Name: culture methods to determine the limit of detection and survival in transport media of campylobacter jejuni in human fecal specimens
Uploaded: 2020-03-10T12:30:00
Duration: 8 min 23 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Culture Methods to Determine the Limit of Detection and Survival in Transport Media of Campylobacter Jejuni in Human Fecal Specimens at JoVE.com

تم تمويل هذه الدراسات من قبل TECHLAB، وشركة

1. تعداد Campylobacter في عينات البراز البشري المفتعلة
ملاحظة: يتم تنفيذ جميع الخطوات باستخدام تقنية معقمة والمواد على ورقة واقية يمكن التخلص منها داخل غطاء سلامة تدفق الصفيحة المطهر.
تنبيه: الكامبيلوباكتر الحية معدية ويمكن أن تسبب المرض، بما في ذلك الإسهال. ارتداء القفازات ومعطف المختبر ونظارات السلامة كلما التعامل مع البكتيريا. لا أنبوب الفم. التخلص من جميع المواد التي اتصلت البكتيريا في حاويات المخاطر البيولوجية المناسبة.
<ol><li>نمو ثقافة المخزون من البكتيريا<ol>
<li>الحصول على سلالات من جيم jejuni (ATCC-33560) أو C. القولونية (ATCC 33559)(جدول المواد)والثقافات المجففة أو المجمدة وترطيب أو ذوبان البكتيريا وفقا لتعليمات الشركة المصنعة. الشرائط البكتيريا rehydrated على لوحة كاجار Campylobacterمحددة لبدء الثقافة. احتضان لوحة 48 ساعة في 37 درجة مئوية في جرة اللاهوائية التي تحتوي على الغلاف الجوي الجزئي توليد الغاز كيس.</li>
		<li>في اليوم التالي، إعداد 100 مل من ضخ الدماغ والقلب (BHI) مرق النمو التي تحتوي على 0.5٪ trypticase، 0.5٪ البروتياز بيبتوني، 0.0125٪ بيروفات الصوديوم، و 0.0125٪ بيسولفيت الصوديوم.</li>
		<li>قبل تقليل مرق BHI من خلال تغطية قارورة فضفاضة ووضعها في جرة اللاهوائية مع كيس من شأنها أن تنتج بيئة microaerophilic. السماح مرق ليقلل مسبقا بين عشية وضحاها في 37 درجة مئوية. وبالمثل، قبل تقليل Campylobacter-لوحاتمحددة لاستخدامها في تعداد مستعمرة في الخطوات 1.1.10 و 1.2.2.</li>
		<li>كما Campylobacter حساسة للهواء، وجمع جميع المواد قبل تلقيح مرق ولا تتسكع أثناء التعامل مع الثقافات. عندما تكون جاهزة للتلقيح، أضف مصل الأبقار الجنيني (FBS) إلى مرق مخفض مسبقًا إلى 4٪ من إجمالي الحجم. احتفظ بـ 1 مل من مرق مقلص مسبق ًا ليكون بمثابة فارغة في قياسات الكثافة البصرية عند 600 نانومتر (OD600).</li>
		<li>إزالة 3 مل من مرق قبل تخفيض تحتوي على FBS واستخدام مرق لكشط لوحة بداية تحتوي على ثقافة Campylobacter. كشط بلطف لوحة مع حلقة التلقيح، ومن ثم نقل الطين البكتيري إلى أنبوب معقم.</li>
		<li>Inoculate 100 مل من مرق خفضت مسبقا مع ما يقرب من 3 مل من الطين البكتيري واحتضان مع اهتزاز معتدل في 115 دورة في الدقيقة في 37 درجة مئوية في جرة اللاهوائية التي تحتوي على كيس توليد الغاز.</li>
		<li>رصد نمو البكتيريا الطيفية عن طريق التعكر في OD600. استخدم المرق المحجوز كفارغ. إذا تم فتح الجرة اللاهوائية، استبدال كيس توليد الغاز.</li>
		<li>توقف عن حضانة المرق بعد 48-72 ساعة أو قبل أن تصل قيمة OD600 إلى ~ 0.4. ملاحظة: هذا OD600 يساوي عادة إلى 107 إلى 108 CFU/mL. راجع الجدول 1 للحصول على النتائج النموذجية.</li>
		<li>لتحديد عدد من البكتيريا في ثقافة المخزون النقي، أداء ثمانية 10 أضعاف سلسلة تخفيف 10 ميكرولتر من مرق في 900 ميكرولتر من تخفيف العازلة(جدول المواد). بعد 100 ميكرولتر من مرق قد أزيلت للتخفيف الأول، والعودة قارورة إلى جرة اللاهوائية مع كيس جديدة لتوليد الغاز في انتظار استخدامها في بركة البراز spiking.</li>
		<li>استخدام حبات الطلاء المعقمة لنشر 100 ميكرولتر من10-5 إلى10-7 تخفيف على مكررة preylobacterلوحات محددة من الخطوة 1.1.3. لوحات التسمية مع تخفيف المستخدمة، ووضعها في جرة اللاهوائية الثانية مع كيس توليد الغاز، واحتضان في 37 درجة مئوية لمدة 48-72 ساعة. ملاحظة: انظر الشكل 1 والشكل 2 لنظام التخفيف وصور المستعمرات.</li>
		<li>بعد النمو، اختر الطبق الذي يتراوح بين 30-300 مستعمرة لعدها. الاستفادة من التهم لتحديد CFU / مل من ثقافة مرق الأسهم باستخدام المعادلة 1 : CFU/ mL في المخزون = متوسط # من المستعمرات على لوحات تحليلية مختارة (مكررة) ☆ (مل مطلي × تخفيف لوحة) [المعادلة 1] 
</li>
	</ol></li>
	<li>إعداد وتعداد عينات البراز السريرية المفتعلة<ol>
<li>مباشرة بعد إعداد لوحات للعد التحليلي في الخطوة 1.1.10، وجعل مجموعة ثانية من تخفيف مرق الأسهم من خلال إعداد 10 التمييع المسلسل 2 أضعاف من مرق الأسهم وبركة البراز كامبيلوباكتر-السلبية (NFP). على سبيل المثال، قم بإعداد التخفيف الأول عن طريق خلط كميات متساوية من مرق وNFP (على سبيل المثال، 0.1 مل لكل منهما) وجعل التخفيفات اللاحقة عن طريق نقل حجم معين من مرق وخليط NFP في أنبوب مع حجم معين يساوي NFP. إضافة لوحة التحكم مع مرق لا يحتوي على Campylobacter تضاف إلى تجمع البراز للمساعدة في تحديد المستعمرات غيرCampylobacter.<ol>
<li>جعل NFP من غير محددة, عينات مراقبة المريض الإسهال أو البراز المتبرعين صحية التي تم اختبارها سابقا وجدت أن Campylobacter-السلبيةبطرق مثل المناعة إنزيم كامبيلوباكتر و16S rRNA qPCR.</li>
		</ol>
</li>
		<li>T-streak 10 μL من كل Campylobacter/ تخفيف البراز على مكررة preylobacter-لوحات أغار محددة. وضع لوحات في جرة اللاهوائية مع كيس توليد الغاز واحتضان في 37 درجة مئوية لمدة 48 ± 2 ساعة.</li>
		<li>فحص لوحات streaked بصريا للمستعمرات تشبه تلك التي من ثقافات كامبيلوباكتر نقية. ملاحظة: الربع الثالث هو عادةً حيث سيتم العثور على هذه. انظر الشكل 1 والشكل 2 لنظام التخفيف والصور من حجم المستعمرة واللون والشكل.</li>
		<li>حدد Multi Campylobacterمثل المستعمرات ووصمة عار غرام. باستخدام المجهر مع عدسة الغمر النفط، ودراسة منطقة رقيقة الشرائط للبكتيريا الصغيرة المنحنية سلبية الغرام، حلزونية، أو على شكل سيجار. ملاحظة: Campylobacter هي سلبية الغرام وتتطلب فوشين الأساسية كمضادة (بدلا من safranin نموذجية) ليتم تصورها بدقة. ويمكن رؤية البكتيريا الكلاسيكية ذات المجنحة النورس ولكن ها هي ليست شرطا. انظر الشكل 2 للميكروجراف التمثيلي.</li>
		<li>إذا كان أي من لوحات مكررة في تخفيف محددة لديها 1 أو أكثر من مستعمرات Campylobacter الحالية، والنظر في أن تخفيف البراز الثقافة إيجابية.</li>
		<li>النظر في التخفيف الأخير الذي يحتوي على Campylobacterمرئية - مثل مستعمرة سلبية الغرام الحد من الكشف عن الثقافة. استخدم المعادلة 2 لحساب CFU/mL للتخفيف الإيجابي في عينة البراز السريرية المفتعلة: CFU/mL في عينة البراز = تحليلي CFU/mL ☆ تخفيف مع مستعمرة إيجابية الماضي [المعادلة 2] ملاحظة: راجع الجدول 2 للحصول على نتائج نموذجية.</li>
	</ol></li>
</ol>2. تحديد قابلية البقاء من Campylobacter المخزنة في وسائل الإعلام النقل
<ol><li>مزيج 1 مل من ثقافة مرق Campylobacter (الخطوة 1.1.8) مع 1 مل من NFP وإعداد 10 مكررة ضعف المسلسل مرتين في NFP. مزيد من تخفيف كل تخفيف إضافية 1:4 في وسائل الإعلام كاري بلير، تماما كما يتم التعامل مع عينة سريرية أعدت في وسائل الإعلام النقل.</li>
	<li>قم بتخزين أنابيب التخفيف العشرين وعنصر تحكم سلبي في وسط كاري بلير في أنابيب مغطاة عند 2-8 درجة مئوية لـ 96 ساعة وعد مستعمرات من كل تخفيف يحدث في الوقت صفر وكل 24 ساعة. لعد مستعمرة، عينة المرق: أنابيب البراز وثقافة البراز الإعداد لمستعمرة العد من كل تخفيف، في مكررة.</li>
	<li>كل يوم لوحة 10 ميكرولتر أجزاء من تخفيف البراز على Campylobacter-agar انتقائية واحتضان في 37 درجة مئوية لمدة 48 ساعة، كما هو موضح أعلاه في الخطوات 1.1.9−1.2.7.</li>
	<li>إجراء عدد تحليلي متزامن للمخزون البكتيري الأصلي (من الخطوة 1.1.8 أو مرق طازج) كما هو موضح أعلاه (الخطوات 1.1.9−1.1.11). حساب CFU / مل من المخزون البكتيري الأصلي(المعادلة 1)لحساب تركيز البكتيريا في عينة البراز وسائل الإعلام النقل والتخفيفات لها(المعادلة 2).</li>
</ol>3. مقالات غير ثقافية للتحقق من نتائج الثقافة
<ol><li>استخدام الانزيم المناعي (EIA) الذي يعطي نتائج إيجابية كاذبة ضئيلة12 وأداء وفقا لتعليمات إدراج حزمة للتحقق من نتائج الثقافة.</li>
	<li>استخدام الفحص الجزيئي التي يمكن الكشف عن الجينات rRNA 16S أو غيرها من الجينات من مجموعة واسعة من الأنواع كامبيلوباكتر 13. تأكد من أن القياس الجزيئي يتفاعل مع أنواع مثل C. upsaliensis أو C. lari التي تنمو بشكل سيئ على agar14القياسية التي تحتوي على المضادات الحيوية. اتبع تعليمات الشركة المصنعة لاستخراج الحمض النووي من عينات البراز وإجراء الاختبار. ملاحظة: يمكن استخدام تسلسل الحمض النووي ثنائي الاتجاه من amplicon 16S لتأكيد نوع Campylobacter في عينة إيجابية. ويمكن أيضا استخدام PCR الأنواع محددة (انظر الجدول 3 للجينات المستهدفة) لتحديد الأنواع الموجودة في العينات الإيجابية أو discrepant15 .</li>
</ol>

<ol>
	<li>. Annual Summaries of Foodborne Outbreaks Available from: <a target="_blank" href="https://www.cdc.gov/fdoss/annual-reports/index.html">https://www.cdc.gov/fdoss/annual-reports/index.html</a> (2018)</li><li>Kaakoush, N. O., Casta&#241;o-Rodr&#237;guez, N., Mitchell, H. M., Man, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Global+Epidemiology+of+Campylobacter+Infection.">Global Epidemiology of Campylobacter Infection.</a> Clinical Microbiology Reviews. 28 (3), 687-720 (2015).</li><li>Pitkanen, T. a., H, M. L., Rose, J. B., Jimenez-Cisneros, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Global Water Pathogen Project. , (2017).</li><li>Fitzgerald, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multicenter+Evaluation+of+Clinical+Diagnostic+Methods+for+Detection+and+Isolation+of+Campylobacter+spp.+from+Stool.">Multicenter Evaluation of Clinical Diagnostic Methods for Detection and Isolation of Campylobacter spp. from Stool.</a> Journal of Clinical Microbiology. 54 (5), 1209-1215 (2016).</li><li>Kirkpatrick, B. D., Tribble, D. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Update+on+human+Campylobacter+jejuni+infections.">Update on human Campylobacter jejuni infections.</a> Current Opinion in Gastroenterology. 27 (1), 1-7 (2011).</li><li>CDC. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Incidence+and+Trends+of+Infection+with+Pathogens+Transmitted+Commonly+Through+Food+-+Foodborne+Diseases+Active+Surveillance+Network,+10+U.S.+Sites,+2006-2013.">Incidence and Trends of Infection with Pathogens Transmitted Commonly Through Food - Foodborne Diseases Active Surveillance Network, 10 U.S. Sites, 2006-2013.</a> Morbidity and Mortality Weekly Report. 63, 328-332 (2014).</li><li>Jaime, A. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Campylobacter+upsaliensis:+Another+Pathogen+for+Consideration+in+the+United+States.">Campylobacter upsaliensis: Another Pathogen for Consideration in the United States.</a> Clinical Infectious Diseases. 34 (11), 59-60 (2002).</li><li>Bullman, S., O'Leary, J., Corcoran, D., Sleator, R., Lucey, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular-based+detection+of+non-culturable+and+emerging+campylobacteria+in+patients+preseting+with+gastroenteritis.">Molecular-based detection of non-culturable and emerging campylobacteria in patients preseting with gastroenteritis.</a> Epidemiology and Infection. 140, 684-688 (2012).</li><li>Giltner, C. L., Saeki, S., Bobenchik, A. M., Humphries, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+Detection+of+Campylobacter+Antigen+by+Enzyme+Immunoassay+Leads+to+Increased+Positivity+Rates.">Rapid Detection of Campylobacter Antigen by Enzyme Immunoassay Leads to Increased Positivity Rates.</a> Journal of Clinical Microbiology. 51 (2), 618-620 (2013).</li><li>M'ikanatha, N. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Culturing+stool+specimens+for+Campylobacter+spp.,+Pennsylvania,+USA.">Culturing stool specimens for Campylobacter spp., Pennsylvania, USA.</a> Emerging Infectious Disease. 18, 484-487 (2012).</li><li>Al Amri, A., Senok, A. C., Ismaeel, A. Y., Al-Mahmeed, A. E., Botta, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multiplex+PCR+for+direct+identification+of+Campylobacter+spp.+in+human+and+chicken+stools.">Multiplex PCR for direct identification of Campylobacter spp. in human and chicken stools.</a> Journal of Medical Microbiology. 56 (10), 1350-1355 (2007).</li><li>Buss, J. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Campylobacter+culture+fails+to+correctly+detect+Campylobacter+in+30%+of+positive+patient+stool+specimens+compared+to+non-cultural+methods.">Campylobacter culture fails to correctly detect Campylobacter in 30% of positive patient stool specimens compared to non-cultural methods.</a> European Journal of Clinical Microbiology &amp; Infectious Diseases. 38, 1087-1093 (2019).</li><li>Wohlwend, N., Tiermann, S., Risch, L., Risch, M., Bodmer, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+a+Multiplex+Real-Time+PCR+Assay+for+Detecting+Major+Bacterial+Enteric+Pathogens+in+Fecal+Specimens:+Intestinal+Inflammation+and+Bacterial+Load+Are+Correlated+in+Campylobacter+Infections.">Evaluation of a Multiplex Real-Time PCR Assay for Detecting Major Bacterial Enteric Pathogens in Fecal Specimens: Intestinal Inflammation and Bacterial Load Are Correlated in Campylobacter Infections.</a> Journal of Clinical Microbiology. 54 (9), 2262-2266 (2016).</li><li>Couturier, B. A., Hale, D. C., Couturier, M. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Association+of+Campylobacter+upsaliensis+with+Persistent+Bloody+Diarrhea.">Association of Campylobacter upsaliensis with Persistent Bloody Diarrhea.</a> Journal of Clinical Microbiology. 50 (11), 3792-3794 (2012).</li><li>Chaban, B., Musil, K. M., Himsworth, C. G., Hill, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+cpn60-Based+Real-Time+Quantitative+PCR+Assays+for+the+Detection+of+14+Campylobacter+Species+and+Application+to+Screening+of+Canine+Fecal+Samples.">Development of cpn60-Based Real-Time Quantitative PCR Assays for the Detection of 14 Campylobacter Species and Application to Screening of Canine Fecal Samples.</a> Applied and Environmental Microbiology. 75, 3055-3061 (2009).</li><li>Allos, B., Blaser, M. J., Mandell, G. L., Bennett, J. E., Dolin, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 7th ed. , 2793-2802 (2009).</li><li>Anderson, N. W., Buchan, B. W., Ledeboer, N. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+the+BD+MAX+Enteric+Bacterial+Panel+to+Routine+Culture+Methods+for+Detection+of+Campylobacter,+Enterohemorrhagic+Escherichia+coli+(O157),+Salmonella,+and+Shigella+Isolates+in+Preserved+Stool+Specimens.">Comparison of the BD MAX Enteric Bacterial Panel to Routine Culture Methods for Detection of Campylobacter, Enterohemorrhagic Escherichia coli (O157), Salmonella, and Shigella Isolates in Preserved Stool Specimens.</a> Journal of Clinical Microbiology. 52 (4), 1222-1224 (2014).</li><li>Wasfy, M., Oyofo, B., Elgindy, A., Churilla, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+preservation+media+for+storage+of+stool+samples.">Comparison of preservation media for storage of stool samples.</a> Journal of Clinical Microbiology. 33 (8), 2176-2178 (1995).</li><li>Bess&#232;de, E., Delcamp, A., Sifre, E., Buissonniere, A., M&#233;graud, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=New+Methods+for+Detection+of+Campylobacters+in+Stool+Samples+in+Comparison+to+Culture.">New Methods for Detection of Campylobacters in Stool Samples in Comparison to Culture.</a> Journal of Clinical Microbiology. 49 (3), 941-944 (2011).</li><li>Bess&#232;de, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+the+Diagnostic+Accuracy+of+Two+Immunochromatographic+Tests+Detecting+Campylobacter+in+Stools+and+Their+Role+in+Campylobacter+Infection+Diagnosis.">Evaluation of the Diagnostic Accuracy of Two Immunochromatographic Tests Detecting Campylobacter in Stools and Their Role in Campylobacter Infection Diagnosis.</a> Journal of Clinical Microbiology. 56 (4), (2018).</li><li>Shane, A. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Infectious+Diseases+Society+of+America+Clinical+Practice+Guidelines+for+the+Diagnosis+and+Management+of+Infectious+Diarrhea.">Infectious Diseases Society of America Clinical Practice Guidelines for the Diagnosis and Management of Infectious Diarrhea.</a> Clinical Infectious Diseases. 65 (12), 1963-1973 (2017).</li><li>Toledo, Z., Simaluiza, R. J., Astudillo, X., Fern&#225;ndez, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Occurrence+and+antimicrobial+susceptibility+of+thermophilic+Campylobacter+species+isolated+from+healthy+children+attending+municipal+care+centers+in+Southern+Ecuador.">Occurrence and antimicrobial susceptibility of thermophilic Campylobacter species isolated from healthy children attending municipal care centers in Southern Ecuador.</a> Revista do Instituto de Medicina Tropical de Sao Paulo. 59, 77-77 (2017).</li><li>Lee, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Symptomatic+and+asymptomatic+Campylobacter+infections+associated+with+reduced+growth+in+Peruvian+children.">Symptomatic and asymptomatic Campylobacter infections associated with reduced growth in Peruvian children.</a> PLoS Neglected Tropical Diseases. 7 (1), 2036 (2013).</li></ol>

المؤلفين هم من موظفي TECHLAB ، وشركة التي تنتج QUIK CHEK ™ عدة المستخدمة كأساس للمقارنة في هذه المقالة.

يتم بناء أساليب الثقافة الموصوفة هنا على تقنيات ومواد بسيطة ومستخدمة على نطاق واسع متوفرة في معظم المختبرات10. إن الجمع بين العينات التحليلية والعينات المفتعلة هو الذي يوفر معلومات جديدة عن عتبة الكشف ذات الصلة سريرياً لثقافات البراز. بالإضافة إلى ذلك، الفصل في نتائج الثقافة مع 5 مقالات منفصلة يعزز الاستنتاجات التي Campylobacter ثقافة البراز mis-يحدد جزء كبير من عينات المريض. واختبارات تقييم الأثر البيئي والمواد الجزيئية مفيدة كضوابط لأن كل منها يستند إلى مبدأ مختلف (تفاعل المستضد مع الأجسام المضادة مقابل تضخيم الحمض النووي) والأهم من ذلك، لا تعتمد على صلاحية البكتيريا. لاحظ أن فحص تقييم الأثر البيئي المستخدم في هذه الدراسات تم التحقق منه بشكل جيد وقد ثبت أنه يتفق تمامًا مع 4 اختبارات جزيئية12.
إن ثقافة Campylobacter spp. مزعجة بشكل خاص، حيث تفيد التقارير بأن الحساسية تتراوح بين 60-76٪19،20، وكما هو واضح من معدل الفشل في اكتشاف العينات الإيجابية الحقيقية هنا بنسبة 30٪. يمكن للموظفين أن يتوقعوا أن التحكم في تقييم الأثر البيئي والاختبارات الجزيئية ستسفر في كثير من الأحيان عن نتائج إيجابية عندما تكون بيانات الثقافة سلبية.
الخطوة الأكثر أهمية في البروتوكول هي تحديد مستعمرات دبوس نقطة بين النباتات البراز المتنافسة. وليس من غير المألوف، كتخفيفات بالقرب من عتبة الكشف، أن يكون هناك تقديرات بالتناوب لعدد المستعمرات صفر امن وغير صفر (على سبيل المثال، 2، 0، 1، 0، 0). ومن المهم الاعتراف بأن عتبات الثقافة ستكون مجموعة من التركيزات، وليس تركيزاً محدداً من نوع CFU/mL. ومع ذلك ، فإن تقدير ~ 1 × 106 CFU / mL البراز كحد أدنى للكشف عن الثقافة يقارن بشكل جيد مع التقارير التي البشر المصابين تسليط 106 إلى 109Campylobacter لكل البراز غرام21. التغيرات في المضادات الحيوية أو لوحات أجار والاختلافات التي لا مفر منها في عينات البراز الفردية سوف تغير بلا شك قيم العتبة. يجب أن يمكّن هذا البروتوكول من إدخال تحسينات على وسائط النمو.
هذه المعلومات الأولى عن الحد من الكشف عن الثقافة يجعل من الممكن لوضع عتبات ذات الصلة سريريا لاختبارات التشخيص، ويضع الأساس الميكروبيولوجي الذي هو مطلوب لمعالجة القضايا غير المدروسة من غير أعراض النقل22،23 من قبل Campylobacter،أو إذا كان الحمل البكتيري يرتبط مع الأعراض أو عواقب خطيرة.

نشرت مراكز الولايات المتحدة لمكافحة الأمراض (CDC) مؤخرًا أن برنامج المراقبة النشطة للأمراض المنقولة بالأغذية (FoodNet) أبلغ عن 9723 حالة من حالات العدوى الكامبيلوباكتر التي تم تشخيصها مختبريًا في عام 20181. ويمثل ذلك زيادة بنسبة 12% في تقارير قضية كامبيلوباكتر عن الفترة 2015-20171. في جميع أنحاء العالم، Campylobacter spp. هي من بين الالتهابات المعوية البكتيرية الأكثر شيوعا2. ومع ذلك ، فإن أعداد الأمراض المعوية القائمة على Campylobacterالتي تحدث كل عام يشتبه في أن يتم الإبلاغ عنها بشكل غير صحيح3. هذا التقليل من شأنه يمكن التنبؤ به لأن معظم المرضى يمكن أن يتعافى مع عدم الراحة المعتدلة فقط وعدم وجود علاج طبي. ومع ذلك ، بالنسبة للمرضى الذين يعانون من أعراض أكثر حدة أو الذين هم أكثر عرضة للإصابة بأمراض خطيرة ، والذين يسعون بعد ذلك إلى الرعاية الطبية ، فإن ثقافة البراز هي الطريقة الأكثر شيوعًا لتقييم ما إذا كان Campylobacter هو العامل الممرض الذي يسبب ضيقهم4.
لCampylobacter spp., ثقافة البراز هو مزعج بشكل خاص. الكائنات المسببة للأمراض الأكثر شيوعا، C. jejuni، C. القولونية، C. upsaliensis، وC. لاري، هي microaerophilic5. وهذا يعني أن البكتيريا سوف تموت عشوائيا، معدلات غير معروفة مرة واحدة تتعرض للهواء. الوقت بين جمع العينات وإعداد الثقافة وبالتالي يصبح متغير غير المنضبط في القدرة على الكشف عن قابلة للحياة Campylobacter spp. حسب الثقافة.
لثقافة مباشرة من عينات البراز، والنمو البطيء للكامبيلوباكتر هو أيضا مشكلة. مستعمرات Campylobacter صغيرة جدا حتى بعد 48 ساعة من الحضانة ويمكن تغطيتها بسهولة من قبل الكائنات الحية المتنافسة في مصفوفة البراز. وتستخدم على نطاق واسع لوحات التي تحتوي على المضادات الحيوية التي معظم سلالات من C. jejuni وC. القولونية هي مقاومة، كما تمنع المضادات الحيوية نمو العديد من (ولكن ليس كل) البكتيريا البرازالمتنافسة، مما يسمح تصور أفضل من مستعمرات كامبيلوباكتر 6. ومع ذلك ، فإن الأنواع الأخرى Campylobacter مثل C. lari و C. upsaliensis حساسة لبعض هذه المضادات الحيوية ، وإما تنمو بشكل سيئ أو لا تنمو على الإطلاق. وهذا يساهم في نقص الإبلاغ عن التهابات كامبيلوباكتر من هذه الأنواع الحساسة للمضادات الحيوية7.
هناك سبب ثالث لماذا ثقافة Campylobacter قد تكون غير دقيقة. البكتيريا، عندما شدد، قد تبقى قابلة للحياة ولكن يمكن أن تصبح "غير صالحة للزراعة"8. وهذا يعني بحكم تعريفه أن الثقافة لن تكتشف البكتيريا الموجودة في العينة. عدد المرات التي يحدث هذا غير معروف8.
وبالنظر إلى هذه القضايا المحتملة مع الثقافة، استخدمنا أساليب مرجعية مقارنة متعددة بحيث نتائج الثقافة الخاطئة لم تجعل اختبار واحد للمقارنة تظهر غير دقيقة9. تم اختيار أساليب الثقافة المستخدمة (على سبيل المثال ، لوحات Campylobacter- انتقائية ، وسيلة نقل ، أكياس توليد الغاز) لأنها تستخدم على نطاق واسع في المختبرات السريرية لثقافة عينة البراز10.
تم تطوير بروتوكولات الثقافة الموصوفة هنا لأن أقل عدد من كامبيلوباكتر جيجوني التي يمكن اكتشافها من قبل الثقافة في البراز البشري لم يكن معروفا. على الرغم من أن التقديرات قد نشرت لأعداد من وحدات تشكيل مستعمرة (CFU) موجودة في براز الدواجن11،لا يمكن أن تكون هذه النتائج مساوية البراز البشري، كما Campylobacter spp. هي commensals في الدجاج، ولا تسبب الإسهال. هذه المعلومات الأساسية مطلوبة لتحديد أعداد البكتيريا Campylobacter التي من شأنها أن تنتج أعراض التهاب المعدة والأمعاء في البشر ومقارنة الفوعة بين السلالات أو الأنواع.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Anaerobic 3.5L Jar</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>HP0031A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>AnaeroGRO Campylobacter Selective Agar</td>
			<td>Hardy Diagnostics</td>
			<td>AG701</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bacto Brain Heart Infusion</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>237500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bacto Protease Peptone</td>
			<td>Life Technologies Corp</td>
			<td>211684</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Basic Fuchsin</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>B12544</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BBL Trypticase Peptone</td>
			<td>Life Technologies Corp</td>
			<td>211921</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>C. coli Type strain</td>
			<td>ATCC</td>
			<td>33559</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>C. jejuni Type strain</td>
			<td>ATCC</td>
			<td>33560</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CampyGen gas generating system sachet</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>CN0025A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Campylobacter QUIK CHEK</td>
			<td>TechLab, Inc.</td>
			<td>T5047 / T31025</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cary-Blair transport medium</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>23-005-47</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Coli Roller Sterile plating beads</td>
			<td>Millipore Sigma</td>
			<td>71013</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dilution Buffer</td>
			<td>Anaerobe Systems</td>
			<td>AS-908</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fetal bovine serum</td>
			<td>Equitech-Bio, Inc</td>
			<td>SFBM30</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium bisulfite</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>243973</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium pyruvate</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P2256</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Spectrophotometer cuvettes</td>
			<td>USA Scientific</td>
			<td>9090-0460</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

culture methods to determine the limit of detection and survival in transport media of campylobacter jejuni in human fecal specimens

ثقافة من البراز البشري لتشخيص مرض الأمعاء القائم على Campylobacterيستغرق عدة أيام ، وهو الانتظار الذي يدفع الثبات من الطبيب والمريض. الثقافة هي أيضا عرضة لنتائج سلبية كاذبة من فقدان عشوائي من القدرة على البقاء أثناء التعامل مع العينة، وفرط نمو النباتات البرازية الأخرى، وضعف نمو العديد من الأنواع الكابيلاكت المسببة للأمراض على وسائل الإعلام التقليدية. هذه المشاكل يمكن أن تربك القرارات السريرية بشأن علاج المريض وحدّت من المجال من الإجابة على الأسئلة الأساسية حول نمو كامبيلوباكتر والعدوى. نحن نصف الإجراء الذي يقدر الحد الأدنى من الأرقام البكتيرية التي يمكن الكشف عنها من قبل ثقافة وطريقة لقياس البقاء على قيد الحياة من C. jejuni في وسائل الإعلام المستخدمة لنقل هذا الكائن الحي الهش. مع العلم هذه المعلومات، يصبح من الممكن تعيين عتبات الكشف ذات الصلة سريريا لاختبارات التشخيص ومعالجة القضايا غير المدروسة من ما إذا كان الاستعمار غير أعراض هو السائد، إذا كان المشترك مع العدوى مع مسببات الأمراض المعوية الأخرى هو شائع، أو إذا كان الحمل البكتيري يرتبط مع الأعراض أو عواقب خطيرة. وشملت الدراسة أيضا اختبار 1552 عينات البراز المريض التي تم جمعها في المستقبل التي تم تصنيفها في البداية من قبل الثقافة التقليدية ومواصلة اختبارها من قبل المناعة إنزيم جديد. ثم تم فحص العينات الإيجابية وdiscrepant من قبل أربع طرق جزيئية لتعيين حالة إيجابية حقيقية أو سلبية حقيقية. وأظهرت الأساليب الخمس غير الثقافية اتفاقاً كاملاً على جميع العينات الإيجابية والمنسبة البالغ عددها 48 عينة، في حين أخطأت الثقافة في تحديد 14 عينة (28 في المائة). وشملت العينات التي تم تحديدها بشكل غير صحيح من قبل الثقافة 13 سلبية كاذبة وعينة إيجابية كاذبة واحدة. ويمكن استخدام هذا البروتوكول الأساسي مع العديد من Campylobacter spp. وسوف تسمح لعدد من البكتيريا Campylobacter التي تنتج أعراض التهاب المعدة والأمعاء في البشر ليتم تحديدها ومعدلات الانتشار ليتم تحديثها.

تحديد Campylobacter spp. المستعمرات بين النباتات البراز المتنافسة يتطلب البصر حريصة وحكم كبير. لم تتم دراسة أقل عدد من المستعمرات التي يمكن اكتشافها بواسطة الثقافة ، على الرغم من أن العينات من المرضى قد قدرت لإيواء 106-109 CFU / mL16،17. ومع ذلك، لا يمكن استخدام عينات المرضى كمياً حيث لا توجد طريقة مستقلة لتحديد أرقام بكتيرية دقيقة. للتغلب على هذا القيد، يتم إجراء قياسين متزامنين مع مخزون بكتيري واحد. ويستخدم اختبار واحد للكشف البصري للمستعمرات Campylobacter من تخفيف المسلسل من البكتيريا المخزون في مصفوفة البراز، ومحاكاة العينات السريرية؛ ويستخدم الآخر تحليليا لتحديد حجم CFU / مل موجودة في ثقافة المخزون البكتيري المستخدمة لspiking(الشكل 2A).
لن يتم تعريف عتبات الكشف لCampylobacter القيم. هذا هو المتوقع لأن كل مصفوفة البراز معقدة وفريدة من نوعها، ونمو البكتيريا هو متغير. المعلمة الرئيسية للنجاح هو تحديد المستعمرات حجم محدد بين النباتات البراز المتنافسة. يظهر لوحة تمثيلية لثقافة البراز المُرتفعت في الشكل 2C والشكل 2D. لوحة التحكم السلبية دون إضافة Campylobacter مهم للمساعدة في تحديد النباتات البرازية الأخرى. غرام تلطيخ العديد من المرشحين أيضا تدريب العين للتمييز بين المستعمرات لامعة الصحيح واللون الوردي المتوسط من الفوشين الملطخة الغرام السلبي البكتيريا ويؤكد مورفولوجيا البكتيريا في المستعمرات المختارة(الشكل 2B). أجريت سبع تجارب مستقلة، باستخدام 5 C. jejuni و 2 C. القولونية مرق، وأعطى العتبات التي تداخلت وامتدت من 0.3-5 × 106 CFU/mL. راجع الجدول 2 للحصول على بيانات نموذجية. وبلغ متوسط حدود الكشف 2 × 106 لجيم جيجوني و 1.2 × 106 CFU / mL لC. coli. وهذا يشير إلى أن الثقافة يمكن أن تكشف على الأرجح ~ 1-2 × 106C. jejuni أو C. coli لكل غرام من عينة البراز على الكابيلاكتر الكابيلاكتالقياسي الذي يحتوي على المضادات الحيوية المستخدمة من قبل العديد من المختبرات السريرية. هناك العديد من الأجار المتخصصة مع المضادات الحيوية المختلفة التي قد تعطي عتبات مختلفة للكشف عن مستعمرة. وينبغي للأساليب الموصوفة هنا أن تشجع على إجراء المزيد من الدراسات الكمية والمقارنة لتحسين دقة الثقافة وتوسيع نطاق تعدد وسائط الإعلام الجديدة. على سبيل المثال، تم حساب 152 مستعمرة على أول10-5 لوحة و 144 مستعمرات على لوحة10-5 الثانية. المعدل بين الاثنان لوحات 148 مستعمرات. تم تلقيح اللوحات مع 0.1 مل (100 ميكرولتر) من10-5 تخفيف، والتي من قبل المعادلة 1 يعادل 148 × 106 (14.8 × 107)CFU/mL في مخزون الثقافة النقية. عندما تم إجراء تخفيف البراز ، تم ارتفاع الثقافة إلى بركة البراز السلبية بنسبة 1:1. لذلك ، من خلال المعادلة 2، تتوافق النقطة الأولى (اللوحة "a") على منحنى البراز مع 14.8 × 107 مقسومًا على 2 وتساوي 7.4 × 107 CFU / mL. يستخدم هذا الأنبوب "أ" لجعل 9 تخفيفات إضافية. في الشكل 1، التخفيف الأخير مع مستعمرة واحدة واضحة سالبة الغرام مع Campylobacter- مثل مورفولوجيا على لوحة "ز". وهذا يعادل 1.1 × 106 CFU /mL لعتبة ثقافة البراز للكشف في هذا المثال.
على الرغم من أن استمرارية الزرع هو مفتاح دقة الثقافة، فإن الاحتفاظ بصلاحية Campylobacter spp. أثناء التعامل مع العينات وشحنها من المرضى إلى العيادات إلى المختبرات المرجعية هو أمر إشكالي. التخزين النموذجي هو تبريد العينات في أنابيب عادية مغطاة مع التعرض للهواء وبدون جو خاص. ويعتقد أن العينات في وسائل النقل (المعروفة أيضا باسم العينات المحفوظة) لديها بقاء أفضل، ولكن هناك تقارير قليلة توفر بيانات كمية18.
واستخدم مرة أخرى الجمع بين أساليب العينات التحليلية والأساليب المفتعلة المبينة أعلاه للحصول على تقديرات مدى صلاحية ووقت البقاء لجيم جيجوني في وسائط النقل. تم استخدام مرق مخزون بكتيري لإعداد عشرة مكررة 2 أضعاف إلى 1024 أضعاف تخفيف العينة في مصفوفة البراز. تم العثور على مرق الأولي من قبل العد التحليلي أن يكون التركيز من 4.8 × 107 CFU /mL. على لوحات المحرز في اليوم 0، تم الكشف عن C. jejuni (2 بعد أيام) على لوحة ملطخة مع تخفيف 32 أضعاف، أي ما يعادل 1.5 × 106 CFU/mL. ومع ذلك ، على لوحات مصنوعة بعد تبريد عينة البراز كاري بلير لمدة 24 ساعة ، فقط تخفيف 2 أضعاف (ما يعادل 2.4 × 107 CFU / مل) نمت المستعمرات المرئية. ولم يُشاهد أي فقدان آخر للاستمرار ية إلى 96 ساعة، عندما توقفت الدراسة. ويعادل هذا الفقدان في القدرة على البقاء 16 ضعفاً (94%) فقدان الكائنات القابلة للزراعة في أقل من 24 ساعة ، ويشير إلى أنه ، حتى مع التبريد ، قد يفتقد البراز في Cary Blair المتوسط مع أقل من 107 CFU / mL C. jejuni من قبل الثقافة.
وعلى النقيض من نتائج الثقافة، اكتشف تقييم الأثر البيئي وجود جيم جيجوني عند التخفيف البالغ 256 ضعفاً عند النقطة الزمنية الأولية وطوال فترة الاختبار البالغة 4 أيام. وعتبة الكشف عن C. jejuni لهذا تقييم الأثر البيئي باستخدام عينات البراز ارتفعت هو 8.4 × 104 CFU /mL. هذه العتبة هي أقل من تلك التي من ثقافة البراز ويسمح الكشف أكثر حساسية واستقرارا من C. jejuni.
لاختبار قدرة الثقافة على الكشف عن Campylobacter spp. في وضع سريري فعلي ، تميزت 1552 عينة براز سريرية بـ 6 إجراءات: ثقافة البراز ، واستئصال المناعة الجديد لCampylobacter spp.، و 4 طرق جزيئية. تم جمع جميع العينات في المستقبل وتصنيفها في البداية حسب الثقافة التقليدية في 3 مختبرات في الولايات المتحدة، ثم تم فحصها عبر هاوية تقييم الأثر البيئي. ثم تم فحص أي عينات إيجابية للثقافة أو EIA /culture-discrepant بواسطة الطرق الجزيئية12. تم تعيين العينات حالة إيجابية حقيقية أو سلبية حقيقية استناداً إلى نتائج الأساليب غير الثقافية الخمسة. وأظهرت الأساليب الخمس غير الثقافية اتفاقاً كاملاً على جميع العينات الإيجابية والمنسبة البالغ عددها 48 عينة، في حين أساءت الثقافة تحديد 14 عينة (28 في المائة). وشملت العينات التي تم تحديدها بشكل غير صحيح من قبل الثقافة 13 سلبية كاذبة وعينة إيجابية كاذبة واحدة.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60457/60457fig1a.jpg"> الشكل 1: مخطط للإعداد المتزامن لعينات البراز التحليلية والمسامير. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60457/60457fig1large.jpg" target="_blank">يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60457/60457fig2a.jpg"> الشكل 2: تحديد مستعمرات ج. جيجوني من الثقافات النقية والبرازية. (أ)صورة لمستعمرات سي جيجوني من الثقافة البكتيرية النقية بعد 72 ساعة من الحضانة. (ب)غرام وصمة عار من C. jejuni من الثقافة البكتيرية النقية، النفط الغمر 400x التكبير. (C)صورة لجيم jejuni-positive ارتفعت ثقافة البراز بعد 48 ح الحضانة. (D)منطقة مكبرة في مربع في(C)،10x التكبير. الأسهم البيضاء تشير إلى دبوس نقطة حجم الغرام سالب المستعمرات جيجوني. يشير رأس السهم الأسود إلى مستعمرة أكبر قليلاً ، إيجابية الجرام ، وليس C. jejuni. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60457/60457fig2large.jpg" target="_blank">يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.</a>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1"><tbody>
<tr>
<td>الثقافات</td>
			<td>OD600 @ T0</td>
			<td>OD600 @ T النهائي1</td>
			<td>CFU النهائي / مل</td>
		</tr>
<tr>
<td>ج. جيجوني</td>
			<td>0.146</td>
			<td>0.321</td>
			<td>1.28 × 107
</td>
		</tr>
<tr>
<td>جيم كولاي</td>
			<td>0.245</td>
			<td>0.508</td>
			<td>4.50 × 108
</td>
		</tr>
</tbody></table>الجدول 1: النمو النموذجي وCFU/mL من أسهم C. jejuni و C. coli. 1جيم توقفت ثقافةجيجوني بعد 48 ساعة من الحضانة. C. تم إيقاف ثقافة القولونية بعد 54 ساعة من الحضانة.
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1"><tbody>
<tr>
<td></td>
			<td>أنبوب تخفيف لعينة البراز ارتفعت</td>
			<td>عدد المستعمرات الكامبيلوباكتر</td>
			<td>عدد المستعمرات سالبة الغرام1</td>
			<td>الثقافة إيجابية؟</td>
			<td>CFU/mL المحسوبة من عينة ارتفعت</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="10">
جيم جيجوني (1.28 × 108 مخزون CFU/mL)</td>
			<td>(2 أضعاف) أ</td>
			<td>كثيفه</td>
			<td>الثانيالثاني
</td>
			<td>نعم</td>
			<td>6.40 × 107
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(4 أضعاف) ب</td>
			<td>20+</td>
			<td>Nd</td>
			<td>نعم</td>
			<td>3.20 × 107
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(8 أضعاف) ج</td>
			<td rowspan="3">4-10</td>
			<td>Nd</td>
			<td>نعم</td>
			<td>1.60 × 107
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(16 أضعاف) د</td>
			<td>Nd</td>
			<td>نعم</td>
			<td>8.00 × 106
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(32 أضعاف) ه</td>
			<td>Nd</td>
			<td>نعم</td>
			<td>4.00 × 106
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(64 أضعاف) و</td>
			<td rowspan="4">1-3</td>
			<td>1 من 2</td>
			<td>نعم</td>
			<td>2.00 × 106
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(128 أضعاف) ز</td>
			<td>2 من 3</td>
			<td>نعم</td>
			<td>1.00 × 106
</td>
		</tr>
<tr>
<td>
3(256 أضعاف) ح
</td>
			<td>1 من 2</td>
			<td>نعم</td>
			<td>5.00 × 105
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(512 أضعاف) ط</td>
			<td>0 من 1</td>
			<td>لا</td>
			<td>2.50 × 105
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(1024 أضعاف) ي</td>
			<td>0</td>
			<td>Nd</td>
			<td>لا</td>
			<td>NFP</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="10">
C. القولونية (4.50 × 108 CFU / mL المخزون)</td>
			<td>(2 أضعاف) أ</td>
			<td rowspan="2">كثيفه</td>
			<td>Nd</td>
			<td>نعم</td>
			<td>2.25 × 108
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(4 أضعاف) ب</td>
			<td>Nd</td>
			<td>نعم</td>
			<td>1.13 × 108
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(8 أضعاف) ج</td>
			<td>50+</td>
			<td>Nd</td>
			<td>نعم</td>
			<td>5.63 × 107
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(16 أضعاف) د</td>
			<td>30+</td>
			<td>Nd</td>
			<td>نعم</td>
			<td>2.81 × 107
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(32 أضعاف) ه</td>
			<td>10+</td>
			<td>Nd</td>
			<td>نعم</td>
			<td>1.41 × 107
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(64 أضعاف) و</td>
			<td rowspan="2">3-8</td>
			<td>Nd</td>
			<td>نعم</td>
			<td>7.03 × 106
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(128 أضعاف) ز</td>
			<td>Nd</td>
			<td>نعم</td>
			<td>3.52 × 106
</td>
		</tr>
<tr>
<td>
3(256 أضعاف) ح
</td>
			<td rowspan="2">1-3</td>
			<td>1 من 3</td>
			<td>نعم</td>
			<td>1.76 × 106
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(512 أضعاف) ط</td>
			<td>0 من 1</td>
			<td>لا</td>
			<td>8.79 × 105
</td>
		</tr>
<tr>
<td>(1024 أضعاف) ي</td>
			<td>0</td>
			<td>Nd</td>
			<td>لا</td>
			<td>NFP</td>
		</tr>
</tbody></table>الجدول 2: الأعداد النموذجية للمستعمرات على لوحات عينات البراز المعزّزة. 1 المستعمرات السلبية غرام بين مستعمرات مثل Campylobacter، 2nd = لم يتم تحديدها، 3البيانات في نوع غامق يشير إلى تخفيف إيجابي الماضي.
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1"><tbody>
<tr>
<td>الانواع</td>
			<td>هدف الجينات</td>
		</tr>
<tr>
<td>ج. جيجوني</td>
			<td>هيبو</td>
		</tr>
<tr>
<td>جيم كولاي</td>
			<td>cadF</td>
		</tr>
<tr>
<td>جيم - upsaliensis</td>
			<td>cpn60</td>
		</tr>
<tr>
<td>جيم لاري</td>
			<td>cpn60</td>
		</tr>
<tr>
<td>جيم- هيلفيتيموس</td>
			<td>cpn60</td>
		</tr>
<tr>
<td>جيم - الجنين</td>
			<td>cpn60</td>
		</tr>
<tr>
<td>جيم - الهيوويالا</td>
			<td>cpn60</td>
		</tr>
<tr>
<td>جيم - الكونكيموس</td>
			<td>cpn60</td>
		</tr>
</tbody></table>الجدول 3: الجينات المفيدة للكشف عن الأنواع الفردية Campylobacter qPCR.

Watch this Scientific Journal Video about Culture Methods to Determine the Limit of Detection and Survival in Transport Media of Campylobacter Jejuni in Human Fecal Specimens at JoVE.com

Culture Methods to Determine the Limit of Detection and Survival in Transport Media of Campylobacter Jejuni in Human Fecal Specimens

على الرغم من أن ثقافة البراز لCampylobacter غير دقيقة ، إلا أنها لا تزال تعتبر المعيار الذهبي لتحديد الهوية. يتم وصف طرق تحديد الحد من الكشف والبقاء على قيد الحياة في وسائل الإعلام النقل من C. jejuni في البراز البشري ومقارنتها مع المناعة الجديدة مع دقة أفضل.

أساليب الثقافة لتحديد الحد من الكشف والبقاء على قيد الحياة في وسائل الإعلام النقل من Campylobacter Jejuni في عينات البراز البشري

A culture from human stool for diagnosis of Campylobacter-based intestinal illness takes several days, a wait that taxes the fortitude of the physician ...

صعوبة ثقافة كامبيلوباكتر منعت الدراسات الأساسية مثل كيفية وجود حاجة قليلة للبكتيريا لإنتاج المرض. ويمكن لهذه العينات التحليلية والمفتعلة المستخدمة هنا أن تعالج هذه المسألة. هذه التقنية تسمح الأعراض السريرية ذات الصلة المريض أن تكون مرتبطة مع نتيجة إيجابية ثقافة البراز وللمرة الأولى، وعدد فعلي من البكتيريا.إن تعلم عدد البكتيريا المرتبطة بالمرض سيوفر تشخيصًا ، وهو هدف مهم للكشف وطريقة قوية لمقارنة الفوعة بين سلالات أو أنواع Campylobacter. ثقافة Campylobacter واضحة ولكنها تتطلب إعدادًا سريعًا ومنظمًا للحفاظ على الجدوى الكمية. وهناك حاجة أيضا حكم كبير لتحديد مستعمرات Campylobacter بين النباتات البراز المتنافسة على طبق من ذهب.قبل البدء في ثقافة C.jejuni أو C.coli ، وضع على القفازات ، ومعطف المختبر ، ونظارات السلامة ، ووضع ورقة واقية يمكن التخلص منها داخل غطاء أمان تدفق لارينار المطهر. باستخدام سلسلة تقنية معقمة كل مرطب البكتيريا رطب أو المذاب على لوحة أجار Campylobacter محددة ووضع لوحة في 37 درجة مئوية لمدة 48 ساعة في جرة لاهوائية تحتوي على غاز الغلاف الجوي ميكروهوائي توليد كيس. بعد 24 ساعة، تغطية فضفاضة قارورة من مرق BHI ووضع قارورة في جرة لاهوائية جديدة مع كيس من شأنها أن تنتج بيئة ميكروهوائية لاحتضان بين عشية وضحاها في 37 درجة مئوية.في صباح اليوم التالي استخدام ثلاثة ملليلتر من مرق ما قبل تخفيض وحلقة تلقيح لكشط لوحة بداية من ثقافة Campylobacter. نقل الطين إلى أنبوب معقمة، وتطعيم 97 ملليلتر المتبقية من مرق ما قبل تخفيض مع ثلاثة ملليلتر من الطين كشط. ضع المرق في الجرة مع كيس الغاز واحتضان الثقافة عند 37 درجة مئوية و115 ثورة في الدقيقة على حاضنة اهتزاز لمدة 48 إلى 72 ساعة ، حتى تصل الثقافة إلى كثافة بصرية عند 600 نانومتر لا يزيد عن 4.لتحديد عدد من البكتيريا في هذه الثقافة الأسهم النقية أداء ثمانية 10 أضعاف سلسلة التخفيف من 100 ميكرولتر من مرق في 900 ميكرولترات من التخفيف. باستخدام الخرز الطلاء العقيم، انتشرت 100 ميكرولترات من 10 مرات إلى الخامسة السلبية إلى 10 إلى التخفيفات السابعة السلبية على لوحات كامبيلوباكت مكررة محددة قبل تخفيض ولوحات التسمية مع تركيز التخفيف قبل وضع لوحات في جرة لاهوائية ثانية مع كيس الغاز توليد لمدة 48 إلى 72 ساعة في 37 درجة مئوية. في النهاية من النموّ فترة ينتقي لوحات مع بين 30 إلى 300 مستعمرات لعدّ.بعد عد استخدام العد لتحديد وحدات تشكيل مستعمرة لكل ملليلتر من الأسهم مرق الثقافة وفقا للصيغة. من المهم أن تكون تعدادات المستعمرة التحليلية دقيقة لأن هذا يدعم جميع الخطوات باستخدام بركة البراز ارتفعت. مباشرة بعد الطلاء للعد كما هو مبين، مزيج كميات متساوية من مرق وكامبيلوباكت حمام البراز السلبية وجعل تسعة اللاحقة اثنين من عمليات التخفيف في بركة البراز السلبية، إضافة لوحة التحكم مع مرق تحتوي على أي Campybacter إلى بركة البراز للمساعدة في تحديد المستعمرات غير Campylobacter.خط 10 microliters من كل Campylobacter البراز التخفيف على مكررة قبل خفض لوحات أجار كامبيلوباكت محددة واحتضان لوحات في جرة اللاهوائية مع كيس توليد الغاز في 37 درجة مئوية لمدة 48 ساعة تقريبا. في نهاية الحضانة فحص بصريا لوحات متشدّد للمستعمرات تشبه تلك من الثقافات كامبيلوباكتر نقية. لتأكيد أن المستعمرات هي في الواقع Campylobacter تحديد Campylobacter متعددة مثل المستعمرات لتلطيخ غرام وتصور منطقة رقيقة من قبل المجهر الخفيف باستخدام عدسة الغمر النفط لتحديد غرام السلبية المنحنية، دوامة، أو السيجار على شكل البكتيريا الصغيرة.لوحة تحكم سلبية دون إضافة Campylobacter مهم للمساعدة في تحديد النباتات البراز الأخرى. النظر في التخفيف الأخير الذي يحتوي على مستعمرة Visualة مثل Campylobacter سلبية الغرام الحد من الكشف عن الثقافة. واستخدام الصيغة لحساب وحدات تشكيل مستعمرة لكل ملليلتر من التخفيف الإيجابي في عينة البراز السريرية المفتعلة.لتحديد جدوى Campylobacter المخزنة في المتوسط مزيج النقل ملليلتر واحد من ثقافة مرق Campylobacter مع ملليلتر واحد من تجمع البراز السلبية وإعداد 10 مكررة مزدوجة أضعاف التخفيف المسلسل في بركة البراز السلبية. مزيد من التخفيف كل تخفيف في نسبة إضافية واحدة إلى أربع في المتوسط كاري بلير وتخزين أنابيب التخفيف 20 والسيطرة السلبية في المتوسط كاري بلير في أنابيب الغطاء في درجتين إلى ثماني درجات مئوية لمدة 96 ساعة. بدءا في الوقت صفر وكل 24 ساعة بعد ذلك خط 10 microliter aliquots من كل تخفيف على لوحات أجار كامبيلوباكتر انتقائية واحتضان لوحات في 37 درجة مئوية لمدة 48 ساعة.كما لا توجد طريقة مستقلة لإنشاء أرقام البكتيريا دقيقة من عينات المريض اثنين من القياسات المتزامنة يمكن إجراء مع مخزون واحد البكتيرية النقية. يتم استخدام اختبار واحد للكشف البصرية من مستعمرات Campylobacter من التخفيفات التسلسلية من البكتيريا الأسهم في مصفوفة البراز، محاكاة العينات السريرية. يتم استخدام الاختبار الآخر تحليليا، وقياس وحدات تشكيل مستعمرة لكل ملليلتر موجودة في نفس ثقافة الأرصدة البكتيريا المستخدمة في ارتفاع.معلمة رئيسية للنجاح هو تحديد المستعمرات الحجم الدقيق بين النباتات البراز المتنافسة، كما يتضح من هذه اللوحة التمثيلية لثقافة البراز ارتفعت. هنا، يمكن ملاحظة البيانات النموذجية من سبع تجارب مستقلة. ببساطة تحديد المستعمرات التي تشبه Campylobacter داخل الثقافات البراز ليست كافية.يجب تأكيد جميع المستعمرات مع وصمة عار غرام أو أساليب أكثر تقدما. نحن نستخدم المناعة الانزيمية التي هي أكثر دقة من الثقافة للكشف عن الأنواع غير الشائعة مثل C.upsaliensis أو C.lari، والتي تنمو بشكل سيئ على المضادات الحيوية القياسية التي تحتوي على أجار. هذه التقنية تضع أساسا ضروريا لدراسة أشياء مثل النقل غير أعراض Campylobacter وما إذا كانت الأحمال البكتيرية العالية وضعت المريض في خطر أكبر لعواقب وخيمة للعدوى Campylobacter.دائما ارتداء معدات الوقاية الشخصية عند العمل مع البكتيريا، والتي غالبا ما تكون معدية ويمكن أن تكون خطرة، ومع بركة البراز السلبية التي قد تحتوي على مسببات الأمراض غير معروف حتى عندما جمعت من متبرعين أصحاء.

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Culture Methods to Determine the Limit of Detection and Survival in Transport Media of Campylobacter Jejuni in Human Fecal Specimens

Combination of Adhesive-tape-based Sampling and Fluorescence in situ Hybridization for Rapid Detection of Salmonella on Fresh Produce

Combination of Adhesive-tape-based Sampling and Fluorescence in situ Hybridization for Rapid Detection of Salmonella on Fresh Produce

مزيج من الشريط اللاصق على أساس أخذ العينات والإسفار في الموقع تهجين للكشف السريع عن السالمونيلا على المنتجات الطازجة

This protocol describes a simple approach for adhesive-tape-based sampling of tomato and other fresh produce surfaces, followed by on-tape fluorescence in ...

Amplifying and Quantifying HIV-1 RNA in HIV Infected Individuals with Viral Loads Below the Limit of Detection by Standard Clinical Assays

تضخيم وقياس HIV - 1 الحمض النووي الريبي في الأفراد المصابين بالايدز مع الأحمال الفيروسية أقل من الحد كشفها بواسطة فحوصات السريرية القياسية

Amplifying viral genes and quantifying HIV-1 RNA in HIV-1 infected individuals with viral loads below the limit of detection by standard assays (below ...

Quantitative In vitro Assay to Measure Neutrophil Adhesion to Activated Primary Human Microvascular Endothelial Cells under Static Conditions

Quantitative In vitro Assay to Measure Neutrophil Adhesion to Activated Primary Human Microvascular Endothelial Cells under Static Conditions

كمي<em&gt; في المختبر</em&gt; الفحص لقياس التصاق العدلات إلى تنشيط الخلايا البطانية الاوعية الدموية الدقيقة الإنسان الأساسية بموجب الشروط ثابت

The vascular  endothelium plays an integral part in the inflammatory response. During the  acute phase of inflammation, endothelial cells (ECs) are ...

Total Protein Extraction and 2-D Gel Electrophoresis Methods for Burkholderia Species

Total Protein Extraction and 2-D Gel Electrophoresis Methods for Burkholderia Species

مجموع استخراج بروتين و 2-D طرق جل الكهربائي ل<em&gt; بيركولديريا</em&gt; الأنواع

The investigation of  the intracellular protein levels of bacterial species is of importance to  understanding the pathogenic mechanisms of diseases ...

Methods to Inhibit Bacterial Pyomelanin Production and Determine the Corresponding Increase in Sensitivity to Oxidative Stress

طرق لمنع البكتيرية Pyomelanin الإنتاج وتحديد الزيادة المقابلة في الحساسية للإجهاد التأكسدي

Pyomelanin is an extracellular red-brown pigment produced by several bacterial and fungal species. This pigment is derived from the tyrosine catabolism ...

Neutrophil Isolation and Analysis to Determine their Role in Lymphoma Cell Sensitivity to Therapeutic Agents

عزل وتحليل العدلة لتحديد ما دورها في الغدد اللمفاوية حساسية الخلية وكلاء العلاجية

Neutrophils are the most abundant (40% to 75%) type of white blood cells and among the first inflammatory cells to migrate towards the site of ...

Human Placental and Decidual Organ Cultures to Study Infections at the Maternal-fetal Interface

الثقافات المشيمة وساقطي الجهاز الإنسان لدراسة العدوى في واجهة الأم والجنين

The placenta shows a large degree of interspecies anatomic variability. To best understand biology and pathophysiology of the human placenta, it is ...

High-throughput Detection of Respiratory Pathogens in Animal Specimens by Nanoscale PCR

كشف الإنتاجية العالية للجهاز التنفسي مسببات الأمراض في العينات الحيوانية التي كتبها النانو PCR

Nanoliter scale real-time PCR uses spatial multiplexing to allow multiple assays to be run in parallel on a single plate without the typical drawbacks of ...

Real-time Quaking-induced Conversion Assay for Detection of CWD Prions in Fecal Material

في الوقت الحقيقي مهتز الناجمة عن تحويل الفحص للكشف عن البريونات CWD في المواد البرازية

The RT-QuIC technique is a sensitive in vitro cell-free prion amplification assay based mainly on the seeded misfolding and aggregation of recombinant ...

Overexpression and Purification of Human Cis-prenyltransferase in Escherichia coli

Overexpression and Purification of Human Cis-prenyltransferase in Escherichia coli

أوفيركسريسيون وتنقية الإنسان<em&gt; رابطة الدول المستقلة</em&gt; -prenyltransferase في<em&gt; الإشريكية القولونية</em

Prenyltransferases (PT) are a group of enzymes that catalyze chain elongation of allylic diphosphate using isopentenyl diphosphate (IPP) via multiple ...