Name: use of magnetic resonance imaging and biopsy data to guide sampling procedures for prostate cancer biobanking
Uploaded: 2019-10-10T13:00:00
Duration: 5 min 49 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Use of Magnetic Resonance Imaging and Biopsy Data to Guide Sampling Procedures for Prostate Cancer Biobanking at JoVE.com

Författarna vill erkänna prostatacancer UK för finansiering SH under prostatacancer UK Centre of Excellence och resa Prize Fellowship (TLD-PF16-004) och HP under innovation (PG14-018-TR2). Detta arbete stöddes av forskare vid National Institute for Health Research University College London Hospitals biomedicinska forskningscentret.

Protokollet följer lokala riktlinjer och godkänns av UCL/UCLC Biobank Research etik Committee (referens 15/YH/0311).
Anmärkning: Eftersom denna metod inbegriper provtagning av mänsklig vävnad, måste alla lokala procedurer avseende etik och samtycke följas innan protokollet inleds. Radikala prostatektomi-fall kan inkluderas om både MRT-och biopsidata finns tillgängliga före operationen, med tumör diameter ≥ 5 mm. fall bör uteslutas om index lesionen inte är väl definierad, d.v.s. endast diffusa förändringar är synliga vid MRT.
1. apparat för prostata skärning
<ol><li>Köpa prostata skivning apparat (tabell över material). Du kan också skriva ut ett blad handtag med en 3D-skrivare som tidigare publicerat10. Anmärkning: Enheten och engångsbladen som används här köptes under material överföringsavtal från Institute of cancer Research, London, UK.</li>
</ol>2. tumör inriktning
<ol><li>Granska kliniska anmärkningar för att identifiera index lesionen som indikeras av diagnostiska biopsi, e.g., vänster bakre.</li>
	<li>Granska MRI-bilder för att mäta placeringen av ovanstående tumör.<ol>
<li>Hitta den sekvens där tumören är mest synlig i det axiella planet, t. ex., T2-vägd.</li>
		<li>Bläddra genom axiella bilder för att hitta den bild där tumören är störst och skriv ut bilden som referens.</li>
		<li>I motsvarande koronala bild, mäta avståndet från basen av prostatan till den valda axiella positionen, och den fulla längden av prostatan från Apex till basen (mm), och skriv ut för referens.</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. insamling av pProstate
<ol><li>Kontrollera patient noteringar för att säkerställa att lämpligt informerat samtycke har erhållits för detta förfarande och eventuella efterföljande forskningsansökningar.</li>
	<li>Efter Radikal prostatektomi, samla in prostatan i en torr kruka. Se till att ingen formalin eller andra fixativ har lagts till i prostatan.</li>
	<li>Överför till en lämplig steril plats för provtagning, t ex ett laminärt flödes skydd i ett patologi laboratorium.</li>
	<li>Fortsätt till provtagning så snart som möjligt om färsk vävnad krävs. Anmärkning: För vissa tillämpningar (t. ex. bedömning av DNA som inte bör brytas ned lika snabbt som RNA) kan det vara lämpligt att kyla preparatet och ta prover nästa dag.</li>
</ol>4. preparat beredning
<ol><li>Förbered laminär Flow Hood och prostata skivning apparater enligt lokala sanering förfaranden, med hjälp av steril teknik. Här, spraya 70% etanol och torka över alla ytor. Använd sterila engångsnålar och skalpeller. Använd utsnitts blad upp till tre gånger; Tvätta efter varje användning i hett tvålvatten, sedan spraya och torka med 70% etanol.</li>
	<li>Väg prostatan (g) med en standard skala.</li>
	<li>Bläck prostatan. Måla vänster sida med blått bläck och höger sida med svart bläck. Täck hela kapseln och sädesblåsor med bläck för att senare beteckna de kirurgiska marginalerna. Anmärkning: Inking-procedurer kan variera lokalt och kan ändras i enlighet med detta.</li>
</ol>5. prostata skivning
<ol><li>Montera skivning apparaten genom att sätta in väggarna vinkelrätt i stativet (figur 1A).</li>
	<li>Placera prostata så att basen och Apex står inför motsatta väggar, med den bakre sidan nedåt och anterior upp. Placera guldnålar runt prostata. Tryck prostata inåt något om det behövs för att få en ombonad passform, som kommer att stödja prostatan under skivning.</li>
	<li>Mät prostata längd från bas till Apex, med hjälp av en linjal, och jämföra med prostata längd mätt med MRI. Om prostatan har krympt, tillämpa en ad hoc-korrigering till det förväntade avståndet från bas till mål tvärgående skiva. Till exempel, om den fulla längden av prostatan i MRI-bilden är 50 mm, men när den mäts med en linjal på denna punkt har krympt till 45 mm, minska den förväntade skivning position med 10%.</li>
	<li>Mät från basen till önskad tvärgående skiva. Välj den PIN-kod som ligger närmast denna mätning för att skära runt.</li>
	<li>Bär Chainmail handskar för att förhindra skada, håll skivning enhet (figur 1B), placera bladen på vardera sidan av den identifierade stift och använda spacer för att hålla bladen 5 mm isär. Ta skiva genom att sakta och stadigt flytta bladen nedåt, framåt och bakåt med långa streck (figur 1C). Se till att en hel skiva har separerats innan apparaten demonterats.</li>
	<li>Ta bort väggar och stift och försiktigt ta slice ut på ett sterilt ark kork ombord med handskar.</li>
</ol>6. provtagning av vävnad
<ol><li>Inspektera det tvärgående segmentet visuellt och jämför med den axiella MRI-bilden. I vissa fall, tumör området kan visas blemmare än omgivande vävnad.</li>
	<li>Palpate den tvärgående slice försiktigt. I vissa fall, tumören kan kännas fastare än den omgivande vävnaden.</li>
	<li>Använd den axiella MRI-bilden som guide och välj ett eller flera områden för provtagning.</li>
	<li>
Ta biopsi stansar av önskat område av vävnad.
	<ol>
<li>Med en 6 mm Punch, tryck ner på önskat område av vävnad.</li>
		<li>Vrid vävnaden Punch på plats och ner mot korken för att säkerställa full separation och använda en skarp skalpell att separera vid behov.</li>
		<li>Ta bort stans och placera i rör/formar som behövs genom att mata ut med hjälp av kolven.</li>
		<li>Upprepa för ytterligare tumör och godartade prover som krävs, med separata sterila biopsi stansar. Bläcket hålen där stansar togs i rött.</li>
		<li>Notera placeringen av varje Punch tillsammans med vikten av prostata och eventuella observationer på vävnad färg/fasthet.</li>
	</ol>
</li>
</ol>7. inlämning av prostata för lokal diagnostik
<ol><li>Stift prostatan till kork med sterila engångsnålar före fixering för att förhindra vävnad krympning och skevhet, vilket kan förändra utseendet på de kirurgiska marginalerna.</li>
	<li>Efter fastlåsning till Cork, skicka prostatan till histopatologisk avdelning för standard klinisk diagnostik.</li>
</ol>8. dekontaminering av apparater
<ol><li>Kassera all engångsutrustning i biomedicinska avfallsströmmar och/eller behållare för vassa föremål som utsetts lokalt.</li>
	<li>Sanera laminarflödeshuven och prostataskivning i enlighet med lokala riskbedömningar som är lämpliga för mänsklig vävnad (t. ex. genom sprutning med 70% EtOH och torkning).</li>
</ol>

<ol>
	<li>Sooriakumaran, P., Henderson, A., Denham, P., Langley, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+novel+method+of+obtaining+prostate+tissue+for+gene+expression+profiling.">A novel method of obtaining prostate tissue for gene expression profiling.</a> International Journal of Surgical Pathology. 17 (3), 238-243 (2009).</li><li>Jhavar, S. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Processing+of+radical+prostatectomy+specimens+for+correlation+of+data+from+histopathological,+molecular+biological,+and+radiological+studies:+a+new+whole+organ+technique.">Processing of radical prostatectomy specimens for correlation of data from histopathological, molecular biological, and radiological studies: a new whole organ technique.</a> Journal of Clinical Pathology. 58 (5), 504-508 (2005).</li><li>Wheeler, T. M., Lebovitz, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fresh+tissue+harvest+for+research+from+prostatectomy+specimens.">Fresh tissue harvest for research from prostatectomy specimens.</a> The Prostate. 25 (5), 274-279 (1994).</li><li>Esgueva, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Next-generation+prostate+cancer+biobanking:+toward+a+processing+protocol+amenable+for+the+International+Cancer+Genome+Consortium.">Next-generation prostate cancer biobanking: toward a processing protocol amenable for the International Cancer Genome Consortium.</a> Diagnostic Molecular Pathology. 21 (2), 61-68 (2012).</li><li>Dev, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biobanking+after+robotic-assisted+radical+prostatectomy:+a+quality+assessment+of+providing+prostate+tissue+for+RNA+studies.">Biobanking after robotic-assisted radical prostatectomy: a quality assessment of providing prostate tissue for RNA studies.</a> Journal of Translational Medicine. 9, 121 (2011).</li><li>Tolkach, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Blind+Biobanking+of+the+Prostatectomy+Specimen:+Critical+Evaluation+of+the+Existing+Techniques+and+Development+of+the+New+4-Level+Tissue+Extraction+Model+With+High+Sampling+Efficacy.">Blind Biobanking of the Prostatectomy Specimen: Critical Evaluation of the Existing Techniques and Development of the New 4-Level Tissue Extraction Model With High Sampling Efficacy.</a> The Prostate. 77 (4), 396-405 (2017).</li><li>Warren, A. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Method+for+sampling+tissue+for+research+which+preserves+pathological+data+in+radical+prostatectomy.">Method for sampling tissue for research which preserves pathological data in radical prostatectomy.</a> The Prostate. 73 (2), 194-202 (2013).</li><li>Heavey, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PatiEnt+prOstate+samPLes+for+rEsearch,+a+tissue+collection+pathway+utilizing+magnetic+resonance+imaging+data+to+target+tumor+and+benign+tissue+in+fresh+radical+prostatectomy+specimens.">PatiEnt prOstate samPLes for rEsearch, a tissue collection pathway utilizing magnetic resonance imaging data to target tumor and benign tissue in fresh radical prostatectomy specimens.</a> The Prostate. 79 (7), 768-777 (2019).</li><li>Bailey, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=VERDICT+MRI+validation+in+fresh+and+fixed+prostate+specimens+using+patient-specific+moulds+for+histological+and+MR+alignment.">VERDICT MRI validation in fresh and fixed prostate specimens using patient-specific moulds for histological and MR alignment.</a> NMR in Biomedicine. 32 (5), 4073 (2019).</li><li>Bourne, R. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Apparatus+for+Histological+Validation+of+In+Vivo+and+Ex+Vivo+Magnetic+Resonance+Imaging+of+the+Human+Prostate.">Apparatus for Histological Validation of In Vivo and Ex Vivo Magnetic Resonance Imaging of the Human Prostate.</a> Frontiers in Oncology. 7, 47 (2017).</li></ol>

Författarna har inget att avslöja.

Kritiska steg inom detta protokoll inkluderar identifiering av tumör region för provtagning, mätning av prostata, och vävnads provtagning. För det första är mätning av MRI för att identifiera rätt område av provtagning nyckeln. Vi visar denna metod i den medföljande videon; men vi rekommenderar också att bekräfta mätningar med en radiolog i första hand. Tydliga kliniska noter som pekar forskaren mot området för MRI-bilder som innehåller index lesionen är idealiska. För det andra bör mätning av prostatan utföras med försiktighet, se till att linjalen hålls i en vinkel för att mäta hela längden från bas till Apex, parallellt med den främre av prostatan. För det tredje bör tumör områden bekräftas före provtagning genom att visuellt inspektera vävnaden slice i förhållande till den ursprungliga MRI bilden, palperas vävnaden (i vissa fall tumör området kan kännas tätare), och visuellt bedöma färgen på vävnaden (i vissa fall tumören kommer att visas mer blek än omgivande godartad vävnad).
Detta protokoll har genomförts i sin helhet på UCL/UCLH av icke-kliniska postdoktorala forskare, en patologi Fellow, patologi konsulter, och forskningstekniker. Enligt vår erfarenhet kan alla steg i protokollet läras ut i under tio fall oavsett teknisk bakgrund. Vi rekommenderar dock utbildning från en radiolog om MRI mätning och utbildning från en patolog om skivning i första hand. Protokollet kan ändras med hjälp av ett 3D-tryckt skivning handtag, som tidigare publicerats10.
Möjliga begränsningar av tekniken inkluderar risken för att hindra diagnos. Skivning av prostatan är ett nyckelsteg, vilket kan hämma vid gradering eller positiva marginal räntor om det görs felaktigt. Det finns två möjliga problem här. För det första, om alla index lesion avlägsnas och används för färsk vävnad experiment omedelbart, rutinmässig klinisk diagnostik kommer inte att utföras för denna lesion och patienten kan feldiagnostiseras som har en lägre grad cancer. För att undvika detta bör forskaren diskutera provtagningsplanen med konsulten patolog som rutinmässigt kommer att granska ärendet, före provtagning, och enas om antalet, och lokalisering, av prover som skall tas. Små tumörer kan uteslutas lokalt av denna anledning. För det andra, om den prostatiska kapseln inte fästs korrekt på kork ombord före fixering, detta kan göra det möjligt för den inre vävnaden att utbuktning utåt under fixering, ändra de kirurgiska marginalerna. Detta kan leda till en falsk positiv marginal, där den återstående tumören verkar vistas på kapseln enbart på grund av vävnad skevhet.
Betydelsen av denna teknik med avseende på befintliga metoder ligger främst med tumör inriktning. En rad metoder för provtagning av radikala prostatektomi-prover har hittills publicerats. dessa förlitar sig dock på en helt eller delvis slumpmässig urvalsmetod1,2,3,4,5,6,7. Användningen av biopsi och i synnerhet MRI data här har förbättrad effektivitet, möjliggör minskad provtagning med ökat förtroende för att få tumör vävnad8.
Framtida tillämpningar av denna metod medger antagande av ett bredare spektrum av nedströmstekniker än med tidigare provtagningsmetoder. Till exempel, tillgången på färsk vävnad som har en hög sannolikhet för att vara tumör innebär att dyrare och/eller arbetsintensiva färsk vävnad tekniker kan utnyttjas, eftersom många prover inte krävs för att säkerställa närvaron av tumör. Detta kan innefatta och är inte begränsat till, ex vivo kultur, ex vivo MRI, avancerad avbildning och transcriptomics.

Tillgång till hög kvalitet mänsklig prostatacancer vävnad är ett centralt krav för att driva effektiv forskning inom området. Det finns ett antal befintliga metoder för att prova prostatavävnad efter Radikal prostatektomi för forskning. Typiskt dessa innebär att använda Punch biopsier att ta slumpmässiga prover från en färsk, fryst eller fast bit av prostatavävnad, och retrospektivt bekräftar huruvida tumören finns i varje prov av hematoxylin & eosin (H & E) som bedöms av en uropatolog1,2,3,4,5. En nyligen genomgång har sammanställt en översikt över dessa befintliga metoder6. Dessa metoder är användbara för vissa nedströms tillämpningar, där vävnad kan lagras och bedömas för tumör halt vid ett senare tillfälle, såsom storskaliga genomiska analyser som International cancer Genome Consortium (ICGC) och cancer Genome Atlas (TCGA) 4,7. Dessa metoder skulle dock kunna förbättras om vi skulle använda magnetisk resonanstomografi (MRI) och/eller biopsidata för att rikta in sig på specifika områden av prostatan för provtagning. Detta skulle förbättra metodiken på två sätt; för det första genom att minska antalet insamlade vävnadsprover, öka effektiviteten och minska trycket på patologi avdelningarna och lagringskostnaderna, och för det andra genom att låta färsk vävnad användas omedelbart utan behov av omedelbar bekräftelse av tumör halt, för nya toppmoderna tekniker som levande vävnad Imaging, Organoid generation eller ex vivo kultur. Detta forskningsbehov har lett till utvecklingen av de människor (PatiEnt prostata prov för forskning) metod, och resultaten från de första 84 fall biobanked med hjälp av människor publicerades nyligen8. En variant av denna metod har också publicerats med en tredimensionell (3D) tryckt skivning apparat och patientspecifika mögel, för att underlätta ex vivo MRI på före och efter fixering vävnad9,10.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:1040px;" width="1039">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:208px;">6 mm biopsy punch</td>
			<td style="width:247px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:115px;">13404607</td>
			<td style="width:471px;">Disposable biopsy punches for removing 6 mm tissue samples</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:208px;">Black Ink</td>
			<td style="width:247px;">Leica Biosystems</td>
			<td style="width:115px;">3801753</td>
			<td>Tissue marking &#38; margin dye</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:208px;">Blue Ink</td>
			<td style="width:247px;">Leica Biosystems</td>
			<td style="width:115px;">3801751</td>
			<td>Tissue marking &#38; margin dye</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:208px;">Chainmail hand glove</td>
			<td style="width:247px;">Arco</td>
			<td>1456803</td>
			<td>Chainmail gloves to protect hand during slicing</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:208px;">Cork board</td>
			<td style="width:247px;">Fisher Scientific</td>
			<td>12396447</td>
			<td>Cork board for pinning prostate to following sampling procedure</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:208px;">Needles</td>
			<td style="width:247px;">SLS (Scientific Laboratory supplies)</td>
			<td>SYR6112</td>
			<td>Sterile needles to use to pin tissue to cork board following sampling</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:208px;">Prostate slicing aparatus</td>
			<td style="width:247px;">Insitute of Cancer Research, London</td>
			<td style="width:115px;">NA - must be obtained under MTA</td>
			<td>A kit containing the slicer handle, blades, spacer, base, walls and pins</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

use of magnetic resonance imaging and biopsy data to guide sampling procedures for prostate cancer biobanking

Tidigare metoder för biobankning av prostatavävnad, efter Radikal prostatektomi, omfattade i allmänhet slumpmässigt urval. För att öka effektiviteten och möjliggöra ett större utbud av nedströmsprogram utvecklades en mer målinriktad metod för provtagning av prostatavävnad. Här använder vi både magnetisk resonanstomografi (MRI) och biopsi data för att rikta specifika områden av orgeln för provtagning. Metoden innebär användning av en tidigare publicerad prostata skivning enhet som tar bort en 5 mm tvärgående skiva från en förutbestämd region i prostatan, följt av avlägsnande av 6 mm Punch biopsier från förutbestämda områden av denna sektor. Dessa prover kan lagras frysta eller fasta för biobankning ändamål, eller används färskt omedelbart med 70% förtroende för tumör halt, jämfört med 10% förtroende från slumpmässig provtagning. Detta gör det möjligt att använda alla standard nedströms tekniker såsom genomik, proteomik eller histologiskt arbete, men också arbete som kräver färsk vävnad såsom levande vävnad Imaging eller ex vivo kultur.

Färsk prostatavävnad som samplas med hjälp av PEOPLE-metoden kan användas för en mängd olika nedströmstekniker, inklusive genomisk sekvensering och ex vivo-kultur. De första 59 fall som samplas med denna metod har tidigare publicerats i jämförelse med en tidigare version av metoden, tillsammans med inledande nedströms data8. Tiden från första skivning prostatan till frysning/fastställande av Punch biopsier här var ungefär 1 min, som hölls till ett minimum för att undvika nedbrytning av RNA. Tid från avlägsnande av prostata till prostata skivning bör också hållas till ett minimum, men här tog ca 20 min på grund av vår teater och patologi Labs är på olika platser.
Beroende på nedströms ansökan, vanligtvis minst två prover tas: en från ett område med förväntad tumör vävnad och en från ett område med förväntad godartad vävnad. Det viktigaste måttet på framgång för själva urvalsmetoden är att bedöma tumör innehållet i ett givet prov.
För inträde i 100 000 genomen hos-projektet måste ett H & E-målat vävnads avsnitt bedömas av en uropatolog, och provet måste innehålla minst 40% tumörceller. Prover som innehåller mindre än 40% tumör kan fortfarande ingå i projektet om de framgångsrikt macrodissected. Av de första 92 fall som ingick i urvalet på detta sätt innehöll 64% minst 40% tumör och lämnades in till 100 000 Genomes-projektet utan makrodissektion. DNA extraherades och var av tillräcklig avkastning och kvalitet i samtliga fall (tabell 1). En första delmängd av 59 av dessa prover publicerades tidigare i jämförelse med en tidigare metod8.
För ex vivo kultur, matchade tumör och godartad vävnad måste vara av tillräcklig kvalitet för att tåla 72 h kultur utan betydande nedbrytning. Flera vävnadsprover från sammanlagt tre patienter odlade framgångsrikt8.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60216/60216fig1.jpg"> Figur 1: apparat för prostata skärning. Denna apparat erhölls enligt material överföringsavtal från Institute of cancer Research. (A) väggarna sätts vinkelräta mot basen, och guldnålar sätts in i basen som omger prostatan (prostata inte bilden). (B) de utbytbara parallella bladen sätts in i blad handtaget. (C) bladen passerar mellan guldsprintar för att skära en 5 mm del av prostatan. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60216/60216fig1large.jpg" target="_blank">Vänligen klicka här för att se en större version av denna siffra.</a>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1"><tbody>
<tr>
<td></td>
			<td>n (%)</td>
		</tr>
<tr>
<td>Hit (> 40% tumör)</td>
			<td>59 (64%)</td>
		</tr>
<tr>
<td>Partisk hit (5-30% tumör)</td>
			<td>6 (7%)</td>
		</tr>
<tr>
<td>Miss (0% tumör)</td>
			<td>27 (29%)</td>
		</tr>
<tr>
<td>Totala</td>
			<td>92 (100%)</td>
		</tr>
</tbody></table>Tabell 1: tumör träff hastighet. Tumör träff Rate bestämdes av en konsult patolog som specialiserat sig på prostatacancer, efter granskning av H & E färgade vävnad. Tumör cells halt på > 40% bestämdes att vara lämplig för att ingå i 100 000 Genomes-projektet, enligt Genomics Englands riktlinjer.

Watch this Scientific Journal Video about Use of Magnetic Resonance Imaging and Biopsy Data to Guide Sampling Procedures for Prostate Cancer Biobanking at JoVE.com

Use of Magnetic Resonance Imaging and Biopsy Data to Guide Sampling Procedures for Prostate Cancer Biobanking

Denna metod innebär användning av kliniska diagnostiska data för prostatacancerpatienter för att vägleda provtagningsförfaranden, när biobankning vävnad efter Radikal prostatektomi. Detta övervinner problem med tidigare publicerade metoder kring effektivitet och tillgång till färsk vävnad för ett bredare spektrum av nedströms applikationer.

Användning av magnetisk resonanstomografi och Biopsidata för att vägleda provtagnings procedurer för biobanker för prostata cancer

Previous methods for biobanking prostate tissue, following radical prostatectomy, generally involved random sampling. In order to increase efficiency, and ...

Betydelsen av detta protokoll över tidigare prostata provtagningsmetoder är att det ger oss ett högre förtroende för att rikta färsk tumörvävnad för forskning. Därför kan vi ta den färska vävnaden direkt tillbaka till labbet och använda den för kultur eller bildbehandling eftersom vi har ett högt förtroende för vilka prover som är tumör och som är godartade. Mitt viktigaste råd när man lär sig tekniken är att arbeta med din lokala patolog så att den slutliga vävnadsdiagnosen och rapporten inte äventyras.För att rikta tumörplatsen, granska MR-bilderna för att mäta platsen ovanför tumören och hitta den sekvens vid vilken tumören är mest synlig i det axiella planet. Bläddra igenom de axiella bilderna för att identifiera bilden där tumören är den största och skriv ut bilden som referens. I motsvarande koronabild mäter du avståndet från basen av prostatan till den valda axialpositionen och mäter den fulla längden av prostatan från apex till basen i millimeter.Skriv sedan ut dessa mätningar och markera platserna för tumören som referens. Efter att exemplaret har samlats, sterilisera laminärflödeshuven och prostatasliceringsapparaturen med 70%etanol och väga prostatan på en standardskala i gram. Måla sedan den högra sidan med blått bläck och den vänstra sidan av provet med svart bläck som täcker hela kapseln och sädesblåsorna med bläck för att tillåta diskriminering av de kirurgiska marginalerna.För att skiva prostatan, placera vävnaden med basen och spetsen mot motsatta väggar av apparaten med den bakre sidan nedåt och den främre sidan upp. Placera guldstift runt vävnadsprovet trycka prostatan inåt något om det behövs för att uppnå en ombonad passform och mäta prostatalängden från basen till spetsen för att jämföra denna mätning till prostatalängd som mäts med MR. Om prostatan har krympt, justera den förväntade skivningspositionen med lämplig procentandel av minskningen.Därefter mäter från basen till önskad tvärsnitt och välj stiftet som sitter närmast denna mätning att skära runt. Bär chainmail handskar för att förhindra skador, placera bladen på skivning enheten på vardera sidan av den identifierade stiftet och använda distansen för att hålla bladen fem millimeter isär. För att förvärva skivan, använd långa drag för att sakta men bestämt flytta bladen nedåt, framåt och bakåt som bekräftar genom att känna att en hel skiva har separerats innan du demonterar apparaten.Ta sedan bort väggar och stift och använda handskar för att försiktigt överföra skiva på en steril bit av corkboard. Efter att ha förvärvat exemplaret, visuellt inspektera tvärgående skiva för jämförelse med axial MRI bilden. I vissa fall kan tumörområdet verka blekare än den omgivande vävnaden.Palpare den tvärgående skiva försiktigt. Tumören kan kännas fastare än den omgivande vävnaden. Med hjälp av den axiella MR-bilden som en guide väljer du ett eller flera områden för provtagning och använder en sex millimeters stans för att trycka ner på vävnadsområdet av intresse.Vrid vävnadsstansen på plats och nedåt mot korken för att säkerställa en fullständig separation med hjälp av en skarp skalpell för att separera biopsiprovet från provet vid behov. När provet har förvärvats, ta bort stansen och använd kolven för att mata ut provet i lämplig behållare för den efterföljande nedströmsanalysen. Sedan bläck hålen där stansar togs i rött och notera platsen för varje stans tillsammans med vikten av prostata och eventuella observationer om vävnaden färg och fasthet.Nåla fast prostatakapseln på korken för att förhindra bilging under fixering. Dränka prostatan och korken till fixativt säkerställa provet är helt nedsänkt. I denna representativa analys, av de första 92 fall provprov som visats, 64%av exemplaren innehöll minst 40%tumör och lämnades till 100, 000 Genomes Project utan microdissection.DNA extraherades och var av tillräcklig avkastning och kvalitet i samtliga fall och en första delmängd på 59 av dessa prover har publicerats för jämförelse med en tidigare provtagningsmetod för exemplar. Efter detta förfarande, den färska tumör prover kan användas för antingen levande bildbehandling eller kultur så att vi kan testa nya biomarkörer, läkemedel, och ta reda på mer om tumörbiologi. Nu när vi använder denna metod rutinmässigt, jag har kunnat föra fram ett projekt med hjälp av denna vävnad för ex vivo kultur att titta på nya kombinationer av prekliniska terapier för prostatacancer.

Research

JoVE Journal

Medicine

Magnetic Resonance Derived Myocardial Strain Assessment Using Feature Tracking

Magnetic Resonance Härledda Myocardial Sila Uppskattning med hjälp av funktionen Spåra

Purpose: An accurate and practical method to measure parameters like strain in myocardial tissue is of great clinical value, since it has been shown, that ...

Multi-modal Imaging of Angiogenesis in a Nude Rat Model of Breast Cancer Bone Metastasis Using Magnetic Resonance Imaging, Volumetric Computed Tomography and Ultrasound

Multi-modal Imaging av angiogenes i en Naken råtta modell av bröstcancer skelettmetastaser med magnetkamera, Volumetric datortomografi och ultraljud

Angiogenesis is an essential feature of cancer growth and metastasis formation. In bone metastasis, angiogenic factors are pivotal for tumor cell ...

Microarray-based Identification of Individual HERV Loci Expression: Application to Biomarker Discovery in Prostate Cancer

Microarray-baserade Identifiering av individuella HERV Loci Expression: Anmälan till biomarkörer vid prostatacancer

The prostate-specific antigen (PSA) is the main diagnostic biomarker for prostate cancer in clinical use, but it lacks specificity and sensitivity, ...

Tracking the Mammary Architectural Features and Detecting Breast Cancer with Magnetic Resonance Diffusion Tensor Imaging

Spårning bröst arkitektoniska särdrag och upptäcka bröstcancer med Magnetic Resonance Diffusion Tensor Imaging

Breast cancer is the most common cause of cancer among women worldwide. Early detection of breast cancer has a critical role in improving the quality of ...

Quantitative Magnetic Resonance Imaging of Skeletal Muscle Disease

Kvantitativ Magnetic Resonance Imaging av skelettmuskulatur sjukdom

Quantitative magnetic resonance imaging (qMRI) describes the development and use of MRI to quantify physical, chemical, and/or biological properties of ...

Dynamic Contrast Enhanced Magnetic Resonance Imaging of an Orthotopic Pancreatic Cancer Mouse Model

Dynamisk kontrast Förbättrad Magnetic Resonance Imaging av en Orthotopic bukspottkörtelcancer musmodell

Dynamic contrast enhanced magnetic resonance imaging (DCE-MRI) has been limitedly used for orthotopic pancreatic tumor xenografts due to severe ...

Simultaneous PET/MRI Imaging During Mouse Cerebral Hypoxia-ischemia

Samtidig PET / MR Imaging Under Mouse Cerebral Hypoxi-ischemi

Dynamic changes in tissue water diffusion and glucose metabolism occur during and after hypoxia in cerebral hypoxia-ischemia reflecting a bioenergetics ...

Cardiac Magnetic Resonance Imaging at 7 Tesla

Hjärt magnetisk resonanstomografi på 7 Tesla

CMR at an ultra-high field (magnetic field strength B0&#160;&#8805; 7 Tesla) benefits from the signal-to-noise ratio (SNR) advantage inherent at higher ...

Phase Contrast Magnetic Resonance Imaging in the Rat Common Carotid Artery

Magnetröntgen i fas kontrast i den gemensamma halspulsådern råtta

Phase contrast magnetic resonance imaging (PC-MRI) is a noninvasive approach that can quantify flow-related parameters such as blood flow. Previous ...

Quantification of Levator Ani Hiatus Enlargement by Magnetic Resonance Imaging in Males and Females with Pelvic Organ Prolapse

Kvantifiering av Levator Ani Hiatus utvidgningen av magnetisk resonanstomografi hos män och kvinnor med bukorganet framfall

Here we present a protocol to examine the levator ani hiatus in males and females with pelvic organ prolapse, during the Valsalva maneuver and while ...