Name: a telemetric, gravimetric platform for real-time physiological phenotyping of plant&ndash;environment interactions
Uploaded: 2020-08-05T13:00:00
Duration: 15 min 30 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about A Telemetric, Gravimetric Platform for Real-Time Physiological Phenotyping of PlantÃ¢â‚¬â€œEnvironment Interactions at JoVE.com

Dette arbejde blev støttet af ISF-NSFC fælles forskningsprogram (tilskud Nr. 2436/18) og blev også delvist støttet af Israel Ministeriet for Landbrug og Udvikling af Landdistrikter (Eugene Kandel Knowledge Centers) som en del af roden af sagen - The Root Zone Knowledge Center for udnyttelse af moderne landbrug.

<ol>
	<li>Ray, D. K., Mueller, N. D., West, P. C., Foley, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Yield+Trends+Are+Insufficient+to+Double+Global+Crop+Production+by+2050.">Yield Trends Are Insufficient to Double Global Crop Production by 2050.</a> PLoS One. 8, 66428 (2013).</li><li>Food and Agriculture Organization of the United Nations. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The future of food and agriculture: Trends and challenges. , (2017).</li><li>Dhankher, O. P., Foyer, C. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Climate+resilient+crops+for+improving+global+food+security+and+safety.">Climate resilient crops for improving global food security and safety.</a> Plant, Cell &amp; Environment. 41, 877-884 (2018).</li><li>Chen, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dissecting+the+phenotypic+components+of+crop+plant+growthand+drought+responses+based+on+high-throughput+image+analysis+w+open.">Dissecting the phenotypic components of crop plant growthand drought responses based on high-throughput image analysis w open.</a> Plant Cell. 26, 4636-4655 (2014).</li><li>Ubbens, J. R., Stavness, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Deep+Plant+Phenomics:+A+Deep+Learning+Platform+for+Complex+Plant+Phenotyping+Tasks.">Deep Plant Phenomics: A Deep Learning Platform for Complex Plant Phenotyping Tasks.</a> Frontiers in Plant Science. , (2017).</li><li>Danzi, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Can+High+Throughput+Phenotyping+Help+Food+Security+in+the+Mediterranean+Area.">Can High Throughput Phenotyping Help Food Security in the Mediterranean Area.</a> Frontiers in Plant Science. , (2019).</li><li>Miflin, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Crop+improvement+in+the+21st+century.">Crop improvement in the 21st century.</a> Journal of Experimental Botany. 51, 1-8 (2000).</li><li>Dalal, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dynamic+Physiological+Phenotyping+of+Drought-Stressed+Pepper+Plants+Treated+With+"Productivity-Enhancing"+and+"Survivability-Enhancing"+Biostimulants.">Dynamic Physiological Phenotyping of Drought-Stressed Pepper Plants Treated With "Productivity-Enhancing" and "Survivability-Enhancing" Biostimulants.</a> Frontiers in Plant Science. , (2019).</li><li>Moshelion, M., Altman, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Current+challenges+and+future+perspectives+of+plant+and+agricultural+biotechnology.">Current challenges and future perspectives of plant and agricultural biotechnology.</a> Trends in Biotechnology. 33, 337-342 (2015).</li><li>Singh, A., Ganapathysubramanian, B., Singh, A. K., Sarkar, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Machine+Learning+for+High-Throughput+Stress+Phenotyping+in+Plants.">Machine Learning for High-Throughput Stress Phenotyping in Plants.</a> Trends in Plant Science. 21, 110-124 (2016).</li><li>Houle, D., Govindaraju, D. R., Omholt, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phenomics:+The+next+challenge.">Phenomics: The next challenge.</a> Nature Reviews Genetics. 11, 855-866 (2010).</li><li>Fiorani, F., Schurr, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Future+Scenarios+for+Plant+Phenotyping.">Future Scenarios for Plant Phenotyping.</a> Annual Review of Plant Biology. 64, 267-291 (2013).</li><li>Tardieu, F., Cabrera-Bosquet, L., Pridmore, T., Bennett, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plant+Phenomics,+From+Sensors+to+Knowledge.">Plant Phenomics, From Sensors to Knowledge.</a> Current Biology. 27, 770-783 (2017).</li><li>Negin, B., Moshelion, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+advantages+of+functional+phenotyping+in+pre-field+screening+for+drought-tolerant+crops.">The advantages of functional phenotyping in pre-field screening for drought-tolerant crops.</a> Functional Plant Biology. , (2017).</li><li>Gebremedhin, A., Badenhorst, P. E., Wang, J., Spangenberg, G. C., Smith, K. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prospects+for+measurement+of+dry+matter+yield+in+forage+breeding+programs+using+sensor+technologies.">Prospects for measurement of dry matter yield in forage breeding programs using sensor technologies.</a> Agronomy. 9, 65 (2019).</li><li>Roitsch, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=New+sensors+and+data-driven+approaches-A+path+to+next+generation+phenomics.">New sensors and data-driven approaches-A path to next generation phenomics.</a> Plant Science. 282, 2-10 (2019).</li><li>Li, L., Zhang, Q., Huang, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+review+of+imaging+techniques+for+plant+phenotyping.">A review of imaging techniques for plant phenotyping.</a> Sensors (Switzerland). 14, 20078-20111 (2014).</li><li>Gosa, S. C., Lupo, Y., Moshelion, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+and+comparative+analysis+of+whole-plant+performance+for+functional+physiological+traits+phenotyping:+New+tools+to+support+pre-breeding+and+plant+stress+physiology+studies.">Quantitative and comparative analysis of whole-plant performance for functional physiological traits phenotyping: New tools to support pre-breeding and plant stress physiology studies.</a> Plant Science. 282, 49-59 (2019).</li><li>Araus, J. L., Cairns, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Field+high-throughput+phenotyping:+the+new+crop+breeding+frontier.">Field high-throughput phenotyping: the new crop breeding frontier.</a> Trends in Plant Science. 19, 52-61 (2014).</li><li>Ito, V. C., Lacerda, L. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Black+rice+(Oryza+sativa+L.):+A+review+of+its+historical+aspects,+chemical+composition,+nutritional+and+functional+properties,+and+applications+and+processing+technologies.">Black rice (Oryza sativa L.): A review of its historical aspects, chemical composition, nutritional and functional properties, and applications and processing technologies.</a> Food Chemistry. 301, 125304 (2019).</li><li>Anjum, S. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=physiological+and+biochemical+responses+of+plants+to+drought+stress.">physiological and biochemical responses of plants to drought stress.</a> African Journal of Agricultural Research. , (2011).</li><li>Halperin, O., Gebremedhin, A., Wallach, R., Moshelion, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+physiological+phenotyping+and+screening+system+for+the+characterization+of+plant-environment+interactions.">High-throughput physiological phenotyping and screening system for the characterization of plant-environment interactions.</a> The Plant Journal. 89, 839-850 (2017).</li><li>Yaaran, A., Negin, B., Moshelion, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Role+of+guard-cell+ABA+in+determining+steady-state+stomatal+aperture+and+prompt+vapor-pressure-deficit+response.">Role of guard-cell ABA in determining steady-state stomatal aperture and prompt vapor-pressure-deficit response.</a> Plant Science. 281, 31-40 (2019).</li><li>Dalal, A., Attia, Z., Moshelion, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=To+produce+or+to+survive:+how+plastic+is+your+crop+stress+physiology.">To produce or to survive: how plastic is your crop stress physiology.</a> Frontiers in Plant Science. 8, 2067 (2017).</li><li>Araus, J. L., Kefauver, S. C., Zaman-Allah, M., Olsen, M. S., Cairns, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Translating+High-Throughput+Phenotyping+into+Genetic+Gain.">Translating High-Throughput Phenotyping into Genetic Gain.</a> Trends in Plant Science. 23, 451-466 (2018).</li><li>Ghanem, M. E., Marrou, H., Sinclair, T. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Physiological+phenotyping+of+plants+for+crop+improvement.">Physiological phenotyping of plants for crop improvement.</a> Trends in Plant Science. 20, 139-144 (2015).</li><li>Sinclair, T. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pot+binding+as+a+variable+confounding+plant+phenotype:+theoretical+derivation+and+experimental+observations.">Pot binding as a variable confounding plant phenotype: theoretical derivation and experimental observations.</a> Planta. 245, 729-735 (2017).</li></ol>

Forfatterne har intet at afsløre.

Den genotype-fænotype viden hul afspejler kompleksiteten af genotype x miljø interaktioner (gennemgået af18,,24). Det kan være muligt at bygge bro over denne kløft ved hjælp af højopløsnings-, HTP-telemetriske diagnostiske og fænotopiske screeningsplatforme, der kan bruges til at studere hele plantens fysiologiske ydeevne og vandrelationskinetik8,9. Kompleksiteten af genotype x miljø interaktioner gør fænotype en udfordring, især i lyset af hvor hurtigt planter reagerer på deres skiftende miljøer. Selv om forskellige fænotypesystemer er tilgængelige i øjeblikket, er de fleste af disse systemer baseret på telemåling og avancerede billedbehandlingsteknikker. Selv om disse systemer giver samtidige målinger, er deres målinger til en vis grad begrænset til morfologiske og indirekte fysiologiske træk25. Fysiologiske træk er meget vigtige i forbindelse med lydhørhed eller følsomhed over for miljøforhold26. Derfor kan direkte målinger, der foretages kontinuerligt og samtidigt med en meget høj opløsning (f.eks. 3 min intervaller), give en meget nøjagtig beskrivelse af en plantes fysiologiske adfærd. På trods af disse betydelige fordele ved gravimetriske system skal der også tages hensyn til, at dette system har visse potentielle ulemper. De største ulemper skyldes behovet for at arbejde med potter og drivhusforhold, som kan udgøre store udfordringer for behandlingsregulering (især regulering af tørkebehandlinger) og eksperimentel repeterbarhed.
For at løse disse problemer, bør man standardisere de anvendte belastninger, skabe en virkelig randomiseret eksperimentel struktur, minimere pot effekter og sammenligne flere dynamiske adfærd af planter under skiftende miljøforhold inden for en kort periode. HTP-telemetriske funktionelle fænotypebestemmelse, der er beskrevet i dette dokument, omhandler disse spørgsmål som nævnt nedenfor.
For at korrelere anlæggets dynamiske respons med dets dynamiske miljø og tage et fuldstændigt, stort billede af komplekse vekselvirkninger mellem anlæg og miljø skal både miljøforhold (figur 4) og planteresponser (supplerende figur 9B) måles kontinuerligt. Denne metode gør det muligt at måle fysiske ændringer i potteplanter medium og atmosfære kontinuerligt og samtidig, sammen med plantetræk (jord-plante-atmosfære kontinuum, SPAC).
For bedst at forudsige, hvordan planter vil opføre sig i marken, er det vigtigt at udføre fænotypebestemmelsesprocessen under forhold, der er så lignende som muligt som dem, der findes imarken 18. Vi udfører eksperimenterne i et drivhus under halvstyrede forhold for at efterligne feltforholdene så meget som muligt. En af de vigtigste betingelser er den voksende eller potning medium. Det er afgørende at vælge det bedst egnede pottemedie til gravimetrisk systemeksperiment. Det er tilrådeligt at vælge en jord medium, der dræner hurtigt, giver mulighed for hurtig opnåelse af pot kapacitet og har en meget stabil pot kapacitet, da disse funktioner giver mulighed for mere præcise målinger af gravimetriske system. Desuden skal de forskellige behandlinger, der skal anvendes i forsøget, også overvejes. F.eks. kræver behandlinger, der involverer salte, gødningsstoffer eller kemikalier, anvendelse af et inert pottefrugtmedie, helst et med en lav kationbytningskapacitet. Tørke behandlinger anvendes på lav-transpiring plantearter ville fungere bedst med potning medier med relativt lave VWC niveauer. I modsætning hertil ville langsomme tørke behandlinger anvendes på høj-transpiring planter ville fungere bedst med potning medier med relativt høje VWC niveauer. Hvis rødderne er nødvendige til analyse efter forsøget (f.eks. rodmorfologi, tørvægt osv.), vil brugen af et medium med relativt lavt indhold af organisk materiale (dvs. sand, porøs keramik eller perlite) gøre det lettere at vaske rødderne uden at beskadige dem. For eksperimenter, der vil fortsætte i længere perioder, er det tilrådeligt at undgå medier, der er rige på organisk materiale, da organisk materiale kan nedbrydes med tiden. Se tabel 1 og tabel 2 for mere detaljerede oplysninger om dette emne.
Feltfædning og drivhusfjedning (præfelt) har deres egne mål og kræver forskellige eksperimentelle set-ups. Pre-field fænotypebestemmelse hjælper udvælgelsen af lovende kandidat genotyper, der har en høj sandsynlighed for at klare sig godt i marken, for at bidrage til at gøre feltforsøg mere fokuseret og omkostningseffektiv. Præfeltfædning indebærer imidlertid en række begrænsninger (f.eks. potteeffekter), der kan få planter til at præstere anderledes, end de ville gøre underfeltbetingelserne 18,27. Lille pot størrelse, vandtab ved fordampning og opvarmning af lysimeter skalaer er eksempler på faktorer i drivhus eksperimenter, der kan føre til pot effekter18. Den metode, der er beskrevet her, er designet til at minimere disse potentielle virkninger på følgende måde:
a) Grydestørrelsen vælges på grundlag af den genotype, der skal undersøges. Systemet er i stand til at understøtte forskellige pot størrelser (op til 25 L) og kunstvanding behandlinger, som gør det muligt at undersøge enhver form for afgrøde plante. b) Gryderne og lysimeterskalaerne er isoleret for at forhindre, at der overføres varme, og at gryderne opvarmes. c) Dette system indebærer et omhyggeligt udformet vandings- og afløbssystem. (d) Der er en separat controller for hver pot, for at muliggøre ægte randomisering med selvvanding og selvovervågede behandlinger. e) Softwaren tager hensyn til planternes lokale VPD ved beregningen af den baldakineformatiske ledningsevne. Se lokaliseringen af flere VPD-stationer i figur 1J.
Dette system indebærer direkte fysiologiske målinger ved feltlignende plantetætheder, hvilket eliminerer behovet for enten store mellemrum mellem planterne eller flytning af planterne til billedbaseret fænotypebestemmelse. Dette system omfatter dataanalyse i realtid samt evnen til præcist at detektere det fysiologiske stresspunkt (θ) for hver plante. Dette gør det muligt for forskeren at overvåge planterne og træffe beslutninger om, hvordan eksperimentet skal udføres, og hvordan eventuelle prøver skal indsamles i løbet af forsøget. Systemets nemme og enkle vægtkalibrering muliggør effektiv kalibrering. Systemer med høj kapacitet genererer enorme mængder data, som giver yderligere datahåndterings- og analytiske udfordringer11,12. Realtidsanalysen af de big data, der føres direkte til softwaren fra den dataansvarlige, er et vigtigt skridt i oversættelsen af data til viden14, der har stor værdi for den praktiske beslutningstagning.
Denne HTP-telemetriske fysiologiske fænotypebestemmelsesmetode kan være nyttig til udførelse af drivhusforsøg under tæt på feltforhold. Systemet er i stand til at måle og direkte beregne vand-relaterede fysiologiske reaktioner af planter til deres dynamiske miljø, mens effektivt at overvinde de fleste af de problemer, der er forbundet med potten effekt. Dette system evner er yderst vigtige i pre-field fænotypebestemmelse fase, da de giver mulighed for at forudsige udbytte sanktioner i de tidlige stadier af plantevækst.

Sikring af fødevaresikkerheden for en voksende global befolkning under forværrede miljøforhold er i øjeblikket et af de vigtigste mål for landbrugsforskning1,2,3. Tilgængeligheden af nye molekylære værktøjer har i høj grad forbedret afgrøde-forbedring programmer. Men mens genomiske værktøjer giver en massiv mængde data, skaber den begrænsede forståelse af faktiske fænotopypiske træk en betydelig videnskløft. At bygge bro over denne kløft er en af de største udfordringer , som moderne plantevidenskabstår over for 4,5,6. For at imødekomme de udfordringer, der opstår i processen med afgrøde forbedring og minimere genotype-fænotype viden hul, må vi afbalancere genotypiske tilgang med en fænocentrisk en7,8.
For nylig har forskellige high-throughput fænotype (HTP) platforme gjort det muligt at ikke-ødelæggende fænotype af store plantepopulationer over tid, og disse platforme kan hjælpe os med at reducere genotype-fænotype viden hul6,8,9,10. HTP screening teknikker tillader måling af træk i massivt antal planter inden for en relativt kort periode, takket være robotteknologi og transportbånd eller gantries bruges til at flytte planter eller sensorer (henholdsvis), i modsætning til hånd-drevne teknikker baseret på gas udveksling eller fotografering. Ikke desto mindre giver de massive mængder data, der produceres af HTP-systemer, yderligere datahåndterings- og analytiskeudfordringer 11,12.
De fleste af disse HTP-platforme omfatter vurdering af fænoyptiske træk via elektroniske sensorer eller automatiseretbilledopkøb 13,14. Avancerede feltphenomics indebærer indsættelse af proksimale sensorer og billeddannelsesteknologier på området samt en højopløsningsskala, præcis og stor befolkningsskala for måling15. Sensor- og billeddata skal integreres med andre multiomics-data for at skabe en holistisk andengenerations fænomic tilgang16. Metodologiske fremskridt inden for dataindsamling, -håndtering og -behandling bliver imidlertid stadig vigtigere, da udfordringerne i forbindelse med omregning af sensoroplysninger til viden er blevet kraftigt undervurderet i de første år af plantephenomicsforskning13. Men pålideligheden og nøjagtigheden af de aktuelt tilgængelige billeddannelsesteknikker til dybdegående fænotype-miljøinteraktioner og plantestressreaktioner er tvivlsom17,18. Desuden er resultaterne fra kontrollerede miljøer ofte meget anderledes end dem, der observeres i marken, især når det kommer til tørke-stress fænotypebestemmelse. Dette skyldes forskelle i situationen planterne oplever med hensyn til jordvolumen, jordbundsmiljø og mekanisk impedans på grund af faldende jordfugtighed under tørkestress. Derfor er det vanskeligt at ekstrapolere resultater fra kontrollerede miljøer til feltet19. Endelig er indgangsprisen på billedbaserede HTP-systemer meget høj, ikke kun på grund af prisen på sensorer, men også på grund af robotteknologi, transportbånd og portaler, som også kræver højere standarder for vækstfacilitetsinfrastruktur og betydelig vedligeholdelse (mange bevægelige dele, der arbejder i et drivhusmiljø).
I dette papir præsenterer vi en HTP-telemetrisk fænotypebestemmelsesplatform, der er designet til at løse mange af de problemer, der er nævnt ovenfor. Telemetriteknologi muliggør automatisk måling og overførsel af data fra fjernkilde(er) til en modtagestation til registrering og analyse. Her demonstrerer vi en ikke-ødelæggende HTP-telemetrisk platform, der omfatter flere vejelysimetre (et gravimetrisk system) og miljøsensorer. Dette system kan anvendes til indsamling og øjeblikkelig beregning (billedanalyse er ikke nødvendig) af en bred vifte af data, såsom hele anlæg biomasse gevinst, transpiration satser, stmatal ledningsevne, rodfæser og vand-brug effektivitet (WUE). Realtidsanalysen af de big data, der føres direkte til softwaren fra den dataansvarlige i systemet, udgør et vigtigt skridt i oversættelsen af data til viden14, der har stor værdi for den praktiske beslutningstagning, hvilket i væsentlig grad udvider den viden, der kan erhverves fra kontrollerede miljøfektpingforsøg, i almindelighed, og drivhusundersøgelser af tørkestress i særdeleshed.
Andre fordele ved telemetriplatformen er dens skalerbarhed og nem installation og dens minimale vækstfacilitetsinfrastrukturkrav (dvs. det kan nemt installeres i de fleste vækstfaciliteter). Da dette sensorbaserede system desuden ikke har nogen bevægelige dele, er vedligeholdelsesomkostningerne relativt lave, herunder både indgangsprisen og de langsigtede vedligeholdelsesomkostninger. For eksempel vil prisen på et gravimetrisk system med 20 enheder, herunder feedback-fertigationssystemet for hvert anlæg, meteorologisk station og software, svare til prisen på et bærbart gasudvekslingssystem for et førende mærke.
Ris(Oryza sativa L.) blev brugt som en model afgrøde og tørke var den undersøgte behandling. Ris blev valgt, da det er en stor kornafgrøde med bred genetisk mangfoldighed, og det er basisfødevarer til over halvdelen af verdens befolkning20. Tørke er en vigtig miljømæssig abiotisk stressfaktor, der kan forringe plantevækst og -udvikling, hvilket fører til nedsat høstudbytte21. Denne kombination af afgrødebehandling blev brugt til at demonstrere platformens evner og mængden og kvaliteten af de data, den kan producere. Yderligere oplysninger om den teoretiske baggrund for denne metode finder du i 22.

<table>
<tbody>
<tr>
<td>Atmospheric Probes </td>
<td>SpectrumTech/Meter group</td>
<td>3686WD</td>
<td>Watchdog 2475</td>
</tr>
<tr>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>40027</td>
<td>VP4</td>
</tr>
<tr>
<td>Array Randomizer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>None</td>
<td>The software "Array Randomizer" can be used for creating an experimental design of a randomized block design, or fully random design. It was developed to have better control over the random distribution of the experimental samples (plants) in order to normalize the atmospheric microvariation inside the greenhouse.</td>
</tr>
<tr>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Free download and more information, please click on the following link: https://drive.google.com/open?id=1y4QbTpxRK5Lx430xzu1RFdrlcL8pz_1q</td>
</tr>
<tr>
<td>Cavity trays</td>
<td>Danish size with curved rim for nursery</td>
<td>30162</td>
<td>4X4X7 Cell, 84 cell per tray https://desch.nl/en/products/seed_propagation_trays/danish-size-with-curved-rim-for-nursery~p92</td>
</tr>
<tr>
<td>Coarse sand</td>
<td>Negev Industrial Minerals Ltd., Israel </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
</tr>
<tr>
<td>Compost</td>
<td>Tuff Marom Golan, Israel</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
</tr>
<tr>
<td>Data Analysis software </td>
<td>Plant-Ditech Ltd., Israel</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>SPAC Analytics</td>
</tr>
<tr>
<td>Drippers</td>
<td>Netafim</td>
<td>21500-001520</td>
<td>PCJ 8L/h</td>
</tr>
<tr>
<td>Fine sand</td>
<td>Negev Industrial Minerals Ltd., Israel </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
</tr>
<tr>
<td>Loamy soil (natural soil)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
</tr>
<tr>
<td>Nylon mesh</td>
<td>Not relevant (generic products)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
</tr>
<tr>
<td>Operating software </td>
<td>Plant-Ditech Ltd., Israel</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Plantarray Feedback Control (PFC)</td>
</tr>
<tr>
<td>Peat-based soil</td>
<td>Klasmann-Deilmann GmbH, Germany</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
</tr>
<tr>
<td>Perlite</td>
<td>Agrekal , Israel</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
</tr>
<tr>
<td>Plantarray 3.0 system</td>
<td>Plant-Ditech Ltd., Israel</td>
<td>SCA400s</td>
<td>Weighing lysimeters</td>
</tr>
<tr>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>PLA300S</td>
<td>Planter unit container</td>
</tr>
<tr>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>CON100</td>
<td>Control unit </td>
</tr>
<tr>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>part of the planter set</td>
<td>Fiberglass stick</td>
</tr>
<tr>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>part of the planter set</td>
<td>Gasket ring</td>
</tr>
<tr>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Operating software</td>
</tr>
<tr>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>SPAC Analytics software</td>
</tr>
<tr>
<td>Porous, ceramic, mixed-sized medium</td>
<td>Greens Grade, PROFILE Products LLC., USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
</tr>
<tr>
<td>Porous, ceramic, small-sized medium</td>
<td>Greens Grade, PROFILE Products LLC., USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
</tr>
<tr>
<td>Pots</td>
<td>Not relevant (generic products)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
</tr>
<tr>
<td>Soil</td>
<td>Bental 11 by Tuff Marom Golan </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
</tr>
<tr>
<td>Soil Probes </td>
<td>Meter group</td>
<td>40567</td>
<td>5TE</td>
</tr>
<tr>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>40636</td>
<td>5TM</td>
</tr>
<tr>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>40478</td>
<td>GS3</td>
</tr>
<tr>
<td>Vermiculite</td>
<td>Agrekal , Israel</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
</tr>
</tbody>
</table>

a telemetric, gravimetric platform for real-time physiological phenotyping of plant&ndash;environment interactions

Fødevaresikkerhed for den voksende globale befolkning er et stort problem. Dataene fra genomiske værktøjer overstiger langt udbuddet af fænotopyske data, hvilket skaber et vidensgab. For at tage udfordringen med at forbedre afgrøderne op for at brødføde den voksende globale befolkning skal denne kløft udlignes.
Fysiologiske træk betragtes som vigtige funktionelle træk i forbindelse med lydhørhed eller følsomhed over for miljømæssige forhold. Mange nyligt indførte høj-throughput (HTP) fænotypebestemmelse teknikker er baseret på telemåling eller billeddannelse og er i stand til direkte at måle morfologiske træk, men måle fysiologiske parametre hovedsagelig indirekte.
Dette papir beskriver en metode til direkte fysiologisk fænotypebestemmelse, der har flere fordele for den funktionelle fænotypebestemmelse af plante-miljø interaktioner. Det hjælper brugerne med at overvinde de mange udfordringer, der opstår i brugen af indtrykscellestingimetriske systemer og potteforsøg. De foreslåede teknikker vil gøre det muligt for brugerne at skelne mellem jordvægt, plantevægt og jordvandsindhold, hvilket giver en metode til kontinuerlig og samtidig måling af dynamiske jord-, plante- og atmosfæreforhold sammen med måling af vigtige fysiologiske træk. Denne metode giver forskerne mulighed for nøje at efterligne felt stress scenarier og samtidig tage hensyn til miljøets virkninger på planternes fysiologi. Denne metode minimerer også pot effekter, som er et af de største problemer i pre-field fænotypebestemmelse. Det omfatter en feed-back fertigation system, der muliggør en virkelig randomiseret eksperimentelt design på et felt-lignende plantetæthed. Dette system registrerer grænseværdien for jord- og vandindhold (θ) og gør det muligt at omsætte data til viden ved hjælp af et analyseværktøj i realtid og en online statistisk ressource. Denne metode til hurtig og direkte måling af flere planters fysiologiske reaktioner på et dynamisk miljø har et stort potentiale for brug i screening for gavnlige egenskaber forbundet med reaktioner på abiotisk stress i forbindelse med præfeltavl og afgrødeforbedring.

Watch this Scientific Journal Video about A Telemetric, Gravimetric Platform for Real-Time Physiological Phenotyping of PlantÃ¢â‚¬â€œEnvironment Interactions at JoVE.com

A Telemetric, Gravimetric Platform for Real-Time Physiological Phenotyping of PlantÃƒÂ¢Ã¢â€šÂ¬Ã¢â‚¬Å“Environment Interactions

Denne high-throughput, telemetriske, hele anlægget vand relationer gravimetrisk fænotypebestemmelse metode muliggør direkte og samtidige real-time målinger, samt analyse af flere udbytte-relaterede fysiologiske træk involveret i dynamiske plante-miljø interaktioner.

En telemetrisk, gravimetrisk platform for real-time fysiologiske fænotypebestemmelse af plante-miljø interaktioner

Food security for the growing global population is a major concern. The data provided by genomic tools far exceeds the supply of phenotypic data, creating ...

Planter reagerer på miljøet på meget komplekse måder. Fysiologiske træk er blandt de hurtigste til at reagere. Normalt, meget tidligere end morfologiske forskelle kan påvises.Denne funktionelle fænotypebestemmelsesmetode med høj opløsning gør det muligt at kvantificere plantens miljøinteraktioner kontinuerligt og destruktivt under mange behandlinger. Dette system kan bruges til real-time målinger af en bred vifte af fysiologiske træk, på mange planter samtidig uden nogen større analyse, mens kontrollere betingelserne for hver plante i området. Her viser vi den mest detaljerede protokol.Vi anbefaler dog, at første gang brugerne begynder med en forenklet protokol, hvilket gør det nemmere at stifte bekendtskab med de vigtigste eksperimentelle procedurer, hardware og software. Demonstration af proceduren vil være Itamar Shenhar, en mester studerende fra MyLab Begin ved at indsætte jorden filter i puljen. Spred nylonmasken oven på hele gryden, og placer netholderen oven på nettet.Skub derefter langsomt netholderen halvvejs ned ad indersiden af hele gryden og sørg for, at nettet forbliver ensartet spredt, da det skubbes ned mellem de to potter. Sæt glasfiber stick mellem de to potter og skubbe det hele vejen ned til bunden af hele gryden. Sørg for, at det er på den ydre side af nettet og ikke skubbe nettet.Før netholderen skubbes helt ned, skal du skubbe nettet ned i hånden inde fra gryden og justere det, så det spredes ensartet og stramt over bunden, hvilket vil sikre korrekt dræning. Skub pakningsringen fra bunden af gryden, der er sat op en tredjedel af vejen op ad siden af gryden, og sørg for, at dette låg i ringen åbne mod bunden af potten. Mærk potterne i henhold til deres placeringer i arrayet inde i drivhuset.At dyrke planterne, spire frøene i hulrum bakker med den ønskede potning medium. Start forsøget, når planten viser sig ca. 10% af den maksimale pot vandkapacitet. Efterlad et par hulrum uden planter til jordvægt målinger, eller detaljer, følg teksten manuskript.Før du starter et nyt eksperiment, niveau og kalibrere lysimetre ved hjælp af en spiritus og standard vægte. Udfør vægtkalibreringen, mens den grønne beholder, herunder alle stik, den er i vejecellen efter trinnene fra tekstmanuskriptet. Hvis du vil starte et nyt eksperiment, skal du åbne driftssoftwaren og derefter åbne fanen Eksperimenter i menuen i venstre side af skærmen.Klik på Opret ny. Navnd eksperimentet, og klik på OK. Åbn det nye eksperiment. Åbn derefter planter og klik på Opret ny.I vinduet skal du ændre plantenavn, position, tårevægt og jordtype. Klik derefter på Anvend. Klik på Planter igen, og tabellen vises på skærmen.Eksporter tabellen ved at klikke på Eksporter planter i nederste venstre hjørne af bordet. Åbn derefter den gemte Excel-fil. Rediger parametrene efter behov, og gem.Klik på Importér planter i nederste venstre hjørne af tabellen. Når et lille vindue popper op siger, planter importeret med succes, skal du klikke på OK. Og kontrollér, om de ændringer, du har foretaget i Excel-filen, er blevet importeret korrekt. Klik på det nye eksperiment og på Start eksperiment i det vindue, der vises.Klik endelig på OK for at begynde at registrere data fra dette eksperiment. De færdiglavede tomme gryder vejes. Hvis du bruger dele, der ligner hinanden, vil den gennemsnitlige vægt på 10 af dem være tilstrækkelig.Pottemediet blandes grundigt med rigeligt vand, medmindre der anvendes sand eller andre homogene jordmedier. Og fyld alle de færdiglavede tomme gryder ensartet. Tryk på bunden af gryden mod gulvet et par gange for at sikre, at pottemediet er godt fordelt.Indsæt en støbt af et hulrum skimmel, der ligner i form og størrelse til roden jordprop af planter i midten af potteplanter medium. Og skub den helt ind. Vand gryderne godt og skyl ydersiden af potterne.Så lad dem løbe i 30 minutter, før du fortsætter videre til næste trin. Placer alle feltpotter på lysimeterarrayen i de grønne beholdere i henhold til forsøgsdesignet. Sørg for, at propperne på de grønne beholdere er på det rigtige sted, og at de grønne beholdere er placeret korrekt i rillen.Åbn eksperimentfanen i operationssoftwaren, og klik på fanen Målér komponenter under det nye eksperiment. Bekræft den nye måling fra det tidspunkt, der er angivet øverst på skærmen, da den forrige prøve var tændt. Klik på Målpunkt.Klik på Næste, når postvægtene og Delta-tagvinduerne dukker op. I vinduet Tag post skal du navngive det nye meta-tag som første måling og klikke på Udfør. Når vinduet med registrering af vægten vises, skal du klikke på OK. Placer multi outlet kunstvanding drypper, og pot dækker på hver gryde i lysimeteret.Bekræft den nye måling, og klik på Målér objekt igen. Klik på Næste, når postvægtene popper op. Vælg første måling i metatags i vinduet Delta-tag for at trække sektionen, og klik på Næste.I kodepostvinduet skal du navngive de nye metakoder som statiske komponenter og klikke på Udfør. Når vinduet med registrering af vægten vises, skal du klikke på OK. Klik på Planter i venstre side, og sørg for, at værdierne opdateres. Åbn derefter fanen behandlingsscenarier under det nye eksperiment, og klik på Opret ny.Klik på det nye trin under planen. I midten af skærmen skal du vælge udpegede testnavn til behandling og bekræfte ved at klikke på OK. Vælg aldrig til opsigelse, og klik på Anvend. Åbn vandingsbehandlingerne i venstre side af det valgte testnavn.Klik på det nye trin. I midten af skærmen skal du ændre ventilåbningstiden et par minutter før det aktuelle tidspunkt sammen med andre parametre, som eksperimentet kræver, og klikke på Anvend. Åbn planterne under det nye eksperiment og klik på det nye plantenavn.I midten af skærmen skal du ændre behandlingsplanen for at planlægge. Et vindue vil poppe op, skal du klikke på OK for at bekræfte. Kontroller, at trinnet har samme navn som kunstvandingstestens navn.Klik derefter på Anvend. Kontroller visuelt, at alle potterne vandes, og at overskydende vandingsvæske drypper ud af den perforerede afløbsprop i den grønne beholder. Fjern det uforstyrrede stik fra den grønne beholder og lad vandet løbe helt ud.Sæt derefter stikket ud. Åbn eksperimentfanen, og klik på Mål komponenter under det nye eksperiment. Når du har bekræftet målingen, skal du klikke på Målobjekt under måleplanets parametre.Når du har klikket gennem postvægtene og Delta-tagvinduerne, skal du navngive de nye metatags som cast-pre og klikke på Udfør. Klik på OK, når vinduet med registrering af vægten vises. Tag forsigtigt afstøbningerne ud fra gryderne.Klik på Mål komponenter og bekræft derefter målingen som før. Klik på Målobjekt under målplanparametre. Klik på Næste, når vinduet med posttykkelser vises.Vælg cast-pre i metatags for at trække sektionen fra, og klik på Næste. I tagpostvinduet skal du navngive det nye metatag som cast-post og klikke på Udfør. Klik på planter på venstre side og sørg for, at værdierne er opdateret.I anlæggets bord skal du manuelt opdatere tårevægten med vægten af de forberedte tomme potter taget manuelt. Klik på Målér komponenter, og bekræft målingen. Under måleplan parametre, skal du klikke på Mål jord våd vægt.Klik på OK, når der vises et lille vindue for at få bekræftet det. Klik på Planter og kontrollere, at værdierne er opdateret. Manuelt måle den gennemsnitlige vægt på fem til 10 hulrum fyldt jord, der er godt vandede og godt drænet uden planter.Igen skal du klikke på Målér komponenter og bekræfte målingen. Klik på Set Planter bulk jord vægt. Når et lille vindue popper op indtaste den gennemsnitlige vægt af jorden bulk og klik på OK. Klik på Planter og kontrollere, at værdierne er opdateret.Vend tilbage for at måle anlægsparametre, og klik på Mål plantens oprindelige nettovægt. Vælg angiv ny post som anlægsnedvægtsreferencepunkt i kodepostvinduet, og klik på Udfør. Klik på OK, når vægten er registreret korrekt vindue popper op, skal du klikke på Planter og kontrollere, at værdierne er opdateret.Sørg for, at frøplanterne i hulrumsbakkerne er godt vandede, træk forsigtigt frøplanterne med deres rødder jordprop fra hulrummene, idet du sørger for ikke at skade dem. Og læg dem omhyggeligt ind i hulrum lavet af kaster i potterne. Plantens nettovægtmåling gentages som tidligere beskrevet i metatagsmålingen.Hvis du vil overveje reservevand i den grønne beholder, skal du følge anvisningerne i tekstmanuskriptet for at sikre, at kornbeholderen er fuld. Vend tilbage for at måle planparametre, og klik på Målér reservevandsvægt. Klik på OK, når reserven vand vægt og succes vinduer dukker op.Klik på Planter og eksportere tabellen ved at klikke eksport planter i nederste venstre hjørne af bordet. Åbn Excel-filen, og træk den målte plantenedstrede vægt og såvægt af bulkjord fra den reserverede vandvægtmåling, og gem. Klik på Opdater planter i nederste venstre hjørne af bordet.Vælg Excel-filen, og klik på Åbn for at opdatere. Når vinduet Update Plants popper op, skal du klikke på OK. Kontroller, at værdierne opdateres. Under måle plante parametre, skal du klikke på Beregn jordtørvægt.Når vinduet popper op, indsætte jord våd vægt og jord tør vægt, eller indsætte manuelt beregnet jordvandsindhold. Klik på Anvend, og klik derefter på Udfør. Når et vindue popper op, skal du klikke på OK for at bekræfte.Følg tekstmanuskriptet for at beregne værdien for jordvandsindhold. Åbn vandingsbehandlinger, og klik på Opret ny, og sæt navnet, og klik på OK. Åbn den nye kunstvanding navn og klik på Opret ny. Åbn derefter standardbehandlingsplanen, indstil ventilåbningstiden og andre parametre efter behov, og klik på Anvend.Dette viser et dynamisk og modulerende vandingsbehandlingsscenarie for hele forsøgsperioden baseret på brugerpræferencer. Åbn behandlingsscenarier, åbn plan, og klik på standardplannavnet. Vælg et behandlingsnavn på listen, og klik på OK for at bekræfte.Vælg de relevante betingelser for opsigelse, og klik på Anvend. Alle muligheder omfatter en timeoutindstilling, der lukker hanen, selvom de akludede betingelser ikke er nået. Endelig skal du følge manuskriptanvisninger for at færdiggøre planens bord.Åbn dataanalysesoftwaren, og log ind med dit brugernavn og din adgangskode. Klik på Vælg eksperiment og derefter på vælg kontrolsystem og vælg eksperiment. Klik på Eksperimenter i venstre side af skærmen, og skriv navnet på eksperimentet på navnelinjen under søgesektionen.Navnet på eksperimentet vises derefter under søgesektionen i eksperimentsektionen. Klik på eksperimentnavnet for at åbne info og plantens sektioner. Rediger WUE-start- og WUE-slutdatoerne i infosektionen for perioden på mindst tre dage før tørkebehandlingens start.Klik derefter på Opdater. WUE og R kvadrerede værdi for hver pot vises eller opdateres i anlægssektionen. I plantesektionen skal du vælge eller udelade en plante eller pot med en negativ WUE-værdi eller en R-kvadreret værdi på mindre end 0,5.Ved at klikke på øjensymbolet under den aktive kolonne, som derefter bliver rød. WUE-dataene kan eksporteres som en Excel-fil ved at klikke på Eksporter data i anlægssektionen. Miljøforholdene blev overvåget under hele forsøget af en atmosfærisk sonde.De indsamlede data, viser fotosyntese aktivt stråling og damptryk underskud for forskellige dage. Og i løbet af hver dag. Det volumetriske vandindhold i de tørkebehandlede potter blev målt ved jordsonder i hele forsøgsperioden.Data indsamlet fra en tørke behandlet indica plante er vist her. Den gennemsnitlige beregnede plantevægt stiger konsekvent blandt både karla-kontrol- og karla-tørkebehandlingerne i første fase af forsøget, hvor alle planterne fik lignende kunstvanding. Når tørken behandling blev anvendt på karla planter, disse planter holdt op med at tage på i vægt ikke genoptage tager på i vægt, indtil inddrivelse fase.På det tidspunkt var der en stigning i vægt, der gik langsommere end hvad der blev observeret for kontrollerne. I modsætning hertil steg karla-kontrolanlæggenes vægt kontinuerligt i hele forsøgsperioden. Andre metoder som prøvesamling for genekspression, mineralindhold og fotosyntetisk aktivitet kan udføres under dette forsøg med en præcis henvisning til plantens adfærd og miljøforhold.Funktionel fænotypebestemmelse er en praktisk plantemiljøinteraktionskarakteriseringsmetode, som giver brugeren et godt værktøj til at sammenligne forskellige anlægsresponsprofiler under forskellige omgivende forhold. Hver specifik profil kunne vælges til dybere undersøgelse eller som en kilde til gavnlige fysiologiske træk for avlsprogrammer.

Research

JoVE Journal

Environment

A Telemetric, Gravimetric Platform for Real-Time Physiological Phenotyping of Plant&ndash;Environment Interactions

Transient Gene Expression in Tobacco using Gibson Assembly and the Gene Gun

Forbigående genekspression i Tobacco hjælp Gibson forsamling og Gene Gun

In order to target a single protein to multiple subcellular organelles, plants typically duplicate the relevant genes, and express each gene separately ...

Physical, Chemical and Biological Characterization of Six Biochars Produced for the Remediation of Contaminated Sites

Fysisk, kemisk og biologisk karakterisering af Six Biochars produceret til rensning af forurenede industrigrunde

The physical and chemical properties of biochar vary based on feedstock sources and production conditions, making it possible to engineer biochars with ...

LC-MS Analysis of Human Platelets as a Platform for Studying Mitochondrial Metabolism

LC-MS analyse af humane blodplader som en platform for at studere Mitokondriel Metabolism

Perturbed mitochondrial metabolism has received renewed interest as playing a causative role in a range of diseases. Probing alterations to metabolic ...

Simultaneous DNA-RNA Extraction from Coastal Sediments and Quantification of 16S rRNA Genes and Transcripts by Real-time PCR

Samtidig DNA-RNA-ekstraktion fra kystsedimenter og kvantificering af 16S rRNA-generne og udskrifter af Real-time PCR

Real Time Polymerase Chain Reaction also known as quantitative PCR (q-PCR) is a widely used tool in microbial ecology to quantify gene abundances of ...

Screening for Endocrine Activity in Water Using Commercially-available In Vitro Transactivation Bioassays

Screening for Endocrine Activity in Water Using Commercially-available In Vitro Transactivation Bioassays

Screening for endokrine aktivitet i vand Brug Kommercielt tilgængelig<em&gt; In vitro</em&gt; Transaktivering Bioassays

In vitro transactivation bioassays have shown promise as water quality monitoring tools, however their adoption and widespread application has been ...

Experimental Column Setup for Studying Anaerobic Biogeochemical Interactions Between Iron (Oxy)Hydroxides, Trace Elements, and Bacteria

Experimental Column Setup for Studying Anaerobic Biogeochemical Interactions Between Iron OxyHydroxides, Trace Elements, and Bacteria

Eksperimentelle kolonne Setup for at studere anaerob biogeokemiske interaktioner mellem jernhydroxider (Oxy), sporstoffer og bakterier

Fate and speciation of trace elements (TEs), such as arsenic (As) and mercury (Hg), in aquifers are closely related to physio-chemical conditions, such as ...

RGB and Spectral Root Imaging for Plant Phenotyping and Physiological Research: Experimental Setup and Imaging Protocols

RGB og spektral Root tænkelig nemlig plante fænotyper og fysiologiske forskning: eksperimentel opsætning og Imaging protokoller

Better understanding of plant root dynamics is essential to improve resource use efficiency of agricultural systems and increase the resistance of crop ...

On-Site Molecular Detection of Soil-Borne Phytopathogens Using a Portable Real-Time PCR System

On-Site molekylær detektion af jord-bårne Phytopathogens ved hjælp af en bærbar Real-Time PCR System

On-site diagnosis of plant diseases can be a useful tool for growers for timely decisions enabling the earlier implementation of disease management ...

Ecosystem Fabrication (EcoFAB) Protocols for The Construction of Laboratory Ecosystems Designed to Study Plant-microbe Interactions

Ecosystem Fabrication EcoFAB Protocols for The Construction of Laboratory Ecosystems Designed to Study Plant-microbe Interactions

Økosystem fabrikation (EcoFAB) protokoller for byggeri Laboratory økosystemers designet til at studere plante-mikrobe interaktioner

Beneficial plant-microbe interactions offer a sustainable biological solution with the potential to boost low-input food and bioenergy production. A ...

Protocol for Acute and Chronic Ecotoxicity Testing of the Turquoise Killifish Nothobranchius furzeri

Protocol for Acute and Chronic Ecotoxicity Testing of the Turquoise Killifish Nothobranchius furzeri

Protokol for akut og kronisk Økotoksicitet afprøvning af turkis Killifish Nothobranchius furzeri

The killifish Nothobranchius furzeri is an emerging model organism in the field of ecotoxicology and its applicability in acute and chronic ecotoxicity ...