's+disease.">The N-glycosylation of immunoglobulin G as a novel biomarker of Parkinson's disease.</a> GLYCOBIOLOGY. 27, 501 (2017).</li><li>Bones, J., Mittermayr, S., O'Donoghue, N., Guttman, A., Rudd, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ultra+performance+liquid+chromatographic+profiling+of+serum+N-glycans+for+fast+and+efficient+identification+of+cancer+associated+alterations+in+glycosylation.">Ultra performance liquid chromatographic profiling of serum N-glycans for fast and efficient identification of cancer associated alterations in glycosylation.</a> Analytical Chemistry. 82, 10208 (2010).</li><li>Pucic, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High+throughput+isolation+and+glycosylation+analysis+of+IgG-variability+and+heritability+of+the+IgG+glycome+in+three+isolated+human+populations.">High throughput isolation and glycosylation analysis of IgG-variability and heritability of the IgG glycome in three isolated human populations.</a> Molecular Cellular Proteomics. 10, M111 (2011).</li><li>Berruex, L. G., Freitag, R., Tennikova, T. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+antibody+binding+to+immobilized+group+specific+affinity+ligands+in+high+performance+monolith+affinity+chromatography.">Comparison of antibody binding to immobilized group specific affinity ligands in high performance monolith affinity chromatography.</a> Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. 24, 95 (2000).</li><li>Ren, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Distribution+of+IgG+galactosylation+as+a+promising+biomarker+for+cancer+screening+in+multiple+cancer+types.">Distribution of IgG galactosylation as a promising biomarker for cancer screening in multiple cancer types.</a> Cell Research. 26, 963 (2016).</li></ol>

UPLC göreceli nicel analizyöntemi5,15olarak hizmet vermektedir. Sonuçlar UPLC iyi tekrarlanabilirlik ve göreceli nicel doğruluk ile istikrarlı bir algılama teknolojisi olduğunu göstermektedir. Her tepedeki glikan miktarı, göreli değer olan UPLC kullanılarak toplam tümleşik alanın yüzdesi olarak ifade edilir. Göreli nicelik, test örneklerinin karşılaştırılabilirliğini artırır. Buna ek olarak, 96 iyi protein G plakaları yüksek iş lenme...

N-insan proteinlerinin glikozilasyon yaygın ve temel post-translational modifikasyon1 ve nispeten doğru hastalıkların oluşumu ve gelişimini tahmin yardımcı olabilir. Yapısının karmaşıklığı nedeniyle, 5.000'den fazla glikan yapısı olması beklenmektedir, hastalıklar için tanısal ve tahmine dayalı biyobelirteçler olarak büyük bir potansiyel sağlayan2. N -glikanlar immünglobulin G bağlı (IgG) IgG fonksiyonu için gerekli olduğu gösterilmiştir, ve IgG N-glikozilasyon pro- ve anti-inflamatuar sistemler arasındaki dengeye katılır3. Diferansiyel IgG N-glikozilasyon hastalık gelişimi ve ilerlemesinde rol oynar ve hastalık patolojisinde yer alan yatkınlık ve fonksiyonel mekanizmayı temsil emdir. IgG N-glikozilasyon inflamatuar rolü yaşlanma ile ilişkili olmuştur, inflamatuar hastalıklar, otoimmün hastalıklar, ve kanser4.
Algılama teknolojisinin geliştirilmesi ile, aşağıdaki yöntemler en yaygın olarak yüksek iş yapma glycomics kullanılır: hidrofilik etkileşim kromatografisi (HILIC) floresan saptama ile ultra-performans sıvı kromatografisi (UPLC-FLR), lazer indüklenen flor ile multipleks kapiller jel elektroforezi eskuss algılama (xCGE-LIF), matris destekli lazer desorpsiyon/iyonizasyon zaman-of-flight kütle spektrometresi (MALDI-TOF-MS) ve sıvı kromatografi elektrosprey kütle spektrometresi (LC-ESI-MS) . Bu yöntemler düşük akı önceki eksiklikleri aşmak var, kararsız sonuçlar, ve kötü duyarlılık özgüllüğü5,6.
UPLC yaygın IgG N-glikozilasyon ve bazı hastalıklar arasındaki ilişkiyi keşfetmek için kullanılır (yani, yaşlanma7, obezite8, dislipidemi9, tip II diyabet10, hipertansiyon11, iskemik inme12, ve Parkinson hastalığı13). Yukarıda belirtilen diğer üç yöntemle karşılaştırıldığında, UPLC aşağıdakiavantajlarasahiptir 5,14. İlk olarak, göreceli bir nicel analiz yöntemi sağlar ve toplam alan normalleştirme içeren veri analizi her örnek karşılaştırılabilirliğini artırır. İkinci olarak, ekipman maliyeti ve gerekli uzmanlık nispeten düşüktür, bu da glikozilasyon biyobelirteçlerinin klinik uygulamalara uygulanmasını ve dönüştürülmesini kolaylaştırır. Daha yaygın olarak kullanılabilir böylece Burada Sunulan UPLC bir giriştir.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>2-aminobenzamide, 2-AB</td>
			<td>Sigma, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96-well collection plate</td>
			<td>AXYGEN</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96-well filter plate</td>
			<td>Pol</td>
			<td>0.45 um GHP</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96-well monolithic plate</td>
			<td>BIA Separations</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96-well plate rotor</td>
			<td>Eppendorf Co., Ltd, Germany</td>
			<td>T_1087461900</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acetic acid</td>
			<td>Sigma, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acetonitrile</td>
			<td>Huihai Keyi Technology Co., Ltd, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium bicarbonate</td>
			<td>Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium formate</td>
			<td>Beijing Minruida Technology Co., Ltd.</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Constant shaking incubator/rocker</td>
			<td>Zhicheng analytical instrument manufacturing co., Ltd, China</td>
			<td>ZWY-10313</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dextran Calibration Ladder/Glycopeptide column</td>
			<td>Watts technology Co., Ltd, China</td>
			<td>BEH column</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dimethyl sulfoxide (DMSO)</td>
			<td>Sigma, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Disodium phosphate</td>
			<td>Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Electric ovens</td>
			<td>Tester instruments Co., Ltd</td>
			<td>202-2AB</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Empower 3.0</td>
			<td>Waters technology Co., Ltd, America</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethanol</td>
			<td>Huihai Keyi Technology Co., Ltd, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Formic acid</td>
			<td>Sigma, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>GlycoProfile 2-AB Labeling kit</td>
			<td>Sigma, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HCl</td>
			<td>Junrui Biotechnology Co., Ltd, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>High-speed centrifuge</td>
			<td>Eppendorf Co., Ltd, Germany</td>
			<td>5430</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Igepal</td>
			<td>Sigma, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Low temperature centrifuge</td>
			<td>Eppendorf Co., Ltd, Germany</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Low temperature refrigerator</td>
			<td>Qingdao Haier Co., Ltd</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Manifold 96-well plate</td>
			<td>Watts technology Co., Ltd, China</td>
			<td>186001831</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Huihai Keyi Technology Co., Ltd, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Milli-Q pure water meter</td>
			<td>Millipore Co., Ltd, America</td>
			<td>Advantage A10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NaOH</td>
			<td>Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PH tester</td>
			<td>Sartorius Co., Ltd, Germany</td>
			<td>PB-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphate buffered saline, PBS</td>
			<td>Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pipette</td>
			<td>Eppendorf Co., Ltd, Germany</td>
			<td>4672100, 0.5-10&#956;l &#38; 10-100&#956;l &#38; 20-200&#956;l &#38; 1000&#956;l</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PNGase F enzyme</td>
			<td>Sigma, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Potassium dihydrogen phosphate</td>
			<td>Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Propan-2-ol</td>
			<td>Huihai Keyi Technology Co., Ltd, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SDS</td>
			<td>Sigma, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium chloride</td>
			<td>Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium cyanoborohydride (NaBH3CN)</td>
			<td>Sigma, China</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Spectrophotometer</td>
			<td>Shanghai Yuanxi instrument Co., Ltd</td>
			<td>B-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Transfer liquid gun</td>
			<td>Smer Fell Science and Technology Co., Ltd, China</td>
			<td>4672100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tris</td>
			<td>Amresco, America</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ultra-low temperature refrigerator</td>
			<td>Thermo Co., Ltd, America</td>
			<td>MLT-1386-3-V; MDF-382E</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ultra-performance liquid chromatography</td>
			<td>Watts technology Co., Ltd, China</td>
			<td>Acquity MLtraPerformance LC</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vacuum Pump</td>
			<td>Watts technology Co., Ltd, China</td>
			<td>725000604</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Volatilizing machine/Dryer</td>
			<td>Eppendorf Co., Ltd, Germany</td>
			<td>T_1087461900</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vortex</td>
			<td>Changzhou Enpei instrument Co., Ltd, China</td>
			<td>NP-30S</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Water-bath</td>
			<td>Tester instruments Co., Ltd</td>
			<td>DK-98-IIA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Weighing balance</td>
			<td>Shanghai Jingke Scientific Instrument Co., Ltd.</td>
			<td>MP200B</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

immunoglobulin g n-glycan analysis by ultra-performance liquid chromatography

Glycomics hastalık yatkınlığı, ilaç hedef keşif ve hassas tıp için yeni nesil biyobelirteçler keşfetmek önemli bir potansiyel sunan omics sistem araştırmayeni bir alt uzmanlık olduğunu. Alternatif IgG N-glikanlar çeşitli yaygın kronik hastalıklarda bildirilmiştir ve klinik uygulamalarda büyük potansiyele sahip olduğu ileri sürülmüştür (yani, hastalıkların tanı ve tahmini için biyobelirteçler). IgG N-glikanlar hidrofilik etkileşim kromatografisi (HILIC) ultra-performanslı sıvı kromatografisi (UPLC) yöntemi kullanılarak yaygın olarak karakterize edilir. UPLC iyi tekrarlanabilirlik ve yüksek göreli kantitatif doğruluk ile istikrarlı bir algılama teknolojisidir. Buna ek olarak, IgG N-glikan yapısı açıkça ayrılır, ve glikan bileşimi ve plazmada göreceli bolluk karakterizedir.

Şekil 1'degösterildiği gibi, IgG N-glikanlar pik pozisyon ve tutma süresine göre 24 ilk IgG glikan piki (GPs) olarak analiz edildi. N-glikan yapıları bir önceki çalışmaya göre kütle spektrometresi tespiti ile kullanılabilir (Tablo 1)15. Sonuçların karşılaştırılabilir olmasını sağlamak için, her tepedeki glikan miktarının toplam entegre alanın yüzdesi olarak ifade edildiği...

Watch this Scientific Journal Video about Immunoglobulin G N-Glycan Analysis by Ultra-Performance Liquid Chromatography at JoVE.com

Immunoglobulin G N-Glycan Analysis by Ultra-Performance Liquid Chromatography

İmmünoglobulin G (IgG) N-glikan hidrofilik etkileşim kromatografiu UPLC ile karakterizedir. Buna ek olarak, IgG N-glikan yapısı açıkça ayrılır. Burada sunulan yaygın araştırma ortamlarında kullanılabilir, böylece bu deneysel yönteme bir giriştir.

Ultra-Performans Sıvı Kromatografi ile İmmünoglobulin G N-Glikan Analizi

Glycomics is a new subspecialty in omics system research that offers significant potential in discovering next-generation biomarkers for disease ...

Ultra-performans sıvı kromatografi salik duyarlılığı nedeniyle igG n-glikan doğru analizi için teknoloji kurulmuş gibi görünüyor ve glikan belirli bir bilgi sağlamak için yeteneğine sahiptir Bu yöntemkullanımı kolay ve artışlar farklı nispeten düşük maliyetli sayısına sahiptir, yüksek tekrarlanabilirlik Glikan izomerleri yeteneği. Plazmadaki protein ölçümleri çekici olabilir. tıpta.ayrıca glikoz baz igG ile ilişkili ve Bu ve biyolojik nüfus içeren. IgG'yi glikanlarda test etmek için saf olmayan bir durum olduğunu biliyorsun. Aslında, protein n-glikanları test edebilir.Bu iki saf durumda çapraz bağlı protein protein protein uygulanabilir VEYA deneysel süreç nispeten basit iken deneysel süreç standardize edilmesi gerekir. Uçuça deneysel sürecin çalışması üç gün sürer ve deneysel becerilerde ustalaşmak için deneysel adımların ezberlenmesi gerekir. Örnekleri hazırlamak için donmuş plazma örneğini eritin.Sonra, 10 dakika boyunca 80 kez G santrifüj. Protein G monolitik plakayı oda sıcaklığında 30 dakika bekletin. İki mililitrelik toplama plakasının her kuyuya 100 mikrometre lik numune aktarın.Tek bir kontrol numunesi olarak ultra saf su ekleyin. Numuneleri bir X PBS ile hacim oranına göre bir ila yedi hacim arasında seyreltin. 0,45 mikron hidrofilik polipropolen filtre plakası 200 mikrolitre ultra saf su ile temizleyin.Temizliği iki kez daha tekrarlayın. Seyreltilmiş numuneleri filtre plakasına aktarın ve 266,6 ila 399,9 Pascal basınçlı bir vakum pompası kullanarak numuneleri kolektif plakaya süzün. Protein G monolitik plakaları hazırlamak için, ilk depolama tampon atın.İki mililitre ultra saf su, iki mililitre x PBS, bir mililitre 0,17 azılı formik asit, iki mililitre 10 X PBS ve iki mililitre bir X PBS sırayla temizleyin. Vakum pompası kullanarak aşağıdaki sıvıyı çıkarın. Çok kanallı bir pipet kullanarak, filtrelenmiş numuneleri IgG bağlama ve temizleme için G monolitik proteinine aktarın.Sonra, yekpare plakaları temizlemek için bir X PBS iki mililitre ekleyin. PBS'yi vakum pompası kullanarak çıkarın ve temizliği iki kez daha tekrarlayın. Bir mililitre 0.17 molar formik asit ile Illute IgG ve vakum pompası ile toplama plakasına örnekleri filtre.Daha sonra, toplama plakaiçine bir molar amonyum bikarbonat 170 mikrolitre ekleyin. 280 nanometre optimum dalga boyunda bir emme spektratörmetre kullanarak IgG konsantrasyonu tespit edin. Üç saat boyunca 60 santigrat derece kuruması için bir fırında çıkarılan IgG yerleştirin.El yazmasında açıklandığı gibi konsantrasyonuna göre gözlemlenecek miktarı belirleyin ve eksi 80 santigrat derecede saklayın. Kurutulmuş IgG'yi toplayın ve %1,33 SDS, %4 IgePal ve %5 PBS gibi kimyasalları oda sıcaklığında saklayın. 250 ünite enzimi 250 mikrolitre ultra saf su ile seyrelterek indoglycosidase F enzimini hazırlayın.IgG dennature için, 1.33% SDS 30 mikrolitre ekleyin ve girdap tarafından karıştırın. Numuneyi 10 dakika boyunca 65 derecelik bir fırına aktarın. Daha sonra fırından çıkarın ve 15 dakika soğumaya bırakın.Aynı numuneye %4 IgePal'ın 10 mikrolitresini ekleyin ve beş dakika boyunca sallayarak bir kuluçka makinesine yerleştirin. PH'ı 8,0'a kadar düzenlemek için 5 X PBS ve 30 ila 35 mikrolitre 0,1 molar sodyum hidroksit 20 mikrolitre ekleyin ve girdap ile karıştırın. Endoglycosidase F enzimdört mikrolitre ekleyin ve girdap tarafından karıştırın.Sonra, 37 santigrat derece su banyosunda 18-20 saat kuluçkaya yatırın. Ertesi gün, serbest bırakılan gylcans 60 santigrat derece bir fırında iki buçuk-üç saat kurumaya yerleştirin. Serbest glikanları eksi 80 santigrat derecede daha fazla ölçüme kadar kaydedin.DMSO 24,5 mikrolitre, asetik asit 10,5 mikrolitre, iki amino benzimid 0,7 miligram ve sodyum siyanoborohydride altı miligram ile iki amino benzimid etiketleme reaktif hazırlayın. Daha sonra, karanlık bir odada, iki amino benzimid etiketleme reaktif 35 mikrolitre ekleyerek glikanlar etiket. Etiketli parıltıları beş dakika lığına bir osilatöre aktarın ve sonra 65 derecede üç saat fırına aktarın.Bundan sonra, 30 dakika oda sıcaklığına aktarın. IgG n-glycase, saf olmayan durumun floresan tespiti tarafından tespit edilebilmesi için etiketle etiketeceğiz. %70 etanol 200 mikrolitre, ultra saf su 200 mikrolitre ve dört santigrat derecede %96 asetit nitril 200 mikrolitre ile 0,2 mikron GHP filtre plakası pretreat.Sonra, bir vakum pompası kullanarak atık kaldırın. Glikan etiketli iki amino benzimid arındırmak için, numuneye% 100 asetonitit 700 mikrolitre ekleyin ve beş dakika boyunca sallayarak bir kuluçka makinesine aktarın. Santrifüj 134 kez G'de beş dakika dört santigrat derecede.Supernatent'i 0,2 mikron GHP filtre plakasına iki dakika aktarın ve vakum kullanarak filtrasyonun çıkarılmasını bekleyin. Dört santigrat derecede %96 asetonitile 200 mikrolitre glikan etiketli iki amino benzimide yıkayın ve 5-6 kez bir vakum pompası kullanarak filtrat kaldırın. Illute iki amino benzimide glikan ultra saf su 100 mikrolitre ile üç kez etiketli.Glian etiketli iki amino benzimide fırına aktarArak 60 derecede üç buçuk saat kurulayın. Etiketli n-glikanları eksi 80 santigrat derecede daha fazla ölçüme kadar kaydedin. İlk olarak, mobil aşamaları kontrol etmek için yazılımı açın.UPLC aletleri %50 solvent B ve %50 solvent C ile dakikada 0,2 mililitre akış hızında 30 dakika boyunca yıkayın. Daha sonra, 20 dakika boyunca dakikada 0,2 mililitre akış hızında %25 çözücü A ve %75 çözücü B ile yıkayın. Daha sonra, dakikada 0,4 mililitre akış hızı ekleyin.Etiketli n-glikanları %100 asetonitril ve ultra saf su karışımının 25 mikrolitresi ile hacim oranına göre iki ila bir hacim de çözün. Daha sonra, dört santigrat derecede beş dakika için 134 kez G santrifüj ve UPLC aletleri içine supernatent 10 mikrolitre yüklemek için kuru bir boru kullanın. Etiketli n-glikanları dakikada 0,4 mililitre akış hızıyla %75 ila %62 asetonitril ile 25 dakika ayırın.Daha sonra, Dexteran kalibrasyon merdiveni glikopeptid sütunu tarafından 60 santigrat derecede bir UPLC üzerinde çalışan bir analitik çalıştırın. X alıntı ve emisyon dalga boylarında n-glijen floresantespit 330 nanometre ve 420 nanometre, sırasıyla. Bu şekilde gösterildiği gibi, IgG n-glikanlar pik pozisyon ve tutma süresine göre 24 ilk IgG glikan pikleri analiz edildi.N-glikan yapıları kütle spektrometresi tespiti ile 24 tipte mevcuttur. Yöntemin tekrarlanabilirliğini ve stabilitesini analiz etmek için standart örnek altı kez paralel olarak test edilmiştir. Nispeten küçük oranlarda glikan zirveleri varyasyon katsayısı fazla% 10 yüksek ölçüm hataları gösterdi.Parça da ve önemli bir IgG n-glikan yapısı nın oluşturulması için, özellikle terminal kurulması için Bu nedenle, yerine bulunan 3.3 IgG n-glycase Bu IgG önemi önemlidir. Glikanların farklı olduğu bilinmektedir. Glikan prototomindeki gelişmelerle birlikte, glikanlarda birleşince bu konuda ki bilgileri keşfetmek için günümüz tanısı için bir potansiyel olarak kullanılabilir.Bu teknik geliştirme den sonra, keşfetmek için yeni bir yol sağlar

Research

JoVE Journal

Medicine

Mouse Model of Intraluminal MCAO: Cerebral Infarct Evaluation by Cresyl Violet Staining

Intraluminar MCAO Mouse Model: kresil Violet Boyama tarafından Serebral İnfarktı Değerlendirilmesi

Stroke is the third  cause of mortality and the leading cause of disability in the World. Ischemic  stroke accounts for approximately 80% of all strokes. ...

Retinal Detachment Model in Rodents by Subretinal Injection of Sodium Hyaluronate

Sodyum Hyaluronat subretinal Enjeksiyon Kemirgenler Retina Dekolmanı Modeli

Subretinal injection of sodium hyaluronate is a widely accepted method of inducing retinal detachment (RD). However, the height and duration of RD or the ...

In utero Measurement of Heart Rate in Mouse by Noninvasive M-mode Echocardiography

In utero Measurement of Heart Rate in Mouse by Noninvasive M-mode Echocardiography

Noninvaziv M-mod ekokardiyografi ile Fare Kalp Puan utero Ölçümünde

Congenital heart disease (CHD) is the most frequent noninfectious cause of death at birth. The incidence of CHD ranges from 4 to 50/1,000 births (Disease ...

Isolation of Human Lymphatic Endothelial Cells by Multi-parameter Fluorescence-activated Cell Sorting

Çoklu-parametre floresans ile aktive edilen hücre sınıflandırma İnsan lenfatik endotel hücreleri İzolasyonu

Lymphatic system disorders such as primary lymphedema, lymphatic malformations and lymphatic tumors are rare conditions that cause significant morbidity ...

VDJ-Seq: Deep Sequencing Analysis of Rearranged Immunoglobulin Heavy Chain Gene to Reveal Clonal Evolution Patterns of B Cell Lymphoma

VDJ-Seq: B Hücreli Lenfoma klonal Evrim Patterns Reveal Rearranged İmmünglobulin Ağır Zincir Gen Derin Sıralama Analizi

Understanding tumor clonality is critical to understanding the mechanisms involved in tumorigenesis and disease progression. In addition, understanding ...

Exosomal miRNA Analysis in Non-small Cell Lung Cancer (NSCLC) Patients' Plasma Through qPCR: A Feasible Liquid Biopsy Tool

Exosomal miRNA Analysis in Non-small Cell Lung Cancer NSCLC Patients' Plasma Through qPCR: A Feasible Liquid Biopsy Tool

qPCR sayesinde küçük hücre dışı akciğer kanseri (KHDAK) Hasta Plazma içinde Exosomal miRNA Analizi: Bir Uygulanabilir Sıvı Biyopsi Aracı

The discovery of alterations in the EGFR and ALK genes, amongst others, in NSCLC has driven the development of targeted-drug therapy using selective ...

Spatial Quantification of Drugs in Pulmonary Tuberculosis Lesions by Laser Capture Microdissection Liquid Chromatography Mass Spectrometry (LCM-LC/MS)

Spatial Quantification of Drugs in Pulmonary Tuberculosis Lesions by Laser Capture Microdissection Liquid Chromatography Mass Spectrometry LCM-LC/MS

Akciğer tüberkülozu lezyonlar lazer ilaçların kayma miktar yakalamak mikrodiseksiyon sıvı Kromatografi Kütle spektrometresi (LCM-LC/MS)

Tuberculosis is still a leading cause of morbidity and mortality worldwide. Improvements to existing drug regimens and the development of novel ...

Application of Biochip Microfluidic Technology to Detect Serum Allergen-specific Immunoglobulin E (sIgE)

Application of Biochip Microfluidic Technology to Detect Serum Allergen-specific Immunoglobulin E sIgE

Biochip mikrosıvısal teknolojisi uygulama algılamak Serum alerjen özgü immünglobulin e (sIgE)

Allergic disease is common in both adults and children. Identification of the causative allergens is significant in disease management and prevention. ...

Assessment of the Acute Inhalation Toxicity of Airborne Particles by Exposing Cultivated Human Lung Cells at the Air-Liquid Interface

Hava-Sıvı Arabiriminde Ekili İnsan Akciğer Hücrelerinin Açığa Çıkarılması yla Havadaki Partiküllerin Akut İnhalasyon Toksisitesinin Değerlendirilmesi

Here, we present a specially designed modular in vitro exposure system that enables the homogenous exposure of cultivated human lung cells at the ALI to ...

Quality-Controlled Sputum Analysis by Flow Cytometry

Akış Sitometrisi ile Kalite Kontrollü Balgam Analizi

Sputum, widely used to study the cellular content and other microenvironmental features to understand the health of the lung, is traditionally analyzed ...