Name: investigating intestinal barrier breakdown in living organoids
Uploaded: 2020-03-26T13:00:00
Duration: 7 min 18 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Investigating Intestinal Barrier Breakdown in Living Organoids at JoVE.com

Ces travaux ont été soutenus par des subventions de la Fondation allemande de recherche (DFG) [KFO257, projet 4 à M.S. et projet 1 à C.B.; FOR2438, projet 2 à M.S. et E.N. et projet 5 à C.B.; projet SFB1181 C05 à C.B.; TRR241, projet A06 à N.B.L. et M.S., projet A03 à C.B., BR5196/2-1 à N.B.L. et BE3686/2 à C.B.]; le Centre interdisciplinaire de recherche clinique (IZKF) du Centre Clinique Erlangen (à M.S., E.N., et M.B.), le W. Lutz Stiftung (à M.S.) et le Forschungsstiftung Medizin du Centre clinique Erlangen (à M.S.). Le présent travail a été effectué dans le respect (partiel) des exigences pour obtenir le diplôme Dr. Med. de Marco Bardenbacher.

Toutes les étapes ont été franchies conformément à toutes les lignes directrices pertinentes en matière de réglementation et de soins aux animaux en établissement.
1. Plating des organoïdes
<ol><li>Isoler les organoïdes comme décrit précédemment3. La procédure est brièvement décrite ci-dessous.
	<ol>
<li>Recueillir les intestins grêles de souris.</li>
		<li>Ouvrez les intestins grêles longitudinally et retirez les pointes de villi en grattant le tissu intestinal interne avec un coverlip.</li>
		<li>Couper le tissu intestinal en petits morceaux à l’aide de ciseaux.</li>
		<li>Laver les morceaux 5x dans le salin à phosphate froid (PBS) en piper les morceaux 10x de haut en bas avec une pipette de 25 mL.</li>
		<li>Incuber les morceaux de tissu dans la solution froide 2 mM EDTA sur la glace pendant 30 min sur une plate-forme horizontale de secousses. Laisser les morceaux de tissu se sédimenter.</li>
		<li>Remplacez la solution EDTA par un tampon PBS une fois que les morceaux de tissu se déposent au fond. Jetez le supernatant et ajoutez 20 ml de PBS.</li>
		<li>Relâchez les cryptes intestinales du tissu en pipenant vigoureusement 10x de haut en bas avec une pipette de 10 ml.</li>
		<li>Recueillir le supernatant dans les tubes de centrifugation et l’inspecter par microscopie de contraste de phase. Pour ce faire, ajoutez une goutte de supernatant à une plaque de culture cellulaire de 96 puits. Gardez les tubes de centrifugation sur la glace.</li>
		<li>Répétez les étapes 1.1.6-1.1.8 jusqu’à ce que le nombre de cryptes intestinales dans le supernatant collecté diminue.</li>
		<li>Passer les fractions contenant le plus de cryptes à travers une passoire cellulaire de 70 m.</li>
		<li>Centrifuge la suspension de crypte à 300 x g,4 oC pour 5 min.</li>
		<li>Jetez le supernatant et réutilisez la pastille dans PBS froid afin de laver les cryptes. Répétez ensuite l’étape de centrifugation telle que décrite dans 1.1.11.</li>
		<li>Résuspendez la pastille dans un total de 25 ll par puits d’un mélange de 1:1 de solution de matrice cellulaire et de milieu de culture organoïde trouble et plaquez les organoïdes dans une 48 plaques de culture cellulaire de puits.</li>
		<li>Incuber les organoïdes à 37 oC, 5% de CO2, pendant 20 min pour permettre à la solution de matrice cellulaire de se solidifier.</li>
		<li>Couvrir les organoïdes de 300 lil de milieu organoïde murin par puits.</li>
		<li>Culture les organoïdes à 37 oC, 5% de CO2, en changeant le milieu tous les 2-3 jours.</li>
		<li>Utilisez les organoïdes pour des expériences après 7 jours de culture.</li>
	</ol></li>
	<li>Préparer les organoïdes pour la mesure de l’intégrité de la barrière.
	<ol>
<li>Précarcez tous les tubes de centrifugation qui seront utilisés pour stocker les organoïdes pendant le processus de placage avec l’albumine de sérum bovin (BSA) en ajoutant assez d’une solution BSA de 0,1% dans PBS pour couvrir toutes les surfaces en plastique. Retirez ensuite la solution BSA et conservez les tubes de centrifugation sur la glace.</li>
		<li>Décongeler la solution de matrice cellulaire et le milieu de la culture organoïde sur la glace.</li>
	</ol></li>
	<li>Pour séparer les organoïdes, retirez soigneusement le milieu de la culture et réutilisez les organoïdes d’un puits d’une plaque de 48 puits dans 1 ml de PBS froid. Dissoudre la matrice cellulaire par tuyauterie vigoureuse. Gardez toujours la suspension organoïde dans les tubes de centrifugation précoatés avec BSA et toujours garder sur la glace. REMARQUE: La densité, la taille et la position des organoïdes dans la glissière de coverlip chambré sont influencées par le rapport de fractionnement, la concentration de solution de matrice cellulaire, et la manipulation de la suspension de matrice organoïde-cellule. Il est recommandé de pratiquer la manipulation de la solution de matrice cellulaire à l’avance. Habituellement, huit couvertures en verre bien chambrés conviennent à l’essai. Les organoïdes dérivés d’un puits d’une plaque de puits confluent de 48 peuvent être divisés en deux puits d’un housse bien chambré (40 l de la matrice organoïde-cellule granule par puits).</li>
	<li>Centrifuge la suspension organoïde à 300 x g à 4 oC pendant 5 min.</li>
	<li>Jetez soigneusement le supernatant et réutilisez la boulette avec 1 ml de PBS froid.</li>
	<li>Centrifuge la suspension organoïde à 300 x g,4 oC pendant 5 min.</li>
	<li>Jetez complètement le supernatant et réutilisez les organoïdes dérivés d’un puits d’une plaque de 48 puits en 40 ll de milieu froid. Fragmentez les grandes structures organoïdes en canalisation de la suspension organoïde 5x à travers une pointe de pipette de 10 l pour recueillir des structures d’une taille de 40 à 60 m pour l’ensemencement. REMARQUE: Utilisez la pointe de 10 L sur une pointe de pipette de 100 L pour la fragmentation des structures organoïdes, et pratiquez l’étape 1.7 à l’avance pour assurer des résultats cohérents. Contrôler la taille des organoïdes par microscopie de contraste de phase dans le tube de centrifugation. Assurez-vous qu’il n’y a plus d’organoïdes multibranchés présents et que les fragments d’organoïdes mesurent environ 40 à 60 m de long.</li>
	<li>Une fois que les organoïdes ont obtenu la taille désirée, mélangez-les avec 40 L de la solution de matrice cellulaire (solution moyenne : matrice cellulaire ' 1:1). REMARQUE: Le rapport de solution de matrice moyenne/cellule doit être maintenu constant pour obtenir des résultats cohérents. La dilution de la solution de matrice cellulaire réduit la rigidité du blob organoïde et affecte ses propriétés de diffusion. Utilisez des pointes de tuyauterie précolées (-20 oC) pour toutes les suspensions contenant la solution de matrice cellulaire.</li>
	<li>Placez 40 l de la suspension de la solution de matrice organoïde-cellule au centre de chaque puits d’un coverlip bien chambré de 8.</li>
	<li>Conserver la lame sur une banquise pendant 5 min. Ceci préserve le liquide de suspension organoïde de matrice cellulaire et augmente la concentration d’organoïdes à la surface de coverlip par gravité.</li>
	<li>Incuber pendant 20 min à 37 oC et 5% de CO2 pour permettre la polymérisation du blob de matrice organoïde-cellule.</li>
	<li>Ajouter 150 L de milieu de culture organoïde par puits et incuber pendant 24 h à 37 oC et 5% de CO2 avant de procéder au traitement expérimental.
	<ol>
<li>Utilisez cette période pour traiter les organoïdes et moduler leur intégrité de barrière selon l’hypothèse scientifique correspondante. Pour le contrôle positif, traiter les organoïdes pendant 48 h avec IFN-md afin d’étudier la dégradation et la perméabilité serrées associées à l’IFN-IN. Stimulez le contrôle positif avec 10 U/mL (10 ng/mL) recombinants murine IFN-. Laissez les organoïdes d’un bien non traité.</li>
	</ol></li>
	<li>Organoïdes de culture à 37 oC et 5% de CO2 pour un maximum de 48 h.</li>
</ol>2. OrganoïdePerméabilité Assay
<ol><li>Porter la chambre d’incubation du microscope à 37 oC au moins 2 h avant de commencer l’expérience pour réduire la dérive thermique tout en imagerie des organoïdes.</li>
	<li>Préparer une solution de 100 mM de LY dans PBS. Conserver sur de la glace protégée de la lumière.</li>
	<li>Préparer une solution de 200 mM d’EGTA dans PBS. Rangez-le sur la glace.</li>
	<li>Transférer le housse chambré, y compris les organoïdes dans la chambre d’incubation d’un microscope confocal inversé et activer l’incubation co2 (5%). Assurez-vous que le housse chambré est étroitement verrouillé dans le stade du microscope.</li>
	<li>En utilisant les organoïdes dans un ainsi qu’une référence, ajuster les paramètres d’imagerie du microscope. Ajouter LY (3 l de 100 mM LY dans 150 ll de milieu) pour obtenir un volume final de 1 mM LY en 300 lL de milieu. Incuber sur le microscope pendant 1 h et ajuster l’accent pour l’imagerie des lumen des organoïdes. Définissez l’énergie laser requise pour l’excitation LY (488 nm) et la sensibilité de détection respective de l’instrument et essayez d’imager la fluorescence LY à 30-40% de la plage dynamique disponible de l’instrument utilisé. REMARQUE: Ajuster l’énergie d’excitation laser et l’efficacité de détection sur les organoïdes non traités 70 min après l’ajout de LY. Assurez-vous que l’énergie d’excitation est assez élevée pour obtenir une image bien exposée. Pour éviter la saturation de la fluorescence LY dans les images microscopiques, il est recommandé d’ajuster ces paramètres après la diffusion LY atteint un état stable.</li>
	<li>Définissez la position des organoïdes par contraste différentiel (DIC) imagerie vivante. Essayez d’imager les organoïdes de diamètres comparables (80 à 30 m) et concentrez-vous sur la tranche centrale des organoïdes pour imaginer leurs lumen. Définissez environ 10 organoïdes par puits et essayez d’imaginer uniquement les organoïdes près de la surface de coverlip avec une structure sphérique. REMARQUE: Le nombre d’organoïdes qui peuvent être photographiés par course dépend de la vitesse du microscope. Il est recommandé d’imager les organoïdes dans un intervalle de 5 minutes. Sur un microscope à balayage laser régulier, 40 positions au total sont un point de départ raisonnable.</li>
	<li>Enregistrez le DIC et la fluorescence LY de chaque position pour documenter la forme et l’autofluorescence de l’organoïde avant d’ajouter le LY aux puits, utilisés pour l’analyse d’intégrité de barrière.</li>
	<li>N’imagez pas les organoïdes qui affichent une grande autofluorescence. Ceci est dû à l’accumulation de cellules mortes dans le lumen de l’organoïde, et les résultats des organoïdes autofluorescents sont difficiles à analyser par la suite.</li>
	<li>Diluer 3 L de la solution LY préparée (100 mM LY en 150 ll de milieu) et ajouter ceci soigneusement à chaque puits sans toucher le coverlip chambré. La concentration recommandée de LY par puits est de 1 mM. Le volume final par puits doit être de 300 ll.</li>
	<li>Vérifiez rapidement l’orientation des positions définies et corrigez si nécessaire. REMARQUE: LY diffuse rapidement à travers la matrice cellulaire. Par conséquent, l’imagerie confocale doit être commencée dans les 3 minutes après l’ajout du fluorophore.</li>
	<li>Commencez une imagerie en time-lapse au microscope. Prenez une image de fluorescence de chaque position toutes les 5 minutes pour un total de 70 min. REMARQUE: Les organoïdes ont été photographiés dans des intervalles de 5 minutes pour visualiser l’absorption LY au fil du temps. Pour mesurer la dégradation de la barrière intestinale, il suffit d’enregistrer la fluorescence avant et 60 min après l’ajout de LY et une fois de plus 10 min après l’ajout de l’EGTA.</li>
	<li>Ajouter 3 L de la solution EGTA préparée par puits sans toucher le coverlip chambré. La concentration recommandée dans le housse chambré de l’EGTA est de 2 mM. Le volume total par puits devrait être de 300 ll.</li>
	<li>Commencez un deuxième time-lapse. Enregistrez à nouveau la fluorescence des organoïdes définis avec un intervalle de 5 min pour un total de 30 min.</li>
	<li>Jetez tout selon les règles de sécurité locales. REMARQUE: Le protocole peut être mis en pause ici.</li>
</ol>3. Analyse des données
<ol><li>N’analysez que les résultats des organoïdes qui ont pris LY après l’ajout EGTA.</li>
	<li>Les résultats peuvent être quantifiés avec Fiji ImageJ.</li>
	<li>Ouvrez l’ensemble de données dans ImageJ en cliquant sur Le fichier ( Ouvrez et sélectionnez les données d’image. Dans les options d’importation BIO-Formats suivantes, dialoguez sélectionnez Pile Vue avec : Hyperstack.</li>
	<li>Ouvrez le gestionnaire de la région d’intérêt (ROI) en cliquant sur Analyze ( Outils GESTIONNAIRE de ROI.</li>
	<li>Dessinez un retour sur investissement ovale en cliquant sur le bouton de sélection ovale dans la barre de menu ImageJ. Dessinez une sélection contenant le lumen intérieur de l’organoïde. Ensuite, appuyez sur Ajouter dans le gestionnaire de retour sur investissement.</li>
	<li>Répétez les étapes pour trois zones représentatives en dehors de l’organoïde.</li>
	<li>Cliquez sur Analyser la barre du menu et sélectionner les mesures définies. Activez uniquement la valeur grise moyenne et désactiver toute autre mesure. Ensuite, cliquez sur OK.</li>
	<li>Assurez-vous que tous les ROI sont sélectionnés dans le gestionnaire de retour sur investissement. Dans le gestionnaire du roi, cliquez sur Plus de Multi mesure. Dans l’option dialoguer sélectionnez Mesure toutes [...] tranches et une rangée par tranche. Ensuite, cliquez sur OK.</li>
	<li>Sélectionnez toutes les valeurs de la fenêtre Résultats et copiez-les dans une application de feuille de calcul pour une analyse plus approfondie. REMARQUE: Si la position de l’organoïde s’est déplacée pendant l’imagerie en time-lapse, le retour sur investissement doit être ajusté en conséquence. Pour ce faire, sélectionnez le bon retour sur investissement dans le gestionnaire du roi d’investissement et déplacez-le à la nouvelle position. Cliquez ensuite sur mise à jour dans le gestionnaire du retour sur investissement. Effectuez la mesure pour chaque point de temps individuellement en cliquant sur Mesure dans le gestionnaire de retour sur investissement, puis passez au point d’heure suivant dans la fenêtre d’image à l’aide de la barre sur le fond. Recueillir toutes les mesures dans une feuille de calcul. La forme individuelle et le mouvement des organoïdes pendant la période d’imagerie nécessitent l’analyse des données d’une manière manuelle.</li>
	<li>Calculez la valeur d’intensité moyenne des trois OID à l’extérieur de l’organoïde pour chaque point de temps.</li>
	<li>Divisez l’intensité du retour sur investissement à l’intérieur du lumen de l’organoïde par l’intensité moyenne du retour sur investissement à l’extérieur et par l’intensité moyenne à l’intérieur de l’organoïde.</li>
	<li>Afin de calculer l’augmentation relative de la fluorescence organoïde luminale, divisez la fluorescence relative (voir étape 3.11) à chaque point de temps illustré par la fluorescence relative minimale. REMARQUE: Utilisez la fluorescence relative minimale, parce que parfois la diffusion du fluorophore peut être lente au début de l’expérience.</li>
</ol>

<ol>
	<li>L&#243;pez-Posadas, R., St&#252;rzl, M., Atreya, I., Neurath, M. F., Britzen-Laurent, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interplay+of+GTPases+and+Cytoskeleton+in+Cellular+Barrier+Defects+during+Gut+Inflammation.">Interplay of GTPases and Cytoskeleton in Cellular Barrier Defects during Gut Inflammation.</a> Frontiers in Immunology. 8, 1240 (2017).</li><li>Zhang, Y. Z., Li, Y. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Inflammatory+bowel+disease:+pathogenesis.">Inflammatory bowel disease: pathogenesis.</a> World Journal of Gastroenterology. 20 (1), 91-99 (2014).</li><li>Sato, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Single+Lgr5+stem+cells+build+crypt-villus+structures+in+vitro+without+a+mesenchymal+niche.">Single Lgr5 stem cells build crypt-villus structures in vitro without a mesenchymal niche.</a> Nature. 459 (7244), 262-265 (2009).</li><li>Leslie, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Persistence+and+toxin+production+by+Clostridium+difficile+within+human+intestinal+organoids+result+in+disruption+of+epithelial+paracellular+barrier+function.">Persistence and toxin production by Clostridium difficile within human intestinal organoids result in disruption of epithelial paracellular barrier function.</a> Infection and Immunity. 83 (1), 138-145 (2015).</li><li>Zietek, T., Rath, E., Haller, D., Daniel, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intestinal+organoids+for+assessing+nutrient+transport,+sensing+and+incretin+secretion.">Intestinal organoids for assessing nutrient transport, sensing and incretin secretion.</a> Scientific Reports. 5 (1), 16831 (2015).</li><li>Pearce, S. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Marked+differences+in+tight+junction+composition+and+macromolecular+permeability+among+different+intestinal+cell+types.">Marked differences in tight junction composition and macromolecular permeability among different intestinal cell types.</a> BMC Biology. 16 (1), 19 (2018).</li><li>Hill, D. R., Huang, S., Tsai, Y. H., Spence, J. R., Young, V. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Real-time+Measurement+of+Epithelial+Barrier+Permeability+in+Human+Intestinal+Organoids.">Real-time Measurement of Epithelial Barrier Permeability in Human Intestinal Organoids.</a> Journal of Visualized Experiments. (130), e56960 (2017).</li><li>Bardenbacher, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Permeability+analyses+and+three+dimensional+imaging+of+interferon+gamma-induced+barrier+disintegration+in+intestinal+organoids.">Permeability analyses and three dimensional imaging of interferon gamma-induced barrier disintegration in intestinal organoids.</a> Stem Cell Research. 35, 101383 (2019).</li><li>Tomita, M., Hotta, Y., Ohkubo, R., Awazu, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Polarized+transport+was+observed+not+in+hydrophilic+compounds+but+in+dextran+in+Caco-2+cell+monolayers.">Polarized transport was observed not in hydrophilic compounds but in dextran in Caco-2 cell monolayers.</a> Biological and Pharmaceutical Bulletin. 22 (3), 330-331 (1999).</li><li>Turner, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intestinal+mucosal+barrier+function+in+health+and+disease.">Intestinal mucosal barrier function in health and disease.</a> Nature Reviews: Immunology. 9 (11), 799-809 (2009).</li></ol>

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

Cet essai offre une technique pour étudier l’intégrité de barrière intestinale dans les organoïdes vivants. L’analyse entière est basée sur de petits organoïdes intestinaux de souris et la microscopie confocale de cellules vivantes. Par conséquent, il est obligatoire de pratiquer la bonne manipulation des organoïdes à l’avance. Sur l’isolement, les organoïdes peuvent être systématiquement divisés et stockés par cryogelant3,9. Pour cet essai, nous recommandons de diviser les organoïdes 48 h avant le début du traitement. Cette période donne aux organoïdes la chance de se refermée et de former des structures sphériques. L’ensemencement des organoïdes pour l’expérience est une étape critique dans l’essai. Pour réduire les variations de manipulation individuelles, nous recommandons une procédure de routine pour le processus d’ensemencement. Cette étape est cruciale, et un protocole de manipulation de routine réduit clairement les variations expérimentales.
Pendant la procédure d’ensemencement (étape 1.7), les organoïdes se fragmentent par un passage répétitif à travers une pointe standard de pipette de 10 L. La taille des pores de ce produit varie d’une entreprise à l’autre. Cette procédure doit être pratiquée à l’avance, et le résultat doit toujours être vérifié par microscopie de contraste de phase. Une fois que les organoïdes obtenus atteignent la taille désirée, ne modifiez pas la procédure.
L’ensemencement des organoïdes doit être optimisé et adapté pour la configuration microscopique disponible. Pour être en mesure de la culture et l’image organoïdes pour au moins 48 h, une chambre de microscope incubée est absolument nécessaire. Choisissez un coverlip chambré qui correspond à vos exigences. Lors de l’ensemencement des organoïdes, assurez-vous de concentrer les organoïdes sur la surface de coverlip. Ceci est possible en gardant le coverlip chambré sur une banquise pendant 5 min après avoir placé la suspension matrice-organoïde de cellule. Cette étape est importante pour améliorer la qualité de l’imagerie confocale des cellules vivantes. La résolution axiale et la distance de travail des lentilles de microscope confocal est particulièrement limitée. Plus vous rapprochez de l’échantillon vers l’objectif, mieux vous pouvez l’image et moins l’énergie laser est nécessaire pour exciter la fluorescence LY.
La phototaxie est un problème important quand il s’agit de microscopie cellulaire vivante. Dans cet essai, nous excluons cette option. Un AJC fonctionnel est visible par l’exclusion de LY du lumen de l’organoïde(figure 1, PBS). L’ajout d’EGTA à la fin de l’expérience provoque la séquestration des ions bivalents, qui sont des cofacteurs pour les protéines AJC. LY est exclu du lumen de l’organoïde seulement dans les organoïdes vitaux avec un complexe fonctionnel d’AJC. En général, les molécules fluorescentes peuvent être utilisées pour mesurer l’intégrité de la barrière intestinale. Nous avons choisi LY au lieu d’autres fluorophores couramment utilisés tels que la fluoresceine étiquetée dextran parce que ceux-ci sont transportés transcellulairement dans les cellules intestinales du basal au compartiment apical9. Nous avons également choisi LY en raison de sa petite taille. LY a un poids moléculaire de 457 Da et facilite donc l’étude de la perméabilité barrière pour les petites molécules. La molécule fluorescente doit être choisie en fonction de la question scientifique étudiée. Étant donné que les défauts de l’AJC phototoxique sont présents, l’énergie d’excitation au laser doit être réduite ou l’intervalle d’imagerie prolongé. La technique d’imagerie confocale optimale pour cet essai est la microscopie par disque de rotation. Les instruments respectifs permettent l’imagerie confocale avec un temps d’exposition court à faible puissance laser.
Différents modèles ont déjà été développés pour étudier l’intégrité de barrière intestinale in vitro. Alors que l’utilisation d’essais basés sur des monocouches de ligne cellulaire ou des expériences in vivo sont en baisse, les méthodes à base d’organoïdes augmentent. Contrairement aux méthodes précédemment décrites4,5,6,7, notre méthode permet la quantification de la fonction de barrière au fil du temps. Cela permet l’exposition des organoïdes à des stimuli supplémentaires au cours de l’expérience. Ici, nous appliquons EGTA comme un deuxième stimulus à la fin de l’expérience comme un contrôle positif.
Contrairement à la situation in vivo, dans notre LY d’essai est ajouté dans le milieu et pénètre l’organoïde du côté épithélial basolatéral extérieur vers l’intérieur lumen apical. Le LY est petit et n’est utilisé que pour visualiser l’étanchéité de la barrière intestinale. Les molécules et les stimuli qui modulent la couche épithéliale à la surface apicale doivent être injectés dans le lumen de l’organoïde7. Pour réduire l’effort expérimental et être en mesure de mesurer l’intégrité barrière de nombreux organoïdes en même temps, nous avons choisi d’appliquer le colorant fluorescent de l’extérieur.
Nous avons utilisé l’essai pour étudier la fonction de l’IFN-sur la jonction serrée de petits organoïdes de souris intestinales. Le fait que nous ayons pu analyser l’intégrité de barrière dans les organoïdes vivants offre des possibilités futures d’appliquer cette technique pour décrire les inhibiteurs pour la dégradation inflammation-induite de la barrière intestinale. Les substances qui contrecarrent la fonction altérée de barrière causée par l’IFN-MD pourraient être des candidats pour le traitement des maladies inflammatoires de l’intestin, dans lesquelles la fonction altérée de barrière est l’un des facteurs pathogènes10.

L’intégrité de la barrière épithéliale est maintenue par le complexe de jonction apical (AJC), qui se composent de jonction serrée (TJ) et de jonction d’adhérence (AJ) protéines1. La structure polarisée de l’AJC est cruciale pour sa fonction in vivo. La dysrégulation de l’AJC est présente dans diverses maladies et est soupçonnée d’être un déclencheur important de la pathogénie inflammatoire de l’intestin. La perte de la fonction de barrière intestinale représente l’événement initiatique de la maladie. La translocation suivante des bactéries commensales et des réponses inflammatoires sont les conséquences douloureuses2.
Divers modèles in vitro et in vivo ont été développés pour étudier la réglementation de l’AJC. L’essai Transwell est basé sur des monocounts cellulaires bidimensionnels (2D) qui ont été dérivés de lignées cellulaires tumorales. Ces systèmes sont bons à évaluer par des méthodes optiques et biochimiques et permettent l’analyse de nombreux échantillons en même temps, mais manquent de nombreuses caractéristiques des cellules primaires et les processus de différenciation présents in vivo. Il est également possible d’étudier l’intégrité de la barrière dans les modèles animaux. Dans les expériences terminales, les effets de traitements spécifiques in vivo sur la perméabilité de l’intestin entier peuvent être quantifiés. Cependant, ces modèles nécessitent un grand nombre d’animaux, et ils ne permettent pas une visualisation détaillée des processus moléculaires sous-jacents. De nos jours, des modèles in vitro 3D améliorés sont disponibles qui récapitulent étroitement les processus de différenciation cellulaire, la polarisation cellulaire, et représentent la structure crypt-villus de l’intestin3. L’application d’organoïdes intestinaux 3D pour des analyses fonctionnelles nécessite l’adaptation des méthodes disponibles à partir de modèles 2D. Ici, nous décrivons un modèle pour étudier l’intégrité de barrière intestinale dans les petits organoïdes intestinaux vivants de souris. L’essai a été établi pour étudier l’effet de l’IFN-sur l’intégrité de barrière et les protéines de jonction serrées respectives8.
Contrairement à la technique appliquée par Leslie4, Zietek5, ou Pearce6, qui mesure la fluorescence après avoir enlevé le jaune lucifer (LY) du milieu, notre approche permet de quantifier l’absorption luminale du fluorophore au fil du temps. Par conséquent, le résultat représente une absorption dynamique cinétique et notre essai permet l’application de stimuli ou d’inhibiteurs supplémentaires au cours de l’expérience. Le fait que les deux essais mesurent l’absorption du côté basolateral extérieur à la surface apicale intérieure est en contraste évident avec la situation in vivo. Dans un modèle décrit par Hill et coll.7, ce sujet a été exploré. Sur microinjection du fluorophore dans le lumen de l’organoïde, la fluorescence a été quantifiée. La direction de la diffusion représente la direction présente in vivo. L’effort technique de microinjection réduit clairement le débit de cette méthode. Contrairement au modèle décrit ici, la méthode de microinjection permet la mesure des effets qui nécessitent une activation biologique sur la surface épithéliale apicale.
Le modèle d’intégrité de barrière organoïde présenté ici est basé sur la microscopie cellulaire vivante et permet l’analyse des changements dynamiques dans le règlement de l’AJC au fil du temps. La configuration peut être appliquée pour tester l’impact pharmacologique des substances induisant et inhibant l’intégrité de la barrière intestinale. En outre, les modèles à base d’organoïdes aident à réduire le nombre d’animaux utilisés pour les études pharmacologiques.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>48-well culture plate</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>#150687</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>8-well chamber slides</td>
			<td>Ibidi</td>
			<td>#80826</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96-well culture plate</td>
			<td>Greiner Bio-One</td>
			<td>#655101</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Axio Observer.Z1 - spinning disc</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td></td>
			<td>excitation laser 488 nm / emission filter 525/25</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bovine serum albumin</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>A3059-100G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cell strainer</td>
			<td>Falcon</td>
			<td>352350</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifugation tube 15 ml</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>11507411</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifugation tube 50 ml</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>10788561</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>EDTA</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>431788-25g</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>EGTA</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>431788</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Lucifer Yellow CH dilithium salt</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>L0259</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Matrigel, growth factor reduced, phenol red free</td>
			<td>Corning</td>
			<td>356231</td>
			<td>Cell matrix solution</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Mice</td>
			<td>The Jackson Laboratory</td>
			<td>M. musculus C57/Bl6</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microscope coverslip</td>
			<td></td>
			<td>24x60 mm</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Organoid Growth Medium mouse</td>
			<td>Stemcell Technologies</td>
			<td>#06005</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphate buffered saline</td>
			<td>Biochrom</td>
			<td>L182-05</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Recombinant murine IFN-&#947;</td>
			<td>Biolegend</td>
			<td>Cat#575304</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

investigating intestinal barrier breakdown in living organoids

Les organoïdes et les cultures cellulaires tridimensionnelles (3D) permettent l’étude de mécanismes et de règlements biologiques complexes invitro, ce qui n’était auparavant pas possible dans les monolayers classiques de culture cellulaire. En outre, les cultures de cellules monocouches sont de bons systèmes de modèle in vitro, mais ne représentent pas les processus complexes de différenciation cellulaire et les fonctions qui reposent sur la structure 3D. Cela n’a jusqu’à présent été possible que dans les expériences animales, qui sont laborieuses, longues et difficiles à évaluer par des techniques optiques. Ici, nous décrivons un essai pour déterminer quantitativement l’intégrité de barrière au fil du temps dans la vie de petits organoïdes de souris intestinales. Pour valider notre modèle, nous avons appliqué l’interféron gamma (IFN-MD) comme un contrôle positif pour la destruction des barrières et les organoïdes dérivés du récepteur IFN-2 assommer les souris comme un contrôle négatif. L’essai nous a permis de déterminer l’impact de l’IFN-sur l’intégrité de la barrière intestinale et la dégradation induite par l’IFN des protéines de jonction serrées claudin-2, -7 et -15. Cet essai pourrait également être utilisé pour étudier l’impact des composés chimiques, des protéines, des toxines, des bactéries ou des sondes dérivées du patient sur l’intégrité de la barrière intestinale.

Pour valider l’application de petits organoïdes de souris intestinales 3D comme modèle pour quantifier l’effet des composés régulant l’intégrité de barrière intestinale, nous avons appliqué l’IFN-. Pour ce faire, nous avons isolé et cultivé des organoïdes dérivés de type sauvage sensible à l’IFN et des8souris à élimination directe IFN-2, qui ne répondent pas à l’IFN-8 . Lors d’un traitement de 48 h avec IFN-ou PBS (contrôle), tous les organoïdes ont été exposés à LY et photographiés par la microscopie de cellules vivantes de disque de rotation confocale dans des intervalles de 5 min pendant une période de 70 min. L’intégrité fonctionnelle de la barrière intestinale dans ce modèle a eu comme conséquence l’exclusion de LY du lumen de l’organoïde tandis que l’accumulation intraluminale de LY a signifié la destruction du TJ. Les images microscopiques représentatives de fluorescence après 70 min d’incubation avec LY démontrent clairement que la fluorescence intraluminale de LY n’était visible que chez les organoïdes d’animaux sauvages traités avec l’IFN-. Dans les contrôles non formulés (PBS) ni dans les organoïdes dérivés des animaux assommants (IFN-R2- 'IEC, figure 1), aucune fluorescence intraluminale de LY n’était présente après 70 min.
L’ajout d’EGTA provoque une dégradation non spécifique de l’intégrité de la barrière intestinale en séquestrant les cofacteurs de TJ. Ce contrôle a toujours été utilisé à la fin de l’expérience pour démontrer la capacité de l’organoïde respectif à prendre LY (figure 1). Si aucune fluorescence intraluminale de LY n’a été détectée sur le traitement d’EGTA, l’organoïde a été exclu de l’expérience.
Pour l’évaluation quantitative des résultats microscopiques, la fluorescence de LY a été mesurée dans le lumen de l’organoïde et à l’extérieur de l’organoïde. Les valeurs d’intensité relative ont été calculées (fluorescence à l’intérieur/fluorescence à l’extérieur et à l’intérieur) et sont affichées pour chaque point de temps illustré. Il est recommandé d’éviter l’imagerie des organoïdes de différentes tailles. Nous avons choisi de nous concentrer sur les organoïdes d’un diamètre de 80 à 30 m(figure 2). Un schéma du protocole avec des images représentatives est montré dans la figure 3. Certains problèmes majeurs et les techniques de dépannage sont montrés et discutés à la figure 4.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60546/60546fig01.jpg"> Figure 1 : L’intégrité de la barrière intestinale peut être analysée chez les organoïdes de souris. Les organoïdes intestinaux de l’IFN-R2WT et de l’IFN-R2-IEC ont été cultivés en présence de l’IFN-Ô pour 48 h ou laissés non traités. Pour étudier l’intégrité de la barrière intestinale, LY (457 Da) a été ajouté et des images fluorescentes confocales ont été capturées dans des intervalles de 5 minutes pour un total de 70 min. Images représentatives au point de temps 0 min, 70 min, et après l’ajout de l’EGTA sont montrés (vert - Jaune Lucifer; Barre d’échelle de 20 m). Ce chiffre a été modifié à partir de Bardenbacher et al.8. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60546/60546fig01large.jpg" target="_blank">S’il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60546/60546fig02.jpg"> Figure 2 : Le petit modèle intestinal d’intégrité de barrière organoïde fournit des résultats quantitatifs. (A) La fluorescence a été déterminée à l’intérieur et à l’extérieur de l’organoïde. Les valeurs d’intensité relative ont été calculées (à l’intérieur/fluorescence à l’extérieur et à l’intérieur) par rapport à l’intensité relative initiale et SEM et sont indiquées pour chaque point de temps. (B) Répartition de taille des organoïdes analysés. Pour réduire l’écart standard et les erreurs dues aux changements dans le rapport surface-volume, nous n’avons analysé les organoïdes qu’avec un diamètre de 80 à 30 m. Les valeurs moyennes des diamètres organoïdes respectifs sont montrées - SD (IFN-R2WT, n - 20; IFN-R2-IEC, n . Les valeurs moyennes de diamètre ne différaient pas significativement entre les différents groupes (ANOVA à sens unique). (C) La perméabilité des organoïdes a été déterminée 70 min après l’ajout de LY. Il a été défini en divisant les intensités intraluminales de fluorescence après 70 min par les intensités relatives minimales de fluorescence mesurées pendant la période d’observation. Chaque barre représente des valeurs moyennes et SD, mesurées en 10 organoïdes dérivés de deux expériences indépendantes (IFN-R2WT, n ' 20; IFN-R2-IEC, n . L’IFN-MD n’a considérablement augmenté l’absorption d’LY que dans les organoïdesWT IFN-R2. p-value 'lt;0.001 dans le t-test de l’étudiant. Ce chiffre a été modifié à partir de Bardenbacher et al.8. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60546/60546fig02large.jpg" target="_blank">S’il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60546/60546fig03.jpg"> Figure 3 : Protocole schématique avec images représentatives. (A) Description schématique des principales étapes du protocole. (B) Images représentatives des principales étapes du protocole. (B1) Image de microscopie DIC d’une tranche centrale par un organoïde approprié qui a été choisi pour l’analyse de perméabilité. La ligne pointillée représente une largeur de 89 m . (B2) Image de microscopie de fluorescence du même organoïde dans (B1) avant d’ajouter LY. L’image montre l’autofluorescence de l’organoïde. (B3) Un organoïde 70 min après l’ajout de LY. L’organoïde représenté ne montre aucune absorption de LY et donc une fonction de barrière intacte. Les lignes pointillées montrent les ROIs pour une analyse plus approfondie. Les lumen intérieurs de l’organoïde et trois zones représentatives autour de l’organoïde sont marqués. (B4) Un organoïde après l’ajout de l’EGTA. L’organoïde est utilisable pour une analyse plus approfondie, car il montre l’absorption LY après le traitement EGTA. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60546/60546fig03large.jpg" target="_blank">S’il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60546/60546fig04.jpg"> Figure 4 : Dépannage de problèmes courants. (A) Table avec des problèmes et des solutions communs. (B) Images exemplaires. (B1) Image DIC d’un grand organoïde multibranché qui n’est pas adapté à cet essai. (B2). L’image confocale d’un organoïde affichant l’autofluorescence élevée avant que LY ait été ajoutée au milieu. L’organoïde a été exclu de la quantification. (B3) L’image confocale d’un organoïde affichant l’autofluorescence basse avant LY a été ajoutée au milieu. La fluorescence a été quantifiée dans ce cas. (B4) Organoïde ne montrant aucune absorption de LY du milieu 30 min après ajout de l’EGTA et donc exclu de la quantification. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60546/60546fig04large.jpg" target="_blank">S’il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.</a>

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Investigating Intestinal Barrier Breakdown in Living Organoids

Ici, nous décrivons une technique pour quantifier l’intégrité barrière des petits organoïdes intestinaux. Le fait que la méthode est basée sur des organoïdes vivants permet l’étude séquentielle de différentes substances modulant l’intégrité de barrière ou des combinaisons de celui-ci d’une manière résolue dans le temps.

Enquêter sur la dégradation des barrières intestinales chez les organoïdes vivants

Organoids and three-dimensional (3D) cell cultures allow the investigation of complex biological mechanisms and regulations in vitro, which previously was ...

Dans le but d’étudier l’intégrité intestinale de barrière, nous avons développé une méthode pour mesurer l’intégrité intestinale de barrière dans de petits organoïdes intestinaux de souris. En revanche, nous nous référons à la culture cellulaire monocouche utilisée, notre analyse est basée sur de petits organoïdes intestinaux tridimensionnels. L’adaptation d’un essai bidimensionnel à notre modèle était essentielle à sa praticité.L’analyse est basée sur des organoïdes cultivés in vitro et son application aidera à définir les inducteurs et les inhibiteurs de l’intégrité de la barrière intestinale. La régulation des protéines de jonction serrées est une caractéristique importante de toutes les cellules épithéliales. Notre analyse permet la fonction et l’analyse de l’intégrité épithéliale de barrière.Pour mesurer l’intégrité de la barrière des organoïdes isolés du tissu intestinal de la souris, préduire d’abord tous les tubes de centrifugation qui seront utilisés pour stocker les organoïdes pendant le processus de placage avec suffisamment de 0,1%BSA en PBS pour couvrir toutes les surfaces en plastique. Retirez immédiatement la solution BSA et placez les tubes sur la glace. Ensuite, décongelez la solution de matrice cellulaire et le milieu de culture organoïde sur la glace et retirez soigneusement le milieu de culture de chaque puits d’une plaque de culture organoïde de 48 puits.Lavez chaque puits avec un millilitre de PBS froid avant de passer vigoureusement pour dissoudre les matrices cellulaires. Lorsque des suspensions cellulaires relativement homogènes ont été obtenues, lavez les organoïdes avec du PBS frais deux fois par centrifugation et réutilisez chaque culture organoïde dans 40 microlitres de milieu froid. Dissocier les grandes structures organoïdes à l’aide d’une pointe de pipette de 10 microlitres cinq fois pour recueillir des structures d’une taille de 40 à 60 micromètres et mélanger chaque suspension organoïde avec 40 microlitres de solution matricielle cellulaire fraîchement préparée.Ajouter chaque suspension de solution de matrice de cellules organoïdes au centre des puits individuels d’un coverslip de huit puits chambés et placer la glissière sur un sac de glace pendant cinq minutes. À la fin de l’incubation, placez la glissade à 37 degrés Celsius et 5 % de dioxyde de carbone pendant 20 minutes pour permettre la polymérisation de la structure de la matrice des cellules organoïdes avant d’ajouter 150 microlitres de culture organoïde moyenne à chaque puits pendant une incubation de 24 heures dans l’incubateur de culture cellulaire. À la fin de l’incubation, traiter les puits de contrôle positifs avec 10 nanogrammes par millilitre d’interféron murinant recombinant gamma pendant 48 heures.Pour effectuer un test de perméabilité, transférez le coverslip chambré à la chambre d’incubation réchauffée de 37 degrés Celsius d’un microscope confocal inversé et réglez le dioxyde de carbone de la chambre à 5 %Verrouillez le coverslip étroitement sur l’étape du microscope et ajustez les paramètres d’imagerie du microscope pour visualiser les organoïdes dans un puits de la chambre. Ensuite, ajoutez trois microlitres de lucifer jaune Lucifer fraîchement préparé 100 millimlaires dans 150 microlitres de moyen à un puits pendant une heure d’incubation dans la chambre de microscope. À la fin de l’incubation, ajuster l’accent pour visualiser le lumen de l’organoïde de référence et définir l’énergie laser requise pour l’excitation jaune Lucifer et la sensibilité de détection respective de l’instrument pour imager le signal jaune Lucifer à 30 à 40% de la plage dynamique disponible de l’instrument.Alternativement, l’intensité du signal peut être modifiée en changeant le temps d’exposition. Pour trouver les positions d’environ 10 organoïdes avec une structure sphérique près de la surface de coverslip par puits par interférence différentielle contrastent l’imagerie vivante, capturant des organoïdes avec des diamètres comparables et se concentrant sur la tranche centrale des organoïdes pour imager les lumens. Enregistrez le contraste différentiel d’interférence et la fluorescence jaune Lucifer de chaque position pour documenter la forme et l’auto fluorescence de chaque organoïde.Lorsque tous les organoïdes ont été photographiés, ajouter 150 microlitres de milieu, y compris le jaune Lucifer, aux puits de traitement jaune Lucifer et l’image de tous les puits toutes les cinq minutes pendant 70 minutes. À la fin de la séance d’imagerie, ajouter quatre microlitres d’EGTA fraîchement préparés à 100 microlitres de milieu. Ajouter l’EGTA dilué aux puits appropriés.Ensuite, enregistrez la fluorescence des organoïdes dans chaque puits toutes les cinq minutes pendant 30 minutes. Assurez-vous de pratiquer la manipulation et la culture ou organoïdes à l’avance que la viabilité cellulaire et l’intégrité sont une condition préalable pour le succès de l’essai. Dans cette expérience représentative, après 70 minutes de traitement avec lucifer jaune intraluminal Lucifer fluorescence jaune n’était visible que chez les organoïdes des animaux sauvages traités avec l’interféron gamma.Ni les contrôles non simulés, ni les organoïdes dérivés des animaux de knock-out de récepteur gamma d’interféron-2 n’ont montré la fluorescence jaune intraluminale de Lucifer à la fin de la période de traitement. L’ajout de l’EGTA a causé une dégradation non spécifique de l’intégrité de la barrière intestinale en séquestrant les co-facteurs serrés de jonction, ayant pour résultat la prise et l’expression jaunes de Lucifer dans tous les organoïdes indépendamment de l’origine ou des conditions de traitement. Les valeurs d’intensité relative pour le niveau de fluorescence jaune de Lucifer dans le lumen organoïde et à l’extérieur de chaque organoïde peuvent également être quantifiées.Assurez-vous de sélectionner des organoïdes avec une taille comparable autour de la configuration et de sélectionner l’axe défini afin que vous puissiez imaginer le lumen central de l’organoïde. En plus d’utiliser des substances induisant la dégradation de la barrière intestinale, nous pouvons également étudier des stratégies pour l’inhibition de la destruction des barrières intestinales. Comme cette méthodologie est basée sur les cellules primaires d’un seul animal, elle peut être utilisée pour de nombreux tests, ce qui réduit le nombre d’animaux nécessaires à chaque expérience.

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