Name: mass spectrometry-guided genome mining as a tool to uncover novel natural products
Uploaded: 2020-03-12T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products at JoVE.com

Det ekonomiska stödet till denna studie tillhandahölls av São Paulo Research Foundation - FAPESP (2019/10564-5, 2014/12727-5 och 2014/50249-8 till L.G.O; 2013/12598-8 och 2015/01013-4 till R.S.; och 2019/08853-9 till C.F.F.A). B.S.P, C.F.F.A., och L.G.O. fick stipendier från Nationella rådet för vetenskaplig och teknisk utveckling - CNPq (205729/2018-5, 162191/2015-4 och 313492/2017-4). L.G.O. är också tacksam för det bidragsstöd som programmet For Women in Science (2008, Brazilian Edition). Alla författare erkänner CAPES (Samordning för förbättring av högre utbildning personal) för att stödja efter examen program i Brasilien.

1. Genombrytning för biosyntetiska genkluster
<ol><li>Utför hela genomsekvensering (WGS) som det första steget för att välja ett biosyntetiskt genkluster (BCG) för MS-guidad genombrytning. Hela genomet utkast av stam av intresse (bakterier) kan erhållas genom Illumina MiSeq teknik med hjälp av följande med hög kvalitet genomisk DNA: hagelgevär TruSeq PCR-Free bibliotek prep och Nextera Mate Pair Library Preparation Kit33. OBS: Efter sekvensering kan Illumina hagelgevärbibliotek oc...

Den starkaste fördelen med detta protokoll är dess förmåga att snabbt dereplikera metaboliska profiler och bro genomisk information med MS-data för att belysa strukturerna hos nya molekyler, särskilt strukturella analoger2. Baserat på genomisk information kan olika naturprodukter undersökas, såsom polyketider (PK), nonribosomala peptider (NRP) och glykoserade naturprodukter (BNP), samt kryptiska BGCs. Metabolomisk screening ger bevis på aktiverade BGC-profiler och kemisk mångfald som pr...

Undersökningar av sekundär metabolism består ofta av screening råextrakt för specifika biologiska aktiviteter följt av rening, identifiering och karakterisering av de beståndsdelar som tillhör aktiva fraktioner. Denna process har visat sig vara effektiv och främjat isolering av flera kemiska enheter. Men numera är detta ses som omöjligt, främst på grund av den höga andelen återupptäckt. Eftersom läkemedelsindustrin revolutionerade utan kunskap om specialiserade metaboliters roller och funktioner utfördes deras identifiering under laboratorieförhållanden som inte korrekt representerade naturen1. Idag finns det en bättre förståelse för naturliga signalering influenser, sekretion, och förekomsten av de flesta mål på omätbart låga koncentrationer. Dessutom kommer reglering av processen att hjälpa den akademiska världen och läkemedelsindustrin att dra nytta av denna kunskap. Det kommer också att gynna forskning som omfattar direkt isolering av metaboliter relaterade till tysta biosyntetiska genkluster (BGCs)2.
I detta sammanhang har framsteg inom genomisk sekvensering förnyat intresset för screening av mikroorganismmetaboliter. Detta beror på att analysera genomisk information av avslöjade biosyntetiska kluster kan avslöja gener kodning nya föreningar som inte observerats eller produceras under laboratorieförhållanden. Många mikrobiella hela genom projekt eller utkast finns idag, och antalet växer varje år, vilket ger stora möjligheter att avslöja nya bioaktiva molekyler genom gruvdrift3,4.
Atlas of Biosynthetic Gene Clusters är den nuvarande största samlingen av automatiskt minerade genkluster som en del av den integrerade mikrobiella genomplattformen vid Joint Genome Institute (JGI IMG-ABC)2. Senast har standardiseringsinitiativet för biosyntetiska genkluster (MIBiG) främjat den manuella reannotationen av BGC, vilket ger en mycket kurerad referensdatauppsättning5. Numera finns det gott om verktyg för att möjliggöra beräkningsbrytning av genetiska data och deras anslutning till kända sekundära metaboliter. Olika strategier har också utvecklats för att få tillgång till nya bioaktiva naturprodukter (dvs. heterologuttryck, målgenborttagning, in vitro-reconstitution, genomisk sekvens, isotopstyrd screening [genomisotopmetoden], manipulering av lokala och globala tillsynsmyndigheter, motståndsbaserad gruvdrift, kulturoberoende gruvdrift och, på senare tid, MS-guidad/kod närmar sig2,6,,7,8,9, 10,11,12,13,14,15).
Genombrytning som en enastående strategi kräver insatser för att kommentera en enda eller liten grupp molekyler; Därmed kvarstår luckor i processen där nya föreningar prioriteras för isolering och strukturklarklarering. I princip, dessa metoder mål endast en biosyntetisk väg per experiment, vilket resulterar i en långsam upptäckt takt. I denna mening, med hjälp av GM tillsammans med en molekylär nätverksstrategi utgör ett viktigt framsteg för naturliga produktforskning14,15.
Mångsidigheten, noggrannheten och den höga känsligheten hos flytande kromatografi-masspektrometri (LC-MS) gör det till en bra metod för sammansatt identifiering. För närvarande har flera plattformar investerat algoritmer och programsviter för oriktade metabolomik16,17,18,19,20. Kärnan i dessa program innehåller funktionsdetektering (toppplockning)21 och toppjustering, vilket gör att matchning av identiska funktioner mellan en grupp prover och sökning efter mönster. MS mönsterbaserade algoritmer22,23 jämföra karakteristiska fragmentering mönster och matcha MS2 likheter som genererar molekylära familjer som delar strukturella funktioner. Dessa funktioner kan sedan markeras och grupperas, vilket ger möjlighet att snabbt upptäcka kända och okända molekyler från ett komplext biologiskt extrakt av tandem MS2,24,25. Tandem MS är därför en mångsidig metod för att få strukturell information av flera chemotypes som finns i en stor mängd data samtidigt.
Algoritmen Global Natural Products Social Molecular Networking (GNPS)26 använder den normaliserade fragmentjonintensiteten för att konstruera flerdimensionella vektorer, där likheter jämförs med hjälp av en cosinfunktion. Förhållandet mellan olika överordnade joner ritas i en diagramrepresentation, där varje fragmentering visualiseras som en nod (cirklar) och relateradheten för varje nod definieras av en kant (linjer). Den globala visualiseringen av molekyler från en enda källa definieras som ett molekylärt nätverk. Strukturellt divergerande molekyler som fragmenterar unikt kommer att bilda sin egen specifika kluster eller konstellation, medan relaterade molekyler kluster tillsammans. Klustring chemotypes möjliggör hypotetisk anslutning av liknande strukturella funktioner till deras biosyntetiska ursprung.
Kombinera både chemotype-to-genotyp och genotyp-till-chemotype metoder är kraftfull när du skapar bioinformatik länkar mellan BGCs och deras små molekylprodukter27. Därför är MS-guidad genombrytning en snabb metod och låg materialförbrukande strategi, och det hjälper bro moderjoner och biosyntetiska vägar avslöjas av WGS av en eller flera stammar under olika metaboliska och miljömässiga förhållanden.
Arbetsflödet för detta protokoll (figur 1) består av att mata WGS-data till en biosyntetisk genklusteranteckningsplattform som antiSMASH28,29,30. Det hjälper till att uppskatta olika föreningar och klass av föreningar kodade av genomet. En strategi för att rikta en biosyntetisk gen kluster kodning en kemisk enhet av intresse måste antas, och kultur extrakt från en vild typ stam och / eller heterolog stam som innehåller BGC kan analyseras för att generera klustrade joner baserat på likheter med GNPS26,31. Följaktligen är det möjligt att identifiera nya molekyler som associerar med den riktade BGC och som inte är tillgängliga i databasen (huvudsakligen okända analoger, ibland producerade i lågtiter). Det är relevant att anse att användarna kan bidra till dessa plattformar och att tillgången till bioinformatik och MS/MS-data ökar snabbt, vilket leder till en ständig utveckling och uppgradering av effektiva beräkningsverktyg och algoritmer för att styra effektiva anslutningar av komplexa extrakt med molekyler.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60825/60825fig1b.jpg"> Bild 1: Översikt över hela arbetsflödet. Visas är en illustration av bioinformatik, kloning och molekylära nätverk steg som deltar i den beskrivna MS-guidad genomgruva strategi för att identifiera nya metaboliter. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60825/60825fig1blarge.jpg" target="_blank">Klicka här för att se en större version av denna siffra.</a>
Detta protokoll beskriver ett snabbt och effektivt arbetsflöde för att kombinera genombrytning och molekylära nätverk som utgångspunkt för den naturliga produktidentifieringspipelinen. Även om många applikationer kan visualisera sammansättningen och släktskapen hos MS-detekterbara molekyler i ett nätverk, antas flera här för att visualisera strukturellt liknande klustrade molekyler. Med hjälp av denna strategi, nya cyclodepsipeptide produkter som observerats i metaboliska extrakt av Streptomyces sp. CBMAI 2042 identifieras framgångsrikt. Guidad av genombrytning, hela biosyntetiska genkluster kodning för valinomycins är erkänd och klonas i producenten stam Streptomyces coelicolor M1146. Slutligen, efter en MS mönster-baserade molekylära nätverk, de molekyler som upptäckts av MS är korrelerade med BGCs ansvarar för deras biogenesis32.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Acetonitrile</td>
			<td>Tedia</td>
			<td>AA1120-048</td>
			<td>HPLC grade</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agar</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>LP0011</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Apramycin</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>A2024</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Carbenicillin</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>C9231</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifuge</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>NA</td>
			<td>5804</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chloramphenicol</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>C3175</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Column C18</td>
			<td>Agilent Technologies</td>
			<td>NA</td>
			<td>ZORBAX RRHD Extend-C18, 80&#197;, 2.1 x 50 mm, 1.8 &#181;m, 1200 bar pressure limit P/N 757700-902</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Kanamycin</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>K1377</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Manitol P.A.- A.C.S.</td>
			<td>Synth</td>
			<td>NA</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microcentrifuge</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>NA</td>
			<td>5418</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nalidixic acid</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>N4382</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phusion Flash High-Fidelity PCR Master Mix</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>F548S</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Q-TOF mass spectrometer</td>
			<td>Agilent technologies</td>
			<td>NA</td>
			<td>6550 iFunnel Q-TOF LC/MS</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sacarose P.A.- A.C.S.</td>
			<td>Synth</td>
			<td>NA</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Shaker/Incubator</td>
			<td>Marconi</td>
			<td>MA420</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Chloride</td>
			<td>Synth</td>
			<td>NA</td>
			<td>P. A. - ACS</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Soy extract</td>
			<td>NA</td>
			<td>NA</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sucrose</td>
			<td>Synth</td>
			<td>NA</td>
			<td>P. A. - ACS</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thermal Cycles</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>NA</td>
			<td>Mastercycler Nexus Gradient</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thiostrepton</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>T8902</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tryptone</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>LP0042</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tryptone Soy Broth</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>CM0129</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>UPLC</td>
			<td>Agilent Technologies</td>
			<td>NA</td>
			<td>1290 Infinity LC System</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Yeast extract</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>LP0021</td>
			<td>NA</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

mass spectrometry-guided genome mining as a tool to uncover novel natural products

Det kemiska utrymme som täcks av naturliga produkter är enorm och allmänt okända. Därför, praktiska metoder för att utföra omfattande utvärdering av deras funktioner i naturen och potentiella mänskliga fördelar (t.ex. för drug discovery applikationer) önskas. Detta protokoll beskriver kombinationen av genombrytning (GM) och molekylära nätverk (MN), två samtida metoder som matchar genklusterkodade anteckningar i hela genomsekvensering med kemisk struktur signaturer från råa metaboliska extrakt. Detta är det första steget mot upptäckten av nya naturliga enheter. Dessa begrepp definieras här som MS-vägledd genombrytning. I den här metoden har huvudkomponenterna tidigare betecknats (med MN) och strukturellt relaterade nya kandidater associeras med genomsekvensanteckningar (med GM). Kombinera GM och MN är en lönsam strategi för att rikta nya molekyl ben eller skörda metaboliska profiler för att identifiera analoger från redan kända föreningar.

Protokollet exemplifierades framgångsrikt med hjälp av en kombination av genombrytning, heterologuttryck och MS-guidad/kod metoder för att få tillgång till nya specialiserade valinomycin analoger molekyler. Genomet-till-molekylarbetsflödet för målet, valinomycin (VLM), representeras i figur 8. Streptomyces sp. CBMAI 2042 utkast genom analyserades i silico, och VLM genklustret identifierades sedan och överfördes till en heterolog värd. Heterologa och vilda typ stammar odla...

Watch this Scientific Journal Video about Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products at JoVE.com

Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products

Här upprättas och beskrivs här ett masspektrometristyrt styrt genombrytningsprotokoll. Den bygger på genomsekvensinformation och LC-MS/MS-analys och syftar till att underlätta identifiering av molekyler från komplexa mikrobiella och växtextrakt.

Mass pektrometri-guidad genombrytning som ett verktyg för att avslöja nya naturliga produkter

The chemical space covered by natural products is immense and widely unrecognized. Therefore, convenient methodologies to perform wide-ranging evaluation ...

Hel genomsekvensering, genombrytning och molekylärt nätverk utgör basen för masspektrometriguiden som genombrytningsprotokollet som vi beskriver här. Och är den mest samtida strategi i naturliga produkt upptäckt. Genombrytning och molekylär nätverk ning matchar i kluster, i kodade anteckningar i hela genomsekvensering med kemiska omstrukturera signaturer från rå extrakt som ger enorma utsikter för att avslöja naveln av aktiva molekyler.I princip riktar genombrytningen mot en enda eller en liten grupp molekyler per experiment. Resulterar därigenom i en långsam upptäcktstakt. I denna mening, med hjälp av genombrytning tillsammans med molekylär nätverk utgör ett viktigt framsteg för naturliga produkter forskning.Masspektrometri guide-genombrytning är en mångsidig metod som kan strukturera information av flera chemotypes som finns i den stora mängden data från ett råextrakt samtidigt. Idag är det hög räckvidd metodik kan utforska bakteriell, svamp eller växter sekvens ger. Chemotype till genotyp och genotyp till chemotype bioinformatik länkar mellan biosyntetiska kluster och är små molekyler produkter.Höra protokollet är visat att karakterisera naveln cykel djup Peptidprodukter observerats i metaboliska extrakt av streptomyces arter. Men det är tillämpligt på svamp och växter sekvens och extrakt också. Det är mycket viktigt att ha fint kurerade genom datauppsättning och numera fragmenterade utkast sekvenser har alltmer ersatts av nära färdiga sekvensdata.Också, olika strategier har utvecklats för att få tillgång till nya bioaktiva naturliga produkter och säkert kombinera dem med MS-Guide strategi. Vi kommer att leda till förbättring av naturliga produkter isolering och struktur klarläggande. Som här vi ansluter genotyp till chemotype strategi, bioinformatik länkar mellan biosyntetiska kluster och det finns små molekylprodukter är avgörande.att uppskatta sort och klass av föreningar och koda genomet. Vilket betyder replikeringen. Senare kan klustring baserat på jonlikheter förformas med hjälp av GNPS.Demonstrera förfarandet kommer att dr Renata Sigrist och professor Angolini mina medarbetare i denna studie. Att erhålla i silico information om sekundära metabolism gen kluster anteckningar från en komplett sekvens genomet. Skicka in sekvensfilen, genbanken E-M-B-L eller snabbare format, till en anti-smash-plattform.Så som genkluster av intresse från utdata baserat på de mest liknande kända klustret. Baserat på DNA-sekvensinformationen i BGC, design primaries mellan 20 till 25 nukleotider som flankerar genklustret för ecoli streptomyces. Artificiell kromosom bibliotek screening.Efter att ha erhållit den rekombinanta heterologa organismen enligt manuskriptet, inokulera en 100: e av stammarna prekultur i lämplig jäsning media. Såsom flytande ISP2-media. Placera kulturen på en inkubator på 30 grader Celsius och 220 RPM, i sju dagar.Efter inympning centrifugerna odlar kulturerna vid 2200 gånger G i 10 minuter. Kasta cellerna och överför supernatanten till en separatortratt. Lägg till en till en volym av etylacetat och skaka.Vänta en till tre minuter för den organiska och samtyst lager för att separera. Och samla det organiska skiktet i en Erlenmeyerkolv. Att förvärva MS/MS-data.Program lämpliga HPLC och masspektrometri metoder med hjälp av styrprogramvaran. Det kommer att noteras att MS/MS-nätverk är det påvisbara molekylära nätverket under de givna masspektrometriska förhållandena. Konvertera massspektra till mzXML-format med hjälp av MS Convert from protea-guiden.Justera indataparametrarna för konverteringen. Ladda upp de konverterade LC-MS/MS-filerna till GNPS-databasen. Två alternativ finns tillgängliga.Med hjälp av ett filöverföringsprotokoll eller direkt i en webbläsare via onlineplattformen. Efter att du har skapat ett konto i GNPS loggar du in på det skapade kontot och väljer skapa ett molekylärt nätverk. Lägg till en jobbtitel.För att utföra grundläggande alternativ. Välj mzXML-filerna för att utföra det molekylära nätverket. Organisera dem i upp till sex grupper.Så som biblioteken för derepliceringsrutinen. Välj föregångaren jonmassa tolerans och fragment Da på massa tolerans av 0,02 Dalton och 0,05 Dalton respektive. Om du vill utföra avancerade nätverksalternativ väljer du de parametrar som direkt påverkade nätverksklusterstorleken och -formuläret.Avancerade parametrar finns i GNPS dokumentation. Välj en e-postadress för att få en avisering när arbetet är klart och skicka jobbet. För att analysera GNPS resultat.Logga in på GNPS. Välj jobb, publicerat jobb, gjort för att öppna ett jobb. En webbsida öppnas med alla resultat som erhållits från molekylära nätverk visas.Välj visa spektralfamiljer i webbläsarnätverk visualizer att se alla nätverk kluster. En lista visas med alla genererade cluster för molekylärt nätverk. Preliminär molekylidentifiering visas i alla ID:ar.Välj visa för att visualisera dem. Om du vill analysera det molekylära nätverksklustret väljer du visualisera nätverk. Välj överordnad massa i rutan nodetiketter.I rutan kantetiketter väljer du co-sign eller Delta Emz. Att observera nodlikhet eller massskillnad mellan noder respektive. Vid analys med flera grupper klickar du på Rita pajer i nodfärgningsrutan.Att observera den frekvens som varje nod visas i varje grupp. Om du vill se alla bibliotek väljer du vy, alla bibliotek, träffar. Öppna fragmenteringsspektra direkt i GNPS-plattformen.Eller i original raw-filer för att manuellt bekräfta dereplicering föreningar och struktur klarering av relaterade föreningar. Protokollet var framgångsrikt exemplifieras med hjälp av en kombination av genomet gruvdrift, heterologt uttryck och MS-guidad kod metoder. För att få tillgång till nya specialiserade Valinomycin och analoga molekyler.Genomet till molekylen arbetsflöde för målet valinomycin presenteras här. Kromatogrammet visade att valinomycin, montanastatin och fem analoger producerades av valinomycin, biosyntetiska gen kluster uttryck i en heterologt värd. Molekylära nätverk joner som motsvarar valinomycin, en redan känd förening med motsvarande biosyntetiska genkluster kommenterade i streptomyces arter, CBM AI två noll fyra två genom.Är klustrade med joner relaterade till analoger, först beskrivs för valinomycin biosyntetiska gen kluster. MS-spektra och kemiska strukturer för valinomycin och relaterade analoger, visas här. Utför hela genomsekvensering och korrekt datauppsättning curating är det första steget för att välja en biosyntetiska kluster för MS-guide genomet gruvdrift.Hela förfarandet kan utföras med de vilda typerna sträng rå extrakt, men du kan välja att välja genkluster av ditt intresse och främja heterologt uttryck. Olika metoder beskrivs för att fånga upp hela det biosyntetiska genklustret från ett DNA-prov. Den starkaste fördelen med detta protokoll är dess förmåga att snabbt replikerar metaboliska profiler och föder upp genomisk information med MS-data.För att klarlägga dessa såsom av nya molekyler. Och massguide-genombrytning beskrevs först inom området peptidgenomik och glykogenomik av Doris Chime och kollegor. Och efter införandet av NPS integrerade metabolomik och genombrytning strategi har blivit den mest mångsidiga avenyn att ansluta molekylära nätverk med biosyntetiska kapacitet.

Research

JoVE Journal

Chemistry

Chemical Gardens as Flow-through Reactors Simulating Natural Hydrothermal Systems

Kemiska Gardens som Flow-through Reaktorer likna den naturliga Hydrotermala Systems

Here we report experimental simulations of hydrothermal chimney growth using injection chemical garden methods. The versatility of this type of experiment ...

A Direct, Early Stage Guanidinylation Protocol for the Synthesis of Complex Aminoguanidine-containing Natural Products

En Direct, Early Stage Guanidinylation protokoll för syntes av komplexa aminoguanidin innehåller naturliga produkter

The guanidine functional group, displayed most prominently in the amino acid arginine, one of the fundamental building blocks of life, is an important ...

Laboratory Production of Biofuels and Biochemicals from a Rapeseed Oil through Catalytic Cracking Conversion

Laboratorium produktionen av biobränslen och biokemikalier från en rapsolja genom katalytisk krackning Conversion

The work is based on a reported study which investigates the processability of canola oil (bio-feed) in the presence of bitumen-derived heavy gas oil ...

NMR Spectroscopy as a Robust Tool for the Rapid Evaluation of the Lipid Profile of Fish Oil Supplements

NMR-spektroskopi som ett kraftfullt verktyg för snabb utvärdering av lipidprofilen av fiskolja kosttillskott

The western diet is poor in n-3 fatty acids, therefore the consumption of fish oil supplements is recommended to increase the intake of these essential ...

Coulomb Explosion Imaging as a Tool to Distinguish Between Stereoisomers

Coulomb Explosion Imaging som ett verktyg för att skilja mellan stereoisomerer

This article shows how the COLTRIMS (Cold Target Recoil Ion Momentum Spectroscopy) or the "reaction microscope" technique can be used to distinguish ...

Electrochemical Impedance Spectroscopy as a Tool for Electrochemical Rate Constant Estimation

Elektroimpedansspektroskopi som ett verktyg för elektrokemisk hastighet konstant uppskattning

Electrochemical impedance spectroscopy (EIS) was used for advanced characterization of organic electroactive compounds along with cyclic voltammetry (CV). ...

Color Spot Test As a Presumptive Tool for the Rapid Detection of Synthetic Cathinones

Färg Spot Test som presumtiva verktyg för snabb påvisande av syntetiska katinoner

Synthetic cathinones are a large class of new psychoactive substances (NPS) that are increasingly prevalent in drug seizures made by law enforcement and ...

Novel Techniques for Observing Structural Dynamics of Photoresponsive Liquid Crystals

Nya tekniker för att observera strukturella dynamiken i Photoresponsive flytande kristaller

We discuss in this article the experimental measurements of the molecules in liquid crystal (LC) phase using the time-resolved infrared (IR) vibrational ...

Employing Pressurized Hot Water Extraction (PHWE) to Explore Natural Products Chemistry in the Undergraduate Laboratory

Employing Pressurized Hot Water Extraction PHWE to Explore Natural Products Chemistry in the Undergraduate Laboratory

Anställa trycksatt varmvatten utvinning (PHWE) att utforska naturprodukter kemi i grundutbildningsprogram laboratoriet

A recently developed pressurized hot water extraction (PHWE) method which utilizes an unmodified household espresso machine to facilitate natural products ...

A Two-Step Pyrolysis-Gas Chromatography Method with Mass Spectrometric Detection for Identification of Tattoo Ink Ingredients and Counterfeit Products

En två-stegs pyrolys-gaskromatografi metod med masspektrometrisk detektion för identifiering av Tattoo Ink ingredienser och förfalskade produkter

Tattoo inks are complex mixtures of ingredients. Each of them possesses different chemical properties which have to be addressed upon chemical analysis. ...