Name: using flexible gold-titanium reaction cells to simulate pressure-dependent microbial activity in the context of subsurface biomining
Uploaded: 2019-10-05T14:00:00
Duration: 13 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Using Flexible Gold-Titanium Reaction Cells to Simulate Pressure-Dependent Microbial Activity in the Context of Subsurface Biomining at JoVE.com

Biz Robert Rosenbauer (USGS, Menlo Park) esnek altın-titanyum reaksiyon hücreleri üzerindeki uzmanlığını paylaşan teşekkür, ve Georg Scheeder (BGR) Hannover değiştirilmiş sistemi kurma ilk aşamasında yaptığı giriş için. Biz yol boyunca küçük iyileştirmeler katkıda bulunan çok sayıda proje de Hannover ve Christian Seeger geliştirmek için katkıda bulunan çok sayıda projede Hannover kurulum kullanarak birçok bilim adamı (Katja Heeschen, Andreas Risse, Jens Gröger-Trampe, Theodor Alpermann dahil) teşekkür etmek istiyorum yüksek basınçlı reaktörler için sallanan cihaz. Laura Castro'ya (Madrid Complutense Üniversitesi) SEM gözlemleri için teşekkür ederiz. Ve son olarak, nils Wölki'ye makale için bu yüksek kaliteli videoyu ürettiği için şükranlarımızı sunmak istiyoruz. Bu çalışma Avrupa Birliği Horizon 2020 projesi BIOMOre (Hibe anlaşması # 642456) tarafından desteklenmiştir.

1. Mikrobiyal kültürün orta ve aşılanmasının hazırlanması
<ol><li>Yayınlanan tekniklere göre ototrofik prokaryotlar için bazal tuz ortamı hazırlayın13. Aşağıdaki kimyasalları distile suda (mg/L) çözün ve karıştırın: Na2SO4·10H2O (150) (NH4)2SO4 (450), KCl (50), MgSO4·7H2O (500), KH2PO4 (50) ve Ca(NO) 3) (3) 2·4H2O (7).</li>
	<li>1000x konsantre iz eleman çözeltisi (g/L): ZnSO4·7H2O (10), CuSO4·5H2O (1), MnSO4· H2O (0.76), CoSO4·7H2O (1), CrK(SO4)2·12H2O (0.4), H3BO3 (0.6), Namoo4·2H2O (0.5), NiSO4·6H2O (1), Na 2.000 SeO4 (0.51), Na2WO4·2H2O (0.1) ve NaVO3 (0.1). 5 M sülfürik asit ekleyerek pH'ı 1,8'e ayarlayın.</li>
	<li>Orta yı 121 °C ve 1,2 bar'da 20 dakika sterilize edin ve ferrik demir çözeltisini 0,22 m gözenek büyüklüğünde şırınga filtresi ile filtreleyerek sterilize edin.</li>
	<li>Sterilize bazal tuz ortamının 50 mL'sini serum şişesine aktarın ve ferrik demir solüsyonu ve elemental kükürtü sırasıyla 50 mM ve 10 g/L'lik son konsantrasyona ekleyin.</li>
	<li>Birkaç mezoasiofilik demir oksitleyici prokaryot14 oluşan karışık bir kültürile orta inoculate .</li>
	<li>Serum şişesini sterilize butil kauçuk durdurucularla kaplayın ve alüminyum kıvrımlı mühürleyin.</li>
	<li>Şiddetle 25 dakika boyunca çözünmüş oksijen şerit N2 ile kültür ortamı kabarcık. İki iğne kullanın, şişe başının daha derin bir yer, kapak yakın diğer.</li>
	<li>Serum şişesinin kafa boşluğunda %90 N 2 ve %10 CO2 atmosferi elde etmek için CO2 enjekte edin. Kültürü karanlıkta 30 °C'de karıştırmadan kuluçkaya yatırın.</li>
</ol>2. Altın-titanyum reaksiyon hücresi ve yüksek basınçlı reaktörün hazırlanması
<ol><li>Altın-titanyum reaksiyon hücresini temizleyin.<ol>
<li>Reaksiyon hücresini, asitin paslanmaz çelik parçalarla temasından veya farklı ısıgenleme özelliklerine sahip monte edilmiş parçaların ısıya maruz kalmasını önlemek için ayrı parçalara ayırın.</li>
		<li>Deney sırasında numuneyle temas edecek yüzeyleri (altın torba, titanyum kafa, titanyum örnekleme tüpü ve titanyum valf) temizleyin.<ol>
<li>Altın torbayı ve titanyum kafayı cam bir kabın içine koy.</li>
			<li>Tüm parçaları kapsayacak kadar % 10 HCl ekleyin.</li>
			<li>Bir ısıtma plakası üzerindeki asidi karıştırArak 3 saat boyunca 50 °C'ye ısıtın.</li>
			<li>PTFE cımbızlı kısımları asit çözeltisinden çıkarın ve deiyonize suyla durulayın.</li>
			<li>Altın torbanın iç yüzeyini ve titanyum kafayı %65 HNO3 ile iyice durulayın ve sonra deiyonize suyla durulayın.</li>
			<li>Titanyum örnekleme tüpünün iç yüzeyini ve titanyum valfin iç yüzeyini %10 HCl ile durulayın, ardından deiyonize su, %65 HNO3, ve sonra tekrar deiyonize su.</li>
			<li>Organik kontaminasyondan tüm parçaları aseton ile durulayarak temizleyin.</li>
			<li>Fırındaki tüm parçaları 105 °C'de en az 1 saat kurulayın.</li>
		</ol>
</li>
		<li>Altın torbanın, titanyum kafanın ve titanyum örnekleme tüpünün yüzeylerini 450 °C'lik bir sıcaklığa maruz bırakarak hava atmosferinde bir boğuk fırında 4 saat ısıtın. NOT: Bu işlem yüzeyleri sterilize eder ve tüm titanyum yüzeylerde pasifize edici titanyum dioksit tabakasının oluşmasına neden olabilir. Titanyum parçaları ısıl işlemden sonra sarı dan maviye renk olmalıdır.</li>
		<li>Anneal altın hücre bir propan meşale ile ısı uygulayarak küçük kristalizasyon etki alanları sıfırlayarak altın esnekliğini artırmak için. Bir deneyde altın torbası hacminin son küçülmesi sırasında oluşmuş olabilecek altındaki kinkleri azaltmak için altın yüzeyini her yerde ısıtın. Erimesini önlemek için altını tek bir yerde çok fazla ısıtmamaya niçin bu kadar çok fazla ısıtmayın. NOT: Altın yüzeyin kırmızı bir parıltı yeterli ısıtma gösterir.</li>
		<li>Altın torbayı titanyum yakaya ve titanyum örnekleme borularını bezler için 10 Nm tork kullanarak titanyum kafaya monte edin.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Yüksek basınçlı reaktörü inceleyin.<ol>
<li>Reaktörü olası hasar, korozyon ve gevşek parçalar için görsel olarak kontrol edin. NOT: Mührün ve sızdırmazlık yerinin bulunduğu çentiklere özel ilgi çekilmelidir. Daha önce reaktörü mühürlemek için grafit conta kullanılmışsa, kalıntıları hala kaldırımda olabilir ve bir sonraki denemeden önce plastik bir iğneyle çıkarılmalıdır.</li>
		<li>Bakır sülfür macunu yüksek basınçlı reaktör başlığındaki itme cıvatalarına uygulayın. Gresin tüm iplik üzerinde dağıtıldığından emin olun.</li>
		<li>Kalan grafit ambalajUzunluğu için vida montaj sıkıştırma confama kontrol edin.</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. Altın-titanyum reaksiyon hücresinin anoksik koşullarda doldurulması ve montajı
<ol><li>Torpido kutusunu yükleyin.<ol>
<li>Bölüm 1'e göre serum şişelerinde kültür ortamını hazırlayın.</li>
		<li>Herhangi bir potansiyel kontaminasyonu en aza indirmek için daha sonra alüminyum folyo numune ile temas edecek goldtitanium reaksiyon hücresi parçaları sarın.</li>
		<li>Torpido gözü kutusunun ön odasını açın ve kilidini açın, gelen tüm malzemeyi hareket ettirilebilir tepsiye yükleyin ve ön kapağı kapatın ve kilitleyin.</li>
		<li>Antechamber 3x tahliye ve yüksek saflıkta azot ile sel.</li>
		<li>Bir çift eldiven giyin ve iç kapağına mümkün olduğunca yaklaşın. Gelen malzemeyi hareketli tepsiden çıkarmak için iç kapağın kilidini açın ve açın.</li>
		<li>İç kapağı kapatın ve kilitleyin.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Altın hücreyi doldur.<ol>
<li>Temiz altın torbayı aç ve cam bir beher ile ayağa kalk, örneğin. 100 mL bakteri kültürü ve elementel sülfür içeren serum şişesini açın.</li>
		<li>Yavaşça serum şişesi sallamak ve altın torbaya bakteri kültürü aktarın.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Tepki hücresini birleştirin.<ol>
<li>Altın torbanın üst kenarını çevreleyen titanyum yakaiçine bağlı titanyum örnekleme tüpü ile titanyum baş yerleştirin. NOT: Titanyum başın konik alt kısmının sızdırmazlık yüzeyinin 90° ileri geri çevirerek düzgün bir şekilde oturduğundan emin olun.</li>
		<li>Yıkayıcıyı ve sıkıştırma cıvata halkasını titanyum örnekleme borusu üzerinde titanyum baş üzerine kaydırın. NOT: Titanyum yakanın flanşlarını ve itme cıvata halkasını hizalamak için titanyum yakadaki sıkıştırma cıvata halkasını 30° çevirin.</li>
		<li>Altı Allen vidasını aynı ölçüde sabitleyerek titanyum yakadaki altın torbanın en üst kenarındaki titanyum kafanın eşit basınç dağılımını (yani reaksiyon hücresinin sızdırmazlık yüzeyine) sabitleyin. NOT: Allen vidalarını sıkıştırma cıvata halkasına, karşı vidaların torku saat yönünde devam etmeden önce önce artırılsın (crisscrossing) artırın, böylece sıkısıkıya kadar sabitle.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Örnekleme valfini titanyum tüpün üst kısmında yeniden kurun. Bağlantıyı elle sıkı titretin ve vanayı kapattırdığından emin olun.</li>
	<li>Torpido glove kutusundan tüm parçaları çıkarın.</li>
</ol>4. Yüksek basınçlı reaktörün reaksiyon hücresi ile montajı
<ol><li>Reaksiyon hücresini reaktör kafasına birleştirin. NOT: Yüksek basınçlı reaktörün montajı, örnekleme borusunun açık ucunun çevredeki atmosfere çok kısa bir şekilde maruz kalmasına neden olur, çünkü örnekleme valfi, tüpü reaktör başlığındaki vida lı contadan geçirmek için çıkarılmalıdır. Kurulum için, reaktör kafası zaten bir tezgah mengene içine yerleştirilmelidir. 45° açı daha kolay kullanım sağlar. Sıkıştırma contası montajı (reaktör kafasının gage blok tertibatının merkezi konumunda yer alan) numune alma tüpünü yerinde tutan, açık olmalıdır.<ol>
<li>Örnekleme tüpünün üstündeki titanyum örnekleme valfini, vidayı ve yakayı çıkarın.</li>
		<li>Tüpün yaklaşık 5 cm'si geçene kadar tüpü reaktör başlığındaki merkezi delikten bağlı reaksiyon hücresi ile yönlendirin. Büyük vidayı tüpün üzerine kaydırın ve küçük yakayı sabitle. NOT: Reaksiyon hücresi tertibatı reaktör başlığından geriye doğru kayamaz ve her iki el de örnekleme valfini yeniden kurmak için serbesttir.</li>
		<li>Titanyum valfi yeniden bağlayın.</li>
		<li>Sıkıştırma contasını sıkın.</li>
		<li>Reaktör kafasını tezgah takindan çıkartın ve reaktör kabına tonuyla tonuyla tattı.</li>
	</ol></li>
	<li>Reaktörü mühürlemeye hazırlanın.<ol>
<li>Reaktör gemisinin kerf üzerine grafit sızdırmazlık koyun.</li>
		<li>Reaktör kafasını bağlı tepki hücresi ile reaktör kabına dikkatlice yerleştirin. NOT: Termokupl da dahil olmak üzere reaktör kafası, altın torbaya veya termokupla zarar vermemek için reaktör kabına dikkatlice yerleştirilmelidir.</li>
	</ol></li>
	<li>Reaktör kabını deiyonize ve musluk suyu karışımıyla doldurun (yaklaşık olarak 1:1 oranında).</li>
	<li>Reaktörü kapatın.<ol>
<li>Sıkıştırma cıvatalarının alt uçlarının ipliklerinin dışına çıkmadığından emin olmak için yakayı kontrol edin. Aksi takdirde, basınçlı kap doğru monte edilmez.</li>
		<li>Tasmayı kaldırın ve reaktör başlığı arabiriminin çıkıntılı kenarlarına yerleştirin. Tasmanın hafifçe hareket ettirilmesi uygun bir uyuma neden olur. Tasmanın yerinde tutulmasını engelleyen kilitleri kapatın.</li>
		<li>Sıkıştırma cıvatalarını bir crisscross deseni takip ederek sabitle ve üretici tarafından önerilen son değerelde edilene kadar torku orta adımlarla artırın. NOT: Farklı yüksek basınçlı reaktör sistemleri farklı tork değerlerine sahip olabilir.</li>
		<li>Son olarak, sıkıştırma cıvatalarını saat yönünde sabitle.</li>
	</ol></li>
	<li>Yüksek basınçlı reaktörü sallanan cihaza takın. NOT: Yüksek basınçlı reaktörün sallanan cihaza yerleştirilmesi, Almanya'nın Hannover şehrindeki Federal Yerbilimleri ve Doğal Kaynaklar Enstitüsü'nde üretilen özel yapım bir model için tanımlanmıştır. Bu nedenle, açıklanan yükleme karşılaştırılabilir tasarıma uygun aygıtlar için genel bir kılavuzdur.<ol>
<li>Reaktörü sallanan alete dikkatlice monte edin. NOT: Yüksek basınçlı reaktörü gage blok montaj parçaları (örneğin, manometre veya numune alma tüpü vidaları) ile tutarak sallanan cihaza düşürmek en iyisidir.</li>
		<li>Reaktörü bir çift uzun vidanın üzerine iki kelepçeyle sabitle.</li>
		<li>Her vida üzerine yıkayışyerleştirin ve kelepçeleri vidalı somunlarla sıkın.</li>
		<li>Termokupl, basınç transdüserve ısıtma elemanı için kontrol üniteleri bağlayın. NOT: Tüm tellerin sallanan hareket için yeterli uzunlukta olduğundan emin olmak ve ısıtmalı yüzeylere temas etmesini önlemek önemlidir.</li>
		<li>Isıtma elemanını reaktör kabının üzerine kaydırın ve vida kilidini sıkın. NOT: Sistemi basınçlandırmak için su yüksek basınçlı pompalı bir rezervuardan alınır. Paslanmaz çelik kılcal damarlardan yüksek basınçlı reaktöre aktarılır. NOT: Yüksek basınçlı reaktörün sallanması, reaksiyon hücresi içeriğinin (yani gaz, sıvı ve içindeki tüm katı fazların) eksiksiz bir şekilde karıştırılması garanti eder. Yavaş sallanan hız, yüksek sıcaklıklarda esnek altın üzerindeki yerçekimi etkileri nedeniyle hızlı hareket eden katılar veya deformasyon ile altın torbasının zarar görmesini önlemek için önemlidir. Sallanan sistem 180°'ye yakın dönebilir.</li>
	</ol></li>
</ol>5. Deneyi başlatma
<ol><li>İzleme yazılımındaki sıcaklık ve basınç sınırlarının istenilen değerlere ayarlanıp ayarlanıp ayarlanıp ayarlanıp ayarlanıp ayarlanıp ayarlaolmadığını kontrol edin. NOT: Bu deneyde 70 °C ve 25 MPa olarak belirlenmiştir.</li>
	<li>Sızıntı kontrolü yapın.<ol>
<li>Paslanmaz çelik bir kılcal damar olan basınç borusunu reaktör başlığına bağlayın.</li>
		<li>Sürekli sızıntı için kontrol ederken farklı aralıklarla hedef basıncı basıncı yükseltmek.</li>
		<li>Pompanın akış hızı neredeyse sıfır olana kadar basıncı sabit tutun. NOT: Suda sıkıştırılabilir, çözünmüş havanın ince akış okumalarında uzun süre görülebildiğine dikkat edin.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Başarılı bir sızıntı kontrolünden sonra ısıtmabaşlatın.<ol>
<li>Basınç pompalarının tomruklarını başlatın.</li>
		<li>IsıtMa için ayar noktasını istenilen değere ayarlayın ve ısıtmayı yazılımla başlatın.</li>
		<li>Tüm parametreleri ve sistem durumunu düzenli olarak kontrol edin.</li>
		<li>Hedef sıcaklığa ulaştıktan sonra basınç borusunu sıkın.</li>
		<li>Sallanan cihazı çalıştırın.</li>
	</ol>
</li>
</ol>6. Yüksek basınçlı reaktörün operasyonel modda örnekalınması
<ol><li>Numune almak için, yüksek basınç reaktörünün üst kısmındaki numune valfinin Luer Lock konektörüne 5 mL'lik bir şırınga takın.</li>
	<li>Vanayı dikkatlice açın ve sıvı örneğinin yüksek basınç reaktörüiçindeki basınçla şırıngaya itmesine izin verin. Örneklenmiş hacim 1 mL'ye ulaştıktan sonra vanayı kapatın. Şırıngayı çıkar.</li>
	<li>Şırıngadaki numuneleri işleme için hemen bir duman kaputundaki 2 mL'lik bir tüpe aktarın.</li>
</ol>7 . Sıvı numunesinin analizi
NOT: Sadece daha az yaygın olan fotometrik ferrozin testinin basamakları (yani bölüm 7.1) burada ayrıntılı olarak açıklanmıştır ve videoda belirtilmiştir, çünkü diğer adımlar mikrobiyolojide standart işlem prosedürleridir.
<ol><li>Çözünmüş demir (Fe2+(aq)ve toplam demir (Fetot) konsantrasyonunu fotometrik olarak belirlemek için ferrozin etomu kullanın15.<ol>
<li>Bilinen miktarda FeSO4·7 H2O'nun suda eriterek bir dizi demir standardı çözüm hazırlayın.</li>
		<li>Bu standart seviyelerin 50 μL'sini 1 M ferrozin çözeltisinin 1 mL'si ile karıştırın. NOT: Ferrozinin çözünmüş demir ile reaksiyonu mor bir kompleks oluşturur. Rengin yoğunluğu demir konsantrasyonu ile ilişkilidir.</li>
		<li>Demir-ferrozin kompleksinin demir konsantrasyonu ve emiciliği arasında bir kalibrasyon eğrisi kurun.</li>
		<li>Bir numunenin demir demirinin konsantrasyonunun belirlenen standart eğriye göre iki paralel ölçümden hesaplayın.</li>
	</ol>
</li>
	<li>PH değerini ve oksidasyon/azaltma potansiyelini (ORP) dijital pH/redoks metreile yarı mikro pH elektrotları ve gümüş klorür elektrotile analiz edin.</li>
	<li>Bir Thoma odası ile Bir ışık mikroskobu kullanarak doğrudan planktonik hücreleri saymak.</li>
	<li>Elektron mikroskobu (SEM) tarayarak hücre morfolojisini araştırın.<ol>
<li>0,1−0,2 m'lik gözenek boyutu filtresi ile farklı koşullar altında yetiştirilen planktonik hücreleri filtreleyin.</li>
		<li>Örnekleri aseton ile kurutun ve %90 aseton içinde 4 °C'de bir gecede saklayın.</li>
		<li>Kritik nokta kurutarak numuneleri kurutun ve grafit veya altınla kaplayın.</li>
		<li>Elektron mikroskobu (FE-SEM) ile 10 kV'de alan emisyon taraması yapılan numuneleri inceleyin.</li>
	</ol>
</li>
</ol>

<ol>
	<li>Johnson, D. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biomining+goes+underground.">Biomining goes underground.</a> Nature Geoscience. 8 (3), 165-166 (2015).</li><li>Bellenberg, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Manipulation+of+pyrite+colonization+and+leaching+by+iron-oxidizing+Acidithiobacillus+species.">Manipulation of pyrite colonization and leaching by iron-oxidizing Acidithiobacillus species.</a> Applied Microbiology and Biotechnology. 99 (3), 1435-1449 (2014).</li><li>Christel, S., Fridlund, J., Watkin, E. L., Dopson, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Acidithiobacillus+ferrivorans+SS3+presents+little+RNA+transcript+response+related+to+cold+stress+during+growth+at+8+&#176;C+suggesting+it+is+a+eurypsychrophile.">Acidithiobacillus ferrivorans SS3 presents little RNA transcript response related to cold stress during growth at 8 &#176;C suggesting it is a eurypsychrophile.</a> Extremophiles. 20 (6), 903-913 (2016).</li><li>Dopson, M., Ossandon, F. J., Lovgren, L., Holmes, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Metal+resistance+or+tolerance?+Acidophiles+confront+high+metal+loads+via+both+abiotic+and+biotic+mechanisms.">Metal resistance or tolerance? Acidophiles confront high metal loads via both abiotic and biotic mechanisms.</a> Frontiers in Microbiology. 5, 157 (2014).</li><li>Schippers, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biomining:+metal+recovery+from+ores+with+microorganisms.">Biomining: metal recovery from ores with microorganisms.</a> Advances in Biochemical Engineering/Biotechnology. 141, 1-47 (2014).</li><li>Shiers, D., Ralph, D., Bryan, C., Watling, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Substrate+utilisation+by+Acidianus+brierleyi,+Metallosphaera+hakonensis+and+Sulfolobus+metallicus+in+mixed+ferrous+ion+and+tetrathionate+growth+media.">Substrate utilisation by Acidianus brierleyi, Metallosphaera hakonensis and Sulfolobus metallicus in mixed ferrous ion and tetrathionate growth media.</a> Minerals Engineering. 48, 86-93 (2013).</li><li>Zhang, R., Hedrich, S., Ostertag-Henning, C., Schippers, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effect+of+elevated+pressure+on+ferric+iron+reduction+coupled+to+sulfur+oxidation+by+biomining+microorganisms.">Effect of elevated pressure on ferric iron reduction coupled to sulfur oxidation by biomining microorganisms.</a> Hydrometallurgy. 178, 215-223 (2018).</li><li>Dickson, F., Blount, C. W., Tunell, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Use+of+hydrothermal+solution+equipment+to+determine+the+solubility+of+anhydrite+in+water+from+100+degrees+C+to+275+degrees+C+and+from+1+bar+to+1000+bars+pressure.">Use of hydrothermal solution equipment to determine the solubility of anhydrite in water from 100 degrees C to 275 degrees C and from 1 bar to 1000 bars pressure.</a> American Journal of Science. 261 (1), 61-78 (1963).</li><li>Seyfried, W., Gordon, P., Dickson, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+reaction+cell+for+hydrothermal+solution+equipment.">A new reaction cell for hydrothermal solution equipment.</a> American Mineralogist. 64 (5-6), 646-649 (1979).</li><li>Cross, M. M., Manning, D. A., Bottrell, S. H., Worden, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Thermochemical+sulphate+reduction+(TSR):+experimental+determination+of+reaction+kinetics+and+implications+of+the+observed+reaction+rates+for+petroleum+reservoirs.">Thermochemical sulphate reduction (TSR): experimental determination of reaction kinetics and implications of the observed reaction rates for petroleum reservoirs.</a> Organic Geochemistry. 35 (4), 393-404 (2004).</li><li>Frerichs, J., Rakoczy, J., Ostertag-Henning, C., Kru&#776;ger, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Viability+and+adaptation+potential+of+indigenous+microorganisms+from+natural+gas+field+fluids+in+high+pressure+incubations+with+supercritical+CO2.">Viability and adaptation potential of indigenous microorganisms from natural gas field fluids in high pressure incubations with supercritical CO2.</a> Environmental Science &amp; Technology. 48 (2), 1306-1314 (2014).</li><li>Heeschen, K., Risse, A., Ostertag-Henning, C., Stadler, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Importance+of+co-captured+gases+in+the+underground+storage+of+CO2:+Quantification+of+mineral+alterations+in+chemical+experiments.">Importance of co-captured gases in the underground storage of CO2: Quantification of mineral alterations in chemical experiments.</a> Energy Procedia. 4, 4480-4486 (2011).</li><li>Wakeman, K., Auvinen, H., Johnson, D. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbiological+and+geochemical+dynamics+in+simulated-heap+leaching+of+a+polymetallic+sulfide+ore.">Microbiological and geochemical dynamics in simulated-heap leaching of a polymetallic sulfide ore.</a> Biotechnology and Bioengineering. 101 (4), 739-750 (2008).</li><li>Pakostova, E., Grail, B. M., Johnson, D. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Indirect+oxidative+bioleaching+of+a+polymetallic+black+schist+sulfide+ore.">Indirect oxidative bioleaching of a polymetallic black schist sulfide ore.</a> Minerals Engineering. 106, 102-107 (2017).</li><li>Lovley, D. R., Phillips, E. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+assay+for+microbially+reducible+ferric+iron+in+aquatic+sediments.">Rapid assay for microbially reducible ferric iron in aquatic sediments.</a> Applied and Environmental Microbiology. 53 (7), 1536-1540 (1987).</li><li>Parkes, R. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prokaryotes+stimulate+mineral+H2+formation+for+the+deep+biosphere+and+subsequent+thermogenic+activity.">Prokaryotes stimulate mineral H2 formation for the deep biosphere and subsequent thermogenic activity.</a> Geology. 39 (3), 219-222 (2011).</li><li>McCollom, T. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Abiotic+methane+formation+during+experimental+serpentinization+of+olivine.">Abiotic methane formation during experimental serpentinization of olivine.</a> Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 113 (49), 13965-13970 (2016).</li><li>Pester, N. J., Conrad, M. E., Knauss, K. G., DePaolo, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kinetics+of+D/H+isotope+fractionation+between+molecular+hydrogen+and+water.">Kinetics of D/H isotope fractionation between molecular hydrogen and water.</a> Geochimica et Cosmochimica Acta. 242, 191-212 (2018).</li><li>Rosenbauer, R. J., Thomas, B., Bischoff, J. L., Palandri, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Carbon+sequestration+via+reaction+with+basaltic+rocks:+Geochemical+modeling+and+experimental+results.">Carbon sequestration via reaction with basaltic rocks: Geochemical modeling and experimental results.</a> Geochimica et Cosmochimica Acta. 89, 116-133 (2012).</li><li>Knauss, K. G., Copenhaver, S. A., Braun, R. L., Burnham, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hydrous+pyrolysis+of+New+Albany+and+Phosphoria+Shales:+production+kinetics+of+carboxylic+acids+and+light+hydrocarbons+and+interactions+between+the+inorganic+and+organic+chemical+systems.">Hydrous pyrolysis of New Albany and Phosphoria Shales: production kinetics of carboxylic acids and light hydrocarbons and interactions between the inorganic and organic chemical systems.</a> Organic Geochemistry. 27 (7-8), 477-496 (1997).</li><li>Parkes, R. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Culturable+prokaryotic+diversity+of+deep,+gas+hydrate+sediments:+first+use+of+a+continuous+high-pressure,+anaerobic,+enrichment+and+isolation+system+for+subseafloor+sediments+(DeepIsoBUG).">Culturable prokaryotic diversity of deep, gas hydrate sediments: first use of a continuous high-pressure, anaerobic, enrichment and isolation system for subseafloor sediments (DeepIsoBUG).</a> Environmental Microbiology. 11 (12), 3140-3153 (2009).</li></ol>

Yazarların açıklayacak bir şeyi yok.

Asidik çözeltiler içinde mikrobiyal reaksiyonların yüksek basınçlı deneyleri için sunulan yöntem, laboratuvar ortamında derin yeraltı jeomikrobiyolojik süreçlerini simüle etmek için güçlü bir araçtı.
Bazıları özel dikkat gerektiren çok sayıda manuel çalışma adımları söz konusur. Genel bir not olarak, esnek altın-titanyum hücre ve reaktör kafasının tek tek parçaları (bölüm 3 ve 4) montajı nda aşırı güç kullanılmamalıdır. Üreticinin teknik özellikleri (örn. maksimum basınç, sıcaklık, tork için) göz ardı edilirse, sızıntı ve/veya malzeme arızalarına neden olabilir.
Altın ve titanyum parçalarının (bölüm 2.2) temizlenmesi sadece bu deney için değil, özellikle (in-)organik reaksiyonları içeren deneyler için de vazgeçilmez bir çalışma adımıdır. Altın hücrede önceki deneylerden kalıntılar istenmeyen reaksiyonlara neden olabilir ve bu nedenle sonuçların önyargılı. Monte edilen altın-titanyum hücresi reaktör kafasına monte edildiğinde, hızlı ve hassas bir şekilde çalışmak en iyisidir, çünkü şu anda az miktarda oksijen altın hücreye girebilir. Torpido glovebox ayrılmadan önce örnekleme vanakapatılması altın hücrenin iç ortam atmosferi arasındaki değişimi en aza indirmek için iyi bir ilk önlemdir.
Reaktör sallanan cihaza yerleştirildikten sonra, sallanan hareket hızını ~170°/da kin olarak ayarlamak önemlidir. Yüksek basınçlı reaktör çok hızlı hareket ederse, kullanıldığında yerçekimsel etkiler veya tortu veya kaya örneklerinin keskin kenarları nedeniyle altın hücresinin kopması meydana gelebilir.
Bu yöntem ek araştırma alanlarında kullanılabilir. Esnek altın-titanyum reaksiyon hücresi, yüksek basınç ve sıcaklıktaki tepkileri inceleyen9 farklı bilimsel araştırmalar ve yüksek aşındırıcı sıvı lar veya gazlar için kullanılma potansiyeline sahiptir.
Mineral yüzeylerin varlığında 70 °C'nin üzerindeki sıcaklıklarda derin yeraltı yüzeyindeki mikroorganizmalar, yüksek basınç altında bile moleküler hidrojen veya asetat gibi organik asitlerin üretimini uyarabilir16. Bu ürünler, ve diğer bileşikler, yerinde biyoleaching süreçleri sırasında yüksek mikrobiyal aktivite neden olabilir, bu çalışmada araştırılan kükürt bileşikleri ek olarak.
Uygulamalar sulu sıvılarda gazve iyonların çözünürlüğünün belirlenmesi, hidrotermal havalandırma sistemlerinin koşullarında jeokimyasal reaksiyonlar17, izotop fraksiyonu18,CO sırasında jeokimyasal reaksiyonlar nicel 2 haciz19, kaynak kayalarda petrol ve gaz oluşumu sırasında abiyotik süreçler20, ve mikrobiyal reaksiyonlar yüzey altı21 yüksek basınçlarda bu çalışmada olduğu gibi.

Son on yılda, madenciliğin çevre üzerindeki etkisini en aza indirme çabaları artmıştır. Cevherlerin hammadde ekstraksiyonu için açık çukur madenciliği (örneğin, bakır bakımından zengin sülfür cevherleri), kazı faaliyetleri ve değerli çıkarma dan sonra işlenmiş cevher kalıntıları nın büyük hacimleri ve kalan büyük atık kayaları ile çevredeki peyzajı etkiler bakır gibi metaller. Yeraltı daki cevherden doğrudan bakır çıkarmak bu etkileri önemli ölçüde azaltacaktır. in situ biomining teknolojisi bu süreç için umut verici bir aday1. Bu yayın, cevherden değerli metalleri yeraltı yüzeyinde sulu bir çözeltiye çıkarmak için uyarılmış mikrobiyal aktivitenin kullanımını açıklamaktadır. Böylece, bakır açısından zengin bir çözelti, örneğin metali daha fazla yoğunlaşmış olmak için yüzeye kolayca pompalanabilir.
Cevher-yıkama asiofilik mikroorganizmaların aktivitesiparametreleri 2,3,4,5,6çeşitli bir dizi için birçok laboratuvarda incelenmiştir. Ancak, hidrostatik koşullar (~ 100 bar) ile 1.000 m derinlikte ortam yüzeyi laboratuvar koşulları (1 bara yakın) ve yeraltı yüzeyi arasındaki farktan kaynaklanan mikrobiyal aktivite üzerindeki basınç etkileri iyi belgelenmemiştir. Bu nedenle, mikrobiyal demir azaltma üzerindeki baskının etkileri farklıdeneysel yollar 7 ile araştırılmıştır. Burada en uygun teknik ayrıntılı olarak açıklanmıştır.
Yüksek basınçlı reaktörler, yerin yüzeyinde meydana gelen basınç ve sıcaklıklardaki reaksiyonları incelemek için yoğun olarak kullanılmıştır. Bu tür reaktörler, mikrobiyal kültüre sahip bir sıvı örneği içerebilen bir reaktör kabından oluşur. Reaktör gemisinin üzerinde oturan reaktör kafası, güvenlik önlemleri ve izleme sensörleri (örn. sıcaklık veya basınç) için çeşitli bağlantılar ve arayüzler sunar. Yüksek basınçlı reaktörlerin çoğu paslanmaz çelikten yapılmıştır. Bu malzeme yüksek esneklik ve iyi işleme özellikleri sunar, ancak paslanmaz çelik yüzeyin korozyon direnci her uygulama için yeterli değildir. Örneğin, yüksek asidik veya yüksek oranda azaltıcı sulu çözeltiler araştırılırsa, reaktör duvarı ile ilgili bileşiklerin önemli reaksiyonları oluşabilir. Bunu önlemek için bir yolu reaktör gemi içine bir astar eklemek için, örneğin borosilikat cam dan yapılmış bir astar7. Temizlenmesi kolaydır ve otoklavlama ile sterilize edilebilir. Buna ek olarak, asidik veya sulu çözeltiler azaltarak tarafından saldırıya uğramaz. Bir astar paslanmaz çelik reaktör duvarı ile çözüm çözeltisi veya mikropların yapay reaksiyonları önlemek için yardımcı olsa da, çeşitli sorunlar kalır. İlk olarak, sülfat azaltıcı bakteriler tarafından üretilen hidrojen sülfür gibi aşındırıcı bir gaz oluşursa, bu gaz reaktör kafasının astarÜzerinde oturan açık yüzeyi ile reaksiyona bile çıkabilir. Bir diğer dezavantajı da basıncı korurken reaktörden numune çekmenin mümkün olmamasıdır.
Bu sınırlamaları aşmak için, yüksek basınçlı reaktörler içinde özel esnek reaksiyon hücreleri çeşitli uygulamalar için geliştirilmiştir. Esnek bir politetrafloroetilen (PTFE) hücre8 yüksek tuzlu salamura tuzların çözünürlük çalışmaları için tasarlanmıştır. Ancak, bu sistemin sınırlama bazı gazlar kolayca PTFE nüfuz olabilir. Buna ek olarak, bu malzeme hala nispeten düşük sıcaklık stabilitesi vardır. Böylece, sistem paslanmaz çelik yüksek basınçlı reaktör içine yerleştirilecek bir titanyum kafa9 ile esnek bir altın çanta tasarlayarak geliştirilmiştir. Altın yüzey, asidik veya azaltıcı çözeltilere ve gazlara karşı korozyona dayanıklıdır. Titanyum yüzeyi de sürekli titanyum dioksit tabakası oluşturmak için iyice pasifildiğinde son derece durağan. Bağlı bir titanyum örnekleme tüpü ile bu reaksiyon hücresinden örnekleme sırasında, altın torba hacmi küçülür. Sistemin iç basıncı, aynı su hacminin pompalanmasıyla korunur, örnekleme ile geri çekilir, reaksiyon hücresini barındıran paslanmaz çelik yüksek basınçlı reaktöre. Reaksiyon hücresi içindeki numune, deney sırasında yüksek basınçlı reaktörü 90°'den fazla sallayarak veya yatırarak hareket halinde tutulur.
Reaksiyon hücresi Şekil 1'debetimlenen parçalardan oluşur: altın torba, titanyum yaka, titanyum kafa, paslanmaz çelik yıkama, titanyum sıkıştırma cıvata halkası, paslanmaz bezleri ve yüksek basınçlı koni ve yakalı titanyum örnekleme tüpü her iki tarafta dişli bağlantıları ve titanyum vana. Altın torba 0.2 mm duvar kalınlığı, 48 mm dış çapı ve 120 mm uzunluğunda silindirik altın (Au 99.99) hücredir.
Tüm titanyum parçaları, atölye tarafından titanyum sınıf 2 çubuklarından özel olarak üretilir. Yaka,baş, yıkama ve sıkıştırma cıvata halkasının boyutları Şekil 2'de görülmektedir. Titanyum örnekleme tüpü, dış çapı 6,25 mm ve duvar kalınlığı 1,8 mm olan titanyumkamı, iç çapı 2,65 mm olan bir tüptür. Titanyum baş ve titanyum valf içine yüksek basınçlı koni ve dişli bağlantıları titanyum-karşı-titanyum yüzeylerbir mühür sağlayan sabitlenir. Yüksek basınçlı titanyum valf, yüksek basınçta bile çok kontrollü bir açma veya örnekleme sağlamak için yavaş bir açma sapı ile donatılmıştır. Bu sistem çok sayıda çalışmada kullanılmıştır10,11,12.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Acetone</td>
			<td>Merck</td>
			<td>100013</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CaN2O6</td>
			<td>Fluka</td>
			<td>31218</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Conax compression seal fittings</td>
			<td>Conax Technologies</td>
			<td>PG2-250-B-G</td>
			<td>sealant could be selected according to temperatures in experiment</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Copper paste</td>
			<td>Caramba</td>
			<td>691301</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Copper paste</td>
			<td>CRC</td>
			<td>41520</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CoSO4x7H2O</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>10026-24-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CrKO8S2x12H2O</td>
			<td>Roth</td>
			<td>3535.3</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CuSO4x5H2O</td>
			<td>Riedel de Haen</td>
			<td>31293</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Disposable cuvettes</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>z330388</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethanol absolute</td>
			<td>Roth</td>
			<td>9065.3</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FE-SEM</td>
			<td>JEOL</td>
			<td>model no. JSM-6330F</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ferrozine</td>
			<td>Aldrich</td>
			<td>180017</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fe2(SO4)3x7H2O</td>
			<td>Alfa Aesar</td>
			<td>33316</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FeSO4x7H2O</td>
			<td>Merck</td>
			<td>103965</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gold cell</td>
			<td>Hereaus GmbH</td>
			<td></td>
			<td>manufactured according to dimensions supplied by customer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>High-pressure reactor</td>
			<td>PARR Instruments</td>
			<td>model no. 4650 Series</td>
			<td>reactors from other vendors could be used, too</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>High-pressure syringe pump</td>
			<td>Teledyne ISCO</td>
			<td>DM-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HCl</td>
			<td>Roth</td>
			<td>6331.3</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HNO3</td>
			<td>Fluka</td>
			<td>7006</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>H3BO3</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>B6768</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>KCl</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P9541</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>KH2PO4</td>
			<td>Merck</td>
			<td>104873</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-(+)-Ascorbic acid/Vitamin C</td>
			<td>Applichem</td>
			<td>A1052</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Light microscope</td>
			<td>Leica DM3000</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MgSO4x7H2O</td>
			<td>Merck</td>
			<td>105886</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>(NH4)2SO4</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A4418</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NaMoO4x2H2O</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>331058</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NaO3Sex5H2O</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>00163</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NaO3V</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>590088</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Na2SO4</td>
			<td>Merck</td>
			<td>106649</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Na2WO4x2H2O</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>72069</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NiSO4x6H2O</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>31483</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Omnifix Luer</td>
			<td>BRAUN</td>
			<td>4616057V</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>pH meter</td>
			<td>Mettler Toledo</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Redox potential meter</td>
			<td>WTW</td>
			<td>ORP portable meter</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Safe-Lock Tubes, 2 mL</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>0030120094</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Serum bottle</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>33110-U</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Spectrophotometer</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>model no. GENESYS 10S</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sterican Hypodermic needle</td>
			<td>BRAUN</td>
			<td>4657519</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Stoppers</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>27234</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sulfur powder</td>
			<td>Roth</td>
			<td>9304</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thoma Chamber</td>
			<td>Hecht-Assistent</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Titanium parts of reaction cell</td>
			<td>Titan-Halbzeug GmbH</td>
			<td>121-238</td>
			<td>manufactured by workshop at BGR according to dimensions supplied from Titanium grade 2 rods from Titan-Halbzeug GmbH</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Titanium valve</td>
			<td>Nova Swiss Technologies</td>
			<td>ND-5002</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Whatman membrane filters nylon</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>WHA7402004</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ZnSO4x7H2O</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>Z4750</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

using flexible gold-titanium reaction cells to simulate pressure-dependent microbial activity in the context of subsurface biomining

Derin cevher yataklarında metal yıkama (biyomining) gibi yeraltı mikrobiyal süreçlerini inceleyen laboratuvar çalışmaları, çoğaltılması gereken özel çevre koşulları, örneğin yüksek basınç dahil olmak üzere ortak ve zorlu engelleri paylaşır ve bazı durumlarda asidik çözeltiler. Eski 100 bar kadar basınçlandırma için uygun deneysel bir kurulum gerektirir, ikincisi korozyon ve konteyner duvarı ile istenmeyen kimyasal reaksiyonlara karşı yüksek kimyasal direnç ile sıvı bir konteyner gerektirir. Bu çalışmada, in situ biyomining alanında bir uygulama için bu koşulları karşılamak için, sallanan yüksek basınçlı reaktör içinde özel bir esnek altın-titanyum reaksiyon hücresi kullanılmıştır. Açıklanan sistem, anoksik, basınç kontrollü, kimyasal olarak son derece durağan deneysel bir ortamda kükürtlü mikrobiyal demir azaltma yoluyla in situ biyomining simülasyonu sağladı. Esnek altın-titanyum reaksiyon hücresi, sistem istenilen basıncı korurken herhangi bir zaman noktasında numune alınabilen 100 mL'ye kadar numune çözeltisi barındırabilir. Deneyler, saatler ile aylar arasında değişen zaman ölçeklerinde gerçekleştirilebilir. Yüksek basınçlı reaktör sisteminin montajı oldukça zaman alır. Bununla birlikte, kimyasal olarak agresif sıvılarda yeryüzünün derin yüzeyinde meydana gelen karmaşık ve zorlu (mikrobiyolojik) süreçler laboratuvarda incelendiğinde, bu sistemin avantajları dezavantajlardan daha ağır basmaktadır. Sonuçlar, yüksek basınçta bile mikrobiyal konsorsiyumun aktif olduğunu, ancak metabolik hızların önemli ölçüde daha düşük olduğunu ortaya koydu.

Özel altın-titanyum reaksiyon hücresi ile yapılan yüksek basınçlı reaktör deneyinin sonuçları, asitofillerin mikrobiyal karışık kültürünün sülfür okside ettiğini ve ferrik demiri demirdemire indirgediğini göstermektedir(Şekil 3).
Her iki 1 bar veya 100 bar basınç koşullarında, kültürler altın-titanyum reaksiyon hücresinde yetiştirilen bir gecikme faz vardı. Bu dönemden sonra demir konsantrasyonunda yaklaşık 9 mM'den 31 mM'ye hızlı bir artış 1 bar'da yetişen kültürde meydana gelmiştir. 22 günlük kuluçka süresi boyunca, 1 bar ve 100 bar'da tahlillerde sırasıyla ~31 mM ve 13 mM demir demirtespit edildi. Bu açıkça mikrobiyal hücrelerin 100 bar aktif olduğunu göstermektedir, ancak ferrik demir azaltıcı aktivite yüksek basınçta önemli ölçüde daha düşüktü. Hungate tüpleri ve serum şişelerinde yapılan abiyotik kontrol deneyleri 1 bar ve 100 bar'da ferrik demir redüksiyonu göstermedi.
Taramalı elektron mikroskobu görüntüleri(Şekil 4)düşük ve yüksek basınçtaki deneylerde yetişen çubuk şeklindeki hücreleri göstermektedir. Hücre morfolojisinde 1 bar a itrinde anlamlı bir değişiklik gözlenmedi. Ancak hücre büyümesi, hücre sayısı 1 bar'da 1 bar'da 1,3 x 108 hücre/mL olduğu için, 100 bar7'de4,5 x 107 hücre/mL olduğu için, hücre büyümesi açıkça yüksek basınç la inhibe edilmiştir. Bu veriler Hungate tüpleri7yapılan testler ile karşılaştırılabilir. Böylece, esnek altın-titanyum reaksiyon hücresinin kendisi hücre büyümesi üzerinde hiçbir etkisi yoktu ve mikrobiyal büyüme testleri için uygun oldu.
Sonuçlar, biyoleaching mikroorganizmaların 100 bar yüksek basınçta bile aktif olduğunu göstermektedir, bu da yerinde biyomining için son derece önemlidir, çünkü bu koşullar 1.000 m7'ninaltındaki derinlikte derin cevher yataklarında meydana gelir.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60140/60140fig1.jpg"> Şekil 1: Reaksiyon hücresi parçalarına genel bakış. Aşağıdan yukarıya: altın çanta, titanyum yaka, titanyum kafa, yıkayıç, titanyum sıkıştırma cıvata halkası, paslanmaz bezleri ve yakalar ile titanyum örnekleme tüpü her iki tarafta yüksek basınçlı koni ve dişli bağlantıları için, ve titanyum vana ile bir Luer Lock şırınga bağlamak için adaptör. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60140/60140fig1large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60140/60140fig2.jpg"> Şekil 2: Titanyum sınıf 2 çubuklarından işlenmiş titanyum parçaların boyutlu çizimleri. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60140/60140fig2large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60140/60140fig3.jpg"> Şekil 3: Altın-titanyum reaksiyon hücresindeki demir konsantrasyonlarının demir oksitleyici kültürle değişimi. Hücreler 30 °C'de anaerobik olarak yetiştirildi. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60140/60140fig3large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60140/60140fig4.jpg"> Şekil 4: Demir oksitleyici kültürün morfolojisi 1 bar ve 100 bar'da yetişir. Hücreler 30 °C'de anaerobik olarak yetiştirildi. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60140/60140fig4large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>

Watch this Scientific Journal Video about Using Flexible Gold-Titanium Reaction Cells to Simulate Pressure-Dependent Microbial Activity in the Context of Subsurface Biomining at JoVE.com

Using Flexible Gold-Titanium Reaction Cells to Simulate Pressure-Dependent Microbial Activity in the Context of Subsurface Biomining

Bu protokol, yerinde biyomining süreçlerinde çalışmak için yüksek basınç altında mikrobiyal deneyler açıklar. Deneysel yaklaşım, asidik, demir açısından zengin bir ortamda mikrobiyal kültür içeren altın-titanyum reaksiyon hücresi ile donatılmış sallanan yüksek basınçlı bir reaktör kullanır.

Yüzey Altı Biyomining Bağlamında Basınca Bağımlı Mikrobiyal Aktiviteyi Simüle Etmek Için Esnek Altın-Titanyum Reaksiyon Hücrelerinin Kullanılması

Laboratory studies investigating subsurface microbial processes, such as metal leaching in deep ore deposits (biomining), share common and challenging ...

Biyomadencilik asiofilik bakterilerin yardımıyla metal sülfürleri eriterek kayalardan bakır ve diğer basınçlı metallerin çıkarılması için uygulanan Bioleaching açıklar. Örneğin, bakır coopashefa cevheri sülfürler çözülerek bu bakteri ile ayıklanabilir. Ve bakır sülfat zengin çözeltisi daha sonra hangi bakır kolayca ayıklanabilir oluşturulur.Yerinde biyomining yeraltı veya açık bir çukurda kazı ve madencilik faaliyetleri gerek kalmadan bakterilerin yardımıyla metallerin çıkarılması olduğunu. Bunun yerine, bir demir açısından zengin asidik çözelti kaya oluşumuaşağı pompalanır, metal sülfürler çözünmüş ve metal açısından zengin çözelti daha sonra metaller ayıklanabilir yüzeye geri pompalanır. Bu deneyde, derin oluşumdaki koşulları simüle eden yüksek basınçlı bir reaktör hücresi var.Bakteriler incelenir ve sülfür bileşiklerinin oksidasyonu ile birleşen demir azaltma ile ilgili faaliyetleri, ve özellikle biz hücrelerin yüksek basınç altında ne kadar aktif olduğunu görmek için ilgileniyoruz, ve nasıl oranları basınç altında değişiyor. Deneyler için, burada tasvir edilen yüksek basınçlı reaktör kullanılabilir ve 350 bara kadar basınç koşullarını simüle edebilir. Yüksek basınçlı reaktörün alt kısmı, mikrobiyal kültüre sahip bir sıvı örneği içerebilen bir reaktör kabından oluşur.Reaktör kafası, güvenlik önlemleri ve izleme sensörleri için çeşitli bağlantılar sunar. Örneğin, reaktör içinde sıcaklık veya basınç. Yüksek basınçlı reaktörlerin çoğu paslanmaz çelikten yapılmıştır.Bu malzeme yüksek esneklik ve iyi işleme özellikleri sunar. Ancak, asidik veya yüksek oranda azaltıcı sulu çözeltilerle yapılan deneyler gibi bazı uygulamalariçin paslanmaz çelik yüzeyin korozyon direnci yeterli olmayabilir. Bunu önlemenin bir yolu da reaktör gemisine bir astar yerleştirmektir.Burada, tefflon'dan yapılmış bir astar. Tefflon yüksek korozyon direncine sahiptir, ancak otoklavlama ile sterilize edilemediği ve demir yüzlerin yüzeyine çökebileceği nden daha yüksek bir kontaminasyon riski vardır. Kullanılabilen bir diğer astar malzemesi kuvars camdır.Temizlenir, otoklavlama ile sterilize edilebilir ve asidik veya sulu çözeltileri azaltarak daha az etkilenir astar malzemesi paslanmaz çelik reaktör duvarlı bir numunenin istenmeyen reaksiyonlarını önlemeye yardımcı olsa da, çeşitli sorunlar kalır. Aşındırıcı bir gaz oluşursa, örneğin hidrojen sülfür, bu gaz reaktör kafasının açığa çıkarılan yüzeyi ile astar Üzerinde oturan reaksiyona olabilir. Bir diğer dezavantajı da basıncı değiştirmeden reaktörden numune çekmenin mümkün olmamasıdır.Bu sınırlamaları aşmak için, özel bir tepki hücresi, titanyum başlı esnek bir altın torba kullandık. Altın yüzey, asidik veya çözeltive gazları azaltan korozyona dayanıklıdır. Titanyum yüzeyi de oldukça durağan.Ne zaman sürekli titanyum dioksit tabakası oluşturmak için, burada koyu mavi görünür. Örnekleme sırasında, altın torba hacmi küçülür. Altın torbanın hacmi keskin kinks ve kenarlarıoluşumunu önlemek için% 50'den fazla azaltılmalıdır.Burada gösterilen parçalar altın çanta deneyin iç kurulum bireysel parçalarıdır. Bir görebilirsiniz, aşağıdan yukarıya, esnek altın torba reaksiyon hücresi, titanyum sızdırmazlık sistemi, bir titanyum kafa oluşan, yıkave sıkıştırma kalın halka, ve örnekleme tüpü ve vana operasyon modu sırasında reaksiyon hücresierişmek için. Şimdi, örneği altın titanyum reaksiyon hücresine aktarAcağız.İlk olarak, boş hazneyi açın ve açın ve tüm gelen malzemeyi hareketli tepsiye yükleyin. Ön kapağı kapatın ve kilitleyin. Anti-oda tahliye sonra, eldiven çifti giymek ve iç kapağına yakın olsun.Gelen malzemeyi hareketli tepsiden çıkarmak için iç kapağın kilidini açın ve açın. Temiz altın torbayı aç ve standını emniyete ala. Bakteri kültürü ve elemental sülfür 100mL içeren serum şişesini açın.Yavaşça serum şişesi sallamak ve altın torbaya bakteri kültürü aktarın. Altın torba üzerinde titanyum kapak içine montaj tüpü ile titanyum kafa yerleştirin. Daha sonra, titanyum örnekleme tüpü üzerinde yıkayıcı ve sıkıştırma kalın halka kaydırın.Titanyum kapakaltın çantanın en üst kenarı üzerinde titanyum şapka eşit bir basınç dağılımı sağlamak için aynı ölçüde altı karaağaç vidaları bağlayın. Bu altın titanyum reaksiyon hücresinin sızdırmazlık yüzeyi. Örnekleme valfini titanyum tüpün üst kısmında yeniden kurun.Bağlantı elini sıkın. Sonra, vana kapatmak için emin olun. Şimdi, yüksek basınçlı reaktörün çekirdek parçası tamamen monte edilmiş ve reaktör şapkasına monte edilebilir.Şimdi, yüksek basınçlı reaktörün kurulumu gerçekleşebilir. Bu, örnekleme borusunun açık ucunun çevredeki atmosfere çok kısa bir şekilde maruz kalmasına neden olur, çünkü örnekleme valfi, tüpüreaktör başlığındaki vidalı contadan geçirmek için çıkarılması gerekir. Örnekleme valfi ve vidaları örnekleme tüpünden çıkarmayı bırakın.Tüpü reaktör başlığından geçirin, büyük vidayı tüpün üzerine kaydırın ve küçük kapağı sabitle. Şimdi reaksiyon hücresi tertibatı reaktör başlığından geriye doğru kayamaz ve her iki el de örnekleme valfini yeniden takmak için serbesttir. Reaktör kafasını tezgah ın dışından çıkar ve reaktör kabına tonuyla çıkarın.Termal çift de dahil olmak üzere reaktör kafası, altın torba ya da termal çift zarar değil, reaktör gemi üzerinde dikkatle yerleştirilmelidir. Son olarak, bölünmüş halka ve sıkıştırma cıvataları ile donatılmış sağlam kapak, sistemi uygun şekilde mühürlemek için reaktör kafası ve kabın etrafına sabitlenir. Yüksek basınçlı reaktör, özellikle parmakların çürümesi gibi olası yaralanmaları önlemek için sallanan cihaza dikkatlice monte edilir.Yüksek basınçlı reaktör, bir çift vidanın üzerine kaydırılan iki kelepçeyle sabitlenir. Yıkayır ve vidalı somunlar kelepçeleri yerinde tutar. Termal çiftin kontrol ünitelerini ve basınç sensörünü bağlayın.Kabloların kayan hareket için yeterli uzunlukta olmasını sağlarken, içeriğinin yüzeylerini ısıtmasını önlemek önemlidir. Son olarak, reaktör kabı üzerinde ısıtma elemanı kaydırın ve vida-lock sıkın. Sistemi basınçlandırmak için su yüksek basınçlı pompa ile bir rezervuar alınır.Paslanmaz çelik kılcal damarlardan yüksek basınçlı reaktöre aktarılır. Yüksek basınçlı reaktörün sallanması reaksiyon hücresinin tam olarak karıştırılmasını garanti eder. Örneğin, gaz, sıvı ve/ veya katı fazlar.Daha yavaş sallanan hız, hızlı hareket eden katılar veya yüksek sıcaklıklarda esnek altın üzerindeki yerçekimi etkileri nedeniyle oluşumu ile altın torbasının zarar görmesini önlemek için önemlidir. Sistemimiz 180 dereceye yakın olan göstergedeki yeşil ve sarı işaretli açıda dönebiliyor. Deneysel parametreler aynı anda bir yazılım tarafından günlüğe kaydedilir.Örnek almak için, yüksek basınçlı reaktörün üst kısmındaki numune valfinin küçük kilit arabirimine 5 mililitrelik bir şırınga bağlanır. Vanayı dikkatlice açın. Sıvı numune, reaksiyon hücresiiçindeki aşırı basınç tarafından otomatik olarak şırıngaya itilir.Numune hacmi bir mililitreye ulaştıktan sonra vanayı kapatın. Şırıngayı çıkar. Şırıngadaki numune hemen daha fazla işleme için iki mililitrelik bir tüpe aktarılır.Reaksiyon hücresinde ferrik demirin demire mikrobiyal azalması fotometrik analiz ile elde edilir. Mor renkli konsantrasyonbağımlı demir kompleksi ve göstergesi, demir ferrosen içeren demir standart çözümler bir dizi, bir kalibrasyon ajanı olarak hizmet vermektedir. Özel altın titanyum reaksiyon hücresi ile yapılan yüksek basınçlı reaktör deneyinin sonuçları, bakterilerin sülfür ve ferrik demiri demirdemire oksitlediğini ve basınç üzerinde önemli bir etkisi olduğunu göstermektedir.Bu şekilde, demir konsantrasyonlarının 22 günlük bir süre içinde artması, bir bar ve 100 bar basınçlarında yapılan deneyde gösterilmiştir. Tahlillerde bir bar ve 100 barda sırasıyla 31 ve 13 milimol demir tespit edildi. Bu açıkça mikrobiyal hücrelerin 100 bar bile aktif olduğunu göstermektedir, ancak ferrik demir azaltma aktivitesi yüksek basınç ta önemli ölçüde daha düşüktü.Taramalı elektron mikroskobu, çubuk şeklindeki hücrelerin düşük ve yüksek basınçta deneyde büyüdüğünü gösteriyor. Seyfried ve iş arkadaşları tarafından 1979 yılında geliştirilen esnek altın titanyum reaksiyon hücresi, çeşitli bilimsel araştırmalar için kullanılma potansiyeline sahiptir ve bunların hepsi aşındırıcı gazlar ve sıvılarla reaksiyonlar da dahil olmak üzere. Bir uygulama yüksek basınç ve sıcaklıklarda demir ve gazların çözünürlüğünün belirlenmesi olabilir.Bir diğeri ise petrol ve gaz oluşumu sırasında devam eden reaksiyonların belirlenmesi olabilir. Ve üçüncüsü, buradaki çalışmada olduğu gibi, yüksek basınç ve sıcaklıklardaki mikrobiyal reaksiyonları araştırıyor olabilir.

Research

JoVE Journal

Engineering

Quantification of Hydrogen Concentrations in Surface and Interface Layers and Bulk Materials through Depth Profiling with Nuclear Reaction Analysis

Nükleer Reaksiyon Analizi Derinlik Profiling yoluyla Yüzey ve Arayüz Katmanlar ve Dökme Malzeme Hidrojen Konsantrasyonları miktar tayini

Nuclear reaction analysis (NRA) via the resonant 1H(15N,&#945;&#947;)12C reaction is a highly effective method of depth profiling that quantitatively and ...

Dynamic Pore-scale Reservoir-condition Imaging of Reaction in Carbonates Using Synchrotron Fast Tomography

Sinkrotron Hızlı Tomografi ile Karbonat içinde Reaksiyon Dinamik Gözenek ölçekli Rezervuar-koşul Görüntüleme

Underground storage permanence is a major concern for carbon capture and storage. Pumping CO2 into carbonate reservoirs has the potential to dissolve ...

In Vitro Culture of Epicardial Cells From Mouse Embryonic Heart

In Vitro Culture of Epicardial Cells From Mouse Embryonic Heart

Fare Embriyonik From The Heart Epikardiyal Hücrelerinin Vitro Kültür

During embryogenesis, the epicardial contribution to coronary vasculature development has been very well established. Cells derived from the epicardium ...

Adsorption Device Based on a Langatate Crystal Microbalance for High Temperature High Pressure Gas Adsorption in Zeolite H-ZSM-5

Zeolit ​​Yüksek Sıcaklık Yüksek Basınçlı Gaz Adsorpsiyon için Langatate kristal mikro dayanarak Adsorpsiyon Cihazı H-ZSM-5

We present a high-temperature and high-pressure gas adsorption measurement device based on a high-frequency oscillating microbalance (5 MHz langatate ...

Subsurface Defect Localization by Structured Heating Using Laser Projected Photothermal Thermography

Lazerle Projeksiyonlu Fototermal Termografi Kullanılarak Yapısal Isıtma Yöntemiyle Alt Yüzey Kusurlu Lokalizasyonu

The presented method is used to locate subsurface defects oriented perpendicularly to the surface. To achieve this, we create destructively interfering ...

Visually Based Characterization of the Incipient Particle Motion in Regular Substrates: From Laminar to Turbulent Conditions

Görsel olarak bağlı normal yüzeylerde yeni başlayan parçacık çekimde karakterizasyonu: çalkantılı koşullarına Laminer üzerinden

Two different experimental methods for determining the threshold of particle motion as a function of geometrical properties of the bed from laminar to ...

Pore-scale Imaging and Characterization of Hydrocarbon Reservoir Rock Wettability at Subsurface Conditions Using X-ray Microtomography

Gözenek ölçekli görüntüleme ve hidrokarbon rezervuar Rock Wettability x-ışını Microtomography kullanarak yeraltı koşulları, karakterizasyonu

In situ wettability measurements in hydrocarbon reservoir rocks have only been possible recently. The purpose of this work is to present a protocol to ...

CO2 Photoreduction to CH4 Performance Under Concentrating Solar Light

CO2 Photoreduction to CH4 Performance Under Concentrating Solar Light

CO2 fotoreğitimlik ch4 performans altında konsantre güneş ışığı

We demonstrate a method for the enhancement of CO2 photoreduction. As the driving force of a photocatalytic reaction is from solar light, the basic idea ...

Multimodal 3D Printing of Phantoms to Simulate Biological Tissue

Biyolojik Doku Simüle Etmek Için Hayaletlerin Multimodal 3D Baskısı

Biomedical optical imaging is playing an important role in diagnosis and treatment of various diseases. However, the accuracy and the reproducibility of ...

Study of a Dot-patterning Process on Flexible Materials using Impact Print-Type Hot Embossing Technology

Darbe Baskı Tipi Sıcak Kabartma Teknolojisi Kullanılarak Esnek Malzemeler dekanlığı Çalışması

Here we present our study on an impact print-type hot embossing process which can create dot patterns with various designs, widths, and depths in real ...