Name: mass spectrometry-guided genome mining as a tool to uncover novel natural products
Uploaded: 2020-03-12T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products at JoVE.com

Финансовая поддержка этого исследования была оказана Сан-Паулу исследовательский фонд - FAPESP (2019/10564-5, 2014/12727-5 и 2014/50249-8 до L.G.O; 2013/12598-8 и 2015/01013-4 до R.S.; и 2019/08853-9 до C.F.F.A). B.S.P., C.F.F.A. и L.G.O. получили стипендии от Национального совета по научно-техническому развитию - CNPq (205729/2018-5, 162191/2015-4 и 313492/2017-4). L.G.O. также благодарна за грантовую поддержку, предоставленную программой для женщин в науке (2008, Бразильское издание). Все авторы признают CAPES (Координация по улучшению высшего образования персонала) для поддержки после окончания программы в Бразилии.

1. Добыча генома для биосинтетических генных кластеров
<ol><li>Выполните секвенирование всего генома (WGS) в качестве первого шага к выбору биосинтетического генного кластера (BCG) для добычи генома с гидом MS. Весь проект генома штамма интерес (бактерии) могут быть получены с помощью illumina MiSeq ?...

Самым сильным преимуществом этого протокола является его способность быстро дереплицировать метаболические профили и мост геномной информации с MS данных для того, чтобы выяснить структуры новых молекул, особенно структурные аналоги2. На основе геномной информации можно ...

Исследования вторичного метаболизма часто состоят из скрининга сырых экстрактов для конкретных биологических видов деятельности с последующим очищением, идентификацией и характеристикой составляющих, принадлежащих к активным фракциям. Этот процесс оказался эффективным, способствуя изоляции нескольких химических организаций. Тем не менее, в настоящее время это рассматривается как неосуществимый, в основном из-за высоких темпов повторного открытия. Поскольку фармацевтическая промышленность произвела революцию, не зная о роли и функциях специализированных метаболитов, их идентификация проводилась в лабораторных условиях, которые не точно представляли природу1. Сегодня лучше понять естественные сигнальные влияния, секрецию и наличие большинства целей при неопределимо низких концентрациях. Кроме того, регулирование этого процесса поможет академическому сообществу и фармацевтической промышленности воспользоваться этими знаниями. Это также пойдет на пользу исследованиям, связанным с прямой изоляцией метаболитов, связанных с молчаливыми биосинтетическими генными кластерами (BGCs)2.
В этом контексте прогресс в области геномного секвенирования возродил интерес к скринингу метаболитов микроорганизмов. Это связано с тем, что анализ геномной информации нераскрытых биосинтетических кластеров может выявить гены, кодирующих новые соединения, не соблюдаемые и не производимые в лабораторных условиях. Многие микробные проекты всего генома или проекты доступны сегодня, и их число растет с каждым годом, обеспечивая огромные перспективы для раскрытия новых биологически активных молекул через геном добычи3,4.
Атлас биосинтетических генных кластеров является текущей крупнейшей коллекцией автоматически добытых генных кластеров в качестве компонента интегрированной платформы микробных геномов Объединенного института генома (JGI IMG-ABC)2. Совсем недавно, Минимальная информация для биосинтетических генных кластеров (MIBiG) Инициатива по стандартизации способствовала ручной реаннотации BGCs, обеспечивая высоко куратором набор справочных данных5. В настоящее время имеется множество инструментов, позволяющих осуществлять вычислительный анализ генетических данных и их связь с известными вторичными метаболитами. Различные стратегии были также разработаны для доступа к новым биологически активным натуральным продуктам (т.е. гетерологическое выражение, удаление целевых генов, восстановление в пробирке, геномная последовательность, изотоп-управляемый скрининг «геномисотемный подход», манипуляции с местными и глобальными регуляторами, добыча на основе сопротивления, культурная независимая добыча полезных ископаемых, и, в последнее время, MS-руководство/код подходы2,6,9,9,9, , 10,11,,12,,13,,14,,15).
Добыча генома как особая стратегия требует усилий по аннотатам одной или небольшой группы молекул; таким образом, сохраняются пробелы в этом процессе, в которых новые соединения отдают приоритет изоляции и разослать структуру. В принципе, эти подходы нацелены только на один биосинтетический путь в эксперимент, что приводит к медленному показателю открытия. В этом смысле использование Gm наряду с молекулярным подходом сетей представляет собой важный шаг для исследования природного продукта14,15.
Универсальность, точность и высокая чувствительность жидкой хроматографии-масс-спектрометрии (LC-MS) делают его хорошим методом для комплексной идентификации. В настоящее время несколько платформ инвестировали алгоритмы и пакеты программного обеспечения для нецелевых метаболомики16,,17,,18,,19,,20. Ядро этих программ включает в себя обнаружение функций (пиковый сбор)21 и пиковое выравнивание, что позволяет совпадать с идентичными функциями по пакету образцов и поиску шаблонов. MS шаблон на основе алгоритмов22,23 сравнить характерные модели фрагментации и матч MS2 сходства генерации молекулярных семейств обмена структурными особенностями. Эти функции могут быть выделены и сгруппированы, предоставляя возможность быстро обнаружить известные и неизвестные молекулы из сложного биологического экстракта тандемом MS2,24,25. Таким образом, тандем MS является универсальным методом получения структурной информации о нескольких хемотипов, содержащихся в большом объеме данных одновременно.
Алгоритм Глобальной естественной молекулярной сети (GNPS)26 использует нормализованную интенсивность ионов фрагментов для построения многомерных векторов, в которых сходства сравниваются с помощью косиновых функций. Взаимосвязь между различными родительскими ионами построена в представлении диаграммы, в котором каждая фрагментация визуализируется как узло (круги), а родственность каждого узла определяется краем (линиями). Глобальная визуализация молекул из одного источника определяется как молекулярная сеть. Структурно расходящиеся молекулы, которые фрагментируют однозначно, образуют свое собственное конкретное скопление или созвездие, в то время как связанные молекулы сгруппируются вместе. Кластеризация хемотипов позволяет гипотетическое соединение аналогичных структурных особенностей с их биосинтетическим происхождением.
Сочетание как хемотипа к генотипу, так и подходов к генотипу к хемотипу является мощным при создании биоинформатичных связей между BGCs и их небольшими молекулярными продуктами27. Таким образом, добыча генома с MS-наведением является быстрым методом и низкой потребляющей материал стратегией, и она помогает преодолеть родительские ионы и биосинтетические пути, выявленные WGS одного или нескольких штаммов в различных метаболических и экологических условиях.
Рабочий процесс этого протокола(рисунок 1) состоит из подачи данных WGS в биосинтетическую платформу аннотации генного кластера, такую как antiSMASH28,,29,30. Это помогает оценить разнообразие соединений и класс соединений, кодируется геномом. Стратегия для целевой биосинтетического генного кластера кодирования химической сущности, представляющие интерес, должны быть приняты, и культура экстракты из штамма дикого типа и / или гетерологовой штамм, содержащий BGC могут быть проанализированы для создания кластерных ионов на основе сходства с помощью GNPS26,31. Следовательно, можно определить новые молекулы, которые ассоциируются с целевым BGC и недоступны в базе данных (в основном неизвестные аналоги, иногда производимые в низких титрах). Уместно учитывать, что пользователи могут вносить свой вклад в эти платформы и что доступность биоинформатики и данных MS/MS быстро растет, что ведет к постоянному развитию и модернизации эффективных вычислительных инструментов и алгоритмов для руководства эффективными соединениями сложных экстрактов с молекулами.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60825/60825fig1b.jpg"> Рисунок 1: Обзор всего рабочего процесса. Показано иллюстрация биоинформатических, клонирующих и молекулярных сетей, участвующих в описанном подходе к добыче генома с гидом MS для выявления новых метаболитов. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60825/60825fig1blarge.jpg" target="_blank">Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.</a>
Этот протокол описывает быстрый и эффективный рабочий процесс для объединения добычи генома и молекулярных сетей в качестве отправной точки для конвейера по открытию природных продуктов. Хотя многие приложения способны визуализировать состав и родственность MS-обнаруживаемых молекул в одной сети, некоторые из них приняты здесь, чтобы визуализировать структурно похожие кластерные молекулы. Используя эту стратегию, успешно идентифицируются новые циклодепсипептидные продукты, наблюдаемые в метаболических экстрактах streptomyces sp. CBMAI 2042. Руководствуясь добычей генома, весь биосинтетический ген кластер, кодируя для валиномицинов, распознается и клонируется в штамм производителя Streptomyces coelicolor M1146. Наконец, после MS шаблон на основе молекулярной сети, молекулы, обнаруженные MS коррелируют с BGCs ответственность за их биогенеза32.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Acetonitrile</td>
			<td>Tedia</td>
			<td>AA1120-048</td>
			<td>HPLC grade</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agar</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>LP0011</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Apramycin</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>A2024</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Carbenicillin</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>C9231</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifuge</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>NA</td>
			<td>5804</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chloramphenicol</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>C3175</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Column C18</td>
			<td>Agilent Technologies</td>
			<td>NA</td>
			<td>ZORBAX RRHD Extend-C18, 80&#197;, 2.1 x 50 mm, 1.8 &#181;m, 1200 bar pressure limit P/N 757700-902</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Kanamycin</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>K1377</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Manitol P.A.- A.C.S.</td>
			<td>Synth</td>
			<td>NA</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microcentrifuge</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>NA</td>
			<td>5418</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nalidixic acid</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>N4382</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phusion Flash High-Fidelity PCR Master Mix</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>F548S</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Q-TOF mass spectrometer</td>
			<td>Agilent technologies</td>
			<td>NA</td>
			<td>6550 iFunnel Q-TOF LC/MS</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sacarose P.A.- A.C.S.</td>
			<td>Synth</td>
			<td>NA</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Shaker/Incubator</td>
			<td>Marconi</td>
			<td>MA420</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Chloride</td>
			<td>Synth</td>
			<td>NA</td>
			<td>P. A. - ACS</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Soy extract</td>
			<td>NA</td>
			<td>NA</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sucrose</td>
			<td>Synth</td>
			<td>NA</td>
			<td>P. A. - ACS</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thermal Cycles</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>NA</td>
			<td>Mastercycler Nexus Gradient</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thiostrepton</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>T8902</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tryptone</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>LP0042</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tryptone Soy Broth</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>CM0129</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>UPLC</td>
			<td>Agilent Technologies</td>
			<td>NA</td>
			<td>1290 Infinity LC System</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Yeast extract</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>LP0021</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

mass spectrometry-guided genome mining as a tool to uncover novel natural products

Химическое пространство, покрытое натуральными продуктами, огромно и широко не признано. Поэтому необходимы удобные методологии для проведения широкомасштабной оценки их функций в природе и потенциальных благ человека (например, для применения лекарственных средств). Этот протокол описывает сочетание добычи генома (ГМ) и молекулярных сетей (MN), двух современных подходов, которые соответствуют генно-кодированным аннотациям во секвенировании всего генома с химическими сигнатурами структуры из грубых метаболических экстрактов. Это первый шаг на пути к открытию новых природных образований. Эти понятия, при применении вместе, определяются здесь как MS-управляемый геном добычи. В этом методе основные компоненты ранее обозначены (с использованием MN), а связанные структурно новые кандидаты связаны с аннотациями последовательности генома (с использованием ГМ). Объединение ГМ и MN является выгодной стратегией для целевой новой молекулы позвоночника или сбора метаболических профилей для того, чтобы определить аналоги из уже известных соединений.

Протокол был успешно иллюстрирован с использованием комбинации добычи генома, гетерологической экспрессии и MS-управляемых/кодовых подходов для доступа к новым специализированным молекулам аналогов валиномицина. Геном-молекулярная рабочая точка для цели, валиномицин (VLM), представле?...

Watch this Scientific Journal Video about Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products at JoVE.com

Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products

Здесь создан и описан протокол добычи генома, направленного масс-спектрометрией. Он основан на информации о последовательности генома и анализе LC-MS/MS и направлен на облегчение идентификации молекул из сложных микробных и растительных экстрактов.

Масс-спектрометрии-управляемый геном добычи в качестве инструмента для выявления новых природных продуктов

The chemical space covered by natural products is immense and widely unrecognized. Therefore, convenient methodologies to perform wide-ranging evaluation ...

Секвенирование всего генома, добыча генома и молекулярные сети составляют основу для руководства по масс-спектрометрии, которое мы описываем здесь. И самый современный подход в открытии натурального продукта. Добыча генома и молекулярные сети совпадают в кластере, в закодированных аннотациях в секвенировании всего генома с химическими подписями реструктуризации из сырых экстрактов, обеспечивающих огромные перспективы для обнаружения пупка активными молекулами.В принципе, добыча генома нацелена на одну или небольшую группу молекул за эксперимент. Таким образом приводящ к в медленном тарифе открытия. В этом смысле использование генома наряду с молекулярными сетями представляет собой важный шаг вперед в исследовании натуральных продуктов.Массовая спектрометрия руководство-геном добычи является универсальным методом, который может структурировать информацию о нескольких химиотипов, содержащихся в большом количестве данных из сырой экстракт одновременно. Сегодня это высокий диапазон методологии, способной исследовать бактериальные, грибковые или растений последовательности предоставления. Химиотип генотипа и генотипа к биоинформатике хемотипа связывает биосинтетические кластеры и являются продуктами малых молекул.Слух протокол продемонстрировано, чтобы охарактеризовать пупка глубины цикла Пептид продукты, наблюдаемые в метаболических экстрактов стрептомице видов. Но это применимо к грибковой и растений последовательности и экстрактов, а также. Очень важно иметь хорошо куратором набора данных генома и в настоящее время фрагментированные последовательности проекта все чаще вытесняются почти готовыми данными последовательности.Кроме того, были разработаны различные стратегии доступа к новым биологически активным натуральным продуктам и, безусловно, их объединения с подходом MS-Guide. Мы поведим к улучшению изоляции натуральных продуктов и структурного выяснения. Поскольку здесь мы соединяем генотип с подходом к хемотипу, биоинформатические связи между биосинтезными кластерами и небольшими молекулами имеют решающее значение.для оценки разнообразия и класса соединений и кодирования генома. Что означает репликацию. Позже кластеризация на основе сходства ионов может быть предварительно формирована с помощью GNPS.Демонстрация процедуры будет д-р Рената Сигрист и профессор Angolini моих сотрудников в этом исследовании. Для получения в силико информации о вторичном метаболизме генные кластеры аннотации из полной последовательности генома. Отправить файл последовательности, банк генов E-M-B-L или более быстрый формат, на платформу против разгрома.Так же, как генные кластеры, представляющие интерес из выходных данных, основанных на наиболее похожих известных кластеров. Основываясь на информации о последовательности ДНК BGC, проектные праймериз от 20 до 25 нуклеотидов, обрамляющих генное скопление для эколи стрептомики. Искусственный скрининг библиотеки хромосом.После получения рекомбинантного гетеролога организма согласно рукописи, привить одну сотую штамма прекультуры в соответствующих средствах брожения. Такие как жидкие средства isP2. Поместите культуру на инкубатор при 30 градусах Цельсия и 220 об/мин, в течение семи дней.После прививки центрифуга культур в 2200 раз G в течение 10 минут. Отбросьте клетки и перенесите супернатант в сепаральную воронку. Добавить один к одному объему этилового ацетата и встряхнуть.Подождите от одной до трех минут для органических и согласился слоев отделить. И собирать органический слой в колбе Эрленмайера. Для получения данных MS/MS.Программа подходящих методов HPLC и масс-спектрометрии с использованием программного обеспечения управления. Следует отметить, что сеть MS/MS является обнаруживаемой молекулярной сетью в данных массовых спектрометрических условиях. Преобразование спектра массы в формат mzXML с помощью MS Convert из мастера protea.Отрегулируйте параметры ввода для преобразования. Загрузите преобразованные файлы LC-MS/MS в базу данных GNPS. Доступны два варианта.Использование протокола передачи файлов или непосредственно в браузере через онлайн-платформу. После создания учетной записи в GNPS войдите в созданную учетную запись и выберите создание молекулярной сети. Добавьте должность.Для выполнения основных опций. Выберите файлы mzXML для выполнения молекулярной сети. Организуйте их в шести группах.Так как библиотеки для деепликации рутины. Выберите толерантность к массе ионов прекурсора и фрагмент Da на массовой толерантности 0.02 Dalton и 0.05 Dalton соответственно. Для выполнения расширенных сетевых опций выберите параметры, которые непосредственно повлияли на размер и форму сетевого кластера.Расширенные параметры находятся в документации GNPS. Выберите адрес электронной почты, чтобы получить оповещение о проделанной работе и отправить задание. Анализ результатов GNPS.Войдите в GNPS. Выберите задания, опубликованные задания, выполненную, чтобы открыть работу. Веб-страница открывается со всеми результатами, полученными из молекулярной сети отображается.Выберите спектральные семьи представлений в визуализации сети браузера, чтобы увидеть все сетевые кластеры. Список отображается со всеми генерируемыми молекулярными сетевыми кластерами. Предварительная молекулярная идентификация отображается во всех удостоверениях личности.Выберите шоу, чтобы визуализировать их. Для анализа молекулярного сетевого кластера выберите визуализировать сеть. В поле меток узла выберите родительская масса.В поле этикетки края, выберите со-знак или Delta Emz. Наблюдать сходство узлов или разницу в массе между узлами соответственно. В случае многогруппового анализа щелкните нарисуйте пироги в поле окраски узла.Наблюдать частоту, с которой каждый узел появляется в каждой группе. Чтобы увидеть все библиотеки, выберите представление, всю библиотеку, хиты. Откройте спектры фрагментации непосредственно на платформе GNPS.Или в оригинальных необработанных файлах вручную подтверждать соединения дереплиции и структуры выяснения связанных соединений. Протокол был успешно проиллюстрирован с использованием сочетания подходов к добыче генома, гетерологом и MS-руководствуясь кодом. Получить доступ к новым специализированным валиномицину и аналоговым молекулам.Геном молекулы рабочего процесса для целевого валиомицина представлен здесь. Хроматограмма показала, что валиномицин, монтанастатин и пять аналогов были произведены валиномицином, экспрессией биосинтетических генных кластеров в гетерологозном хозяине. Молекулярные ионы сетей, соответствующие валиномицину, уже известному соединению с соответствующими биосинтезными генными кластерами, аннотированными в видах стрептомице, CBM AI два нулевых четырех двух генома.Группируются с ионами, связанными с аналогами, во-первых, описаны для валиномицин биосинтетических генных кластеров. Спектры MS и химические структуры для валиомицина и связанных с ним аналогов, показаны здесь. Выполнить секвенирование всего генома и правильное кураторство набора данных является первым шагом к выбору биосинтеического кластера для MS-руководства по добыче генома.Вся процедура может быть выполнена с дикими типами строки сырой экстракт, но вы можете выбрать, чтобы выбрать ген кластера вашего интереса и содействовать гетерологические выражения. Описаны различные методы захвата всего биосинтетического генного кластера из образца ДНК. Самым сильным преимуществом этого протокола является его способность быстро воспроизводить метаболические профили и разводить геномную информацию с данными MS.Для того, чтобы прояснить эти, такие как новые молекулы. И массовое руководство-геном добычи был впервые описан в области пептидной геномики и гликогеномики Дорис Чим и его коллег. А после внедрения НПС интегрированная метаболомика и подход к добыче генома стали наиболее универсальным способом подключения молекулярных сетей с биосинтезными возможностями.

Research

JoVE Journal

Chemistry

Chemical Gardens as Flow-through Reactors Simulating Natural Hydrothermal Systems

Химические сады в Проточный Реакторы, имитирующее естественное гидротермальных систем

Here we report experimental simulations of hydrothermal chimney growth using injection chemical garden methods. The versatility of this type of experiment ...

A Direct, Early Stage Guanidinylation Protocol for the Synthesis of Complex Aminoguanidine-containing Natural Products

Прямой, Ранняя стадия Guanidinylation Протокол для синтеза сложных Аминогуанидин содержащих натуральных продуктов

The guanidine functional group, displayed most prominently in the amino acid arginine, one of the fundamental building blocks of life, is an important ...

Laboratory Production of Biofuels and Biochemicals from a Rapeseed Oil through Catalytic Cracking Conversion

Лаборатория производства биотоплива и биопрепаратов из рапсового масла через каталитического крекинга конверсии

The work is based on a reported study which investigates the processability of canola oil (bio-feed) in the presence of bitumen-derived heavy gas oil ...

NMR Spectroscopy as a Robust Tool for the Rapid Evaluation of the Lipid Profile of Fish Oil Supplements

Спектроскопия ЯМР как надежный инструмент для быстрой оценки липидного профиля рыбьего жира добавки

The western diet is poor in n-3 fatty acids, therefore the consumption of fish oil supplements is recommended to increase the intake of these essential ...

Coulomb Explosion Imaging as a Tool to Distinguish Between Stereoisomers

Кулоновская взрыв изображений как инструмент для различения стереоизомеров

This article shows how the COLTRIMS (Cold Target Recoil Ion Momentum Spectroscopy) or the "reaction microscope" technique can be used to distinguish ...

Electrochemical Impedance Spectroscopy as a Tool for Electrochemical Rate Constant Estimation

Электрохимический импеданс спектроскопия как инструмент для электрохимических скорость постоянной оценки

Electrochemical impedance spectroscopy (EIS) was used for advanced characterization of organic electroactive compounds along with cyclic voltammetry (CV). ...

Color Spot Test As a Presumptive Tool for the Rapid Detection of Synthetic Cathinones

Цветовой тест месте как предполагаемого инструмент для быстрого обнаружения синтетических Cathinones

Synthetic cathinones are a large class of new psychoactive substances (NPS) that are increasingly prevalent in drug seizures made by law enforcement and ...

Novel Techniques for Observing Structural Dynamics of Photoresponsive Liquid Crystals

Новые методы для наблюдения за структурной динамики Photoresponsive жидких кристаллов

We discuss in this article the experimental measurements of the molecules in liquid crystal (LC) phase using the time-resolved infrared (IR) vibrational ...

Employing Pressurized Hot Water Extraction (PHWE) to Explore Natural Products Chemistry in the Undergraduate Laboratory

Employing Pressurized Hot Water Extraction PHWE to Explore Natural Products Chemistry in the Undergraduate Laboratory

Используя мытье под давлением горячей водой (PHWE) для изучения химии натуральных продуктов в бакалавриат лаборатории

A recently developed pressurized hot water extraction (PHWE) method which utilizes an unmodified household espresso machine to facilitate natural products ...

A Two-Step Pyrolysis-Gas Chromatography Method with Mass Spectrometric Detection for Identification of Tattoo Ink Ingredients and Counterfeit Products

Двухступенчатый пиролиза-газ хроматографии метод с масс спектрометрическое обнаружение для идентификации татуировки чернила ингредиенты и контрафактной продукции

Tattoo inks are complex mixtures of ingredients. Each of them possesses different chemical properties which have to be addressed upon chemical analysis. ...