Name: quantification of cell-substrate adhesion area and cell shape distributions in mcf7 cell monolayers
Uploaded: 2020-06-24T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Quantification of Cell-Substrate Adhesion Area and Cell Shape Distributions in MCF7 Cell Monolayers at JoVE.com

עבודה זו נתמכת על ידי המרכז הלאומי למדע הפולני תחת מענק מס ' 2014/14/M/NZ1/00437.

1. צעדי הכנה
<ol><li>זריעת תאים להשגת מונאולאיירס שוטפת<ol>
<li>לפני הזריעה, העילו את הבארות של שקופית קאמרית של 4 בארות עם קולגן I (או רכיב ECM אחר של בחירה). עבור קולגן אני ציפוי, בצע פרוטוקול מסחרי: https://www.sigmaaldrich.com/technical-documents/articles/biofiles/collagen-product-protocols.html בריכוז של 8 μg/cm2.</li>
		<li>הזרע 400,000 תאים לאחד...

<ol>
	<li>Li, D. S., Zimmermann, J., Levine, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modeling+closure+of+circular+wounds+through+coordinated+collective+motion.">Modeling closure of circular wounds through coordinated collective motion.</a> Search Results. 13 (1), 016006 (2016).</li><li>Ilina, O., Friedl, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanisms+of+collective+cell+migration+at+a+glance.">Mechanisms of collective cell migration at a glance.</a> Journal of Cell Science. 122, 3203-3208 (2009).</li><li>Ladoux, B., Mege, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanobiology+of+collective+cell+behaviours.">Mechanobiology of collective cell behaviours.</a> Nature Reviews Molecular Cell Biology. 18 (12), 743-757 (2017).</li><li>Stossi, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High+throughput+microscopy+identifies+bisphenol+AP,+a+bisphenol+A+analog,+as+a+novel+AR+down-regulator.">High throughput microscopy identifies bisphenol AP, a bisphenol A analog, as a novel AR down-regulator.</a> Oncotarget. 7 (13), 16962-16974 (2016).</li><li>Legland, D., Arganda-Carreras, I., Andrey, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MorphoLibJ:+integrated+library+and+plugins+for+mathematical+morphology+with+ImageJ.">MorphoLibJ: integrated library and plugins for mathematical morphology with ImageJ.</a> Bioinformatics. 32 (22), 3532-3534 (2016).</li><li>Balcerak, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HAX1+impact+on+collective+cell+migration,+cell+adhesion,+and+cell+shape+is+linked+to+the+regulation+of+actomyosin+contractility.">HAX1 impact on collective cell migration, cell adhesion, and cell shape is linked to the regulation of actomyosin contractility.</a> Molecular Biology of the Cell. 30 (25), 3024-3036 (2019).</li><li>Buskermolen, A. B. C., Kurniawan, N. A., Bouten, C. V. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+automated+quantitative+analysis+of+cell,+nucleus+and+focal+adhesion+morphology.">An automated quantitative analysis of cell, nucleus and focal adhesion morphology.</a> PLoS One. 13 (3), 0195201 (2018).</li><li>Fokkelman, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cellular+adhesome+screen+identifies+critical+modulators+of+focal+adhesion+dynamics,+cellular+traction+forces+and+cell+migration+behaviour.">Cellular adhesome screen identifies critical modulators of focal adhesion dynamics, cellular traction forces and cell migration behaviour.</a> Scientific Reports. 6, 31707 (2016).</li><li>Horzum, U., Ozdil, B., Pesen-Okvur, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Step-by-step+quantitative+analysis+of+focal+adhesions.">Step-by-step quantitative analysis of focal adhesions.</a> MethodsX. 1, 56-59 (2014).</li><li>Kim, D. H., Wirtz, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Focal+adhesion+size+uniquely+predicts+cell+migration.">Focal adhesion size uniquely predicts cell migration.</a> FASEB Journal. 27 (4), 1351-1361 (2013).</li><li>Pincus, Z., Theriot, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+quantitative+methods+for+cell-shape+analysis.">Comparison of quantitative methods for cell-shape analysis.</a> Journal of Microscopy. 227, 140-156 (2007).</li><li>Tsygankov, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=CellGeo:+a+computational+platform+for+the+analysis+of+shape+changes+in+cells+with+complex+geometries.">CellGeo: a computational platform for the analysis of shape changes in cells with complex geometries.</a> Journal of Cell Biology. 204 (3), 443-460 (2014).</li><li>Tiryaki, V. M., Adia-Nimuwa, U., Ayres, V. M., Ahmed, I., Shreiber, D. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Texture-based+segmentation+and+a+new+cell+shape+index+for+quantitative+analysis+of+cell+spreading+in+AFM+images.">Texture-based segmentation and a new cell shape index for quantitative analysis of cell spreading in AFM images.</a> Cytometry A. 87 (12), 1090-1100 (2015).</li><li>Tong, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+micropatterning+reveals+the+modulatory+effect+of+cell+shape+on+proliferation+through+intracellular+calcium+transients.">Cell micropatterning reveals the modulatory effect of cell shape on proliferation through intracellular calcium transients.</a> Biochimica et Biophysica Acta. 1864 (12), 2389-2401 (2017).</li><li>Vartanian, K. B., Kirkpatrick, S. J., Hanson, S. R., Hinds, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Endothelial+cell+cytoskeletal+alignment+independent+of+fluid+shear+stress+on+micropatterned+surfaces.">Endothelial cell cytoskeletal alignment independent of fluid shear stress on micropatterned surfaces.</a> Biochemical and Biophysical Research Communications. 371 (4), 787-792 (2008).</li></ol>

תא תא ותא הדבקה של תא מהווים תכונות הטבועה של התאים אפיתל לשחק את התפקיד הקריטי ברקמות מורפולגנזה ו embriogenesis. ברקמות למבוגרים את הרגולציה הנכונה של תכונות מכניות של שכבת התא היא חיונית לשמירה על הומאוסטזיס ומניעת תגובות פתולוגיים כמו התקדמות הגידול גרורות. הגודל והמספר של הידקויות מיקוד ת?...

תאי אפיתל monolayers לפעול כקולקטיב שבו תא תא ותא הדבקה, כמו גם כוחות ומתחים והמתיחות מייצגים פרמטרים חשובים האיזון הנכון שלהם תורמת השלמות הכוללת של היחידה1,2,3. לפיכך, הערכת פרמטרים אלה מייצגת דרך ליצירת המצב הנוכחי של שכבת התא.
שתי השיטות המתוארות כאן מייצגות ניתוח דו מימדי של המונאולאיירס הקונקולני של חסיד, תאי אפיתל (במקרה זה MCF7 סרטן השד קו התאים). הניתוח מבוצע באמצעות תמונות מיקוד (Z-פרוסות בודדות) מאזורים שונים על ציר Z; אזור בסיס ליד מצע למדידות מיקוד (FA) ולאזור אפיפיורי למדידות בצורת תא. השיטות המוצגות פשוטות יחסית ודורשות טכניקות סטנדרטיות של מעבדה ותוכנות קוד פתוח. מיקרוסקופ confocal וקד מספיק עבור פרוטוקול זה, כך שניתן לבצע מבלי להעסיק TIRF מיוחדים יותר (כולל השתקפות פנימית השתקפויות פלואורסצנטית) מיקרוסקופ. לפיכך, ניתן ליישם את הפרוטוקול במסגרת מעבדה סטנדרטית יחסית. למרות שרמת הדיוק של השיטות מוגבלת, הם יכולים להבחין בין הבדלים בסיסיים בצורה מוקד ובצורת תא.
שתי השיטות המתוארות כאן כוללות את ההליכים הניסיוניים הסטנדרטיים כגון כגון תא, כתמים, דימות ממוקד וניתוח תמונה שבוצעו באמצעות ImageJ. עם זאת, ניתן להשתמש בכל תוכנה לעיבוד תמונה עם הפונקציות המתאימות. השיטות שהוצגו יכול לעקוב ולהשוות שינויים שנגרמו על ידי טיפול תרופתי או שינוי גנטי מינימלי. השגת ערכים מסוימים אינה מומלצת, בשל הדיוק המוגבל של שיטות אלה. שתי פקודות מאקרו אוטומטיות נכללו, כדי להקל על המדידות של תמונות רבות.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Alexa Fluor 594</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>A32740</td>
			<td>goat anti-rabbit, 1:500</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium chloride</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A9434</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BSA</td>
			<td>BioShop</td>
			<td>ALB001.500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Collagen from calf skin</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>C9791-10MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DAPI</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>D9542</td>
			<td>1:10000 (stock 1 mg/mL in H2O), nucleic acid staining</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DMEM + GlutaMAX, 1 g/L D-Glucose, Pyruvate</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>21885-025</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FBS</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>10270-136</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Junction plakoglobin</td>
			<td>Cell Signaling</td>
			<td>2309S</td>
			<td>rabbit, 1:400</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Laminar-flow cabinet class 2</td>
			<td>Alpina</td>
			<td></td>
			<td>standard equipment</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MCF7-basedHAX1KD cell line</td>
			<td>Cell line established in the National Institute of Oncology, Warsaw, described in Balcerak et al., 2019</td>
			<td></td>
			<td>MCF7 cell line withHAX1knockdown</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MCF7 cell line (CONTROL)</td>
			<td>ATCC</td>
			<td>ATCC HTB-22</td>
			<td>epithelial, adherent breast cancer cell line</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Olympus CK2 light microscope</td>
			<td>Olympus</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Paxillin</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>ab32084</td>
			<td>rabbit, 1:250, Y113</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PBS</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>10010023</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phalloidin-TRITC conjugate</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P1951</td>
			<td>1:400 (stock 5 mg/mL in DMSO), actin labeling</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PTX</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>T7402-1MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TBST &#8211; NaCl</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>S9888</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TBST &#8211; Trizma base</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>T1503</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triton X-100</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>9002-93-11</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Zeiss LSM800 Confocal microscope</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

quantification of cell-substrate adhesion area and cell shape distributions in mcf7 cell monolayers

השיטות המוצגות כאן מכמת כמה פרמטרים של תא מדומה מונואולאן מדומה מספר תמונות ויטראז ' מרובים: הדבקה למצע כפונקציה של מספר וגודל של מיקוד מוקד, וצורה תא, מאופיין על ידי מדד צורת התא ומתארי צורה אחרים. הידקויות מיקוד היו מדמיינו על ידי כתמים פקעבלין וגבולות תא התא סומנו על ידי הצומת פלקוטין ו actin. השיטות לתרבית תאים וכתמים היו סטנדרטיים; תמונות מייצגות מטוסי מוקד יחידים; ניתוח תמונה בוצעה באמצעות תוכנת עיבוד תמונה זמינה לציבור. הפרוטוקולים המוצגים משמשים כדי לכמת את מספר וגודל של הידקויות מיקוד ואת ההבדלים בפיזור הצורה התא ב monolayers, אבל הם יכולים להיות מחדש עבור כימות של גודל וצורה של כל מבנה הסלולר ברורים אחרים, כי יכול להיות מוכתם (למשל, המיטוa או גרעיני). הערכת פרמטרים אלה חשובה באפיון הכוחות הדינמיים בשכבת התא החסיד, כולל הדבקה בתאים וכיוונון actomyosin המשפיע על צורת התא.

ניתוח הדבקה מוקד הנוק-אין HAX1 ג'ין הוצגה בעבר כדי להשפיע על הידקויות מיקוד6. תאים היו מתורבתים על משטח קולגן I-מצופה עבור 48 h. תמונות של תאים בקרה MCF7 ותאים MCF7 עם מיקוד HAX1 (HAX1 KD) מתוך שלושה ניסויים עצמאיים ויטראז ' מוקד הדבקה ממוקד חלבון מושגת באמצעות מיקרוס?...

Watch this Scientific Journal Video about Quantification of Cell-Substrate Adhesion Area and Cell Shape Distributions in MCF7 Cell Monolayers at JoVE.com

Quantification of Cell-Substrate Adhesion Area and Cell Shape Distributions in MCF7 Cell Monolayers

המאמר מתאר את הכמת של 1) את גודל ומספר של הידעיות מיקוד ו 2) אינדקס צורת תא ואת ההתפלגות שלה מתוך תמונות קונפוקלית וקד של המונאולאיירס הקונאולית של תאים MCF7.

קוונפיקציה של אזור הדבקה בתשתית התא והפצות צורות התא ב-MCF7 Cell Monolayers

The methods presented here quantify some parameters of confluent adherent cell monolayers from multiple appropriately stained confocal images: adhesion to ...

פרוטוקול זה מאפשר כימות של האזור, ההיקף והצורה של מבנה תאי מהתמונה הדו-ממדית שלו. טכניקה זו מהירה וקלה, דורשת רק הגדרות מעבדה סטנדרטיות ומיקרוסקופ קונפוקל ומשתמשת בתוכנת opensource. הפגנת ההליך תהיה אנה Balcerak, דוקטורנט מהמעבדה שלי.התחל על ידי זריעת ארבע פעמים 10 לתאים החמישיים ב 0.5 מיליליטר של תרבות בינונית לגם בשקופית תא מצופה ארבע באר אחד לתרבות של 24 שעות ביממה ב 37 מעלות צלזיוס וחמש מעלות פחמן דו חמצני אינקובטור. למחרת בבוקר, השתמש במיקרוסקופ אופטי הפוך כדי לאמת נוכחות של לפחות 90% מונוליאר קונפלונט ולהשתמש במיקרוסקופ קונפוקלי כדי להשיג תמונות בודדות של פרוסת Z. לניתוח הידבקות מוקד, פתחו את התמונות ב-ImageJ ובחרו לנתח, להגדיר קנה מידה, להסיר קנה מידה וגלובלי כדי להגדיר את סולם התמונה בפיקסלים.כדי לכלול את שם הקובץ ואת האזור של אזור העניין באפשרויות המדידה, לחץ על נתח והגדר מידות ובדוק את אפשרויות האזור והצג תוויות. לחסר את הרקע, בחרו 'עבד' ו'חיסור רקע'. הגדר את רדיוס הכדור המתגלגל ל- 50 פיקסלים ובדוק פרבולואיד הזזה.כדי לקבוע את האזור של האזור הקטן ביותר של עניין, מתאר את ההיתוך המוקד הבודד הקטן ביותר ולחץ לנתח ולמדוד כדי למדוד את האזור. כאשר לפחות 20 אזורי עניין נבחרו ונמדדו, חשב ושמור את ממוצע התוצאות שהתקבלו. הגדר את הגבול העליון ל- 25% מאזור תא טיפוסי.כדי להעניק את התמונה לתמונה בינארית, לחץ על תמונה, התאם סף ובדוק את ברירת המחדל, רקע שחור-לבן ורקע כהה. כדי למדוד את המספר ואת האזורים של אזורי העניין, בחר לנתח ולנתח חלקיקים ובדוק יחידות פיקסלים, הצג תוצאות, נקה תוצאות וסכם. העבר את נתוני הגודל הממוצע של הפרוסה, הספירה והגודל הממוצע הכולל מחלון הסיכום לתוכנית ניהול הנתונים הרצויה.עבור כימות הידבקות מוקד, פתח את המאקרו ImageJ הידבקות המוקד ולהיכנס לאזור של האזור הקטן ביותר של עניין כאזור של האזור הקטן ביותר של פרמטר עניין. הגדר את ערך סוג הסף כידני או אוטומטי ושמור את השינויים. לאחר מכן התקשר למאקרו מתוך ImageJ ובחר את התמונה לעיבוד.לניתוח ידני של צורת תא, פתח תמונה בתוכנה מתאימה לעיבוד תמונה ובחר את הפרמטרים שיש למדוד. השתמש בכלי הבחירה ביד חופשית כדי לסמן ידנית את גבולות התא כפי שהם מסומנים בחלבוני הצומת הנבחרים. הפרמטרים שנבחרו יחושבו באופן אוטומטי עבור כל תא.לאחר חלוקה לרמות של כל התאים, בחר עריכה, בחירה והוספה למנהל. יש לבחור רק תאים גלויים לחלוטין עם גבולות ללא הפרעה. כדי לבצע את המדידה, סמן את כל המספרים המופיעים בתיבה הימנית של מנהל אזור העניין ולחץ על מידה.התוצאות יופיעו בתיבת התוצאות ו ניתן לייבא אותן לגיליון האלקטרוני של הבחירה. ניתוח תאים אוטומטי מאפשר כימות של מספר התאים הגדול. עבור כל סוג תא חדש, הפעל תחילה את המאקרו כדי ליצור פרמטרים.לאחר סיום המאקרו, בחר הגדר גבולות גודל תא. לחץ על התווית של התאים הקטנים והגדולים ביותר ולחץ על מידה. הגדר את הערך של התא הקטן ביותר ומשתני התא הגדולים ביותר ושמור את השינויים.סגור את כל חלונות המאקרו ובחר את התמונה לעיבוד בגווני אפור. לאחר מכן הפעל שוב את המאקרו. המאקרו יספק טבלה של התוצאות הכוללות את נתוני הרשימה אינדקס צורת תא, יחס גובה-רוחב ואזורים של בחירות עניין.כאן, תמונות מייצגות של הידבקויות מוקד נספר עם ImageJ כולל קווי המתאר ממוספרים הסופיים ואת שכבות העל של קווי התווה הידבקות המוקד עם התמונה המקורית עבור שני קווי תא שליטה ו knockdown ניתן לראות. כפי שמודגם בניתוח זה, תאי ההפלה הדגימו מספר גבוה יותר של הידבקויות לכל תא, כמו גם הידבקויות שגודלן גדול יותר בהשוואה לתאי קו הבקרה. בתמונות אלה, אזורים מייצגים של מונואירים תאים לא מטופלים וכימותרפיים מוצגים.תאי החלוקה לרמות התאפיינו על פי ערכי מדד צורת התא שלהם, למשל בניתוח זה המראים עלייה בסל האחרון ושיטוח הפסגות העיקריות של התאים המטופלים בתרופה בהשוואה לפקדים לא מטופלים. לאחר מכן ניתן ליצור התפלגות תדירות והתפלגות מצטברת עבור כל תרבות תאים. הדמיה בגווני אפור של המונו-שכבות כפי שהוכח אפשרה ניתוח וכימות של 512 תאים מ-12 שדות תצוגה שחשפו התפלגות תדרים יחסית של אינדקס צורת התא.כדי שפרוטוקול זה יפעל, חשוב להשתמש בתמונות באיכות הטובה ביותר האפשרית. זריעת תאים נכונה, כתמים והדמיה צריכים להבטיח תמונות באיכות ניסיונית מספקת.

Research

JoVE Journal

Biology

Dissection of Organizer and Animal Pole Explants from Xenopus laevis Embryos and Assembly of a Cell Adhesion Assay

Dissection של ארגונית הקוטב Explants בעלי חיים מעוברים Xenopus laevis והרכבה של Assay הידבקות התא

Video Bioinformatics Analysis of Human Embryonic Stem Cell Colony Growth

וידאו ביואינפורמטיקה ניתוח גדילה אנושי בתאי גזע עובריים קולוני

Because video data are complex and are comprised of many images, mining information from video material is difficult to do without the aid of computer ...

In situ Quantification of Pancreatic Beta-cell Mass in Mice

In situ Quantification of Pancreatic Beta-cell Mass in Mice

ב כימות באתרו של המיסה הלבלב בטא תא עכברים

Tracing changes of specific cell populations in health and disease is an important goal of biomedical research. The process of monitoring pancreatic ...

Imaging Cell Shape Change in Living Drosophila Embryos

Imaging Cell Shape Change in Living Drosophila Embryos

צורה הדמיה תא שינוי חיים תסיסנית עוברים

The developing Drosophila melanogaster embryo undergoes a number of cell shape changes that are highly amenable to live confocal imaging.  Cell shape ...

Mechanical Stimulation-induced Calcium Wave Propagation in Cell Monolayers: The Example of Bovine Corneal Endothelial Cells

הרבייה מכאנית מושרה גירוי סיד גל בmonolayers הסלולרי: דוגמה לתאי אנדותל קרני שור

Intercellular communication is essential for the coordination of physiological processes between cells in a variety of organs and tissues, including the ...

High Resolution Quantification of Crystalline Cellulose Accumulation in Arabidopsis Roots to Monitor Tissue-specific Cell Wall Modifications

High Resolution Quantification of Crystalline Cellulose Accumulation in Arabidopsis Roots to Monitor Tissue-specific Cell Wall Modifications

כימות רזולוציה גבוהות של הצטברות צלולוזת גבישים ב<em&gt; ארבידופסיס</em&gt; שורשי לפקח סלולארי רקמות ספציפיות קיר שינויים

Plant cells are surrounded by a cell wall, the composition of which determines their final size and shape. The cell wall is composed of a complex matrix ...

Analyzing Cell Surface Adhesion Remodeling in Response to Mechanical Tension Using Magnetic Beads

ניתוח Cell Surface שיפוץ הדבקה בתגובה מתח מכני באמצעות חרוזים מגנטיים

Mechanosensitive cell surface adhesion complexes allow cells to sense the mechanical properties of their surroundings. Recent studies have identified both ...

Quantification of Interbacterial Competition using Single-Cell Fluorescence Imaging

כימות של תחרות בין-בקטריאלית באמצעות הדמיית פלואורסצנטיות חד-תאית

Interbacterial competition can directly impact the structure and function of microbiomes. This work describes a fluorescence microscopy approach that can ...

Automating Aggregate Quantification in Caenorhabditis elegans

Automating Aggregate Quantification in Caenorhabditis elegans

אוטומציה של כימות מצטבר ב - Caenorhabditis elegans

A rise in the prevalence of neurodegenerative protein conformational diseases (PCDs) has fostered a great interest in this subject over the years. This ...