Name: use of magnetic resonance imaging and biopsy data to guide sampling procedures for prostate cancer biobanking
Uploaded: 2019-10-10T13:00:00
Duration: 5 min 49 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Use of Magnetic Resonance Imaging and Biopsy Data to Guide Sampling Procedures for Prostate Cancer Biobanking at JoVE.com

Forfatterne ønsker at anerkende prostatacancer UK for finansiering SH under prostatacancer UK Centre of Excellence og Travelling Prize Fellowship (TLD-PF16-004) og HP under INNOVERE (PG14-018-TR2). Dette arbejde blev støttet af forskere ved National Institute for Health Research University College London hospitals biomedicinsk Forskningscenter.

Protokollen overholder lokale retningslinjer og er godkendt af UCL/UCLC biobank Forskningsetiske Komité (reference 15/YH/0311).
Bemærk: Da denne metode omfatter prøvetagning af humant væv, skal alle lokale procedurer vedrørende Etik og samtykke overholdes forud for indledningen af protokollen. Radikale prostatektomi tilfælde kan være inkluderet, hvis både MRI og biopsi data er tilgængelige forud for kirurgi, med tumor diameter ≥ 5 mm. tilfælde bør udelukkes, hvis indeks læsionen ikke er veldefineret, dvs kun diffuse ændringer er synlige ved MRI.
1. apparater til prostata udskæring
<ol><li>Køb prostata udskæring-apparatet (tabel over materialer). Alternativt kan du udskrive et klinge håndtag ved hjælp af en 3D-printer som tidligere udgivet10. Bemærk: Enheden og engangs bladene, der anvendes her, blev købt under materiale overførselsaftale fra Institute of Cancer Research, London, UK.</li>
</ol>2. tumor målretning
<ol><li>Gennemgå kliniske noter for at identificere indekslæsion som indikeret ved diagnostisk biopsi, f. eks, venstre posterior.</li>
	<li>Gennemgå MRI-billeder for at måle placeringen af ovennævnte tumor.<ol>
<li>Find sekvensen, hvor tumoren er mest synlig i det aksiale plan, fx T2-vægtet.</li>
		<li>Rul gennem aksiale billeder for at finde det billede, hvor tumoren er størst, og Udskriv billede til reference.</li>
		<li>I den tilsvarende koronal billede, måle afstanden fra bunden af prostata til den valgte aksiale position, og den fulde længde af prostata fra spids til Base (mm), og udskrive til reference.</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. samling af Pprostata
<ol><li>Kontrollér patient noterne for at sikre passende informeret samtykke til denne procedure og eventuelle downstream-forsknings applikationer.</li>
	<li>Efter radikal prostatektomi, indsamle prostata i en tør gryde. Sørg for, at der ikke er tilsat nogen form Alin eller andre fikat opløsninger til prostata.</li>
	<li>Overfør til et egnet sterilt sted til prøvetagning, fx en laminar flow hætte i et patologisk laboratorium.</li>
	<li>Fortsæt til prøvetagning så hurtigt som muligt, hvis der er behov for fersk væv. Bemærk: For visse anvendelser (f. eks. vurdering af DNA, som ikke bør nedbrydes så hurtigt som RNA), kan det være hensigtsmæssigt at opbevare prøven i køleskab og tage prøverne næste dag.</li>
</ol>4. klargøring af præparatet
<ol><li>Forbered laminar flow hætte og prostata udskæring apparater i henhold til lokale dekontamineringsprocedurer, ved hjælp af steril teknik. Her spray 70% ethanol og tørres på tværs af alle overflader. Brug sterile engangsnåle og Scalpels. Brug udsnitsklinger op til tre gange; vask efter hver brug i varmt sæbevand, derefter spray og tørres med 70% ethanol.</li>
	<li>Afvejes prostata (g) ved hjælp af en Standardskala.</li>
	<li>Blæk prostata. Mal venstre side med blåt blæk og højre side med sort blæk. Dæk den fulde kapsel og skelsættende vesikler med blæk til senere betegner de kirurgiske margener. Bemærk: Inking procedurer kan variere lokalt og kan ændres i overensstemmelse hermed.</li>
</ol>5. prostata udskæring
<ol><li>Monter udsnitnings apparatet ved at anbringe væggene vinkelret i foden af stativet (figur 1A).</li>
	<li>Placer prostata, så basen og spidsen vender mod modsatte vægge, med den bageste side nedad og forreste opad. Placer guld stifter omkring prostata. Push prostata indad lidt om nødvendigt for at få en tætsiddende pasform, som vil støtte prostata under udskæring.</li>
	<li>Mål prostata længde fra base til spids, ved hjælp af en lineal, og Sammenlign med prostata længde som målt ved Mr. Hvis prostata er skrumpet, skal du anvende en ad hoc korrektion til den forventede afstand fra base til mål tværgående skive. For eksempel, hvis den fulde længde af prostata i MRI-billedet er 50 mm, men når målt med en lineal på dette punkt er skrumpet til 45 mm, reducere den forventede udskæring position med 10%.</li>
	<li>Mål fra bunden til det ønskede tværsnit. Vælg den pinkode, der sidder tættest på denne måling, for at skære rundt.</li>
	<li>Iført Chainmail handsker for at forhindre skade, hold udskæring enhed (figur 1B), Placer blade hver side af den identificerede PIN og bruge afstandsstykket til at holde bladene 5 mm fra hinanden. Tag skive ved at bevæge knivene langsomt og forsigtigt nedad, fremad og bagud med lange strøg (figur 1C). Sørg for, at en fuld skive er blevet adskilt inden demontering af apparatet.</li>
	<li>Fjern vægge og stifter, og Tag forsigtigt udsnittet ud på et sterilt ark kork plade med handsker.</li>
</ol>6. vævs prøvetagning
<ol><li>Undersøg visuelt det tværgående udsnit, og Sammenlign med det aksiale MRI-billede. I nogle tilfælde kan tumor området synes bleer end omgivende væv.</li>
	<li>Palpere den tværgående skive forsigtigt. I nogle tilfælde kan tumoren føles fastere end det omgivende væv.</li>
	<li>Brug det aksiale MRI-billede som en hjælpelinje, og vælg et eller flere områder til prøvetagning.</li>
	<li>
Tag biopsi slag af ønskede område af væv.
	<ol>
<li>Brug en 6 mm punch, Tryk ned på det ønskede område af væv.</li>
		<li>Drej vævs punch på stedet og ned mod proppen for at sikre fuld adskillelse og brug en skarp skalpel til at adskille om nødvendigt.</li>
		<li>Fjern punch og Placer i rør/forme efter behov ved at skubbe ved hjælp af stemplet.</li>
		<li>Gentag for yderligere tumor og godartede prøver efter behov, med separate sterile biopsi punches. Blæk hullerne, hvor slag blev taget i rødt.</li>
		<li>Bemærk placeringen af hver punch sammen med vægten af prostata og eventuelle observationer på vævs farve/fasthed.</li>
	</ol>
</li>
</ol>7. indsendelse af prostata til lokal diagnostik
<ol><li>Fastgør prostata til kork med sterile engangsnåle før fiksering for at forhindre vævs svind og vridning, hvilket kan ændre udseendet af de kirurgiske margener.</li>
	<li>Efter fastgørelse til kork, indsende prostata til histopatologiske afdeling for standard klinisk diagnostik.</li>
</ol>8. dekontaminering af apparatur
<ol><li>Kassér alt engangsudstyr i biomedicinske affaldsstrømme og/eller skarpe beholdere som lokalt udpegede.</li>
	<li>Laminar flow hætten og prostata udskæring-apparatet dediskes i overensstemmelse med lokale risikovurderinger, som er passende for humant væv (f. eks. ved sprøjtning med 70% EtOH og aftørring).</li>
</ol>

<ol>
	<li>Sooriakumaran, P., Henderson, A., Denham, P., Langley, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+novel+method+of+obtaining+prostate+tissue+for+gene+expression+profiling.">A novel method of obtaining prostate tissue for gene expression profiling.</a> International Journal of Surgical Pathology. 17 (3), 238-243 (2009).</li><li>Jhavar, S. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Processing+of+radical+prostatectomy+specimens+for+correlation+of+data+from+histopathological,+molecular+biological,+and+radiological+studies:+a+new+whole+organ+technique.">Processing of radical prostatectomy specimens for correlation of data from histopathological, molecular biological, and radiological studies: a new whole organ technique.</a> Journal of Clinical Pathology. 58 (5), 504-508 (2005).</li><li>Wheeler, T. M., Lebovitz, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fresh+tissue+harvest+for+research+from+prostatectomy+specimens.">Fresh tissue harvest for research from prostatectomy specimens.</a> The Prostate. 25 (5), 274-279 (1994).</li><li>Esgueva, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Next-generation+prostate+cancer+biobanking:+toward+a+processing+protocol+amenable+for+the+International+Cancer+Genome+Consortium.">Next-generation prostate cancer biobanking: toward a processing protocol amenable for the International Cancer Genome Consortium.</a> Diagnostic Molecular Pathology. 21 (2), 61-68 (2012).</li><li>Dev, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biobanking+after+robotic-assisted+radical+prostatectomy:+a+quality+assessment+of+providing+prostate+tissue+for+RNA+studies.">Biobanking after robotic-assisted radical prostatectomy: a quality assessment of providing prostate tissue for RNA studies.</a> Journal of Translational Medicine. 9, 121 (2011).</li><li>Tolkach, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Blind+Biobanking+of+the+Prostatectomy+Specimen:+Critical+Evaluation+of+the+Existing+Techniques+and+Development+of+the+New+4-Level+Tissue+Extraction+Model+With+High+Sampling+Efficacy.">Blind Biobanking of the Prostatectomy Specimen: Critical Evaluation of the Existing Techniques and Development of the New 4-Level Tissue Extraction Model With High Sampling Efficacy.</a> The Prostate. 77 (4), 396-405 (2017).</li><li>Warren, A. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Method+for+sampling+tissue+for+research+which+preserves+pathological+data+in+radical+prostatectomy.">Method for sampling tissue for research which preserves pathological data in radical prostatectomy.</a> The Prostate. 73 (2), 194-202 (2013).</li><li>Heavey, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PatiEnt+prOstate+samPLes+for+rEsearch,+a+tissue+collection+pathway+utilizing+magnetic+resonance+imaging+data+to+target+tumor+and+benign+tissue+in+fresh+radical+prostatectomy+specimens.">PatiEnt prOstate samPLes for rEsearch, a tissue collection pathway utilizing magnetic resonance imaging data to target tumor and benign tissue in fresh radical prostatectomy specimens.</a> The Prostate. 79 (7), 768-777 (2019).</li><li>Bailey, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=VERDICT+MRI+validation+in+fresh+and+fixed+prostate+specimens+using+patient-specific+moulds+for+histological+and+MR+alignment.">VERDICT MRI validation in fresh and fixed prostate specimens using patient-specific moulds for histological and MR alignment.</a> NMR in Biomedicine. 32 (5), 4073 (2019).</li><li>Bourne, R. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Apparatus+for+Histological+Validation+of+In+Vivo+and+Ex+Vivo+Magnetic+Resonance+Imaging+of+the+Human+Prostate.">Apparatus for Histological Validation of In Vivo and Ex Vivo Magnetic Resonance Imaging of the Human Prostate.</a> Frontiers in Oncology. 7, 47 (2017).</li></ol>

Forfatterne har intet at afsløre.

Kritiske trin i denne protokol omfatter identifikation af tumor region for prøvetagning, måling af prostata, og vævs prøvetagning. For det første er måling af MRI for at identificere det korrekte område af prøveudtagningen afgørende. Vi demonstrerer denne metode i den medfølgende video; men vi anbefaler også at bekræfte målinger med en radiolog i første omgang. Klare kliniske noter, som peger forskeren mod området af MRI billeder, der indeholder indekset læsion er ideelle. For det andet, måling af prostata bør udføres med omhu, at sikre, at linealen holdes i en vinkel for at måle den fulde længde fra base til spids, parallelt med den forreste af prostata. For det tredje bør tumor områder bekræftes forud for prøvetagning ved visuelt at inspicere vævs skive i forhold til det oprindelige MRI-billede, palpere vævet (i nogle tilfælde tumor området kan føle sig mere tætte), og visuelt vurdere farven på vævet (i nogle tilfælde tumoren vil fremstå mere bleg end omgivende godartet væv).
Denne protokol er blevet gennemført fuldt ud på UCL/UCLH af ikke-kliniske postdoktorale forskere, en patologi stipendiat, patologiske konsulenter og forsknings teknikere. I vores erfaring kan alle trin i protokollen læres i under ti tilfælde uanset teknisk baggrund. Vi anbefaler dog, at der undervisning fra en radiolog om MRI-måling og træning fra en patolog om udskæring i første omgang. Protokollen kan ændres ved hjælp af et 3D-trykt udskæring-håndtag, som tidligere udgivet10.
Potentielle begrænsninger af teknikken omfatter risikoen for at hæmme diagnosen. Udskæring af prostata er et vigtigt skridt, som kan hæmme på sortering eller positive margin satser, hvis det gøres forkert. Der er to potentielle problemer her. For det første, hvis alle indekslæsion fjernes og anvendes til frisk væv eksperimenter straks, rutinemæssig klinisk diagnostik vil ikke blive udført for denne læsion og patienten kan blive fejldiagnosticeret som havende en lavere grad kræft. For at undgå dette bør forskeren drøfte prøveudtagningsplanen med konsulent patologen, som rutinemæssigt vil gennemgå sagen, før prøveudtagningen, og blive enige om antallet og placeringen af de prøver, der skal udtages. Små tumorer kan udelukkes lokalt af denne grund. For det andet, hvis den prostatiske kapsel ikke er fastgjort korrekt til Korkplader forud for fiksering, dette kunne tillade det inderste væv til at bule udad under fiksering, ændre de kirurgiske margener. Dette kunne føre til en falsk positiv margin, hvor den resterende tumor synes at opholde sig på kapslen udelukkende på grund af vævs vridning.
Betydningen af denne teknik med hensyn til eksisterende metoder ligger hovedsageligt med tumor målretning. En række metoder til prøvetagning af radikale prostatektomi enheder er blevet offentliggjort til dato; disse er dog alle afhængige af en helt eller delvis stikprøveudtagning tilgang1,2,3,4,5,6,7. Brugen af biopsi og især MRI data her har forbedret effektivitet, giver mulighed for reduceret prøvetagning med øget tillid til at opnå tumor væv8.
Fremtidige anvendelser af denne metode giver mulighed for at vedtage en bredere vifte af downstream-teknikker end med tidligere prøvetagningsmetoder. For eksempel, tilgængeligheden af fersk væv, der har en høj sandsynlighed for at være tumor betyder, at dyrere og/eller arbejdskraftintensive friske væv teknikker kan udnyttes, da mange prøver ikke er forpligtet til at sikre tilstedeværelsen af tumor. Dette kan omfatte og er ikke begrænset til ex vivo-kultur, ex vivo MRI, avanceret billeddannelse og transkriptomik.

Adgang til høj kvalitet humant prostatacancer væv er et centralt krav for at køre effektiv forskning på området. Der er en række eksisterende metoder til at prøve prostata væv efter radikal prostatektomi for forskning. Typisk disse involverer ved hjælp af punch biopsier til at tage tilfældige prøver fra en frisk, frosset eller fast skive af prostata væv, og retrospektivt bekræfter, om tumor er til stede i hver prøve ved hematoxylinlegemer & eosin (H & E) som vurderet af en uropatolog1,2,3,4,5. En nylig gennemgang har samlet en oversigt over disse eksisterende metoder6. Disse metoder er nyttige for visse downstream-anvendelser, hvor væv kan lagres og vurderes for tumor indhold på et senere tidspunkt, såsom stor skala genomanalyser som international Cancer Genome Consortium (ICGC) og cancer Genome Atlas (TCGA) 4,7. Men, disse metoder kunne forbedres på i hvis vi skulle bruge magnetisk resonans imaging (MRI) og/eller biopsi data til at målrette specifikke områder af prostata til prøvetagning. Dette vil forbedre metodologien på to måder; for det første ved at reducere antallet af indsamlede vævsprøver, øge effektiviteten og reducere presset på patologiske afdelinger og oplagringsomkostninger og for det andet ved at tillade, at fersk væv anvendes straks uden behov for øjeblikkelig bekræftelse af tumor indhold, for nye state of the art downstream teknologier såsom levende væv Imaging, organoid generation eller ex vivo kultur. Dette forskningsbehov har ført til udviklingen af de mennesker (PatiEnt prostata prøver til forskning) metode, og resultaterne fra de første 84 tilfælde biobanked ved hjælp af mennesker blev for nylig offentliggjort8. En variation af denne metode er også blevet offentliggjort med en tredimensionel (3D) trykt udskæring apparater og patient-specifikke skimmel, for at lette ex vivo MRI på præ-og post-fikserings vævet9,10.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:1040px;" width="1039">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:208px;">6 mm biopsy punch</td>
			<td style="width:247px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:115px;">13404607</td>
			<td style="width:471px;">Disposable biopsy punches for removing 6 mm tissue samples</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:208px;">Black Ink</td>
			<td style="width:247px;">Leica Biosystems</td>
			<td style="width:115px;">3801753</td>
			<td>Tissue marking &#38; margin dye</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:208px;">Blue Ink</td>
			<td style="width:247px;">Leica Biosystems</td>
			<td style="width:115px;">3801751</td>
			<td>Tissue marking &#38; margin dye</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:208px;">Chainmail hand glove</td>
			<td style="width:247px;">Arco</td>
			<td>1456803</td>
			<td>Chainmail gloves to protect hand during slicing</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:208px;">Cork board</td>
			<td style="width:247px;">Fisher Scientific</td>
			<td>12396447</td>
			<td>Cork board for pinning prostate to following sampling procedure</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:208px;">Needles</td>
			<td style="width:247px;">SLS (Scientific Laboratory supplies)</td>
			<td>SYR6112</td>
			<td>Sterile needles to use to pin tissue to cork board following sampling</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:208px;">Prostate slicing aparatus</td>
			<td style="width:247px;">Insitute of Cancer Research, London</td>
			<td style="width:115px;">NA - must be obtained under MTA</td>
			<td>A kit containing the slicer handle, blades, spacer, base, walls and pins</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

use of magnetic resonance imaging and biopsy data to guide sampling procedures for prostate cancer biobanking

Tidligere metoder til biobanking prostata væv, efter radikal prostatektomi, generelt involveret tilfældig prøvetagning. For at øge effektiviteten og muliggøre et større udvalg af downstream-applikationer blev der udviklet en mere målrettet metode til prøvetagning af prostata væv. Her bruger vi både magnetisk resonans imaging (MRI) og biopsi data til at målrette specifikke områder af organet til prøvetagning. Metoden indebærer brug af en tidligere offentliggjort prostata udskæring anordning, som fjerner en 5 mm tværsnit skive fra en forudbestemt region af prostata, efterfulgt af fjernelsen af 6 mm punch biopsier fra forudbestemte områder af denne skive. Disse prøver kan opbevares frosset eller fast til biobanking formål, eller anvendes friske straks med 70% tillid til tumor indhold, sammenlignet med 10% tillid fra stikprøveudtagning tilgang. Dette gør det muligt at anvende alle standard downstream-teknikker såsom genomforskning, proteomik eller histologisk arbejde, men også arbejde, der kræver fersk væv såsom levende vævs dannelse eller ex vivo-kultur.

Frisk prostata væv, der udtages prøver af metoden PEOPLE, kan anvendes til en lang række downstream-teknikker, herunder genomsekvensering og ex vivo-kultur. De første 59 tilfælde, hvor denne metode blev udtaget, er tidligere blevet offentliggjort sammenlignet med en tidligere version af metoden sammen med de oprindelige downstream-data8. Tiden fra første skæring prostata til frysning/fastsættelse punch biopsier her var ca 1 min, som blev holdt på et minimum for at undgå nedbrydning af RNA. Tid fra fjernelse af prostata til prostata udskæring bør også holdes på et minimum, selvom her dette tog ca. 20 min på grund af vores teater og patologi Labs at være i forskellige steder.
Afhængigt af downstream-applikationen udtages typisk mindst to prøver: en fra et område af forventet tumor væv og en fra et område af forventet godartet væv. Det vigtigste mål for succes for stikprøvemetoden i sig selv er at vurdere tumor indholdet i en given prøve.
For indrejse i 100.000 genomer projektet, en H & E farvede væv afsnit skal vurderes af en uropatolog, og prøven skal indeholde mindst 40% tumorceller. Prøver, der indeholder mindre end 40% tumor kan stadig indgå i projektet, hvis de er med held makrodissekeret. Af de første 92 tilfælde i stikprøven på denne måde, 64% indeholdt mindst 40% tumor og blev indsendt til 100.000 genomer projekt uden macrodissection. DNA blev ekstraheret og var af tilstrækkelig udbytte og kvalitet i alle tilfælde (tabel 1). En første delmængde af 59 af disse prøver blev tidligere offentliggjort i sammenligning med en tidligere metode8.
For ex vivo-kulturen skal matchet tumor og godartet væv være af tilstrækkelig kvalitet til at modstå 72 h-kulturen uden signifikant nedbrydning. Flere vævsprøver fra i alt tre patienter blev dyrket med succes8.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60216/60216fig1.jpg"> Figur 1: apparater til udsnitning af prostata. Dette apparat blev opnået i henhold til materiale overførsels aftalen fra Institute of Cancer Research. (A) væggene er indsat vinkelret på basen, og guld stifter er indsat i bunden omkring prostata (prostata ikke afbilledet). B) de udskiftelige parallelle klinger indsættes i kniv håndtaget. (C) knivene passerer mellem guld stifterne for at skære en 5 mm del af prostata. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60216/60216fig1large.jpg" target="_blank">Venligst klik her for at se en større version af dette tal.</a>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1"><tbody>
<tr>
<td></td>
			<td>n (%)</td>
		</tr>
<tr>
<td>Hit (> 40% tumor)</td>
			<td>59 (64%)</td>
		</tr>
<tr>
<td>Partielt hit (5-30% tumor)</td>
			<td>6 (7%)</td>
		</tr>
<tr>
<td>Miss (0% tumor)</td>
			<td>27 (29%)</td>
		</tr>
<tr>
<td>Samlede</td>
			<td>92 (100%)</td>
		</tr>
</tbody></table>Tabel 1: tumor hit rate. Tumor hit sats blev bestemt af en konsulent patolog med speciale i prostatakræft, efter gennemgang af H & E farvede væv. Tumor celleindhold af > 40% var fast besluttet på at være egnet til optagelse i 100.000 genomer projekt, som pr Genomics England retningslinjer.

Watch this Scientific Journal Video about Use of Magnetic Resonance Imaging and Biopsy Data to Guide Sampling Procedures for Prostate Cancer Biobanking at JoVE.com

Use of Magnetic Resonance Imaging and Biopsy Data to Guide Sampling Procedures for Prostate Cancer Biobanking

Denne metode indebærer udnyttelse af kliniske diagnostiske data for prostatacancer patienter for at vejlede prøveudtagningsprocedurer, når biobanking væv efter radikal prostatektomi. Dette overvinder problemer med tidligere offentliggjorte metoder omkring effektivitet og tilgængelighed af fersk væv for en bredere vifte af downstream-applikationer.

Brug af magnetisk resonansbilleddannelse og biopsi data til at vejlede prøveudtagningsprocedurer for prostata cancer Biobanking

Previous methods for biobanking prostate tissue, following radical prostatectomy, generally involved random sampling. In order to increase efficiency, and ...

Betydningen af denne protokol i forhold til tidligere prostata prøvetagning metoder er, at det giver os en højere tillid til at målrette frisk tumorvæv til forskning. Derfor kan vi tage det friske væv direkte tilbage til laboratoriet og bruge det til kultur eller billeddannelse, fordi vi har en høj tillid til, hvilke prøver er tumor, og som er godartede. Mit vigtigste råd, når man lærer teknikken, er at arbejde med din lokale patolog, så den endelige vævsdiagnose og -rapport ikke kompromitteres.At målrette tumor placering, gennemgå MR-billeder til at måle placeringen over tumoren og finde den sekvens, hvor tumoren er mest synlig i aksiale plan. Rul gennem de aksiale billeder for at identificere det billede, hvor tumoren er den største, og udskriv billedet som reference. I det tilsvarende koronalbillede måles afstanden fra prostatas bund til den valgte aksiale position, og prostatas fulde længde måles fra toppen til bunden i millimeter.Derefter udskrive disse målinger og markere placeringen af tumoren til reference. Efter prøven er indsamlet, sterilisere laminar flow hætte og prostata udskæring apparat med 70% ethanol og veje prostata på en standard skala i gram. Derefter male højre side med blåt blæk og venstre side af prøven med sort blæk, der dækker hele kapsel og sædsjegler med blæk til at tillade forskelsbehandling af de kirurgiske margener.At skære prostata, placere væv med basen og spids vender modsatte vægge af apparatet med den bageste side ned og den forreste side op. Placer guld stifter omkring vævsprøven skubbe prostata indad lidt om nødvendigt for at opnå en lun pasform og måle prostata længde fra bunden til toppen for at sammenligne denne måling til prostata længde, der måles ved MR. Hvis prostata er krympet, justere den forventede udskæring position med den relevante procentdel af reduktionen.Derefter skal du måle fra bunden til den ønskede tværgående skive og vælge den stift, der sidder tættest på denne måling for at skære rundt. Iført chainmail handsker for at forhindre skader, placere knivene på udskæring enhed på hver side af den identificerede pin og bruge afstandsanordningen til at holde knivene fem millimeter fra hinanden. For at få skiven til at tage skiven ud, skal du bruge lange strøg til langsomt, men fast at bevæge knivene nedad, fremad og bagud, hvilket bekræfter, at en fuld skive er blevet adskilt, før apparatet skilles ad.Fjern derefter vægge og stifter og brug handsker til forsigtigt at overføre skiven på et sterilt stykke opslagstavle. Efter erhvervelse af prøven, visuelt inspicere den tværgående skive til sammenligning med aksiale MR-billede. I nogle tilfælde, tumorområdet kan synes lysere end det omgivende væv.Palper den tværgående skive forsigtigt. Tumoren kan føle sig fastere end det omgivende væv. Brug aksiale MR-billede som en guide, skal du vælge et eller flere områder til prøveudtagning og bruge en seks millimeter punch til at skubbe ned på væv område af interesse.Drej vævspund på stedet og ned mod proppen for at sikre en fuld adskillelse ved hjælp af en skarp skalpel til at adskille biopsiprøven fra prøven efter behov. Når prøven er anskaffet, fjernes stansningen, og stemplet anvendes til at skubbe prøven ud i den relevante beholder til den efterfølgende downstream-analyse. Så blæk hullerne, hvor slagene blev taget i rødt og bemærk placeringen af hver punch sammen med vægten af prostata og eventuelle observationer om vævsfarve og fasthed.Fastgør prostatakapslen til proppen for at forhindre bilging under fikseringen. Nedsænk prostata og kork i fiksativ sikre prøven er helt nedsænket. I denne repræsentative analyse indeholdt 64 % af prøverne af de første 92 tilfælde, der blev udtaget prøver, mindst 40 % tumor og blev sendt til 100.000 genomprojekt uden mikrodissektion.DNA blev udvundet og var af tilstrækkelig udbytte og kvalitet i alle tilfælde, og en indledende delmængde på 59 af disse prøver er blevet offentliggjort til sammenligning med en tidligere prøvetagningsmetode. Efter denne procedure, de friske tumor prøver kan bruges til enten levende billeddannelse eller kultur giver os mulighed for at teste nye biomarkører, narkotika, og finde ud af mere om tumor biologi. Nu, hvor vi bruger denne metode rutinemæssigt, jeg har været i stand til at fremsætte et projekt ved hjælp af dette væv til ex vivo kultur til at se på nye kombinationer af prækliniske behandlinger for prostatakræft.

Research

JoVE Journal

Medicine

Magnetic Resonance Derived Myocardial Strain Assessment Using Feature Tracking

Purpose: An accurate and practical method to measure parameters like strain in myocardial tissue is of great clinical value, since it has been shown, that ...

Multi-modal Imaging of Angiogenesis in a Nude Rat Model of Breast Cancer Bone Metastasis Using Magnetic Resonance Imaging, Volumetric Computed Tomography and Ultrasound

Multi-modal Imaging af angiogenese i en nøgen rotte model af Breast Cancer knoglemetastaser Brug Magnetic Resonance Imaging, Volumetrisk Computed Tomography og Ultralyd

Angiogenesis is an essential feature of cancer growth and metastasis formation. In bone metastasis, angiogenic factors are pivotal for tumor cell ...

Microarray-based Identification of Individual HERV Loci Expression: Application to Biomarker Discovery in Prostate Cancer

Microarray-baserede identifikation af individuelle HERV Loci Expression: Ansøgning til biomarkør opdagelse i Prostata Cancer

The prostate-specific antigen (PSA) is the main diagnostic biomarker for prostate cancer in clinical use, but it lacks specificity and sensitivity, ...

Tracking the Mammary Architectural Features and Detecting Breast Cancer with Magnetic Resonance Diffusion Tensor Imaging

Sporing mælke- arkitektoniske træk og Afsløring brystkræft med magnetisk resonans Diffusion Tensor Imaging

Breast cancer is the most common cause of cancer among women worldwide. Early detection of breast cancer has a critical role in improving the quality of ...

Quantitative Magnetic Resonance Imaging of Skeletal Muscle Disease

Kvantitativ Magnetic Resonance Imaging af Skeletal Muscle Disease

Quantitative magnetic resonance imaging (qMRI) describes the development and use of MRI to quantify physical, chemical, and/or biological properties of ...

Dynamic Contrast Enhanced Magnetic Resonance Imaging of an Orthotopic Pancreatic Cancer Mouse Model

Dynamisk kontrast Forbedret Magnetic Resonance Imaging af en ortotopisk kræft i bugspytkirtlen Mouse Model

Dynamic contrast enhanced magnetic resonance imaging (DCE-MRI) has been limitedly used for orthotopic pancreatic tumor xenografts due to severe ...

Simultaneous PET/MRI Imaging During Mouse Cerebral Hypoxia-ischemia

Samtidig PET / MR Imaging Under Mouse Cerebral iskæmi Hypoxi-

Dynamic changes in tissue water diffusion and glucose metabolism occur during and after hypoxia in cerebral hypoxia-ischemia reflecting a bioenergetics ...

Cardiac Magnetic Resonance Imaging at 7 Tesla

Hjerte Magnetic Resonance Imaging på 7 Tesla

CMR at an ultra-high field (magnetic field strength B0&#160;&#8805; 7 Tesla) benefits from the signal-to-noise ratio (SNR) advantage inherent at higher ...

Phase Contrast Magnetic Resonance Imaging in the Rat Common Carotid Artery

Fase kontrast magnetisk resonans i rotte fælles halspulsåren

Phase contrast magnetic resonance imaging (PC-MRI) is a noninvasive approach that can quantify flow-related parameters such as blood flow. Previous ...

Quantification of Levator Ani Hiatus Enlargement by Magnetic Resonance Imaging in Males and Females with Pelvic Organ Prolapse

Kvantificering af Levator Ani Hiatus udvidelsen af magnetisk resonans i hanner og hunner med bækken orgel prolaps

Here we present a protocol to examine the levator ani hiatus in males and females with pelvic organ prolapse, during the Valsalva maneuver and while ...