Name: quantification of cell-substrate adhesion area and cell shape distributions in mcf7 cell monolayers
Uploaded: 2020-06-24T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Quantification of Cell-Substrate Adhesion Area and Cell Shape Distributions in MCF7 Cell Monolayers at JoVE.com

Dit werk werd ondersteund door het Poolse National Science Center onder grant nr.

1. Voorbereidende stappen
<ol><li>Celzaaien om confluent monolagen te verkrijgen<ol>
<li>Vóór het zaaien, bestrijk de putten van een 4-putten kamer dia met collageen I (of andere ECM component van keuze). Voor collageen I coating, volg een commercieel protocol: https://www.sigmaaldrich.com/technical-documents/articles/biofiles/collagen-product-protocols.html bij een concentratie van 8 μg/cm2.</li>
		<li>Zaad 400.000 cellen tot een put van een 4-well kamer dia.</li>
		<li>Kweek de cellen 24 uur (of langer,...

<ol>
	<li>Li, D. S., Zimmermann, J., Levine, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modeling+closure+of+circular+wounds+through+coordinated+collective+motion.">Modeling closure of circular wounds through coordinated collective motion.</a> Search Results. 13 (1), 016006 (2016).</li><li>Ilina, O., Friedl, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanisms+of+collective+cell+migration+at+a+glance.">Mechanisms of collective cell migration at a glance.</a> Journal of Cell Science. 122, 3203-3208 (2009).</li><li>Ladoux, B., Mege, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanobiology+of+collective+cell+behaviours.">Mechanobiology of collective cell behaviours.</a> Nature Reviews Molecular Cell Biology. 18 (12), 743-757 (2017).</li><li>Stossi, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High+throughput+microscopy+identifies+bisphenol+AP,+a+bisphenol+A+analog,+as+a+novel+AR+down-regulator.">High throughput microscopy identifies bisphenol AP, a bisphenol A analog, as a novel AR down-regulator.</a> Oncotarget. 7 (13), 16962-16974 (2016).</li><li>Legland, D., Arganda-Carreras, I., Andrey, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MorphoLibJ:+integrated+library+and+plugins+for+mathematical+morphology+with+ImageJ.">MorphoLibJ: integrated library and plugins for mathematical morphology with ImageJ.</a> Bioinformatics. 32 (22), 3532-3534 (2016).</li><li>Balcerak, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HAX1+impact+on+collective+cell+migration,+cell+adhesion,+and+cell+shape+is+linked+to+the+regulation+of+actomyosin+contractility.">HAX1 impact on collective cell migration, cell adhesion, and cell shape is linked to the regulation of actomyosin contractility.</a> Molecular Biology of the Cell. 30 (25), 3024-3036 (2019).</li><li>Buskermolen, A. B. C., Kurniawan, N. A., Bouten, C. V. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+automated+quantitative+analysis+of+cell,+nucleus+and+focal+adhesion+morphology.">An automated quantitative analysis of cell, nucleus and focal adhesion morphology.</a> PLoS One. 13 (3), 0195201 (2018).</li><li>Fokkelman, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cellular+adhesome+screen+identifies+critical+modulators+of+focal+adhesion+dynamics,+cellular+traction+forces+and+cell+migration+behaviour.">Cellular adhesome screen identifies critical modulators of focal adhesion dynamics, cellular traction forces and cell migration behaviour.</a> Scientific Reports. 6, 31707 (2016).</li><li>Horzum, U., Ozdil, B., Pesen-Okvur, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Step-by-step+quantitative+analysis+of+focal+adhesions.">Step-by-step quantitative analysis of focal adhesions.</a> MethodsX. 1, 56-59 (2014).</li><li>Kim, D. H., Wirtz, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Focal+adhesion+size+uniquely+predicts+cell+migration.">Focal adhesion size uniquely predicts cell migration.</a> FASEB Journal. 27 (4), 1351-1361 (2013).</li><li>Pincus, Z., Theriot, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+quantitative+methods+for+cell-shape+analysis.">Comparison of quantitative methods for cell-shape analysis.</a> Journal of Microscopy. 227, 140-156 (2007).</li><li>Tsygankov, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=CellGeo:+a+computational+platform+for+the+analysis+of+shape+changes+in+cells+with+complex+geometries.">CellGeo: a computational platform for the analysis of shape changes in cells with complex geometries.</a> Journal of Cell Biology. 204 (3), 443-460 (2014).</li><li>Tiryaki, V. M., Adia-Nimuwa, U., Ayres, V. M., Ahmed, I., Shreiber, D. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Texture-based+segmentation+and+a+new+cell+shape+index+for+quantitative+analysis+of+cell+spreading+in+AFM+images.">Texture-based segmentation and a new cell shape index for quantitative analysis of cell spreading in AFM images.</a> Cytometry A. 87 (12), 1090-1100 (2015).</li><li>Tong, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+micropatterning+reveals+the+modulatory+effect+of+cell+shape+on+proliferation+through+intracellular+calcium+transients.">Cell micropatterning reveals the modulatory effect of cell shape on proliferation through intracellular calcium transients.</a> Biochimica et Biophysica Acta. 1864 (12), 2389-2401 (2017).</li><li>Vartanian, K. B., Kirkpatrick, S. J., Hanson, S. R., Hinds, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Endothelial+cell+cytoskeletal+alignment+independent+of+fluid+shear+stress+on+micropatterned+surfaces.">Endothelial cell cytoskeletal alignment independent of fluid shear stress on micropatterned surfaces.</a> Biochemical and Biophysical Research Communications. 371 (4), 787-792 (2008).</li></ol>

Celcel- en celsubstraathechting vormen inherente kenmerken van de epitheelcellen en spelen de cruciale rol in weefselmorfogenese en embriogenese. In volwassen weefsels is de juiste regulatie van mechanische eigenschappen van de cellaag cruciaal bij het handhaven van homeostase en het voorkomen van pathologische reacties zoals tumorprogressie en metastase. De grootte en het aantal brandpuntsverklevingen zijn afhankelijk van de sterkte van de hechting van het celsubstraat, terwijl de celvorm afhankelijk is van contractiele...

Epitheelcelmonolagen fungeren als een collectief waarin celcel- en celsubstraathechting en contractielkrachten en spanningen belangrijke parameters vertegenwoordigen en hun juiste evenwicht bijdraagt aan de algehele integriteit van eenheid1,2,3. Het beoordelen van deze parameters is dus een manier om de huidige status van de cellaag vast te stellen.
De twee hier beschreven methoden vertegenwoordigen een tweedimensionale analyse van de samenvloeiende monolagen van aanhangende, epitheelcellen (in dit geval MCF7 borstkankercellijn). De analyse wordt uitgevoerd met behulp van confocale afbeeldingen (enkele Z-segmenten) uit verschillende regio's op de Z-as; basaal gebied in de buurt van een substraat voor focale hechting (FA) metingen en apicale regio voor celvorm metingen. De gepresenteerde methoden zijn relatief eenvoudig en vereisen standaard laboratoriumtechnieken en open-source software. Confocale microscopie is voldoende voor dit protocol, dus het kan worden uitgevoerd zonder gebruik te maken van meer gespecialiseerde TIRF (Total Internal Reflection Fluorescentie) microscopie. Zo zou het protocol kunnen worden geïmplementeerd in een relatief standaard laboratoriumomgeving. Hoewel de nauwkeurigheid van de methoden beperkt is, kunnen ze basisverschillen in brandpuntshechting en celvorm onderscheiden.
Beide hier beschreven methoden bestaan uit de standaard experimentele procedures zoals celverlening, immunostaining, confocale beeldvorming en beeldanalyse uitgevoerd met ImageJ. Echter, elke beeldverwerking software met de juiste functies kan worden gebruikt. De gepresenteerde methoden kunnen veranderingen volgen en vergelijken die zijn veroorzaakt door farmacologische behandeling of minimale genetische modificatie. Het verkrijgen van bepaalde waarden wordt niet aanbevolen, vanwege de beperkte precisie van deze methoden. Twee geautomatiseerde macro's werden opgenomen, om de metingen van vele beelden te vergemakkelijken.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Alexa Fluor 594</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>A32740</td>
			<td>goat anti-rabbit, 1:500</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium chloride</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A9434</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BSA</td>
			<td>BioShop</td>
			<td>ALB001.500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Collagen from calf skin</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>C9791-10MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DAPI</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>D9542</td>
			<td>1:10000 (stock 1 mg/mL in H2O), nucleic acid staining</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DMEM + GlutaMAX, 1 g/L D-Glucose, Pyruvate</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>21885-025</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FBS</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>10270-136</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Junction plakoglobin</td>
			<td>Cell Signaling</td>
			<td>2309S</td>
			<td>rabbit, 1:400</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Laminar-flow cabinet class 2</td>
			<td>Alpina</td>
			<td></td>
			<td>standard equipment</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MCF7-basedHAX1KD cell line</td>
			<td>Cell line established in the National Institute of Oncology, Warsaw, described in Balcerak et al., 2019</td>
			<td></td>
			<td>MCF7 cell line withHAX1knockdown</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MCF7 cell line (CONTROL)</td>
			<td>ATCC</td>
			<td>ATCC HTB-22</td>
			<td>epithelial, adherent breast cancer cell line</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Olympus CK2 light microscope</td>
			<td>Olympus</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Paxillin</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>ab32084</td>
			<td>rabbit, 1:250, Y113</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PBS</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>10010023</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phalloidin-TRITC conjugate</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P1951</td>
			<td>1:400 (stock 5 mg/mL in DMSO), actin labeling</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PTX</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>T7402-1MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TBST &#8211; NaCl</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>S9888</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TBST &#8211; Trizma base</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>T1503</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triton X-100</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>9002-93-11</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Zeiss LSM800 Confocal microscope</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

quantification of cell-substrate adhesion area and cell shape distributions in mcf7 cell monolayers

De hier gepresenteerde methoden kwantificeren enkele parameters van aanhangende celmonolagen van meerdere op de juiste wijze vastgehouden confocale afbeeldingen: hechting aan het substraat als functie van het aantal en de grootte van focale verklevingen en celvorm, gekenmerkt door de celvormindex en andere vormbeschrijvingen. Focale verklevingen werden gevisualiseerd door paxilline kleuring en cel-cel grenzen werden gekenmerkt door knooppunt plakoglobine en actin. De methoden voor celkweek en kleuring waren standaard; afbeeldingen vertegenwoordigen afzonderlijke brandpuntsvlakken; beeldanalyse werd uitgevoerd met behulp van openbaar beschikbare software voor beeldverwerking. De gepresenteerde protocollen worden gebruikt om het aantal en de grootte van focale verklevingen en de verschillen in celvormverdeling in de monolagen te kwantificeren, maar ze kunnen opnieuw worden gebruikt voor de kwantificering van de grootte en vorm van een andere afzonderlijke cellulaire structuur die kan worden gekleurd (bijvoorbeeld mitochondriën of kernen). Het beoordelen van deze parameters is belangrijk bij de karakterisering van de dynamische krachten in de hechtende cellaag, inclusief celhechting en actomyosinecontractiliteit die de celvorm beïnvloedt.

Focale adhesieanalyse De knockdown van het HAX1-gen bleek eerder van invloed te zijn op focale verklevingen6. Cellen werden gekweekt op collageen I-gecoate oppervlak voor 48 uur. Beelden van de MCF7 controlecellen en MCF7 cellen met een HAX1 knockdown(HAX1 KD) van drie onafhankelijke experimenten gekleurd met focale adhesie eiwit paxilline werden verkregen met behulp van een confocale microscoop (afbeelding van single focal plane / Z-slice basale regi...

Watch this Scientific Journal Video about Quantification of Cell-Substrate Adhesion Area and Cell Shape Distributions in MCF7 Cell Monolayers at JoVE.com

Quantification of Cell-Substrate Adhesion Area and Cell Shape Distributions in MCF7 Cell Monolayers

Het artikel beschrijft kwantificering van 1) de grootte en het aantal focale verklevingen en 2) celvormindex en de verdeling ervan van confocale beelden van de confluent monolagen van MCF7-cellen.

Kwantificering van celsubstraatadhesiegebied en celvormverdelingen in MCF7-celmonolagen

The methods presented here quantify some parameters of confluent adherent cell monolayers from multiple appropriately stained confocal images: adhesion to ...

Dit protocol maakt kwantificering van het gebied, de omtrek en de vorm van intracellulaire structuur van het tweedimensionale beeld mogelijk. Deze techniek is snel en eenvoudig, vereist alleen standaard laboratoriuminstellingen en een confocale microscoop en maakt gebruik van opensource software. Het aantonen van de procedure zal Anna Balcerak zijn, een promovendus uit mijn laboratorium.Begin met het zaaien van vier keer 10 tot de vijfde cellen in 0,5 milliliter cultuurmedium per put in een vier-goed collageen een gecoate kamer dia voor een 24-uurs cultuur in een 37 graden Celsius en vijf graden kooldioxide incubator. De volgende ochtend, gebruik maken van een optische omgekeerde microscoop om de aanwezigheid van ten minste 90% confluent monolayer te verifiëren en gebruik een confocale microscoop om enkele Z-slice beelden te verkrijgen. Open de afbeeldingen in ImageJ voor analyse van focale hechtingen en selecteer analyseren, schaal instellen, schaal verwijderen en globaal om de afbeeldingsschaal in pixels in te stellen.Als u de bestandsnaam en het gebied van het gebied van belang wilt opnemen in de meetopties, klikt u op metingen analyseren en instellen en controleert u het gebied en de weergavelabelopties. Als u de achtergrond wilt aftrekken, selecteert u proces en trekt u de achtergrond af. Stel de rolballenstraal in op 50 pixels en controleer de glijdende paraboloïde.Als u het gebied van het kleinste interessegebied wilt bepalen, schetst u de kleinste brandpuntshechting en klikt u op analyseren en meten om het gebied te meten. Wanneer ten minste 20 regio's van belang zijn geselecteerd en gemeten, berekent en bewaart u het gemiddelde van de verkregen resultaten. Stel de bovengrens in op 25% van een typisch celgebied.Als u de afbeelding wilt overleggen aan binair, klikt u op afbeelding, past u deze aan en drempelwaarden en controleert u de standaard-, zwart-wit- en donkere achtergrond. Als u het aantal en de gebieden van de interessegebieden wilt meten, selecteert u deeltjes analyseren en analyseren en pixeleenheden controleren, resultaten weergeven, resultaten wissen en samenvatten. Breng de gegevens van het segment, het aantal en de totale gemiddelde grootte van het gebied over van het overzichtsvenster naar het programma voor gegevensbeheer naar keuze.Open voor focale adhesie kwantificering de focale adhesie ImageJ macro en betreed het gebied van het kleinste gebied van belang als het gebied van de kleinste parameter regio van belang. Stel de waarde van het drempeltype in op handmatig of automatisch en sla de wijzigingen op. Bel vervolgens de macro van ImageJ en selecteer de afbeelding die moet worden verwerkt.Open een afbeelding in een geschikt softwareprogramma voor beeldverwerking en selecteer de te meten parameters voor handmatige celvormanalyse. Gebruik het gereedschap keuze uit de vrije hand om de celranden handmatig af te bakenen, zoals aangegeven door de knooppunteiwitten naar keuze. De gekozen parameters worden automatisch berekend voor elke cel.Wanneer alle cellen zijn beschreven, selecteert u bewerken, selecteren en toevoegen aan manager. Alleen volledig zichtbare cellen met ononderbroken randen moeten worden geselecteerd. Als u de meting wilt maken, markeert u alle getallen die in het linkervak van de regio van belangbeheerder worden weergegeven en klikt u op meten.De resultaten worden weergegeven in het vak resultaten en kunnen worden geïmporteerd naar de spreadsheet naar keuze. Geautomatiseerde celanalyse vergemakkelijkt kwantificering van het grote aantal cellen. Voer voor elk nieuw celtype eerst de macro uit om parameters vast te stellen.Wanneer de macro is voltooid, selecteert u celgroottegrenzen instellen. Klik op het label van de kleinste en grootste cellen en klik op meten. Stel de waarde in van de kleinste cel en de grootste celvariabelen en sla de wijzigingen op.Sluit alle macrovensters en selecteer de afbeelding die in grijswaarden moet worden verwerkt. Voer vervolgens de macro opnieuw uit. De macro bevat een tabel met de resultaten die de lijstgegevens van de celvorm, de aspectratio en de gebieden van renteselecties bevat.Hier kunnen representatieve afbeeldingen van brandpuntsverklevingen worden geteld met ImageJ, inclusief de uiteindelijke genummerde contouren en de overlays van de brandpuntshechtingsoverzichten met de oorspronkelijke afbeelding voor zowel de controle- als knockdowncellijnen. Zoals geïllustreerd in deze analyse, de knockdown cellen aangetoond een hoger aantal verklevingen per cel, alsmede verklevingen die groter zijn in omvang in vergelijking met controle cellijncellen. In deze beelden worden representatieve gebieden van onbehandelde en chemotherapeutisch behandelde celmonolagen getoond.De overzichtscellen werden gekenmerkt op basis van hun celvormindexwaarden, bijvoorbeeld in deze analyse die een toename van de laatste opslaglocatie en een afvlakking van de belangrijkste pieken voor de met geneesmiddelen behandelde cellen in vergelijking met onbehandelde controles weergeeft. Een frequentieverdeling en cumulatieve verdeling kunnen dan worden gegenereerd voor elke celcultuur. Grijswaarden beeldvorming van de monolagen zoals aangetoond toegestaan de analyse en kwantificering van 512 cellen uit 12 velden van mening onthullen een relatieve frequentie verdeling van de celvorm index.Om dit protocol te laten werken, is het belangrijk om afbeeldingen van de best mogelijke kwaliteit te gebruiken. Goede celzaaien, vlekken en beeldvorming moeten zorgen voor beelden van voldoende experimentele kwaliteit.

Research

JoVE Journal

Biology

Dissection of Organizer and Animal Pole Explants from Xenopus laevis Embryos and Assembly of a Cell Adhesion Assay

Ontleding van Organisator en dierlijke Pole Explantaten van Xenopus laevis embryo&#39;s en montage van een Celadhesie Assay

Video Bioinformatics Analysis of Human Embryonic Stem Cell Colony Growth

Video Bioinformatica Analyse van menselijke embryonale stamcellen Colony Growth

Because video data are complex and are comprised of many images, mining information from video material is difficult to do without the aid of computer ...

In situ Quantification of Pancreatic Beta-cell Mass in Mice

In situ Quantification of Pancreatic Beta-cell Mass in Mice

In situ kwantificering van beta-celmassa in Muizen

Tracing changes of specific cell populations in health and disease is an important goal of biomedical research. The process of monitoring pancreatic ...

Imaging Cell Shape Change in Living Drosophila Embryos

Imaging Cell Shape Change in Living Drosophila Embryos

Imaging Cel Vorm wijzigen in Living Drosophila Embryo&#39;s

The developing Drosophila melanogaster embryo undergoes a number of cell shape changes that are highly amenable to live confocal imaging.  Cell shape ...

Mechanical Stimulation-induced Calcium Wave Propagation in Cell Monolayers: The Example of Bovine Corneal Endothelial Cells

Mechanische stimulatie geïnduceerde Calcium golfvoortplanting in celmonolagen: Het voorbeeld van Bovine corneale endotheelcellen

Intercellular communication is essential for the coordination of physiological processes between cells in a variety of organs and tissues, including the ...

High Resolution Quantification of Crystalline Cellulose Accumulation in Arabidopsis Roots to Monitor Tissue-specific Cell Wall Modifications

High Resolution Quantification of Crystalline Cellulose Accumulation in Arabidopsis Roots to Monitor Tissue-specific Cell Wall Modifications

Hoge resolutie Kwantificering van kristallijne cellulose accumulatie in<em&gt; Arabidopsis</em&gt; Roots aan Tissue-specifieke celwand Wijzigingen Monitor

Plant cells are surrounded by a cell wall, the composition of which determines their final size and shape. The cell wall is composed of a complex matrix ...

Analyzing Cell Surface Adhesion Remodeling in Response to Mechanical Tension Using Magnetic Beads

Het analyseren van de celoppervlakadhesie remodeling in reactie op mechanische spanning met behulp van Magnetic Beads

Mechanosensitive cell surface adhesion complexes allow cells to sense the mechanical properties of their surroundings. Recent studies have identified both ...

Quantification of Interbacterial Competition using Single-Cell Fluorescence Imaging

Kwantificering van interbacteriële concurrentie met behulp van single-cell fluorescentiebeeldvorming

Interbacterial competition can directly impact the structure and function of microbiomes. This work describes a fluorescence microscopy approach that can ...

Automating Aggregate Quantification in Caenorhabditis elegans

Automating Aggregate Quantification in Caenorhabditis elegans

Aggregaatkwantificering automatiseren bij Caenorhabditis elegans

A rise in the prevalence of neurodegenerative protein conformational diseases (PCDs) has fostered a great interest in this subject over the years. This ...