Name: segmentation and linear measurement for body composition analysis using slice-o-matic and horos
Uploaded: 2021-03-21T13:00:00
Duration: 13 min 35 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Segmentation and Linear Measurement for Body Composition Analysis using Slice-O-Matic and Horos at JoVE.com

המחברים רוצים להכיר בתמיכתם של יסודות משפחת ג'ון רובינסון צ'רצ'יל.

<ol>
	<li>Psutka, S. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Decreased+skeletal+muscle+mass+is+associated+with+an+increased+risk+of+mortality+after+radical+nephrectomy+for+localized+renal+cell+cancer.">Decreased skeletal muscle mass is associated with an increased risk of mortality after radical nephrectomy for localized renal cell cancer.</a> The Journal of Urology. 195 (2), 270-276 (2016).</li><li>Fukushima, H., Nakanishi, Y., Kataoka, M., Tobisu, K., Koga, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prognostic+significance+of+sarcopenia+in+patients+with+metastatic+renal+cell+carcinoma.">Prognostic significance of sarcopenia in patients with metastatic renal cell carcinoma.</a> The Journal of Urology. 195 (1), 26-32 (2016).</li><li>Santilli, V., Bernetti, A., Mangone, M., Paoloni, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Clinical+definition+of+sarcopenia.">Clinical definition of sarcopenia.</a> Clinical Cases in Mineral and Bone Metabolism. 11 (3), 117-180 (2014).</li><li>Caan, B. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Association+of+muscle+and+adiposity+measured+by+computed+tomography+with+survival+in+patients+with+nonmetastatic+breast+cancer.">Association of muscle and adiposity measured by computed tomography with survival in patients with nonmetastatic breast cancer.</a> JAMA Oncology. 4 (6), 798-804 (2018).</li><li>Borga, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Advanced+body+composition+assessment:+from+body+mass+index+to+body+composition+profiling.">Advanced body composition assessment: from body mass index to body composition profiling.</a> Journal of Investigative Medicine. 66 (5), 1-9 (2018).</li><li>Cushen, S. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Body+composition+by+computed+tomography+as+a+predictor+of+toxicity+in+patients+with+renal+cell+carcinoma+treated+with+sunitinib.">Body composition by computed tomography as a predictor of toxicity in patients with renal cell carcinoma treated with sunitinib.</a> American Journal of Clinical Oncology. 40 (1), 47-52 (2017).</li><li>Bernstein, A. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+comparison+of+perinephric+fat+surface+area+and+Mayo+Adhesive+Probability+score+in+predicting+malignancy+in+T1+renal+masses.">A comparison of perinephric fat surface area and Mayo Adhesive Probability score in predicting malignancy in T1 renal masses.</a> Urologic Oncology. 36 (11), 417-499 (2018).</li><li>Auclin, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prediction+of+everolimus+toxicity+and+prognostic+value+of+skeletal+muscle+index+in+patients+with+metastatic+renal+cell+carcinoma.">Prediction of everolimus toxicity and prognostic value of skeletal muscle index in patients with metastatic renal cell carcinoma.</a> Clinical Genitourinary Cancer. 15 (3), 350-355 (2017).</li><li>Vashi, P. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sarcopenia+supersedes+subjective+global+assessment+as+a+predictor+of+survival+in+colorectal+cancer.">Sarcopenia supersedes subjective global assessment as a predictor of survival in colorectal cancer.</a> PLoS One. 14 (6), 0218761 (2019).</li><li>Elliott, J. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sarcopenia:+prevalence,+and+impact+on+operative+and+oncologic+outcomes+in+the+multimodal+management+of+locally+advanced+esophageal+cancer.">Sarcopenia: prevalence, and impact on operative and oncologic outcomes in the multimodal management of locally advanced esophageal cancer.</a> Annals of Surgery. 266 (5), 822-830 (2017).</li><li>Kanellakis, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+and+validation+of+a+bioelectrical+impedance+prediction+equation+estimating+fat+free+mass+in+Greek+-+Caucasian+adult+population.">Development and validation of a bioelectrical impedance prediction equation estimating fat free mass in Greek - Caucasian adult population.</a> Clinical Nutrition ESPEN. 36, 166-170 (2020).</li><li>Bredella, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+DXA+and+CT+in+the+assessment+of+body+composition+in+premenopausal+women+with+obesity+and+anorexia+nervosa.">Comparison of DXA and CT in the assessment of body composition in premenopausal women with obesity and anorexia nervosa.</a> Obesity (Silver Spring). 18 (11), 2227-2233 (2010).</li><li>Mourtzakis, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+practical+and+precise+approach+to+quantification+of+body+composition+in+cancer+patients+using+computed+tomography+images+acquired+during+routine+care.">A practical and precise approach to quantification of body composition in cancer patients using computed tomography images acquired during routine care.</a> Applied Physiology, Nutrition, and Metabolism. 33 (5), 997-1006 (2008).</li><li>Avrutin, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Clinically+practical+approach+for+screening+of+low+muscularity+using+electronic+linear+measures+on+computed+tomography+images+in+critically+ill+patients.">Clinically practical approach for screening of low muscularity using electronic linear measures on computed tomography images in critically ill patients.</a> JPEN. Journal of Parenteral and Enteral Nutrition. 42 (5), 885-891 (2018).</li><li>Cespedes Feliciano, E. M., Avrutin, E., Caan, B. J., Boroian, A., Mourtzakis, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Screening+for+low+muscularity+in+colorectal+cancer+patients:+a+valid,+clinic-friendly+approach+that+predicts+mortality.">Screening for low muscularity in colorectal cancer patients: a valid, clinic-friendly approach that predicts mortality.</a> Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle. 9 (5), 898-908 (2018).</li><li>Peng, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Impact+of+sarcopenia+on+outcomes+following+resection+of+pancreatic+adenocarcinoma.">Impact of sarcopenia on outcomes following resection of pancreatic adenocarcinoma.</a> Journal of Gastrointestinal Surgery. 16 (8), 1478-1486 (2012).</li><li>Jones, K. I., Doleman, B., Scott, S., Lund, J. N., Williams, J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Simple+psoas+cross-sectional+area+measurement+is+a+quick+and+easy+method+to+assess+sarcopenia+and+predicts+major+surgical+complications.">Simple psoas cross-sectional area measurement is a quick and easy method to assess sarcopenia and predicts major surgical complications.</a> Colorectal Disease. 17 (1), 20-26 (2015).</li><li>Prado, C. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sarcopenia+as+a+determinant+of+chemotherapy+toxicity+and+time+to+tumor+progression+in+metastatic+breast+cancer+patients+receiving+capecitabine+treatment.">Sarcopenia as a determinant of chemotherapy toxicity and time to tumor progression in metastatic breast cancer patients receiving capecitabine treatment.</a> Clinical Cancer Research. 15 (8), 2920-2926 (2009).</li><li>Fields, D. A., Goran, M. I., McCrory, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Body-composition+assessment+via+air-displacement+plethysmography+in+adults+and+children:+a+review.">Body-composition assessment via air-displacement plethysmography in adults and children: a review.</a> The American Journal of Clinical Nutrition. 75, 453-467 (2002).</li><li>Zopfs, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Single-slice+CT+measurements+allow+for+accurate+assessment+of+sarcopenia+and+body+composition.">Single-slice CT measurements allow for accurate assessment of sarcopenia and body composition.</a> European Radiology. 30 (3), 1701-1708 (2020).</li><li>Schwenzer, N. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+analysis+of+adipose+tissue+in+single+transverse+slices+for+estimation+of+volumes+of+relevant+fat+tissue+compartment.">Quantitative analysis of adipose tissue in single transverse slices for estimation of volumes of relevant fat tissue compartment.</a> Investigative Radiology. 45 (12), 788-794 (2010).</li><li>Baracos, V. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Psoas+as+a+sentinel+muscle+for+sarcopenia:+a+flawed+premise.">Psoas as a sentinel muscle for sarcopenia: a flawed premise.</a> Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle. 8 (4), 527-528 (2017).</li><li>Potretzke, A. M., Schmitz, K. H., Jensen, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preventing+overestimation+of+pixels+in+computed+tomography+assessment+of+visceral+fat.">Preventing overestimation of pixels in computed tomography assessment of visceral fat.</a> Obesity Research. 12 (10), 1698-1701 (2004).</li><li>Shen, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Total+body+skeletal+muscle+and+adipose+tissue+volumes:+estimation+from+a+single+abdominal+cross-sectional+image.">Total body skeletal muscle and adipose tissue volumes: estimation from a single abdominal cross-sectional image.</a> Journal of Applied Physiology. 97 (6), 2333-2338 (2004).</li><li>Weston, A. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Automated+abdominal+segmentation+of+CT+scans+for+body+composition+analysis+using+deep+learning.">Automated abdominal segmentation of CT scans for body composition analysis using deep learning.</a> Radiology. 290 (3), 669-679 (2019).</li></ol>

למחברים אין מה לחשוף.

שריר הפסואס, קבוצות השרירים הפרספינליים והשרירים האלכסוניים תואמים באופן הדוק עם מסת השריר הכוללת5. בפרט, שטח הפנים בתוך CT או MRI חתך רוחב של קבוצות שרירים אלה בנקודת האמצע של החוליה המותנית השלישית (L3) הוא בקורלציה גבוהה עם מסת שריר הכוללת, מה שהופך את התמונה הזאת אחד אידיאלי עבור חוקרים או רופאים להשתמש בעת הערכת סרקופניה1,2,13. פילוח ומדידות ליניאריות הוכיחו ערך רב בהערכת הרכב הגוף וזיהוי תנאים פרוגנוסטיים ירודים כגון סרקוזניה והשמנת יתר סרקופינית בחולים16,17. מחקרים הראו כי מדידות מסת שריר קשורות להישרדות וסיכונים לסיבוכים גדולים בעקבות ניתוחים גדולים או תוכניות טיפול כגון כימותרפיה ורעילותכימותרפית 16,17,18. לכן, היינו מניחים שזה עשוי להיות מועיל עבור רופאים יש נתוני הרכב הגוף לפני ייעוץ חולים לגבי אפשרויות הטיפול.
נכון לעכשיו, ישנן מספר שיטות להערכת הרכב הגוף. מספר שיטות, כגוןdensitometry 12 ו plethysmography תזוזת אוויר (ADP)19, לנצל את משקל האוויר ואת התזוזה, בהתאמה כדי להעריך את אחוז השומן בגוף ואת צפיפות הגוף. בעוד שיטות אלה יכולים להיות שימושיים, הם אינם מסוגלים לקבוע התפלגות רקמת שומן5,19. טכניקות אנליטיות אחרות להרכב הגוף, כגון BIA, מבססות את הניתוח שלהן על המאפיינים החשמליים השונים של מסת השומן ומסה נטולת שומן12. עם זאת, שוב טכניקה זו אינה מצליחה להעריך כראוי את התפלגות השומן, והיא גם דורשת מידע נוסף כגון מוצא אתני, גיל ומין למדידות מדויקות יותר19. לעומת זאת, הערכות כגון DEXA הוכחו להיות שימושי בהערכת הרכב הגוף, אבל יש נטייה להעריך יתר על המידה מסת שריר עם הגדלת אדיפוזיה12. מספר פרוטוקולים השתמשו גם בשיטת אזור העניין (ROI) כדי להשיג נתוני מסת שריר ורקמת שומן בתוכנה לצפייה ב- DICOM, אשר הוכח שיש לה מתאם טוב עם ניתוח הרכב הגוף של BIA להערכת סרקוזניה והערכה תזונתית20,21.
הליך פילוח שפותח על ידי Mourtzakis ואח 'יש יתרון על הערכות הרכב גוף חלופי שכן ניתן לעשות זאת על רוב תמונות CT או MRI וקובע במדויק הפצות רקמת שומן ואזור שריר13. בנוסף, פילוח צירי L3 יש את היתרון של דיוק ללא קשר למצב השמנת יתר של המטופל13. בדומה לחלופות הנ"ל, טכניקת האמצעים הליניאריים שפותחה על ידי אברוטין ואח'14 אינה כוללת את היכולת להעריך את התפלגות השומן. לאחרונה, חוקרים הוכיחו זלזול בפילוח הגוף, במיוחד בשיטות למדידת שרירי פסואס בלבד22. מסת שריר Psoas לבד אינו מייצג מאוד את כמות שריר המותני או בזבוז שריר שיטתי, ולא יכול להיות בקורלציה מאוד עם תוצאות קליניות22. בעיה זו עשויה להיות מדאיגה יותר במדידה ליניארית, כמו שריר פסואס היא קבוצת השרירים העיקרית בהערכה. עם זאת, הטכניקה המתוארת שלנו כוללת פסואס דו-צדדי והערכות שרירים paraspinal כדי לאמוד מדויק יותר, תוך הערכה מהירה ונוחה של מסת שריר חתך. מחקרים עתידיים המאמתים את ההסמכה בין מדידה ליניארית CT/MRI ושיטות פילוח לבין המתאם שלהם לתוצאות קליניות מוצדקים.
הן פילוח L3 והן הליכי מדידה ליניאריים תוכננו בתחילה כדי להעריך במהירות ובדייקנות את תכולת השרירים בכל הגוף. על ידי פילוח בחוליות L3 בלבד, הפרוטוקול חוסך זמן ועדיין מספק לחוקרים או לרופאים מספיק מידע כדי לקבוע את מסת השריר הרזה של המטופל ואת מצב השומן. עם זאת, למרות פילוח L3 לוקח הרבה פחות זמן מאשר פילוח גוף מלא, זה עדיין יכול להיות זמן רב ויקר להשתמש בתוכנה Slice-O-Matic. לעומת זאת, מדידות ליניאריות יש פוטנציאל להיות מדויק כמו פילוח L3 בהערכת מצב השריר סרקוזניה בחולים אנושים14,15. הדגמנו קשר כזה בקבוצת קרצינומה של תאי הכליה T3, שבה שריר השלד הנמדד על ידי מדידות ליניאריות מתואם באופן הדוק עם הערך הנמדד על ידי פילוח (איור 6). חשוב לציין, השיטה היא מהירה מאוד, ותוכנת ההדמיה היא בחינם. עם זאת, המגבלה הבולטת ביותר להליך המדידה הליניארית היא חוסר היכולת להעריך את תכולת רקמת השומן, מה שמגביל את המטפלים להקשרים שבהם מספיקה הערכה כללית של תכולת השרירים.
קיימים שלושה שלבים קריטיים הן בהליכי פילוח והן בהליכי מדידה ליניאריים. ראשית, רופאים וחוקרים צריכים לזהות את אמצע חוליות L3 כדי להשיג עקביות. אמצע חוליות L3 יהיה הפרוסה שבה מח העצם של התהליכים הרוחביים בולט ביותר. פרוסת חוליות L3 צירית מזוהה בקלות רבה יותר בעזרת נוף קשתי או קורנל. חוקרים או קלינאים יכולים תחילה למצוא חוליות L1 או סקרום כנקודת התייחסות, תוך התחשבות כי נוכחות של שש חוליות מותניות במקום חמש היא גרסה נורמלית. הצעד המכריע הבא הוא זיהוי השרירים. במדידות ליניאריות, אין לכלול את הלומברום מרובע בעת לקיחת המדידות האנכיות והאופקיות. שלישית, החוקרים צריכים גם לשים לב בעת תיוג מע"מ בפרוטוקול פילוח, כמו תוכן המעי הגס עשוי לפעמים להיות מתויג כמו רקמת שומן הקרביים23. כאשר מתרחשת שגיאה כזו, החוקרים צריכים למחוק אזורים אלה לפני שהם עוברים לשלב הבא.
בעיה נפוצה בסגמנטציה היא איכות תמונה ירודה של CT או MRI (ראה תוצאות מייצגות לקבלת דוגמאות). במקרים מסוימים, איכות ירודה אינה הופכת את התמונה לחסרת תועלת, אך במקרים אחרים ייתכן שיהיה צורך להוציא את התמונה מניתוח. מגבלה נוספת, אולי בלתי נמנעת, של פילוח תמונה אחת כוללת וריאציה אקראית של מיקום איבר מוצק מתמונה לתמונה.
בעיות נפוצות אחרות הן עבור ניתוח פילוח L3 והן עבור ניתוח מדידה ליניארית קשורות לעתים קרובות לווריאציה בין-קצבית ותוך-קצבית. כפי שקורה ברוב הפרוטוקולים, ניתן לצפות לכמות מסוימת של שונות בין משקיפים ובין הניסויים הנפרדים של אדם יחיד. כדי להסביר ולמזער וריאציה בין-מדרגית עם מספר אנשים המבצעים ניתוח, צוות החוקרים או הקלינאים יכול לבדוק כל וריאציה מובהקת סטטיסטית במדידות שטח הפנים ו- HU ממוצע מאותה תמונה. שים לב מיוחד של וריאציה HU כמו זה יציין אם חוקרים או רופאים שיש להם שטחי פנים דומים מאוד עבור אותה תמונה הם אכן תיוג הרקמות בערך אותו הדבר. כדי לבדוק וריאציה תוך-מדרגית משמעותית עבור אדם, חוקרים או קלינאים עשויים לצלם תת-קבוצה קטנה של תמונות ולחלק כל תמונה עד שכל העותקים המשוכפלים עבור כל תמונה נמצאים בתוך שוליים צרים וחסרי משמעות סטטיסטית.
אנו מכירים בכך שלשני הפרוטוקולים המוצגים כאן יש מגבלות בניתוח הרכב הגוף מכיוון שנעשה שימוש בפרוסה אחת בלבד. כפי שהוצע על ידי שן ואח ', ניתוח 3D עשוי לספק מידע מדויק יותר עבור שומן הקרביים בבטן, וניתוח פרוסה אחת למע"מ הוא ברמות שונות עבור גברים ונשים24. עם זאת, הפרוטוקולים הנדונים כאן הם עדיין בעלי ערך כפי שהם מספקים הערכות מהירות של שריר, כמו גם רקמת שומן, אשר ניתן להשתמש בהם עבור הקרנת סרקוזניה במרפאות.
יתר על כן, היו פרוטוקולי ניתוח הרכב גוף אוטומטיים רבים באמצעות אלגוריתמים למידת מכונה 3D, במיוחד אלגוריתמי סיווג מבוססי רשת עצבית25. אנו מכירים בכך שאלה עשויות להיות החלופות העתידיות הפוטנציאליות לפילוח דו-מימדי מסורתי. עם זאת, שיטות אלה דורשות ערכות נתונים גדולות של תמונות CT ו- MRI כדי להיות מפותחות, נבדקות ומיושמות בהגדרות קליניות ומחקריות. בנוסף, שיטות אלה דורשות לעתים קרובות ניתוח פילוח דו-מימדי כדי ליצור הפניה בסיסית שנגדה ניתן לאמת את האלגוריתמים של למידת מכונה. הפרוטוקולים המודגמים כאן יכולים אפוא להיות שימושיים כאשר ערכות נתונים גדולות או תמונות תלת-ממד אינן זמינות, וניתן להחיל פרוטוקולים אלה כדי לסייע בפיתוח ואימות של אלגוריתמים של למידת מכונה כאשר הם ישימים. לפיכך, אנו מאמינים כי רופאים וחוקרים יכולים להפיק תועלת מסרטון הדרכה זה ולאמץ שיטות מהירות ואמינות אלה כבדיקה ראשונית לפני ניתוח אוטומטי זמין ועל מנת להקל על יישום טכנולוגיה מתקדמת זו.
היכולת לנתח במהירות הפצת רקמת שומן ומסת שריר השלד יש מגוון רחב של אינטרסים קליניים החל טיפול בסרטן ומחקר למחלות לב5. בהשוואה לשיטות נפוצות אחרות, Mourtzakis ואח '. הליך פילוח L3 בפרוסה-O-Matic יכול להעריך במדויק ובמהירות את התפלגות רקמת השומן ולקבוע מצב סרקוזניה5,12,13,19. בנוסף, בהקשרים שבהם מידע על מסת שריר השלד מספיק, הליך מדידה ליניארי L3 הוא כלי אמין ומהיר מאוד כדי לעזור לחזות הצלחה בטיפולים בסרטן כגון ניתוח, הקרנות, וכימותרפיה1,2,4,6,7,8. מטרת סרטון ההכשרה וכתב היד הזה היא לתאר בבירור את הפרוטוקול לפילוח ומדידות ליניאריות לשימוש עתידי, כך שקלינאים יוכלו להעריך ביתר קלות את הרכב הגוף במסגרת המרפאה.

הערכת סרקוזניה והרכב הגוף היא כיום עניין קליני רב. למרות הגדרות ספציפיות של סרקוזניה להשתנות בהתאם להגדרה והקשר, כל ההגדרות כוללות אובדן משמעותי של מסת שריר השלד או כוח השריר, אשר מתואמים קשר הדוק1,2,3. ניתוח הרכב הגוף משלב מדידות של מסת שריר השלד והפצת רקמת שומן, ומספק מידע מקיף יותר על הכושר הכללי של חולים1,3,4. באופן דומה, רקמת שומן מופצת באופן לא פרופורציונלי, במיוחד רקמת שומן הקרביים, נמצאה קשורה למחלות שונות, כולל מחלות לב, סוכרת מסוג II וסרטן5.
מבחינה קלינית, סרקוזניה והערכתה על ידי מדידות ליניאריות הוכחו שוב ושוב כגורם פרוגנוסטי חזק להישרדות ספציפית לסרטן על פני ממאירויות ותוצאות אונקולוגיות לאחר ניתוח, הקרנות וכימותרפיה1,2,4,6,7,8. בפרט, מחקרים קודמים מראים כי חולים עם סרקוזניה ירדו ההישרדות הספציפית לסרטן ואת ההישרדות הכוללת1,2,9,10. לכן, הערכה קלינית מדויקת ומהירה של התקדמות סרקוזניה חשובה בקביעת הבחירות לטיפול. פרופיל קונבנציונאלי של הרכב גוף שלם דורש ניתוח ברמה תלת מימדית (3D) באמצעות טכניקות הדמיה, כולל טומוגרפיה ממוחשבת (CT), הדמיית תהודה מגנטית (MRI), צפיפות עצם (DEXA) וניתוח עכבה ביואלקטרית (BIA), אשר גוזלים זמן, יקרים ודורשים הכשרה מקיפה5,11. חיסרון נוסף הוא חוסר מידע על חלוקת שומן, במיוחד עבור plethysmography עקירת אוויר (ADP) ו DEXA12. לכן, הערכה וקביעה של סרקוזניה והרכב הגוף עם השימוש באופני הדמיה חתך קונבנציונליים כגון CT או MRI, המשמשים כחלק מפרקטיקה קלינית סטנדרטית של טיפול, יש ערך קליני רב5.
אחת התוכנות הנפוצות לפילוח במסגרת המחקר הקליני היא תוכנית Slice-O-Matic שפותחה על ידי TomoVision. באמצעות הליך פילוח Mourtzakis et al.13, התוכנית מאפשרת לחוקרים או קלינאים לתייג באופן אוטומטי למחצה סוגי רקמות שונים כגון שרירי השלד (SM), רקמת שומן תוך שרירית (IMAT), רקמת שומן הקרביים (מע"מ), ורקמת שומן תת עורית (SAT) באמצעות סף מבוסס צפיפות, המאפשר מדידה של האזורים הכוללים של כל חציית דם של כל רקמה. מדידות אלה משמשות לאחר מכן כדי להעריך את מסת שריר השלד הכולל של הגוף ואת אדיפוזיות, לעתים קרובות לאחר נורמליזציה על ידי גובה המטופל בריבוע, כדי לזהות סרקוזניה והשמנת יתר סרקופינית על ידי סף מבוסס אוכלוסייה.
שיטה שפותחה לאחרונה על ידי Avrutin et al.14 באמצעות מדידות ליניאריות של שרירי השלד שפותחו הראו את הפוטנציאל להיות אמין באותה מידה בהערכת מסת השריר הכוללת באמצעות תמונות MRI ו- CT של חתך L314,15. קבוצות השרירים הפסואס והפרספינליות מהוות חלק גדול משטח השרירים של אזור L3 ויש להן פונקציונליות גבוהה, מה שמרמז על כך שהן עשויות להיות מנבאות נאמנות גבוהה של כוח השריר הכולל, ולכן המועמדים העיקריים למדידה ליניארית14,15. כדי לחשב את שטח הפנים השרירי, מדידות אופקיות ואנכיות של קבוצות הפסואס והשרירים הפרספינליים מתקבלות באמצעות כלי סרגל כדי לצייר קווים ישרים מצטלבים של 90°. המדידות האופקיות והאנכיות של כל קבוצת שרירים מוכפלות כדי להעריך את שטח הפנים של כל קבוצת שרירים, אשר משמש לאחר מכן לחישוב מדד שריר ליניארי כאשר מחולק לפי גובה המטופל. עם הכשרה מינימלית, כל התהליך הזה יכול לקחת פחות משעה.
בהתחשב בהשלכות האפשריות של מדידות הרכב הגוף על הטיפול בחולה, יש צורך דחוף ביצירת חומרי אימון נגישים. במאמר זה אנו מספקים תיאור מפורט של שתי שיטות שפותחו על ידי Avrutin et al.14 ו Mourtzakis et al.13 כדי לכמת את מסת שריר השלד ואת הרכב הגוף, בהתאמה, עבור ספקים וחוקרים קליניים.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Centricity PACS Radiology RA 1000 Workstation</td>
			<td>GE&#160; Healthcare</td>
			<td></td>
			<td>Image viewer to obtain subject&#39;s MRI and CT images</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Slice-O-Matic 5.0</td>
			<td>TomoVision</td>
			<td></td>
			<td>Segmentation software used in this protocol. Other versions of this software may be used, but tools may be slightly different.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Horos</td>
			<td>Nimble Co LLC d/b/a Purview</td>
			<td></td>
			<td>Linear segmentation software used in this protol, but researchers can use any image viewer with a ruler tool.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

segmentation and linear measurement for body composition analysis using slice-o-matic and horos

הרכב הגוף קשור לסיכון להתקדמות המחלה וסיבוכי טיפול במגוון תנאים. לכן, כימות של מסת שריר השלד ורקמות שומן על טומוגרפיה ממוחשבת (CT) ו / או דימות תהודה מגנטית (MRI) עשוי להודיע הערכת סיכון ניתוח פרוגנוזה המחלה. מאמר זה מתאר שתי שיטות כימות שתוארו במקור על ידי Mourtzakis et al. ו Avrutin ואח ': פילוח רקמות ומדידה ליניארית של שריר השלד. התמונה החתוכים של המטופלים בנקודת האמצע של החוליה המותנית השלישית הושגה עבור שתי המדידות. עבור פילוח, התמונות יובאו לפרוסה-O-Matic וצבעוני עבור שריר השלד, רקמת שומן תוך שרירית, רקמת שומן הקרביים, ורקמת שומן תת עורית. לאחר מכן, שטחי פנים של כל סוג רקמה חושבו באמצעות פונקציית שטח פני השטח של התג. עבור מדידות ליניאריות, הגובה והרוחב של פסואס דו-צדדי ושרירים paraspinal ברמה של החוליה המותנית השלישית נמדדים ואת החישוב באמצעות ארבעה ערכים אלה להניב את מסת שריר השלד המשוער. ניתוח פילוח מספק מידע כמותי ומקיף על הרכב הגוף של המטופלים, אשר לאחר מכן ניתן לתאם עם התקדמות המחלה. עם זאת, התהליך גוזל זמן רב יותר ודורש הכשרה מיוחדת. מדידות ליניאריות הן כלי יעיל וידידותי למרפאה להערכה מהירה לפני הניתוח. עם זאת, מדידות ליניאריות אינן מספקות מידע על הרכב רקמת השומן. עם זאת, לשיטות אלה יש יישומים רחבים במגוון מחלות כדי לחזות תוצאות כירורגיות, הסיכון להתקדמות המחלה וליידע את אפשרויות הטיפול בחולים.

הליך הפילוח L3 גורם לתמונת CT או MRI מתויגת עם רקמת שריר השלד (SM) המתויגת באדום, IMAT בירוק, מע"מ בצהוב ופסיכומטרי בציאן (איור 1). שאר הרקמות הלא מתויגות יישארו בגוונים הלבנים, האפורים והגבים המקוריים שלהן התואמים לערכי יחידת Hounsfield (HU) המתאימים לכל פיקסל. רוב הרקמות הלא מתויגות שנותרו בלבן יהיו עצם, רוב הרקמות שיישארו באפור יהיו שרירים לא שלד, רקמת איברים ורקמות שומן בתוך לומן המעיים, ורוב התמונה שנותרה בשחור תהיה אוויר. תמונה מחולקת כראוי לא יהיה תיוג אדום או ירוק מחוץ fascia שריר השלד, ולא צהוב או ציאן תיוג בתוך fascia שריר השלד. בנוסף, תיוג צהוב לא צריך לפלוש לומן של מעיים או איברים כגון הכליה או הכבד, תיוג ציאן לא צריך להיות נוכח לאורך הקצוות החיצוניים בהירים יותר התואמים את העור. לאחר השלמת פילוח התמונה, יש לתעד את שטחי הפנים ואת ערכי HU של הרקמה הממוצעת, לצד גובה המטופל (טבלה 1). מתוך נתונים אלה, ניתן לחשב את מדד שרירי השלד ולהמשיך עם כל ניתוח אחר הרלוונטי למחקר הספציפי או לשאלות הקליניות. שים לב כי עבור רוב תמונות MRI, רק שריר השלד ניתן לתייג כראוי ולאחר מכן לנתח (טבלה 2). במדידות ליניאריות, אינדקס מחושב על-ידי חלוקת שטח הפנים על-פני ריבוע הגובה (טבלה 3).
בעיות נפוצות שחוקרים עשויים להיתקל בהן במהלך הליך הפילוח כוללות תמונות הכוללות השמטה של מידע מרכזי. לדוגמה, ייתכן שחלקים גדולים של תמונות נחתכו או נחתכו (איור 2). באופן ספציפי, תמונות שיש להם SAT ו / או רקמת שריר השלד לגזור מתוך מסגרת יהיה להפחית באופן דרסטי את הדיוק של חישובי שטח הפנים של רקמות מושפעות. בין אם זה הופך תמונה לא מתאימה לניתוח יהיה תלוי בהקשר הקליני או המחקרי וחייב להיות מוכרע על ידי צוות המחקר על בסיס כל מקרה לגופו. מכשול נוסף הוא כי החוקרים עשויים לכלול בטעות חוט השדרה ומח העצם בשריר השלד. כדי למנוע בעיה זו, החוקרים צריכים להיות מאומנים היטב ולהישאר זהירים במהלך פילוח. חפצים נפוצים אחרים בתמונות CT או MRI כוללים בעיות טכניות הנגרמות על ידי מיקום המטופל או תנועה בסורק, נטיעת שומן ורקמות צלקת סביב fascia שריר השלד, וממצאים אחרים בצורה מוזרה (איור 3). בעיות טכניות הנגרמות על ידי תנועת המטופל או מיקום לא תקין בדרך כלל ייראו קלות יותר, עם ערכי HU גבוהים יותר מאשר הרקמה שמסביב. בעיות טכניות מסוג זה מופיעות בדרך כלל בפסיכומטרי ויכולות גם להוריד את הדיוק של חישוב שטח הפנים. ההקשר הקליני או המחקרי יקבע את רמת הסובלנות לנושאים כאלה. גדילת שומן וחפצי רקמת צלקת בדרך כלל אינם גורמים כמויות גבוהות של שגיאה בחישובים שטח פני השטח של הרקמה. עם זאת, הם יכולים להוביל לזיכוי מוטעה של הקו fascial. שרירי השלד ושטחי הפנים של IMAT יכולים להיות מאוד לא מדויקים במקרים שבהם גדילי שומן או רקמת צלקת טועים כמו קו fascia שריר. פגמים קטנים אחרים וממצאים בתמונות CT ו- MRI בדרך כלל אינם משפיעים על איכות התמונה הכוללת למעט במקרים נדירים. בהתאם להקשר הקליני או המחקרי, ייתכן שיהיה צורך להעריך חפצים אלה על ידי מומחה לרדיולוגיה כדי לאמת את איכות התמונה. הבעיה הנפוצה האחרונה בתמונות CT ו-MRI היא עיוותים בקו השרירים (איור 4). הפסקות אלה בדרך כלל לא ישפיעו על איכות התמונה, אבל תמונות המכילות הפסקות גדולות או עיוותים אחרים fascia שריר צריך להיות מוערך על ידי רדיולוג כדי לקבוע אם מקור העיוות ישפיע על הניתוח של הקשר קליני או מחקרי.
הליך המדידה הליניארי L3 שפותח על ידי Avruvin et al. יש פחות שגיאות נפוצות מאשר הליך פילוח L314,15. הבעיות העיקריות בהן נתקלים באמצעים ליניאריים סובבות סביב זיהוי קבוצות השרירים המעניינות, שתי קבוצות הפסואס והשרירים הפרספינליים (איור 5). ברוב המקרים קצוות פסואס יהיה שונה איברים סמוכים, אבל במקרה כי הקצה קשה להבחין, שינוי מסנני HU או בהירות בדרך כלל יפתור את רוב הבעיות. בנוסף, הקצוות של קבוצות השרירים paraspinal לעתים קרובות יהיה שונה מרקמות סמוכות אחרות, אבל יש לציין כי אם אין שריר ברור מגיע לקו fascia התחתון ביותר, הקו לא צריך להיכלל בקביעת הקצה התחתון של קבוצת השרירים paraspinal. לבסוף, יש לשלול את הלומבורום מרובע בעת קביעת קצה הפסו או קבוצות השרירים paraspinal (איור 5E).
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61674/61674fig01.jpg"> איור 1: פילוח L3 נכון בפרוסה-O-Matic. (A) תמונת CT צירית ללא שינוי בחוליות L3. (B)CT צירי מתויג במלואו עם אדום המתאים לשריר השלד (SM), ירוק לרקמת שומן תוך שרירית (IMAT), צהוב לרקמת שומן שלפוחית (מע"מ), וציאן לרקמת שומן תת עורית (SAT). <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61674/61674fig01large.jpg" target="_blank">לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61674/61674fig02.jpg"> איור 2: ניתוק תמונת L3 CT. תמונת CT לא מתויגת בפרוסה-O-Matic עם כמויות משמעותיות של SAT, כמו <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61674/61674fig02large.jpg" target="_blank"></a> גם כמויות משמעותיות של רקמת שריר השלד חתוכה.
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61674/61674fig03.jpg"> איור 3: ממצאים נפוצים. (A) תמונת CT לא מתויגת כוללת פריטים חזותיים שונים המסומנים בתיבה האדומה, אליפסה כחולה ותיבה ירוקה, בהתאמה. התיבה האדומה מציגה בעיות טכניות עם סריקת CT, פוטנציאל מ malalignment או תנועה במהלך הסריקה. האליפסה הכחולה מדגישה חפץ נפוץ שנובע ככל הנראה מרקמות צלקתיות. הריבוע הירוק מדגיש פגמים שעשויים להיות להם סיבות פוטנציאליות מרובות. (B)סריקת CT מתויגת עם מראה של אותם חפצים בהתאמה המסומנים בתיבה האדומה, אליפסה כחולה ותיבה ירוקה. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61674/61674fig03large.jpg" target="_blank">לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61674/61674fig04.jpg"> איור 4: הפסקה גדולה בשריר fascia. ( (A) תמונת ה- L3 CT הלא מתויגת מדגישה הפסקה גדולה בשריר השלד fascia בקופסה הסגולה. (B)תמונת ה-L3 CT המתויגת מדגישה את המראה המתויג של ההפסקה הגדולה בשריר השלד בקופסה הסגולה. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61674/61674fig04large.jpg" target="_blank">לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.</a>
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61674/61674fig05.jpg"> איור 5: מדידות ליניאריות L3. (A) תמונת ה- L3 CT המקורית לפני הניתוח במציג התמונות של הורוס. (B) שיטת המדידה הליניארית המסורתית כוללת קו אנכי אחד וקו אופקי אחד שצויר עבור כל שריר. קווים אלה נמדדים באמצעות כלי סרגל ומוכפלים כדי למצוא את שטח הפנים של כל קבוצת שרירים. שים לב ששיטת האמצעים הליניאריים המסורתית צריכה תמיד לציין קווים המצטלבים ב- 90°. תמונה זו של שיטת המדדים הליניאריים המסורתית היא הדגמה חזותית רק מכיוון שהיא נוצרה בהורוס ואינה מובטחת בצמתים של 90°. (C) (D) (E) שיטת התיבה למדידות ליניאריות L3. (C) (D) הקופסה הכחולה והסגולה מקיפה את הפסואס הימני והשמאלי, בהתאמה, והתיבה הצהובה והירוקה מקיפה את שריר הפרספינל הימני והשמאלי, בהתאמה. (E)הקופסאות הסגולות והכתומות הבהירות מדגישות את הלומבורום מרובע, אשר לא צריך להיחשב בעת קביעת קצוות של Psoas וקבוצות שרירים paraspinal. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61674/61674fig05large.jpg" target="_blank">לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.</a>
<img alt="Figure 6" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61674/61674fig06.jpg"> איור 6: השוואה בין אמצעים ליניאריים לבין אזור שריר השלד L3 חתך רוחב, n = 65. הפסואס והאזורים הפארספינליים המשולבים הם בהתאם לשריר השלד הכולל ב חתך L3. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61674/61674fig06large.jpg" target="_blank">לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.</a>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td>פילוח CT</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
<tr>
<td></td>
			<td>שריר</td>
			<td>רקמת שומן תוך שרירית</td>
			<td>רקמת שומן הקרביים</td>
			<td>רקמת שומן תת עורית</td>
		</tr>
<tr>
<td>אזור התפרצת (ס"מ2)</td>
			<td>134.4</td>
			<td>8.402</td>
			<td>72.43</td>
			<td>271</td>
		</tr>
<tr>
<td>יחידת הונספילד (ממוצע)</td>
			<td>33.61</td>
			<td>2.1</td>
			<td>18.11</td>
			<td>67.76</td>
		</tr>
<tr>
<td>גובה המטופל בריבוע (m2)</td>
			<td>2.69</td>
			<td>מדד שרירי השלד (אזור שריר/גובה2, ס"מ2/ מ')</td>
			<td></td>
			<td>49.97</td>
		</tr>
</tbody></table>טבלה 1: פילוח CT
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td>סגמנון MRI</td>
			<td></td>
		</tr>
<tr>
<td></td>
			<td>שריר</td>
		</tr>
<tr>
<td>אזור התפרצת (ס"מ2)</td>
			<td>241.8</td>
		</tr>
<tr>
<td>יחידת הונספילד (ממוצע)</td>
			<td>35.85</td>
		</tr>
<tr>
<td>גובה המטופל (m2)</td>
			<td>3.39</td>
		</tr>
<tr>
<td>מדד שרירי השלד</td>
			<td rowspan="2">71.42</td>
		</tr>
<tr>
<td>(אזור שרירים/גובה2, ס"מ2/m2)</td>
		</tr>
</tbody></table>טבלה 2: פילוח MRI
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td colspan="8">מידות ליניאריות</td>
		</tr>
<tr>
<td>גובה פסואס ימני (ס"מ)</td>
			<td>רוחב פסואס ימני (ס"מ)</td>
			<td>גובה פסואס שמאלי (ס"מ)</td>
			<td>רוחב פסואס שמאלי (ס"מ)</td>
			<td>גובה פרזפינאל ימני (ס"מ)</td>
			<td>רוחב פרזפינלי ימני (ס"מ)</td>
			<td>גובה פרזפינאל שמאלי (ס"מ)</td>
			<td>רוחב פרזפינלי שמאלי (ס"מ)</td>
		</tr>
<tr>
<td>3.934</td>
			<td>2.927</td>
			<td>3.743</td>
			<td>2.788</td>
			<td>4.916</td>
			<td>6.264</td>
			<td>4.403</td>
			<td>7.045</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">סה"כ שטח פסואס (ס"מ2)</td>
			<td colspan="2">21.950</td>
			<td colspan="2">סה"כ שטח פרזפינלי (ס"מ2)</td>
			<td colspan="2">61.813</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">סה"כ אזור שרירים (ס"מ2)</td>
			<td colspan="4">83.76</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">גובה המטופל בריבוע (m2)</td>
			<td colspan="2">2.496</td>
			<td colspan="2">מדד מדידה ליניארי (ס"מ2/m2)</td>
			<td colspan="2">33.55</td>
		</tr>
</tbody></table>טבלה 3: מידות ליניאריות

Watch this Scientific Journal Video about Segmentation and Linear Measurement for Body Composition Analysis using Slice-O-Matic and Horos at JoVE.com

Segmentation and Linear Measurement for Body Composition Analysis using Slice-O-Matic and Horos

פילוח ומדידות ליניאריות מכמתים מסת שריר השלד ורקמות שומן באמצעות טומוגרפיה ממוחשבת ו/או תמונות הדמיית תהודה מגנטית. כאן, אנו מתארים את השימוש בתוכנת Slice-O-Matic וצופה תמונות הורוס לניתוח מהיר ומדויק של הרכב הגוף. שיטות אלה יכולות לספק מידע חשוב עבור פרוגנוזה וריבוד סיכונים.

פילוח ומדידה ליניארית לניתוח הרכב הגוף באמצעות פרוסה-או-מאטי והורוס

Body composition is associated with risk of disease progression and treatment complications in a variety of conditions. Therefore, quantification of ...

ניוון שריר הסרט על סרקוזניה הוכח להיות גורם פרוגנוסטי להישרדות סרטן והצלחה בטיפול. ניתוח הרכב של האזור המותני השלישי הוא עניין כפי שהוא מספק אפיון כמותי של שריר השלד בתוך סריקות CT מספק מידע איכותי של רקמת שומן. ההליכים הבאים מספקים פרוטוקול ומפולחים אנכית בתוכנה sliceOmatic, כמו גם פרוטוקולי המדידה שלך לניתוח קומפוזיציה בתמונות CT ו- MRI.הבחירה של פרוטוקול חוליות L3 הושלמה בתוך CENTRICITY GE. שים לב שאם משתמשים בתוכנה אחרת, הכלים עשויים להשתנות. פתח את תמונות ה- CT או ה- MRI של המטופל שבוצעו במסגרת הזמן המעניינת.בחר אזורי צג, תצוגת חלון 2V. בחר את התצוגה coronal או sagittal על המסך השמאלי על ידי ניווט לסדרה ולאחר מכן בחירת תמונות coronal או קשת. בחר את התצוגה הצירית במסך הימני על-ידי ניווט לסדרות ולאחר מכן בחירת התמונות הציריות.לחץ על קון, הפניה מקושרת כדי לקשר את שתי התמונות, ולאחר מכן לגלול דרך התמונות על התצוגה coronal או sagittal כדי להבטיח את חוליות עמוד השדרה גלויים בקלות. לאחר מכן, גלול בין תמונות התצוגה הצירית כדי למצוא את חוליות L1. L1 הוא החוליות הראשונות שאין להן קשר לצלעות.לספור מ L1 עד לחוליות L3. הקפידו להשתמש בתצוגה הסגיטלית או הקורונטלית לעיון באיתור מרכז חוליות L3. ייצאו את תמונת L3 על ידי ניווט לתפריט הבחינה, בחרו 'ייצוא תמונות', תמונות שנבחרו.ודא שהתבנית היא DICOM. לאחר מכן בחרו במיקום שבו יש לשמור את התמונה. לחץ פעמיים על קובץ DICOM כדי לפתוח את sliceOmatic.לאחר שהתוכנית נטענה, גרור את תמונת DICOM לכל מקום לתוך הפרוסהמסך האמטי. עבור למצבים, אזור הגדל כדי להתחיל פילוח. בחר כלים, נעילת תגים.תכונה זו תשמש בשלבים הבאים. לחץ על האדום אחד תחת אזור גדל כדי להגדיר את מגבלות H.U.the. לשרירים. לאחר מכן לחץ על כפתור כיבוי ליד הגבול התחתון.זה יפעיל את זה. התאם את המגבלה עם המחוון כך שתהיה קרובה ככל האפשר ל- 29 שלילי. לאחר מכן השתמש בגלגל העכבר כדי להגדיר אותו בדיוק שלילי 29.לאחר מכן, לחץ על כפתור ההכבה ליד הגבול העליון כדי להגדיר אותו מופעל. השתמש במחוון ובגלגל העכבר כדי להגדיר את מגבלת H.U.h.h חיובי 150 הבא, לחץ על שני ירוקים כדי להגדיר את מגבלות H.U.limits עבור I.M.A.T. ולהגדיר את הגבולות התחתונים והעליון באותו אופן אבל הגדרת הגבול התחתון שלילי 190 ואת הגבול העליון שלילי 30. לחץ על חמשת הצהובים כדי להגדיר את הגבולות עבור V.A.T.this. הפעם להגדיר בגבול התחתון שלילי 150 ואת הגבול העליון שלילי 50.לבסוף, לחץ על ציאן שבע כדי להגדיר את מגבלות H.U.T.S.T.הגדרת הגבול התחתון שלילי 190 ואת הגבול העליון שלילי 30. הקש על מקשי הפלוס והמינוס בלוח המקשים כדי להגדיל את התמונה לפי הצורך. התאם את גודל התצוגה לפי הצורך לאורך תהליך הפילוח.בחרו באדום וודאו שאפשרות המברשת מוגדרת לצביעה. השתמש בגודל המברשת היעיל ביותר עבור התמונה ולהתחיל לצייר על ידי לחיצה על רקמת שריר. צבעו על הפסואס, קבוצות השרירים הפארספינליות וקבוצות השרירים האלכסונית.יש להקפיד על שולי השריר הקרובים לעמוד השדרה, לאיברים הפנימיים או לנוזלים, כדי לוודא שאלה אינם מתויגים כשריר. אם משהו מתויג באופן כוזב, בחר באפשרות ללא ומחק את הטעות. לאחר שכל השרירים תויגו, בחר אחד בתפריט נעילת התג.פעולה זו תבטיח שאף שריר לא יימחק בטעות או יתויג מחדש עם המשך הפילוח. בחר את שני הירוקים וצבע על רקמת I.M.A.T.בתוך fascia השריר. שים לב, רוב הפערים בתוך השריר עצמו יהיה I.M.A.T.Note כי הקצוות של fascia שריר הם לעתים קרובות קל יותר במראה מאשר הרקמה שמסביב.זה יכול להיות מדריך מועיל, במיוחד באזורים שבהם קבוצות השרירים האלכסוניים פוגשות את קבוצות השרירים הפארספינליות ובאזור שמתחת לספינה הזקפה אך מעל הקו fascial. לאחר שכל .M.A.T. תויג, בחר את השניים תחת תפריט נעילת התגים. לאחר מכן בחר את חמשת הצהובים מהתפריט הגדל באזור כדי להתחיל לפלח V.A.T.One עדיין יכול להשתמש באפשרות המברשת, אבל עבור תמונות רבות, זה יכול להיות קל ומהיר יותר להשתמש באפשרות לגדול ל- D במקום.אם אתם משתמשים ב-Grow to D, הקפידו לבחור את גודל המברשת הקטן ביותר, ולאחר מכן לחצו על רקמת V.A.T.בתוך התמונה כדי לתייג אותה. ודא את הרקמות או שומנים בתוך הגבול של המעיים או איברים אחרים אינם מתויגים כמו V.A.T.Once כל V.A.T.is מתויגים, בחר חמישה מתפריט נעילת תג. לבסוף, בחר את שבעת הציאן מהתפריט הגדל באזור כדי לתייג את רקמת S.A.T..שוב, בהתאם לתמונה, S.A.T.רקמת הוא לעתים קרובות קל יותר לתייג עם האפשרות לגדול כדי D. לאחר S.A.T.רקמת מתויג, לבדוק את הקצוות, במיוחד סביב העור, כדי להיות בטוח רק שומן תת עורי מסומן כמו S.A.T.לאחר כל הרקמות תויגו, להסתכל על התמונה כדי להיות בטוח שאין שגיאות או רקמה מסומן לא נכון. לאחר השלמת, עבור אל כלים, תייג את עוצמת פני השטח.לחץ על כפתור ערכי החלון והקלט את שטח הפנים של כל רקמה ואת ערכי H.U. ממוצעים. לבסוף, עבור אל קובץ, שמור קבצי תגים. פעולה זו תשמור קובץ תגים שבו ממוקמת תמונת DICOM.כדי להתחיל פילוח MRI, עבור למצבים, אזור גדל. במבט בחלון התצוגה המקדימה, אנו יכולים לראות היסטוגרמה של ערכי H.U., שם הפסגה הראשונה היא אוויר, הבא הוא שריר השלד, ואם הפסגות הבאות ניתן להבחין, הם יהיו עצם ואחריו רקמת שומן. הערה, בעת שימוש בתמונות MRI, בדרך כלל רק שריר השלד יכול להיות מחולק בביטחון עקב אפליה רקמת שומן עניים.בחר את האדום והגדר את הגבול התחתון על השארתו מוגדר לאפס. לאחר מכן הפעל את הגבול העליון ושנה את אפשרות גלגל העכבר לגבול העליון. לאחר מכן, בחרו 'צבע' ואפשרות מברשת גדולה, ולאחר מכן הזיזו את הסמן מעל שריר הפסואה כך שאזור הסמן יכלול גם שריר וגם עצם.כדי להיות בטוח העצם אינה מתויגת כמו שריר, להגדיר את הגבול העליון באופן שמרני על ידי הזזת גלגל העכבר עד הגבול העליון אינו כולל את כל רקמות העצם החיצונית. ואז פלח את רקמת השריר מיד בסמוך לעמוד השדרה. לאחר מכן, להעביר את הסמן אלבה לינאה או בכל מקום אחר על הסריקה שבו רקמת שומן ושרירים קל להבדיל.הגדל את הגבול העליון גבוה ככל האפשר מבלי לכלול כל רקמת שומן. מכאן, אפשר להמשיך לפלח את כל שרירי השלד שנותרו. שים לב, עבור תמונות מסוימות, ייתכן שיהיה צורך להתאים את הגבול העליון ללא הרף.הערה, בעוד הגדרת הגבול העליון עם הליך זה שני שלבים הוא שמרני, זה יהיה לייעל את כמות שריר השלד להיות מתויג מבלי לדאוג תיוג שגוי משמעותי של עצם או רקמת שומן. בסיום, עבור אל כלים, תייג את נפח פני השטח ובחר ערכי חלון כדי לתעד את שטח הפנים ואת ערכי H.U.u. הממוצעים של שריר השלד. מדידה ליניארית של אזור חוליות L3 הוכח בקורלציה הדוקה עם מסת שריר הכוללת.היתרון במדידה ליניארית הוא הקלות והמהירות שלה, כמו גם העובדה שניתן לעשות זאת בכל תוכנה עם כלי סרגל או כלי תיבה. פרוטוקול זה מודגם באמצעות אפליקציית ההדמיה הרפואית Horace. אם אתה משתמש בתוכנה אחרת, שים לב שהכלים הספציפיים עשויים להיות מאוד.יבא את התמונה לתוך המציג על ידי לחיצה על ייבוא ולאחר מכן ניווט למיקום התמונה ובחירה פתוחה. לאחר הייבוא, לחץ על התמונה או שם המטופל כדי להציג את התמונה בתחתית. לחצו פעמיים על התמונה כדי להגדיל אותה, מה שיפתח גם את אפשרויות הכלי.זהה את הפסואס וקבוצות השרירים הפרספינליות. הערה, לומבורום quadratus לא צריך להיחשב בעת קביעת הקצוות של קבוצות שרירים paraspinal. בחרו בכלי סרגל.צייר קו אנכי מהנקודות הגבוהות ביותר של קבוצת השרירים לתחתית קבוצת השרירים. לאחר מכן צייר קו אופקי מהקצה הרחב ביותר של קבוצת השרירים לקצה הרחב השני של קבוצת השרירים. חזור על תהליך זה הן עבור הפסואס הימני והן עבור הפסואס השמאלי והן עבור קבוצות הפרספינל הימניות והשמאליות.שים לב, הקווים שצוירו חייבים להצטלב ב-90 מעלות. שים לב, אם הקצוות של הקווים שצוירו היו להיות מחוברים, חיבור זה צריך ליצור תיבה המקיפה את כל קבוצת השרירים. במציג הרפואי הוראס, קשה להשתמש בכלי הסרגל כדי להבטיח את הקווים מצטלבים ב 90 מעלות.מסיבה זו, יש להשתמש בכלי ציור התיבה במקום זאת. בחרו בכלי המלבן. צייר תיבה סביב כל קבוצת שרירים, עכשיו לשים לב כי הקצוות של התיבה לגעת בחלקים הגבוהים והנמוכים ביותר של השריר, כמו גם את החלקים הרחבים ביותר של השריר.כל עוד כלי התיבה מציג את הממדים האנכיים והאופקיים שלו, הוא עשוי להיות עדיף על פני כלי הסרגל, שכן הוא מאפשר הדמיה קלה של גבולות השריר. תמונת CT או MRI מקוטעת כראוי לא צריכה להיות תיוג שרירים מעבר לקווים fascial, ועבור תמונות CT, לא צריך להיות תיוג שומן בתוך fascia השריר או על העור. רשום את שטח פני השטח של השריר לצד גובה המטופל כדי לחשב את מדד שרירי השלד.עבור סריקות CT, ניתן לתעד את שטחי פני השטח של רקמת השומן בהתבסס על המחקר הספציפי או שאלות קליניות מעניינות. בנוסף, ניתן לרשום ערכי H.U.U. ממוצעים למדידה ליניארית בקרת איכות L3 צריך להיות מדידות הסרגל או התיבה המקיפות את כל השריר. רשום את הרוחב האופקי ואת הגבהים האנכיים של כל שריר, כמו גם את גובה המטופל.הכפל את הרוחב והגבהים עבור כל שריר, מאשר לסכם אזורים אלה כדי לקבל את אזור השריר הכולל. חשב את מדד המדידה הליניארי על-ידי חלוקת השטח הכולל לפי גובה המטופל בריבוע. הפרוטוקול המוכתם מאפשר לרופאים ולחוקרים להשתמש בסריקות L3 CT או MRI כדי להשיג מידע כמותי מהיר ואמין להערכת סרקוזניה.

Research

JoVE Journal

Medicine

Dissection of Human Vitreous Body Elements for Proteomic Analysis

Dissection של גוף האדם אלמנטים הזגוגיות לניתוח proteomic

The vitreous is an optically clear, collagenous extracellular matrix that fills the inside of the eye and overlies the retina. 1,2 Abnormal interactions ...

Segmentation and Measurement of Fat Volumes in Murine Obesity Models Using X-ray Computed Tomography

פילוח ומדידה של כמויות השומן מודלים השמנת יתר Murine באמצעות קרני רנטגן טומוגרפיה ממוחשבת

Obesity is associated with increased morbidity and mortality as well as reduced metrics in quality of life.1 Both environmental and genetic factors are ...

The Measurement and Treatment of Suppression in Amblyopia

המדידה והטיפול בדיכוי בעין עצלה

Amblyopia, a developmental disorder of the visual cortex, is one of the leading causes of visual dysfunction in the working age population. Current ...

Semi-automated Analysis of Mouse Skeletal Muscle Morphology and Fiber-type Composition

ניתוח חצי אוטומטי של מורפולוגיה שרירי השלד העכבר והרכב סיבים מסוג

For years, distinctions between skeletal muscle fiber types were best visualized by myosin-ATPase staining. More recently, immunohistochemical staining of ...

Whole-brain Segmentation and Change-point Analysis of Anatomical Brain MRI&#8212;Application in Premanifest Huntington's Disease

Whole-brain Segmentation and Change-point Analysis of Anatomical Brain MRIÃƒÆ’Ã‚Â¢ÃƒÂ¢Ã¢â‚¬Å¡Ã‚Â¬ÃƒÂ¢Ã¢â€šÂ¬Ã‚ÂApplication in Premanifest Huntington's Disease

מוח-כל פילוח וניתוח נקודת השינוי האנטומי במוח MRI – היישום ב- Premanifest של מחלת הנטינגטון

Recent advances in MRI offer a variety of useful markers to identify neurodegenerative diseases. In Huntington&#39;s disease (HD), regional brain atrophy ...

Body Composition and Metabolic Caging Analysis in High Fat Fed Mice

הרכב הגוף וניתוח מטבולית שכולאת בעכברים פד שומן גבוה

Alterations to body composition (fat or lean mass), metabolic parameters such as whole-body oxygen consumption, energy expenditure, and substrate ...

Handheld Metal Detector Screening for Metallic Foreign Body Ingestion in Children

גלאי מתכות ידני הקרנה של גוף זר מתכתי בליעה בילדים

Coins are the most common ingested metallic foreign bodies among children. The goal of this protocol is to assess the accuracy and feasibility of using a ...

Comparing Bibliometric Analysis Using PubMed, Scopus, and Web of Science Databases

השוואת אנליזה ביבליומטרית באמצעות הצופים והאינטרנט של מאגרי מידע מדעיים

Literature databases (i.e., PubMed, Scopus, and Web of Science) differ in terms of their coverage, focus, and the tool they provide. PubMed focuses mainly ...

Quantitative Analysis of Cellular Composition in Advanced Atherosclerotic Lesions of Smooth Muscle Cell Lineage-Tracing Mice

ניתוח כמותי של הרכב הסלולר בנגעים טרשת עורקים מתקדמת של שריר חלק תא שושלת היוחסין-עקיבה עכברים

Atherosclerosis remains the leading cause of death worldwide and, despite countless preclinical studies describing promising therapeutic targets, novel ...

Dynamic Measurement and Imaging of Capillaries, Arterioles, and Pericytes in Mouse Heart

מדידה והדמיה דינמיות של נימים, עורקים ופריציטים בלב העכבר

Coronary arterial tone along with the opening or closing of the capillaries largely determine the blood flow to cardiomyocytes at constant perfusion ...