Name: assessment of de novo protein synthesis rates in caenorhabditis elegans
Uploaded: 2020-09-12T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Assessment of de novo Protein Synthesis Rates in Caenorhabditis elegans at JoVE.com

Vi tackar Chaniotakis M. och Kounakis K. för videoinspelning och redigering. K.P. finansieras genom ett anslag från Hellenic Foundation for Research and Innovation (HFRI) och generalsekretariatet för forskning och teknik (GSRT). N.T. finansieras genom bidrag från Europeiska forskningsrådet (ERC – GA695190 – MANNA), Europeiska kommissionens ramprogram, och det grekiska utbildningsministeriet.

OBS: Både transkriptionella och translationella fusioner till fluoroforer kan användas för att utvärdera de novo protein translation i flera vävnader. Proteinsynteshastigheter kan bedömas för flera proteinfamiljer som lokaliserade i olika cellulära fack, inklusive cytoplasman, mitokondrierna och kärnan7. Följande stammar används för att övervaka globala och neuronala proteinsyntesen priser, N2; Ex[pife-2GFP, pRF4], ife-2(ok306); Ex[p...

<ol>
	<li>Syntichaki, P., Troulinaki, K., Tavernarakis, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=eIF4E+function+in+somatic+cells+modulates+ageing+in+Caenorhabditis+elegans.">eIF4E function in somatic cells modulates ageing in Caenorhabditis elegans.</a> Nature. 445 (7130), 922-926 (2007).</li><li>Charmpilas, N., Daskalaki, I., Papandreou, M. E., Tavernarakis, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+synthesis+as+an+integral+quality+control+mechanism+during+ageing.">Protein synthesis as an integral quality control mechanism during ageing.</a> Ageing Research Reviews. 23, 75-89 (2015).</li><li>Li, G. W., Burkhardt, D., Gross, C., Weissman, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantifying+absolute+protein+synthesis+rates+reveals+principles+underlying+allocation+of+cellular+resources.">Quantifying absolute protein synthesis rates reveals principles underlying allocation of cellular resources.</a> Cell. 157 (3), 624-635 (2014).</li><li>Dermit, M., Dodel, M., Mardakheh, F. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Methods+for+monitoring+and+measurement+of+protein+translation+in+time+and+space.">Methods for monitoring and measurement of protein translation in time and space.</a> Molecular Biosystems. 13 (12), 2477-2488 (2017).</li><li>Iwasaki, S., Ingolia, N. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Growing+Toolbox+for+Protein+Synthesis+Studies.">The Growing Toolbox for Protein Synthesis Studies.</a> Trends in Biochemical Sciences. 42 (8), 612-624 (2017).</li><li>Corsi, A. K., Wightman, B., Chalfie, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Transparent+Window+into+Biology:+A+Primer+on+Caenorhabditis+elegans.">A Transparent Window into Biology: A Primer on Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 200 (2), 387-407 (2015).</li><li>Kourtis, N., Tavernarakis, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell-specific+monitoring+of+protein+synthesis+in+vivo.">Cell-specific monitoring of protein synthesis in vivo.</a> PLoS One. 4 (2), 4547 (2009).</li><li>Parker, R., Sheth, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=P+bodies+and+the+control+of+mRNA+translation+and+degradation.">P bodies and the control of mRNA translation and degradation.</a> Molecular Cell. 25 (5), 635-646 (2007).</li><li>Rieckher, M., Markaki, M., Princz, A., Schumacher, B., Tavernarakis, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maintenance+of+Proteostasis+by+P+Body-Mediated+Regulation+of+eIF4E+Availability+during+Aging+in+Caenorhabditis+elegans.">Maintenance of Proteostasis by P Body-Mediated Regulation of eIF4E Availability during Aging in Caenorhabditis elegans.</a> Cell Reports. 25 (1), 199-211 (2018).</li><li>Reits, E. A., Neefjes, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=From+fixed+to+FRAP:+measuring+protein+mobility+and+activity+in+living+cells.">From fixed to FRAP: measuring protein mobility and activity in living cells.</a> Nature Cell Biology. 3 (6), 145-147 (2001).</li><li>Keith, S. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Graded+Proteasome+Dysfunction+in+Caenorhabditis+elegans+Activates+an+Adaptive+Response+Involving+the+Conserved+SKN-1+and+ELT-2+Transcription+Factors+and+the+Autophagy-Lysosome+Pathway.">Graded Proteasome Dysfunction in Caenorhabditis elegans Activates an Adaptive Response Involving the Conserved SKN-1 and ELT-2 Transcription Factors and the Autophagy-Lysosome Pathway.</a> PLoS Genetics. 12 (2), 1005823 (2016).</li><li>Kumsta, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+autophagy+receptor+p62/SQST-1+promotes+proteostasis+and+longevity+in+C.+elegans+by+inducing+autophagy.">The autophagy receptor p62/SQST-1 promotes proteostasis and longevity in C. elegans by inducing autophagy.</a> Nature Communications. 10 (1), 5648 (2019).</li><li>Gregersen, N., Bolund, L., Bross, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+misfolding,+aggregation,+and+degradation+in+disease.">Protein misfolding, aggregation, and degradation in disease.</a> Molecular Biotechnology. 31 (2), 141-150 (2005).</li></ol>

Proteinsyntesmodulering är väsentligt för organismal homeostas. Under åldrandet är global såväl som specifik proteinsyntes störd. Nyligen genomförda studier visar det faktum att protein översättning balans direkt styr senescence och åldrande är inte bara en biprodukt av åldrandet. I synnerhet kärnkomponenter i översättningsmaskineriet såsom eukaryota initieringsfaktor 4E (eIF4E), som underlättar mRNA-capping under översättningsinitiering, och därmed graden av cap-beroende proteinöversättning, indu...

Proteinsyntes och nedbrytning är väsentligt för organismal homeostas. En mängd åldersrelaterade sjukdomar anstiftas av defekt proteinproduktion1,2. För att mäta globala proteinöversättningshastigheter finns biokemiska tekniker som ribosomal profilering, vilket innebär djup sekvensering av ribosomskyddade mRNA-fragment för att övervaka uttryck samt ny proteinsyntes3. Denna metod, förutom att vara en indirekt avläsning av translationella priser, som ökad RNA-association till ribosomer inte nödvändigtvis innebär ökad översättning, har tekniska nackdelar, såsom hög kostnad och ett krav på en stor mängd utgångsmaterial. Å andra sidan möjliggör proteomikbaserade metoder direkt proteinkvantifiering genom pulsmetabolisk profilering följt av masspektrometrianalys4,5. Detta är dock en semi-kvantitativ metod med begränsad temporal resolution som inte lätt kan användas in vivo. Märkningen av proteinet kan dessutom säredels fördelas i det djur/den vävnad som är av intresse. Viktigt, båda dessa metoder kan dölja vävnadsspecifika eller cellspecifika variationer i proteinöversättningshastigheter i hela djur eller vävnader, respektive.
Caenorhabditis elegans är en lättanvänd modellorganism som kan odlas i stort antal6. Dessutom, dess genetiska amenability och öppenhet möjliggör levande bildbehandling in vivo. Detta protokoll beskriver metodiken för att detektera proteinsynteshastigheter med hjälp av fluorescensåterhämtning efter fotobleaching (FRAP). Vi utnyttjar det transgena uttrycket av fluorescerande proteiner, antingen i hela organismen eller i specifika vävnader/celler. Transgena djur kan antingen uttrycka GFP med hjälp av promotorn av en gen, som är allmänt/globalt uttryckt eller en vävnadsspecifik promotor för att rikta in sig på specifika celltyper. Denna teknik kan utvidgas till en specifik promotor för att undersöka proteinsyntesen priser av ett specifikt protein.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Agar</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>5040</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agarose</td>
			<td>Biozym</td>
			<td>8,40,004</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agarose pads 2%</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Calcium chloride dehydrate (CaCl2&#8729;2H2O)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>C5080</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cholesterol</td>
			<td>SERVA Electrophoresis</td>
			<td>17101.01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>cycloheximide</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>C-7698</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dissecting stereomicroscope</td>
			<td>Nikon Corporation</td>
			<td></td>
			<td>SMZ645</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>edc-3(ok1427);Ex[punc-119GFP, pRF4]</td>
			<td>Tavernarakis lab</td>
			<td></td>
			<td>Maintain animals at 20 &#176;C</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Epifluorescence microscope</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td></td>
			<td>Axio Imager Z2</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Escherichia coli OP50 strain</td>
			<td>Caenorhabditis Genetics Center (CGC)</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fluorescence dissecting stereomicroscope</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td></td>
			<td>SteREO Lumar V12</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Greiner Petri dishes (60 x 15 mm)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P5237</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ife-2(ok306);Ex[pife-2GFP, pRF4]</td>
			<td>Tavernarakis lab</td>
			<td></td>
			<td>Maintain animals at 20 &#176;C</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>image analysis software</td>
			<td>Fiji</td>
			<td></td>
			<td>https://fiji.sc</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>KH2PO4</td>
			<td>EMD Millipore</td>
			<td>1,37,010</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>K2HPO4</td>
			<td>EMD Millipore</td>
			<td>1,04,873</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LB liquid medium</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>M9 buffer</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Magnesium sulfate (MgSO4)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>M7506</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microscope slides (75 x 25 x 1 mm)</td>
			<td>Marienfeld, Lauda-Koenigshofen</td>
			<td>10 006 12</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microsoft Office 2011 Excel software package</td>
			<td>Microsoft Corporation, Redmond, USA</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>N2;Ex[pife-2GFP; pRF4]</td>
			<td>Tavernarakis lab</td>
			<td></td>
			<td>Maintain animals at 20 &#176;C</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>N2;Ex[psod-3GFP; pRF4]</td>
			<td>Tavernarakis lab</td>
			<td></td>
			<td>Maintain animals at 20 &#176;C</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>N2;Ex[punc-119GFP; pRF4]</td>
			<td>Tavernarakis lab</td>
			<td></td>
			<td>Maintain animals at 20 &#176;C</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Na2HPO4</td>
			<td>EMD Millipore</td>
			<td>1,06,586</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nematode growth medium (NGM) agar plates</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nystatin stock solution</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>N3503</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Peptone</td>
			<td>BD, Bacto</td>
			<td>211677</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphate buffer</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium chloride (NaCl)</td>
			<td>EMD Millipore</td>
			<td>1,06,40,41,000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Standard equipment for preparing agar plates (autoclave, Petri dishes, etc.)</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Standard equipment for maintaining worms (platinum wire pick, incubators, etc.).</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>statistical analysis software</td>
			<td>GraphPad Software Inc., San Diego, USA</td>
			<td></td>
			<td>GraphPad Prism software package</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Streptomycin</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>S6501</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>UV Crosslinker</td>
			<td>Vilber Lourmat BIO-LINK BLX 254</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Worm pick</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

assessment of de novo protein synthesis rates in caenorhabditis elegans

Att upprätthålla en hälsosam proteom är viktigt för cell och organismen homeostas. Perturbation av balansen mellan protein translationell kontroll och nedbrytning anstiftar en mängd åldersrelaterade sjukdomar. Tillbakagång av proteostass kvalitetskontrollmekanismer är ett kännetecken för åldrande. Biokemiska metoder för att upptäcka de novo proteinsyntesen är fortfarande begränsade, har flera nackdelar och kan inte utföras i levande celler eller djur. Caenorhabditis elegans, som är transparent och lätt genetiskt modifierad, är en utmärkt modell för att övervaka proteinsynteshastigheter med hjälp av avbildningstekniker. Här introducerar vi och beskriver en metod för att mäta de novo proteinsyntesen in vivo utnyttja fluorescens återhämtning efter fotobleaching (FRAP). Transgena djur som uttrycker fluorescerande proteiner i specifika celler eller vävnader bestrålas av en kraftfull ljuskälla som resulterar i fluorescensfotobleaching. I sin tur, bedömning av fluorescens återhämtning innebär nya proteinsyntesen i celler och / eller vävnader av intresse. Därför kan kombinationen av transgena nematoder, genetiska och/eller farmakologiska interventioner tillsammans med levande avbildning av proteinsynteshastigheter belysa mekanismer som medlar åldersberoende proteostaskollaps.

Med hjälp av förfarandet som presenteras här, vild typ och mutanta transgena nematoder uttryckerföljande somatiska reportrar, pife-2GFP, psod-3GFP och punc-119GFP, användes för att bedöma proteinsyntesen skattesatser enligt respektive protokoll. Särskilt jämfördes vildtyp och om-2 mutantmaskar som uttrycker cytoplasmatisk GFP i hela sina somatiska vävnader genom att använda promotorn ife-2 fö...

Watch this Scientific Journal Video about Assessment of de novo Protein Synthesis Rates in Caenorhabditis elegans at JoVE.com

Assessment of de novo Protein Synthesis Rates in Caenorhabditis elegans

Här introducerar vi och beskriver en nonradioactive och noninvasive metod för att bedöma de novo proteinsyntes in vivo, utnyttja den nematoden Caenorhabditis elegans och fluorescence återhämtning efter photobleaching (FRAP). Denna metod kan kombineras med genetiska och/eller farmakologiska skärmar för att identifiera nya modulatorer av proteinsyntes.

Bedömning av de novo Proteinsyntesen Priser i Caenorhabditis elegans

Maintaining a healthy proteome is essential for cell and organismal homeostasis. Perturbation of the balance between protein translational control and ...

Graden av proteinsyntes är störd under sjukdom och åldrande. Fluorescens återhämtning efter fotobleaching, eller FRAP, tillåter mätning av hastigheten av proteinsyntesen in vivo. Vi använder transparenta C.elegans maskar, som uttrycker GFP, som en modell för att övervaka den nya proteinsyntesen efter fotobleaching.Vi ger praktiska riktlinjer för att mäta fluorescensåterhämtning genom att använda transgena maskar, som uttrycker GFP under olika initiativtagare, antingen brett uttryckta eller i specifika celler eller vävnader. Också, denna metod erbjuder proteinsyntes hastighetsövervakning i realtid. Använd ett dissekerande stereomikroskop för att bedöma utvecklingsstadier och tillväxt av vild-typ och mutanta transgena nematoder.Plocka 10 L4-larver av vilda och muterade transgena djur som bär den önskade fluorescerande reportern på nematodtillväxtmedieplattor som är seedade med E.coli. Inkubera och odla nematoderna vid standardtemperaturen på 20 grader Celsius. Fyra dagar senare innehåller plattan en blandad population av transgena maskar.Välj och överför 15 L4-larver av varje stam på nyutfrö OP50 NGM-plattor. Utför FRAP-analys, och övervaka proteinsynteshastighet på dag ett av vuxen ålder. Nästa dag, förbereda och använda cykloheximid-innehållande NGM plattor som en positiv kontroll.Döda bakterier genom att exponera de seedade NGM-plattorna i 15 minuter med UV-ljus. Tillsätt cykloheximid på toppen av bakterie-seedade plattor för 500 mikrogram per mL slutlig koncentration i agar volymen. Låt plattorna torka.Överför transgena nematoder som uttrycker GFP på fordons- och cykloheximidhaltiga plattor. Ruva djur i två timmar vid standardtemperaturen på 20 grader Celsius. Plocka och överföra en dag vuxna transgena djur till enskilda NGM plattor seedade med en 20 microliters OP50 droppe i centrum.Ta bort locket och placera varje platta under en 20H objektiv lins av ett epifluorescerande mikroskop. Fokusera och ta en referensbild innan du fotoblekning. Fotobleach varje prov i 10 minuter.Ta en bild efter fotoblekning. Håll djur i enskilda NGM-plattor, och låt dem återhämta sig. Bild och spela in återvinning av varje fluorescerande reporter var en timme i minst sex timmar vid ett epifluorescerande stereomikroskop.Förbered 2%agaros kuddar, och tillsätt 10 mikroliters droppe M9 buffert i mitten av agarospaden. Överföra fem transgena nematoder uttrycker pan-neuronal cytoplasmatiska GFP i en droppe M9 buffert. Använd en ögonfrans för att sprida vätskan.Djur visar minskade rörelser inom två minuter på grund av M9-absorbans i agaren. Ändra nematods position genom att använda en ögonfransplockning. Placera provet vid den objektiva 40H-linsen i ett epifluorescerande mikroskop utan att använda en täcksli.Fokusera och fånga en referensbild. Photobleach ett målinriktat intresseområde i 90 sekunder. Ta en bild efter fotoblekning.Lägg till en 10 mikroliters droppe M9 buffert på fotobleached nematoder. Låt djuren återhämta sig i fem minuter. Använd ögonfransplockningen eller en pipett för att överföra nematoderna till enskilda NGM-plattor som är seedade med 20 mikroliters OP50-dropp i mitten.Ta en bild av varje prov var en timme under ett epifluorescerande stereomikroskop. Vild-typ och fe-2 mutanta maskar uttrycker cytoplasmatiska GFP hela deras somatiska vävnader genom att använda fe-2 promotorn jämfördes före, omedelbart efter photobleaching och fem timmar efter återhämtning. Vildtypsdjur återhämtade sig helt medan fe-2-mutanter hade minis återhämtningskapacitet.Således vild typ maskar initiera den normala proteinsyntesen efter fotobleaching, medan maskar saknar mRNA översättning inledande faktor fe-2 inte kan göra det, vilket tyder på att graden av fluorescerande återhämtning illustrerar graden av proteinsyntesen in vivo. Cykloheximid, en specifik hämmare av mRNA översättning kan användas som en positiv kontroll för protein översättning hämning. Cykloheximidbehandlade transgena djur som uttrycker cytoplasmatiskt GFP under promotorn återfår inte sin fluorescens vid fotobleaching.mRNA-bearbetningsorgan påverkar graden av proteinöversättning. Wild-typ och edc-3 mutant nematoder uttrycker GFP pan-neuronally undersöktes för deras återhämtning kapacitet på riktade photobleaching på regionen huvudet. Fluorescerande återhämtning är mycket långsammare i EDC-3-bristfälliga djur jämfört med vild-typ maskar.Proteinsyntesmodulering är väsentligt för organismal homeostas. Under åldrandet är global såväl som specifik proteinsyntes störd. Protein översättning balans styr direkt senescence och åldrande.Specifikt kärnkomponenter i översättningsmaskineriet samt P-kroppens interagerande komponenter påskyndar åldrandet. Perturbation av översättning inledande avtar åldrande. Därför är mätning av globala proteinsynteshastigheter av FRAP en direkt avläsning av åldrandeprocessen.

Research

JoVE Journal

Biology

Assessment of de novo Protein Synthesis Rates in Caenorhabditis elegans

Osmotic Avoidance in Caenorhabditis elegans: Synaptic Function of Two Genes, Orthologues of Human NRXN1 and NLGN1, as Candidates for Autism

Osmotic Avoidance in Caenorhabditis elegans: Synaptic Function of Two Genes, Orthologues of Human NRXN1 and NLGN1, as Candidates for Autism

Osmotiska skatteundandragande i Caenorhabditis elegans: Synaptic funktion av två gener, Orthologues de mänskliga NRXN1 Och NLGN1, Som kandidater för Autism

Neurexins and neuroligins are cell adhesion molecules present in excitatory and inhibitory synapses, and they are required for correct neuron network ...

Time-lapse Microscopy of Early Embryogenesis in Caenorhabditis elegans

Time-lapse Microscopy of Early Embryogenesis in Caenorhabditis elegans

Time-lapse Mikroskopi av tidig embryogenesen i Caenorhabditis elegans

Caenorhabditis elegans has often been used as a model system in studies of early developmental processes.  The transparency of the 
embryos, the genetic ...

Basic Caenorhabditis elegans Methods: Synchronization and Observation

Basic Caenorhabditis elegans Methods: Synchronization and Observation

Basisk<em&gt; Caenorhabditis elegans</em&gt; Metoder: Synkronisering och miljöövervakning

Research into the molecular and developmental biology of the nematode Caenorhabditis elegans was begun in the early seventies by Sydney Brenner and it has ...

Biochemical and High Throughput Microscopic Assessment of Fat Mass in Caenorhabditis Elegans

Biochemical and High Throughput Microscopic Assessment of Fat Mass in Caenorhabditis Elegans

Biokemisk och hög kapacitet Mikroskopisk bedömning av fettmassa i<em&gt; Caenorhabditis elegans</em

The nematode C. elegans has emerged as an important  model for the study of conserved genetic pathways regulating fat metabolism as  it relates to human ...

Prostaglandin Extraction and Analysis in Caenorhabditis elegans

Prostaglandin Extraction and Analysis in Caenorhabditis elegans

Prostaglandin Extraktion och analys i<em&gt; Caenorhabditis elegans</em

Caenorhabditis elegans is emerging as a powerful animal model to study the biology of lipids1-9. Prostaglandins are an important class of eicosanoids, ...

Protein WISDOM: A Workbench for In silico De novo Design of BioMolecules

Protein WISDOM: A Workbench for In silico De novo Design of BioMolecules

Protein visdom: En Workbench för<em&gt; I silico</em&gt;<em&gt; De novo</em&gt; Design av biomolekyler

The aim of de novo protein design is to find the amino acid sequences that will fold into a desired 3-dimensional structure with improvements in specific ...

Using Caenorhabditis elegans as a Model System to Study Protein Homeostasis in a Multicellular Organism

Using Caenorhabditis elegans as a Model System to Study Protein Homeostasis in a Multicellular Organism

The folding and assembly of proteins is essential for protein function, the long-term health of the cell, and longevity of the organism. Historically, the ...

Methods to Study Changes in Inherent Protein Aggregation with Age in Caenorhabditis elegans

Methods to Study Changes in Inherent Protein Aggregation with Age in Caenorhabditis elegans

Metoder för att studera förändringar i inneboende Protein aggregering med åldern i Caenorhabditis elegans

In the last decades, the prevalence of neurodegenerative disorders, such as Alzheimer's disease (AD) and Parkinson's disease (PD), has grown. These ...

De Novo Generation of Somatic Stem Cells by YAP/TAZ

De Novo Generation of Somatic Stem Cells by YAP/TAZ

De Novo Generation av somatiska stamceller av YAP/TAZ

Here we present protocols to isolate primary differentiated cells and turn them into stem/progenitor cells (SCs) of the same lineage by transient ...

Detecting Protein Subcellular Localization by Green Fluorescence Protein Tagging and 4',6-Diamidino-2-phenylindole Staining in Caenorhabditis elegans

Detecting Protein Subcellular Localization by Green Fluorescence Protein Tagging and 4',6-Diamidino-2-phenylindole Staining in Caenorhabditis elegans

Att upptäcka Protein subcellulär lokalisering av grönt fluorescerande Protein taggning och 4', 6-diamidin-2-fenylindol färgning i Caenorhabditis elegans